Eucaryotes unicellulaires et virologie

I introduction
La vision de la classification des eucaryotes a chang. Les 3 domaines du vivant :

La position de la racine de larbre phylogntique dtermine lapparition de la vie sur terre.

A retenir : taille moyenne dune protine 300aa 900 nuclotides 1000pb = 1gne (Valable quand il ny a pas dintrons)

II introduction la virologie
1) introduction : dfinition, structure et classification
1886 Mayer se pense sur la maladie de la mosaque du tabac. Il essaye de rendre artificiellement dautres plants, mais ny arrive pas. 1892 Ivanovski reprend les recherches de Mayer. Il utilise le postulat de Koch mais choue. Il prcise cependant quil existe un lment qui se multiplie. Il titre llment mais il est incapable de le cultiver. Il montre que llment est capable de passer travers un filtre de papier et un filtre de porcelaine. Cest donc un lment ultrafiltrable ce qui est inhabituel. Beijevinck montre une autre proprit : la diffusion de llment travers les mailles de lagar, cest un lment trs petit. Ce nest pas une bactrie, ni un micro-organisme mais un virus. Trs rapidement on identifie plusieurs virus (fivre jaune, fivre aphteuse ) Rous 1911 identifie le premier rtrovirus. Twort et dHrelle tudient la shigelle. Ils la cultivent dans des fioles. Ils crent le terme de bactriophage, il sagit dun virus qui sattaque aux bactries. Fin des annes 30 on sait quelle est la composition chimique dun virus : essentiellement de protines et dacide nuclique. Pendant les annes 40 apparat le microscope lectronique, il permet de voir la forme des virus. Virus : parasite oblig dune cellule soit eucaryote, soit archenne, soit bactrienne, form dun ou plusieurs acides nucliques (ex : dsoxyribonuclique, ribonuclique ) et de protines. Le virus est susceptible dtre envelopp ou non. ARN : virus bicatnaire (2brins) ou monocatnaire (1brin) messager ou anti messager Acides nucliques : peuvent tre circulaire ou linaire Gnome viral : peut tre form dune molcule (ARN ou ADN) =mono segment, de plusieurs molcules = segment. La coque protique = capside entoure lARN viral. Elle est constitue de protines. Protomre = protines constituant la capside Nuclocapside = capside + acide nuclique Certains virus ont une bicouche lipidique en plus avec une protine enveloppe dessus Particule virale = virion (dans le cas dun virus non envelopp, la particule virale correspond la nuclocapside).

2 types de formes diffrentes : Hlicodale : en btonnet Icosadre : 20 faces triangulaires, 12 sommets, se dfinit par 3 symtries dordre 5, 3,2. Symtrie complexe : form par plusieurs lments diffrents. Capsomre = association de protomres entre eux. Modalit de construction dicosadre : A partir de capsomres = pentons et hexons (symtrie du capsomre). Ils peuvent tre forms par plusieurs protines. 12 pentons logs sur le sommet dun icosadre (plus petit virus possible) On retrouve le plus souvent les pentons au niveau des sommets, le reste est rempli pas des hexons.

2) stratgie de rplication
Il y a plusieurs tapes : _absorption _pntration Quand un virus pntre dans une cellule il peut tre accompagn de sa capside ou pas (_dcapsidation) _rplication _encapsidation _Lyse ou production continue Labsorption et la pntration sont diffrentes selon le type de cellule. _chez les bactries Lattache et la reconnaissance ncessitent un rcepteur Ex : bactriophage l sattache E.coli via la maltose permase. Cette protine lorigine fait rentrer le maltose dans la cellule. Le virus utilise cette protine pour rentrer. Chez les bactries il nexiste pas le phnomne dendocytose. Il ne peut pas y avoir fusion cause de la paroi. Il doit y avoir une pntration active : mise en jeu dun principe actif, lors de la pntration il y a contraction de la gaine et injection de lacide nuclique avec ou sans sa capside. Une cellule est dite sensible si elle porte le rcepteur sur lequel se fixe le virus. Une cellule est permissive quand elle contient tous les lments ncessaires la synthse du virus.

