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PRIMER DESIGN

DESAIN PRIMER SEKUENS aeBlue+TT


aeBlue + TT (895 bp)
GTTTCTTCGAATTCGCGGCCGCTTCTAGAGatggcttcactggttaaaaaagacatgtgcatcaaaatga
cgatggaaggaacagtaaacggtcaccatttcaagtgtgtaggagaaggcgaaggcaaaccatttgaagggacc
caggtggaaaagatacgcatcactgaaggtgggcccttaccatttgcgtatgatattttggccccttgttgcatgtat
ggcagtaaaaccttcattaagcatgtgtcgggtattccggattactttaaggagtcttttcctgagggctttacctggg
aaagaacacaaatcttcgaggatggcggctatctcaccatacaccaggacacgagccttcagggtaataattttatt
ttcaaagttaatgtcatcggtgccaacttccctgcaaacggtcccgtgatgcagaaaaaaacagctggatgggaac
cgtgcgttgagatgctttatccgcgggacggcgtcctgtgtggtcagagcctgatggccctgaaatgcactgatggc
aatcatctgacgtcccacctgcgcactacctatcgttctcgcaagccatccaatgcagttaacatgccggaatttcatt
ttggggatcatcgcattgagattttgaaagctgaacaaggtaaattttatgaacaatacgagtcagcggtggcccgt
tactgtgaggcggcaccgagtaaattagggcatcactaataatactagagccaggcatcaaataaaacgaaagg
ctcagtcgaaagactgggcctttcgttttatctgttgtttgtcggtgaacgctctctactagagtcacactggctcacctt
cgggtgggcctttctgcgtttataTACTAGTAGCGGCCGCTGCAGGAAGAAAC
Keterangan :
ATG TAATAA (stop codon) 699 bp aeBlue BBa_K864401
Prefix iGEM PCR
Suffix iGEM PCR
TAATAA stop codon

FILOGENETIK
IDENTIFIKASI SEKUENS X< Y< DAN Z!
Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 strain N16961 16S ribosomal
RNA
TTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGGCAGCACAG
AGGAACTTGTTCCTTGGGTGGCGAGCGGCGGACGGGTGAGTAATGCCTGGGAAATTGCCC
GGTAGAGGGG
GATAACCATTGGAAACGATGGCTAATACCGCATAACCTCGCAAGAGCAAAGCAGGGGACCTT
CGGGCCTT
GCGCTACCGGATATGCCCAGGTGGGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAGGGCTCACCAAGGCG
ACGATCCCT
AGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGG
AGGCAGCAG
TGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGC
CTTCGGGTT
GTAAAGTACTTTCAGTAGGGAGGAAGGTGGTTAAGTTAATACCTTAATCATTTGACGTTACCTA
CAGAAG
AAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGG
AATTACTGG
GCGTAAAGCGCATGCAGGTGGTTTGTTAAGTCAGATGTGAAAGCCCTGGGCTCAACCTAGG
AATCGCATT
TGAAACTGACAAGCTAGAGTACTGTAGAGGGGGGTAGAATTTCAGGTGTAGCGGTGAAATG
CGTAGAGAT
CTGAAGGAATACCGGTGGCGAAGGCGGCCCCCTGGACAGATACTGACACTCAGATGCGAA
AGCGTGGGGA
GCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCTACTTGGAGGTTGTGC
CCTAGAGG
CGTGGCTTTCGGAGCTAACGCGTTAAGTAGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAA
ACTCAAATG
AATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAA
CCTTACCTA
CTCTTGACATCCAGAGAATCTAGCGGAGACGCTGGAGTGCCTTCGGGAGCTCTGAGACAGG
TGCTGCATG
GCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATC
CTTGTTTG
CCAGCACGTAATGGTGGGAACTCCAGGGAGACTGCCGGTGATAAACCGGAGGAAGGTGGG
GACGACGTCA
AGTCATCATGGCCCTTACGAGTAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGTATACAGAGGGCAG
CGAATACC
GCGAAGGTGGAGCGAATCTCACAAAGTACGTCGTAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACT
CCATGAAG

