A maioria das enzimas so de natureza proteica e, relativamente aos outros catalisadores, tm uma grande especificidade em relao aos substratos

e produtos da reaco.
1- A palavra enzima (do Grego: en, na + zima, levedura) foi inventada em 1878 por Fredrich Khne. 2- A sua natureza proteica s foi definitivamente aceite na dcada de 1930. 3- Relativamente aos catalisadores no enzmicos as enzimas so, em geral: a) mais potentes, b) actuam em condies pouco agressivas (pH 7, temp. < 100C, etc.), c) tm uma enorme especificidade relativamente aos substratos e produtos, e d) a sua actividade pode ser, frequentemente, regulada por substncias diferentes dos substratos e dos produtos (as enzimas podem ser sensores do meio ambiente em que esto inseridas...). 4- Sendo as enzimas molculas proteicas o seu tamanho , geralmente, muito grande relativamente ao tamanho das molculas dos substratos.

A Comisso de Enzimas da Unio Internacional de Bioqumica definiu critrios para a classificao e denominao das enzimas; os critrios so de tipo funcional: duas enzimas com estruturas diferentes que catalisam a mesma reaco (isozimas ou isoenzimas) tm o mesmo nome.
1- A cada enzima foi atribudo um nmero EC (de Enzyme Comission) que contm 4 nmeros separados por pontos (EC W.X.Y.Z). Os nmeros W, X e Y referem-se, respectivamente, classe, sub-classe e sub-sub-classe e o nmero Z especfico de cada enzima. 2- No dia 31-10-2006 estavam classificadas 3985 enzimas que podem ser consultadas em http://www.expasy.ch/enzyme/ 3- Em geral uma mesma enzima tem vrios nomes e a nomenclatura no isenta de ambiguidade; a atribuio de um nmero EC s enzimas uma tentativa de resolver essa ambiguidade. Foram definidas 6 classes: Classe 1: oxi-redtases, Classe 2: transfrases, Classe 3: hidrlases Classe 4: lases, Classe 5: isomrases, Classe 6: lgases ou sinttases 4- A classificao de tipo funcional: diferentes protenas com a mesma actividade cataltica

O stio activo (ou stio cataltico) um local especfico modelado de tal forma que permite a interaco especfica com o substrato (ou substratos) e onde ocorre a reaco qumica.
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(como as isoenzimas) tm o mesmo nome e nmero EC.

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As isomrases (EC 5.x.y.z) catalisam a interconverso de dois ismeros: AB

Nas reaces catalisadas pelas hidrlases (EC 3.x.y.z) um dos reagentes a gua e o substrato rompe-se nas suas partes constituintes: AB + H2O A + B
Em geral, quando frente do nome de um composto se coloca o sufixo ase a enzima em questo uma hidrlase.

Em rigor, as isomrases so as nicas enzimas em que se pode falar do substrato da enzima no singular.
As hidrlases catalisam a rotura de ligaes sendo a gua um dos substratos.

Exemplo: isomrase das hexoses-fosfato fosfoglico-mtase fosfoglicerato-mtase epimrase das pentose-fosfato

(Glicose-6-P Frutose-6-P) (Glicose-1-P Glicose-6-P) (3-fosfoglicerato 2-fosfoglicerato) (Ribulose-5-P Xilulose-5-P)

Exemplos de ligaes que podem sofrer rotura hidroltica: 1- ster (produtos = lcool + cido) ou tioster (produtos = tiol + cido) 2- lactona (produtos = lcool + cido; notar que neste caso, porque a lactona um ster interno: A + H2O B)

Em geral, nas reaces catalisadas pelas isomrases as Keq tm valores no muito diferentes de 1 ( G no muito diferente de 0) e so fisiologicamente reversveis. 27

