Chapitre IV :Isomries et stroisomries

Nadia BOULEKRAS

Isomries et Stroisomries
Isomrie

Stroisomrie

Isomrie de constitution

Position Isomrie de conformation Isomrie de configuration Chane

Fonction

Diastroisomrie

Enantiomrie

Isomrie thylnique Z/E

Isomrie cyclanique cis/trans

Un ou plusieurs carbones asymtriques, images l'un de l'autre mais non superposables

Molcules comportant plusieurs carbones asymtriques et non images l'un de l'autre

Les isomres sont des espces chimiques de mme formule brute qui diffrent par : lordre ou la nature des liaisons (isomrie de constitution), ou par la disposition des atomes dans lespace (stroisomrie).

I.

ISOMRIE PLANE ou ISOMRIE de CONSTITUTION

1) Isomrie de constitution : on appelle isomres de constitution, deux molcules qui possdent la mme formule brute mais ont des formules dveloppes planes diffrentes. Les isomres ont des proprits physiques, chimiques et biologiques diffrentes. On distingue trois types disomrie :

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a) Isomrie de fonction : les isomres groupements fonctionnels diffrents :

CH3 C O Fonction ctone CH3 C3H6O CH3

de

fonction

ont

des

CH2

C O

Fonction aldhyde

b) Isomrie de position : les isomres de position ont la mme fonction, mais le groupement fonctionnel ou une insaturation (une double liaison entre deux carbones) est port par des carbones diffrents de la chane carbone :
CH3 CH CH3 C3H8O OH Propan-2-ol alcool II Propan-1-ol alcool I CH3 CH2 CH2 OH

c) Isomrie de squelette ou de chane : Lenchanement des atomes sur le squelette carbon est diffrent :
CH3 CH CH3 C4H10 Butane CH3 CH2 CH2 CH3

CH3 mthyl propane

2) Tautomrie : cest la transformation dun groupe fonctionnel en un autre par dplacement (migration) facile et rapide dun atome dhydrogne entre deux atomes. Les deux formes tautomres coexistent et sont en quilibre chimique, ce sont deux isomres de fonction particuliers :
C CH C Y C C YH C

II. STROISOMRIE
Lorsqu'on considre une molcule dans l'espace trois dimensions, de nouveaux cas d'isomrie peuvent apparatre. On parle alors d'isomrie spatiale ou de stroisomrie. On appelle stroisomres, des isomres qui ont la mme formule dveloppe plane mais qui diffrent par l'arrangement spatial (disposition gomtrique) de leurs atomes. Il existe diffrentes manires de reprsenter les stroisomres dans lespace:

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a) Reprsentation perspective (ou perspective cavalire) :

La reprsentation en perspective est essentiellement utilise pour des molcules cycliques:

b) Reprsentation projective ou convention de Cram :

Elle consiste reprsenter une liaison par convention :

Liaison dans le plan du papier : Liaison en avant du plan du papier : Liaison en arrire du plan du papier :

On place gnralement la chane hydrocarbone la plus longue dans le plan de la figure.

c) Projection de Newman :

Dans la reprsentation de Newman, la molcule est regarde dans laxe dune liaison simple C-C entre deux atomes de carbone voisins. Les liaisons issues des deux atomes sont projetes sur un plan perpendiculaire laxe de la liaison tudie : Les liaisons de latome le plus proche (de lobservateur) sont reprsentes par des segments partant du mme point, formant des angles de 120.

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Le second carbone (le plus loign de lobservateur), clips par le premier, est reprsent par un cercle. Les liaisons de cet atome sont reprsentes par des segments sarrtant la priphrie du cercle.

La Projection de Newman d'un compos organique permet d'tudier ses diffrentes conformations (on passe d'un conformre un autre par rotation autour d'une liaison simple C-C).
d) Projection de Fisher :

En projection de Fischer, les liaisons sont reprsentes par des traits pleins verticaux et horizontaux, selon les conventions suivantes : Les traits verticaux reprsentent les liaisons en arrire du plan de la figure. Les traits horizontaux reprsentent les liaisons en avant du plan de la figure. la chane carbone la plus longue est place verticalement et numrote de haut en bas. Le chanon de plus faible indice (le plus souvent associ au carbone le plus oxyd) est plac en haut.