TCGGAATCGCTAGTAATCGCAAATCAGAATGTTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACAC
ACCGCCC
GTCACACCATGGGAGTGGGCTGCAAAAGAAGCAGGTAGTTTAACCTTCGGGAGGACGCTT
Vibrio cholerae O395 strain O395 16S ribosomal RNA
TTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGGCAGCACAG
AGGAACTTGTTCCTTGGGTGGCGAGCGGCGGACGGGTGAGTAATGCCTGGGAAATTGCCC
GGTAGAGGGG
GATAACCATTGGAAACGATGGCTAATACCGCATAACCTCGCAAGAGCAAAGCAGGGGACCTT
CGGGCCTT
GCGCTACCGGATATGCCCAGGTGGGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAGGGCTCACCAAGGCG
ACGATCCCT
AGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGG
AGGCAGCAG
TGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGC
CTTCGGGTT
GTAAAGTACTTTCAGTAGGGAGGAAGGTGGTTAAGTTAATACCTTAATCATTTGACGTTACCTA
CAGAAG
AAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGG
AATTACTGG
GCGTAAAGCGCATGCAGGTGGTTTGTTAAGTCAGATGTGAAAGCCCTGGGCTCAACCTAGG
AATCGCATT
TGAAACTGACAAGCTAGAGTACTGTAGAGGGGAGTAGAATTTCAGGTGTAGCGGTGAAATGC
GTAGAGAT
CTGAAGGAATACCGGTGGCGAAGGCGGCCCCCTGGACAGATACTGACACTCAGATGCGAA
AGCGTGGGGA
GCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCTACTTGGAGGTTGTGC
CCTAGAGG
TGTGGCTTTCGGAGCTAACGCGTTAAGTAGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAA
CTCAAATG
AATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAA
CCTTACCTA
CTCTTGACATCCAGAGAATCTAGCGGAGACGCTGGAGTGCCTTCGGGAGCTCTGAGACAGG
TGCTGCATG
GCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATC
CTTGTTTG
CCAGCACGTAATGGTGGGAACTCCAGGGAGACTGCCGGTGATAAACCGGAGGAAGGTGGG
GACGACGTCA
AGTCATCATGGCCCTTACGAGTAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGTATACAGAGGGCAG
CGATACCG
CGAGGTGGAGCGAATCTCACAAAGTACGTCGTAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCC
ATGAAGTC
GGAATCGCTAGTAATCGCAAATCAGAATGTTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACAC
CGCCCGT

CACACCATGGGAGTGGGCTGCAAAAGAAGCAGGTAGTTTAACCTTCGGGAGGACGCTT
Vibrio cholerae strain ATCC 14035 16S ribosomal RNA gene
TTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGGCAG
CACAGAGGAACTTGTTCCTTGGGTGGCGAGCGGCGGACGGGTGAGTAATGCCTGGGAAAT
TGCCCGGTAG
AGGGGGATAACCATTGGAAACGATGGCTAATACCGCATAACCTCGCAAGAGCAAAGCAGGG
GACCTTCGG
GCCTTGCGCTACCGGATATGCCCAGGTGGGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAGGGCTCACCAA
GGCGACGA
TCCCTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTA
CGGGAGGC
AGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAG
AAGGCCTTC
GGGTTGTAAAGTACTTTCAGTAGGGAGGAAGGTGGTTAAGTTAATACCTTAATCATTTGACGTT
ACCTAC
AGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTT
AATCGGAATT
ACTGGGCGTAAAGCGCATGCAGGTGGTTTGTTAAGTCAGATGTGAAAGCCCTGGGCTCAAC
CTAGGAATC
GCATTTGAAACTGACAAGCTAGAGTACTGTAGAGGGGGGTAGAATTTCAGGTGTAGCGGTGA
AATGCGTA
GAGATCTGAAGGAATACCGGTGGCGAAGGCGGCCCCCTGGACAGATACTGACACTCAGATG
CGAAAGCGT
GGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCTACTTGGAGGT
TGTGCCCT
AGAGNCGTGGCTTTCGGAGCTAACGCGTTAAGTAGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGA
TTAAAACTC
AAATGAATTGACGGGGGNCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGANNCAACGCG
AAGAACCTT
ACCTACTCTTGACATCCAGAGAATCTAGCGGAGACGCTGGAGTGCCTTCGGGAGCTCTGAGA
CAGGTGCT
GCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCC
TTATCCTT
GTTTGCCAGCACGTAATGGTGGGAACTCCAGGGAGACTGCCGGTGATAAACCGGAGGAAG
GTGGGGACGA
CGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGAGTAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGTATACAGAG
GGCAGCGA
TACCGCGAGGTGGAGCGAATCTCACAAAGTACGTCGTAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCG
ACTCCATG
AAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCAAATCAGAATGTTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTA
CACACCG
CCCGTCACACCATGGGAGTGGGCTGCAAAAGAAGCAGGTAGTTTAANCTTCGGGAGGACGC
TT

