BASE QUMICA DE LA VIDA:

BIOELEMENTOS Y BIOMOLCULAS

BASE QUMICA DE LA VIDA

Uno de los principales descubrimientos de la biologa es que los organismos vivos estn compuestos del mismo tipo de elementos qumicos.
Toda la materia viva est compuesta por: Agua (hasta 75-80% del peso celular), Bioelementos primarios como C, O, N, H, P y S. Bioelementos secundarios: como Ca, Na, Cl, K, Mg, Fe, etc.

CONSTITUYENTES DE LA MATERIA
tomos: unidades fundamentales de la materia Los elementos son sustancias puras que estn compuestas por un solo tipo de tomos El nmero de protones identifica el elemento Los electrones son responsables de la formacin de los enlaces qumicos

CONSTITUYENTES DE LA MATERIA
1. 2. 3. 4. Los tomos tienen: Volumen Nmero atmico Smbolo qumico Masa: Cantidad de materia presente

LA TABLA PERIDICA

LAS MOLCULAS SE FORMAN MEDIANTE ENLACES QUMICOS

El comportamiento de los electrones determina como ocurren las reacciones.

LAS MOLCULAS SE FORMAN MEDIANTE ENLACES QUMICOS

Enlace qumico: fuerza de atraccin que une a los tomos para formar molculas. Existen diferentes tipos de enlaces qumicos:
Enlaces covalentes Enlaces inicos Enlaces de hidrgeno Interacciones hidrofbicas Fuerzas de van der Waals

LAS MOLCULAS SE FORMAN MEDIANTE ENLACES QUMICOS

Enlace covalente: tomos que comparten uno o ms electrones en su ltima rbita o nivel para alcanzar su estabilidad.
Es muy fuerte y difcil de romper. Sencillo, doble, triple Coordinado Solubilidad variable de acuerdo a polaridad. No polar (simtrico) Polar (asimtrico)

LAS MOLCULAS SE FORMAN MEDIANTE ENLACES QUMICOS

LAS MOLCULAS SE FORMAN MEDIANTE ENLACES QUMICOS

Enlaces covalentes polares cuando las cargas de un elemento son mayores a las del otro y se comparten electrones asimtricamente = ELECTRONEGATIVIDAD

LAS MOLCULAS SE FORMAN MEDIANTE ENLACES QUMICOS

Enlace inico: tomos que transfieren completamente uno o ms electrones y se forman por atraccion de cargas positivas y negativas
Cationes (+) y aniones (-)
Se rompe con facilidad obtenindose los iones que lo forman Las substancias con enlaces inicos son solubles en solventes polares.

LAS MOLCULAS SE FORMAN MEDIANTE ENLACES QUMICOS

LAS MOLCULAS SE FORMAN MEDIANTE ENLACES QUMICOS

LAS MOLCULAS SE FORMAN MEDIANTE ENLACES QUMICOS

Enlaces de hidrgeno: se forman por la atraccin de la carga parcial (+) del hidrgeno de una molcula y la carga parcial () del hidrgeno de otra molcula. Los enlaces de hidrgeno se forman entre molculas de agua y son importantes en la estructura del ADN y protenas

LAS PROPIEDADES DEL AGUA

El agua tiene una estructura NICA que la convierte en un es un solvente eficz! Es una molcula polar Forma enlaces de hidrgeno Tiene forma tetradrica

QUE MS?

LAS PROPIEDADES DEL AGUA

LAS PROPIEDADES DEL AGUA

LAS PROPIEDADES DEL AGUA

Porque el agua moja? Como sube de las races a las hojas el agua? Porque el hielo flota?

DE QU SE COMPONEN LOS ORGANISMOS?

Proteinas cidos nucleicos Carbohidratos Lpidos

MACROMOLCULAS Macromolculas: polmeros gigantes que se forman por reacciones de condensacin e hidrlisis.