Cette reprsentation est utilise, essentiellement en biochimie pour reprsenter les sucres et les acides amins. Les stroisomres peuvent tre des isomres de configuration ou des isomres de conformation :
A. ISOMRIE de CONFIGURATION

Les stroisomres de configuration sont des molcules qui ne sont pas superposables. Ce sont des espces isolables qui possdent des proprits physico-chimiques diffrentes. Pour passer dune configuration une autre, il faudrait rompre des liaisons, ce qui demanderait beaucoup dnergie.

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A temprature ordinaire, lagitation thermique ne suffit pas. On peut donc sparer les deux stroisomres. On distingue deux types de stroisomres de configuration : o o les NANTIOMRES, les DIASTROISOMRES.

1) Isomrie optique & nantiomrie : a) Chiralit :

La chiralit dun objet dsigne sa proprit de ne pas tre superposable son image dans un miroir plan. Plusieurs composs qui existent dans les organismes vivants sont chiraux. o Une main est un objet chiral.

Une molcule contenant un carbone asymtrique (C*) est chirale. Un C* est un carbone ttradrique hybrid (sp3) li 4 atomes (ou groupements datomes) diffrents :

Les 2 stroisomres, images non superposables, appels nantiomres ou isomres optiques.

sont

Certaines molcules possdent des carbones chiraux, mais sont toutefois superposables leur image dans un miroir. Les molcules suivantes possdent plusieurs carbones asymtriques :

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Par contre, elles possdent aussi un centre de symtrie ou un plan de symtrie. Possder un centre de symtrie ou un plan de symtrie implique quune molcule pourra toujours tre superpose son image dans un miroir.
b) Activit optique :

La plupart des nantiomres possdent des proprits physicochimiques identiques, l'exception de leur pouvoir rotatoire. Deux nantiomres purs font dvier le plan de la lumire polarise dune valeur gale mais en sens oppos. On dit que ces molcules sont optiquement actives ou doues de pouvoir rotatoire : L'nantiomre faisant tourner le plan de polarisation de la lumire vers la droite est dit dextrogyre, not (d) ou (+); ( qui tourne droite , en latin dextro : droite). celui faisant tourner le plan vers la gauche est dit lvogyre, not (l) ou (-) ; ( qui tourne gauche , en latin laevus : gauche.). Un mlange racmique est optiquement inactif car il contient les deux nantiomres en quantit quimolaire et a un pouvoir rotatoire nul. Le "racmique" est not ().

Exprience : Quand une substance optiquement active est traverse par un faisceau de lumire polarise, elle provoque une rotation du plan de polarisation de cette lumire d'un angle qu'on peut mesurer exprimentalement grce un polarimtre.

Le polarimtre est un appareil qui utilise la lumire dite polarise (lumire qui nvolue que dans un plan, appel le plan de polarisation). Il est constitu dune cuve de longueur l, remplie dune solution dun nantiomre la concentration C :

est proportionnel la longueur de la cuve contenant la substance optiquement active et la concentration de la solution. dpend galement du solvant, de la longueur donde de la lumire et de la temprature.

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Pour chacun des 2 nantiomres d'une molcule chirale, on dfinit t un pouvoir rotatoire spcifique [ ] donn par la loi de BIOT :

: angle de rotation optique observe (en degrs) l : longueur de la cuve contenant la solution (en dm). c : concentration de la solution (en g/mL). t : temprature (C) : longueur donde de la lumire incidente.
c) Enantiomrie :

Les nantiomres possdent des proprits chimiques identiques vis--vis d'un ractif non chiral. Par contre, vis--vis d'un rcepteur chiral, leur ractivit peut tre trs diffrente (une chaussure droite distingue un pied droit d'un pied gauche, alors qu'une chaussette ne le fait pas). Cela induit des proprits biologiques trs diffrentes voire opposs. Pour qu'une molcule ait un effet biologique, elle doit interagir avec un site rcepteur particulier dans lorganisme (membranes, enzymes). Les systmes biologiques rcepteurs sont eux-mmes chiraux car ils sont constitus de molcules chirales (protines, glucides, acides nucliques), ils interagissent diffremment avec les deux nantiomres d'une molcule chirale externe : la forme du site rcepteur est telle que seule une molcule prsentant une forme complmentaire peut s'adapter correctement.

