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AA NO ESENCIALES
ALANINA ASPARAGINA ASPARTATO CISTENA GLUTAMATO GLUTAMINA GLICINA PROLINA SERINA TIROSINA
AA ESENCIALES
ARGININA HISTIDINA ISOLEUCINA LEUCINA LISINA METIONINA FENILALANINA TREONINA TRIPTOFANO VALINA
AA NO ESTNDAR
Son derivados de los aa estndar 4-Hidroxiprolina (pared celular de plantas, colgeno) 5-Hidroxilisina (colgeno) N-metil-lisina (miosina) -carboxiglutamato: (protrombina y protenas que fijan Ca2+) Selenocistena (glutation peroxidasa) Ornitina: intermediario en la biosntesis de arginina Citrulina: Intermediario en el ciclo de la urea
Participan en el mantenimiento del equilibrio osmtico entre los diferentes compartimentos del organismo. Las protenas, por ser grandes molculas coloidales, no son difusibles, esto es, no pueden atravesar las membranas y ejercen una presin osmtica coloidal, la cual sirve para mantener un volumen normal de sangre y un contenido normal de agua en el lquido intersticial y los tejidos.
CLASIFICACIN DE PROTENAS
SIMPLES: SLO AA CONJUGADAS: AA + GRUPO PROSTTICO
LIPOPROTENAS GLUCOPROTENAS METALOPROTENAS
PUENTES DE HIDRGENO
PUENTES DE HIDRGENO
CORTAR PROTENAS
UNIN PEPTDICA
SE DA ENTRE COOH Y NH3+ MANIFIESTA RESONANCIA PLANAR RGIDO POSEE UN NGULOS DE ENLACE CARACTERSTICOS ( Y )
RAMACHANDRAN
REPRESENTACIN GRFICA MUESTRA LAS CONFORMACIONES TERICAMENTE PERMITIDAS PARA PPTIDOS LAS CONFORMACIONES ESTN EN FUNCIN DE Y DE
RAMACHANDRAN
SOMBREADO OBSCURO: CONFORMACIONES ACCESIBLES PARA TODOS LOS AA SOMBREADO MEDIO: CONFORMACIONES ACCESIBLES PARA TODOS LOS AA, EXCEPTO PARA LA VALINA Y LA ISOLEUCINA SOMBREADO CLARO: CONFORMACIONES INESTABLES PERO PUEDEN DARSE EN ALGUNAS PROTENAS
ESTRUCTURA 3
LA SECUENCIA DE AA DETERMINA LA ESTRUCTURA 1
POLIPPTIDOS IMPORTANTES
INSULINA (REGULACIN) OXITOCINA (REGULACIN) HEMOGLOBINA (TRANSPORTE) ALBMINA (TRANSPORTE)
POLIPPTIDOS IMPORTANTES
La insulina, es una hormona polipeptdica formada por 51 aminocidos, producida y secretada por las clulas beta de los islotes de Langerhans del pncreas.
POLIPPTIDOS IMPORTANTES
La oxitocina, es un pptido de nueve aminocidos (un nonapptido), es una hormona relacionada con los patrones sexuales y con la conducta maternal y paternal que acta tambin como neurotransmisor en el cerebro.
POLIPPTIDOS IMPORTANTES
La hemoglobina es una heteroprotena de la sangre, la forman cuatro cadenas polipeptdicas (globinas) a cada una de las cuales se une un grupo hemo, cuyo tomo de hierro es capaz de unir de forma reversible una molcula de oxgeno.
POLIPPTIDOS IMPORTANTES
La albmina es una protena que se encuentra en gran proporcin en el plasma sanguneo, siendo la principal protena de la sangre y una de las ms abundantes en el ser humano. Su secuencia se forma por tres dominios que a su vez se forman por 2 subdominios.
PROTENA NATIVA
PROTENA DESNATURALIZADA
PROTENA NATIVA
Anclajes del citoesqueleto: son protenas perifricas que se encuentran en la parte del citosol de la membrana y que sirven para fijar los filamentos del citoesqueleto.
