A R T C U t OT C N I C O

Anlisis Estadstico deMedidas Repetidas* l. Se cumple elsupuesto deunpatrn de Astrid Gutirrez deG.'y Carlos Manrique P2 varanza y covaranza homogneas

ABSTRACT

R E SU M E N

En estetrabajo sedescribela metodologaestadstica para el anlisisde Ia informacin provenientede experimentos con medidasrepetidas sobrela misma unidad experimenL The assumption of tal cuando se cumplen los supuestos de homogeneidadde la matriz de varianzahomogeneous variance-covariance covarianza. matrix is met El modelo estadstico, con una estructurade anilisis devarianzade parcelas divididas, esilustrado con datosde un experimentode inmunidad animal. Sepresentala prueba This paperdescribes the statistical F <conservadorao, la cual permite decidir sin un examenprevio de los datos,si el anmethodology for the analysisof Iisis univariado esel adecuado, o serequierede un procedimiento ms riguroso. information from experimentswith De otro lado, la prueba de esfericidadbajo la hiptesisnula (Ho) de no correlacin e repeatedmeasurements on the same igual varianza de los componentesortogonales,indica el tipo de pruebasestadsticas experimentalunit under the requeridaspara probar el efectode tratamientosy perodoslos cualesserndiscutidos assumption of homogeneous varjance en la parte II de estetpico. - covariance matrix. The statisticalmodel, with a structure PalabrasClaves:mtodos estadsticos. matrz varianza- covarianza. of analysisof varianceassplit plot, is illustrated with data from an experiment of animal immunity. A <conservative) F-test is proposed;it INTROD UCCON allows to decide, without a previous y otra para los perodosde tiempo (Steel examination of data,the adequacy of T I-os rvsrrcADoRES del reaagrope- y Torrie,1986), o un enfoquemultivariado, the univariate analysisof varianceor cuaria frecuentementeconducen experi- cuando se tiene una matriz de varanzathe needof more rigurousprocedures. mentosque involucran datosen cadauna covarianza heterognea,condicin que In addition, the sphericity test under de varias unidades experimentales (i.e. puede afectar lavalidez de las pruebas F (Ho) of no the nule hypothesis plantas,animales, tubos de ensayo), bajo para el factor repetitivo. correlation and equal varianceof (i.e.ferdiferentes estmulos o tratamientos Aunque en la prctica se observamuorthogonalcomponents, indicates the tilizantes,dietas,drogas)y cuyo efectose chasveces que la correlacinentre dos petype of statisticaltestsrequired for mide a travsdel tiempo (i.e.das,meses). rodos declina con diferencias grandesen testingtreatments and period effects, En genera otros casos, la informacin se propone el tiempo, se el anilisis de varianza which are discussed in part II of this cuando cada uno de varios tratamientos univariadoporquela estructurae interpre(i.e. drogas,nivelesde riego) se aplican tacin esfamiliar y no requierede un masecuencialmente a la misma unidad expe- nejo matricial complejo. A diferenciadel Key Words: statisticalmethods, rimental. mtodo multivariado,su estadstica F est -covariance variance matrix En general,el arreglo de medidasrepe- definida si el nmero de respuestas excede tidas difiere del de parcelasdivididas en los gradosde libertad dentro de grupos o que los nivelesde uno o ms factoresno tratamientos. Por estarazn, Geisser y puedenserasignados aleatoriamente a las Greenhouse (1958) investigaronel anilisis unidadesexperimentales, tal como podra de varianzade perfiles,bajo el supuesto de ser el tiempo de lectura, o en otros casos, residuales, con distribucin multinormal y los nivelesde riego. general y propuuna matriz de covarianza Bajo estascircunstancias, los errores sieronuna pruebaF conservadora (basada correspondientes a las unidadesexperi- en Ia mxima reduccinde gradosde libermentalespuedentener o no una matriz de tad),para laspruebasde hiptesisde difev arianza-cov arianzahomo gnea(Milliken rencias en respuestay paralelismo cuyo et al, 1986; Gill et al, r97r). verdaderovalor ct no excedaun valor de para el casoms significanciaespecfico.Proponenlos auEI anlisisestadstico medidas puedetener toresun factor de ajusteE, a los gradosde simple de repetidas, r. Coordinacin RegionalPecuaria, IcA, c.I. entoncesun enfoque univariado, con es- libertad, cuando el estadstico Tibaitat, Apartado t5ttz3 Eldorado, Bogot, el R excede Colombia. tructura de parcelas divididas dado que el valor crtico tradicional pero no excede el z. ProgramaNacionalde Biometraconporce modelo y el anlisistienen dospartes,una valor F tabulado encontradocon los grac.I. Tibaitat, Apartado z4ot4zLas Palmas. paralos sujetos(unidades experimentales) dos de libertad conservadores. Bogot, Colombia.

