Fundao Coordenao de Aperfeioamento de Pessoal de Nvel Superior

Memria da Ps-Graduao

Projetos de Pesquisa
MULTIDISCIPLINAR
ANO BASE: 2004 MODELAGEM COMPUTACIONAL - LNCC

Sistema de Avaliao Relaes Nominais

PROGRAMA: 31036015001P-1

LINHA DE PESQUISA: Computao Cientfica Projeto de Pesquisa ACIMA - Ambientes Colaborativos e Mutimdia Aplicada Descrio: O Laboratrio ACiMA (Ambientes Colaborativos e Multimdia Aplicada) objetiva explorar a utilizao de ambientes virtuais colaborativos nas diversas reas do conhecimento bem como a explorao de sistemas multimdia. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Bruno L.B.Lima Carla G.V.de Oliveira Carlos R.A. e Silva Eduardo de Almeida Cadorin Jauvane Cavalcante de Oliveira Melina de Vasconcelos Alberio Welsing P.Moreira Projeto de Pesquisa Computao Algbrica Aplicada Fsica Matemtica Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: Categoria Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Docente Outro Participante Outro Participante Ano Incio 1999 Especializao: Ano Incio 2004

Descrio: O projeto visa desenvolver algoritmos, tcnicos e aplicativos (softwares) dentro da rea da computao algbrica voltados a fsica matemtica. Em especial, nossas reas de concentrao so: clculo variacional, clculo tensoral, reas afins e fsica terica rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Leon Ricardo Manssur Renato Portugal Projeto de Pesquisa Computao Cientfica Distribuda em Grade Computacional - Com CiDis Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: Categoria Outro Participante Docente Ano Incio 2002 Especializao:

Descrio: A medida que o desempenho das redes ampliou a capacidade computacional e de armazenamento, um novo paradigma tem evoludo para habilitar o compartilhamento e uso coordenado de recursos geograficamente distribudos. Este paradigma popularmente conhecido como Grid Computing (Computao em Grade) e tem por objetivo acoplar recursos distribudos oferecendo acesso consistente e de baixo custo a recursos independente da sua localizao fsica. Grid Computing prov acesso remoto, seguro e escalvel a computao, dados, e outros recursos computacionais atravs da internet. Estas novas tecnologias habilitam o agrupamento (clustering) de uma grande variedadede recursos geograficamente distribudos, tais como supercomputadores, sistemas de armazenamento, fontes de dados e especialmente unidades e servios, que podem ser utilizados como um recurso unificado. Muito do foco de Grade atualmente est dentro de organizaes de pesquisa. A medida que as tecnologias de grade vo surgindo, entretanto, parceiros comerciais tambm aumentam o seu nvel de participao. Isto leva a uma maior focalizao na integrao com modelos computacionais comerciais e mais atividade em segurana e gerncia de recursos necessrios para automatizao e segurana na negociao por recursos remotos. De forma a controlar tal base ampla de recursos, Grid Computing tem uma camada de Middleware que controla a execuo distribuda de aplicaes. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Bruno Richard Schulze Gilson Antonio Giraldi Jauvane Cavalcante de Oliveira Milton Corra Filho Raul Antonino Feijo Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: Categoria Docente Docente Docente Outro Participante Docente Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Computao Cientfica Projeto de Pesquisa Computao de Alto Desempenho Ano Incio 1995

Descrio: Pesquisa e desenvolvimento de mtodos computacionais de alto desempenho em arquiteturas paralelas aplicados a simulao de reservatrios de petrleo, dinmica dos fluidos computacional, previso numrica de tempo, clima e banco de dados, desenhos racional de frmacos. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Anderson Fernandes Pereira dos Santos Carla Osthoff Ferreira de Barros Eduardo Chaves Ferreira Eduardo Lucio Mendes Garcia Elson Magalhaes Toledo Renato Simes Silva Projeto de Pesquisa Computao Quntica: Anlise e Desenvolvimento de Algoritmos Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: 2 Categoria Discente Autor Outro Participante Discente Autor Docente Docente Docente Ano Incio 2001 Especializao:

Descrio: A computao quntica um novo paradigma computacional baseado na manipulao de qubits, que so estados binrios qunticos que podem estar em superposio em contrapartida aos bits que s podem assumir os valores 0 ou 1. Um computador quntico pode usar o emaranhamento e o paralelismo qunticos, caractersticas que no esto disponveis no computador clssico. Nossa rea de pesquisa se concentra na anlise e desenvolvimento de novos algoritmos qunticos. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Amanda Castro Oliveira Carlile Campos Lavor Demerson Nunes Gonalves Jean Faber Ferreira de Abreu Leon Ricardo Manssur Renato Portugal Resp. Graduao: Mestrado: 1 Doutorado: 2 Categoria Discente Autor Outro Participante Discente Autor Discente Autor Outro Participante Docente Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Computao Cientfica Projeto de Pesquisa PRONEX 2003: Modelagem Computacional Em Engenharia e Cincias Aplicadas Ano Incio 2003

