Filogenia bacteriana Se conocen 17 linajes principales (phyla).

Se observan a travs de un rbol filogentico

PROTEOBACTERIAS Gran grupo de microorganismos pertenecientes al dominio de las bacterias principalmente gram negativos; antiguamente denominadas bacterias purpreas Anatoma de una bacteria sencilla Una bacteria simplificada est formada por tres capas externas que envuelven las estructuras internas; la capa pegajosa protege la pared celular rgida, que a su vez cubre la membrana celular semipermeable. El flagelo es un medio de locomocin y los pelos que se extienden por fuera de la cpsula ayudan a la bacteria a sujetarse a las superficies. El material gentico est contenido en el ADN que forma el nucleoide. Los ribosomas que flotan en el citoplasma intervienen en la sntesis de protenas. BACTERIAS ROJAS FOTOTFICAS .-Fotosintesis no oxigenica .Contiene pigmentos de clorofila bacterioclorofilas color rojo .Forman sistemas fotosinteticos membranosos intracelulares que contienen los pigmentos fotosintticos BACTERIAS ROJAS DEL AZUFRE .-Utilizan sulfuro de hidrogeno (H2S) como un donador de electrones para la reduccion fotosintetica del CO2 . El sulfuro es oxidado a S y queda almacenado; luego el S dasaparece a medida que se oxida a sulfato .-Se encuentran en zonas anoxicas de lagos bien iluminados donde el H2S se acumula lagos meromicticos . Estratificados; mas densa en el fondo (salada). El sulfuro originado de los sedimentos difunde hacia arriba BACTERIAS ROJAS NO DEL AZUFRE .-Incapaces de usar sulfuros como donadores de electrones para reduccion del CO2 hasta material celular .Algunas pueden crecer anaerobicamente en la oscuridad utilizando la fermentacion o la respiracion anaerobica .-Su xito en la naturaleza es la fotoheterotrofia (luz fuente de energia y un compuesto organico fuente de carbono) Enriquecimiento: utilizando un medio de sales minerales, suplementado con un acido organico como fuente de carbono BACTERIAS NITRIFICANTES .-Son bacterias capaces de crecer quimiolitotroficamente a expensas de compuestos inorganicos reducidos. Dos grupos : .Nitrosificantes: oxidantes de amoniaco NH3 Prefijo Nitro > Nitrobacter .-Nitrificantes: oxidantes de nitritos NO3. Prefijo Nitroso > Nitrosomonas Se encuentran en aguas residuales

BACTERIAS OXIDANTES DEL AZUFRE Y DEL HIERRO .-Crecen quimiolitotroficamente sobre compuestos reducidos de azufre.Dos clases: A pH neutro y a pH acido .Thiobacillus son los mejores estudiados son acidofilos .-Achromatium se aisla normalmente en agua dulce con sedimentos ricos en sulfuros. Relacionados con las bacterias rojas fototroficas. Acumulan S .-Beggiatoa son filamentosos, deslizantes y oxidan azufre; se encuentran en habitat ricos en H2S (aguas residuales) . engrosamiento (alcantarillado) .-Se llevo al concepto de quimiolitotrofia, tras oxidar H2S hasta S y despues hasta SO4 (Winogradsky) BACTERIAS OXIDANTES DEL HIDRGENO .- Poseen H2 como unico donador de electrones y de O2 como aceptor de ellos .-Casi todas son quimiolitotrofos facultativos (comp. Org e inorg. Como fuente de energia) .Contienen una o mas hidrogenasas que funcionan uniendo H2 y lo usan para producir ATP .Crecen mejor en condiciones de microaerofilia ( que necesitan O2, pero en cantidad inferior a la atmosferica) METANOTROFOS Y METILOTROFOS .-Utilizan el metano como donadores de electrones para la generacion de energia y como unicas fuentes de carbono .-Los metanotrofos poseen una enzima especifica, la monooxigenasa de metano(introducir un atomo de oxigeno en la molcula de metano, obteniendo metanol) .-Los metanotrofos se encuentran en medios acuaticos y terrestres, siempre que exista una fuente estable de metano, tambien los hay simbiontes de moluscos .-Para el enrequecimiento se necesita un medio de sales minerales y una atmosfera de metano al 80% y al 20% de aire .- Obteniendo 2 tipos de colonias sobre el agar: organotrofos comunes: 1-2 dias metanotrofos: despus de 1 semana .color rosas PSEUDOMONAS .-Son bacilos rectos, gram negativos,aerobios y quimioorganotrofos con flagelos polares .-Las caracteristicas claves para su identificacion: ausencia de gas a partir de la glucosa; oxidasa y catalasa positiva; indol y rojo de metilo negativo; metabolismo respiratorio nunca fermentativo .-Zymomonas; fermenta vigorosamente los azucares hasta etanol; es el responsable del deterioro de bebidas tales como la cerveza .-Se destingue de Pseudomonas por su metabolismo fermentativo,microaerofilia, oxidasa negativa BACTERIAS DEL ACIDO ACETICO .-Llevan una oxidacion incompleta de alcoholes y de azucares acumulando acidos organicos como productos finales. Con etanol como sustrato se produce acido acetico .- resistentes a condiciones acidas / produccin comercial del vinagre .-Genero Gluconobacter : flagelos polares, carece de un ciclo del acido citrico

.-Genero Acetobacter: flagelos peritricos, es superoxidante,oxida acido acetico hasta CO2 BACTERIAS AEROBICAS DE VIDA LIBRE FIJADORAS DE NITROGENO .-Habitan en el suelo y poseen la capacidad de fijar nitrogeno aerobicamente .-Azotobacter tiene formas de resistencias denominadas cistos, resistentes a la desecacion, radiaciones UV. Son fijadoras de N2 sin establecer simbiosis con plantas .-Azomonas; no forma cistos de resistencia y son primariamente acuticos BACTERIAS ENTERICAS .-Bacilos no esporulados, no moviles, anaerobios facultativos, oxidasa negativo .-Ej: Escherichia, Salmonella, Proteus Cultivos bacterianos Colonias de bacterias Escherichia coli (ms grande, rosa) y Proteus vulgaris (ms pequea, de color castao) que crecen juntas en una placa Petri. En circunstancias normales estas bacterias son inofensivas y habitan en el intestino humano favoreciendo la digestin, si bien pueden convertirse en patgenas y producir infecciones del tracto urinario. Bacterias patgenas Muchos tipos de bacterias flageladas, como la Salmonella de la imagen, producen enfermedades en los animales y en las personas. El organismo se mueve por medio de proyecciones filiformes, llamadas flagelos y se multiplica en el intestino, produciendo graves inflamaciones. Los animales de granja, especialmente las aves, son un depsito de bacterias, que pueden llegar al hombre a travs de la carne, huevos y productos contaminados. VIBRIO Y PHOTOBACTERIUM .-Poseen un metabolismo fermentativo, se diferencia del grupo enterico en su oxidasa positiva .Algunas poseen la propiedad de emitir luz luminiscencia (photobacterium) regulada por la autoinduccion Bacteria del clera Esta micrografa electrnica ilustra la bacteria Vibrio cholerae, causante del clera, una grave enfermedad infecciosa del hombre. Produce una toxina que induce la secrecin de grandes cantidades de lquido en el intestino delgado, lo cual determina un cuadro de vmitos, diarrea, calambres musculares y, a veces, la muerte. Hay una vacuna preparada con bacterias muertas que proporciona proteccin parcial. RICKETSIAS .-Son parasitos intracelulares, no pudiendo ser cultivados en ausencia de celulas hospedadoras. No sobreviven mucho tiempo fuera del hospedador (transmisin animal) .-Causante de enfermedades humanas (fiebre de las montaas rocosas) .-El genero Wolbachia puede tener efectos muy severos en insectos . Desarrollo de huevos no fertilizados. Produce Feminizacion (macho a hembra) ESPIRILOS .-Moviles, con morfologia de espiral, gran variedad de atributos fisiologicos