Le plus souvent, l'action pharmacologique d'un mdicament n'est porte que par un seul des nantiomres. Le second, dans le meilleur des cas se rvle inactif, mais il peut arriver quil ait une activit thrapeutique compltement diffrente de celle de l'autre :

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Le limonne est constitu de deux nantiomres qui sont utiliss dans l'industrie des parfums :

le (R)-limonne possde une odeur d'orange ; le (S)-limonne a une odeur de citron.

Un prcurseur de la dopamine, utilis comme traitement dans la maladie de Parkinson, existe sous deux formes nantiomres. Seul l'nantiomre L-DOPA a une activit thrapeutique :
HO COOH HOOC OH

H HO D-Dopa

NH2

H 2N

H OH

L-Dopa (agent antiparkinsonien)

La thalidomide, un anti-nauseux utilis dans les annes 60 sous forme racmique. Or, si un des nantiomres tait effectivement un anti-nauseux, l'autre tait un tratogne (malformation de lembryon). Lactivit tratogne a t attribue lnantiomre (S).

d) Rgles de Cahn-Ingold-Prelog (C.I.P.) :

La faon dont les nantiomres s'organisent dans l'espace permet d'attribuer par convention une configuration dite absolue chacun deux. Ces configurations sont dites le plus souvent R (rectus) ou S (sinister). En chimie des sucres et des acides amins,

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ces configurations sont quelques fois dites L ou D. Dans tous les cas, la nature de la configuration adopte par convention, sur la base d'un classement par rang de priorit des substituants (rgles de Cahn, Ingold et Prelog), est indpendante du pouvoir rotatoire mesur exprimentalement (un nantiomre de configuration S peut tre lvogyre ou dextrogyre et inversement). Les rgles qui permettent de dterminer l'ordre de priorit des quatre substituants sont les suivantes :

la priorit des atomes diminue avec leur numro atomique Z (Br>F>C>H). pour deux atomes isotopes, la priorit diminue avec la masse (D>H). Si les atomes directement attachs un centre chiral sont identiques, on compare alors les atomes de 2me rang.

Si c'est ncessaire, on considrera les atomes en 3me, position

4me

Les doubles ou triples liaisons sont dcomposes en 2 ou 3 liaisons simples.

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e) Dtermination de la configuration absolue :

Les quatre substituants 1, 2, 3, 4, de l'atome de carbone ordre de priorit asymtrique (C*) sont placs par dcroissante: 1 > 2 > 3 > 4. L'observateur tant plac de faon oppose la liaison C*-4 :

Si lordre de priorit des groupes 1 2 3 suit la rotation des aiguilles dune montre, la configuration est R (rectus, latin, droit). Si lordre de priorit suit la rotation inverse des aiguilles dune montre, la configuration est S (sinister, latin, gauche). Le symbole est ajout sous forme de prfixe au nom de la molcule.

La dtermination des configurations absolues R et S peut se faire directement sur la projection de Fischer. Pour cela il faut suivre les rgles suivantes : 1er cas: 4 se trouve en position verticale, le sens de rotation 1 2 3 donne directement la configuration absolue. 2me cas : 4 se trouve en position horizontale, la squence 1 2 3 indique l'inverse de la configuration absolue.

