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DEPARTAMENTO ACADMICO DE CIENCIAS BSICAS









Gua de Seminarios

BIOLOGA CELULAR Y MOLECULAR
2014-II



Personal Docente :
Bil. Lezama Vigo, Hlmer, MSc. (Responsable)
Bil. Nolasco Crdenas, Oscar, MSc. (Coordinador)
Md. Amanzo Lpez, Csar. (Coordinador de seminarios)
Bil. Jer Apaza, Csar. (Coordinador de prcticas)
Bil. Murrugarra Bringas, Victoria. (Coordinador de tutoras)
Md. Mena Navarro, Cecilia.
Bil. Quintana Cceda, Milagros, MSc.
Md. Lapa Salinas, Yolanda, Mg
Q.F. Barreto Yaya, Danilo.
Bil. Alata Linares, Vicky, Mg
Bil. Velarde Vlchez, Mnica.
Bil. Cervantes Snchez, Wilmer
Q.F. Ramrez Rojas, Luisa
Bil. Snchez Dvila, Johanna. MSc.
Bil. Vicente Vicente, Nlida. Dr.
Md. Gutirrez Aures, Ysabel
Bil. Fujita Alarcn, Ricardo, PhD.




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INTRODUCCIN


La gua de seminarios del curso de Biologa Celular y Molecular tiene como objetivo
fomentar en el estudiante la lectura cientfica y el razonamiento de casos prcticos y
reales relacionados con las bases tericas.

Esta gua rene una lista de preguntas relacionadas con cada tema expuesto en la
conferencia magistral terica. Dichas preguntas sern resueltas por los alumnos
durante cada sesin de seminarios, con la tutora del profesor y valindose de la
bibliografa recomendada en el syllabus y sugerida por cada profesor as como de
informacin actualizada reunida por el alumno. Al final de cada seminario el alumno
debe ser capaz de razonar y resolver cuestionamientos aplicativos similares a los
desarrollados en el seminario.

La gua se ha dividido en 3 partes de acuerdo a cada evaluacin parcial. La primera
parte comprende la clula y componentes celulares. La segunda parte incluye procesos
celulares. La tercera parte trata sobre la genmica y las tcnicas moleculares.

Se tomar un paso corto al inicio de cada seminario, basado en los temas a tratar ese
mismo da. El alumno debe contar con su respectiva bibliografa (libros, artculos
cientficos, separatas, etc.) previamente revisada para solucionar cada seminario en
forma activa durante la clase.

Los alumnos formaran grupos de 4 a 5 personas y deben traer resueltas las preguntas
del cuestionario. As mismo, el grupo responsable del tema de la semana debe
presentar un resumen del artculo cientfico de revisin y presentarlo en Power Point a
sus compaeros de clase.

La duracin del seminario es de dos horas acadmicas (45 minutos cada hora).





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PAUTAS PARA EL DESARROLLO DE LOS SEMINARIOS

CONCEPTO DE SEMINARIO:
El Seminario es una actividad acadmica, que tiene como propsito principal introducir
al estudiante de nivel superior en la reflexin y prctica investigativa, al tiempo que
contribuye al avance del saber en su rea. El seminario es una actividad de aprendizaje
activa y colaborativa, centrada en el trabajo del estudiante.

Es una tcnica de capacitacin grupal, en la que participan todos los integrantes y
estudian intensivamente un tema en sesiones planificadas recurriendo a fuentes
originales de informacin.

OBJETIVOS DEL SEMINARIO:
1. Investigar, analizar y estudiar un tema para sacar conclusiones aprobadas por
todos los asistentes.
2. Desarrollar habilidades de bsqueda de informacin, interpretacin y sntesis de
la misma.
3. Fomentar el trabajo en grupo.*
4. Desarrollar la capacidad de comunicacin cientfica y sustentacin oral de un
tema cientfico.
*Trabajar en grupo no es realizar varias partes de forma independiente y fusionarlas al final. Es preparar y
discutir el esquema, analizar los contenidos, valorar y opinar sobre la literatura revisada e integrar los
conceptos obtenidos (todos los miembros del grupo deben conocer todo el tema).

