EduardoPetro .

En el proceso operativo y funcional de la PCR, que papel cumplen la electroforesis y el

espectrofotmetro, especificando los pozos controles y marcadores en el gel.
La electroforesis en gel es una tcnica sencilla empleada de forma rutinaria en laboratorio para
separar molculas biolgicas especialmente ADN, ARN y protenas. Permite separar especies
qumicas (cidos nucleicos o protenas) a lo largo de un campo elctrico en funcin de su tamao y
de su carga elctrica. Los cidos nucleicos, ADN y ARN, tienen por naturaleza carga negativa. se
puede usar para comparar muestras de individuo sano frente a individuo enfermo, para la
identificacin de cidos nucleicos de agentes infecciosos o para la obtencin de un fragmento
determinado de ADN que, una vez localizado en el gel, puede ser extrado para anlisis posteriores
2. Explique el modelo de transfeccin (Trasformacin e infeccin) de Agrobacterium
tumefaciens en plantas.
Agrobacterium es una bacteria Gram negativa, capaz de infectar plantas dicotiledneas, a travs
de heridas, e inducir la formacin de agallas en las plantas infectadas. Las cepas virulentas de
Agrobacterium contienen un plsmido, denominado Ti (Tumor-inducing) de un tamao que vara
entre los 130 y los 230 kb. El plsmido Ti determina las caractersticas de la agalla y la produccin
de aminocidos. Las plantas son incapaces de catabolizar stos aminocidos, por lo que
Agrobacterium puede desviar el metabolismo de la planta para producir compuestos que
nicamente la bacteria puede utilizar. El mecanismo de infeccin de Agrobacterium involucra la
transferencia y la integracin de una regin del plsmido Ti al genoma nuclear de la clula vegetal
Es una bacteria comn del suelo que tiene la capacidad de insertar genes en el genoma de las
plantas el plsmido de la bacteria (Agrobacterium tumefaciens) se utiliza como vector o vehculo
de transformacin dentro del genoma de la planta ,el plsmido contiene informacin que para el
proceso de trasformacin es necesario retirar. Esto se logra con la ayuda de las enzimas de
restriccin, se le inserta el transgen el cual contiene las caractersticas que queremos darle a la
planta. De este modo se obtiene un plsmido trasformado que se inserta en agrobacterium
tumefaciens , la suspensin de agrobacterium se vierte en una caja de Petri que contiene
porciones de tejido vegetal , el plsmido entra a la clula atravez de los cortes de los cortes e
insertas el transgen
3 Que son las bibliotecas genmicas, cDNA y BLAST: Basic Local Alignment Search Tool, y
finalmente que importancia tienen estos en los programas de anlisis y mejoramiento
gentico.
Una genoteca (o biblioteca genmica) no es una base de datos. Una genoteca es una coleccin de
fragmentos de DNA que sumados completan (o casi) un genoma entero. Estos fragmentos estn
alojados en plsmidos bacterianos o en virus. O sea que bsicamente es un conjunto de bacteria o
virus que portan fragmentos de DNA de un genoma de otro organismo
El ADN complementario o ADNc es un ADN de doble cadenaEl ADN complementario ADNc (cDNA)
es una molcula de ADN complementaria a una molcula de ARNm. Se genera por accin de la
enzima trasncriptasa inversa y tiene mltiples usos

Se suele utilizar para la clonacin de genes propios de clulas eucariotas en

clulas procariotas, debido a que, dada la naturaleza de su sntesis, carece de intrones.
creacin de genotecas de expresin

