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Estudo BIOQUIMICA ILUSTRADA Harvey UNIDADE I

Captulo 01 Aminocidos
VISO GERAL: As protenas so as molculas mais abundantes e com maior diversidade de funes nos sistemas vivos. Participam de praticamente todos os processos vitais do organismo e possuem diversas funes. Todavia, todas so estruturalmente: POLMEROS LINEARES DE AMINOCIDOS ESTRUTURA DOS AMINOCIDOS: Apesar de mais de 300 j terem suas estruturas descritas, para ns, apenas os 20 mais comumente encontrados nas protenas dos mamferos sero analisados. Cada aminocido apresenta um grupo carboxila, um grupo amino primrio e uma cadeia lateral que os distingue dos demais (o Grupo R) ligados ao carbono (quiral). Em pH fisiolgico (aproximadamente 7,4) o grupo carboxila estar dissociado, formando o on carboxilato (-COO), e o grupo amino estar protonado (-NH). Esses grupos, nas protenas, estaro quase sempre ocupados formando as ligaes peptdicas. Portanto, conclui-se, em uma anlise grosseira e superficial, que quem determina o papel do aminocido na protena a CADEIA LATERAL (R) ela permite a classificao em polares e apolares. A) Aminocidos com cadeias laterais apolares: so incapazes de receber ou doar prtons, de participar em ligaes inicas ou de hidrognio e caracterizam-se como oleosas HIDROFBICAS. a. Localizao: nas protenas encontradas em solues aquosas (ambiente polar), elas tendem a se agrupar no interior das protenas efeito hidrofbico. J em locais hidrofbicos, isso , lipdicos, os grupos R apolares preenchem a superfcie da protena, interagindo diretamente com esse ambiente. b. Prolina: possui em sua estrutura mais rgida, formado por um anel de 5 tomos. Apresenta, portanto, um grupo amina secundrio, denominado IMINOCIDO. Auxilia na formao da estrutura fibrosa do colgeno. B) Aminocidos com cadeias laterais polares, desprovidas de carga eltrica: em pH neutro, apresentam carga lquida igual a zero. a. Ligao dissulfeto: o radical do aminocido cistena apresenta um grupo sulfidrila (-SH), que um importante componente do stio

ativo de diversas enzimas. Duas sulfidrilas podem se oxidar para formar um dmero, a cistina, e essas se conectam atravs de uma ligao chamada ponte dissulfeto (-S-S-). Esse grupo pode estabilizar uma grande gama de protenas extracelulares. b. Cadeia laterais como stios de ligao para outros compostos: isso pode ocorrer com o grupo hidroxila da serina, treonina e tirosina que podem servir como stio de ligao para estruturas, como o grupo fosfato. Cadeia oligossacardeas podem usar os grupos amida da asparagina e hidroxila da serina e da treonina como stio de ligao nas glicoprotenas. C) Aminocidos com cadeias laterais cidas: o aspartato e o glutamato, so, respectivamente, os aminocidos cido asprtico e cido glutmico ionizados e, portanto, carregados negativamente (-COO). D) Aminocidos com cadeias laterais bsicas: essas cadeias, bsicas, so aceptoras de prtons. Em pH fisiolgico, os radicais da lisina e da arginina esto completamente ionizados, com carga positiva. J a histidina fracamente bsica e, normalmente, no apresenta carga eltrica nessa situao. Entretanto, quando incorporada a uma protena, sua cadeia lateral pode se apresentar positiva ou neutra, dependendo do ambiente inico proporcionado pelas cadeias polipeptdicas da protena. GLICINA
FENILANANINA

ALANINA TRIPTOFANO TIROSINA


C.GLUTMICO

VALINA METIONINA S ASPARAGINA HISTIDINA

LEUCINA PROLINA GLUTAMINA LISINA

ISOLEUCINA

SERINA CISTENA S ARGININA

TREONINA
C.ASPRTICO

APOLARES//APOLARES DESPROVIDOS DE CARGA//CIDAS//BSICAS


Desses aminocidos, apenas dois possuem ENXOFRE em suas estruturas, so eles a metionina e a cistena. Desses dois, apenas a CISTENA capaz de formar LIGAO DISSULFETO, uma vez que, nela, o enxofre est protonado e localizado no final da cadeia lateral.

E) Abreviaturas e smbolos. F) Propriedades pticas dos aminocidos: o carbono quiral, por definio, opticamente ativo (Exceo para a glicina, cujo quiral possui dois hidrognios sendo, assim, opticamente inativa). Todos esses aminocidos possuidores de um centro assimtrico, podem existir em duas formas, designadas D e L, que so imagens especulares uma da outra. Essas formas

