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Qumica Computacional Aplicada

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Mara Font. Dpto. Qumica Orgnica y Farmacutica. Seccin de Modelizacin Molecular. Universidad de Navarra
Mecnica Cuntica
Qumica Computacional Aplicada
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Mtodos de mecnica cuntica Mtodos de mecnica cuntica
Tratan las molculas como conjuntos de
tomos, con su dotacin electrnica concreta,
hibridacin, orbitales....
Tratan explcitamente los electrones.
Basan los estados energticos en interacciones
entre orbitales.
Describen tanto los enlaces que se forman
como los que se rompen.
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Mecnica Molecular versus Mecnica Cuntica ()
Mecnica Molecular (MM)
Esferas y muelles. Campos de
fuerza.
Multitud de parmetros y
aproximaciones.
Sistemas grandes.
Clculos rpidos.
Mecnica Cuntica (QM)
Partculas subatmicas.
Densidad electrnica.
Propiedades moleculares.
Formacin y rotura de enlaces:
reacciones.
Sistemas pequeos.
Alto consumo de recursos
computacionales (cpu, memoria,
disco).
+ + +
+ + =

elect vdW
diedros angulos enlaces total
E E
E E E E
E H =
`
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Mecnica Molecular versus Mecnica Cuntica ()
zona de mnimos zona de mnimos
e
n
e
r
g

a
R (distancia internucIear)
mecnica moIecuIar mecnica moIecuIar
mtodos mtodos semiempricos semiempricos
mecnica cuntica mecnica cuntica
Equivalencia Equivalencia
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Objetivos de la aplicacin de los mtodos de QM
Afinamiento de modelos: "E
real
, componente
electrnico.
Aplicacin de los distintos mtodos a elegir.
Conocimiento de las opciones de los distintos
mtodos.
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Los clculos de QM: premisas
Existencia del dualismo onda-corpsculo.
Ondas asociadas a partculas y a radiacin.
Conocimiento de onda asociada proporciona
informacin sobre la posicin y la E de una
partcula.
Cualquier estado dinmico puede ser descrito
"completamente por una funcin:
(q
1
, q
2
,., q
3N
t)
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Fundamentos de los clculos de QM ()
ProbabiIidad de encontrar
ese eIectrn
Funcin de onda
Los electrones tienen comportamiento ondulatorio
El comportamiento de un electrn slo puede ser
descrito por medio de una distribucin estadstica
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Fundamentos de los clculos de QM ()
Bohr Bohr (1913): analizando el espectro de emisin del tomo de
hidrgeno establece que su electrn est localizado en ciertas rbitas,
cada una con una energa asociada
De BrogIie BrogIie (1924): en mecnica clsica una partcula puede tener
cualquier energa. En el movimiento ondulatorio solo se observan
valores discretos de energa
Energa Energa cuantizada cuantizada
Bohr: Nobel en Fsica en 1922. De Broglie: Nobel en Fsica en 1929
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Fundamentos de los clculos de QM ()
De De BrogIie BrogIie: naturaleza dual de la materia
= h/m.u
Schrdinger Schrdinger (1926): ecuacin descriptora de
comportamiento y energa de las partculas subatmicas
H = E
Schrdinger: Nobel Fsica en 1933
= Funcin de onda. = Funcin de onda.
Funcin propia.
Describe estado del sistema y todas sus propiedades.
ndependiente del tiempo y sin efectos relativistas de spn.
H H = = Operador hamiItoniano. Operador hamiItoniano.
Energa cintica y potencial.
E E = = Energ Energ a deI sistema. a deI sistema.
Energa asociada al hamiltoniano.
Cuantizada.
Valor propio.
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Fundamentos de los clculos de QM (V):
el hamiltoniano, 1
Operador: smbolo que representa una transformacin matemtica que
se aplica a una funcin para obtener otra funcin.
para una dimensin
para las tres dimensiones
2 Ecuacin de Schrdinger
) (
2
` ` `
2
2 2
x J
dx
d
m
J T H + = + =

) , , (
2
` ` `
2
2
2
2
2
2 2
: v x J
d:
d
dv
d
dx
d
m
J T H +

+ + = + =

Operador Laplaciana
E J
m
= +
2
2
2

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Fundamentos de los clculos de QM (V):
el hamiltoniano, 2
Expresin completa para el hamiltoniano no relativista
E
c
ncleos E
c
electrones
Repulsin
ncleos
Repulsin
electrones
Atraccin
elec-nuc
Ecuacin de Schrdinger dependiente de las coordenadas de electrones
y ncleos.