.-Bdellovibrio, parasitar a otras bacterias utilizando sus nutrientes citoplasmticos como base de sustento .-Ancylobacter; forma de anillo, no moviles, quimioorganotrofos, de ambientes acuticos .-Campylobacter y Helicobacter; moviles y la mayoria patogenos para humanos. Son microerofilicos. Cultivados de muestras clinicas en medios con baja tensin de oxigeno y alta concentracin de CO2 PROTEOBACTERIAS CON VAINA .-Con un ciclo unico que implica la elaboracion de una forma nadadora dentro de la vaina .- La forma nadadora sale fuera dispersada a nuevos ambientes; dejando la vaina vacia. En cond. Favorables tiene lugar el crecimiento dentro de filamentos largos llenos de celulas. Son comunes en aguas dulces (arroyos) .Sphaerotilus formado por celulas bacilares con extremos redondeados rodeados por una vaina apretada BACTERIAS PEDUNCULADAS CON HIFAS Y QUE GEMAN .-La division tiene lugar debido a un crecimiento celular no balenceado , a diferencia de una bacteria normal donde la division es por fision binaria originando 2 cel. Hijas iguales .-Se diferencia de una bacteria convencional en la formacion de nuevo material celular a partir de un unico punto en lugar de en toda la celula .-Las dos bacetrias mejor estudiadas y que geman son Hyphomibrobium (quimioorganotrofo), ampliamente distribuido en aguas dulces, marinas y en suelos; y Rhodomicrobium (fototrofico) .Las bacterias con prostecas son quimioorganotros aerobios, cuya funcion principal es la fijacin; tambien disminuir la tasa de sedimentacin en medios acuticos (flota) MIXOBACTERIAS DESLIZANTES .-Bacilos largos, carecen de flagelos, lisan otras bacterias para obtener su sustento .-Algunas bacterias poseen la propiedad de formar estructuras multicelulares cuerpos fructferos .- los cuerpos fructferos se desarrollan en deposiciones de animales; se aislan preparando agar al 1,5% en agua sin ningun otro nutriente; encima se agrega una capa densa de bacteria y en el centro se deposita un trozo de corteza de arbol en descomposicin. Asi las mixobacterias lisan a la bacteria y utilizan el material intracelular como nutriente .-Poseen los modelos de comportamiento y ciclos de vida mas complejos, por ello el tamao de su cromosoma Bacterias Gram + Diversidad Procaritica: Dominio Bacteria Bacilos y cocos Gram positivos formadores de endosporas. Las bacterias que forman endospora sobreviven a condiciones hostiles, tales como calor y falta de agua por largos periodos Bacillus e insecticidas bacterianos.

Reino:Eubacterium Nombre Cientfico: Bacilo thuringeinsis Esta toxina cristalina es venenosa a diversos insectos que los coman, incluyendo polillas, moscas y mosquitos. Gnero Clostridium. Los miembros del gnero clostridium son barras Gram-positivas, anaerobias que son formadoras de endosporas. Mecanismos de produccin de energa. Grupos del gnero Clostrium. Hbitat suelo. Responzables de enfermedades. Clostridium botulinum Es agente que causa el botulismo, que se considera uno de los venenos ms potentes conocidos. C. perfringens Es capaz de necrotizar el tejido fino intestinal y puede lanzar una enterotoxina que conduce a diarrea severa. Gnero Sporosarcina. Forma de coco, con endospora refringente y anaebico estricto. Formacin de tetradas o paquetes de ocho o ms clulas. S. ureae Se encuentra en el suelo y es tolerante al pH alto. Descompone la urea a CO2 y a NH3 Levanta el pH de un medio no tamponado. Rol ecolgico importante como degradador de la urea. Micoplasmas. Elemento cocoideo que carece de PC. Esteroles. Carotenoides. Lipoglicanos. Crecimiento e inhibicin a antibiticos. Spiroplasma forma helicoidal .

Los micoplasmas son clulas procariotas pequeas (0.3 a 0.5 um de dimetro) No poseen pared celular y por ello slo son capaces de crecer en ciertos medios. Bacterias Gram positivas con elevado contenido de GC: Actinomicetes.

Variabilidad morfolgica. Unidad filogentica. Rasgos comunes. Bacterias Corineformes. Caractersticas:G +, forma bacilar, aerbicos e inmobiles . Divisin crepitante: formacin de paredes transversales y rotura de la capa exterior.

Principales gneros de este grupo Corynebacterium: incluye patgenos de animales y plantas, adems de saprfitos. Tiende a estar inchada en un extremo Arthrobacter: organismos del suelo, en su ciclo de desarrollo pasa de forma bacilar a forma esfrica y nuevamente a la forma bacilar. Bacterias del cido propinico. La produccin de cido propinico en gran cantidad es una caracterstica del gnero Propionibacterium. Gnero Mycobacterium cido-alcohol resistencia y presencia de cidos miclicos. Caractersticas: pleomrficas. Fotocromognesis. Escotocromognesis.

Actinomicetes filamentosos Bacterias filamentosas, G +, ramificadas y forman micelio. Streptomyces: Forma esporas llamados conidios, que no tienen relacin con las endosporas de Bacillus o clostridium. Cianobacterias y proclorofitos Cianobacterias Diversidad morfolgica: Unicelulares con divisin por fisin binaria. Unicelulares con divisin por fisin mltiple. Filamentosas con clulas diferenciadas, llamadas heterocistes y fijadoras de nitrgeno. Filamentosas sin formar heterocistes. Filamentosas ramificadas. Principales caractersticas Tamao entre 0.5 y 60 um de diam. Forman estromatolitos. Presentan frecuentemente cidos grasos no saturados. Pared celular como Gram. Membranas fotosintticas lamelares, en forma concntrica en la periferia del citoplasma. Producen envueltas o vainas. Deslizamiento. (fototaxis y quimiotaxis) Slo presenta clorofila a (P 700). Presentan pigmentos llamados ficobilinas. (ficocianina azul, ficoeritrina roja ) Cianoficina Polmero sencillo del cido asprtico, unido a molculas Puede constituir un 10% de la masa muscular.

de arginina.

Reserva de nitrgeno y energa.

Biotoxinas de cianobacterias Neurotoxinas : Alcaloides que actan como potentes bloqueadores neuromusculares y producen la muerte por parlisis respiratoria. (Anabaena flos-aquac, A. Spiroides, A. Circinalis, Aphanizomenon flos-aquae y Oscillatoria), Hepatotoxinas : Pptidos que producen la muerte por destruccin y hemorragia heptica; como efecto crnico, en bajas concentraciones, estimulan el crecimiento de tumores. (microcistinas por microcystis y nodularinas) Aphanizomenon. Reproduccin Biparticin. Fragmentacin de filamentos, los framentos liberados son los hormogonios, que regeneran al individuo completo. Esporas, reproduccin por elementos de resistencia. (acinetos) Variaciones estructurales Vesculas de gas. Heterocistes. Fisiologa No requieren vitaminas y usan nitrato o amoniaco como fuente de nitrgeno. Algunas pueden asimilar comp. org. simples como glucosa y acetato en presencia de luz. Gran capacidad para absorber dixido de carbono disuelto, aun en concentraciones muy bajas. Algunas crecen en la oscuridad a partir de glucosa u otros azcares. Algunas realizan fotosntesis anoxignica en presencia de sulfuro. Ecologa y Evolucin Toleran mejor los ambientes extremos que las algas. Variabilidad de hbitat. Primeros organismos fototrficos. Proclorfitos Denominadas tambin cloroxibacterias. Fueron descubiertas en los aos 60 . Fototrofos procariotas. Contienen clorofila a y b, pero no ficobilinas. Prochloron Primer proclorfito que se descubri. Se encuentra en la naturaleza como simbionte de invertebrados marinos. Morfologa esfrica. Membranas tilacoides. Otros Proclorfitos