Descrio: O foco deste Projeto o desenvolvimento de Modelos Computacionais capazes de prever da forma mais realista possvel a resposta de sistemas fsicos, qumicos e/ou biolgicos nas reas de Engenharia e Cincias Biolgicas e da Natureza. Em termos matemticos, questes relativas anlise da existncia, unicidade e estabilidade da soluo so fundamentais para a confiabilidade dos modelos computacionais propostos. Estabelecido o modelo matemtico, a sua aproximao via modelo numrico e a algoritmizao do mtodo de soluo compe o modelo matemtico-computacional, para o qual o estabelecimento dos erros de aproximao, taxas de convergncia e computabilidade dos algoritmos propostos determina o grau de sua aplicabilidade real. No escopo deste Projeto, ao modelo anteriormente elaborado alia-se o uso de computao de alto desempenho, objetivando a otimizao da performance dos aplicativos a serem desenvolvidos. Uma metodologia comum de abordagem e soluo de problemas em reas disciplinares distintas permite a articulao das pesquisas propostas neste Projeto. Objetivando destacar as peculiaridades inerentes s classes de problemas que sero tratados no mbito deste Projeto, adotamos uma estrutura semelhante do PRONEX anterior, consolidando as atividades de pesquisa em trs grandes reas de atividades, a saber: Atividade 1: Modelos Computacionais Atividade 2: Anlise Matemtica e Numrica Atividade 3: Mtodos Computacionais A Atividade 1 concentra-se fundamentalmente na fenomenologia subjacente Modelagem Computacional dos Problemas de Engenharia e Cincias Aplicadas a serem abordados neste Projeto. Nesta Atividade o foco principal das pesquisas a serem desenvolvidas recai na construo de modelos que quantificam processos de evoluo e de equilbrio. De uma forma concisa ela aborda: i) os princpios fsicos, qumicos e/ou biolgicos, que governam o fenmeno a ser modelado; ii) as relaes constitutivas que descrevem as interaes entre os agentes do processo; iii) as condies de fronteira que restringem o objeto da anlise; iv) as condies iniciais que individualizam o processo de evoluo do sistema, e/ou as restries que asseguram o seu estado de equilbrio. Estrutura-se esta Atividade em Temas, que aglutinam um conjunto coerente de atividades multidisciplinares correlatas, com foco interdisciplinar definido. Assim, a Atividade 1 deste Projeto PRONEX consolidada nos Temas: Modelagem Computacional de Circulao e Transporte Modelagem Computacional Multi-Escala Modelagem Computacional na Anlise de Sensibilidade Mudana de Forma e Topologia e suas Aplicaes em Cincias Mecnicas, Geofsica e Mdicas Modelagem Computacional de Biossistemas e Bioinformtica Neste ultimo tema inclui-se a Modelagem do Sistema Cardiovascular, a Modelagem Molecular de Macromolculas Biolgicas e Bioinformtica e Genmica Evolutiva. A Atividade 2 focaliza a estrutura e as propriedades matemticas, numricas e computacionais que validam: a consistncia dos modelos desenvolvidos e a acuracidade, convergncia e eficincia dos algoritmos e mtodos computacionais elaborados. Esta Atividade consolidada nos Temas: Formulao Matemtica Anlise Numrica Otimizao A Atividade 3 sintetiza o desenvolvimento de tcnicas e simuladores computacionais, englobando os Temas: Visualizao Cientfica e Animao de Fluidos Ambientes Colaborativos Imersivos de Mnima Despesa Computao Cientfica e Distribuda Uma descrio detalhada destes temas pode ser obtida em http://www.lncc.br rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Abimael Fernando Dourado Loula Afonso Celso Castro Lemonge Alcino Dall Igna Junior Alexandre Loureiro Madureira Graduao: Mestrado: 1 Doutorado: 23 Categoria Docente Outro Participante Discente Autor Docente Especializao:

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Equipe Ana Paula Camardella Rio Doce Ana Paula Pintado Wyse Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos Antonio Carlos Salgado Guimares Antonio Castelo Filho Araken dos Santos Werneck Augusto Cesar Noronha Rodrigues Galeo Aureo Quintas Garcia Bruno Richard Schulze Camila Silva de Magalhes Carla Osthoff Ferreira de Barros Carlos Carbonel Humman Carlos Cristiano Hasenclever Borges Carlos Emanuel de Souza Christian Moyne Claudia Marins Alves Claudio Padra Clemente Augusto Souza Tanajura Cleverson Alessandro Veronez Edgardo Omar Taroco Aliano Eduardo Alberto Fancello Eduardo de Souza Neto Eduardo Lucio Mendes Garcia Eliane dos Santos de Souza Coutinho Elson Magalhaes Toledo Enzo Alberto Dari Erasmo Senger Ernesto Ral Caffarena Esbel Toms Valero Orellana Fabiano Saldanha Gomes de Oliveira Fabio Lima Custodio Fabola Valria Barreto Teixeira Fernando Basombrio Fernando Marques Federson Flvia Paiva Agostini Frederico Furtado Gilson Antonio Giraldi Glaucio Paulino Gustavo Alberto Perla Menzala Gustavo Benitez Gustavo Buscaglia Guzmn Eullio Isla Chamilco Helio Jos Correa Barbosa Helio Pedro Amaral Souto Ian Foster J.T.Oden Jaime Edilberto Munoz Rivera Jairo Vales de Alencar Ramalho Jauvane Cavalcante de Oliveira Jean Faber Ferreira de Abreu Jiang Zhu Resp.

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Categoria Discente Autor Discente Autor Docente Outro Participante Outro Participante Outro Participante Docente Discente Autor Docente Discente Autor Outro Participante Outro Participante Docente Docente Outro Participante Discente Autor Outro Participante Docente Discente Autor Docente Outro Participante Outro Participante Docente Discente Autor Docente Outro Participante Discente Autor Outro Participante Discente Autor Docente Discente Autor Discente Autor Outro Participante Outro Participante Discente Autor Outro Participante Docente Outro Participante Docente Outro Participante Outro Participante Discente Autor Docente Outro Participante Outro Participante Outro Participante Docente Discente Autor Docente Discente Autor Docente

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Equipe Jim Douglas Jr. Joo Nisan Correia Guerreiro Jos Herskovits Normam Jos Karam Filho Jos Walter Crdenas Konstantin Pavlovich Belyaev Laura De Simone Borma Laurent Emmanuel Dardenne Leandro Carlos Gazoni Leandro Schaeffer Marturelli Leopoldo Luis Cabo Penna Franca Luigi Quatarpele Luis Augusto Feijo Luis Felipe Feres Pereira Luis Godoy Luis Marcos Garcia Gonalves Luis Paulo da Silva Barra Luiz Felipe da Silva Manuel Jesus Cruz Barreda Marcelo Venere Marcio Antonio de Andrade Bortoloti Marcio Arab Murad Marco Antonio Raupp Maria Elizabeth Puelles Bulnes Mohamed Masmoudi Murilo Francisco Tom Nelson Albuquerque de Souza e Silva Othon Jambeiro Paolo Pdio-Guidugli Patricia Regina Chaves Drach Patricia Snez Pacheco Paulo Csar Faria Raul Antonino Feijo Regina Clia Cerqueira de Almeida Regina Clia Paula Leal Toledo Renato Portugal Renato Simes Silva Ricardo Amorim Abreu Ricardo Duran Rigoberto Gregrio Sanabria Castro Rita de Cassia Carvalho e Silva Rodolfo Rodriguez Rubem Alves da Silva Sandra Mara Cardoso Malta Santina de Ftima Arantes Simone de Almeida Delphim Sonia Limoeiro Monteiro Sven.O.Wille Teresinha Fres Burnham Valria Cristina Ferreira Barbosa