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2) Isomrie gomtrique & Diastroisomrie :

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Les diastroisomres sont des stroisomres de configuration qui ne sont pas image l'un de l'autre dans un miroir. Les diastroisomres, la diffrence des nantiomres, ne possdent pas les mmes proprits physico-chimiques ; ils peuvent donc tre plus facilement spars par distillation, recristallisation ou chromatographie. La diastroisomrie peut tre due, soit :

Prsence dune double liaison. Existence de plusieurs carbones asymtriques.

a) Isomrie gomtrique des thylniques :

La prsence d'une double liaison C=C (thylnique), C=N (imine) ou N=N (diazonium) empche la rotation des deux atomes l'un par rapport l'autre. Par consquent, si chacun de ces deux atomes porte 2 groupements diffrents, il peut exister deux configurations distinctes appeles stroisomres gomtriques ou diastroisomres de type Z/E. Pour les nommer, on utilise les rgles (C.I.P) qui permettent de classer les groupements sur chaque carbone : o si les deux groupements prioritaires a et a' sont du mme ct de laxe de la double liaison, il sagit de lisomre Z (de lallemand Zusammen qui signifie ensemble). si a et a' sont de part et dautre de la double liaison, il sagit de lisomre E (de Entgegen qui signifie oppos).

Nomenclature Z/E :

De manire gnrale, les configurations Z sont plus rares car les groupements prioritaires (souvent les plus volumineux) sont dstabiliss par leur encombrement strique.

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b) Isomrie cyclanique Cis/Trans :

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La diastroisomrie cis-trans est utilise dans les composs cycliques qui portent deux substituants R identiques. Elle repose sur la position relative des deux substituants : o o si les 2 substituants se trouvent du mme ct d'un plan dfini par le cycle ; il sagit de lisomre " Cis". Si les 2 substituants se trouvent de part et d'autre du plan du cycle ; cest lisomre " Trans ".

Nomenclature cis/trans :

c) Molcules comportant plusieurs C* :

La diastroisomrie est d la prsence de 2 (ou plus) C* dans une molcule. De telles molcules sont frquentes dans la nature et notamment dans les composs naturels: sucres, acides amins
Une molcule contenant plus dun carbone asymtrique nest pas ncessairement chirale. Pour une structure donne, il nexiste

quune molcule image dans un miroir ; les autres structures possibles sont des diastroisomres.

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Quand une molcule possde plusieurs carbones asymtriques, on prvoit 2 configurations possibles pour chacun. Il peut donc exister 2n stro-isomres. Cette rgle permet de prvoir le nombre maximal de stro-isomres, mais si certains substituants sont identiques ce nombre maximal ne sera pas atteint (car le nombre d'arrangements possible est plus petit).
Rgle : si une molcule contient n carbones asymtriques, le nombre de stroisomres est 2n (des lments de symtrie interne diminuent ce nombre). Nomenclature R/S pour une molcule 2C* :

B. ISOMRIE de CONFORMATION 1) Dfinition :

Deux conformres reprsentent la mme molcule, dans des dispositions spatiales et tat dnergie diffrents. Le passage d'une conformation une autre se fait par simple rotation autour d'une liaison simple (liaison ), sans rupture de liaison. Ce passage ne ncessite que quelques KJ et se fait rapidement temprature ambiante et le mme compos existe successivement sous diffrentes conformations en quilibre entre elles. D'une manire gnrale, les diffrents conformres d'une mme molcule ne constituent pas des espces chimiques distinctes. En effet, la faible barrire nergtique qui les spare, ne permet pas de les sparer dans les conditions ordinaires (25C, 1 atm).

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Lisomrie de conformation, cest--dire la possibilit que les molcules peuvent subir des dformations (de longueurs ou dangle de liaisons) sans que leurs liaisons se cassent, a une norme importance dans le vivant : les ractions de synthse des protines les ractions de duplication de lADN lefficacit des enzymes les mcanismes biocatalytiques

Certains composs d'intrt thrapeutique peuvent toutefois se rvler davantage actifs sous l'une ou l'autre de leurs conformations.
2) Analyse conformationnelle :

Cest ltude des quilibres entre les diffrentes conformations dune mme molcule. La barrire d'nergie franchir pour passer d'une conformation l'autre est faible, ce qui explique que les molcules tournent librement autour de la liaison C-C.
a) Les conformations de lthane : CH3-CH3

Les deux structures de lthane (dcale et clipse) reprsentes ci-dessous se dduisent lune de lautre par rotation, dun angle , autour de laxe de la liaison C-C. Lexprience montre qu temprature ordinaire, ces deux structures ne sont pas sparables car la mme molcule se prsente successivement sous une infinit de conformations :

Si = 0 ou 120 ou 240, on a une conformation clipse. Si = 60 ou 180 ou 300, on a une conformation dcale.
Aspect nergtique: Si l'on considre l'nergie potentielle de cette molcule, on s'aperoit qu'elle varie suivant la position respective des hydrognes des deux carbones adjacents. Dun point de vue nergtique, il existe deux positions extrmes :

l'thane clips, conformation la moins stable (nergie potentielle maximale) l'thane dcal, conformation la plus stable (nergie potentielle minimale).