intrn es un fragmento de ADN que est presente en un gen pero que no codifica ningn
fragmento de la protena
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) es un programa informtico de alineamiento de
secuencias de tipo local, ya sea de ADN, ARN o de protenas. El programa es capaz de comparar
una secuencia problema (tambin denominada en la literatura secuencia query) contra una gran
cantidad de secuencias que se encuentren en una base de datos. BLAST es usado para encontrar
probables genes homlogos. Por lo general, cuando una nueva secuencia es obtenida, se usa el
BLAST para compararla con otras secuencias que han sido previamente caracterizadas, para as
poder inferir su funcin. El BLAST es la herramienta ms usada para la anotacin y prediccin
funcional de genes o secuencias proteicas. Muchas variantes han sido creadas para resolver
algunos problemas especficos de bsqueda.
4. Qu importancia tiene la tecnologa de antisentido en el mejoramiento de plantas
La tecnologa antisentido permite bloquear la biosntesis de protenas especficas en las clulas.
Aplicada al diseo de nuevas terapias, su objetivo sera bloquear la sntesis de la correspondiente
protena diana. Insertamos un gen en orientacin opuesta a la normal, lo que determina un ARN
(antisentido) que se empareja con el ARN del gen homlogo normal de la planta. Ello parece que
dificulta la traduccin de este ARNm por los ribosomas, y favorece su degradacin. De esta manera
se puede anular o inhibir el fenotipo dependiente del gen que se quiere controlar.
Ejemplo: Inhibicin gen de la poligalacturonasa en tomate: retrasa la maduracin.
5. En qu consisten las tcnicas de Southern blot y Northern blot, cul es su vigencia y las
alternativas actuales
Southern blot, hibridacin Southern o, simplemente, Southern es un mtodo de biologa
molecular que permite detectar la presencia de una secuencia de ADN en una mezcla compleja de
este cido nucleico. Para ello, emplea la tcnica de electroforesis en gel de agarosa con el fin de
separar los fragmentos de ADN de acuerdo a su longitud y, despus, una transferencia a una
membrana en la cual se efecta la hibridacin de la sonda. Su nombre procede del apellido de su
inventor, un bilogo ingls llamado Edwin Southern
Northern blot es una tcnica de deteccin de molculas de cido ribonucleico (ARN) de una
secuencia dada dentro de una mezcla compleja (por ejemplo, un ARN mensajero para
un pptidodado en una extraccin de ARN total). Para ello, se toma la mezcla de ARN y se somete
a una electroforesis en gel a fin de separar los fragmentos en base a su tamao. Tras esto, se
transfiere el contenido del gel, ya resuelto, a una membrana cargada positivamente en la cual se
efecta la hibridacin de una sonda molecular marcada radiactiva o qumicamente
Tanto la tcnica de Southern como de Northern blot se usan poco hoy en da al haber sido
sustituidas por tcnicas derivadas de la PCR.
6. Cules son los elementos fundamentales de la transformacin gentica de plantas con
Agrobacterium

Plasmido ti obtenido en ingeniera gentica.

Celula de la planta
Celula trasnformadora
Medio cultivo .
7. Desarrolle una estrategia de conservacin y aprovechamiento de los recursos genticos
locales.
En Este modelo considerare el tamao y nmero de poblaciones, dispersin geogrfica, rareza y
singularidad.
Tomaramos la conservacin in situ, a este esquema se le podra agregar el criterio de nivel de
importancia de la especie, segn si cumple un rol en la mantencin del equilibrio en un ecosistema
y cuya eventual desaparicin provoque una cadena de extincin, este tipo de especie se designan
como especies clave
Una conservacin efectiva y eficiente, requiere aplicar la conservacin ex situ,en bancos de
germoplasma, con la conservacin in situ, en los hbitats de las especies. La conservacin ex situ
(amplio conocimiento de la especie) asegurara la variabilidad gentica de las especies en el
tiempo y la conservacin in situ, permitira la evolucin y la coevolucin natural de las especies. La
integracin de los sistemas de conservacin en los planes de desarrollo sustentable regional, con
la Participacin de las comunidades locales, permitiran garantizar la conservacin de la
biodiversidad en el tiempo y su aprovechamiento sostenible al otorgar Nuevas alternativas para el
desarrollo
ex situ : consiste en el mantenimiento de algunos componentes de la biodiversidad fuera de sus
hbitats naturales Existen dos tipos de conservacin ex situ:

Bancos de germoplasma en donde se conservan las especies para la alimentacin y la

agricultura.