Une cellule sensible nest pas forcment permissive. Pour les virus envelopps il y a fusion avec la membrane et libration de lacide nuclique directement dans le cytoplasme.

_chez les vgtaux lentre se fait par des vecteurs ou des blessures. Ex de vecteur : le puceron, il pique le tissu vgtal et introduit le virus. Lyse ou production continue :

Lyse : la prsence de la paroi empche le virus de sortir malgr la lyse cellulaire. Il y a des enzymes qui vont dtruire la paroi. Une cellule sans paroi clate facilement. Production continue : les protines enveloppes restent sur la membrane de la cellule, il y a bourgeonnement. Il ny a pas lyse. Rplication Le gnome viral exprime ses gnes de manire prcoce, moyenne, tardive. Il y a une rgulation dans le temps de tous les gnes _virus ADN bicatnaire Le virus le plus simple contient 1 gne pour sa capside. il utilise lADN polymrase, les ribosomes de la cellule pour produire les protines de la capside. LADN polymrase chez les eucaryotes nest que diffrenci, il ny a pas de rplication. Un virus aura pour premire fonction de faire rentrer la cellule en mitose (phase S) : transformation cellulaire, pour pouvoir se rpliquer eux-mmes. Ils ont une capacit cancrigne. Sils tuent la cellule la fin il ny a pas de tumeur, de plus les protines sont trangres au systme immunitaire, donc elles seront dtruites. _virus ADN monocatnaire Il doit synthtiser un second brin. 1) recrute lADN polymrase pour quil synthtise le second brin car il ne le ferait pas spontanment.

Rplication en cercle roulant : se produit la fin de linfection. Cest une protine qui transforme un ADN circulaire bicatnaire en monocatnaire.

Le dcoupage est synchrone avec lencapsidation. Il arrive souvent que les protines dencapsidation dcoupent le concatmre. Le dcalage dans le temps sexplique par des gnes ayant besoin de facteurs dinitiation produits par des gnes prcdents. Les gnes tardifs ont besoin de facteurs produits par les gnes moyens, les gnes moyens ont besoin des gnes prcoces. Les gnes prcoces sont dits constitutifs (nont besoin de rien) Il y a contrle de la transcription grce aux facteurs produits par les gnes (rgulation transcriptionnelle). _les virus ARN : monocatnaire polarit messagre Il traduit une protine : ARN polymrase ARN dpendante : rplicase virale Il faut un ARN polymrase ARN dpendant qui nexiste pas dans une cellule. Le brin ne code pour rien, il sert juste la rplication.

La rgulation se fait au niveau de la transcription Sur ARN il y a des boucles avec des liaisons H = structures secondaires AUG : codon initiateur La rgulation est base sur la structure stable de lARN au cours du temps

Le ribosome droule lARN : les structures inaccessible un temps t le sont un temps t1 Les boucles se font par appariement des bases Les AUG qui ne sont pas accessibles pendant la transcription le deviennent lors de la synthse de lARN + La rgulation se fait au niveau des structures secondaires et tertiaires. Si on met lARN + dans une cellule il produit des protines virales, lARN ne produit rien. LARN est anti messager, pour faire son cycle de rplication il doit rentrer avec sa capside et ne doit pas tre dcapsid pour avoir les protines virales. A partir du moment que la capside est entre il faut produire plusieurs ARN+ qui seront envoys dans le cytoplasme.

Transcriptase virale : synthtise lARN + partir de lARN viral de faon tre en dehors de la capside. Elle est un ARN polymrase ARN dpendant et est une protine de la capside. La rplicase synthtise lARN partir des ARN+ ARN bicatnaire Ne peut pas tre rpliqu, ni transcris La capside doit entrer on produit lARN messager, la transcriptase va ouvrir lARN bicatnaire.pour synthtiser lARN + (ou messager). LARN bicatnaire reste lintrieur de la capside. Un des ARN + va coder pour une rplicase qui va synthtiser lARN , sauf quil ny aura quun bras puis il y a encapsidation.