Tlle: Statistict """tr*::rl:T::11

REVISTC A O R P O I C AV . Ot | . Nol . OCTUBRE 1996,

repetidas 49 de medidas estadstico Anlisis

una En el anlisisde medidasrepetidas, condicin suficientepara que las pruebas F del anlisisde varianza seanvlidas es que las matrices de covarianzade9,,f por 6, denotadas

parte del modelo: La segunda

n+ftn) + t
los perodosde tiempo anaconsidera lizadosdondepoesel efectodel perodo,

'x ' 2=-lv-zp26 (p-t)

3P!3

lmw

tiene la distribucin fi cuadrado con f = Vzp(p-I)-l gradosde libertad cuando v es grande y I tiene el patrn tiPo H. encontrlos momentos Anderson (1984), Cov(6;)=A FP)n Cov (Ei)=2 y de I4l y demostr que panaq = 3, K fieperodopor tratamien- ne una distribucin exactafi-cuadrada la interaccin tenganuna forma de simetracomPuesta, t los erroresasociados con f=2 gradosde libertad. --o representan y es- to implicando que lasvariablesaleatorias asumeque perodos. Se a dichs y tienen tn igualmentecorrelacionadas I4l se puede calcular con Ia siguiente iguales.La simetriacompuesta varianzas oi) t t* N(o'oi) N ( o . alterna: expresin de los erroresson cay la independencia (Huynh de la condicin H-F sosespeciales , " , , ( pt-) ' ' ' S U ' s - i ) el Para el casode medidasrepetidas, y Feldt,rgzo). Sin embargo,estacondi,1^ grrr' parcelasdivididas cin permite varianzas y correlaciones anlisisde vaanzade ms genela cual indica la invarianza de l4lbajo siempre y cuando se ajuste el es el adecuadobajo supuestos desiguales, las de formas de la matriz C (Morrison, ciertas que la escogencia contemplan numeradory el denominadorde los gra- rales, denotadas 6, covarianzaEu 1 9 9 0 ) . de matrices I dos de libertad que pueden al.udar a que los nivelesde proteccin de las pruebasF por Cov(s)=2y Cov(d)=A univariadasseajustena susvaloresnomiResultadosy Discusin nales. cetcomsimetra de En el experimentode referencia,20 es Ia condicin como aplicanLa condicin de H-F seevala aleatoriaDicha confueron (Huynh 1970). condicin y Feldt, de similar dos puesta (Anderson, esfericidad do la prueba de a dosgrupos( 10animales como: menteasignados orto- dicin seexpresa a un grupo de componentes 1958) en uno de los gruLos animales uno). cada bajo la hiptesisnula (Ho) que gonales, problema y los la vacuna pos recibieron no estnco[,0 ortogonales los componentes p / grupo control. Las como actuaron otros > o 2 rrelacionados y tienen varianza ig:ual. aquanaleucocitario recuento del lecturas seutiliserechaza, Cuandoestahiptesis o de los uno en cada se realizaron lizadas io zan las pruebasmultivariadas o se hacen durandos das de intervalos con animales los de antesmencionadas lascorrecciones aleato- te 5 perodospost-vacunacin. La cual implica que lasvariables gradosde libertad a las pruebasF unies y tiecorrelacionadas En estecasode medidasrePetidas riasestnigualmente variadas. de del efecto adems conocer, iguales. importante de nen varianzas el anlisis trabaioseconsidera En este Huynh and Feldt (1970)han demostra- tratamiento, el efectoque el tiempo tiene medidasrepetidascon un enfoqueunivay suficien- sobrela variable de referencia,aunque la que su condicin necesaria do de un riado,cuandosecumple el supuesto repetidas validez de las comparaciones dentro de la medidas para t sobre te dada iguales.Se patrn devari anzasycovarianzas del (entre perodos), adems si: animales cumple se con losdatosde estadstico ilustrael anlisis de depende iguales, varianzas de supuesto tomados nrecuento leucocitario>, la variable entre la uniformidad de las correlaciones C2 C'=)'I del experimentoque evalael posibleefecdatos para cualquier par de periodos; lo la contra la vacuna de to inmunosupresor semisignificauna matriz submatriz que estadsticamente es cualquier donde C fueronsumicuales peste porcinaclsica,los - covarianzahomognea.DiHelmert (p-1) matriz p la x de devarianza ortogonal de Biotecnologa por el Programa nistrados chaestructurasepuedeexaminarmedianortogonal. Animalde CORPOICA. t l te la prueba de esfericidadaplicada a ,lp I la cual tiene componentesortogonales, Anlisis Estadstico L C] Sin embaruna distribucin fi-cuadrada. resla variable El modeloque describe 1 go , cuando no setienen las facilidadesde + los de es uno y h P Parmetros las de dos tamaos los y considera puesta sepuede aplicar que definenel patrn tipo H. j'es el vector cmputo pararealzarIa, es el siguiente: unidadesexperimentales F nconservadoprueba de la directamente lxp de unos. y Geisser Y i j k= V * r i + E t + p + f t r ) + E i k ra> sugeridapor Greenhouse (tgsil. Pruebade Huynh-Feldtpara Patrn de en estetrabaH. Paralos datosanalizados CovarianzaTiPo donde: La prueba Para evaluar el Patrn de jo, no seobserven el anlisisdevarianza p+ri+6t covarianza tipo H es de una mattiz de una interaccinperodox tratamientosigesfrica(Mauchl I 940) cuya nificativa (P=o.zt78), ni efecto de tratacovarianza es: miento (p=o.8549).El efectode perodo las estadstica es,laparte del modelo que considera ' ( c l c ' ) fu significativo (P=o.ooz7)indicando la (animales)donunidadesexperimentales - Ilo w @ de observarla tendenciaque necesidad el promedio general' t el de p representa (tr CSC')'-' leucocitario a travs del recuento tuvo el efectodel tratamiento,6es el error asoobteni(Tabla Los resultados 1). tiempo ciado a las unidadesexperimentales. es dos con la prueba de F <conservadora>,

