LOS MICROORGANISMOS EN SUS

AMBIENTES NATURALES

Las bacterias son ubicuitas:

- Su pequeño tamaño permite una fácil dispersión.
- Conversión de energía no restringida a ambientes
aerobios.
- Versatilidad metabólica extrema.
- Muchas bacterias pueden tolerar condiciones
ambientales desfavorables
 TEMA XV

EL AMBIENTE
TERRESTRE:
EL SUELO
™ El SUELO es la capa externa, blanda, de la superficie
terrestre que está totalmente diferenciada del lecho rocoso

™ Soporta el crecimiento de los vegetales.

™ Contiene multitud de sustancias orgánicas.
™ Contiene multitud de microorganismo que interaccionan de
forma muy dinámica.

Componentes principales: Materia mineral, agua, aire, materia

orgánica, organismos.
COMUNIDADES MICROBIANAS DEL SUELO

™ Organismo AUTÓCTONO: Microorganismos

capaces de utilizar compuestos húmicos
refractantes (bacilos G- , actinomicetos y
algunos hongos ).
™ Organismos ZIMÓGENOS u
OPORTUNISTAS: también son del suelo pero
no utilizan compuestos húmicos sino sustratos
fácilmente utilizables (Pseudomonas, Bacillus,
Penicillium, Aspergillus, Mucor).

™ Gran cantidad de
microorganismos
(106-109 bacterias/gr)
™ La mayoría
heterotróficos
 Hifas de hongos
AGREGADO del suelo
mostrando los
microhábitat y la
distribución de los
microorganismos.

Agua

Bacterias
Bacterias

Actinomicetes
MO
Concentración de O2 entre los agregado del suelo:
 LAS BACTERIAS

™ Son los organismos más numerosos del suelo (106-109 células/g suelo).
™ Principales responsables del reciclado y transformación de los ciclos edáficos del C,
N, P, Fe y S.
™ Muy diversos taxonómicamente y fisiológicamente (aerobios obligados, microaerófilos,
anaerobios, etc.).

Las características particulares de cada suelo determinan el tipo de microorganismos

que viven allí.

Aunque dominan las bacterias G-, en relación a otros hábitat hay mayor proporción de
G+. Los géneros más comunes incluyen:
Acinetobacter, Agrobacterium, Alcaligenes, Arthrobacter, Bacillus, Brevibacterium,
Caulobacter, Cellulomonas, Clostridium, Corynebacterium, Flavobacterium, Micrococcus,
Mycobacterium, Pseudomonas, Staphylococcus, Streptococcus, Xanthomonas.
 ACTINOMICETOS

™ Pueden ser un porcentaje muy alto de la población bacteriana (10-30%).

™ Los géneros más abundantes son: Streptomyces y Nocardia. Otros géneros como
Micromonospora, Actinomyces, etc., se encuentran en mucha menor cantidad.

Nocardia

Streptomyces

™ Resistentes a la desecación.
™ Crecen sobres suelos alcalinos o neutros
™ Importantes productores de antibióticos.

™ Son muy abundantes en

MIXOBACTERIAS
determinados suelos.
™ Activos descomponedores de
residuos vegetales.
™ Los géneros más
representativos son:
Myxococcus, Cytophaga,
Chrondococcus, Archangium y
Polyamgium. Myxococcus
 CIANOBACTERIAS

Microcoleus
™ Contribuyen a la estabilización del suelo
al formar costras en los suelos desnudos.
™ Principales géneros en el suelo:
Anabaena, Calothirx, Chroococcus,
Cylindrospermun, Lyngbya, Microcoleus,
Nodularia, Nostoc, Oscillatoria,
Phormidium, Plectonema, Schizothrix,
Scytonema y Tolypothrix.