III origine et classification des eucaryotes

1) initiation la phylognie molculaire
Taxonomie : ranges les organismes dans des taxons (niveau de classification arbitraire) Systmatique : reconnatre et identifier les organismes Taxons : espce, genre, famille, ordre, classe, embranchement, rgne, domaine. Espces : font partie dune mme espce des individus interfconds dont la descendance est fertile.

Les arches et les bactries nont pas de reproduction sexue, mais parasexue : change de segment dinformation gntique, il y a peu de spcificit. Chez certains eucaryotes soit les organismes nont pas de sexe, soit on ne la pas dtect. Reprsentation graphique : arbre de vie ne reprsente pas lvolution des espces. La classification ne suit pas lvolution parce que les taxa sont compltement arbitraires. Dans le monde des micro-organismes les caractres ne sont pas faciles choisir. Comme on na pas de critres spcifiques, on les prend tous en mme temps : taxonomie numrique. Sur un micro-organisme on analyse la capacit ou lincapacit de se fixer sur milieu, dutiliser le nitrate comme source dazote On observe la croissance (+) ou labsence de croissance (-) sur un milieu donn. Le principe de la taxonomie numrique est de prendre des centaines de caractres afin dannuler les erreurs entre eux. On tablit entre micro-organisme un coefficient de similitude :

phntique :organismes classs selon leur apparence 2. cladistique La cladistie cherche retracer lhistoire volutive des taxa. Avant on navait pas accs au squenage des protines, acides amins

On dit que chaque clade est prcd par un nud, et que chaque nud prcde 2 clades. Un cladogramme est un arbre sans chelle. Un arbre phylogntique a des branches de longueur proportionnelle au nombre de mutations par site (il nest pas proportionnel au temps car cela voudrait dire que la vitesse de mutations est identique pour toutes les espces, et que la frquence de mutations est continue dans le temps, or ce nest pas vrai)= horloge molculaire. Apomorphie : caractre driv Pleisomorphie : caractre ancestral Quand plusieurs organismes possdent la mme apomorphie on parle de synopomorphie qui dtermine les clades

Le bon chemin volutif est celui qui met en place le moins de changements possibles.

Avec 4 sous units taxonomiques :

3. phylognie molculaire

Choix du gne : le gne doit tre prsent dans toutes les espces tudies. Transfert latral : acquisition accidentelle de gnes par une espce par le biais de lenvironnement. 1% du gnome subit des transferts latraux. Les plantes ont 15% de leur gnome qui proviennent de transferts latraux de gnes de cyanobactrie. Les ARN ribosomiques sont des squences qui changent lentement, on les trouve chez tous les organismes, ce sont des molcules que lon utilise le plus souvent. Phylognie signifie comparaison des squences et alignement des squences. Pour construire un arbre il faut que les squences soient alignes 100%. Mthodes de distance, parcimonie, parcimonie et probabilit Mthode distance : UPGMA, considre que les branches dun arbre soient de la mme longueur. On mesure la distance (nombre de diffrences sur la squence) entre paires.

La mthode UPGMA nest pas applicable 3) phylognie molculaire On utilise : _ NJ = neighlor joining

Cette mthode permet de mesurer les diffrences par paire de squence. On construit une matrice et on transforme ces donnes en diagramme en toile.

Les couples les plus proches vont tre joints, progressivement on a un arbre phylogntique qui se forme. _maximum de ressemblance : cette mthode est plus longue mais meilleure

Analyse statistique de bootstrap ; elle mesure la solidit des nuds en faisant des calculs darbres phylogntiques avec les mmes squences. 1 2 3 4 56 7 8 9 GCGGACAAA 5 6 2 45 6 7 4 1 ACCGACAGG squence alatoire

A chaque squence compltement alatoire on doit obtenir peu prs le mme arbre. Dans le cas contraire, le premier arbre est faux ? Poly1 La valeur de bootstrap permet de connatre la solidit du nud Poly2 On a de grandes diffrences causes par : _le temps : La diversification des grands groupes sest faite dans un temps plutt restreint, lanalyse manque donc de prcisions. _saturation en mutation : Il y a eu tellement de mutation que le nuclotide ne donne aucune info en phylogntique, mais cause des erreurs. _phnomne dattraction des longues branches la racine.