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Categoria Outro Participante Docente Outro Participante Docente Outro Participante Outro Participante Outro Participante Docente Outro Participante Discente Autor Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Discente Autor Outro Participante Discente Autor Docente Docente Discente Autor Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Discente Autor Discente Autor Outro Participante Docente Docente Outro Participante Docente Docente Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Discente Autor Docente Discente Autor Discente Autor Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante

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LINHA DE PESQUISA: Computao Cientfica Projeto de Pesquisa Visualizao Cientfica, Realidade Virtual e Segmentao de Imagens Mdicas Ano Incio 2001

Descrio: Como objetivos gerais deste sub-projeto temos os seguintes itens: Desenvolvimento de softwares grficos para visualizao de dados numricos na rea de Mecnica Computacional em geral; Desenvolver pesquisa e software para permitir a visualizao e segmentao de imagens mdicas obtidas via MRI e CT entre outras. Desenvolver tcnicas de transmisso progressiva de dados entre centros de pesquisa para facilitar a troca de informao e conhecimento; Integrar rotinas de visualizao ao um sistema distribudo (ver projeto Computao Cientfica Distribuida - Grid Computing) para disponibilizar recursos de simulao-armazenamento-transmisso-visualizao de dados; Formao de recursos humanos na rea de visualizao no LNCC/CMC. Com o intuito de alcanar os objetivos (gerais)mencionados, temos os seguintes objetivos particulares: Integrao entre pesquisadores e instituies para troca de conhecimento e aglutinao de foras em direo a um objetivo comum; Desenvolver tcnicas de transmisso progressiva de dados dedicadas; Desenvolvimento de um sistema Cliente-Servidor para a integrao entre simulao e visualizao, e a integrao deste sistema com os simuladores a serem desenvolvidos em outros projetos do LNCC; Desenvolvimento de aplicativos para visualizao cientfica utilizando recursos de Realidade Virtual; Desenvolvimento de softwares grficos para computadores paralelos. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Edson Leite Arajo Gilson Antonio Giraldi Jauvane Cavalcante de Oliveira Leandro Schaeffer Marturelli Raul Antonino Feijo Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: 2 Categoria Discente Autor Docente Docente Discente Autor Docente Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Controle e Filtragem de Sistemas Dinmicos Projeto de Pesquisa Anlise e Controle de Sistemas Biolgicos Ano Incio 2000

Descrio: Aplicao da teoria de controle na regulao da dinmica populacional de espcies interativas e de clulas tumoriais. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Gilberto Oliveira Corra Michel Iskin da Silveira Costa Paulo Cesar Marques Vieira Projeto de Pesquisa Controle de Sistemas Dinmicos Estocsticos Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: Categoria Docente Docente Docente Ano Incio 2003 Especializao:

Descrio: um fato bastante conhecido que o tratamento realstico de sistemas fsicos, econmicos, biolgicos, entre outros, envolve incertezas tanto ambientais como de modelagem. Nesse cenrio, a modelagem estocstica ocupa um lugar de destaque na derivao das equaes para diversos tipos de sistemas. Abordagens via controle timo linear quadrtico, H-infinito e robusto, tm demonstrado grande potencialidade sob um ponto de vista de aplicaes. Quando as incertezas envolvidas se do por variaes aleatrias abruptas, uma modelagem potencialmente interessante aquela interpretada por Sistemas Lineares com Saltos Markovianos (SLSMs). Esses modelos hbridos se caracterizam por uma multiplicidade de modos de operao discretos (saltos) que so visitados pelo modelo de forma aleatria ao longo do tempo. Esse um dos cenrios, entre outros, em que a comunidade de controle brasileira vem se destacando com uma participao de liderana. As contribuies vo de resultados tericos fundamentais em estabilidade, controle e filtragem algortmos para soluo numrica (ver referncias nos itens 6 e 9 -). Aplicaes naturais so, entre outras, econometria, processos qumicos, robtica e sistemas de controle areo. Apesar do conjunto considervel de trabalhos lidando com a classe SLSM, um nmero razovel de questes continua em aberto, como por exemplo a questo de estabilidade com probabilidade um (almost sure), o problema de controle com observaes parciais, controle ergdico, etc. Alm disso, pouco foi feito para a classe SLSM onde a cadeia de Markov tem espao de estado infinito enumervel: [5], [6] do item 9 para o caso a tempo discreto e [1],[2],[4],[6] do item 6 para o caso a tempo contnuo so as primeiras incurses nesse cenrio. Abordaremos os problemas de estabilidade e controle com SLSMs em um cenrio de espaos de estado infinito contvel e relativamente aos tpicos de controle H-infinito e soluo para equaes diferenciais e algbricas de Riccati. O problema de filtragem tem como aspecto fundamental o fato da observao imperfeita da cadeia de saltos Marovianos, alm do porcess de estado do sistema. O problema de controle ergdico com SLSMs tambm importante, j que no existem resultados sobre o assunto na literatura disponvel. Este problema, junto com os problemas LQG e LEQG, formam um trip na caracterizao do custo nos problemas de controle com SLSMs. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Eulina Nascimento Jack Baczynski Marcelo Dutra Fragoso Nei C S Rocha Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: Categoria Outro Participante Docente Docente Outro Participante Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Controle e Filtragem de Sistemas Dinmicos Projeto de Pesquisa Estabilidade e Controle Robusto de Sistemas Dinmicos Ano Incio 1999

Descrio: Este projeto tem como objetivo desenvolver metodologias de anlise de estabilidade robusta e de projeto de sistemas de controle robustos com desempenho garantido nos contextos H-2 e H-infinito para sistemas dinmicos com parmetros incertos, inclusive o caso de sistemas dinmicos lineares com parmetros incertos variantes no tempo e cujas magnitudes e taxas de variao so restritas a intervalos conhecidos. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Carlos Emanuel de Souza Emerson Souza Freire Gilberto Oliveira Corra Paulo Cesar Marques Vieira Projeto de Pesquisa Estabilidade, Controle e Filtragem de Sistemas Dinmicos Sujeitos Falhas Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: 1 Categoria Docente Discente Autor Docente Docente Ano Incio 2000 Especializao:

Descrio: O objetivo a soluo de problemas de estabilidade, controle e filtragem de sistemas lineares com saltos markovianos, bem como suas aplicaes a robtica mvel, motores de induo e usinas hidroeltricas. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Carlos Emanuel de Souza Jack Baczynski Marcelo Dutra Fragoso Oswaldo Luiz do Valle Costa Telles Timteo da Silva Projeto de Pesquisa Ncleo de Excelncia PRONEX: Controle de Sistemas Dinmicos - Processo: 66.2015/1998-3 Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: 1 Categoria Docente Docente Docente Outro Participante Discente Autor Ano Incio 2000 Especializao:

Descrio: O Ncleo de Excelncia em Controle de Sistemas Dinmicos tem por objetivo desenvolver metodologias avanadas de controle e automao de sistemas dinmicos abordando aspectos cientficos e tecnolgicos. O Ncleo tem como foco importantes problemas em aberto em controle e estimao de sinais em sistemas dinmicos incertos, isto , sistemas nos quais incertezas de modelagem so significativas e inevitveis, e abranger atividades de pesquisa em abordagens de alta relevnciaa saber: controle robusto, controle estocstico, sistemas adaptativos e estimao robusta de sinais. dada nfase tanto ao estudo de questes tericas fundamentais quanto as aplicaes em importantes problemas prticos como, por exemplo, em sistemas aeroespaciais, automao industrial e robtica mvel. Instituies Envolvidas: Laboratrio Nacional de Computao Cientfica - LNCC Instituto Tecnolgico da Aeronutica - ITA Universidade de So Paulo - USP Universidade Estadual de Campinas - UNICAMP Universidade Federal de Santa Catarina - UFSC rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Carlos Emanuel de Souza Gilberto Oliveira Corra Joao Bosco Ribeiro do Val Marcelo Dutra Fragoso Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: Categoria Docente Docente Outro Participante Docente Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Modelagem Matemtica e Computacional de Biossistemas e Bioinformtica Projeto de Pesquisa Bioinformtica e Modelagem de Biosistemas Ano Incio 2000

Descrio: Este projeto se encaixa mo projeto do Instituto Virtual que foi aprovado formalmente no fim de 2000 na FAPERJ. O IVBMB foi criado em maio prximo passado com sede no LNCC reunindo quatro instituies que formam o Conselho Diretor: LNCC, Instituto de Biofsica da UFRJ, FIOCRUZ e IMPA. Alm dessas concordaram em fazer parte da rede vrias instituies do RIO entre elas: COPPE/UFRJ, PUC-RJ, UERJ, UFF, UNIENF. Os objetivos bsicos do IVBMB esto orientados para fazer avanar os conhecimentos nas reas de bioinformtica, genmica, modelos de sistemas biolgicos (micro- e macrosistemas), modelagem molecular. Ser formada uma rede virtual, numa plataforma com suporte na internet. Ao LNCC cabe a tarefa de desenvolver ferramentas computacionais para estoque e anlise de informaes biolgicas bem como mtodos de processamento computacional dessas informaes e desenvolvimento de banco de dados. Sero organizados cursos, tele-conferncias, workshops, programa de visitantes e apoio a iniciativas novas. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Ana Paula Pintado Wyse Augusto Cesar Noronha Rodrigues Galeo Eliane dos Santos de Souza Coutinho Esbel Toms Valero Orellana Jos Karam Filho Laurent Emmanuel Dardenne Luiz Bevilacqua Paulo Mascarello Bisch Raul Antonino Feijo Rubem Alves da Silva Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: 5 Categoria Discente Autor Docente Discente Autor Discente Autor Docente Docente Docente Outro Participante Docente Discente Autor Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Modelagem Matemtica e Computacional de Biossistemas e Bioinformtica Projeto de Pesquisa Bioinformtica Ano Incio 2004