Prochlorothrix. Clorofila a y b y carece de ficobilinas. Prochlorococcus. Clorofila b y divinilclorofila a. Productores primarios en aguas marinas. CLAMIDIAS Son parsitos obligados. Estudios demuestran que las Clamidias tienen paredes celulares del tipo G(-). Continen DNA y RNA. Se reproducen por fisin binaria. En su genoma se reconoce la presencia de genes para la sintesis de ATP. Carece del gen condificante de la protena FtsZ. SU CICLO CELULAR Los cuerpos elementales son celulas especializadas en la transmicin. Son transmitidas va area al sistema respiratorio Tipos de Clamidias Clamidia trachomatis. Clamidias pneumoniae. Clamidia psittaci. C. trachomatis es la que se encuentra con mayor frecuencia en diversos pases. Adems, es el agente causal ms importante de enfermedades de transmisin sexual (ETS) en sociedades industrializadas. En la mujer en etapa reproductiva C. trachomatis infecta el endocrvix de la mujer y puede ser una causa de cervicitis mucopurulenta. Las consecuencias clnicas ms severas de la infeccin genital por clamidias son la endometritis y la salpingitis. La UNG, produce graves daos, como la enfermedad plvica inflamatoria y daos en las trompas de Falopio. En los varones produce uretritis.(UNG). La UNG puede llevar complicaciones enla parte de los testculos e inflamacin de la prstata. Cada vez se reconoce con ms frecuencia que Chlamydia Pneumoniae es un agente responsable de infecciones respiratorias bajas, como neumona en los nios, bronquitis y neumonas en los adultos. Al parecer, C. pneumoniae es principalmente un agente patgeno para el aparato respiratorio del ser humano, no se le conoce ningn reservorio animal. Probablemente, los contagios se producen persona a persona a travs de las gotitas respiratorias, y la infeccin se propaga entre las personas que conviven en la misma casa. Clamidia psittaci Esta enfermedad fue descrita por primera vez por Ritter (1897) en Suiza, en una familia dedicada a la importacin de aves psitcidas, de ah el nombre de psitacosis. Se trata de una de las enfermedades ms temibles y conocidas que se dan en aves. En un principio se pens que al agente productor de esta enfermedad era de naturaleza vrica. La transmisin de esta enfermedad se lleva a cabo por va ergena fundamentalmente, a travs del polvo de las plumas o de los excrementos, expectoraciones de animales enfermos o

portadores sanos. Tambin se puede producir contagio a traves de la va digestiva, del huevo, cebado de las arias, siendo probable que tambin los caros acten como vectores de la enfermedad. En el hombre esta enfermedad puede llegar a ser mortal. En la actualidad cursa con neumona, pleuresa (inflamacin de las pleuras), tos, cansancio, fiebre, dolor de cabeza, sntomas que cesan al cabo de 3-4 semanas tras una tratamiento con antibiticos. La principal vial de entrada del germen en el hombre es inhalatoria. El contagio directo entre humanos es raro . REINO PLANTOMICES Morfologa de Plantomices: Flagelos Pili Crateres Nucleo Prosteca o tallo Pared celular. No posee peptidoglucano. Esta formado por protenas, en su mayoria cisteina y prolina. Resistente a antibioticos.

REPRODUCCION Tipo asexual en un proceso de gemacin. Formacin de tallo para anclaje. Se produce la formacin de una protuberancia. Se desprende la clula hija flagelada. Ciclo de vida dimorfo. Genero plantomyces Viven en aguas saladas y dulces Son mesofilas Pueden degradar la quitina Poseen un ciclo de vida dimorfo. Su reproduccin es por gemacin. Crecen por la fermentacin y respiracin de los azucares. Genero gemmata Viven en agua dulce Poseen dos membranas nucleares. Poseen un nucleo formado por un circulo genetico superenrrollado. Genero pirellula. Viven en agua dulce. Poseen un compartimiento celular grande. Se caracteriza por su importancia en la degradacin de macromoleculas. Genero isosphaera Vive en zonas termales.

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En aguas saturadas de oxigeno. Soporta altos niveles de radiacin Son bacterias filamentosas.

VERRUCOMICROBIUM Ubicacin Taxonomica dominio bacteria phylum verrucomicrobia clase verrucomicrobiae orden verrucomicrobiales familia i verrucomicrobiacea genero i verrucomicrobium especies v. spinosum genero ii prosthecobacter especies i p. fusiformis ii p. dejongeii iii p . debotii iv p. vanneervenii genero iii ultramicrobium especie i m. veglc2 familia ii xiphinematobacteriaceae genero i xiphinematobacter

taxa nueva agregado en marzo 2000

CARACTERISTICAS GENERALES DEL PHYLUM Fuentes de Carbono: Solo un nmero lmitado de sustratos. Principalmente azucares como derivados de la glucosa como hexosa, di triglicerido, etc. Reproduccin simtrica CARACTERISTICAS SP. V.SPINOSUM TAMAO : 0.8 1.0 x 1.0 3.8 um PROSTECAS : Numerosas long. de 0.5um NO POSEEN MOVILIDAD QUIMIOHETEROTROFOS ANAEROBIOS FACULTATIVOS FUENTE DE Nitrgeno: Amonio, Urea, Nitrato T Optima: 26 - 33 C Poca tolerancia a la salinidad HABITAT : Acuticos (agua dulce, lagos eutroficados) Suelos agrcolas, bosques

GENERO PROSTHECOBACTER Caractersticas generales Aerobias estrictas Heterotrfico

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Forma : fusiformes o de vibrio Tamao: 0.5 0.9 x 2 5 um No poseen movilidad Prostecas: polares diametro 0.1 0.2 um adelgazada, que posee una punta tipica bulbosa que le permite adherencia Caractersticas de la especie P. Fusiformis Crecen en medios con poca materia orgnica (menos de 0.1%) T optima de crecimiento 1 10 C y 35 40C No necesitan Vitaminas Hbitat: Acuticos (oligotroficos), suelos

Genero Ultramicrobium Bacteria ms pequea conocida (es 1/10 el tamao de E. Coli.) Fermentativos Utilizan azcar como fuente de carbono Hbitat: Abundantes en el suelo y agua dulce

Flavobacterias Este phylum de Bacteria comprende una mezcla de diferentes tipos fisiolgicos desde aerobios hasta anaerobios estrictos pasando por los anaerobios facultativos. Se encuentran en hbitat muy diversos (suelo, agua) Gnero Bacteroides Comprende anaerobios estrictos no esporulados, fermentan sacarosa hasta acetato y succinato. Las especies son comensales del intestino de humanos y otros animales (1010 1011 celulas por gramo de heces Pueden ser patgenos, suelen ser la causa de infecciones por anaerobios. Caracterstica: pueden sintetizar esfingolpidos Se encuentran principalmente en: ambientes acuticos tanto en agua dulce como salada en alimentos y en plantas procesadoras de los mismos Tiene restringido el nmero de fuentes de carbono que pueden utilizar (glucosa) Rara vez son patgenos pero la especie F. Meningosepticum puede estar asociada a la meningitis infantiles no meningocsicas Enfermedad Bacteriana en los peces por Flavobacterium Procesos infecciosos externos que afectan a la piel, aletas y branquias. Factores: T altas, excesiva presencia de materia orgnica en el agua, manejo inadecuado de los peces Flavobacterium psychrophylum afecta a t inferiores a 15 C Grupo Cytophaga Son bacilos largos y delgados, con los extremos frecuentemente terminados en punta y que se mueven por deslizamiento.