Les parasites ont systmatiquement des longues branches car ils voluent plus vite que les autres. Ex : microsporidies Le rgne des champignons et le rgne animal sont trs proche.

2) classification et phylognie molculaire eucaryote : le monde des unikontes et bikontes

Poly3 Unikontes : 1 seul flagelle. Les individus ont t flagells, ou le sont encore. Bikontes : 2 flagelles (pas obligatoirement)

Choanoflagells : organismes unicellulaires proches des animaux, ils sont drivs des anctres unicellulaires des animaux.

Opisthokontes : indique la place du flagelle avec le sens du dplacement. Amibes : (diffrents de forme amibe) groupe dans lequel on trouve des formes amibes (cellule sans paroi ni flagelle) mais pas toujours. On connat le gnome complet des champignons, des animaux, de quelques Amibes et quelques plantes. Endosymbiose primaire du plaste : bikonte a phagocyt une cellule bactrienne (cyanobactrie) au lieu de la digrer il y a eu mise en place dune symbiose. Lendosymbiose ne sest produite quune seule fois, toutes les plantes en descendent. Ce rgne vgtal a t limit correctement il y a quelques annes.

Alvols : dinoflagells + cilis + apicomplexe, descendent dune endosymbiose secondaire : une cellule eucaryote a captur un autre eucaryote et en a fait un plaste. Racine : Ex : enracin arbre mammifre On mesure la distance avec un groupe qui nappartient pas larbre mais qui est assez proche = outgroup (oiseaux) On prend larbre qui donne une racine la plus prs des oiseaux. Ici il ny a aucun organisme qui soit assez proche, on utilise des apomorphies (unikontes bikontes) qui permettent de poser la racine au milieu. Ces apomorphies molculaires sont des fusions de gnes accidentelles, elles permettent de faire passer le substrat une vitesse plus grande. Les gnes qui ont fusionn sont : _carbomoyl phosphate synthase / Dihydro orotase / ACT _DHFR thymidilate Synthase (enzyme qui synthtise la thymine) Elle catalyse la mthylation de luracile Le donneur de mthyle (=ttrahydrofolate) est oxyd en dihydrofolate. Il doit tre rgnr par la DHFR

3) les origines
Chez les eucaryotes on a un groupe de gnes bactriens, un groupe de gnes archens 1. scnario 1 :lhypothse de Margulis Hypothse de symbiose : La premire cellule eucaryote vient dune symbiose dun archen qui assure le mtabolisme et dune bactrie qui assure la mobilit

Cest impossible car on ne retrouve pas les mmes gnes chez les eucaryotes et spirochtes et flagelles nont pas la mme structure. 2. scnario 2 : les nomuriens et lhypothse de Cavalier Smith Hypothse : Les eucaryotes ont pratiquement tous acquis une mitochondrie par endosymbiose, pour cela il faut quil y ait phagocytose. Donc la phagocytose a t cre avant ainsi que le cytosquelette, mais pas la paroi. Le groupe susceptible davoir donn naissance aux eucaryotes : Bactries : actinomycte (GRAM+) _Elles possdent des strols dans la membrane comme les eucaryotes _La couche S est plus facile transformer pour donner la structure des eucaryotes _Elles contiennent des kinases quon trouve que chez les eucaryotes On retrouve des gnes ressemblant ceux de lactine et tubuline mais ils nont pas la mme fonction, on suppose quil y a eu volution. Nomurien : hypothse quil y a eu acquisition dune nouvelle paroi Les cyanobactries rejettent de lO2, occupent presque toutes les niches cologiques, juste avant le dveloppement des eucaryotes. LO2 bouleverse les cosystmes : les mtabolismes anarobies stricte sont trs fragiles. Hypothse : la prsence dO2 a privilgi les nomuriens : organismes qui ont fait lendosymbiose mitochondriale avec une bactrie capable de dtoxiquer lO2 Dans cette hypothse, do viennent les archens ?