il

' vOl | ' Nol ' OCTUBRE 1996 CoRPOIcA REvlsTA

repetidas de medidas Anlisis estadstico

repetidas. conmedidas leucocitario enunexpermento elrecuento Tablal, Anlisis de varianza Dara

Fuente de Variacin Tratamiento Anim firatF E(l) Perodo *Perodo Tratamiento = E(2) Residual Total

CL
I l8 4 4 72 99 17

CM
1026169.00 29806420.1 1 51000514.00 16756234.00 11335407.33
4.50 1.48

DF ord.
0.8549

DF cons.

** 0.0027 NS 0.2178

* 0.048 * 0.489

c.v.

= 9.4197 ortogonales: Criterio deMauchly aplicada acomponentes Prueba deEsfericidad = 0.1136 = 14.25 gl4 Pr>F NS Aprox Ji-cuadrada + Significativo (P<.05) ** Significatvo (P<.01) N5 Nosignificativo.

(DE)del (X)y desviacin leucocitarioenlostratamientosyperodosanalizados. recuento estandard Tabtal.Promedios TRAT

I 2 PERIODO 1 2
J

n 50 50 n 20 20 20 20 20 PERIODO I 2 3 4 I 2 4
I

19599.40 r9802.00

x
x

DE 3665.84 4438.26 DE 4727.76 3018.00 4634.29 3144.19 3457.14

4 5 TRAT l

21903.00 20766.00 18913.00 18970.50 17951.00 n l0 IO l0 l0 IO l0 IO 10 t0 l0

i
20526.00 20462.00 18676.00 19251.00 r9082.00 23280.00 21070.00 19150.00 1B690.00 16820.00

DE 4251.34 2446.99 4875.65 5096.05 3547.54 4989.94 3610.49 4650.63 5353.r 5 313t.l3