Macromolcula: > 1 kilodalton

Condensacin e Hidrlisis de Polmeros

Condensacin e Hidrlisis de Polmeros

MACROMOLCULAS Protenas: polmeros de aminocidos Carbohidratos: azcares y polmeros de azcares Lpidos: molculas insolubles en agua: glicerol, cidos grasos, fosfolpidos, carotenoides, esteroides cidos nucleicos: polmeros de nucletidos

MACROMOLCULAS
Las funciones de las macromolculas estn relacionadas con su forma y las propiedades qumicas de sus monmeros. Algunas de las funciones de las macromolculas son:
Almacenamiento de energa Soporte estructural Transporte Proteccin y defensa Regulacin de actividades metablicas Movimiento, crecimiento y desarrollo Almacenamiento de informacin

DE DNDE SURGIERON LAS MOLCULAS ORGNICAS? Dos teoras: 1. La vida tiene origen extraterrestre 2. La vida se origin en la tierra por evolucin qumica

DE DNDE SURGIERON LAS MOLCULAS ORGNICAS? Origen extraterrestre

Meteorito ALH84001 (4500 millones de aos)

PHOTO 3.1 LIFELIKE

STRUCTURES ON

MARS
METEORITE ALH

84001. SEM.

DE DNDE SURGIERON LAS MOLCULAS ORGNICAS? Origen de la vida segun la evolucin qumica Las condiciones de la tierra primitiva dieron origen a las molculas orgnicas Experimento de Stanley Miller y Harold Urey.

GRUPOS FUNCIONALES
El comportamiento qumico de un compuesto est dado por los GRUPOS FUNCIONALES Son grupos de H, N y O unidos a los esqueletos de carbono

PROTENAS

Las diferencias entre los aminocidos estn dadas por los grupos R o cadenas terminales.

PROTENAS

AA con cadenas hidroflicas cargadas

PROTENAS

AA con cadenas polares NO cargadas

PROTENAS

AA con cadenas no-polares hidrofbicas

FUNCIONES DE LAS PROTENAS

Funcin
Catlisis Defensa Transporte

Tipo de protena
Enzimas Inmunoglobulinas, Toxinas, Antgenos de superficie Transportadores de membrana, transportadores circulantes Fibras Msculo Osmtica, Gnicos, Hormonas Unin de iones

Ejemplos
Polimerasa Proteasas

Uso
Sintesis DNA y RNA

Soporte Movimiento Regulacin Almacenamiento

ESTRUCTURAS PROTEICAS
Cdigo de tres letras y de una letra para los AA
Glicina Alanina Serina Treonina Cisteina Valina Isoleucina Leucina Prolina Fenilalanina Gly Ala Ser Thr Cys Val Ile Leu Pro Phe G A S T C V I L P F Tirosina Metionina Triptofano Asparagina Glutamina Histidina Acido asprtico Acido glutmico Lisina Arginina Tyr Met Trp Asn Gln His Asp Glu Lys Arg Y M W N Q H D E K R

ESTRUCTURAS PROTEICAS
Existen cuatro estructuras proticas: 1. Primaria: secuencia de aminocidos
Estructura primaria de la Lisozima: KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWM CLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQI NSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDN IADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQ NRDVRQYVQGCGV

ESTRUCTURAS PROTEICAS
1. Primaria: secuencia de aminocidos

ESTRUCTURAS PROTEICAS
2. Secundaria: patrones regulares repetidos en diferentes puntos de la cadena polipeptdica

Hlices Lminas

ESTRUCTURAS PROTEICAS
3. Terciaria: es la forma tridimensional del polipptido completo
El determinante primario de esta estructura es la interaccin entre los grupos R por: Enlaces o puentes disulfuro (entre Cistenas) Interacciones hidrofbicas Enlaces inicos Fuerza de Van der Waals Puentes de H

3. Terciaria: es la forma tridimensional del polipptido completo

Interacciones no-covalentes entre Protenas y otras Molculas

UNIONES NO COVALENTES ENTRE PROTENAS Y OTRAS MOLECULAS A travs de grupos R

ESTRUCTURAS PROTEICAS
4. Cuaternarias: es la estructura final de la proteina, dada por la asociacin de los diferentes polipptidos

ESTRUCTURAS PROTEICAS
4. Cuaternarias
Hemoglobina

Se puede predecir la configuracin de una proteina a partir de la secuencia?

SI! NO! Pero...

