La gran diversidad de organismos se deben agrupar y organizar en grupos
generales, lo cual lo hace la TAXONOMA, la cual se descompone en tres partes
independientes pero relacionadas: Clasificacin: es la estructuracin de los organismos en grupos o taxones en funcin de semejanzas mutuas o parentesco evolutivo. Nomenclatura: rama de la taxonoma que asigna los nombres a grupos taxonmicos
Identificacin: lado prctico de la taxonoma que establece a que taxn
corresponde un microorganismo. Carl von Linneo, estableci el sistema de nomenclatura binomial, que se usa todava en la actualidad. El cual deca que exista solo 2 reinos: animal y vegetal. Despus Ernst Haeckel cre un tercer reino que llam los Protistas. Ms tarde fue posible el reconocimiento de clulas procariotas y eucariotas, y en base a esto se ubicaron a las bacterias en un reino aparte separado de microorganismos sin ncleo, al que se le llamo Procariotas, Robert G. E. Murray. Despus R. H. Whittaker propuso un sistema de clasificacin en cinco reinos: Monera: incluye a todos los microorganismos procariotas. Protista: incluye a todos los microorganismos eucariotas unicelulares u ocasionalmente multicelulares.
Fungi: reino que incluye a los hongos en sus diversas formas.
Plantae: corresponde al reino vegetal.
Animalia: corresponde al reino animal. Con las nuevas tcnicas de biologa molecular se usaron para estudiar la composicin del ARN ribosmico y revelaron que hay realmente dos tipos de clulas procariotas (arqueas y bacterias) y un tipo de clulas eucariotas. Carl R. Woese propuso elevar los tres tipos de clulas a un nivel por encima del reino, llamado dominio y de ah surgi el sistema de clasificacin de tres dominios que se conoce en la actualidad y que comprende: Bacteria (procariotas unicelulares cuya pared celular contiene peptidoglucano) Arquea (procariotas unicelulares cuya pared celular no contiene peptidoglucano) Eukarya(todos los eucariotas)