(l a 5), para y no lineal leucocitario en losperodos analizados lineal del recuento la tendenca Tabla. Prueba de contraste CONTRASTE
Lineal No- Lineal ** Significativo (P<.01) NS Nosignificativo GL
I

c.M.
t88160600.49 5280485.16

P >F

r6.60 0.47

** 0.0001 0.7644 NS

vo REVIST C AO R P O I G A . L | . *', . OarUra,,rJa

L-

repetidas 5l de medidas estadstico Anlisis

decir,con la mxima reduccinde los grade despus dos de libertad, encontrados dividir los grados de libertad para el numeradory denominadorde la tasaF por el nmero de perodosmenosuno (en el simiejemplo1, 18gl), arrojanresultados laresaunquecon P>F ms altas(0.0a8y 0.489) para el efecto de perodo y Ia interaccintratamiento x perodo respectivamente. para esta generalizar Sepuedeentonces que si el valor F pruebade conservadora, calculadode F es menor al valor crtico F tabulado,la hiptesisHo de promedios y la conclusinno se no serechaza iguales alteraal reducir los gradosde libertad. Al contrario,si el valor calculadode F excede el valor crtico tradicional (hay significancia se obtiene el valor F <conserestadstica), el F todavaexcede vadorr. Si la estadstica nuevovalor crtico, la Ho sepuederechasedebenutilizar otros zar.Si no Ia excede. en procedimientos ms crticosdetallados trabajo de estetpico de mediel segundo dasrepetidas. Es importante anotar que la prueba de fu no significativa(* = 4.25, esfericidad de una P= o.n36) indicando la existencia y homognea matriz varianza- covarianza la validezde las pruebasF del asegurando anlisisdevarianzaunivariado. Los promediosdel recuentoleucocitariopor trataen miento,perodo e interaccinaparecen paraevalaTabla2. La pruebadecontrastes luar la tendenciadel recuentoleucocitario lnealen el tiempo (P<.01) indicaun efecto con una disminucin en el recuentoa travs de los perodos analizados(Tabla 3). Cabe anotar, que cuando se observauna interaccinsignificativa,sedebencomparar con cadauno lospromediosdelosperodos y hallarlastendencias si de lostratamientos y/o compararlos tratamientos esnecesario; segnel caso. en cadauno de los perodos, En este trabajo no sediscutenlasimplicaobtenidos cionesbiolgicasde los resultados sonparcialesytieyaquelosdatosanalizados nen un enfoquemetodolgico- estadstico. Conclusiones EI anlisisde datos provenientesde medidasrepetidassobrela misma unidad experimental puede tener un enfoque univariado o multivariado segnseala estructurade los datos. La prueba F - conservadoraes un indicador delavalidez de los resultados obtenidos,cuandono seconocecon exactitud la estructurade la matriz devaranza - covarianza. de medidasrepeEI anlisisestadstico tidas con un enfoque univariado es simi-

lar al de parcelas divididas bajo el supuesto que pares de observaciones sobre la misma unidad experimental estn igualmente correlacionadas. La prueba de esfericidad determina si los componentes ortogonales estn igualmente correlacionados y tienen igual varianza. Si es significativo, se debe acudir al anlisis multivariado orealizar aitstes a las pruebas F univariadas. srrLrocnre Anderson, T.W. rg8+. An introduction analysis.z"ded. to multivariatestatistical fohn Wiley and Sons,Inc., NewYork. Geisser,S., and Greenhouse,S.W.1958. An extension of Box's results on the use of the F distribution in multivariate analysis. Ann. of Math. Stat. 29:885-891. Gill, J.L. and Hafs, H.D. t97r. Analysis of repeatedmeasurementsof animals. f. Arrim. Sci.zzQ):llt-n6. Gill, J.L. 1986.Repeatedmeasurement; sensitivetestsfor experiments with few animals.I. Anim. Sci.g:943-954. Huynh, H., and Feldt, L.S. r97o. Conditions under which mean squareratios in repeatedmeasurementsdesignshave exact F - distributions. f. Am. Stat.Assoc. 6':af,S82-r589. Maychly, J.W. r94o. Significancetest for sphericity of a normal n-variate distribution. Ann. of Math. Stat.u:zo4-2o9. Milliken, G.A., and fohnson, D.E, t984. Analysis of Messy Data. Vol I: Designed experiments.Van Nostrand, New York. Morrison, D.F. r99o. Multivariate StatisticalMethods. 3'" ed. McGraw Hill Int. SAS. r99r. SAS - Systemfor linear models. 3'" ed. SASInstitute Inc. Car North Caroline. Steel,R.G.D. and Torrie, J.H. rg88. Bioestadstica. Principios y procedimientos. z"ded. (r" espaol). McGraw Hill, Inc. U.S.A.

AVOL | . Nol . ocruBRE 1996 R E V T S TC AO R P O I C .