NORMAS PARA LA REALIZACIN DE UN SEMINARIO:
1. Los seminarios son de realizacin obligatoria.
2. El profesor facilitar la realizacin de cada seminario.
3. Los temas sern propuestos por el profesor, en forma de cuestionarios.
4. Los temas propuestos en el cuestionario sern incorporados en un mapa
conceptual hecho a mano y entregados individualmente al inicio del seminario
correspondiente.
5. En la parte posterior del Mapa Conceptual se citarn las fuentes
consultadas (libros, artculos de revisin y otros recursos) siguiendo el
estilo Vancouver:
http://www.medicc.org/mediccreview/documents/requisitos-de-
uniformidad-para-manuscritos.pdf
6. Los temas sern asignados a los grupos de alumnos (3 o 4 integrantes)
conformados al inicio del curso para ser expuestos y presentados durante el
desarrollo de los seminarios siguiendo un orden correlativo.
7. La presentacin y el desarrollo de los cuestionarios fomentar la discusin con la
participacin de los alumnos de la seccin.

MECNICA DEL TRABAJO DE SEMINARIO:
1. Duracin del seminario: dos (02) horas acadmicas (45 minutos cada hora).







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DISTRIBUCION DEL TIEMPO DURANTE EL SEMINARIO
Tiempo
(minutos)
Parte del Seminario
10 Registro de asistencia (10 minutos de tolerancia). VoBo
de Mapas Conceptuales.
10 Paso corto.
50 Desarrollo de cuestionario y discusin.
(Aproximadamente cada pregunta se resolver en 10
minutos).
10 Presentacin y discusin de Lecturas.
Entrega de Mapas Conceptuales

Los docentes estn en la obligacin de brindar la ayuda necesaria que requieran los
alumnos para que el desarrollo de cada una de las actividades del seminario sean
resueltas de la mejor manera posible.

PRESENTACIN DEL MAPA CONCEPTUAL:
1. El Mapa Conceptual debe ser manuscrito, individual y se presentar al iniciar
cada sesin para el visto bueno (VoBo) del Docente de Seminario. (Durante el
paso corto el Docente coloca una firma en el Mapa conceptual elaborado que
permitir reconocer que fue realizado previamente).
2. El Mapa Conceptual se elaborar en una hoja de papel bond A4, empleando
diversos colores, una buena caligrafa y ortografa.
3. El tema del Mapa Conceptual es el considerado en las preguntas del seminario y
la lectura.
4. El Mapa conceptual pre-elaborado podr ser enriquecido a lo largo del seminario,
a medida que se realice la discusin de las preguntas (no significa realizar el
mapa conceptual durante el desarrollo del seminario).
5. Al finalizar el Seminario se entregaran los Mapas Conceptuales de elaboracin
individual.

CALIFICACIN DE LA PARTICIPACIN ORAL:
Un grupo de alumnos presentara el tema de la sesin y dirigir la discusin. Se
resolvern las preguntas del cuestionario con la participacin de los asistentes. La
intervencin es personal, se responde a la pregunta, se argumenta, se cuestiona, o se
corrige, se fomenta una discusin sobre la misma.

Se valorar:
1. Presentacin. Claridad y orden. Capacidad de sntesis en la presentacin del
tema. (Respecto al tiempo designado).
2. Discusin, claridad, orden, vocabulario.
3. Actitud y motivacin durante el desarrollo del seminario.
4. Puntualidad, consultas realizadas al profesor, integracin del equipo.
5. Conducta durante el desarrollo del seminario.