> >
+ + =
i f i if
e
i i i
i
r r
e
r
e :
m m
H
2 z z z
2
1
2
`
2 2
2
2
2
2



, : ncleos.
i,f: electrones.
Z: nmero atmico.
r: distancia entre partculas.
) , ( ) , (
`

q q E q q H
i i
=
q
i
, q

:coordenadas de electrones y ncleos.


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Aproximacin de Aproximacin de Born Born- -Oppenheimer Oppenheimer: dado que los ncleos
son miles de veces ms pesados que los electrones, se
desprecia el movimiento de los ncleos, considerando que
estos se encuentran en un estado estacionario con respecto a
los electrones. Se considera entonces el movimiento de las
nubes electrnicas independiente del movimiento de los
ncleos.
Fundamentos de los clculos de QM (V):
el hamiltoniano, 3
)... , (
`
) (
` `

q q H q T H
i e N
+ =
operador de energa
cintica nuclear
operador Hamiltoniano electrnico que describe el movimiento
de los electrones para la posicin de los ncleos, es decir,
depende de la posicin (y no del momento).
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Aproximacin de Aproximacin de Born Born- -Oppenheimer Oppenheimer ( (cont cont) ):
Fundamentos de los clculos de QM (V):
el hamiltoniano, 4
la funcin de onda deber ser una funcin que dependa de q
i
y q, que se pueda separar en una funcin de onda
electrnica, que dependa de q
i
y q , y una funcin de onda
nuclear, que dependa exclusivamente de q , es decir:
Se calcula entonces la contribucin electrnica para geometra dada
de ncleos fijos.
N e i
q q

+ = ) , (
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Fundamentos de los clculos de QM (V)
Aproximacin de Ios orbitaIes atmicos y moIecuIares Aproximacin de Ios orbitaIes atmicos y moIecuIares: la funcin de
onda de un tomo concreto se puede expresar como un producto de
funciones orbitales (orbital: producto de funciones de onda
monoelectrnicas). Cada orbital se representa mediante una funcin de
Slater
Para el C: 1s
2.
. 2s
2
. 2p
2
Orbitales STO: Slater Type Orbitals
Coeficientes de combinacin lineal. Orbitales atmicos.

=
= + + + =
n
i
i i n n
x a x a x a x a
1
2 2 1 1
...
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Fundamentos de los clculos de QM (V): las
funciones,1
Existen muchas funciones que pueden representar a los orbitales
atmicos, por ejemplo las funciones hidrogenoides, las funciones tipo
Slater y Gaussianas.
Gausianas (GTO) Orbitales Slater (STO)
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Fundamentos de los clculos de QM (V): las
funciones, 2
Son funciones muy poco manejables ya que las
integrales correspondientes tienen formas funcionales
ms complejas
Las funciones tipo Slater: Orbitales Slater (STO)
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Fundamentos de los clculos de QM (V): las
funciones, 3
Las funciones Gaussianas: orbitales (GTO).
Gausianas (GTO)
Clculos ms sencillos: el
producto de dos gaussianas es
otra centrada entre las dos
anteriores y su integral es otra
gaussiana; las integrales de dos
e
-
en 3 y 4 centros atmicos
diferentes se reducen a
integrales de dos centros.)
No tienen la cspide, por ello representan pobremente el
centro atmico: necesidad de uso de gaussianas contraidas
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Fundamentos de los clculos de QM (V)
Aproximacin LCAO Aproximacin LCAO (Linear Combination of Atomic Orbitals): las
funciones de onda moleculares se obtienen por combinacin lineal de los
orbitales atmicos de todos los tomos que forman la molcula