Marcadores de la identidad de la clula: son glicoprotenas y glicolpidos caractersticas de cada individuo y que permiten identificar las clulas provenientes de otro organismo. Por ejemplo, las clulas sanguneas tienen unos marcadores ABO que hacen que en una transfusin slo sean compatibles sangres del mismo tipo. Al estar hacia el exterior las cadenas de carbohidratos de glicoprotenas y glicolpidos forma una especie de cubierta denominada glicocalix
ENZIMAS 070912
ENZIMAS
Las enzimas son protenas especializadas de actividad cataltica.
ENZIMAS
Algunas de ellas estn formadas nicamente de aminocidos mientras que otras presentan algn otro componente de naturaleza no aminocida.
La parte proteica se denomina apoenzima, mientras que la parte no proteica se denomina coenzima; cuando se encuentran aisladas, ambas son no funcionales, pero juntas forman una protena funcional denominada holoenzima.
ENZIMAS
Las coenzimas funcionan a menudo en la transferencia de electrones o de grupos funcionales. Generalmente son derivados de vitaminas, las cuales no pueden ser sintetizadas en las clulas de los organismos superiores, por lo que deben ser adquiridas en la dieta.
ENZIMAS
Coenzimas
Coenzyme A (CoA)
ENZIMAS
Las enzimas presentan algunas caractersticas que las diferencian de los catalizadores qumicos, como:
Mayor velocidad de reaccin, ya que las reacciones catalizadas enzimticamente alcanzan velocidades de reaccin de 106 a 1012 veces mayores que las reacciones no catalizadas y de varios rdenes de magnitud mayor que las catalizadas qumicamente.
ENZIMAS
ENZIMAS
Condiciones de reaccin ms suaves, ya que trabajan a temperaturas relativamente bajas, a presin atmosfrica y en condiciones de pH neutro.
Mayor especificidad de reaccin, ya que presentan una gran selectividad por la identidad de los grupos qumicos de sus sustratos y productos, de tal manera que rara vez se obtienen productos colaterales o secundarios.
ENZIMAS
Capacidad de regulacin, es decir, que sus actividades varan de acuerdo con la concentracin de otras molculas diferentes de sus sustratos. Los mecanismos de regulacin incluyen la inhibicin, control alostrico, modificacin covalente de la enzima y variacin en la cantidad de enzima sintetizada.
ENZIMAS
Las enzimas aceleran las reacciones biolgicas al disminuir la energa de activacin de una reaccin dada sin alterar su equilibrio.
ENZIMAS
UNIDAD 6 Enzimas
Inicio
E+S
La Ea de la hidrlisis de la urea baja de 30 a 11 kcal/mol con la accin de las enzimas, acelerando la reaccin 1014 x El aumento de temperatura necesario para producir la reaccin no catalizada seria de 529C
E+P
Tiempo de la reaccin
Su mecanismo de accin consiste en la formacin de un complejo entre la enzima y el sustrato (ES), el cual realiza la reaccin qumica adecuada y permite la recuperacin de la enzima original en el momento en que el complejo enzima-producto se rompe para liberar al producto.
ENZIMAS
UNIDAD 6 Enzimas
Inicio
ENZIMAS
El sustrato se une a la enzima en el sitio activo, el cual consiste en un arreglo espacial de algunos aminocidos de la protena donde se encuentran generalmente el grupo prosttico o la coenzima y que tienen la capacidad de interactuar con el sustrato.
E + S ESEP E + P
E E E E
Enzima - Catalizador
Tanto la enzima como el catalizador aceleran la velocidad de una reaccin qumica. Una enzima puede transformar 1000 molculas de sustrato/ segundo Las enzimas tienen 3 propiedades que los catalizadores NO tienen
Especificidad por el sustrato Se inactivan por desnaturacin Pueden ser reguladas
Las enzimas cumplen su papel cataltico gracias a: Fijacin estereoqumicamente complementaria del substrato Transformacin cataltica del mismo En ambas funciones participan:
Cadenas laterales de los aminocidos Grupos o molculas no proteicas: Grupos prostticos Iones metlicos Cofactores
Los siguientes hechos: Especificidad de la reaccin enzimtica Carcter heterogneo de la catlisis enzimtica
Nos llevan a postular la existencia de un Centro Activo en la molcula de enzima, capaz de: Fijar especficamente al substrato Transformarlo catalticamente.
