Biosntesis de Macromolculas

(Cdigo asignatura: 101845) Gabriel Dorado Prez <bb1dopeg@uco.es> Grado de Bioqumica Curso 2 Facultad de Ciencias Universidad de Crdoba Curso 2012/13

Tema 4. Regulacin de la biosntesis y degradacin de protenas. Traduccin. Plegamiento asistido de protenas. Modificaciones postraduccionales y degradacin de protenas
Cdigo gentico Procariotas versus eucariotas Traduccin en procariotas Traduccin en eucariotas Plegamiento de protenas Modificaciones postraduccionales de protenas Degradacin de protenas

Traduccin

Traduccin (ARNm a protena)

Cdigo gentico

Traduccin del lenguaje del ADN/ARN al de protenas

Cdigo gentico

Fosforilasa de polinucletido Severo Ochoa (1959) (RNA)n + NDP (RNA)n+1 + Pi

Descubrimiento del cdigo gentico

Cdigo gentico

Cdigo gentico (I)

Cdigo gentico

Cdigo gentico (II)

Cdigo gentico

Cdigo gentico (y III)

Procariotas vs eucariotas

Clula procariota y eucariota

Procariotas vs eucariotas

Ribosomas

Procariotas vs eucariotas

ARN mensajero (ARNm)

Procariotas vs eucariotas

Proceso cooperativo con reacciones en cascada

Estructura de ARNm en procariotas y traduccin

Procariotas vs eucariotas

Proceso cooperativo con reacciones en cascada

Estructura de ARNm en eucariotas y traduccin

Traduccin
Las fosforilaciones suelen activar (energizar) las molculas La hidrlisis del pirofosfato desplaza ms la reaccin hacia la derecha

Proceso costoso (gasto de energa en forma de ATP), y por tanto importante para la supervivencia de la clula

Activacin de aminocidos

Traduccin

Codgeno (ADN) Codn (ARNm) Anticodn (ARNt)

Estructura secundaria (trbol) y terciaria (L invertida) del ARN transferente (ARNt)

Traduccin

Fases de la traduccin

Traduccin

Fases de la traduccin (vdeo)

Traduccin en procariotas

John Shine (1975)

Lynn Dalgarno (1975)

Secuencia consenso de Shine-Dalgarno (sitio de unin de ribosomas) e inicio de traduccin (ATG) en procariotas

Secuencia consenso de Shine-Dalgarno: AGGAGG

Traduccin en procariotas
IF: factor de iniciacin (Initiation Factor)

Proceso cooperativo con reacciones en cascada

Proceso costoso (gasto de energa en forma de GTP), y por tanto importante para la supervivencia de la clula

Inicio

Traduccin en procariotas
EF: factor de elongacin (Elongation Factor)

Proceso cooperativo con reacciones en cascada

Proceso costoso (gasto de energa en forma de GTP), y por tanto importante para la supervivencia de la clula

Elongacin (traslocacin)

Traduccin en procariotas

Proceso cooperativo con reacciones en cascada

Proceso costoso (gasto de energa en forma de GTP), y por tanto importante para la supervivencia de la clula

Terminacin

Traduccin en procariotas

Polirribosoma (polisoma)

Traduccin en procariotas

Polirribosoma (vdeo)

Traduccin en eucariotas

Caperuza de 7-metilguanosina

Traduccin en eucariotas

Marilyn Kozak (1987)

Secuencia consenso de Kozak (iniciacin de traduccin; no sitio de unin del ribosoma), incluyendo el triplete de inicio de la traduccin (AUG) en humanos

Secuencia consenso de Kozak: (gcc)gccRccAUGG

Traduccin en eucariotas
eIF: factor de iniciacin eucaritico (eukaryotic Initiation Factor)

UTR: regin no traducida (UnTranslated Region)

Interviene tanto la regin 5 como la 3 no traducidas

Proceso cooperativo con reacciones en cascada

Inicio (I)

Traduccin en eucariotas

Proceso cooperativo con reacciones en cascada

Proceso costoso (gasto de energa en forma de GTP), y por tanto importante para la supervivencia de la clula

Inicio (y II)

Traduccin en eucariotas

Inicio (modelos)

Traduccin en eucariotas
Proceso cooperativo con reacciones en cascada Proceso costoso (gasto de energa en forma de GTP), y por tanto importante para la supervivencia de la clula IRES: sitio de entrada interno del ribosoma (Internal Ribosome Entry Site) con estructura secundaria/terciaria

Inicio dependiente de Cap y de IRES

Traduccin en eucariotas
eEF: factor de elongacin eucaritico (eukaryotic Elongation Factor) Proceso costoso (gasto de energa en forma de GTP), y por tanto importante para la supervivencia de la clula

Proceso cooperativo con reacciones en cascada

Elongacin (traslocacin)

Traduccin en eucariotas

eRF: factor de liberacin eucaritico (eukaryotic Release Factor) Proceso cooperativo con reacciones en cascada

Proceso costoso (gasto de energa en forma de GTP), y por tanto importante para la supervivencia de la clula