 Antes: muy difcil Ahora: en una semana se publican unas cuantas estructuras terciarias de protenas. Por:
Biotecnologa ha permitido purificar protenas a mayor escala Avances computacionales para el anlisis de datos atmicos = BIOINFORMTICA, PROTEMICA

PDB = Protein Data Bank http://www.rcsb.org/pdb/ 30263 modelos

PDB = Protein Data Bank: base de datos de modelos

JALVIEW (BARTON GROUP)

PDB = Protein Data Bank http://www.rcsb.org/pdb/ 30263 modelos

PDB = Protein Data Bank: http://www.rcsb.org/pdb/

PDB = Protein Data Bank

PDB = Protein Data Bank

Tres representaciones de Lisozima

Varias formas de representar una estructura terciaria .

DENATURACIN
Prdida de la estructura tridimensional de una proteina Temperatura: Puentes H e Interaciones hidrofbicas pH: Atracciones y repulsiones inicas Concentracin de sustancias polares y no polares: Puentes H

Denaturacin es la Prdida de la Estructura Terciaria y la Funcin de una Protena

DENATURACIN
Protenas a veces se unen a los ligandos equivocados (vaca loca)
Denaturadas Recin sintetizada y no plegada correctamente

Cmo lo evita la clula?

Chaperoninas (o chaperonas) son proteinas especializadas que evitan que esto ocurra.
Unas ayudan al proceso de plegamiento Otras evitan plegamiento hasta el momento adecuado

Chaperonas: Protegen a las Protenas de Plegarse Inapropiadamente

CARBOHIDRATOS

CARBOHIDRATOS
Azcares y polmeros de azcares Compuestos primordialmente de H - C OH Dos funciones: 1. Fuente de energa (almacenamiento y transporte) 2. Componentes estructurales

CARBOHIDRATOS
Existen cuatro categoras principales:
Monosacridos: azcares simples- glucosa, fructosa Disacridos: dos monosacridos Oligosacridos: de 3 a 20 monosacridos Polisacridos: compuestos de cientos o miles de monosacridos almidn, glucgeno, celulosa

CARBOHIDRATOS
Todas las clulas contienen glucosa C6 H12 O6 La glucosa existe en dos formas: lineal y anillo (ms abundante y ms estable) El anillo posee dos configuraciones: y

Monosacridos: Glucosa
>C=O

Monosacridos: Glucosa

Numeracin de carbonos estandar

Monosacridos:

El ms pequeo No forma anillo

Propiedades diferentes ARN ADN

Monosacridos:

Son ismeros estructurales: C6H12O6 pero tienen propiedades bioqumicas (funciones) diferentes

Disacridos:
Es la unin de dos monosacridos covalentemente por enlaces glicosdicos
Glucosa + Fructosa = Sucrosa Glucosa + Galactosa = Lactosa

Digerible por nosotros y muchos organismos

MALTOSA

No digerible por nosotros y muchos organismos (solo algunos microorganismos)

CELULOSA

Reconocidos por diferentes enzimas

Oligosacridos:
Contienen ms de dos monosacridos Se encuentran con frecuencia unidos a proteinas y lpidos de la superficie celular, y sirven de seales de reconocimiento

Oligosacridos:
Los grupos sanguneos ABO, son determinados por los oligosacridos de la superficie celular de los heritrocitos. Son diferentes gracias a las cadenas de oligosacaridos

Oligosacridos:
GRUPOS SANGUNEOS

Polisacridos:
Son cadenas largusimas de monosacaridos unidos or enlaces glicosdicos Almidn: polisacrido de glucosa con enlaces glicosdicos Almacenamiento de energa en plantas Glucgeno: polisacrido de glucosa altamente ramificado Almacenamiento de energa en animales

Polisacridos:
Celulosa: polisacrido de glucosa con enlaces glicosdicos Componente de paredes vegetales, muy estable

Polisacridos:

Polisacridos:
Difcilmente digerible Fcilmente digeribles

Celulosa

Almidn

Glucgeno

Carbohidratos modificados
Los carbohidratos son modificados por la adicin de grupos funcionales:
Oxidacin de un OH a COOH Adicin de fosfato Adicin de grupos amino

Carbohidrato Modificado Qumicamente

Fosfato adicionado a uno a ms sitios hidroxilo (OH) da lugar a un azcar-fosfato importantes en obtencin de energa en la clula

Carbohidrato Modificado Qumicamente

Los grupos OH pueden ser sustituidos por grupos amino convirtindose en amino-azcares tal como glucosaminas y galactosamina. Son componentes escenciales de cartlago y tejido conectivo en vertebrados

Carbohidrato Modificado Qumicamente

Quitina: polimero de N-acetilglucosamina