Enzima
Sustrato
Sitio activo
Modelo aceptado durante mucho tiempo; hoy se considera insuficiente al no explicar algunos fenmenos de la inhibicin enzimtica
Tanto la enzima como el substrato sufren una alteracin en su estructura por el hecho fsico de la unin. Est mucho ms de acuerdo con todos los datos experimentales conocidos hasta el momento.
La teora del Ajuste Inducido se ampla en la actualidad definiendo la accin enzimtica como Segn lo cual, el Centro Activo enzimtico es en realidad complementario no al substrato o al producto, sino al estado de transicin entre ambos.
Clasificacin y nomenclatura
Nombre sistemtico: Grupo transferido
EC 2.7.1.1
Grupo
Clasificacin y nomenclatura
Clasificacin de enzimas por Grupos
EC 1.x Oxidorreductasas EC 2.x Transferasas EC 3.x Hidrolasas EC 4.x Liasas EC 5.x Isomerasas EC 6.x Ligasas
Clasificacin y nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas
Catalizan reacciones de oxidorreduccin, en que tomos de oxigeno hidrogeno son trasladados entre molculas:
Ared + Box
Aox + Bred
AH2 + B
A + BH2
En las reacciones redox, siempre tienen que estar presentes a la vez el aceptor y el dador electrnico.
Clasificacin y nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas
Nombre: Dador:Aceptor oxidorreductasa b-D-Glucosa : O2 1-oxidorreductasa
Dador Aceptor Nombre comn: Glucosa oxidasa
EC 1.1.3.4
Clasificacin y nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas
Nomenclatura del subgrupo en oxidorreductasas:
EC 1.1.x EC 1.2.x EC 1.3.x EC 1.4.x EC 1.5.x EC 1.6.x etc. Deshidrogenasas Oxidasas Peroxidasas Oxigenasas Hidroxilasas Reductasas
Aplicaciones: Ensayos de diagnostico clnico (glucosa oxidasa y colesterol oxidasa Deslignificacin Bioblanqueamiento
Clasificacin y nomenclatura
Grupo 2: Transferasas
Catalizan reacciones de transferencia de tomos grupo de tomos entre molculas:
A-X + B
A + B-X
EC 2.7.1.1
Clasificacin y nomenclatura
Grupo 2: Transferasas
Clasificacin de subgrupo de las transferasas:
EC 2.1.x EC 2.2.x EC 2.3.x EC 2.4.x EC 2.5.x EC 2.6.x EC 2.7.x EC 2.8.x EC 2.9.x Grupos monocarbonados Grupos aldehido o ceto Aciltransferasas Glicosiltransferasas Alquil- o Ariltransferasas Grupos nitrogenados Grupos fosfato Grupos sulfato Grupos selenio
Clasificacin y nomenclatura
Grupo 3: Hidrolasas
Catalizan reacciones de hidrlisis y tambin su reverso. Son las ms comunes en el dominio de la tecnologa enzimtica:
A-B + H2O
A-OH + H-B
No se suelen utilizar nombres sistemticos en las hidrolasas. Muchas de ellas conservan el nombre Primitivo. Ejemplo: Quimosina EC 3.4.23.4.