so denominadas estereoismeros, ismeros pticos ou enantiomeros. Nas protenas, TODOS os aminocidos encontrados apresentam configurao L. PROPRIEDADES ACIDOBSICAS DOS AMINOCIDOS Tanto os aminocidos livre quanto alguns aminocidos combinados por meio de ligaes peptdicas podem atuar como tampes, em soluo aquosa. Vale lembrar que: CIDOS = Doadores de Prtons BASES = Aceptores de Prtons Eles so definidos como fracos quando ionizam em poro limitada. A concentrao de prtons em soluo aquosa expressa como pH, onde pH = log 1/*H+ ou -log*H+. A. Derivao da equao: a. Constante de dissociao do cido, K, K = *H+.*A+/*HA+; quanto maior o K, mais forte ser o cido, pois indica que a maior parte de H dissociou-se em H e A. b. Equao de Henderson-Hasselbalch: pH = pK + log *A+/*HA+ B. Tampes: uma soluo que resiste a mudanas de pH quando se adicionam pequenas quantidades de cido ou base. O tampo pode ser produzido pela mistura de um cido fraco (HA) com sua base conjugada (A). A capacidade tamponante mxima ocorre quando o pH for igual ao pK. Se as concentraes de HA e A forem iguais, tambm sero iguais os valores do pH e pK. O tampo efetivo at uma unidade de pH, acima ou abaixo, do seu valor de tamponamento mxima. pH < pK = predominncia da forma cida protonada pH > pK = predominncia da forma bsica no protonada C. Titulao de um aminocido a. Dissociao do grupo carboxila: um aminocido, como j vimos, pode perder prtons para o meio por influncia do pH da soluo. Isso pode originar o grupo carboxilato (-COO). Quando a carga lquida do aminocido for igual a zero, ele ter adquirido a sua estrutura isoeltrica ou zwitterion. b. Aplicao da equao de Henderson-Hasselbalch: A constante de dissociao de um grupo carboxila de um aminocido denominada K1, e no Ka, pois a molcula possui um segundo grupo titulvel. pH = pK1 + log [I]/[II] I a forma completamente protonada e II a isoeltrica Essa equao prev a capacidade tamponante, de +/-1 unidade de pH a partir do pKa.

c. Dissociao do grupo amino: a dissociao desse grupo, que um cido mais fraco que o grupo carboxila, apresenta uma constante de dissociao muito menor, K2. d. pKs da Alanina: Cada grupo titulvel apresenta um pKa numericamente igual ao pH no qual exatamente metade dos prtons foram removidos do dado grupo. i. pK1 = o pKa para o grupo mais cidico (-COO-) ii. pK2 = o pKa para o grupo mais cidico seguinte (-NH+) iii. pI = mdia entre pK1 e pK2. Corresponde ao pH em que predomina a forma II e em que h tambm a forma I e III, no caso da alanina.
A separao de protenas plasmticas por meio de cargas eltricas realizada tipicamente em pH acima do ponto isoeltrico (pI) das principais protenas, de modo que a carga dessas protenas negativa. Em um campo eltrico, as protenas movem-se no sentido do eletrodo positivo, a uma velocidade determinada por sua carga liquida. Variaes nos padres de mobilidade so indcios de certas doenas.

e. Carga lquida dos aminocidos em pH neutro: em pH fisiolgico todos os aminocidos apresentam um grupo carregado negativamente e um carregado positivamente, ambos ligados ao carbono quiral. Esse tipo de substancia, que pode atuar como cido ou bases, so classificadas como anfotricas e chamadas de anflitos. D. Outras aplicaes da equao de Henderson-Hasselbalch: Calcular como o pH de uma soluo ser afetado depois de uma mudana de concentrao dos ons que compem uma determinada soluo. Um aumento do on bicarbonato (HCO3-) faz com que o pH aumente. Obstruo pulmonar causa o aumento do dixido de carbono e causa a reduo do pH, resultando em acidose respiratria. No pH do estomago (1,5), um frmaco estar predominantemente protonado e, portanto, desprovido de carga. Frmacos desprovidos de carga geralmente atravessam membranas mais rapidamente do que molculas com carga.

Destaques: Aminocidos Sulfurados: a cistena e sua forma oxidada, cistina, contem enxofre e apresentam baixa polaridade. A cistena possui um papel importante na estabilizao da estrutura das protenas, uma vez que pode participar da formao de uma ponte

dissulfeto com outros resduos de cistena, para formar resduos de cistina, que ligam cruzadamente as cadeias de protenas. Ponte dissulfeto intracadeia (unio covalente) Ponte dissulfeto intercadeias (formadora de dmeros) Outro portador de enxofre em sua estrutura a Metionina, que contem esse elemento e um grupo metil-tioter apolar em sua cadeia lateral. Resumo: cada aminocido apresenta um grupo carboxila e um grupo amino primrio (exceto a prolina que possui um secundrio imina). Em pH fisiolgico t eremos a formao do on carboxilato e do grupo amino protonado. Ligadas ao carbono central (quiral) teremos uma cadeia lateral, que nos mamferos abrange uma variedade de 20 aminocidos essa cadeia determina a classificao dos aminocidos em: apolares, desprovidos de carga, cidos e bsicos. Todos os aminocidos livres quando ligados s cadeias peptdicas, podem servir como tampes. A presena de um carbono quiral, garante a caracterstica de opticamente ativo, que por sua vez a responsvel por desviar a luz e formar os ismeros L e R. No corpo humano, apenas a forma L sintetizada.