3- anidrido (produtos = cido + cido) 4- amida (produtos = cido + amina) 5- osdicas (produtos = semi-acetal + lcool ou semi-acetal + semi-acetal ou semi-acetal + cido ou o semi-acetal + amina)
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As reaces catalisadas pelas enzimas podem, frequentemente, ser conceptualmente consideradas como o acoplamento de dois processos:

um exergnico (G<0) e outro endergnico (G>0) ... mas o somatrio exergnico

As fosftases so hidrlases em que um dos produtos o fosfato inorgnico (Pi). As reaces catalisadas pelas fosftases chamam-se desfosforilaes.
Alguns exemplos de fosftases: ATPase (ATP + H2O ADP + Pi) pirofosftase inorgnica (PPi + H2O 2 Pi) fosftase alcalina, uma enzima que se pensa estar envolvida na desfosforilao de protenas (protena-fosfato + H2O protena + Pi)

endergnico (G>0)

(G<0)

exergnico

NOTA: Embora, teoricamente, as hidrlases catalisem as reaces directa e inversa, nas reaces de hidrlise a Keq to elevada no sentido da hidrlise que, em geral, no faz sentido falar da reaco inversa.

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As lgases (ou sinttases) (EC 6.x.y.z) catalisam reaces que podem ser lidas como sendo o somatrio de duas reaces: uma de hidrlise do ATP e outra de combinao de duas substncias.

As reaces nunca evoluem no sentido em que so endergnicas mas os processos anablicos so endergnicos...

H2 O G = + 35 KJ glutamato ATP H2 O glutamina sinttase da glutamina ATP

endergnico (G= +35 KJ) exergnico

ATP + A + B ADP + Pi + AB ou ATP + A + B AMP + PPi + AB

Nas reaces catalisadas pelas lgases a energia libertada no processo de hidrlise do ATP permite a combinao de dois reagentes A e B. Ou, considerando o sentido inverso, que a energia libertada na ciso de AB permite a sntese de ATP.

NH4+

glutamina ADP + Pi G = -50 KJ

Sinttase do AB NH4+ glutamato

Quando a rotura do ATP ocorre entre os resduos fosfato e forma-se ADP e Pi mas quando ocorre entre os resduos fosfato e forma-se AMP e PPi.

G soma = -15 KJ
ADP + Pi (G=-50KJ)

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As enzimas so as mquinas que acoplando processos endergnicos com exergnicos possibilitam a ocorrncia dos processos endergnicos. 32 A sinttase da glutamina um exemplo.

Nalgumas lgases o nucleosdeo trifosfato envolvido na reaco no ATP mas o GTP.

Nas reaces catalisadas pelas transfrases (EC 2.x.y.z) um substrato dador cede um grupo qumico ou um resduo a um outro substrato (o substrato aceitador) que o aceita: XT + Y X + YT

No ciclo de Krebs a reaco catalisada pela sinttase de succinil-CoA (uma das isoenzimas) evolui no sentido da rotura do succinil-CoA e sntese de GTP: GDP + Pi + succinil-CoA succinato + CoA + GTP Podemos considerar, conceptualmente, que a sinttase de succinil-CoA faz a acoplagem de duas reaces: G1<0 Succinil-CoA + H2O Succinato + CoA (reaco exergnica) GDP + Pi GTP + H2O (reaco endergnica) G2>0 33 GDP + Pi + Succinil-CoA GTP + Succinato + CoA G(1,2)=G1+G2

Uma transfrase catalisa uma reaco em que um resduo T transferido de XT para Y (ou, tendo em conta a reaco inversa, de YT para X).

So exemplos de transfrases:
1- cnases 2- fosforlases 3- pirofosforlases 4- tilases (ATP + Aceitador ADP + Aceitador-P) (Dador-T + Pi Dador + T-P) (Dador-T + PPi Dador + T-PP) (Dador-T + CoASH Dador + T-CoA)

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As cnases so fosfotransfrases que catalisam reaces do tipo: ATP + Y ADP + Y-P. As reaces catalisadas pelas cnases chamam-se fosforilaes. Nas reaces catalisadas por cnases o resduo transferido um fosfato e, em geral, o dador de fosfato o ATP (ou o GTP) que cede o fosfato (o terceiro) a um aceitador. Os produtos so o ADP (ou o GDP) e o aceitador fosforilado (Aceitador-P). Numa reaco enzmica do tipo: ATP + Y ADP + Y-P a enzima denominar-se-ia cnase do Y sendo Y o substrato que aceita o fosfato do ATP.
Exemplos de cnases: cnases de protenas