Clasificacin y nomenclatura
Grupo 3: Hidrolasas
Clasificacin de las hidrolasas:
3.1.-.3.2.-.3.3.-.3.4.-.3.5.-.etc. Esterasas (carboxilesterasas, fosfoesterasas, sulfoesterasas) Glicosidasas ter hidrolasas Pptido hidrolasas Acil anhdrido hidrolasas
Clasificacin y nomenclatura
Grupo 3: Hidrolasas
Caso particular Pptido hidrolasas: clasificacin comn (no sistemtica) I. Segn la situacin del enlace atacado: - Exopeptidasas (extremos de la cadena) (Peptidasas) - Endopeptidasas (interior de la cadena) (Proteinasas) II. Segn el mecanismo cataltico: - Serin proteinasas - Tiol proteinasas - Aspartil proteinasas - Metaloproteinasas
Clasificacin y nomenclatura
Grupo 4: Liasas
Catalizan reacciones reversibles de remocin de grupo de tomos del sustrato (este grupo no incluye las hidrolasas):
A-B
Ejemplo Nombre sistemtico: Histidina amonio-liasa (EC 4.3.1.3)
Nombre comn: Histidasa
A+B
Clasificacin y nomenclatura
Grupo 4: Liasas
Clasificacin de las liasas:
4.1.x - Actan sobre enlaces C-C 4.2.x - Actan sobre enlaces C-O 4.3.x - Actan sobre enlaces C-N 4.4.x - Actan sobre enlaces C-S 4.5.x - Actan sobre enlaces C-Haluro (S-, Cl-, Br-, I- At-) 4.6.x - Actan sobre enlaces P-O 4.99.x - Otras liases
Aplicaciones: Pectato liasa Remueve los compuestos indeseables (ceras, pectinas, protenas) en fibras en la industria textil bioscouring
Clasificacin y nomenclatura
Grupo 5: Isomerasas
Catalizan reacciones de isomerizacin moleculares
A
Ejemplo: Glucosa isomerasa (EC 5.3.1.5)
Clasificacin y nomenclatura
Grupo 5: Isomerasas
Clasificacin de las isomerasas:
5.1.x - Rasemasas y Epimerasas 5.2.x - cis-Trans-Isomerasas 5.3.x - Oxidoreductasas Intramolecular 5.4.x - Transferasas Intramoleculares (mutases) 5.5.x - Liasas Intramoleculares 5.99.x - Otras Isomerasas
Clasificacin y nomenclatura
Grupo 6: Ligasas
Catalizan la unin de dos grupos qumicos a expensas de la hidrlisis de un nucletido trifosfato (ATP, GTP, etc.).
A + B + ATP
A-B + ADP + Pi
Clasificacin y nomenclatura
Grupo 6: Ligasas
Clasificacin de las ligasas:
6.1.x 6.2.x 6.3.x 6.4.x 6.5.x 6.6.x - Forman enlaces C-O - Forman enlaces C-S - Forman enlaces C-N - Forman enlaces C-C - Forman enlaces steres fosfricos - Actan sobre enlaces N-metal
Cintica Enzimtica
Cintica Enzimtica
La cintica enzimtica es el anlisis cuantitativo del efecto de cada uno de los factores que intervienen en la actividad enzimtica, que se evala a travs de la velocidad de la reaccin catalizada. Las variables ms importantes son: Concentracin de enzima, sustratos y productos (incluyendo inhibidores y/o activadores) pH Temperatura basada en la medicin de la velocidad de reaccin. As en la reaccin:
Hay un nmero limitado de sitios en la enzima para fijar substrato; una vez que estn ocupados todos, por mucho que aumente la concentracin de substrato, la velocidad permanecer constante tendiendo a un valor asinttico
E+S
k+1
ES
k+2
E+P
k-1
. . .
. . . . .
[s]
E+S
k+1
k-1
ES
k+2
E+P
E+S
k+2
k+1 k-1
ES
ES
E+P
v=
Vmax * s
Km + s
Significado de la constante Km
1. Constante de equilibrio de disociacin del complejo ES (en condiciones de equilibrio rpido) 2. Medida inversa de la afinidad de la enzima por el substrato (en condiciones de equilibrio rpido) 3. Mide la funcin de fijacin (en cond.de equilibrio rpido) 4. Concentracin de substrato para la que la velocidad se hace igual a la mitad de la mxima (s0.5) 5. Se define para una pareja enzima-substrato
Vmax
Vmax/2
Km
Vmax
Vmax/2
Km
A mayor Km, menor es la afinidad de la enzima por el sustrato A menor Km mayor es la afinidad de la enzima por el sustrato
Representacin directa
v
100 80
Vmax
v Vmx s Km s
60
40
20
s
0 0 20 40 60 80 100
Km