Centros con especies que se dividen en centros de fauna (zoolgicos, centros de rescate,

museos) y centros de flora (jardines botnicos, viveros).

8. En que consiste el anlisis diferencial de protenas como herramienta de captura
de genes.

9. Mencione 4 reactivos de la extraccin del DNA que generan una PCR negativa
Urea inhiben la pcr
Nacl inhiben la pcr

10. Haga un anlisis situacional sobre el uso de transgnicos en la regin.

En Colombia se sembraron el ao pasado 103.230 hectreas de cultivos transgnicos, en su
mayora maz, de maz y algodn que rodean su territorio.Igualmente, muchas organizaciones
indgenas y campesinas para defender la soberana alimentaria frente 75.046 de esta gramnea,
revel
la
Asociacin
de
Biotecnologa
Vegetal
Agrcola
(Agrobio).
Para Mara Andrea Usctegui, directora ejecutiva, "los agricultores de las regiones productoras de
cultivos biotecnolgicos han encontrado en la tecnologa una herramienta sostenible para proteger
sus cultivos, ahorrar costos de produccin y obtener una mejor y mayor cosecha, adems son
conscientes de los beneficios que esta tecnologa aporta para el medio ambiente".
De eso da fe Fray Monterrosa Jaramillo, cultivador en Ceret-San Carlos: "en Crdoba ya no se
quiere trabajar con la semilla convencional". Su cultivo es de 90 hectreas: maz de abril a
septiembre
y
algodn
los
otros
seis
meses.
Aunque la semilla es ms costosa, se compensa con los otros ahorros y la produccin: ms de
350.000 pesos menos en control de plagas y malezas, y 1,5 toneladas ms que la semilla
convencional,
explic
Monterrosa.
Mientras al convencional le aplican tres o cuatro riegos para las malezas al transgnico solo uno,
dijo
Cabal.
En 2012 se sembraron 15.582 hectreas ms de maz que en 2011, mientras las de algodn
fueron
28.172.
Y
en
flores
12.
Hoy 21 departamentos cultivan transgnicos. Tolima, Crdoba y Meta lideran en maz y Crdoba,
Tolima
y
Cesar
en
algodn.
"Son importantes, pero no son la panacea", coment Clive James, del Servicio Internacional para
la Adquisicin de la Biotecnologa, al recomendar el uso de buenas prcticas agrcolas, como la
rotacin.
En el mundo desde 1996 aument 100 veces la siembra de transgnicos.Existe una evidente
alianza entre los varios sectores que estn promoviendo los transgnicos en el pas: algunas
entidades gubernamentales, las empresas biotecnolgicas, la academia, el sector agroindustrial y
los medios de comunicacin. Es as como las autoridades competentes en la materia han
restringido el acceso a la informacin que es de uso pblico. Ante esta situacin, desde la sociedad
civil, han tenido que recurrir a las demandas judiciales, para que la sociedad sea tenida en cuenta
en la toma de decisiones sobre estos temas.. El ICA ha autorizado a estas empresas realizar
ensayos de campo en el 2003 y 2004 en las regiones especialmente alrededor del maz, frente a la
contaminacin gentica que se pueda producir por la introduccin de maz transgnico en sus
territorios.
Este es el caso del pueblo Zen, quien posee una fuerte cultura del maz, expresada en mas de 25
variedades de este cultivo. Es as como en octubre de 2005, 170 cabildos las comunidades
indgenas Zenes de Crdoba y Sucre, declararon el resguardo indgena de San Andrs de
Sotavento Territorio Libre de Transgnicos. Esta decisin es de trascendental importancia, puesto
que los Zenes amparados en los derechos constitucionales sobre su territorio, estn ejerciendo la
defensa sobre su biodiversidad y soberana alimentaria, que se ve fuertemente amenazada por los
cultivos agroindustriales principalmente a los transgnicos, estn promoviendo y fortaleciendo los
sistemas productivos y de alimentacin tradicionales, basados en el manejo de la biodiversidad y la
produccin agroecolgica. Tambin se estn articulando alianzas entre las organizaciones rurales
con otros sectores de la sociedad, para la promocin del debate pblico, la difusin de informacin
y la implementacin de estrategias y acciones frente a los transgnicos