Mais on tend penser que les archens sont apparus plus tt que les eucaryotes car ils taient capables de survivre dans le milieu terrestre de lpoque.

3. scnario 3 : la syntrophie Paralasalides (trichomonas) et diplomonades (Gardia) nont pas de mitochondires, en faisant des arbres phylogniques ils apparaissent la base de la racine. La connaissance du gnome indique quils ne sont pas entirement dpourvus de mitochondries. Gardia a peut tre contenu une mitochondrie dans le pass. Pareil pour Trichomonas, on a un sac en plus. Le sac (est une mitochondrie) est un hydrogenosome. Hydrogenase : transformation du pyruvate pour donner des H

Ces 2 espces sont des parasites, on a donc le phnomne dattraction des grandes branches c. scnario 3 Martin et Moreira : symbiose entre archens et une protobactrie.

Ces bactries interviennent dans les boues rsiduelles

LADN mitochondrial est transfr en grande quantit dans lADN nuclaire. Pour dmontrer que ce transfert existe on a pris dans une levure son gre ura3 (dltion) qui code pour luracile. Ura3 sauvage est introduit dans la mitochondrie de la levure. La mitochondrie ne produit pas duracile. On place des millions de cellules dans une boite de Ptri. On constate un ordre de grandeur de mutation spontane est gal lordre de grandeur de transfert de gne soit 10^-6.

Quand la concentration en oxygne augmente lADN mitochondrial va remplacer lADN archen. Larchen va changer ses fonctions, on va obtenir une mitochondrie comme celle actuelle. Les points faibles de cette hypothse : _la membrane des archens est compltement diffrente de celle des bactries et des eucaryotes. _on devrait avoir dans les gnes de mtabolisme un signal constant, ce nest pas le cas.

4) cycles de vie :
La notion de cycle est dfinie par un organisme cycle sexu dfini Dans un cycle sexu on a une phase n et 2n. Chez les bactries on a un nombre variable de copies. Si les eucaryotes nont quune seule copie cest cause du centromre. Chez les levures si on introduit une squence centromrique dans un plasmide qui se multipliait plus de 100 copies, il se multipliera en 1 seule copie. Il existe chez les gamtes une polarit sexuelle. Si les gamtes sont de polarits diffrentes on parle disogamte. Si les gamtes sont semblables on parle danisogamte La fusion de 2 gamtes consiste en une cytogamie et une caryogamie Le zygote est le diplode issu de la fusion Forme unicellulaire :

Haplo diplo bionte : les formes n et 2n se multiplient par mitoses Forme multicellulaire est toujours issue de mitoses. Cette forme est acquise indpendamment chez plusieurs eucaryotes. Myclium = thalle

Haplobionte : mitoses seulement en phase n Diplobionte : mitoses seulement en phase 2n (ex : homme) Homotallique : besoin dun thalle pour faire un cycle Htrothallique : besoin de 2 thalles pour faire un cycle Chez haplo et haplo-diplobionte : Il ny a que la levure de boulanger qui est homothallique. Pour cela elle change de sexe afin de donner un zygote. Htrothallique : on a les 2 sexes, on produit un zygote Lhomotallisme induit une consanguinit qui permet de faire face la distance. Chez les diplobiontes : Un thalle 2n peut faire des mioses dans certaines zones. Sil y a un seul type de gamte sur 2 thalles diffrents : htrothallique (ex : homme) sinon cest homothallique.