Descrio: O desenvolvimento de mtodos computacionais eficientes para a anlise de bancos de seqncias de ADN e protenas hoje importante e necessrio.Desde o incio dos anos 90, a Dra. Ana Tereza R. de Vasconcelos vem atuando no LNCC na rea de Bioinformtica, sendo a responsvel pela criao em 2000 do Laboratrio de Bioinformtica (LABINFO-http://www.lncc.br/~labinfo/). Este laboratrio recebe desde ento apoio do Programa de Biotecnologia do Ministrio da Cincia e Tecnologia tornando-se laboratrio de referncia nesta rea. Este laboratrio vem desenvolvendo metodologias matemticas e computacionais para as reas de genmica e ps-genmica e protemica como por exemplo, ferramentas para anotaes funcionais e estruturais, e para o estudo ps-genoma de regies codificantes e no-codificantes. A partir de 2000 o LABINFO passou a ser o centro de Bioinformtica para vrias redes genmicas; BRGENE (Projeto Genoma Brasileiro - http://www.brgene.lncc.br <http://www.brgene.lncc.br/>), RIOGENE (Projeto Genoma do Estado do Rio de Janeiro - http://www.riogene.lncc.br <http://www.lncc.br/%7Eriogene>) e PIGS (Projeto Genoma do Sul http://www.genesul.lncc.br <http://www.brgene.lncc.br/>). Para lidar com estas tarefas foi desenvolvido um software para montagem e anotao automtica de Genomas: *SABI:* *S*ystem of *A*utomated *B*acterial *I*ntegrated *A*nnotation. Atravs da visibilidade alcanada por estes projetos, o LABINFO tem sido convidado a participar de vrios projetos de genmica e de protemica: Genoma de /R. tropici, /genmica comparativa de /Xylella fastidiosa, /proteoma de /S. cerevisiae,/* *BRAPAPAP- BRAzilian PAthogenic Proteins Annotation Project entre outros.// rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Alex Sandro Mundstein Alexandre Rossi Paschoal Aline Rossi da Silveira Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos Claudia Barros Monteiro Vitorello Claudia Russo Cristiano Gallina Moreira Darcy Fontoura de Almeida David Anderson de Lima Moraes Felipe Ribeiro Duarte Fernanda Nascimento Almeida Frank J. A. Barrientos Glauber Mrcius Cardoso Menezes Joo Carlos Pereira da Silva Luiz Gonzaga Paula Almeida Marcia Guglielmi Marco Antonio Mattos Vilela Marisa Fabiana Nicols Mauricio Costa Alves da Silva Oberdan de Lima Cunha Pablo Nehab Hess Pablo Riera Freire Rangel Celso Souza Renato Camara da Silva Roger Ferreira Cury Paixo Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: Categoria Outro Participante Outro Participante Outro Participante Docente Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Modelagem Matemtica e Computacional de Biossistemas e Bioinformtica Projeto de Pesquisa Ano Incio Desenvolvimento de Mtodos Computacionais Aplicados ao Desenho Racional De Frmacos e Predio de 2004 Estruturas de Protenas Descrio: Os objetivos cientficos deste projeto esto associados com o desenvolvimento de metodologias computacionais e algoritmos na rea de modelagem molecular nas seguintes linhas de pesquisa: (I) Desenho racional de frmacos baseado em estruturas, i.e., descrever e quantificar o modo de interao entre uma protena/receptor e uma molcula ligante; (II) Predio de estruturas tridimensionais de protenas; e (III) Clculo de propriedades eletrostticas de macrfomolculas biolgicas. Estas linhas de pesquisa tiveram grande desenvolvimento na ltima dcada e se caracterizam por possurem aplicaes prticas de grande impacto biotecnolgico. Um aspecto importante desta rea o seu carter marcadamente multidisciplinar envolvendo conhecimento e pesquisadores das reas da biologia, bioqumica, qumica, qumica medicinal, fsica e computao cientfica. Atualmente esto em desenvolvimento os seguintes trabalhos associados a projetos de pesquisa financiados pela FAPERJ e CNPq: (i) Desenvolvimento de metodologias computacionais de docking receptor-ligante utilizando Algoritmos Genticos e o algoritmo Generalized Simulated Annealing; (ii) Desenvolvimento de um programa para o gerenciamento de um banco de ligantes; (iii) Construo de um banco de alvos moleculares, a partir de estudos do genoma do parasita Tripanosoma cruzi, visando a descoberta de compostos prottipos para o desenvolvimento de frmacos teis para o tratamento da Doena de Chagas; (iv) Desenvolvimento de metodologias computacionais para a predio ab initio de estruturas de protenas; (v) Desenvolvimento de um campo de fora polarizvel baseado no uso de clculos qunticos de estrutura eletrnica visando o seu uso futuro em metodologias de docking receptor-ligante. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Alcino Dall Igna Junior Camila Silva de Magalhes Carlos Cristiano Hasenclever Borges Fabio Lima Custodio Fausto Lima Custdio Fernanda Maria Pereira Raupp Helio Jos Correa Barbosa Laurent Emmanuel Dardenne Luiz Bevilacqua Priscila Vanessa da Silva Zabala Capriles Renato Simes Silva Thas Gaudcio do Rgo Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: 4 Categoria Discente Autor Discente Autor Docente Discente Autor Discente Autor Docente Docente Docente Docente Discente Autor Docente Outro Participante Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Modelagem Matemtica e Computacional de Biossistemas e Bioinformtica Projeto de Pesquisa GEOMA - Rede Tematica de Pesquisa em Modelagem Ambiental da Amazonia Ano Incio 2003

Descrio: A interao entre aspectos naturais e sociais do desenvolvimento humano vem tendo especial ateno nesta ltima dcada por parte da comunidade cientfica resultando no desenvolvimento de modelos e programas que tem por objetivo integrar estes aspectos. Particularmente, ressaltamos o MIT Integrated Global System Model (IGSM) para o estudo de mudanas do meio ambiente e econmica (Prinn et al., 1999) e o LUCC (Land Use and Land Cover Change). Este ltimo como resultado de uma iniciativa do International Geosphere and Biosphere Program (IGBP) (Turner, Skole et al. 1995). Alm das vantagens dos modelos quantitativos, fundamental destacar a centralidade da noo do espao geogrfico como suporte s consideraes sobre sustentabilidade. Ao contrrio de outros fatores de produo (como capital e trabalho), os recursos naturais so inflexveis em termos de localizao. A floresta Amaznica est onde ela est; os recursos hdricos para nossas cidades no podem ser transportados. O dilema colocado pelo desenvolvimento sustentvel que no podemos mais tratar estes fatores como substituveis, e mover pessoas e capital para novas reas quando os recursos naturais tornam-se escassos ou exauridos: no h novas fronteiras num mundo globalizado. Para enfrentar esses desafios, baseados nos novos nveis de competncia cientfica, um grupo de instituies brasileiras com liderana em pesquisa e desenvolvimento prope a Rede Temtica de Pesquisa em Modelagem da Amaznia. O objetivo desta Rede desenvolver modelos computacionais capazes de predizer a dinmica dos sistemas ecolgicos e scio-econmicos em diferentes escalas geogrficas, dentro do conceito de sustentabilidade; auxiliar a tomada de deciso nos nveis local, regional e nacional, ao fornecer ferramentas de simulao e modelagem; contribuir na formao de recursos humanos nos nveis de mestrado e doutorado. Para desenvolver novas abordagens ao conceito de sustentabilidade, que levem a modelos computacionais, a Rede ser baseada em uma forte perspectiva interdisciplinar, com um time de investigadores com experincia em modelagem matemtica/computacional, economia, informao geogrfica, sensoriamento remoto, ecologia, demografia, meteorologia, geografia, computao, entre outras. Instituioes participantes: LNCC-Laboratrio Nacional de Computao Cientfica MPEG-Museu Paraense Emlio Goeldi INPE-Intituto de Pesquisas Espaciais IDSM-Instituto de Desenvolvimento Sustentvel Mamirau IMPA-Instituto de Matemtica Pura e Aplicada (Coordenaao Geral) CBPF-Centro Brasileiro de Pesquisas Fsicas rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Ana Paula Camardella Rio Doce Ana Paula Pintado Wyse Carla Osthoff Ferreira de Barros Claudia Mazza Dias Eliane dos Santos de Souza Coutinho Fabiano Saldanha Gomes de Oliveira Jos Karam Filho Laura De Simone Borma Mauricio Vieira Kritz Regina Clia Cerqueira de Almeida Renato Simes Silva Sandra Mara Cardoso Malta Simone de Almeida Delphim Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: 3 Categoria Discente Autor Discente Autor Outro Participante Outro Participante Discente Autor Docente Docente Outro Participante Docente Docente Docente Docente Discente Autor Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Modelagem Matemtica e Computacional de Biossistemas e Bioinformtica Projeto de Pesquisa Modelagem do Sistema Respiratrio Ano Incio 2000