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MODELO EDUCATIVO POR COMPETENCIAS: DIMENSIONES PARTICIPANTES*
10%
PUNTOS PONDERACION
ACTITUDINAL DEFICIENTE REGULAR BIEN
PUNTUALIDAD 0 a 5 0 2.5 5

PRESENTACION MAPA
CONCEPTUAL.
0 a 5 0 2.5 5
ACTITUD 0 a 10 0 5 10
50%
CONCEPTUAL
PASO CORTO 0 a 20

40%
PROCEDIMENTAL
PARTICIPACION 0 a 5 0 2.5 5

EXPOSICION CONTRIBUCION
MAPA CONCEPTUAL.
0 a 5 0 2.5 5

DISCUSION
0 a 10 0 5 10
* Evaluacin que se llevara a cabo semana a semana

EVALUACIN DE LOS PASOS CORTOS:
1. Al inicio de cada sesin se tomar una Prueba Escrita de 4 5 preguntas sobre
el tema del seminario, la que incluir conceptos de las clases tericas
relacionadas al tema.
2. Se calificar con cero (00) al alumno que no est presente y no rinda el paso
corto.
3. Todo PASO CORTO NO RENDIDO, no se podr recuperar.


CALENDARIO Y TEMAS DE SEMINARIOS
Semana Tema
1 Distribucin de grupos de trabajo
2 Origen y evolucin de las clulas.
3 Composicin y organizacin molecular de la membrana celular.
4 Citoplasma, Citoesqueleto, matriz extracelular.
5 Motilidad no muscular. Huso acromtico.
6 Mitocondrias. ADN mitocondrial.
7 Lisosomas. Muerte celular. Apoptosis y necrosis.
8 EXAMEN PARCIAL
9 Transporte intracelular.
10 REPASO
11 Molculas de relacin celular
12 Recepcin celular. Mecanismos moleculares.
13 Replicacin del ADN. Reparacin del ADN.
14 De gen a protena.
15
Regulacin genmica. Clulas madre. Clonacin. Protena verde
fluorescente.
16 EXAMEN FINAL





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SEMANA 1


INTRODUCCIN


1. Orientacin en relacin a la dinmica de los Seminarios.
2. Calificacin del seminario.
3. Mapas conceptuales aspectos bsicos para su elaboracin.
4. Formacin de grupos de trabajo.
5. Distribucin de temas.




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SEMANA 2

SEMINARIO N 1
ORIGEN Y EVOLUCION DE LAS CLULAS

1. Cules fueron las probables condiciones de la atmsfera y de la tierra hace
aproximadamente 3,500 millones de aos atrs? Cmo relaciona este hecho
con el experimento de Miller y Urey?

2. La controversia entre los partidarios de las teoras heterotrficas y teoras
autotrficas sobre el origen de los primeros organismos vivos contina. Usted
por qu teora se inclina?, explique.

3. Qu sabe de la hiptesis del mundo ARN? Explique.

4. Averige el significado de los siguientes trminos y explique sus caractersticas
principales:
Reino monera. Reino Protista. Reino Fungi. Reino plantae. Reino animal.
Virus.
Prin.



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SEMANA 3

SEMINARIO N 2

COMPOSICIN Y ORGANIZACIN MOLECULAR DE LA MEMBRANA CELULAR.

1. Las propiedades de una bicapa lipdica se determinan por las estructuras de sus
molculas de lpidos. Predecir las propiedades de las bicapas lipdicas que
resultaran si lo siguiente fuera cierto:
A. Los fosfolpidos slo tienen una cadena de hidrocarburo en lugar de dos.
B. Las cadenas de hidrocarburos son ms cortos de lo normal, digamos de
unos 10 tomos de carbono de longitud.
C. Todas las cadenas de hidrocarburos son saturadas.
D. Todas las cadenas de hidrocarburos son insaturados.
E. La bicapa contiene una mezcla de dos tipos de molculas lipdicas, uno
con dos colas de hidrocarburos saturados y el otro con dos colas de
hidrocarburos insaturados.
F. Cada molcula de lpido se une covalentemente hasta el tomo de
carbono final de una de sus cadenas hidrocarbonadas a una molcula
lipdica en la monocapa opuesta.

2. Debido a que caracterstica una porina (una protena presente en bacterias y
en la membrana externa mitocondrial) puede atravesar la membrana celular?
Seale adems la diferencia con una protena que atraviesa la membrana con
un hlice alfa.