i i
= = c c
ij ij

j j

j j
Funcin de onda moIecuIar
OrbitaI atmico
Coeficiente de contribucin deI orbitaI
atmico
j
aI orbitaI moIecuIar
i
CicIos iterativos que pretenden determinar eI conjunto de
coeficientes C
ij
que minimizan Ia energa de Ia moIcuIa:
aproximacin SCF aproximacin SCF (SeIf-Consistent FieId)
La calidad de La calidad de
la funcin de la funcin de
onda obtenida onda obtenida
depender de la depender de la
cantidad y calidad cantidad y calidad
de los orbitales de los orbitales
atmicos atmicos
Solo se podrn combinar orbitales segn unas condiciones de simetra
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Fundamentos de los clculos de QM (V)
Funcin de onda para una molcula diatmica
Si dos tomos de H a y b estn suficientemente separados (> 10 Angstroms) las
nubes de densidad electrnica no estn influenciadas una por la otra.
Si los dos tomos de H se van acercando, las nubes electrnicas se van
acercando al ncleo
a b
a b
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Fundamentos de los clculos de QM (V)
Cuando los dos tomos se encuentran a una distancia determinada, se produce
un solapamiento de las dos nubes electrnicas y aumenta la probabilidad
electrnica entre los ncleos. Se ha formado un nuevo enlace.
D
e
n
s
i
d
a
d

e
l
e
c
t
r

n
i
c
a
Distancia internuclear
b a
Funcin de onda para una molcula diatmica (cont).
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Fundamentos de los clculos de QM (V)
Aplicando la aproximacin de Combinacin Lineal de
Orbitales Atmicos (CLOA)
Distancia internuclear
D
e
n
s
i
d
a
d

e
l
e
c
t
r

n
i
c
a

=
= + + + =
n
i
i i n n
x a x a x a x a
1
2 2 1 1
...
Funcin de onda para una molcula diatmica (cont).
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Fundamentos de los clculos de QM (X): el
determinante de Slater
Tcnica matemtica para generar funciones de onda
antisimtricas para fermiones (partculas de espin semientero, 1/2,
3/2 como electrones, protones, quarks o neutrinos)
ejemplo: dados 3 electrones x1, x2 y x3, hay diferentes
formas de describirlos con tres orbitales 1, 2, 3.
Usando un determinante podemos describirlos asegurando la
naturaleza antisimtrica de la funcin de onda (que cambie
de signo si permutamos dos electrones cualesquiera)
Este determinante se puede
expandir a cualquier nmero de
electrones y funciones de onda
Se anula si dos electrones o dos
funciones de onda tienen el
mismo valor (P. de E. de Pauli).
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Funcin de onda: las funciones base, 1
Representacin de Orbitales Atmicos. Conjuntos Base.
Gausianas (GTO) Orbitales Slater (STO)
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Funcin de onda: las funciones base, 2
Conjuntos base Conjuntos base: son las representaciones
matemticas de los orbitales moleculares en una
molcula dada
Se pueden interpretar como las restricciones impuestas a
cada electrn en una regin particular del espacio
Los conjuntos mayores son aquellos que imponen menos
restricciones a los electrones y se acercan mas a la forma
"real de los orbitales, pero requieren mayores recursos de
clculo.
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Funcin de onda: las funciones base, 2
Conjuntos (cont.)
Conjunto de funciones mnimo: constituido por una
funcin para cada orbital de la teora de valencia (1s
para H y He; 1s 2s 2p
x
2p
y
2p
z
para segunda fila)
Conjuntos de bases Doble Zeta (DZ), Triple Zeta
(TZ),...Ntuple Zeta: cada funcin del conjunto mnimo se
reemplaza por 2, 3...N funciones.
Conjuntos de bases Split Valence (SV): cada orbital
atmico de valencia est descrito por N funciones base
(DZ, TZ,...NZ) y cada orbital interno por 1 funcin base
(en el carbono, el orbital 1s se describe por una funcin
base, mientras que el 2s y los tres 2p estn descritos por
dos funciones base cada uno)
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Funcin de onda: las funciones base, 3
Ejemplos de Gaussianas
STO-KG: Una STO es representada por una combinacin
lineal de K gaussianas primitivas
m-npG: Una gaussiana contraida compuesta de m
gaussianas primitivas para cada orbital atmico de capas
internas, dos gaussianas contraidas de n primitivas y p
primitivas para cada orbital atmico de la capa de valencia
m-npG
*
: Es m-npG ms 6 gaussianas tipo d de
polarizacin para cada tomo excepto los hidrgenos.
m-npG
**
: Es m-npG
*
ms 3 gaussianas tipo p de
polarizacin para cada tomo de hidrgenos.
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Coeficientes de combinacin y Energa del sistema
Una vez elegida la forma de la funcin de onda as como la
del hamiltoniano, podemos realizar el clculo de la energa
esperada del sistema.
Partiendo de la aproximacin CLOA-OM, se pretende
encontrar la mejor combinacin de orbitales atmicos para la
formacin de los orbitales moleculares.
Se prueban distintas funciones variacionales y luego se calculan los
coeficientes (vectores propios que minimizan la E de la molcula).