Pseudomonas stutzeri ATTC 17594 16S ribosomal RNA gene


TTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGGATGAGTGG
AGCTTGCTCCATGATTCAGCGGCGGACGGGTGAGTAATGCCTAGGAATCTGCCTGGTAGTGG
GGGACAAC
GTTTCGAAAGGAACGCTAATACCGCATACGTCCTACGGGAGAAAGTGGGGGATCTTCGGACC
TCACGCTA
TCAGATGAGCCTAGGTCGGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTCACCAAGGCGACGATCC
GTAACTGG
TCTGAGAGGATGATCAGTCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAG
CAGTGGGGA
ATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGTCTTCGG
ATTGTAAAG
CACTTTAAGTTGGGAGGAAGGGCAGTAAGTTAATACCTTGCTGTTTTGACGTTACCAACAGAA
TAAGCAC
CGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACT
GGGCGTAA
AGCGCGCGTAGGTGGTTCGTTAAGTTGGATGTGAAAGCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTGC
ATCCAAAAC
TGGCGAGCTAGAGTATGGCAGAGGGTGGTGGAATTTCCTGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAT
ATAGGAAG
GAACACCAGTGGCGAAGGCGACCACCTGGGCTAATACTGACACTGAGGTGCGAAAGCGTG
GGGAGCAAAC
AGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCGACTAGCCGTTGGGATCCTTGA
GATCTTAG
TGGCGCAGCTAACGCATTAAGTCGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAA
ATGAATTGA
CGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTAC
CAGGCCTTG
ACATGCAGAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTCTGACACAGGTGCTGCA
TGGCTGTC
GTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCTTAGTT
ACCAGCA
CGTTAAGGTGGGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGAC
GTCAAGTCAT
CATGGCCCTTACGGCCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTCGGTACRAAGGGTTGCCAAG
CCGCGAGGT
GGAGCTAATCCCATAAAACCGATCGTAGTCCGGATCGCAGTCTGCAACTCGACTGCGTGAAG
TCGGAATC
GCTAGTAATCGTGAATCAGAATGTCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACRCCGCCC
GTCACACC
ATGGGAGTGGGTTGCTCCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTT
Pseudomonas stutzeri partial 16S rRNA gene, strain 28a22

TTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGGATGAGTGGAGCT
TGCTCCATGATTCAGCGGCGGACGGGTGAGTAATGCCTAGGAATCTGCCTGGTAGTGGGGG
ACAACGTTT
CGAAAGGAACGCTAATACCGCATACGTCCTACGGGAGAAAGCAGGGGACCTTCGGGCCTTG
CGCTATCAG
ATGAGCCTAGGTCGGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCGACGATCCGTAA
CTGGTCTG
AGAGGATGATCAGTCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGT
GGGGAATAT
TGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGTCTTCGGATTG
TAAAGCACT
TTAAGTTGGGAGGAAGGGCAGTAAGTTAATACCTTGCTGTTTTGACGTTACCGACAGAATAAG
CACCGGC
TAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGC
GTAAAGCG
CGCGTAGGTGGTTTGTTAAGTTGAATGTGAAAGCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTGCATCC
AAAACTGGC
AAGCTAGAGTATGGCAGAGGGTGGTGGAATTTCCTGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATAG
GAAGGAAC
ACCAGTGGCGAAGGCGACCACCTGGGCTACTACTGACACTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGA
GCAAACAGGA
TTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCGACTAGCCGTTGGGATCCTTGAGATCT
TAGTGGC
GCAACTAACGCATTAAGTCGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGA
ATTGACGGG
GGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGG
CCTTGACAT
GCAGAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTCTGACACAGGTGCTGCATGG
CTGTCGTCA
GCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCTTAGTTACCA
GCACGTC
ATGGTGGGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCA
AGTCATCATG
GCCCTTACGGCCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTCGGTACAAAGGGTTGCCAAGCCGC
GAGGTGGAG
CTAATCCCATAAAACCGATCGTAGTCCGGATCGCAGTCTGCAACTCGACTGCGTGAAGTCGG
AATCGCTA
GTAATCGTGAATCAGAATGTCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCA
CACCATGG
GAGTGGGTTGCTCCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGAGGACGGTT
Pseudomonas stutzeri strain 28a24
TTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGGA

TGAAGGGAGCTTGCTTCCTGATTCAGCGGCGGACGGGTGAGTAATGCCTAGGAATCTGCCT
GGTAGTGGG
GGACAACGTTTCGAAAGGAACGCTAATACCGCATACGTCCTACGGGAGAAAGCAGGGGACC
TTCGGGCCT
TGCGCTATCAGATGAGCCTAGGTCGGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCG
ACGATCCG
TAACTGGTCTGAGAGGATGATCAGTCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGG
AGGCAGCA
GTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGG
TCTTCGGAT
TGTAAAGCACTTTAAGTTGGGAGGAAGGGCATTAACCTAATACGTTAGTGTTTTGACGTTACC
GACAGAA
TAAGCACCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGTGCAAGCGTTAATCG
GAATTACTG
GGCGTAAAGCGCGCGTAGGTGGTTTGTTAAGTTGGATGTGAAAGCCCCGGGCTCAACCTGG
GAACTGCAT
CCAAAACTGGCAAGCTAGAGTATGGCAGAGGGTGGTGGAATTTCCTGTGTAGCGGTGAAAT
GCGTAGATA
TAGGAAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGACCACCTGGGCTAATACTGACACTGAGGTGCGA
AAGCGTGGGG
AGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCGACTAGCCGTTGGGA
TCCTTGAG
ATCTTAGTGGCGCAGCTAACGCATTAAGTCGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAA
AACTCAAAT
GAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAG
AACCTTACCA
GGCCTTGACATGCAGAGAACTTTCCAGAGATGGATGGGTGCCTTCGGGAACTCTGACACAG
GTGCTGCAT
GGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGT
CCTTAGTT
ACCAGCACGTTATGGTGGGCACTCTAAGGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGG
GGATGACGTC
AAGTCATCATGGCCCTTACGGCCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTCGGTACAAAGGGTT
GCCAAGCC
GCGAGGTGGAGCTAATCCCATAAAACCGATCGTAGTCCGGATCGCAGTCTGCAACTCGACTG
CGTGAAGT
CGGAATCGCTAGTAATCGTGAATCAGAATGTCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACA
CCGCCCG
TCACACCATGGGAGTGGGTTGCTCCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGAGGACGGTT
Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 strain K-12 16S ribosomal RNA
TTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGT
AACAGGAAGAAGCTTGCTTCTTTGCTGACGAGTGGCGGACGGGTGAGTAATGTCTGGGAAA
CTGCCTGAT

GGAGGGGGATAACTACTGGAAACGGTAGCTAATACCGCATAACGTCGCAAGACCAAAGAGG
GGGACCTTC
GGGCCTCTTGCCATCGGATGTGCCCAGATGGGATTAGCTAGTAGGTGGGGTAACGGCTCACC
TAGGCGAC
GATCCCTAGCTGGTCTGAGAGGATGACCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTC
CTACGGGAG
GCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGA
AGAAGGCCT
TCGGGTTGTAAAGTACTTTCAGCGGGGAGGAAGGGAGTAAAGTTAATACCTTTGCTCATTGA
CGTTACCC
GCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCG
TTAATCGGAA
TTACTGGGCGTAAAGCGCACGCAGGCGGTTTGTTAAGTCAGATGTGAAATCCCCGGGCTCAA
CCTGGGAA
CTGCATCTGATACTGGCAAGCTTGAGTCTCGTAGAGGGGGGTAGAATTCCAGGTGTAGCGGT
GAAATGCG
TAGAGATCTGGAGGAATACCGGTGGCGAAGGCGGCCCCCTGGACGAAGACTGACGCTCAG
GTGCGAAAGC
GTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCGACTTGGA
GGTTGTGCC
CTTGAGGCGTGGCTTCCGGAGCTAACGCGTTAAGTCGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCA
AGGTTAAAAC
TCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACG
CGAAGAACC
TTACCTGGTCTTGACATCCACAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGA
GACAGGTG
CTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAAC
CCTTATCT
TTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACTGGAGGAA
GGTGGGGATG
ACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGACCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGCATACAAA
GAGAAGCG
ACCTCGCGAGAGCAAGCGGACCTCATAAAGTGCGTCGTAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTC
GACTCCAT
GAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGAATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTG
TACACACC
GCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCG
CTT
Escherichia coli strain POONR 01 16S ribosomal RNA gene
TTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAGCAGCTTGCTG
CTTTGCTGA
CGAGTGGCGGACGGGTGAGTAATGTCTGGGAAACTGCCTGATGGAGGGGGATAACTACTG
GAAACGGTAG