Descrio: A modelagem do sistema respiratrio tem sido feita a partir de modelos muito simplificados, utilizando um conjunto de massas molas e amortecedores viscosos. Os modelos so ajustados de modo a calibrar certas constantes fsicas do sistema a partir de resultados experimentais. No obstante os bons resultados o modelo pode ser aperfeioado introduzindo-se uma representao mais prximas realidade. A idia modelar o sistema de alveolos com membranas visco-elsticas formando uma rvore que pode ser representada com uma geometria fracionria. Alguns autores j consideram a geometria fractal da distribuio dos vasos capilares no pulmo para modelar os mecanismos de perfuso. Na nossa concepo seria importante modelar tambm a geometria do suporte com uma representao fractal. Alguns trabalhos j foram feitos e esto sendo submetidos para publicao. Estamos agora em posio de comear uma nova fase de cooperao com o professor Walter Zinn do Instituto de Biofsica "Carlos Chagas Filho" da UFRJ. At o presente temos mantido trocas de informaes sobre publicaes relativas ao carter fractal do sistema respiratrio. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Augusto Cesar Noronha Rodrigues Galeo Luiz Bevilacqua Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: Categoria Docente Docente Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Modelagem Matemtica e Computacional de Biossistemas e Bioinformtica Projeto de Pesquisa Modelagem em Ecologia Trica: Dinmica de Populaes Ano Incio 2004

Descrio: A biologia populacional, enfoca a variao do nmero de indivduos de uma populao ao longo do tempo, tentando entender, explicar e prever mudanas no seu tamanho. Em ecossistemas de baixa diversidade, submetidos a estresses fsicos, ou naqueles submetidos a perturbaes extrnsecas irregulares ou no previsveis, o tamanho da populao tende a ser influenciado principalmente por fatores fsicos, tais como condies meteorolgicas, correntes aquticas, condies limitantes qumicas, poluio, etc. Em ecossistemas de alta diversidade, em ambientes benignos (com baixa probabilidade de estresses fsicos peridicos, tais como tempestades ou incndios), as populaes tendem a ser controladas biologicamente e, at um certo ponto, a sua densidade auto-regulada. Qualquer fator, seja limitante ou favorvel a uma populao pode ser independente ou dependente da densidade. Fatores diretamente dependentes da densidade agem como reguladores e por essa razo so considerados entre os principais agentes na preveno da superpopulao. Fatores biticos (competio, parasita, organismos patognicos, etc) muitas vezes podem agir de uma forma dependente da densidade. Devido ao grande nmero de populaes, a biologia populacional procura princpios que possam ser aplicados ao maior nmero de casos. Esses princpios tentariam elucidar porque populaes crescem ou declinam, so estveis ao longo de vrias geraes, apresentam surtos, colapsos ou tendem a extino. Modelos matemticos podem colaborar na elaborao precisa de argumentos tericos acerca dos fatores que afetam a variao do tamanho de uma populao. A biologia populacional, enfoca a variao do nmero de indivduos de uma populao ao longo do tempo, tentando entender, explicar e prever mudanas no seu tamanho. Em ecossistemas de baixa diversidade, submetidos a estresses fsicos, ou naqueles submetidos a perturbaes extrnsecas irregulares ou no previsveis, o tamanho da populao tende a ser influenciado principalmente por fatores fsicos, tais como condies meteorolgicas, correntes aquticas, condies limitantes qumicas, poluio, etc. Em ecossistemas de alta diversidade, em ambientes benignos (com baixa probabilidade de estresses fsicos peridicos, tais como tempestades ou incndios), as populaes tendem a ser controladas biologicamente e, at um certo ponto, a sua densidade auto-regulada. Qualquer fator, seja limitante ou favorvel a uma populao pode ser independente ou dependente da densidade. Fatores diretamente dependentes da densidade agem como reguladores e por essa razo so considerados entre os principais agentes na preveno da superpopulao. Fatores biticos (competio, parasita, organismos patognicos, etc) muitas vezes podem agir de uma forma dependente da densidade. Devido ao grande nmero de populaes, a biologia populacional procura princpios que possam ser aplicados ao maior nmero de casos. Esses princpios tentariam elucidar porque populaes crescem ou declinam, so estveis ao longo de vrias geraes, apresentam surtos, colapsos ou tendem a extino. Modelos matemticos podem colaborar na elaborao precisa de argumentos tericos acerca dos fatores que afetam a variao do tamanho de uma populao. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Ana Paula Camardella Rio Doce Francisca Ana Soares dos Santos Michel Iskin da Silveira Costa Natlia Cristina Braga Arruda Alves da Silva Paula Rogria Lima Couto Regina Clia Cerqueira de Almeida Sandra Mara Cardoso Malta Simone de Almeida Delphim Wesley Godoy Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: Categoria Discente Autor Outro Participante Docente Discente Autor Discente Autor Docente Docente Discente Autor Outro Participante Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Modelagem Matemtica e Computacional de Biossistemas e Bioinformtica Projeto de Pesquisa PRONEX 2003: Modelagem Computacional Em Engenharia e Cincias Aplicadas Ano Incio 2003