3. Ordene las molculas en la siguiente lista en funcin de su capacidad para
difundir a travs de una bicapa lipdica, empezando por la que atraviesa la
bicapa con mayor facilidad. Explique su orden.
a. Ca
2++

b. CO
2

c. Etanol
d. Glucosa
e. ARN
f. H
2
O

4. Describa las propiedades de las tres clases de protenas de membrana (integral,
perifrica y lpidos anclado), cmo se diferencian unos de otros, y la forma en
que varan entre s.




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SEMANA 4

SEMINARIO N 3

CITOPLASMA, CITOESQUELETO, MATRIZ EXTRACELULAR.

1. En una clula animal tpica, Cul de los siguientes compartimentos es el ms
grande? Qu compartimento est presente en mayor nmero? Fundamente su
respuesta.
a. Citosol.
b. Retculo endoplsmico.
c. Endosoma.
d. Aparato de Golgi.
e. Lisosoma.
f. Mitocondria.
g. Ncleo.
h. Peroxisoma.

2. En cul de los siguientes tipos de clulas Usted espera una alta densidad de
filamentos intermedios citoplasmticos? Explique su respuesta.
a. Amoeba proteus (una ameba de vida libre).
b. Clula epitelial de la piel humana.
c. Clula muscular lisa en el tracto digestivo de un vertebrado.
d. Clula nerviosa en la mdula espinal de un ratn.
e. Espermatozoide humano.
f. Clula vegetal.

3. Cul de los siguientes cambios tiene lugar cuando el msculo esqueltico se
contrae?
a. Discos Z se mueven y se alejan ms.
b. Los filamentos de actina se contraen.
c. Los filamentos de miosina se contraen.
d. Los sarcmeros se acortan.

4. Las cadenas de polisacridos de glicosaminoglicanos que se vinculan a las
protenas centrales especficas para formar los proteoglicanos de la lmina basal
que se encuentran altamente cargados negativamente. Cmo cree que estas
cadenas de polisacridos cargados negativamente ayudan a establecer un
entorno similar a un gel, hidratado alrededor de la clula? Cmo podran las
propiedades de estas molculas diferir si las cadenas de polisacridos se
encontraran sin carga?.



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SEMANA 5

SEMINARIO N 4

MOTILIDAD NO MUSCULAR. HUSO ACROMTICO.

1. Cmo es posible que una misma vescula sea transportada a lo largo de
microtbulos y microfilamentos?

2. Describa los pasos tomados por una clula de mamfero al arrastrase sobre un
sustrato.

3. La concentracin de actina en las clulas es 50 - 100 veces mayor que la
concentracin crtica observado para la actina pura en un tubo de ensayo.
Cmo es esto posible? Qu impide que las subunidades de actina en las
clulas se polimericen en filamentos? Por qu es VENTAJOSA para la clula
mantener un gran nmero de subunidades de actina?

4. Cmo se estructura el huso acromtico? Cul es su funcin? Qu sucede en
una clula en interfase?

5. Averige que sucede a nivel molecular en la enfermedad de los cilios inmviles.









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SEMANA 6

SEMINARIO N 5

MITOCONDRIAS. ADN MITOCONDRIAL


1. La cadena respiratoria es relativamente inaccesible a la manipulacin
experimental en mitocondrias intactas. Despus de perturbar a la mitocondria
con ultrasonido, es posible aislar partculas sub-mitocondriales funcionales, las
que consistirn en crestas rotas que se han vuelto a sellar al revs en pequeas
vesculas cerradas. En estas vesculas los componentes que originalmente se
encontraban hacia la matriz mitocondrial estn ahora expuestas al medio
circundante. Cmo cree que una disposicin de este tipo podra ayudar en el
estudio del transporte de electrones y la sntesis de ATP?

2. Compare las propiedades y la historia evolutiva de las membranas
mitocondriales interna y externa; el espacio inter-membrana y la matriz.

3. De los cinco tipos de transportadores de electrones, Quin tiene la masa
molecular ms pequea? Cul tiene mayor relacin entre tomos de hierro a
electrones transportados? Cul tiene un componente que se encuentra fuera
de la bicapa lipdica? Cules son capaces de aceptar protones y electrones y
cules slo electrones?