CTAATACCGCATAACGTCGCAAGACCAAAGAGGGGGACCTTCGGGCCTCTTGCCATCGGATG
TGCCCAGA
TGGGATTAGCTAGTAGGTGGGGTAACGGCTCACCTAGGCGACGATCCCTAGCTGGTCTGAGA
GGATGACC
AGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTG
CACAATGGG
CGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGTACTTTC
AGCGGGGA
GGAAGGGAGTAAAGTTAATACCTTTGCTCATTGACGTTACCCGCAGAAGAAGCACCGGCTAA
CTCCGTGC
CAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCA
CGCAGGCGG
TTTGTTAAGTCAGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTGCATCTGATACTGGCAAG
CTTGAGTC
TCGTAGAGGGGGGTAGAATTCCAGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATCTGGAGGAATAC
CGGTGGCGA
AGGCGGCCCCCTGGACGAAGACTGACGCTCAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGA
TTAGATACCCT
GGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCGACTTGGAGGTTGTGCCCTTGAGGCGTGGCTTCCGG
AGCTAACGC
GTTAAGTCGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGG
CCCGCACAA
GCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCA
CGGAAGTT
TTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGC
TCGTGTTGT
GAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGC
CGGGAACT
CAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACTGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCC
CTTACGACC
AGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGCATACAAAGAGAAGCGACCTCGCGAGAGCAAGCG
GACCTCATAA
AGTGCGTCGTAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAAT
CGTGGAT
CAGAATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGGA
GTGGGTTGC
AAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTT
Escherichia coli partial 16S rRNA gene, isolate C10
TTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAG
GAAGCAGCTTGCTGCTTCGCTGACGAGTGGCGGACGGGTGAGTAATGTCTGGGAAACTGC
CTGATGGAGG
GGGATAACTACTGGAAACGGTAGCTAATACCGCATAACGTCGCAAGACCAAAGAGGGGGAC
CTTCGGGCC

TCTTGCCATCGGATGTGCCCAGATGGGATTAGCTAGTAGGTGGGGTAACGGCTCACCTAGGC
GACGATCC
CTAGCTGGTCTGAGAGGATGACCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACG
GGAGGCAGC
AGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAG
GCCTTCGGG
TTGTAAAGTACTTTCAGCGGGGAGGAAGGGAGTAAAGTTAATACCTTTGCTCATTGACGTTAC
CCGCAGA
AGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATC
GGAATTACT
GGGCGTAAAGCGCACGCAGGCGGTTTGTTAAGTCAGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTG
GGAACTGCA
TCTGATACTGGCAAGCTTGAGTCTCGTAGAGGGGGGTAGAATTCCAGGTGTAGCGGTGAAAT
GCGTAGAG
ATCTGGAGGAATACCGGTGGCGAAGGCGGCCCCCTGGACGAAGACTGACGCTCAGGTGCG
AAAGCGTGGG
GAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCGACTTGGAGGTTGT
GCCCTTGA
GGCGTGGCTTCCGGAGCTAACGCGTTAAGTCGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTT
AAAACTCAAA
TGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAG
AACCTTACC
TGGTCTTGACATCCACGGAAGTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAG
GTGCTGCA
TGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTA
TCCTTTGT
TGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTGCCAGTGATAAACTGGAGGAAGGTGG
GGATGACGTC
AAGTCATCATGGCCCTTACGACCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGCATACAAAGAGAA
GCGACCTC
GCGAGAGCAAGCGGACCTCATAAAGTGCGTCGTAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACT
CCATGAAGT
CGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGAATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACAC
ACCGCCCG
TCACACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTT
sekuens X
TTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGGCAGCACAG
AGGAACTTGTTCCTTGGGTGGCGAGCGGCGGACGGGTGAGTAATGCCTGGGAAATTGCCC
GGTAGAGGGG
GATAACCATTGGAAACGATGGCTAATACCGCATAACCTCGCAAGAGCAAAGCAGGGGACCTT
CGGGCCTT
GCGCTACCGGATATGCCCAGGTGGGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAGGGCTCACCAAGGCG
ACGATCCCT
AGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGG
AGGCAGCAG
TGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGC
CTTCGGGTT