IV diversit du monde eucaryote

1) les unikontes
1. Amibes Poly 4 Quand les Amibes sont dans un milieu favorable elles produisent un messager chimique qui repousse les autres Amibes afin de coloniser dautres milieux. Au contraire quand le milieu est dfavorable elles produisent un autre messager chimique, et elles se regroupent et font le cycle sexu. Si les conditions sont toujours mauvaises, elles forment un pseudoplamode qui est capable de se dplacer. Si les conditions sont pires, il y a formation dun pdoncule puis dun sporange. Les parois formes deviennent des spores.

Cest un haplobionte, htrothallique ou homothallique, isogamte. Poly5 Physarum polycephalum Amibe acellulaire Haplo-diplobionte, homothallique ou htrothallique, isogamte Entamoela histolytica Unicellulaire, parasite, anarobie, ne contient pas de mitochondrie mais une structure ressemblante : mitosome = mitochondrie sans ADN mitochondrial, qui ne fait pas la phosphorylation et ne produit pas de H. Le temps de divergence des Ammibes est plus loin que le temps de divergences des champignons et animaux. 2) rgne des champignons Tous les champignons ont une paroi rsistante former de B glucanes, mannoprotines, chitine. a) champignons multicellulaires Chytridiomyctes

Poly 6 Allomyces Flagelle permet de nager, il est postrieur, il dmontre que les champignons taient flagells. Spore : forme unicellulaire de propagation Quand une spore est flagelle = zoospore Ici une cellule haplode donne un gamte mle et femelle, mais cest htrothallique Sil y a 2 polarits diffrentes cest homothallique Isogamte = gamte de la mme taille Zygomyctes

Poly 7 Rhizopus On peut trouver des homothalliques ou htrothallique Ascomyctes

Poly 8 Cycle gnral Une asque contient des ascospores, sa paroi dorigine est celle du zygote Quand il ny a pas danthridie :

Dicaryon est considr comme haplode Les hyphes dicaryotiques donnent des ascognes Prithce = fructification de champignons ascomyctes Basidiomyctes

Poly9 Fructification lors dune saison prcise en cellules dicaryotiques organises Certains sont homothalliques b. les levures Ex : saccharomyces cerevisiae protoascomyctes On a une cellule mre plus grosse que la fille (asymtrie), la cellule mre se divise environ une trentaine de fois avant de mourir, on retrouve le processus de snescence.

Cycle haplo diplo bionte, htrothallique La levure a apport la plupart des infos en gntique, biochimie, chimie molculaire Elle est en anarobie facultatif : Elle fait la fermentation tant quil y a du glucose, si la quantit est limite alors elle respire La levure produit la fermentation alcoolique

On a moins dATP en fermentant quen respirant mais la levure va plus vite en fermentant, donc le nombre dATP synthtis / seconde est plus important, il y a tout de mme un gaspillage important de glucose pour se diviser coloniser le milieu. c. les microsporidies Parasites unicellulaires obligatoires de cellules eucaryotes Poly 10 Ils contiennent peu de gnes (2000), ils contaminent de linsecte lhomme 3) les choanoflagells Poly 11 Ils sont unicellulaires. Certaines protines sont prsentes aussi dans le rgne animal On les trouve dans les rivires, mers, prs du sable, ils filtrent leau.

2 les bikontes
1) endosymbiose primaire Du rgne vgtal descend des lignes qui viennent dun vnement unique : endosymbiose Il sagit dun bikonte htrotrophe traditionnel qui a phagocyt une cyanobactrie, ce qui va devenir un plaste. Les vgtaux actuels descendent dun partenariat de 2 tres. Cet vnement est mal dat, entre 800 millions et 1,6 milliards dannes.

