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Merkblatt zur Einfhrung in die Taxonomie der Bakterien

Archaebakterien
(Archaeobactaeria, Archaea)
frher als Abt. 4 der Bakterien: Mendosicutes (mendosus lat: Fehler besitzend, abartig)

Das Urreich der Archaebakterien gliedert sich in 15 bis 20 Phyla bzw. Zweige. Physiologisch/morphologisch knnen 5 Gruppen unterschieden werden:

I.

Methanogene anaerobe Atmung mit CO 2 als H-Akzeptor, CO 2 + H 2 CH 4 anstelle von H 2 knnen auch niedermolekulare organische Substanzen (Formiat, Acetat u. a.) als H-Donatoren dienen. Vorkommen: Smpfe, Sedimente, Pansen, Biogasanlagen Beispiel: Methanobacterium

II. Sulfatreduzierer zu den Archaebakterien gehren hyperthermophile Sulfatreduzierer, die z.T. bei 140 C lebensfhig sind; alle anderen Gruppen von Sulfatreduzierern gehren zu den Eubakterien Beispiel: Archaeoglobus III. Extrem Halophile extrem halophile Archaebakterien; Optimum: 12 23 % NaCl, Maximum: 32 % (= gestt. Salzlsung); z. T. Lichtnutzung und phototrophe ATP-Bildung mittels Bacteriorhodopsin, das in der sogen. Purpurmembran lokalisiert ist. Beispiel: Halobacterium IV. Zellwandlose Beispiel: Thermoplasma (nur CM vorh.) V. Extrem thermophile Schwefel-Verwerter a) extrem thermophil (85 105 C); Nutzung von CO 2 (od. CO) und H 2 z. T. S H 2 S (S-Reduktion) b) acidophil in sauren Wssern S SO 4 2- (Schwefelsureproduktion, S-Oxidation) Beispiel: Sulfolobus, Desulfurococcus, Thermoproteus Die Gruppe I bis IV stellen den 1. Hauptzweig der Archaebakterien dar (= Euryarchaeota). Gruppe V stellt den 2. Hauptzweig der Archaebakterien (= Crenarchaeota) dar.

Eubakterien
(Eubacteria, Bacteria)

Das Urreich der Eubakterien gliedert sich in ca. 20 Phyla bzw. Zweige. Die meisten Zweige der Eubakterien sind gramnegativ, nur 2 Zweige sind grampositiv (letztere umfassen aber sehr viele Gattungen bzw. Arten).

Aquifex/Hydrogenobacter-Zweig tiefster Abzweig der Eubakterien, hyperthermophile MO, anaerob bis microaerophil, obligat chemolithotroph (H 2 -Oxidation). H 2 , S oder S 2 O 3 - als H-Donator NO 3 - als H-Akzeptor Aquifex pyrophilus

Thermotoga-Zweig extrem thermophil (ursprngliches Merkmal), weitverbreitet in heien Quellen besitzen zustzliche Hlle um Zellwand (Toga); keine DAP in Murein; in Lipiden: langkettige Dicarbonsuren als Besonderheit.

Cyanobacteria-Zweig = Oxyphotobakterien (ltere Bez.: Blaualgen) Photosynthese hnlich der der Pflanzen (aber kein Zellkern und Murein-haltige Zellwand = typ. Bakterienmerkmal); Besitz von Chlorophyll a und Phycobilinen (als Hilfspigmenten). Einige Cyanobakterien enthalten (wie die Pflanzen) sowohl Chlorophyll a als auch Chlorophyll b (z.B. Gattung Prochloron). Vorkommen im Wasser oder in feuchten, warmen Bden (oder auf Gesteinen) einzellig (z. T. als durch Schleim verbundene Zellverbnde) oder mehrzellig (Fden, Trichome) keine Geieln, mobil durch gleitende Bewegung oder Schweben in lichtintensive Wasserbereiche mittels Gasvakuolen oft N 2 -Fixierung; bei fdigen Typen durch spezielle Zellen, den dickwandigen Hererocysten (enthalten Nitrogenase; keine photosynth. O 2 -Produktion in diesen Zellen) durch Phosphateintrge in Gewsser ( Eutrophierung) oft Massenentwicklung dieser Bakterien an der Oberflche von Gewssern (N-Mangel kann durch N 2 Fix. ausgeglichen werden) z. T. symbiontisches Vorkommen mit Pilzen als Flechten Beispiele: Anabaena, Nostoc, Chlorococcus