GTAAAGTACTTTCAGTAGGGAGGAAGGTGGTTAAGTTAATACCTTAATCATTTGACGTTACCTA
CAGAAG
AAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGG
AATTACTGG
GCGTAAAGCGCATGCAGGTGGTTTGTTAAGTCAGATGTGAAAGCCCTGGGCTCAACCTAGG
AATCGCATT
TGAAACTGACAAGCTAGAGTACTGTAGAGGGGGGTAGAATTTCAGGTGTAGCGGTGAAATG
CGTAGAGAT
CTGAAGGAATACCGGTGGCGAAGGCGGCCCCCTGGACAGATACTGACACTCAGATGCGAA
AGCGTGGGGA
GCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCTACTTGGAGGTTGTGC
CCTAGAGG
TGTGGCTTTCGGAGCTAACGCGTTAAGTAGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAA
CTCAAATG
AATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAA
CCTTACCTA
CTCTTGACATCCAGAGAATCTAGCGGAGACGCTGGAGTGCCTTCGGGAGCTCTGAGACAGG
TGCTGCATG
GCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATC
CTTGTTTG
CCAGCACGTAATGGTGGGAACTCCAGGGAGACTGCCGGTGATAAACCGGAGGAAGGTGGG
GACGACGTCA
AGTCATCATGGCCCTTACGAGTAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGTATACAGAGGGCAG
CGATACCG
CGAGGTGGAGCGAATCTCACAAAGTACGTCGTAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCC
ATGAAGTC
GGAATCGCTAGTAATCGCAAATCAGAATGTTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACAC
CGCCCGT
CACACCATGGGAGTGGGCTGCAAAAGAAGCAGGTAGTTTAACCTTCGGGAGGACGCTT

sekuens Y
ATGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGGCAGCGGGT
CCTTCGGGATGCCGGCGAGCGGCGGACGGGTGAGTAATGCCTAGGAATCTGCCTGGTAGTG
GGGGATAAC
TCGGGGAAACTCGAGCTAATACCGCATACGTCCTACGGGAGAAAGCGGGGGATCTTCGGAC
CTCGCGCTA
CCAGATGAGCCTAGGTCGGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTCACCAAGGCGACGATC
CGTAGCTGG
TCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAG
CAGTGGGGA
ATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGTCTTCGG
ATTGTAAAG

CACTTTAAGTTGGGAGGAAGGGCAGTAAGTTAACACCTTGCTGTTTTGACGTTACCGACAGA
ATAAGCAC
CGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACT
GGGCGTAA
AGCGCGCGTAGGTGGTTTGATAAGTTGGATGTGAAAGCCCCGGGCTCAACCTGGGAATTGC
ATCCAAAAC
TGTCTGACTAGAGTATGGCAGAGGGTGGTGGAATTTCCTGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAT
ATAGGAAG
GAACACCAGTGGCGAAGGCGACCGCCTGGGCTAATACTGACACTGAGGTGCGAAAGCGTG
GGGAGCAAAC
AGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCGACTAGCCGTTGGGATCCTTGA
GATCTTAG
TGGCGCAGCTAACGCATTAAGTCGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAA
ATGAATTGA
CGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGGAGCAACGCGAAGAACCTTA
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