Les cyanobactries ont le systme photosynthtique le plus dvelopp. Elles pratiquent la photosynthse oxygnique. La cyanobactrie a chapp la phagocytose, srement en brisant la membrane de phagocytose (on ne retrouve pas de vestige de membrane de phagocytose au niveau des plastes). Il y a une continuit des membranes. La relation de symbiose consiste fournir du C la cellule eucaryote en change dazote rduit. Les cyanobactries sont diazotrophes, mais ont besoin de carbone pour fixer lazote atmosphrique, donc elles ne peuvent pas donner du carbone et fixer lazote, donc la cellule htrotrophe donne de lazote rduit. Cette relation est srement la relation de symbiose

Le systme volue progressivment : la cellule doit tre capable dadresser des protines dans le compartiment pour que ce soit un organite. Avant lorganite on a un endosymbionte. Les endosymbiotes ne font pas forcment des organites. (Ex chez les insectes) La mcanique dimportation est constitue essentiellement de protines. Ce systme a mis plusieurs millions dannes se mettre en place. Lorganite est appel plaste : on retrouve les chloroplastes, rhodoplaste et cyanelle.

La chlorophylle dans lantenne permet de collecter lnergie lumineuse La nature des antennes diffrencie les chloroplastes, rhodoplastes et cyanelle ainsi que la couleur Le gradient de pH conduit la synthse dATP avec la production de NADPH, ceci se fait grce au couplage PSI cytb6f PSII, on ne retrouve pas les mmes chez les autres bactries NADPH et ATP font tourner le cycle de Calvin dans lequel le Co2 est captur par la rubisco et il y a synthse avec C5 + C de 2 molcules en C3, molcules de phosphoglycrate. Elle ncessite indirectement la lumire. La rubisco a volu dans une atmosphre sans O2, elle est extrmement sensible lO2. Les antennes capturent la lumire, elles sont soit en priphrique soit dans le PS Au cur du PS on trouve de la chlorophylle a, dans les antennes on trouve des carotnodes et des phycobilisomes. Poly 8 Phybobilisomes = phycorythrine + phycocyanine + allophycocyanine, ils permettent de couvrir un large spectre dabsorption Les cyanobactries sont bleues cause des pigments, mais elles ne le sont pas toutes, il y a quand mme de la chlorophylle. Certaines sont rouges, brunes, vertes. Les glaucophytes gardent lorganisation des antennes

Les rhodophytes gardent les phycobilisomes avec une richesse en phycorythrine. Elles ont invent au PSI un nouveau systme dantenne : LHC (complexe qui capture la lumire), on trouve de la chlorophylle b au niveau des antennes du PSI _chlorophytes perdent les phycobilisomes et les remplacent par une gamme de la famille LHC : chlorophylle a, b et carotnodes Les proprits de collecte de lumire sont donc diffrentes, cela explique que les organismes colonisent diffrents milieux. Glaucophytes :

On ne connat pas de cycle sexu. Lhypothse quils sont asexus explique leur volution lente. Les glaucophytes ressemblent plus lanctre commun des 3 branches, ce sont des plantes bleues. Le plaste ressemble une cyanobactrie, chez les autres ils ont perdu la paroi entre les 2 membranes. Il y a un changement de mode de concentration du carbone organique. La cyanelle contient un carboxyzome qui contient une enzyme (anhydrase carbonique) qui permet de transformer le CO2 partir des sels de carbonate. La paroi permet de ne pas exploser cause des diffrences de pression osmotique Chez la cyanelle on trouve un ADN de 150kpb On trouve des glauconphytes dans les trous deau prs des tourbires pH acide. Il y en a peu dans le domaine marin, pas du tout sur terre. Rhodophytes :

On les trouve dans tous les environnements marins et eau douce. Au niveau volutif, les rhodophytes sont des substrats pour lendosymbiose secondaire, donnant de grandes lignes. Elles sont trs importantes

2) Endosymbiose secondaire :