4. En qu son los peroxisomas similares a las mitocondrias? En qu manera son
nicas?

5. Mencione las diferencias estructurales y funcionales entre la membrana
mitocondrial interna y externa. Mencione las caractersticas del ADN mitocondrial
que lo diferencian del ADN nuclear y explique cmo se hereda.




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SEMANA 7

SEMINARIO N 6

LISOSOMAS. MUERTE CELULAR. APOPTOSIS Y NECROSIS.

1. Describir los eventos que se producen durante la destruccin autofgica de una
mitocondria.

2. Cules son algunas de las funciones de la apoptosis en la biologa de los
vertebrados?

3. Describir los pasos que se producen entre (a) el tiempo que una molcula de
Factor de Necrosis Tumoral (TNF) se une a su receptor y la eventual muerte de
la clula y (b) el tiempo de una protena proapopttica Bcl-2 se une a la
membrana mitocondrial externa y la muerte celular.

4. Fjense bien en las micrografas electrnicas. Describa las DIFERENCIAS entre
la clula que muri por necrosis y la que muri por apoptosis. Cmo las
imgenes confirman las diferencias entre los dos procesos? Explique su
respuesta.




Necrosis Apoptosis




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SEMANA 9

SEMINARIO N 7

TRANSPORTE INTRACELULAR.

1. Describa los pasos que se producen entre el momento en un ribosoma se
une a un ARN mensajero que codifica una protena de secrecin y el
momento en que una protena abandona el Retculo Endoplsmico Rugoso
(RER).

2. Cmo logra una protena integral recin sintetizada insertarse en una
membrana?

3. Describa algunas de las maneras en que las organelas membranosas
pueden mantener sus composiciones nicas a pesar del continuo trfico de
membranas y materiales que se desplazan a travs de ellas.

4. Cmo son dirigidas las protenas recin sintetizadas a determinados
compartimentos subcelulares especficos? Averige cmo una protena
despus de su sntesis en los polirribosomas llega al interior de la matriz
mitocondrial.

5. Qu determina la especificidad de la interaccin entre una vescula de
transporte y el compartimento de la membrana con la que se va a fundir?
Cmo son las protenas SNARE involucrados en el proceso de fusin de
membranas?




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SEMANA 11

SEMINARIO N 8

MOLCULAS DE RELACIN CELULAR

1. Qu tipo(s) de las uniones celulares contienen filamentos de actina?
Quin(es) contienen(s) filamentos intermedios? Quin(es) contienen(s)
integrinas? Quin(es) contiene(n) cadherinas?

2. Comparar la disposicin de las protenas integrales de la membrana en una
unin estrecha (tight junction) contra unas uniones comunicantes (gap
junction).

3. Se requiere una fuerza de unos 20 piconewtons (pN) para tirar de una
protena transmembrana como P-selectina de una bicapa lipdica pura. Para
tirar de una molcula de P-selectina fuera de la membrana plasmtica se
requiere ms de 110 pN. Por qu crees que se necesita mucha ms fuerza
para tirar de P-selectina fuera de la membrana plasmtica que fuera de una
bicapa lipdica?

4. Contraste los papeles del colgeno y proteoglicanos en el espacio
extracelular. Cmo la fibronectina y laminina contribuyen al desarrollo
embrionario?

5. Explique qu sucede a nivel molecular cuando un leucocito migra desde el
interior de un vaso sanguneo hacia el espacio intercelular.








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SEMANA 12

SEMINARIO N 9

RECEPCIN CELULAR. MECANISMOS MOLECULARES.

1. Las clulas se comunican de maneras que se asemejan a la comunicacin
humana. Decida cul de las siguientes formas de comunicacin humana son
anlogas a la comunicacin autocrina, paracrina, endocrina, y la sealizacin
sinptica de las clulas, explique:
a. Una conversacin telefnica.
b. Hablar con personas durante una fiesta.
c. Un anuncio en la radio.
d. Hablar consigo mismo

2. Qu entiende por transduccin de la seal? Seale ejemplos.

3. Cmo el uso de una cascada de reaccin resulta en la amplificacin de una
seal? Cmo aumenta las posibilidades de regulacin metablica?