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Cela sexplique par les rpulsions lectroniques (des doubles liants) qui sont minimales dans la forme dcale (lorsque les distances entre les doublets sont maximales) et maximales dans la forme clipse. La diffrence dnergie entre la valeur maximale et la valeur minimale est appele barrire dnergie (elle est de lordre de 12 kJ.mol-1 pour lthane). Cette nergie est du mme ordre de grandeur que lnergie dagitation thermique : les molcules passent dune conformation lautre, la suite des chocs intermolculaires.

b) Les conformations du butane : CH3-CH2-CH2-CH3 Aspect nergtique: D'un point de vue nergtique, les conformations les plus stables sont les conformations dcales, la plus stable de toutes tant la conformation anti ( = 180). C'est celle dont l'nergie est minimale (les deux groupes mthyle -CH3 sont le plus loin possible lun de lautre, leffet de gne strique entre les deux est moindre). Les conformations clipses sont d'nergie suprieure. La conformation la moins stable tant celle pour laquelle = 0 (conformation syn). La barrire nergtique (25 kJ.mol-1) est suffisamment basse pour quil y ait libre rotation.

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c) Les conformations du cyclohexane : C6H12

Le cyclohexane est un hydrocarbure cyclique satur de formule brute C6H12. La rotation autour des axes C-C permet dadopter une infinit de conformations (respectant les longueurs de liaison et approximativement les angles valenciels). Cependant, deux conformations remarquables sont obtenues pour le cyclohexane, il sagit des formes appeles "chaise" et "bateau" :

Diagramme nergtique du cyclohexane

Ces deux formes se transforment lune en lautre avec facilit. Toutefois, la forme chaise est plus stable. La diffrence d'nergie entre les conformations chaise et bateau est telle qu' la temprature ordinaire, 99 % des molcules de cyclohexane sont sous forme chaise. Dans la forme chaise, les douze liaisons C-H se divisent en deux groupes :

les liaisons axiales, perpendiculaires au plan moyen du cycle (verticales sur le dessin).

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les liaisons quatoriales, situes approximativement dans le plan moyen du cycle.

Lorsque le cyclohexane est substitu, le substituant port par un des atomes de carbone peut occuper soit une position axiale, soit une position quatoriale. La conformation qui sera privilgie sera celle pour laquelle il y aura, moins de gne strique (substituant plus dgag du reste de la molcule). Rgle gnrale : on constate que les substituants volumineux se placent prfrentiellement en position quatoriale (interactions faibles). Lorsque le cyclohexane est substitu, la forme chaise pour laquelle le substituant se trouve en position quatoriale est la plus stable.
Aspect nergtique: A temprature ambiante, lagitation thermique permet dobtenir toutes les conformations. Les conformations chaises sont de loin les plus stables et les plus abondantes (99 % des molcules). En effet, pour les conformations chaise, toutes les liaisons sont dcales, ce qui est favorable nergiquement. Le cas est diffrent pour les autres conformations, telles que des conformations bateau et des conformations croises.

Rfrences & Bibliographie conseille

http://personnel.univ-reunion.fr/briere/ cecnbouvier.educanet2.ch/chimie4os/stereoisomeresepfl.pdf http://www.orgapolym.com/accueil_caco.html http://fr.wikipedia.org/wiki/Isom%C3%A9rie

McMurry, John, Chimie organique - les grands principes, Dunod, 2000. Solomons, Graham et Fryhle, Craig. Chimie organique, Dunod. 7me dition, 2000. Arnaud, Paul. Cours de chimie organique, Dunod, 18e dition, 2009.

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