ms productoras de maz del pas. Introducir maz transgnico en Colombia es muy crtico, porque
inevitablemente seria contaminada y erosionada la enorme diversidad de este cultivo, que ha sido
conservada y utilizada por los campesinos e indgenas del pas, quienes serian los mas
directamente afectados con un modelo tecnolgico que no ha sido diseado para estos
agricultores. Tambin porque el maz es uno de los productos bsicos de la alimentacin de los
colombianos, tanto poblaciones rurales como urbanas.
En general la sociedad civil ha estado marginada del debate pblico y de la participacin en la
toma de decisiones sobre la evaluacin e introduccin de OGM en el pas. Especialmente los
campesinos e indgenas no han sido tenidos en cuenta, a pesar de que pueden ser los ms
afectados por la introduccin de estas tecnologas. Sin embargo, en muchas regiones del pas las
organizaciones indgenas, negras y campesinas tienen una posicin muy crtica sobre los impactos
que podra generar los organismos transgnicos en sus territorios
11. Presente 4 ejemplos de tcnicas de anlisis molecular que tienen como base la PCR,
especificando en que varan.
.Reaccin en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa (RT-PCR del ingls Reverse
transcription
polymerase
chain
reaction)
es
una
variante
de PCR,
una tcnica de laboratorio comnmente usada en biologa molecular para generar una gran
cantidad
de
copias
de ADNLa PCR
cuantitativa (en
ingls,
quantitative polymerase chain reaction; qPCR o Q-PCR) o PCR en tiempo real (en ingls real
time PCR; RT-qPCR o RT-Q-PCR) es una variante de la reaccin en cadena de la
polimerasa (PCR) utilizada para amplificar y simultneamente cuantificar de forma absoluta
el producto de la amplificacin de cido desoxirribonucleico (ADN)
La tcnica de REP-PCR se caracteriza por su simplicidad (no requiere el uso de enzimas de
restriccin, ni tcnicas electroforticas especiales), rapidez (menos de 24 h) ysu relativo bajo coste,
una vez que se dispone de un termociclador
La tcnica de PCR-RFLP se basa en la digestin con enzimas de restriccin de productos de
amplificacin de genes o secuencias de ADN polimrficas2 , 3. Con esta tcnicas se estudia una
regin muy limitada del genoma
12 relaciones transcriptomica, proteomica, metabolomica
La transcriptmica estudia y compara transcriptomas, es decir, los conjuntos de ARN mensajeros
o transcriptos presentes en una clula, tejido u organismo. Como los proteomas, los
transcriptomas son muy variables, ya que muestran qu genes se estn expresando en un
momento dado. Son particularmente interesantes para los cientficos los transcriptomas de las
clulas cancerosas y de las clulas madre, ya que pueden ayudar a entender los complicados
procesos de carcinognesis y de desarrollo y diferenciacin celular.
La protemica: es el estudio del proteoma es el conjunto de protenas que se expresa a partir de
un genoma. La protemica es el estudio y caracterizacin de todo el conjunto de
protenas expresadas de un genoma (proteoma). Las tcnicas de protemica abordan
el estudio de este conjunto de protenas. La Protemica permite identificar, categorizar
y clasificar las protenas con respecto a su funcin y a las interacciones que establecen
entre ellas

La metabolmica es el estudio y comparacin de los metabolomas, es decir, la coleccin de

todos los metabolitos (molculas de bajo peso molecular) presentes en una clula, tejido u
organismo en un momento dado. Estos metabolitos incluyen a intermediarios del metabolismo,
hormonas y otras molculas de sealizacin, y a metabolitos secundarios.

EduardoPetro .