Descrio: O foco deste Projeto o desenvolvimento de Modelos Computacionais capazes de prever da forma mais realista possvel a resposta de sistemas fsicos, qumicos e/ou biolgicos nas reas de Engenharia e Cincias Biolgicas e da Natureza. Em termos matemticos, questes relativas anlise da existncia, unicidade e estabilidade da soluo so fundamentais para a confiabilidade dos modelos computacionais propostos. Estabelecido o modelo matemtico, a sua aproximao via modelo numrico e a algoritmizao do mtodo de soluo compe o modelo matemtico-computacional, para o qual o estabelecimento dos erros de aproximao, taxas de convergncia e computabilidade dos algoritmos propostos determina o grau de sua aplicabilidade real. No escopo deste Projeto, ao modelo anteriormente elaborado alia-se o uso de computao de alto desempenho, objetivando a otimizao da performance dos aplicativos a serem desenvolvidos. Uma metodologia comum de abordagem e soluo de problemas em reas disciplinares distintas permite a articulao das pesquisas propostas neste Projeto. Objetivando destacar as peculiaridades inerentes s classes de problemas que sero tratados no mbito deste Projeto, adotamos uma estrutura semelhante do PRONEX anterior, consolidando as atividades de pesquisa em trs grandes reas de atividades, a saber: Atividade 1: Modelos Computacionais Atividade 2: Anlise Matemtica e Numrica Atividade 3: Mtodos Computacionais A Atividade 1 concentra-se fundamentalmente na fenomenologia subjacente Modelagem Computacional dos Problemas de Engenharia e Cincias Aplicadas a serem abordados neste Projeto. Nesta Atividade o foco principal das pesquisas a serem desenvolvidas recai na construo de modelos que quantificam processos de evoluo e de equilbrio. De uma forma concisa ela aborda: i) os princpios fsicos, qumicos e/ou biolgicos, que governam o fenmeno a ser modelado; ii) as relaes constitutivas que descrevem as interaes entre os agentes do processo; iii) as condies de fronteira que restringem o objeto da anlise; iv) as condies iniciais que individualizam o processo de evoluo do sistema, e/ou as restries que asseguram o seu estado de equilbrio. Estrutura-se esta Atividade em Temas, que aglutinam um conjunto coerente de atividades multidisciplinares correlatas, com foco interdisciplinar definido. Assim, a Atividade 1 deste Projeto PRONEX consolidada nos Temas: Modelagem Computacional de Circulao e Transporte Modelagem Computacional Multi-Escala Modelagem Computacional na Anlise de Sensibilidade Mudana de Forma e Topologia e suas Aplicaes em Cincias Mecnicas, Geofsica e Mdicas Modelagem Computacional de Biossistemas e Bioinformtica Neste ultimo tema inclui-se a Modelagem do Sistema Cardiovascular, a Modelagem Molecular de Macromolculas Biolgicas e Bioinformtica e Genmica Evolutiva. A Atividade 2 focaliza a estrutura e as propriedades matemticas, numricas e computacionais que validam: a consistncia dos modelos desenvolvidos e a acuracidade, convergncia e eficincia dos algoritmos e mtodos computacionais elaborados. Esta Atividade consolidada nos Temas: Formulao Matemtica Anlise Numrica Otimizao A Atividade 3 sintetiza o desenvolvimento de tcnicas e simuladores computacionais, englobando os Temas: Visualizao Cientfica e Animao de Fluidos Ambientes Colaborativos Imersivos de Mnima Despesa Computao Cientfica e Distribuda Uma descrio detalhada destes temas pode ser obtida em http://www.lncc.br rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Augusto Cesar Noronha Rodrigues Galeo Resp. Graduao: Mestrado: 1 Doutorado: 23 Categoria Docente Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Modelagem Matemtica e Computacional de Circulao e Transporte Projeto de Pesquisa Anlise e Simulao de Problemas Combinados de Transferncia de Momento, Massa e Calor Ano Incio 2004

Descrio: Este projeto visa a modelagem, anlise numrica e simulao computacional de problemas envolvendo formas combinadas de transferncia de movimento, massa e energia, com nfase na energia trmica. So desenvolvidas novas formulaes de elementos finitos estabilizados e algoritmos adequados que permitam o emprego de tecnicas modernas para a resoluo dos sistemas. Dentre os problemas abordados neste projeto destacam-se problemas ntermicamente acoplados de dinmica dos fluidos,fenmenos de transferncia de calor atravs de interfaces, problemas de difuso de antgeno no processo alrgico, problemas de conforto trmico em ambientes construdos e interao com a regulao trmica humana. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Abimael Fernando Dourado Loula Cristiane Oliveira de Faria Esbel Toms Valero Orellana Jiang Zhu Joo Nisan Correia Guerreiro Jos Karam Filho Marcio Antonio de Andrade Bortoloti Patricia Regina Chaves Drach Rubem Alves da Silva Projeto de Pesquisa Anlise e Simulao Numrica de Escoamentos de Fluidos No-Newtonianos Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: 5 Categoria Docente Discente Autor Discente Autor Docente Docente Docente Discente Autor Discente Autor Discente Autor Ano Incio 2000 Especializao:

Descrio: Este projeto visa a modelagem, anlise numrica e simulao computacional de fluidos newtonianos e no-newtonianos, envolvendo interaes mecnicas e fenmenos de transferncia conjugada de calor atravs de interfaces slido-lquido. So desenvolvidas novas formulaes de elementos finitos estabilizados e algoritmos adequados que permitam o emprego de tecnicas modernas para a resoluo dos sistemas. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Abimael Fernando Dourado Loula Erasmo Senger Esbel Toms Valero Orellana Jiang Zhu Joo Nisan Correia Guerreiro Jos Karam Filho Marcio Antonio de Andrade Bortoloti Patricia Regina Chaves Drach Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: 3 Categoria Docente Discente Autor Discente Autor Docente Docente Docente Discente Autor Discente Autor Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Modelagem Matemtica e Computacional de Circulao e Transporte Projeto de Pesquisa Anlise Numrica e Computacional de Escoamentos em Meios Porosos Ano Incio 2000

Descrio: So propostas novas tcnicas de elementos finitos estabilizados para a soluo de problemas relacionados com o escoamento de fluidos em meios porosos rgidos e, particularmente, na simulao computacional dos problemas de escoamentos de fronteira livre. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Abimael Fernando Dourado Loula Guzmn Eullio Isla Chamilco Maicon Ribeiro Corra Paula Rogria Lima Couto Rosa Luz Medina Aguilar Sandra Mara Cardoso Malta Projeto de Pesquisa Estabilizao de Modelos Dinmicos Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: 3 Categoria Docente Discente Autor Discente Autor Discente Autor Discente Autor Docente Ano Incio 2000 Especializao:

Descrio: Estudamos fenmenos Fsicos as quais ondas de diferentes estruturas interagem mutuamente. Notadamente isso acontece em termo elasticidade e magneto-elasticidade. Procura-se obter resultados sobre o comportamento assinttico da energia do modelo, quando o tempo muito grande. Taxas uniformes timas so desejadas. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Ademir Fernando Pazoto Celene Buriol Claudio Fernandez Enrique Zuazua Gustavo Alberto Perla Menzala Santina de Ftima Arantes Vladimir Konotop Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: 1 Categoria Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Docente Discente Autor Outro Participante Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Modelagem Matemtica e Computacional de Circulao e Transporte Projeto de Pesquisa Mtodo dos Elementos Finitos Adaptativos Aplicados Problemas da Dinmica dos Fluidos Ano Incio 2001