=
= + + + =
n
i
i i n n
x a x a x a x a
1
2 2 1 1
...

= =
=
n
i
i i
n
i
i i
x a E x a H
1 1
`
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La energa del sistema
El clculo de sta energa aplicando normalmente el
mtodo de variaciones debe cumplir que la energa
calculada (E) a partir de la ecuacin de Schrdinger,
proveniente de una funcin de onda ser ms grande o
igual que la energa que tiene el estado fundamental (E
o
),
es decir :
0
E E
0
`
* E d H


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Clculo de funciones de onda: Hartree-Fock SCF
(1)
La aproximacin de Hartree-Fock o del campo autoconsistente (SCF), es
un procedimiento iterativo para calcular la mejor solucin a la ecuacin
de Schrdinger, independiente del tiempo, aplicable a molculas
aisladas, tanto en estado fundamental como excitado
Se parte de un conjunto de orbitales aproximados (orbitales de un tomo
hidrogenoide para un clculo atmico; CLOA para clculos moleculares)
Dada la funcin de ondas inicial se elige un electrn y se promedia
mediante un potencial el efecto medio del resto de los electrones. Para
el electrn elegido, que se mueve en un campo definido, se calcula la
ecuacin de Schrdinger, obtenindose una funcin de ondas dada. Se
repite el proceso para cada electrn
Con la nueva distribucin electrnica se obtiene un nuevo potencial
elctrico. Se repite el proceso hasta alcanzar la convergencia.
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i i i i
E F =
) , ( ) ( ) , (
`

q q q E q q H
i e i e e
=
Clculo de funciones de onda: Hartree-Fock SCF
(2)
Para un sistema multielectrnico, se propone un nuevo
operador F , (operador de Fock), para cada electrn en el
sistema, que reemplaza al Hamiltoniano correspondiente
en la ecuacin de Schrdinger.
E
c
ncleos E
c
electrones
Repulsin
ncleos
Repulsin
electrones

> >
+ + =
i f i if
e
i i i
i
r r
e
r
e :
m m
H
2 z z z
2
1
2
`
2 2
2
2
2
2



Atraccin
elec-nuc
MEDIA MEDIA
Cada electrn se mueve en el campo del ncleo y en el campo medio de
los electrones.
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Clculo de funciones de onda Hartree-Fock SCF
(3)
Si se aplica la aproximacin de CLOA, la ecuacin de
Hartree-Fock, queda:

=
k
i ik i
k
i ik i
a E a F
`
Los operadores J
u
y K
u
dependen de los orbitales-spin
i .
Se realiza un clculo iterativo hasta que el campo sea
autoconsistente (SCF):
Se plantean unos orbitales-spn
i
iniciales de prueba.
Se calculan J
u
y K
u .
Se aplican a las ecuaciones de Hartree-Fock y se
obtienen nuevos
i
.
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Clculo de funciones de onda: Hartree-Fock SCF
(4)
Restrictred HF: espines a y b ocupan el mismo orbital espacial. Se
define un sistema de capa cerrada, sin electrones desapareados.
Unrestricted HF: dos conjuntos de orbitales espaciales a y b. Se define
un sistema de capa abierta (open shell) con uno o varios electrones
desapareados, en el que habr un exceso de electrones de un tipo.
(ejemplos: CH
3
, CH
2
) .
RHF

1

2

3

4

5
UHF
1a 1b 2a2b 3a 3b 4a 4b 5a 5b

1
LUMO
HOMO
1a
2a
3a
4a
5a
5b
4b
3b
2b
1b
LUMO
HOMO
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Modificaciones sobre HF: correlacin electrnica
Con los mtodos HF se detecta un mal tratamiento de la
energa, al no cuantificar el trmino de energa
dependiente de la correlacin entre los e
-
de un sistema
dado.
E
real
E
HF
E
correlacion
Se incluyen expresiones que permitan cuantificar de alguna
forma esta correlacin
Correlacin electrnica: interaccin entre electrones en un
sistema cuntico.
Correlacin: dos funciones de distribucin f(x) y g(y) no son
independientes entre si.
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Modificaciones sobre HF: Perturbaciones
La teora perturbacional o de la perturbacin, es un conjunto
de aproximaciones que permiten describir sistemas
cunticos complicados en trminos de otros ms sencillos
Funcin de onda y energa se expresan como serie de
potencias de .
Va aadiendo secuencialmente a HF una serie de factores de
perturbacin y recalculando la nueva energa
Perturbaciones de Mller-Plesset
H H
0
J
Mtodos: MP2, MP3, MP4.
E E
0
E(
1)