OTRAS BACTERIAS FIJADORAS DE N2

™ Azotobacter, heterótrofo de
vida libre.
™ Algunos Clostridium del suelo.
™ Rhizobium y Bradhyrhizobium
en los nódulos de las raíces.
Azotobacter
Calothrix
Plectonema

Nodularia

Scytonema

Tolypothrix
 LOS HONGOS

™ Tan importantes en lo suelos como las bacterias, constituyen una altísima

proporción de la biomasa edáfica.
™ Papel esencial en la descomposición de los residuos vegetales, especialmente de
sustancias recalcitrantes y en la formación de compuestos húmicos.
™ Aparecen como organismos de vida libre o en asociación con raíces (micorrizas).
™ Principalmente en los 10 primeros cm del suelo, no llegan a más de 30 cm de
profundidad. Prefieren suelos bien aireados.
™ Los géneros filamentosos más frecuentes son hongos Ascomicetos imperfectos:
Aspergillus, Geotrichum, Penicillium, Trichoderma, Botrytis, pero también se
encuentran numerosos basidiomicetos.
 LAS LEVADURAS

™ Muy comunes también en el suelo

™ Géneros más frecuentes: la mayoría son también hongos imperfectos o
Deuteromicetos tanto Ascomicetos: Candida, como basidiomicetos: Rhodotorula
y Cryptococcus).
™ Algunas especies de los géneros Lipomyces, Schwanniomyces,
Kluyveromyces, Schizoblastoporion, Hansenula, Candida y Cryptococcus han
sido aisladas únicamente del suelo.

™ La mayoría de los hongos del suelo son

oportunistas (zimógenos).
™ Muchos metabolizan carbohidrátos, pero son Candida
pocos los que degradan lignina.
™ El letargo es una condición muy común en los
hongos. Forman estructuras especializadas:
Esporangiosporas, conidios, oosporas, ascosporas,
basidiosporas, clamidosporas y esclerocios.
™ En el suelo existe un efecto inhibidor de la
germinación de las esporas fúngicas llamado
FUNGISTASIS y que parece estar asociado a la
actividad bacteriana.
 LAS ALGAS

™ Se encuentran tanto en la superficie como en

el interior del suelo pero sólo en los primeros
milímetros es donde se pueden encontrar en gran
cantidad.
™ Pueden ser clorofitas, rodofitas, euglenofitas
y crisofitas.

LOS PROTOZOOS

™ Tamaño pequeño y diversidad baja en comparación con la de los ambientes

acuáticos.
™ No demasiado abundantes (104-105 organismos/g).
™ En los primeros 10 cm del suelo.
™ Importantes depredadores de bacterias y algas del suelo, son
predominantemente biflagelados.
™ Géneros más comunes: Heteromita, Oikomonas, Cercomonas (flagelados),
Colpoda (ciliado), Acanthamoeba,Naegleria (amébas) etc.
 FORMACIÓN DEL SUELO
™ Combinación de distintos procesos físicos, químicos y biológicos.
™ Los cinco factores principales que influyen en la formación y características
del suelo son: la roca original, el clima, la topografía, la actividad biológica y el
tiempo.
 Participación de los organismos en la formación del Suelo

Ac. cítrico
Ac. oxálico
Algas

Líquenes
disolución

MO
Musgos

MO

Bacterias heterotróficas

Hongos

Ác. orgánicos
RESPIRACIÓN

RIZOSFERA
H2CO3 CO2
Textura de los Suelos

=10 mm
Arena Arcilla
(Sand) (Clay)

Limo
(Silt)
 MATERIA ORGÁNICA DEL SUELO

MINERALIZACIÓN
Más o menos rápida
Restos vegetales, NH3; CO2; PO42+
animales, microbianos

MINERALIZACIÓN
Lenta
DESHUMIFICACIÓN

Síntesis de compuestos
Monómeros intermediarios Húmicos coloidales
HUMIFICACIÓN
Repolimerización
HUMUS: Porción de la MO que ha sufrido una transformación tal que es irreconocible
el material original. Es menos del 6 % del peso del suelo.

POLÍMEROS ORGÁNICOS
Formación
de las
sustancias Degradación
húmicas:

COSTITUYENTES MONOMÉRICOS
(fenoles, quinonas, aa, azúcares)

Reacciones espontáneas
HUMIFICACIÓN
Autoxidación
Oxidación por enzimas microbianas Repolimerización
(lacasas, polifenoloxidasas,
peroxidas)

COMPUESTOS HÚMICOS

Ac. Fúlvico Ac. Húmico Humina

 Ac. Fúlvico

Ac. Húmico

Humina
 Interacción de la MO con el material arcilloso
Hay evidencias de que el tipo de material arcilloso y sus cationes asociados influyen sobre la
estabilización de la MO y viceversa, la presencia de MO es de gran importancia en la formación
y estabilización del suelo.
 FUNCIONES DEL HUMUS

™ Actúa como reservorio que regula los ciclos biogeoquímicos.