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Sporocytophaga Es semejante a la Cytophaga, pero genera formas de resistencia cocaceas denominados microcistos Ampliamente distribuidos en el suelo y el agua Digieren polisacaridos como: Celulosa Quitina Agar Cytophaga No producen enzimas solubles Puede crecer en agar con celulosa Algunas especies son patogenas de peces: C. Columnaris: que causa enfermedad columnar C. Psychrophyla: Sindrome del agua fria Flexibacter Requieren medios complejos para crecer No son celuloliticos Pueden producir cambios en su morfologia Muchas especies son pigmentadas: Carotenoidicos Flexirrubinas Espiroquetas Bacterias Procariotas Gram negativas Mviles Formas de espiral o sacacorchos Flexibles Se encuentran en : Medios acuticos Animales Humanos como patgenos Estructura Esta formada por un cilindro protoplasmtico Endoflagelos Vaina externa flexible Las Espiroquetas se clasifican en 8 gneros principalmente. Spirochaeta : Se reconocen 14 especies, son anaerobios o anaerobios facultativos, todos acuticos de aguas saladas y dulces de vida libre. Algunas especies del gnero son: S.plicatilis S.stenostrepta

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S.aurantia

Cristispira: Se reconoce solo una especie, poseen de 3 a 10 vueltas completas , su hbitat es el tracto digestivo de molusco no son patgenos Treponema: Se reconocen 20 especies dentro de este gnero, son microaerfilos o anaerobios. Sus vueltas son helicoidales o aplanadas. Son comensales o parsitos de humanos u otros animales . Algunas Especies importantes del gnero son: T. pallidum. T. denticola. T. macrodentium. T. oralis T. saccharophilum Leptospira y leptonema:son anaerobias y aerobias sus vueltas son apretadas y sus extremos terminan en forma de gancho la diferencia entre ambos gneros es su dependencia a los Ac. Grasos de cadena larga la Leptonema no los requiere en cambio la leptospira si. Pueden ser de vida libre o parsito del hombre u otros mamferos La especie ms importante del gnero es. L. interrogans Borrelia: Microaerofilos poseen de 5 a 7 vueltas. Son patgenas por tanto, su hbitat natural son los humanos y otros animales. Las especies ms importante del gnero son. B. recurrentis. B. burgdorferi.

Brachyspira: Se reconocen 8 especies dentro del genero son anaerobias y se les puede encontrar en el intestino de animales de sangre caliente produce diarrea en pollos y cerdos GENERO DEINOCOCCUS Reino: Bacteria Phylum: Deinococos Familia: Deinococcaceae Genero: Deinococcus /Thermus Especie: D. radiodurans y T. aquaticus Forma: Cocos

Caracteristicas Gram Positiva y Gram Negativa respectivamente Existen 2 especies: D. radiodurans y T. aquaticus las mas estudiadas. Capacidad de resistencia a radiacin y calor respectivamente. Capacidad de reponer su DNA de modo eficaz. Deinococcus Radiodurans Descubiertos en 1956.

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Sobrevive a calor, fro, vaco y cido. Utilizada en ingeniera gentica. Sobrevive a radiaciones mil veces mas altas que el hombre.

Como sobreviven? TEORIA DE J.R. Battista. Formacin de esporas protectoras. Efecto de la radiacin. Eficiencia en la reparacin del material gentico. Protena RecA.

Reparacion Permite gran cantidad de reparaciones en su genoma, hasta 200 veces. Proceso de reparacin. CONCLUSIN utilidad en vertederos. utilidad plantas nucleares. ingeniera gentica. d. radiodurans es el mas fuerte en el mundo de los microbios. FILOGENIA Y METABOLISMO DE ARCHAEA Incluyen la ausencia de peptidoglicano en las paredes celulares. Presencia de lpidos con enlaces ter. RNA polimerasas muy complejas. Forman un grupo muy diverso (fenotpico). Phylum Crenarchaeota Agrupa especies hipertermfilos y psicrfilos. Muchas de estas especies son quimiolitoautotrofos. Son productores primarios.

Phylum Euryarchaeota Bacterias metanognicas y halobacterias. Hipertermfilos Thermococcus y Pyrococcus. Metanongeno Methanopyrus. Thermoplasma (sin pared celular).

Phylum Korarchaeota Se descubrieron muestreando comunidades microbianas en un manantial caliente de Yellowstone. No se ha reconocido oficialmente en taxonoma. Caractersticas de los organismos antiguos.

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Metabolismo de las Archaea Algunos son quimiorganotrofos, utilizan compuestos orgnicos como fuente de carbono y energa. Catabolismo de la glucosa por la ruta de Entner-Doudoroff. Oxidacin de acetato hasta CO2 por el ciclo del cido ctrico o con variaciones por la ruta del acetil-coA. Quimioorganotrofismo (donadores orgnicos, reduccin de O2 y S0, ATP en ATPasas). Quimiolitotrofia, H2 es el principal donador de electrones. Metangenos y quimiolitotrofos hipertermfilos, el CO2 se incorpora por la va acetil-coA. Otros hipertermfilos, el CO2 se fija a travs del del ciclo inverso del cido ntrico o el ciclo de Calvin.

Phylum euriarchaeota Halfilos extremos Halobacterium Haloferax Natronobacterium Metangeno Methanobacterium Methanoccocus Methanosarcinas

Termfilos extremos Thermoplasmas Ferroplasmas Phycropulus Hipertermfilos Methanopyrococcus Thermococcus Pyrococcus Archaeoglobus Ferroglobus

HALFILOS EXTREMOS Carcteristicas genrales Hbitat : Salinas marinas, lagos salados, hbitat slinos artificiales. Concentracin de Na Cl : Mnimo 9%, ptimo12-13%, Mximo 32%. Ambiente: secos y calientes. Metabolismo: Quimioorgnotrofas, aerobias estrictas. Sustrato: Aminocidos, acidos orgnicos y factores de crecimiento (vitaminas). Reproduccin : fisin binaria. Reaccin Gram: Negativa. Forma de resistencia: No tiene, ni forma esporas de ninguna clase. Mvilidad: La mayora son inmviles, excpto algunas flageladas.

HALFILOS EXTREMOS Taxonoma y fisiologa HALOALCALFILOS. -Gneros: Natronobacterium, Natrnomonas y otras relacionadas. -pH: Optimo 9 11. BALANCE DE AGUA: -A traves de un Balance positivo con el medio ambiente. -Composicin de la pared celular. COMPONENTES CITOPLASMTICOS: -Protenas.

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-Bacteriorrodopsinas. METANGENOS Hbitat : Sedimentos anoxicos, tracto digestivo animales y fuentes hidrotermales marinas. Metabolismo: Quimioorgnotrofos, anaerobios estrictos. Sustrato: Cualquier sustrasto orgnico cmo acetato, metilo y del tipo CO2, excluyendo glucosa, acidos grasos o acidos orgnicos. Pared celular: Seudomurena (Methanobacterium), Metanocondroitina (Methanosarcina), o de glicoprotenas (Methanococcus y Methanoplanus). Son el escaln final de la biodegradacin de la materia orgnica en ambientes anaerobios. TERMFILOS- ACIDFILOS Termoplsmatales Thermoplasmas: Hbitat : Pilas de resto de carbn y pirita (FeS). Temperatura : Optimo 55C. pH: Optimo 2. Metabolismo: Quimioorgnotrofos, anaerobios facultativos. Sustrato: Compuestos orgnicos generados de la combustin del carbn. Pared celular: Carecen de pared celular. Movilidad: Algnas especies son mviles por multiples flagelos. Supervivencia: Membrana compuesta de lpido tetrater con manosa y glucosa, y glicoproteinas, no posee esterles.