2
E
2
.

(1)

2

(2)
.
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Clculo de funciones de onda: los mtodos DFT
La Teora del Funcional de la Densidad (DFT) es una teora de
la estructura electrnica escrita en trminos de distribucin de
la densidad electrnica (Funcional: funcin de funciones).
Dado que la densidad electrnica en una molcula es una
funcin (x,y,z), y que diferentes distribuciones electrnicas
tienen distintas energas, se puede expresar la energa como
un funcional E[ (x,y,z)]
Si se conoce el funcional que relaciona Energa con densidad
electrnica, podremos encontrar el estado fundamental, aquel
en el que su distribucin electrnica se corresponda con la
mnima energa.
la densidad electrnica es un dato obtenible experimentalmente
a partir por ejemplo de un diagrama de difraccin de electrones .
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Aplicacin de los clculos de QM ()
El clculo de la energa del sistema, comnmente por el
mtodo de variaciones, debe cumplir que la energa calculada
(E) a partir de la ecuacin de Schrdinger, proveniente de una
funcin de onda, ser ms grande o igual que la energa que
tiene el estado fundamental (E
o
), es decir:
0
E E
0
`
* E d H


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Aplicacin de los clculos de QM ()
Aproximaciones Aproximaciones
EIiminacin/desprecio de factores/parmetros que
en principio se consideran no significativos
La complejidad de las molculas hace prcticamente
imposible resolver la ecuacin de funcin de onda
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Mtodos de clculo de QM en Hyperchem ()
Son mtodos que resuelven la ecuacin de onda de
Schrdinger
1. Mtodos 1. Mtodos "ab initio "ab initio
Mtodos de clculo que introducen solamente las aproximaciones
anteriormente citadas. Se diferencian en el nmero y calidad de las
funciones base empleadas en el clculo
Proporcionan resultados de
una gran exactitud.
Gran cantidad de tiempo
Elevado gasto en clculo
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Mtodos de clculo de QM en Hyperchem ()
1. Mtodos 1. Mtodos "ab initio "ab initio
Mtodos de clculo que resuelven la ecuacin de onda de Schrdinger
introduciendo solamente las aproximaciones anteriormente citadas. Se
diferencian en el nmero y calidad de las funciones base empleadas en el
clculo
STO-3G: Una STO es representada por una
combinacin lineal de 3 gaussianas primitivas
3-21G: Una gaussiana contraida compuesta de 3
gaussianas primitivas para cada orbital atmico de
capas internas, dos gaussianas contraidas de 2
primitivas y 1 primitiva para cada orbital atmico de
la capa de valencia
6-31G
*
: Es 3-21G ms 6 gaussianas tipo d de
polarizacin para cada tomo excepto los
hidrgenos.
6-31G
**
: Es m-npG
*
ms 3 gaussianas tipo p de
polarizacin para cada tomo de hidrgenos.
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Mtodos de clculo de QM en Hyperchem ()
2. Mtodos 2. Mtodos " "semiempricos semiempricos
Difieren de los anteriores en la tcnica de evaluacin de los elementos
descriptores de las interacciones electrn-electrn y electrn-ncleo de
un sistema.
Se utilizan frmulas empricas y parmetros atmicos experimentales.
Ms frecuentes, sistemas ms complicados, y menos consumo
computacional.
Algunos problemas no son abordables por mtodos ab initio.
Repulsin
ncleos
E
c
ncleos E
c
electrones
Repulsin
electrones