Anoxyphotobacteria auch diese Bakterien betreiben Photosynthese, aber eine anaerobe Photosynthese (d. h. eine typ. bakterielle Photosynthese, die sich von der pflanzlichen oder der der Oxyphotobacteria unterscheidet). als Pigmente kommen Bacteriochlorophylle vor, die andere Lichtanteile absorbieren als Chlorophyll (Anoxyphotobakt. Leben auch in tieferen Schichten, wo anaerobe Verhltnisse und gerade noch Licht) Erscheinungsbild der Biomasse: rot-braun-oliv (selten grn) verschiedene Zellformen (Stbchen, Kokken, Spirillen, sprossende Formen); oft begeielt Vorkommen in S- und Meerwasser (anaerobe Bereiche) z. T. N 2 -Fixierung, z. T. Massenentwicklung (rote Platten ber Schlammschichten der Gewsser) phylogenetisch sehr verschiedene Linien unterscheidbar (obwohl physiolog. hnl. Eigenschaften):

1. Gruppe: Grne Schwefelbakterien (eigenes Phylum Chlorobi) (frher: Chlorobiaceae, Chlorobacteriaceen); oliv bis grn, S als Zwischenprodukt der anaeroben Photosynthese abgelagert; i. d. R. extern, d. h. auerhalb der Zellen Beispiel: Chlorobium

2. Gruppe: Schwefelfreie grne Bakterien (eigenes Phylum Chloroflexi) grn, i. d. R. als Filamente, oft in heien Quellen Beispiele: Chloroflexus, Heliothrix (lebt symbiontisch)

3. Gruppe: Schwefelfreie Purpurbakterien (im Phylum Proteobacteria, i. d. R. . . innerhalb der Klasse Alphaproteobacteria, frher auch als Athiorhodaceae, oder Rhodospirillaceae); rot/braun, keine S-Ablagerung bei H 2 S-Nutzung Beispiele: Rhodospirillum, Rhodobacter, Rhodocyclus (zu Betaproteobacteria), Rhodomicrobium . .

4. Gruppe: Schwefelhaltige Purpurbakterien (im Phylum Proteobacteria, innerhalb der . . Klasse Gammaproteobacteria, frher auch als Thiorhodaceae oder Chromatiaceae); rot/braun; S als Zwischenprodukt abgelagert, i. d. R. intern (in den Zellen) Beispiele: Chromatium, Thiospirillum Massenentwicklung in oberer Schicht v. H 2 S-haltigem Tiefenwasser. 5. Gruppe: Heliobakterien (im Phylum Firmicutes, Klasse Clostridia) Beispiel: Heliobacterium (im Gegensatz zu brigen Anoxyphotobacteria: grampositiv)

Deinococci-Zweig Deinococcus: strahlungsresistente Zellen (hocheffiziente Rep.-systeme) Thermus: thermophile Bakterien (z. T. techn. Enzymproduzenten)

Planctomycetes-Zweig Sprossende Bakterien, ohne Peptidoglykan

Gleitende Bakterien besondere Art der Fortbewegung: gleiten auf Oberflchen (ohne Geieln); Vorkommen in Boden, Dung, auf verrottenden Pflanzen, Rinde, selten auch im Wasser; gehren zu verschiedenen Phyla: 1. Gruppe: Cytophaga/Flavobacterium/Bacteroides-Zweig: Bacteroidetes keine Photosynthese, davon nur bestimmte Gattungen gleitend: Cytophaga: Flexibacter: Flavobacterium: Abbau vieler Stoffe (Zellulose, Lignin, Chitin, Agar) fischpathogene Bakt. gelbe Farbstoffe bildend, kaum gleitend, aber verwandt mit vorherigen Gattungen Bacteroides: nicht gleitend, anaerob (Grung), Darmbewohner