Ferroplasmas: Hbitat : Minas de pirita (FeS). Temperatura : Optimo 35C. Metabolismo: Quimiolitotrofos, asimilando CO2. Fuente de energa: Oxida ion ferroso a ferrico. Pared celular : No tiene. Phicrphilus: Hbitat : Sulfataras. pH: Optimo 0,7 Patred celular: No posee. Sustrato: Hetertrofo de medios complejos. Sus celulas se desintegran a pH 4.

HIPERTERMFILOS Temperatura: Optima sobre 80C. Thermococcus Hbitat : Anoxicos de aguas termales. Temperatura: Mnima 70C, Mxima 95C. Metabolismo: Quimioorganotrofo, anaerobio extricto. Sustrato: Proteinas y azucares, Oxida el S a H2SO4. Movilidad: Por medio de flagelos. Pyrococcus: Hbitat : Anoxicos de aguas termales.

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Temperatura: Mxima 106C, Optimo 100C. Metabolismo: Quimioorganotrofo. Sustrato: Proteinas, almidon o maltosa.

Methanopyrococcus: Hbitat : Sedimentos submarinos y chimeneas negras submarinas. Temperatura: Mxima 110C, Optimo 100C. Metabolismo: Quimioorganotrofo, produciendo metano solo del H2 + CO2. Archaeoglobus: Hbitat: Sedimentos marinos calientes. Temperatura: Optimo 83C. Metabolismo: Genera energia por metanogenesis y reduccin del sulfato a sulfhidrico. Sustrato: Lactato, piruvato, glucosa y compuestos orgnicos complejos Ferroglobus: Hbitat: Chimeneas negras hidrotermales submarinas. Temperatura: Optimo 85C. Metabolismo: Quimiolitotrofo, anaerobio, obtiene energa de la oxidacin del in ferroso a in ferrico utilizando el H2 y H2S PHYLUM CRENARCHAEOTA Viven en ambientes extremos de temperaturas. Los psicrfilos viven en aguas muy fras y con pocos nutrientes, son planctnicos La mayor parte de los Archaea hipertermfilos han sido aislados de suelos/aguas calentados por la actividad volcnica y ricos en azufre. Gran mayora anaerobios estrictos. Quimioorgantrofo, quimiolittrofo, o ambos (Sulfolobus). Conservacin de energa es por los mismos mecanismos que Bacteria. No se conocen fotosintticos. Hipertermfilos de hbitat terrestres volcnicos SULFOLOBALES THERMOPROTEALES Sulfolobus Manantiales calientes ricos en azufre Hasta 90C pH 1 5 Quimiolittrofo y/o quimioorgantrofo aerbico Tambin puede oxidar Fe+2 a Fe+3 (minera Acidianus Sulfataras cidas 65C y 95C, ptimo de 90C anaerobio facultativo En aerobiosis : S H2SO4 En anaerobiosis: S H2S

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Thermoproteus y Thermophilum Poseen clulas bacilares. Manantiales calientes neutros o ligeramente acidos. Anaerobios estrictos que llevan una respiracin anaerobia basada en el azufre. Thermoproteus puede crecer quimiolitotrficamente sobre hidrgeno o quimioorganotrficamente sobre compuestos orgnicos. Hipertermfilos de hbitat volcnicos submarinos: Desulfurococcales Pyrodictium Temperatura ptima de crecimiento 105C. Contiene una serie de fibras (rgano de fijacin a las superficies). Anaerobio estricto . Crece quimiolitotrficamente sobre H2 utilizando S como aceptor de electrones. Quimiorganotrficamente sobre sustratos complejos orgnicos. Desulfurococcales Pyrolobus Temperatura ptima de crecimiento 106C. Vive en las paredes de fuentes hidrotermales submarinas. Quimiolittrofo obligado Fuente de produccin primaria de biomasa. Sobrevive autoclavado a 121C durante 1 hora. Desulfurococcus Anaerobio estricto reductor de S Temperatura ptima 85C Pyrobaculum Algunas sp pueden respirar tanto aerbicamente como anaerbicamente con NO-3, Fe+3 o S como aceptores de electrones e H2 como donador. Otras sp crecen en anaerobiosis sobre donadores orgnicos y reduciendo S hasta H2S. Temperatura ptima 100C, y se han aislado tanto de manantiales calientes de medios terrestres como de zonas profundas submarinas Ignococcus Contiene una membrana externa, poco habitual, ya que se forma a cierta distancia del citoplasma, generando un espacio periplasmtico muy grande (2 a 3 veces ms grande que el citoplasma). Crece ptimamente a 90C. Su metabolismo se basa en H2/S Staphylotermus

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 Sus clulas son esfricas y forman agregados de hasta 100 clulas. Quimiorgantrofo Crece ptimamente a 92C. Se han encontrado tanto en aguas poco profundas como en las chimeneas negras de las fuentes hidrotermales submarinas de zonas muy profundas. Evolucin y Vida a altas Temperaturas Estabilidad trmica de las Biomoleculas La estabilidad de las protenas y del DNA de los hipertermofilos es critica para su supervivencia a altas temperaturas. La composicin de aminocidos de estas protenas no nos indica nada inusual, de hecho tienen las mismas caractersticas estructurales que sus equivalentes de bacterias mesfilas. Las protenas termofilicas tienden a tener ncleos hidrofbicos, que probablemente dan mas estabilidad intrnseca a la protena. Sin embargo es el plegamiento lo que da una caracterstica de termoresistencia, cambiar un aminocido por otro son suficientes como para transformar una protena en termoresistente. Los hipertermofilos producen CHAPERONINAS(proteinas de choque trmico), cuya funcin es reconfigurar, al menos parcialmente, protenas desnaturalizadas. En las clulas de Pyrodiction, la chaperonina mas importante se denomina el Termosoma. Su misin es mantener las protenas en una conformacion activa , puede incrementar la tasa de resistencia celular a la temperatura, cuando el termosoma esta presente, las clulas de Pyrodiction puede sobrevivir 1 hora en el autoclave(121 C) Estabilidad del DNA El citoplasma de metanogenos hipertermofilos contiene grandes cantidades 2,3-difosfoglicerato potasico cclico, este es un soluto que evita el dao qumico, como la depurinizacion del DNA, que puede ocurrir a altas temperaturas. No todos los hipertermofilos lo producen. Todos los hipertermofilos producen una forma particular de DNA topoisomerasa denominada girasa reversa de DNA, que introduce vueltas positivas en el DNA y se ha constatado que el enrollamiento positivo estabiliza el DNA y lo hace resistente a la desnaturalizacion termica. La Sulfolobus tiene una pequea protena la Sac7d, que se une al surco menor del DNA de manera no especifica aumentando la temperatura de fusin del DNA en unos 40 C. Estabilidad de los lpidos Todos ellos tienen lpidos construidos sobre la base del modelo de bifitanil tetraeter. Es resistente a la temperatura, debido al enlace covalente entre las unidades de fitanilo, la membrana que genera es monocapa en lugar de bicapa lipidica como en las membranas normales, esta resiste la tendencia que tiene el calor para desorganizar la bicapa lipidica de cidos grasos. Los limites para la existencia de vida microbiana Las fuentes hidrotermales y chimeneas negras emiten fluidos a 250-350 C que forman estructuras llamadas chimeneas a partir de los sulfuros metlicos del fluido. Se han encontrado en las pared de las chimeneas hipertermofilos, los estudios del agua sobrecalentada a 250 C muestran que esta estril. Los experimentos de laboratorio sugieren que la vida puede mantenerse a temperaturas de hasta 140-150 C, pero sobre esta temperatura no podran hacerlo.