Numa reaco enzmica do tipo: ATP + Y ADP + Y-P a enzima denominar-se-ia cnase do Y e a regra mantm-se mesmo quando o aceitador outra enzima. Exemplo: a cnase da desidrognase do piruvato catalisa a fosforilao da desidrognase do piruvato pelo ATP

Em geral, quando existe uma cnase que catalisa a fosforilao de um substrato A existe tambm uma fosftase (hidrlase) que catalisa a desfosforilao do substrato A fosforilado

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A denominao das cnases no tem em linha de conta o sentido em que a reaco ocorre nos seres vivos mesmo quando (por razes de ndole termodinmica) apenas a reaco em que ocorre formao de ATP pode ser observada ADP + Y-P Y + ATP a cnase continua a chamar-se cnase de Y.

Alguns frmacos e hormonas exercem os seus efeitos ligando-se a receptores celulares que tm actividade cataltica intrnseca e que so, portanto, enzimas. Alguns receptores celulares so enzimas.

O receptor da insulina uma cnase que, quando a insulina est ligada, catalisa a fosforilao de uma protena citoplasmtica chamada substrato do receptor da insulina.

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o fosfato inorgnico (Pi): XT + Pi X + T-P. As reaces catalisadas pelas fosforlases denominam-se fosforlises. Numa reaco do tipo XT + Pi X + T-P a enzima denominar-se-ia fosforlase do XT (T o resduo transferido) ...e XT sofre uma fosforlise: XT rompe-se (lise) por aco do fosfato inorgnico (Pi).

As fosforlases so transfrases em que o substrato aceitador

As pirofosforlases so enzimas em que o substrato aceitador do resduo transferido o pirofosfato inorgnico (PPi): XT + PPi X + T-P-P. As reaces catalisadas pelas fosforlases denominam-se pirofosforlises.
Numa reaco do tipo XT + PPi X + T-P-P a enzima denominar-se-ia pirofosforlase do XT ...e XT sofre pirofosforlise: rompe-se (lise) por aco do pirofosfato inorgnico (PPi).

Exemplo de fosforlase: A fosforlase do glicognio catalisa a fosforlise do glicognio Glicose-glicose-glicose...+ Pi glicose-glicose...+ Glicose-1-P
Exemplo de pirofosforlase: Pirofosforlase do UDP-Glicose

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interessante notar as semelhanas entre as denominaes das enzimas e as reaces catalisadas pelas fosforlases, pirofosfosforlases e hidrlases. 40 do No limite as hidrlases poderiam ser consideradas transfrases em que o substrato aceitador resduo transferido a gua; rompe-se uma ligao mas formam-se outras com a gua.

As reaces catalisadas pelas transfrases tambm podem ser conceptualmente consideradas como o acoplamento de dois processos: um exergnico e outro endergnico.

glicose + ATP
glicose + Pi ATP + H2O

glicose-6-P + ADP
glicose-6-P + H2O ADP + Pi cnase da glicose

G = -32 KJ
G = + 18 KJ G = -50 KJ

Nas reaces catalisadas pelas lases (EC 4.x.y.z) um dos reagentes que contm uma dupla ligao combina-se com um segundo reagente de tal maneira que o produto j no contm a dupla ligao: A=B + C ABC

glicose-6-P
endergnico (G= +18 KJ) exergnico

ATP

Ou, pensando na reaco inversa: so lases as enzimas que catalisam reaces em que um composto se rompe dando origem a dois produtos sendo que um destes produtos contm uma dupla ligao que no existia no composto que lhe deu origem: ABC A=B + C

glicose

ADP (G=-50KJ)

A cnase da glicose uma mquina qumica que acopla um processo endergnico (a 41 formao de glicose-6-P) com outro exergnico (a hidrlise do ATP).

