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DNA plasmidico

Dibujo esquemático de un plásmido en una bacteria: en rojo, el ADN del


cromosoma; en azul, los plásmidos.

Los plásmidos, vectores o también llamados plasmidios, son moléculas de


ADN extracromosómico circular o lineal que se replican y transcriben
independientes del ADN cromosómico. Están presentes normalmente en
bacterias, y en algunas ocasiones en organismos eucariotas como las
levaduras, aparecen en el citoplasma de las bacterias. Su tamaño varía
desde 1 a 250 pb. El número de plásmidos puede variar, dependiendo de su
tipo, desde una sola copia hasta algunos cientos por célula.

Determinan ciertos rasgos, que no son vitales, pero que de alguna manera
determinan la capacidad del organismo para adaptarse. Estas moléculas de
ADN portan solamente unos pocos genes que en cierto modo están ligados
al cromosoma bacteriano, de forma que se replican en números fijos, junto
con los cromosomas.
Las moléculas de ADN plasmìdico, adoptan una conformación tipo doble
hélice al igual que el ADN de los cromosomas, aunque, por definición, se
encuentran fuera de los mismos. Se han encontrado plásmidos en casi todas
las bacterias. A diferencia del ADN cromosomal, los plásmidos no tienen
proteínas asociadas.

Poseen información genética importante para las bacterias. Por ejemplo, los
genes que codifican para las proteínas que las hacen resistentes a los
antibióticos están, frecuentemente, en los plásmidos.
Hay algunos plásmidos integrativos, es decir, que tienen la capacidad de
insertarse en el cromosoma bacteriano. Estos rompen momentáneamente el
cromosoma y se sitúan en su interior, con lo cual, automáticamente la
maquinaria celular también reproduce el plásmido. Cuando ese plásmido se
ha insertado se les da el nombre de episoma.

Los plásmidos se utilizan en ingeniería genética por su capacidad de


reproducirse de manera independiente del ADN cromosomal como así
también por que es relativamente fácil manipularlos e insertar nuevas
secuencias genéticas. Los plásmidos usados en Ingeniería Genética suelen
contener uno o dos genes que les confieren resistencia a antibióticos y
permiten seleccionar clones recombinantes, los basados en fluorescencia o
en proteínas que destruyen las células sin uso de antibióticos. Los
plásmidos a menudo contienen genes o paquetes de genes que le confieren
una ventaja selectiva lo cual les da la habilidad de hacer a la bacteria,
resistente a los antibióticos.
Cada plásmido contiene al menos una secuencia de ADN que sirve como un
origen de replicación u ORI (un punto inicial para la replicación del ADN), lo
cual habilita al ADN para ser duplicado independientemente del ADN
cromosomal. Los plásmidos de la mayoría de las bacterias son circulares,
pero también se conocen algunos lineales, los cuales reensamblan
superficialmente los cromosomas de la mayoría de eucariotes.
Tipos
Una forma de agrupar plásmidos es por su habilidad de transferirse a otra
bacteria.
• Los plásmidos conjugativos contienen “tra-genes”, los cuales
ejecutan complejos procesos de conjugación, como la transferencia
sexual de plásmidos a otra bacteria.
• Los plásmidos no-conjugativos, son incapaces de iniciar una
conjugación, de allí que ellos pueden transferirse únicamente con la
asistencia de los plásmidos conjugativos y lo hacen “por accidente”.
• Una clase intermedia de plásmidos son los “movilizables” los
cuales llevan solo un subtipo de genes requeridos para la
transferencia. Ellos pueden “parasitar” un plásmido conjugativo,
transfiriéndose a una alta frecuencia solo en su presencia.

Otra forma de clasificar plásmidos es por función. Hay 5 clases principales:


• Plásmidos de fertilidad: los cuales contienen tra-genes, ellos son
capaces de conjugarse.
• Plásmidos de resistencia: los cuales contienen genes que pueden
constituir resistencia contra antibióticos o venenos. Históricamente
conocidos como Factores R, antes de que se entendiera la naturaleza
de los plásmidos.
• Col-plásmidos: los cuales contienen genes que codifican
(determinan la producción de) colinas y proteínas que pueden matar
a otra bacteria.
• Plásmidos degradativos: los cuales habilitan la digestión de
sustancias inusuales como tolueno o ácido salicílico.
• Plásmidos virulentos: los cuales convierten la bacteria en un
patógeno.

Conformaciones
El ADN plásmido puede aparecer en uno de cinco conformaciones, las
cuales (para un tamaño dado) corren a diferentes velocidades en un gel
durante electroforesis. Las conformaciones se muestran abajo en orden de
movilidad electroforética (velocidad para un voltaje dado), del más lento al
más rápido:

• Mellado abierto circular: el ADN tiene un solo corte filamentario.


• Lineal: ADN tiene terminales libres, ya sea porque los filamentos
fueron cortados o porque el ADN era linear in vivo. Usted puede
modelar este como un cordón que no se ha conectado así mismo.
• circular relajado: ADN que interactúa completamente con ambos
filamentos sin cortar, pero que ha sido enzimáticamente “relajado”.
Usted puede modelar este dejando un cordón relajado y luego
conectándolo a sí mismo.
• superespiral desnaturalizado: ADN como el ADN superespiral o
superenrollado (ver más abajo), pero que tiene regiones sin unir que
lo hacen ligeramente menos compacto; esto resulta de una excesiva
alcalinidad durante la preparación del plásmido.
• ADN superespiral: Es un ADN totalmente intacto con los filamentos
sin cortar, y con forma de remolino, resultando en una forma
compacta.

En el caso de una infección viral, el uso indebido o innecesario de


antibióticos matará a la población bacteriana normal, quedando (o
seleccionando) las que tengan el factor R; éstas pueden reproducirse aún en
presencia del antibiótico. La próxima vez que tenga una infección
bacteriana, las bacterias con factores R estarán listas para transferir su
factor a la nueva bacteria invasoras, que se harán resistentes a los
antibióticos.

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