2. Gruppe: Cyanobacteria (bereits behandelt, s. o.)

3. Gruppe: Vertreter des Phylums Proteobacteria (s. u.) Myxobacterium: bilden als einzige Bakterien Fruchtkrper: 0,1 0,5 mm gro (makroskop. sichtbar, oft lebhaft gefrbt), entstehen durch Zusammenkriechen der Zellen; bilden

Ruhezellen: Myxosporen, oft bakteriolytische Wirkung: berflieen und zersetzen andere Bakterienkolonien Beggiatoa: blaualgenhnliche filamentse Formen (aber ohne

Photosynthese), keine Fruchtkrper

Spirochaetes-Zweig schraubige, flexible und stark bewegliche Bakterien mit periplasmatischen Geieln (Endogeieln, die unterhalb der ueren Hllmembran verlaufen); dadurch korkenzieherartige Bewegungen in hoch visksen Medien (Serum) und auf Oberflchen mglich; sehr geringe Durchmesser dadurch schlecht sichtbar im Hellfeld-Mikroskop, saprophyt. od. parasit. Lebensweise. Die Gesamtheit aller periplasmat. Geieln wird Achsialfilament (od. Axostyle)

benannt. Beispiele: Spirochaeta plicatilis: Sedimente u. Gewsser (saprophyt.) Treponema pallidum: Syphilis (parasit.) Borrelia recurrentis: Rckfallfieber (Vektoren: Luse) Borrelia burgdorferi: Lyme-Krankheit (Vektoren: Zecken) Leptospira interrogans: Leptospirosen der Haustiere, z. T.

bertragung auf Mensch (Badeanstalten mit wenig Chlor i. Wasser); Fieber, Nieren- und Leberentzndungen Monate) Chlamydiae-Zweig obligate intrazellulre Parasiten, kein Peptidoglykan, keine Cytochrome u. (z. T. latent mehrere

Atmungskettenenzyme, eigener Baustoffwechsel aber ATP-Schmarotzer, sehr kleines Genom (1/5 bis 1/8 v. E. coli), versch. menschl. u. tier. Erkrankungen. Beispiel: Chlamydia trachomatis: Chlamydia psittaci: Trachom Papageienkrankheit

Eine hnliche Lebensweise wie Chlamydien (als obligate intrazellulre Parasiten) haben Rickettsien; letztere sind aber nicht verwandt mit dem Phylum der Chlamydien, sondern gehren zu den Proteobakterien (, s. u.).

Proteobacteria-Zweig groe Bakteriengruppe mit ca. 300 Gattungen; gliedern sich in Alpha-, Beta-, Gamma-, Delta- und Epsilon-Subgruppe.

1. Gruppe: Anoxyphotobakterien Innerhalb der Proteobakterien gibt es 2 Gruppierungen von Anoxyphotobakterien, die bereits bei den brigen Anoxyphotobakterien (s. Seite 3) abgehandelt wurden ( bzw. -Zweig). Daneben existieren heterotrophe Bakterien, die noch

Photosynthesepigmente (z.T. ohne Funktion) besitzen, z.B. Roseobacter ().

2. Gruppe: Scheidenumhllte Bakterien (sheated bacteria) bilden lange Scheiden, in denen die stbchenfrmigen Bakterien wie in einer Rhre leben, Scheiden knnen bei Wachstum sehr lang werden (bis cm-Bereich) und bilden fellartige Belge in Abwasser in Rhren und Grben (bes. bei Nhrstoffberschuss), z. T. Schden in der Wasserwirtschaft (Verstopfungen, Aufwuchs auf Wassertieren u. Pflanzen, z. T. sogar Fischaugen; O 2 -Mangel bei Fischeiern verursachend). Beispiel: Sphaerotilus natans (Trivialname: Abwasserpilz),

3. Gruppe: Sprossende Bakterien/Bakterien mit Anhngern (prosthekate Bakterien) Hyphomicrobium: sprossend, Tochterzellen an lebenden Stielchen bilden z. T. Hutchen auf Wasserbdern, Caulobacter: bohnenfrmige Zellen mit Stielen, die sich am Ende mit Anheftungsstellen an feste Oberflchen anlegen knnen, Gallionella: stbchen- bis bohnenfrmige Zellen bilden an Breitseite Exkretstiele (kein lebendes Material), nicht festsitzend, Stiele aus Schleimfibrillen und Eiseninkrustierungen,