4. Cul es el mecanismo de la formacin del segundo mensajero Inositol tri-
fosfato (IP
3
)? Cul es la relacin entre la formacin de IP3 y una elevacin
de calcio intracelular? Cmo es que la concentracin calcio inico (Ca
+2
) del
citosol se mantiene a un nivel tan bajo? Cmo afecta el cambio de
concentracin calcio inico en respuesta a los estmulos?

5. Los receptores nucleares tienen un sitio de unin para una molcula seal y
para una secuencia de ADN. Cmo es posible que receptores nucleares
idnticos en diferentes clulas puedan activar genes diferentes cuando se
unen a una misma molcula seal?








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SEMANA 13

SEMINARIO N 11

REPLICACIN DEL ADN. REPARACIN DEL ADN.

1. Describir el mecanismo de accin de las ADN polimerasas que operan en las
dos hebras del ADN y el efecto que esto tiene en la sntesis de la hebra
rezagada en comparacin con el hebra principal.

2. Suponga que usted es incapaz de reparar el dao en el ADN causado por la
prdida de bases de purina. Este defecto causa la acumulacin de unas
5.000 mutaciones por da en el ADN de cada una de sus clulas. Como la
diferencia promedio en las secuencias de ADN entre humanos y chimpancs
es de aproximadamente 1%, es slo cuestin de tiempo hasta que te
conviertes en un chimpanc. Qu es lo incorrecto en este argumento?

3. De qu manera las dos actividades de exonucleasa de la ADN polimerasa I
se diferencian unas de otras Cules son sus respectivas funciones en la
replicacin?

4. Contraste los acontecimientos de la reparacin por escisin de nucletidos y
la reparacin por escisin de base.

5. Por qu es importante en la reparacin de genes que la clula distinga las
cadenas parentales de las cadenas recin sintetizadas Cmo se logra esto?















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SEMANA 14

SEMINARIO N 12

DE GEN A PROTENA.

1. Describir las diferencias entre un transcrito primario, una unidad de
transcripcin, un espaciador de transcrito, y un ARNr maduro.

2. Cules son los pasos generales en el procesamiento de un pre ARNm en
un ARNm? Cul es el papel de los snRNPs y de los espliceosomas?

3. Qu es un polirribosoma? De qu manera su formacin difiere en
procariotas y eucariotas?

4. Durante elongacin de la traduccin, se puede decir que un aminocil-ARNt
entra en el sitio A, un peptidil-ARNt entra en el sitio P, y un ARNt desacilado
entra en el sitio E. Explicar cmo se produce cada uno de estos eventos.

5. Investigue sobre las chaperonas y chaperoninas y su relacin la protena
naciente. Qu sucedera en el interior de las clulas si no existirn
chaperonas ni chaperoninas?












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SEMANA 15

SEMINARIO N 13

REGULACIN GENMICA. CLULAS MADRE. CLONACIN.

1. Describir los componentes que forman la envoltura nuclear. Cul es la
relacin entre las membranas nucleares y el complejo del poro nuclear?
Cmo funciona el complejo del poro nuclear al regular el movimiento
bidireccional de materiales entre el ncleo y el citoplasma? Qu son la
importinas y las exportinas?

2. Cul es la diferencia en la estructura y la funcin entre heterocromatina y
eucromatina? Entre heterocromatina constitutiva y facultativa? Entre un
cromosoma X activo e inactivo en una clula de mamfero hembra? Cmo
es el cdigo de histonas un determinante del estado de un regin cromatina?

3. Cmo el cdigo de histonas es un factor determinante del estado de una
regin de la cromatina?

4. Cul es la diferencia en la estructura y funcin entre los centrmeros y
telmeros de un cromosoma?

5. Investigue sobre las implicancias para la medicina humana de las clulas
madre, la clonacin de animales y el desarrollo de la protena verde
fluorescente.