Frequentemente o composto C a gua mas aqui, ao contrrio do caso das hidrlases, a reaco de C com A=B no resulta na lise de A=B.
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As oxi-redtases (EC 1.x.y.z) catalisam reaces de oxireduo

A palavra sntase (no confundir com sinttase) est popularmente associado a algumas enzimas e as sntases podem pertencer a diferentes classes.

Algumas vezes o nome que foi originalmente atribudo a uma enzima (sntase do composto X), embora fora da nomenclatura sistemtica, manteve-se o mais popular ao longo dos anos.

Exemplos de nomes associados a oxi-redtases: Desidrognases Redtases Oxdases Oxignases Peroxdases Catlase Dismtases

1- A sntase do glicognio de facto uma transfrase. 2- Outras sntases foram classificadas na classe das lases. Exemplos:

dinucleotdeos so substratos O2 o oxidante directo o H2O2 reduzido a gua... catalisam reaces de dismutao 43
Sntase do citrato
(acetil-CoA + oxalacetato + H2O

citrato + CoA)

Sntase da hidroxi-metil-glutaril-CoA
(acetil-CoA + acetoacetil-CoA + H2O hidroxi-metil-glutaril-CoA + coenzima A) 44

 rotura hidroltica das ligaes fosfoanidrido do ATP (entre os fosfatos - e -) esto associados valores de G muito negativos; por isso se diz na gria dos bioqumicos que estas ligaes so ricas em energia.
1- Dizemos que a glicose e o etanol so substncias energticas porque no seu processo de oxidao libertam enormes quantidades de energia: Glicose + 6 O2 6 CO2 + 6 H2O Etanol + 2 O2 2 CO2 + 2 H2O G = - 2840 KJ/mol G = - 168 KJ/mol

As ligaes em que o G que corresponde sua rotura hidroltica (em condies padro) tem um valor semelhante ou ainda mais negativo que o que corresponde rotura das ligaes fosfoanidrido do ATP (- 31 KJ mol-1 ou -46 KJ mol-1) dizem-se ricas em energia e costumam representar-se por

~.

G= - 43KJ

As ligaes ricas em energia podem, por exemplo, ser de tipo a) fosfoanidrido como no ATP b) fosfamida como na fosfocreatina c) enolfosfato

(nota: estes G no se referem aos seres vivos; G refere-se sempre a condies padro) 2- Quando dizemos que o ATP uma substncia energtica no estamos a falar da reaco de oxidao do ATP mas da sua fosfohidrlise. ATP + H2O ADP + Pi ATP + H2O AMP + PPi G = - 31 KJ/mol G = - 46 KJ/mol

como no fosfoenolpiruvato.
G= -62KJ

G= -31KJ G= -46KJ Quando dizemos que a fosfocreatina ou o fosfoenolpiruvato so substncias energticas tambm estamos simplesmente a dizer que a sua fosfohidrlise tem um valor de G muito negativo.
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Fosfocreatina + H2O Creatina + Pi Fosfoenolpiruvato + H2O Piruvato + Pi

G = - 43 KJ/mol 46 G = - 62 KJ/mol

As substncias que contm ligaes ricas em energia participam no metabolismo em reaces de fosfotransferncia catalisadas por cnases.

G- 49KJ

As reaces enzmicas que in vivo geram PPi tm um G (real) muito negativo porque o produto PPi rapidamente hidrolisado pela aco cataltica de pirofosftases que mantm a sua concentrao muito baixa.

No 1,3-bisfosfoglicerato h uma ligao fosfoanidrido...

Como resultado da aco cataltica das pirofosftases celulares a concentrao de PPi na clula muito baixa; no existe um dos substratos para que a reaco inversa possa ocorrer

A cnase do 3-fosfoglicerato catalisa uma reaco de fosfotransferncia que 47 de fisiolgicamente reversvel: sntese de ATP na gliclise (G=-18KJ) e consumo ATP na gliconeognese (G= +18KJ) .

As reaces em que um dos produtos o PPi so reaces exergnicas em todas as condies metablicas

reaces fisiologicamente irreversveis.

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