4. Gruppe: Spirillen/gebogene Stbchen schraubenfrmige unflexible Zellen mit starrer Zellwand, z. T. lophotrich begeielt; z. T. microaerophil Beispiele: Azospirillum: Spirillum: Aquaspirillum: Bdellovibrio: spiralfrmig., N 2 -Fixierer(bei Graswurzeln u. a.), spiralf., saprophyt, spiralf., saprophyt., in Wasser, kleine gebogene Stbchen, parasitieren an anderen

gramnegativen Bakterien, ganze Zelle dringt in Periplasma v. Wirtsbakterien ein und lst Wirtsbakterienzellen auf (PlaqueBildung wie bei Phagen), Campylobacter: gebogen, parasit.; Durchflle bei Mensch und Tieren, Abort bei Schafen und Rindern, bertragung z. B. durch nichtpasteurisierte Milch,

5. Gruppe: Aerobe Stbchen und Kokken

Rhizobium:

symbiontische

N 2 -Fixierer,

Knllchenbakterien

der

Leguminosen, zu Rhizobakterien, 6

Agrobacterium:

Erreger

des

Pflanzenkrebses,

besitzt

das

T i -Plasmid

(T i = Tumoren induzierend), Acetobacter: Gluconobacter: Brucella: Essigsurebakterien: Ethanol Essigsure CO2 + H2O,

Brucellosen der Haustiere; seuchenhaftes Verwerfen,

Neisseria gonorrhoeae: Erreger des Trippers, Pseudomonas: monopolar begeielte Stbchen, Abbau vieler Stoffe (Cellulose, Lignin, Kohlenwasserstoffe; Aromaten, Detergentien, Herbizide u. a. Umweltchemikalien, bilden z. T. grn fluoreszierende Farbstoffe wie Fluorescein (= Pyoverdin), oder blaue nichtfluoresz. Farbstoffe wie Pyocyanin, selten pflanzenpathogen, Xanthomonas: Azotobacter: gelbe Pigmente, generell pflanzenpathogen, freilebende N 2 -Fixierer, Ca++-Bedarf, knnen dickwandige Zysten bilden, Methylococcus: methylotrophe Bakterien (Methan/Methanol-Ox.),

6. Gruppe: fakultativ anaerobe Stbchen () Grung unter Luftabschluss (versch. Formen v. Grungen), oft im Darm (= Enteron) vorkommend, daher als Enterobacteriaceae bezeichnet. Escherichia coli: Modellobjekt untersuchten Trinkwasser, selten pathogen: bestimmte Stmme verursachen Durchflle bei Kindern oder Reise-Diarrhoe Shigella: Salmonella: Ruhr-Erreger Erreger v. Typhus (Mensch), Paratyphus (bes. Tiere) oder Enteritis (daher: TPE-Erreger) Salmonella typhi Salmonella paratyphi Salmonella typhimurium Salmonella enteritidis sowie 2 000 weitere Sarovare wichtige Keime fr Hygienekontrollen, Verbreitung ber der Mikrobiologie, der einer Welt, der am besten im

Organismen

Fkalanzeiger

verschmutztes Wasser oder Lebensmittel Serratia marcescens: bildet rotes zellgebundenes Pigment: Prodigiosin Yersinia pestis: Pesterreger, bertragung z. T. durch Flhe Beulenpest: Ratten Mensch (Rattenflhe) Lungenpest: Mensch Mensch (Trpfcheninfektion) 7

Proteus:

typ. saprophyt. Bakterien, H 2 S-Produzent

7. Gruppe: Vibrionen und Verwandte () Vibrio cholerae: Photobacterium: Cholera-Erreger sendet Licht aus, marine Biotope

8. Gruppe: Chemolithotrophe Bakterien Nutzung von anorganischen H-Donatoren Beispiele: Nitrosomonas: Nitrobacter: Thiobacillus: NH 4 NO 2 - , NO 2 - NO 3 - , H 2 S/S SO 4 2-, z. T. acidophil techn. Nutzung zur Laugung v. Armerzen (Leaching),