> >
+ + =
i f i if
e
i i i
i
r r
e
r
e :
m m
H
2 z z z
2
1
2
`
2 2
2
2
2
2



Atraccin
elec-nuc
Qumica Computacional Aplicada
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Mtodos de clculo de QM en Hyperchem ()
2. Mtodos 2. Mtodos " "semiempricos semiempricos ( (Cont Cont.) .)
Mtodos CNDO (Complet Neglet of Differential Overlap):
desprecian totalmente la contribucin del solapamiento entre
orbitales a la energa final
Mtodos INDO (ntermediate Neglet of Differential Overlap):
desprecian parcialmente la contribucin del solapamiento.
ncluyen algunas contribuciones de repulsin entre orbitales
atmicos de un mismo tomo
Mtodos NDDO (Neglet of Diatomic Differential Overlap):
desprecian el solapamiento diatmico, teniendo en cuenta las
contribuciones del solapamiento entre orbitaIes atmicos deI
mismo tomo.
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Mtodos "semiempricos en Hyperchem (1)
El ms rpido y simple
Se simplifica eliminando
interacciones electrn-electrn.
Da una forma aproximada de los O.M.
y sus energas
nteraccin orbitales: cte de Hckel.
Energas de orbitales fijadas.
Bueno para estudiar forma y energa
de orbitales hasta tipo p. dea general
2D.
Utilizado para calcular diferencias
compuestos aromticos.
No se puede realizar optimizacin de
geometra o dinmica molecular
Extended Hckel
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Mtodos "semiempricos en Hyperchem (2)
CNDO: Complete Neglect of Differential
Overlap
Deja de considerar algunas
interacciones electrn-electrn
La repulsin entre los electrones en los
diferentes orbitales depende solo de la
naturaleza de los tomos involucrados y
no del orbital concreto
Simple. Rpido. Utiliza pocos
parmetros y los resultados son fciles
de entender y modificar los clculos.
No usar en problemas donde el spn
electrnico es importante. No puede
calcular diferencias entre estados de
multiplicidad resultante de la misma
configuracin electrnica
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Mtodos "semiempricos en Hyperchem (3)
NDO: ntermediate Neglect of
Differential Overlap
Se puede usar para calcular
efectos de spn. Las repulsiones
electrnicas consideran los OM.
Uso en molculas de capa abierta
utilizando clculos UHF.
Resultados menos interpretables
que CNDO.
La parametrizacin se apoya en
modelos tericos.
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Mtodos "semiempricos en Hyperchem (4)
MNDO/3: Modified ntermediate
Neglect of Differential Overlap
Ms adecuado para tratar
heterotomos.
Particularmente bueno para
describir carbocationes.
Resultados muy buenos con
compuestos orgnicos polinitrados.
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Mtodos "semiempricos en Hyperchem (5)
MNDO: Modified Neglect of Differential
Overlap
Bueno en clculo de calores de
formacin, geometras moleculares,
momentos dipolares.
Bueno en compuestos fosforados.
Problemas con impedimentos
estricos grandes, anillos de cuatro
miembros, enlaces de H,
compuestos hipervalentes y nitrados.
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Mtodos "semiempricos en Hyperchem (6)
AM1: Austin Model 1
Salva los problemas de la
aproximacin de los mtodos
NDO de repulsin e-e.
Mtodo semiemprico ms
preciso de Hyperchem y el ms
elegido para resolver problemas.
Clculo de calor de formacin
40% mejor que MNDO, buen
tratamiento enlaces H, energas
de activacin de reacciones.
Problemas con enlaces P-O,
compuestos nitrados y
peroxidos.
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Mtodos "semiempricos en Hyperchem (7)
PM3: Parametrized Model 3
Reparametrizacin de AM1
Mtodo semiemprico ms
preciso de Hyperchem y el ms
elegido para resolver problemas.
Clculo de calor de formacin
40% mejor que MNDO, buen
tratamiento enlaces H, energas
de activacin de reacciones.
Problemas con enlaces P-O,
compuestos nitrados y
peroxidos.
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Mtodos "semiempricos en Hyperchem (8)
ZNDO/1: Zener ntermediate
Neglect of Differential Overlap
Metales de transicin de
primera y segunda fila.
No tan bueno en molculas
orgnicas
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Mtodos "semiempricos en Hyperchem (9)
ZNDO/S: Zener ntermediate
Neglect of Differential Overlap
Reproduce transiciones
espectroscpias.
Realizar clculos C
simples.
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Resultados obtenidos con los mtodos semiempricos (1)
Cargas atmicas netas: suma de los electrones en todos los
orbitales atmicos para cada tomo, siendo la suma de las
cargas atmicas netas el nmero total de electrones de la
molcula
Cada tomo soporta una carga parcial + + - - en funcin del defecto o
exceso de electrones en esa posicin
Interacciones eIectrostticas con Ia diana Interacciones eIectrostticas con Ia diana