™ Juega un papel importante en el establecimiento de la estructura del suelo

y de su estabilidad.

™ Contribuye a determinar la capacidad de cambio del suelo, manteniendo los

cationes bajo forma intercambiable y disponible para los vegetales.

™ Participa en el establecimiento del pH del suelo y del poder tampón.

™ Retiene agua.

™ Absorbe virus, sustancias tóxicas, enzimas, etc., pudiendo contrabalancear

los efectos perjudiciales de distintos compuestos y/o ejercer un efecto
estimulante sobre la fisiología de los vegetales.
 MICROORGANISMOS EN EL SUBSUELO
PROFUNDO

Condiciones de vida en la corteza terrestre:

• Disponibilidad de agua
• Temperatura y presión
• Valor del pH
• Concentración de O2

Las tasas metabólicas más bajas se han medido en la biosfera subterránea

Se distinguen dos grandes zonas en la corteza terrestre según sus características

Fisico-químicas diferenciales:
• Cobertura de sedimentos
• Rocas ígneas de la corteza continental (mayormente graníticas) y
oceánica (basálticas)
 Sedimentos
™ Potencias de hasta 3 Km
™ Contienen entre 1/3 y 1/10 de la MO total existente en la biosfera
™ Contiene de 4 a 8 veces mas C como metano (en forma de hidratos) que existe en la biomasa
superficial y el suelo juntos.
™ Valores dispares en el número de bacterias en sedimentos profundos (105- 109 células/ml)

Metabolismo Sustrato oxidable Profundidad en

respiratorio el sedimento
Reducción de O2 NH4+, NO2-, Mn(III), Fe(II), H2S, Sº, carbono capa superficial
(respiración aerobia) orgánico, CH4+, H2 oxigenada
Reducción de NO3- Mn(III), Fe(II), H2S, Sº, carbono orgánico, CH4+, capa superficial
H2
Reducción de Mn(IV) Fe(II), H2S, Sº, carbono orgánico, CH4+, H2 capa media
anóxica
Reducción de Fe(III) H2S, Sº, carbono orgánico, CH4+, H2 capa media
anóxica
Reducción de SO42- carbono orgánico, CH4+, H2 fondo anóxico
Reducción de CO2 H2, acetato, otras pequeñas sustancias carbonadas fondo anóxico
(metanogénesis)

Tomado de J.S. López-Villalta (2006)

 Corteza de roca ígnea
™ Los ecosistemas situados en esta zona dependerán de la energía química de cationes metálicos
(principalmente Fe2+ y Mn2+) y gases hidrotermales (H2, CH4 y H2S ) que distintos tipos de bacterias
quimiolitoautotrofas pueden utilizar.
™ Algunas de estas oxidaciones se realizan aeróbicamente, pero también existen procariotas capaces de
oxidarlas anaeróbicamente (ej: Oxidación de Fe2+ respirando nitrato –Thiobacillus denitrificans- o
compuestos reducidos de S respirando nitrato o Fe3+). Su actividad debe de estar limitada debido a la
escasez de oxidantes.
™ En esta zona, debido a los fluidos hidrotermales, el H2 y el CO2 son abundantes, por lo que es un sito
propicio para la metanogénesis. Posiblemente esta actividad es la dominante en toda la corteza de la tierra
desde hace miles de millones de años.
™ Puede haber producción de compuestos orgánicos abióticamente (altas presiones y temperaturas) o
puede quedar MO atrapada en rocas sedimentarias que pueden ser usados como energía y como recurso de
C.

Bacterias a 400 m de profundidad

Figure 5. The deep hydrogen-driven biosphere hypothesis,
illustrated by the carbon cycle. At relevant temperature
and water availability conditions, subterranean
microorganisms are theoretically capable of performing a
life cycle that is independent of sun-driven ecosystems.
Hydrogen and carbon dioxide from the deep crust of
Earth, or organic carbon from sedimentary deposits can be
used as energy and carbon sources. Phosphorus is
available in minerals such as apatite and nitrogen for
proteins; nucleic acids, and so on can be obtained via
nitrogen fixation; and nitrogen gas predominates in many
groundwater.