Les algues rouges vont disparatre totalement, il ne restera que 4 membranes : _membrane externe du plaste _membrane interne du plaste _membrane plasmique de lalgue _membrane de phagocytose On sen rend compte facilement avec les compositions lipidiques des membranes Le plaste lintrieur contient 4 membranes, tous ceux qui ont 4 membranes ne sont pas des vgtaux. Idem pour les algues vertes, on ne sait pas le nombre exact dendosymbiose, on tend rduire le nombre car cest un phnomne plutt rare Les organismes qui descendent des endosymbioses secondaires des rhodophytes sont trs importants, on trouve les chromistes, et les alvols. Certaines algues vertes et rouges ont perdu la capacit de photosynthse, on parle dalgues blanches Tout ce qui vient de lendosymbiose secondaire nest pas un vgtal. Les endosymbioses dalgues vertes ont donn : les euglnes et les chlorarachniophytes (maintien dun nuclomorphe, avec 3 petits chromosomes, unicellulaire) Les antennes dalgues brunes ressemblent aux antennes dalgues rouges, ils ont invent dautres pigments. 3) glaucophytes Le plus tudi est cyanophora paradoxa Ils nont pas de sexe, tous unicellulaires, nont pas volu, vivent dans les eaux prs des tourbires. Il existe une douzaine despces dcrites 4) rhodophytes Poly 9 _cyanidiales : on les trouve prs des sources chaudes, pH acide, avec une salinit importante. Ce sont les plus primitifs, ils sont unicellulaires, ils font la photosynthse. _porphyridiales : unicellulaires, marins _bongiales : complexit intermdiaire _florideo : les plus volus, multicellulaires Il ny a pas de paroi au niveau des rhodoplastes, ils nont jamais de flagelle. On trouve des phycobilisomes et chlorophylle b au niveau des antennes. La paroi est trs complique et rsistante, elle contient les polymres de galactoses = galactanes parois dans lesquelles il y a lagarose Les algues rouges vivent une certaine profondeur car elles supportent mal lexcs de lumire Poly 10 et 11

5) chlorophytes Monde vari qui a colonis beaucoup denvironnements Il y a 3 grands types de lignes : _prasinophytes : Ils ont diverg en premier, ils sont trs primitifs, avec des flagelles, ce sont des unicellulaires. _chlorophytes : unicellulaire ou multicellulaire (qui ont une organisation trs varie), flagell _streptophytes : progressivement non flagell, correspondent ceux qui donnent naissance aux vgtaux terrestres. Lorganisation de la paroi a fait la diffrence. Ils ont une paroi de plus en plus identique celle des vgtaux terrestres. 6) Les alvols : _cilis _api complexes : plaste non photosynthtiques, ont le plus petit gnome deucaryote connu _dinoflagells : synthtisent des toxiques, font des symbioses avec des coraux, ont le plus gros gnome eucaryote connu Leurs membranes sont indpendantes En dessous de la membrane plasmique il y a des sacs membranaires = alvoles (Remplis de polysaccharides = armures)

7) Les chromistes : Ils ont une dissymtrie dans la longueur des flagelles. _cryptophytes : unicellulaires, poussent au fond des ocans (pigments), la structure des antennes dtermine la colonisation des milieux. Ils se rapprochent des algues rouges, on trouve un noyau vestige de lalgue rouge qui a fortement rgress = nuclmorphe, il est form de 3 petits chromosomes. _haptophytes : unicellulaire important sur le plan cologique, ils ont un grand rle au niveau du cycle du carbone. Poly 12 et 13 2HCO3 - + Ca2+ CaCO3 + CO2 + H2O Coccolites (carapace seulement) : continues (holococcolites) ou en plaques, vont sdimenter et former la craie et le calcaire. Leur paroi les protge et permet de concentrer le C inorganique. Les coccolites prolifrent plus dans les eaux chaudes, ils forment leur plaque au niveau dun sac membranaire.

_stramnopiles : oomyctes, algues brunes, diatomes Fusion de la membrane du rticulum endoplasmique et la membrane de phagocytose. (Elles ont une composition lipidique trs proche) Oomyctes et algues brunes sont multicellulaires. Les oomyctes sont non photosynthtiques, ce sont des parasites de plantes et poissons. Les algues brunes ont une dissymtrie des flagelles trs marque (htrochontes) Les diatomes sont unicellulaires, importants dans le cycle de la silice, ils fixent le plus de CO2