Inicas: cargas totales sobre los tomos
PoIares: cargas parciales sobre los tomos
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Resultados obtenidos con los mtodos semiempricos (2)
Energa de los orbitales moleculares: especialmente los
orbitales frontera
HOMO (Highest Occupied Molecular Orbital)
LUMO (Lowest Unoccupied Molecular Orbital)
Interacciones con Ia diana por Interacciones con Ia diana por
transferencia de carga transferencia de carga
HOMO: dador de eIectrones
LUMO: aceptor de eIectrones
Interacciones ms favorabIes cuanto menor diferencia de energa entre Ios orbitaIes
que interaccionan
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Resultados obtenidos con los mtodos semiempricos (3)
Contribucin de los orbitales atmicos a los orbitales
moleculares: el valor absoluto indica la mayor o menor
participacin de ese orbital tomico al molecular.
Para
HOMO
LUMO
EI vaIor de contribucin ser mayor
sobre Ios tomos que ms
participan en estos orbitaIes
Zonas de Ia moIcuIa
impIicadas en Ias interacciones
por transferencia de carga
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Resultados obtenidos con los mtodos semiempricos (4)
Geometra molecular: valores de distancias, diedros, ngulos
de enlace y matriz de distancias interatmicas
Contribucin aI diseo deI
farmacforo
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Resultados obtenidos con los mtodos semiempricos (5)
Entalpa Entalpa de formacin del compuesto de formacin del compuesto
EstabiIidad de Ia moIcuIa
CIcuIo deI coste energtico de
cuaIquier transformacin que
se reaIice sobre eIIa
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Resultados obtenidos con los mtodos semiempricos (6)
Densidad electrnica atmica s y p: : distribucin 3D de nubes
s y p (zonas con exceso de carga negativa, la densidad
electrnica tiene mayor valor)
Polarizacin: valor medio de las cargas atmicas, tomadas
en valor absoluto. Medida del carcter polar de la molcula
Momento dipolar: : magnitud de carcter vectorial,
dependiente de los valores de cargas de los distintos tomos,
y del vector direccin resultante que las une entre si si
Espectros Vibracionales
Espectros UV-Visible
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Resultados obtenidos con los mtodos semiempricos (7)
Potencial electrosttico molecular: campos electrostticos
creados a partir de la distribucin de carga electrosttica y
nuclear, calculados a partir de las cargas atmicas.
Determina las posibles trayectorias de acercamiento de un
reactivo.
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Propiedades ms utilizadas
Geometra molecular.
Energa de conformaciones. Calor de formacin.
Energas de estados de transicin.
Cargas atmicas.
Densidad Electrnica.
Momento dipolar.
Potencial Electrosttico Molecular.
Orbitales moleculares.
Espectros R.
Espectros UV-visible.
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Algunos ejemplos de propiedades (1)
Geometra molecular.
Carbono tetradrico.
Le Bel y van't Hoff (1874).
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Algunos ejemplos de propiedades (2)
Calor de formacin.
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Algunos ejemplos de propiedades (3)
Energas de estados de transicin.
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Algunos ejemplos de propiedades (4)
Momento dipolar ().
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Algunos ejemplos de propiedades (5)
Potencial Electrosttico Molecular (PEM).
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Algunos ejemplos de propiedades (6)
Densidad electrnica.
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Algunos ejemplos de propiedades (7)
Orbitales moleculares de metano.
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Algunos ejemplos de propiedades (8)
Anlisis vibracional y espectroscopa R. CO
2
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Algunos ejemplos de propiedades (9)
Espectro UV-Visible.
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Mtodos hbridos MM/MQ
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Mtodos Hbridos (I)
Parte de molcula QM alto nivel. Parte en
clculo de menor nivel.
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Mtodos Hbridos (II)
MOMM MOMM (ntegrated Molecular Orbital +
Molecular Mechanics).QM/MM.
MOMO MOMO (ntegrated Molecular Orbital +
Molecular Orbital).
ONOM ONOM. (Our N-layered ntegrated molecular
Orbital + molecular Mechanics).
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Resumen
1. Mecnica Molecular:
MM+, AMBER, OPLS, BO+
2. Mecnica Cuntica:
Ab initio.
Semiempricos. CNDO, NDO, MNDO, AM1, PM3.
3. Mtodos Hbridos:
QM/MM. MOMO. ONOM.

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