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Si existiesen organismos capaces de crecer sobre esta temperatura su economa energtica tendra que ser basada en algo diferente al ATP ya que el ATP es inestable a esta temperatura. Archaea hipertermofilos y evolucin microbiana En la tierra primigenia existieron ambientes extremos como ocurre en la actualidad, y fue en esos ambientes en los que pudo aparecer la vida. La tierra seguramente era mas caliente que en la actualidad, es por eso que los hipertermofilos, pueden considerarse como los mejores candidatos a ser los representantes de las primeras formas de vida en la tierra. Un aspecto recurrente entre los Archea cultivados es su adaptacin a los ambientes extremos. Los hipertermofilos y sus lentos relojes evolutivos. El estudio de la secuencia de diversos genomas de Archaea permite decir que evolucionan mas lentamente que Bacteria y Eukarya.(Particularmente en Archaea hipertermoflicos Euryarchaeotas y crenarchaeotas). De esto se extrae de estudiar el rbol evolutivo, los linajes de los hipertermfilos son muy cortos y se ramifican cerca de la base. El margen evolutivo en estos ambientes es muy estrecho y estn sometidos a tremenda presin para mantener activos algunos genes que son en realidad los responsables de la termorresistencia celular. Las Archaeas son reliquias vivientes de las formas primigenias de vida y su estudio racional, concienzudo y serio debe llevarnos a comprender principios importantes sobre el inicio de la vida en la tierra. Korarchaeota Una que tiene reloj evolutivo lento es la del phylum Korarchaeota, solamente se han identificado en un nico mantial, Estanque obsidiana del parque nacional de Yellowstone de Wyoming y aun su grupo no es reconocido oficial mente. Existen cultivos mixtos de laboratorio de estos microorganismos que indican claramente que son hipertermofilos. Se anticipan mas progresos en este grupo y su estudio puede revelar secretos sobre la tierra primigenia y sus formas de vida iniciales. El hidrgeno como forma de energa primitiva El hidrogeno se encuentra implicado en el marco metablico de este grupo de bacterias, muchas Archaea crecen anaerbica mente con hidrogeno como donador de electrones y uno o mas aceptores de electrones S , NO3 y Fe 3+. Casi con seguridad el metabolismo del hidrogeno es una reliquia fisiolgica de esquemas bioqumicos antiguos, ya que estos elementos inorgnicos eran muy abundantes entonces. La diversidad de Archaea hipertermofilas oxidantes de hidrogeno en la actualidad y el hecho de que muchas bacterias mes filas tambin utilicen el H2 fue un xito en la evolucin del metabolismo. De hecho, la habilidad para utilizar el hidrogeno por parte de los hipertermofilos y de aquellos procariotas que viven en las profundidades de la Tierra, ofrece ejemplos viables de esta estrategia metablica. Las fuentes hidrotermales submarinas, habitas hoy de los hipertermofilos mas extremos, han sido propuestos como ambientes propicios semejantes a los primigenios donde pudo haber surgido la vida en este planeta. Es posible que los hipertermofilos actuales sean en reliquias vivientes de los primeros habitantes de la tierra. METODOS DE LA ECOLOGIA MICROBIANA

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ECLOGIA MICROBIANA: Trata de la interaccin de los microorganismos, entre s y con su ambiente. BIODIVERSIDAD: Aislamiento y la identificacin y cuantificacin de microorganismos en sus determinados hbitat, y -ACTIVIDAD MICROBIANA: El papel que cumplen dichos microorganismos en sus hbitat. Los mtodos de la ecologa microbiana comprenden: -Enriquecimiento y aislamiento -Tincin de clulas -Aislamiento y caracterizacin de genes, y -Medicin de las actividades de microorganismos in situ Enriquecimiento y aislamiento. Las tcnicas de enriquecimiento estn diseadas para incrementar el nmero relativo de un microorganismo , favoreciendo su desarrollo , supervivencia o su separacin especial de otros miembros de la poblacin. Para que luego stos puedan ser aislados en un cultivo axnico. Columna de winogradsky .- Corresponde a un ecosistema anxico en miniatura, que puede ser utilizado como suministro de bacterias para cultivos de enriquecimiento. .- Utilizada tradicionalmente para el aislamiento de bacterias fototrficas rojas y verdes, de bacterias sulfato reductoras y de otros anaerobios. Preparacin: .-Se tiene un cilindro grande de vidrio que se llena hasta la mitad de lodo rico en materia orgnica, al que se le aade CaCO3, ( como tampn) y CaSO4 ,(como fuente de sulfato). .-El lodo se compacta de tal manera que no quede aire atrapado. .-El lodo se cubre con agua de lago, embalse y el cilindro se tapa para evitar la evaporacin. .-El cilindro se coloca en una ventana donde reciba luz atenuada y se deja varias semanas.

Aislamiento en cultivo axnico Los mtodos mas utilizados para la obtencin de estos cultivos, a partir de un enriquecimiento ,son: -Siembra por estra en superficie :Mtodo utilizado para aquellos microorganismos que crecen bien en medio de cultivo slido. Puede ser utilizada para aislar tanto microorganismos aerobios como anaerobios. -Siembra en profundidad : Mtodo que consiste en la dilucin de un cultivo mixto en tubo de agar fundido, es utilizado para purificar microorganismos de tipo anaerobios. -Dilucin en liquido (NMP) : Mtodo que consiste en la dilucin seriada de un inoculo en un medio liquido. Utilizado en muestras donde hay que evaluar rutinariamente el numero de clulas. Cultivos axnicos de alta tecnologa Las pinzas de lser .-Consiste en un microscopio ptico invertido equipado con un lser infrarrojo enfocado con precisin y un instrumento de micro manipulacin. .-Se emplean para seleccionar organismos a partir de una mezcla para su purificacin y posterior estudio en laboratorio. .- Son utilizadas para el aislamiento de bacterias de desarrollo lento, o aquellas que estn en nmero muy bajo.

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ANALISIS MOLECULAR DE LAS COMINIDADES MICROBIANAS viabilidad y cuantificacin mediante tcnicas de tincin. tincin fluorescente con dapi. (4,6-diamido-fenilindol). .-utilizado para teir microorganismos en hbitat opacos. .-las celulas teidas con dapi presentan fluorescencia azul brillante. .-proporciona una estimacin razonable del nmero de clulas presente. .-se emplea para la enumeracin de microorganismos en muestras clinicas , del ambiente y de alimentos. TINCION DE VIABLES .- tiene la ventaja de diferenciar entre clulas vivas y muertas. .- distincion que se basa en la integridad de la membrana citoplasmatica celular. .- a la muestra se agregan dos tipos de colorantes: -verde fluorescente, que penetras clulas tanto vivas como muertas. -rojo, solo penetra clulas muertas .- metodo que se utiliza con cultivos bacterianos de laboratorio ANTICUERPOS FLUORESCENTES .-Mtodo en que a las tcnicas de tincin se incluye el empleo de anticuerpos fluorescentes. .-Esta tcnica se basa en la gran especificidad de los anticuerpos frente a los constituyentes de la superficie de un organismo particular. .-De esta manera se puede identificar o rastrear un organismo en un hbitat complejo. Protena fluorescente verde para el etiquetado celular .- Las clulas bacterianas son alteradas mediante tcnicas de ingeniera gentica para volverlas fluorescentes. .- A estas se les inserta el gen GFP ( green fluorescent protein), que codifica una protena fluorescente verde. .- Al expresarse el gen, las clulas aparecen de color verde cuando se observan en microscopio de luz UV. Limitaciones de la microscopa .- LAS CLULAS muy pequeas pueden pasar inadvertidas. .- La dificultad de diferenciar entre clulas vivas y muertas y la materia inerte. .- Imposibilidad de evaluar la diversidad gentica de los microorganismos en un hbitat natural. Tinciones genticas .- Se utilizan sondas de cidos nucleicos con el fin de identificar y cuantificar microorganismos en la naturaleza. .- Una sonda de cido nucleico es un oligonucleotido de DNA o RNA complementario a una secuencia en un gen diana, stos pueden hacerse fluorescentes mediante colorantes y pueden utilizarse para identificar organismos que contienen una secuencia de cido nucleico complementaria. .- El gen utilizado como diana es el que codifica el RNA ribosmico 16S, en procariotas. .- Esta tcnica se conoce como hibridacin fluorescente in situ (FISH). Tinciones genticas