9. Gruppe: Sulfat- und Schwefelreduzierer (Desulfurikanten) Anaerobe Atmung mit Sulfat oder Schwefel als e-Akzeptor, obligate Anaerobier (Sedimente v. Gewssern) Beispiel: Desulfovibrio: SO 4 2- H 2 S (NAD-Regeneration), H 2 S reagiert mit Metallen unter Sulfidbildung (schwarze Frbung v. Sedimenten)

Firmicutes-Zweig (erste Hauptgruppe der grampositiven Bakterien) (Firmicutes; lat. firmus = fest, stark; bezogen auf Murein)

1. Gruppe: Endosporen bildende Stbchen und Kokken Bacillus : ovale oder runde Sporen, aerob oder fak. anaerob B. subtilis: B. anthracis : B. cereus: B. thuringensis: Paenibacillus: Heubazillus Milzbranderreger Lebensmittel-Kontaminante insektenpathogen

ovale Sporen, aerob oder fak. anaerob P. polymyxa: Saprophyt auf Pflanzenmaterial, N2-Fixierung, Antibiotikabildner P. larvae: insektenpathogen

Geobacillus: Clostridium:

ovale Sporen, aerob, thermophil, z.T. Alkanabbau anaerob 8

C. botulinum:

Lebensmittel-Vergifter (Botulismus), bildet das hochtoxische Botulinus-Toxin; 1 mg ist letale Dosis fr 18 0000 Menschen oder 20 Millionen Muse

C. tetani:

Tetanus-Errger (Wundstarrkrampf)

2.Gruppe: Asporogene Kokken Staphylococcus aureus: oft als Eitererreger, gelblich, Kokken in unregelm. Aggreg. Streptococcus pyogenes: oft Eitererreger, weilich, bildet hydrolyt. Enzyme u. Toxine; zu humanpathogenen Streptokokken. Kokken in Ketten angeordnet Streptococcus mutans: Lactococcus lactis: Erreger der Karies; zu oralen Streptococcen Milchsure-Bakterium; wichtig als Starterkultur der Herstellung von Milchprodukten (Sauerrahm-Butter); zu Milch-Streptococcen Leuconostoc mesenteroides: Milchsure-Bakterien, ebenfalls in Milchindustrie Verwendet

3. Gruppe: Asporogene Stbchen Lactobacillus plantarum: Sauerteig, Silage, Sauerkraut, andere Arten:

Milchsuerung (z. T. als Starter) Listeria: z. T. pathogene Arten Listeriose, versch.

Krankheitsbilder, bes. bei geschwchten Personen: Grippe, hohes Fieber, Gehirnhautentzndung,

Hautvernderungen, Fehl- und Frhgeburten

4. Gruppe: Mycoplasmen (Mollicutes) keine echte Zellwand, nur CM (daher resistent gegen Penicillin), stark pleomorph, erscheint in Gram-Frbung gramnegativ, nach rRNA-Daten aber verwandt mit Clostridien, sehr kleine Zellen (0,2 m) und kleines Genom, auf knstl. Medien; spiegeleiartige Kolonien (Mitte erhaben), z. T. Steroidbedarf, saprophyt. oder parasit. Lebensweise. Beispiel: Mycoplasma pneumoniae: grippehnl. Infekt/atyp. Pneumonie

Actinobacteria-Zweig (zweite Hauptgruppe der grampositiven Bakterien) meist unregelmige Stbchen, z. T. auch Filamente und Myzelien bildend Micrococcus: grampositive Kokken mit Sonderstellung (nicht verwandt mit 2. Gruppe der Firmicutes), saprophytisch Actinomyces: bilden z.T. verzweigte Filamente, spter fragmentierend zu unregelmigen, z.T. keulenfrmigen Stbchen; fakultativ anaerob; z.T. pathogen Clavibacter: Corynebacterium: . Mycobacterium: gerade bis unregelmige Stbchen; aerob; pflanzenpathogen unregelm. Stbchen, z.T. keulenfrmig, C. diphtheriae (Diphtherie) schlanke gerade Stbchen, M. tuberculosis, M. bovis

(Tuberkulose) Nocardia: lange verzweigte Fden, die wieder in Einzelzellen zerfallen knnen, Streptomyces: Mycelien bildend von (Substratmycel Kulturen + Luftmyzel), Bildung typ. vieler

Bodengeruch Antibiotika.

(Geosmin),

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