Terminacin

Traduccin en eucariotas

Polirribosoma y mltiples sitios de inicio (y terminacin)

Plegamiento de protenas

Christian Boehmer Anfinsen, Jr. (1973)

Desnaturalizacin de ribonucleasa A con urea/mercaptoetanol y renaturalizacin espontnea tras dilisis

Plegamiento de protenas

Energa libre de las conformaciones y agregados proteicos

Plegamiento de protenas

Proceso costoso (gasto de energa en forma de ATP), y por tanto importante para la supervivencia de la clula

Plegamiento espontneo y asistido por carabinas (chaperonas) moleculares y chaperoninas (I)

Plegamiento de protenas
Plegamiento espontneo

Plegamiento cotraduccional (protenas grandes; varios dominios) asistido por chaperonas

Plegamiento postraduccional (protenas pequeas; un dominio) asistido por chaperoninas

Plegamiento espontneo y asistido por carabinas (chaperonas) moleculares y chaperoninas (y II)

Plegamiento de protenas

Clasificacin de carabinas (chaperonas) moleculares y chaperoninas (I)

Plegamiento de protenas

Clasificacin de carabinas (chaperonas) moleculares y chaperoninas (II)

Plegamiento de protenas

Clasificacin de carabinas (chaperonas) moleculares y chaperoninas (y III)

Plegamiento de protenas
Proceso costoso (gasto de energa en forma de ATP), y por tanto importante para la supervivencia de la clula

Hsp70: protena de choque trmico de 70 kDa (70-kilodalton heatshock protein)

Carabinas (chaperonas) moleculares: sistema Hsp70 (DnaK)

Plegamiento de protenas

Cilindros huecos con residuos hidrofbicos en el interior, para facilitar el plegamiento correcto de las protenas Proceso costoso (gasto de energa en forma de ATP), y por tanto importante para la supervivencia de la clula

Chaperonina-Chaperona: sistema Hsp60/Hsp10 (GroEL/GroES)

Plegamiento de protenas
Algunas protenas procariticas y eucariticas son sintetizadas en forma de precursores (pre-pro-protenas): pptido seal (regin pre) para transporte + propptido (regin pro) para ayudar al plegamiento + pptido propiamente dicho. Es tpico de proteasas, que se sintetizan inactivas.

Las chaperonas intramoleculares de tipo I (figuras de la izquierda y abajo) ayudan al plegamiento del pptido (estructura terciaria), mientras que las de tipo II (figura de la izquierda) guan la formacin de la estructura cuaternaria de la protena

Chaperonas intramoleculares

Plegamiento de protenas
Cooperacin entre distintas chaperonas y chaperoninas Proceso cooperativo con reacciones en cascada Proceso costoso (gasto de energa en forma de ATP), y por tanto importante para la supervivencia de la clula

Plegamiento de protenas en eubacterias, arquibacterias (arqueas o arqueobacterias) y eucariotas

Plegamiento de protenas

Cooperacin entre distintas chaperonas y chaperoninas

Visin de conjunto del plegamiento de protenas en eucariotas

Plegamiento de protenas

Plegamiento de protenas y deficiencias o enfermedades asociadas (I)

Plegamiento de protenas

Implicacin en enfermedades como Alzheimer, esclerosis mltiple, Parkinson, etc.

Plegamiento de protenas y deficiencias o enfermedades asociadas (y II)

Modificaciones postraduccionales de protenas

Prenilacin (isoprenilacin o lipidacin): unin de grupos hidrofbicos a pptidos

Modificaciones postraduccionales de protenas (I)

Modificaciones postraduccionales de protenas

Ubiquitinacin

Etiquetaje de pptidos, que determina su destino posterior Glucosilacin (glicosilacin)

Modificaciones postraduccionales de protenas (II)

Modificaciones postraduccionales de protenas

Biosntesis de insulina, incluyendo oxidacin y proteolisis para liberar el pptido seal, el pptido C y la insulina madura

Modificaciones postraduccionales de protenas (y III)

Degradacin de protenas

Mezcla de enzimas hidrolticas

Lisosomas

Degradacin de protenas
AAA: ATPasas asociadas con diversas actividades celulares (ATPases Associated with diverse cellular Activities) Proceso costoso (gasto de energa en forma de ATP), y por tanto importante para la supervivencia de la clula

Proteosomas (proteasomas): conservados evolutivamente

Degradacin de protenas
Marcaje (poliubiquitinacin); captura y entrada en el proteosoma; y digestin

El beso de la muerte

Degradacin de protenas: proteosomas

Degradacin de protenas

Visin de conjunto del proteosoma

Degradacin de protenas
La inhibicin del proteosoma favorece la apoptosis, la senescencia celular y los efectos citotxicos de la quimioterapia

Proceso cooperativo con reacciones en cascada

Proteosoma y ciclo celular: estrs, supervivencia, apoptosis y senescencia

Degradacin de protenas

Los proteosomas estn implicados en mecanismos de degradacin de pptidos, pero tambin en mecanismos de activacin de pptidos (regulacin de la expresin gnica)

Visin de conjunto de lisosomas y proteosomas