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.- Tincin filogentica con FISH. Permite identificar o rastrear un organismo particular grupo de organismos relacionados dependiendo de la especificidad de la sonda. .- Tincin de cromosomas. Se emplea para identificar genes especficos de la microbiota de muestras naturales. .- Transcripcin inversa in situ (ISRT). Tcnica que busca si un organismo esta expresando un gen o genes determinados en la naturaleza en un momento determinado. Reaccin en cadena de la polimerasa (PCR) .-Tcnica desarrollada por Kary Mullis a mediado e los aos 80. .- Con esta metodologa se pueden producir en laboratorio mltiples copias de un fragmento de ADN especfico. .- Se basa en la actividad de la enzima ADN polimerasa. .- Debe existir: -nucletidos en el medio. -un cebador. Principales pasos de la PCR 1.-Separacin de las dos cadenas que forman la molcula de ADN. 2.-La ADN polimerasa copia el gen diana. 3.-Generacin de la cadena complementaria, consiguindose mltiples copias del gen diana. ELECTROFORESIS EN GEL DESNATURALIZANTE EN GRADIENTE (DGGE): SEPARACIN DE GENES. .- Mtodo utilizado para el anlisis filogentico de las secuencias de genes amplificados. .- La DGGE es un mtodo de electroforesis en gel que separa los genes del mismo tamao que difieren en la secuencia de bases. .- Se utiliza un gradiente de una mezcla de urea y formamida que desnaturaliza el DNA. .- Las bandas obtenidas se pueden cortar y secuenciar , siendo posible determinar las especies presentes en la comunidad. MEDICIN DE LA ACTIVIDAD MICROBIANA EN LA NATURALEZA MEDIANTE LA UTILIZACIN DE: .- RADIOISOTOPOS. Estos son tiles cuando es preciso determinar la tasa de recambio de algn compuesto, o cuando hay que realizar un seguimiento por parte de una clula. .- MICROELECTRODOS. ( pH, O2 , N2O , CO2 , H2 o H2S). .- ISOTOPOS ESTABLES. Utilizado para el estudio de diversas transformaciones microbianas en la naturaleza. El carbono y el azufre son elementos de gran utilidad para el estudio de sus istopos estables. Carbono: 12C y 13C Azufre: 32S y 34S. HBITAT MICROBIANOS Ciclos Biogeoqumicos Del Carbono Del Nitrgeno del Azufre y del Hierro

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Es el resultado conjunto de los peocesos biolgicos y qumicos durante el reciclado de estos elementos escenciales de los sistemas vivos. A menudo implican reacciones de oxidacin - reduccin a medida que el elmento se desplaza atravs del ecosistema Ex: H2S oxida S So4-2 reducido Sulfato Ambientes y Microambientes Existen hbitat en ambientes de condiciones extremas Habitan superficies de organismos superiores, interior de plantas y animales. Las diferencias en el tipo y cantidad de los recursos y en las condiciones fisicoqumicas de un hbitat definen un nicho de cada organismo en particular(diversidad metablica y microbiana) Microambiente es donde vive un M.O. y lleva a cabo su metabolismo. Las condiciones fisicoqumicas pueden cambiar rpidamente en cuanto a tiempo y espacio. Microambientes heterogneos y las condiciones cambian muy de prisa lo que contribuye al aumento de diversidad microbiana. Niveles de nutrientes y velocidad de crecimiento Entran al Ecosistema de manera intermitente un gran aporte, seguido de una fuerte escasez. Desarrollo de sistemas bioqumicos de produccin de polmeros , almacenar material de reserva.(poli-B hidoxibutirato, polifosfato) La fase exponencial no se prolonga por mucho tiempo en la naturaleza.(en etapas o periodos) La disminucin de la velocidad de crecimiento refleja: 1. La disponibilidad de un nutriente suele ser baja. 2. La distribucin de los nutrientes en el hbitat no son uniformes. 3. Los m.o se enfrentan a la competencia.(cultivo no axnico)

Competencia y cooperacin microbiana La competencia depende de varios factores: 1. Tasa de incorporacin de nutrientes. 2. Tasas metablicas inherentes. 3. Y la velocidad de crecimiento. La sintrofia crucial para el xito competitivo de algunas bacterias anaerbicas. Tambin se aprecia cooperacin metablica en grupos de organismos que llevan a cabo metabolismos complementarios Crecimiento Microbiano en superficies y Biofilmes Las superficies absorben nutrientes. Los portaobjetos sirven de superficies experimentales , pueden ser tambin un nutriente , como las partculas de materia orgnica. Los Biofilmes son microcolonias asociadas a una superficie mediante polisacridos adhesivos.(P.aeruginosa) Los Biofilmes aparecen en las caries, clculos de rin, en la tuberculosis, implantes mdicos, etc. En las industrias, la calidad del agua se puede ver afectada. Hbitat Microbianos Terrestres y de Aguas Dulces Hbitat principales son los suelos y las masas de agua dulce.

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Suelo y agua varan en su estructura fsica, composicin de nutrientes, temperatura y potencial de agua. Al considerar el ambiente terrestre nuestra atencin se dirige hacia el suelo y las plantas, donde tienen lugar los procesos determinantes para el ecosistema Como lo es la formacin del suelo donde existen interacciones complejas entre el material original, la topografa del terreno, el clima y los seres vivos. Suelos inorgnicos y suelos orgnicos.

Formacin del suelo (I). El lecho se descompone en la roca madre que, a su vez, se divide en partculas menores (II). Los organismos de la zona contribuyen a la formacin del suelo desintegrndolo cuando viven en l y aadiendo materia orgnica tras su muerte. Al desarrollarse el suelo, se forman capas llamadas horizontes (III). El horizonte A, ms prximo a la superficie, suele ser ms rico en materia orgnica, mientras que el horizonte C contiene ms minerales y sigue parecindose a la roca madre. (IV). En esta etapa, el suelo puede contener un horizonte B, donde se almacenan los minerales lixiviados. El suelo como hbitat microbiano Crecimiento microbiano en la Rizosfera, con diferentes tipos de microorganismos. Para su exmen directo : 1. Microscopio de fluorescencia. 2. Tincin filognica. 3. Microscpio electrnico de barrido. Principales factores que influyen en la actividad microbiana. 1. Disponibilidad de agua 2. Estado nutricional del suelo Microbiologa de las superficies profundas Cientos de metros por debajo del suelo. Ex: a 300 m se han hallado: Anaerobios estrictos, como bacteria sulfato reductoras, metanognicas y homoacetgenos. Diversos aerobios y anaerobios facultativos. La actividad metablica, pueden causar la mineralizacin de compuestos orgnicos y liberar productos a las aguas subterrneas. Biorremedio in situ de las sustancias txicas que alcanzan las aguas subterrneas por lixiviacin tiene gran inters en la actualidad.

Ambientes de agua Dulce Lagos, ros y manantiales Los organismos fototrficos ( productores primarios) son los predominantes . En zonas xicas; predominan Cianobacterias y algas En zonas anxicas dominan las bacterias fototrficas anoxignicas. Las algas que flotan o se mantienen en suspensin se denominan Fitoplancton. Las algas que se adhieren al fondo o a los lados se denominan algas bnticas. Cuando la actividad fotosinttica es muy elevada: La materia orgnica lleva al agotamiento de o2 (anxicas). Se desencadena la Fermentacin y la Respiracin anaerbica.

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Relaciones con el Oxgeno en Lagos y Ros La produccin fotosinttica de oxgeno se lleva acabo donde la luz est disponible. Cuando se ha consumido el oxgeno disuelto , las capas ms profundas se vuelven anxicas, donde se produce cambio de metabolismo respiratorio. Esto depende de varios factores : Si la materia orgnica es escasa. La velocidad de intercambio de agua entre las capas de la profundad y la superficie. Demanda biolgica de oxgeno Es una medida indirecta de la cantidad de materia orgnica que puede ser oxidada por los microorganismos Microbiologa Marina Presencia de procariotas en el mar abierto Microbiologa de las profundidades marinas Ecosistemas microbianos que sostiene vida animal en las proximidades de las fuentes hidrotermales. Ambientes marinos y distribucin de microorganismos Los niveles nutritivos en el mar abierto resultan limitantes La fotosntesis y produccin de oxgeno, escenciales en el equilibrio ecolgico del carbono. La produccin primaria en el mar abierto se debe a la actividad fotosinttica de proclorfitos. Prochlorococcus.destacado productor primario. Zona proxima a la orilla es ms frtil. Si la contaminacin es alta las aguas se pueden volver anxicas. Microbiologa del mar abierto A pesar de los bajos niveles de nutrientes inorgnicos y de carbono orgnico se han encontrado N significativo en susupenciones entre 103 y 106 clulas procariotas/mililitro. Existen celulas eucariotas muy pequeas. Contienen un metabolismo energtico basado en luz Y otros llevan a cabo fotosntesis anoxignica Muchas bacterias en la zona ftrica del mar contiene una forma de pigmento vasual capaz de usarlo para convertir la energa luminosa en ATP. Proteorrodopsina

Distribucin de Archaea / Bacteria Los oceanos contiene la mayor cantidad de Biomasa microbiana existente en toda la superficie de la tierra Efectos moleculares de altas presiones Afecta la biologa y la bioqumica de la clula. Su aumento, disminuye la capacidad de fijacin de las enzimas al sustrato. Si es elevada tiene mayor proporcin de cidos grasos insaturados en la membrana plasmtica En barfilos gram (-) el crecimiento a alta presin 500-600 atm. tiene cambios en la composicin de las proteinas de la membrana externa de la pared celular. Puede afectar la expresin gentica en las bacterias barfilas. Fuentes Hidrotermales submarinas Existen 2 tipos principales:

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1. Fuentes templadas: Expulsan fluidos hidrotermales de 6 23 C (H2O Mar 2C) Su velocidad de salida es de 0,5- 2 cm/s 2- Fuentes calientes: Desprenden el fluido a 270- 380 C (Chimeneas negras) Su velocidad de salida es de 1-2 m/s. El agua es muy rica en minerales, formando una nube oscura. Animales que viven en las fuentes hidrotermales submarinas . Gusanos tubcolas Tiene un penacho por el que recoge los nutrientes de la fuente hidrotermal. ms de 2 mts longuitud. Carecen de ano e intestino, poseen un tubo digestivo modificaoformado por un tejido esponjoso llamado Trofosoma. Muestra actividad de la enzima RubisCO y otras del ciclo de Calvin. Mejillones y almjas gigantes de 20 y 25 cm respectivamente En las branquias de estos animales existen comunidades de bacterias oxidadoras de sulfuros Dependen de la actividad de los quimiolittrofos que crecen a expensas de las fuentes de energa inorgnicas. Alimentandose de la excresin de los simbiontes y sus celulas muertas. Microorganismos de las fuentes hidrotermales submarinas Quimiolitotrofos oxidadores de azufre como:Thiobacillus, Thiomicrospira, Thiotrix Y Beggiatoa.(fijacin de CO2 H2S S2O32-) Bacterias nitrificantes Oxidadoras de hierro, hidrgeno y magnecio, metilotrofas. (se nutren de CH4 y CO) SimbiosisDeterminados quiniolitotrofos viven en asociacin direscta con animales de fuentes hidrotermales.

Fuentes Hidrotermales submarinas Zona donde el magma caliente y el basalto hacen que el fondo se vaya separando lentamente. Surgen en las grandes profundidades Comunidades muy activas de animales cuya subsistencia est asegurada por la actividad de m.o agrupados alrrededor de funetes hidrotermales,distribuidas por todos los fondos marinos El agua marina que se filtra por las grietas, se mezcla con minerales calientes y vuelve a salir a gran presin. Habitt Microbianos: II Parte Ciclos: Carbono, Oxgeno, Nitrgeno, Azufre y Fierro. Biorremedio Microbiana. Interacciones Microbianas con las plantas. Ciclo del Carbono y del Oxgeno

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.- Devido al aumento de las emisiones de CO2 a causa de las actividades humanas el estudio de este ciclo es de renovado inters por los cientifcos, quienes tratan de entender la magnitud de los cambios que como el calentamiento global es una catstrofe plametaria. Ciclo del Carbono .- Circula por la atmsfera, medio terrestre, ambientes acuticos, presente en la biomasa, sedimentos y rocas. .- Estan relacionado con el oxgeno por los procesos de fotosntesis y respiracin: la fijacin de CO2 por los fottrofos oxignicos libera O2 ( philum 3) y mucha materia orgnica es oxidada a CO2 por la respiracin aerbica. .- El humus, que es la materia orgnica muerta, tiene mayor cantidad de carbono que los seres vivos. .- El aporte de CO2 ms importante proviene de la degradacin de materia orgnica muerta llavada a cabo por los microorganismos. .- En hbitat anxicos el CO2 es reducido por los metangenos. Sintrofia y Metanognesis .- Los microorganismos cooperan en la degradacin de algunos compuestos. .- Microorganismos del dominio Archaea compuestos por anaerobios estrictos utilizan CO2 como aceptor final de electrones y el donador es por lo general H 2 produciendo metano. .- Hbitat anxicos como pantanos, rumen e interior de partculas de suelo. Ciclo de Nitrgeno. .- Reservorio ms importante la atmsfera. .- La desnitrificacin es el proceso en el cual el nitrato es transformado a nitrgeno gaseoso. .- La nitrificacin es la oxidacin de amonaco a nitrato. Ciclo de Azufre .- El sulfuro de hidrgeno es un gas que se forma principalmente por la reduccin bacteriana de sulfato (hbitat anxico). .- La reduccin de azufre a sulfuro es una forma de respiracin anaerbica. .- La oxidacin de azufre la produce Thiobacillus. Ciclo del Hierro .- Es un elemento abundante en la corteza terrestre. .- La reduccin frrica del hierro ocurre en sedimentos anxicos de lagos. .- El hierro ferroso, es oxidado por las bacterias del hierro, en medios no cidos ( Gallionella; Leptothrix). .- T. ferrooxidans oxida de ferroso a ferrico en condiciones cidas. Biorremedio Microbiana .- El lixiviado microbiano es necesario cuando las concentraciones de los metales a extraer es baja ya que las bacterias acidfilas otorgan cidez y solubilidad al metal desempeando una funcin beneficiosa en la minera (T. Ferrooxidans). .- Algunas bacterias llevan a cabo la biotransformacin del mercurio de formas toxcas a no txicas. .- Los microorganismos actan oxidando el petrleo a CO 2. .- Tanto bacterias como hongos, con capacidad metabolica, pueden oxidar compuestos Xenobiticos. Interacciones microbianas con plantas.

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.- Ocurre en la rizosfera regin del suelo inmediata a la raz. .- Liquenes: simbiosis entre alga y hongo. .- Micorriza: simbiosis entre planta y hongo. .- Agrobacterium forma crecimientos tumorales en muchas plantas. .- Formacin de ndulos radicales por bacterias fijadoras de nitrgeno ( Rhizobium).

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