Descrio: Este projeto d continuidade s atividades que vm sendo desenvolvidas. Resumidamente, este projeto visa a modelagem numrica e elaborao de algoritmo numrico com implementao em paralelo e/ou sistemas distribudos para a simulao numrica de escoamentos compressveis e incompressveis. Do ponto de vista numrico, a ocorrncia frequente de solues no regulares nesta classe de problemas (fortemente hiperblicos), caracterizadas pela formao de camadas limite e/ou choques, exige alm de esquemas numricos estveis (providos pela formulao de Petrov-Galerkin) a adoo de esquemas de refinamento adaptativo. Uma outra razo para o uso de esquemas adaptativos eficientes reside no fato de que problemas de interesse prtico envolvem discretizaes tridimensionais com um nmero elevado de graus de liberdade (problemas com 105-106 graus de liberdade so tpicos). Cabe lembrar que a resoluo numrica de problemas deste tipo tambm tem o custo computacional como forte preocupao, requerendo o emprego de tcnicas de computao de alto desempenho. Do ponto de vista numrico, mtodos clssicos para tratar a restrio de incompressibilidade no so timos ou simplesmente no funcionam para escoamentos compressveis. Entretanto, algumas formulaes de elementos finitos do tipo Petrov-Galerkin tm sido aplicadas com relativo sucesso em ambos os casos e parecem ser o caminho para o desenvolvimento de uma formulao unificada. Esta abordagem combinada compressvel-incompressvel se torna atraente quando o efeito de empuxo considerado e introduzido nas equaes de Navier-Stokes via a aproximao de Boussinesq. Tal formulao permitiria, ento, a anlise de escoamentos dirigidos por empuxo associados com campos de velocidade de divergncia nula que so tpicos, por exemplo, em certas aplicaes de crescimento de cristais. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Augusto Cesar Noronha Rodrigues Galeo Aureo Quintas Garcia Carlos Carbonel Humman Regina Clia Cerqueira de Almeida Renato Simes Silva Projeto de Pesquisa Mtodos de Elementos Finitos para Escoamento de guas Subterrneas Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: 1 Categoria Docente Discente Autor Outro Participante Docente Docente Ano Incio 2002 Especializao:

Descrio: Este projeto tem como objetivo principal a pesquisa em mtodos de elementos finitos e computao de alto desempenho para problemas de escoamentos em meios porosos com aplicaes a guas subterrneas. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Abimael Fernando Dourado Loula Eduardo Lucio Mendes Garcia Maicon Ribeiro Corra Sandra Mara Cardoso Malta Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: 1 Categoria Docente Docente Discente Autor Docente Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Modelagem Matemtica e Computacional de Circulao e Transporte Projeto de Desenvolvimento Modelagem Computacional da Difuso do Conhecimento Ano Incio 2003

Descrio: A anlise atual do problema de transmisso do conhecimento tem duas vertentes: uma vertical que considera os fatores genticos e, portanto hereditrios, na transmisso cultural, incluindo possveis mutaes no processo evolutivo de gerao para gerao, e outra horizontal que considera a transmisso entre membros de uma mesma gerao sem laos geneticamente transmissveis. Este projeto focaliza apenas o segundo aspecto, horizontal, o que implica num intervalo de tempo suficientemente curto para que fatores genticos sejam de menor importncia. O objetivo central, nesta fase, a determinao do tipo de equilbrio da produo de conhecimento ou da evoluo da inovao dentro de um grupo social, em funo de parmetros que regulam o processo e das condies iniciais e de contorno.Tais parmetros seriam, por exemplo: criatividade - que a fonte de gerao de conhecimento; transmisso de conhecimento - que determina como o conhecimento flui ao longo da cadeia; taxa de estmulo - que representa de certa forma o investimento para a produo; e a impedncia cognitiva - que representa a velocidade de aprendizado. A motivao inicial para a investigao deste tema foi antes de tudo terica, simplesmente curiosidade cientfica. A maior contribuio foi feita por Cavalli-Sforza e seus colaboradores, cujo interesse foi verificar como se reproduzem padres culturais no contato entre duas ou mais geraes. Este projeto acrescenta um novo objetivo: a determinao do processo de transmisso com gerao simultnea de conhecimento. O modelo pode ser aplicado para um processo de produo global, ou focalizado em um determinado produto, que teve origem numa descoberta cientfica ou numa inovao tecnolgica bem distinta e chegou at ao aproveitamento pela sociedade. Para tanto, a difuso do conhecimento passa a ser modelada dentro do enfoque de sistemas dinmicos a partir de uma equao de transporte por difuso com reao, que representar toda a dinmica vital do processo. Portanto, ainda que num modelo simplificado, se a determinao do comportamento da soluo para certas relaes de parmetros, condies iniciais e de contorno, puder ser adequadamente simulada, teremos disposio uma ferramenta de grande utilidade para a definio de polticas pblicas para o desenvolvimento tecnolgico, implementando medidas que controlem parmetros tais como: estmulo inovao, educao e treinamento, e investimentos em P&D. Os objetivos principais deste projeto podem ser sintetizados em dois aspectos: o aperfeioamento do modelo j proposto do processo de difuso do conhecimento; e a incluso de parceiros da rea de cincia da cognio para estudar a caracterizao fenomenolgica (psico-pedaggica) do processo de gerao e transmisso de conhecimento. Para isso sero abordados os seguintes tpicos: Tratamento matemtico computacional do modelo proposto, com o objetivo principal de estudar a estabilidade das solues, o que determina se teremos uma sociedade em expanso, estacionria ou em extino. Extenso do modelo, considerando-se a difuso de conhecimento numa sociedade mais complexa na qual existam caminhos preferenciais de difuso e outras representaes de realimentao do processo de gerao e agregao de indivduos ativos, incluindo limites de saturao. Investigao de fenmenos locais, particularmente: o efeito da incluso de plos locais de conhecimento com alta densidade mas no geradores ( transferncia de tecnologia) e a propagao de descobertas locais na cadeia (ocorrncia de slitons?). Interao com pesquisadores da rea da cincia da cognio, neuro-cincias, psico-pedagogia, para a crtica do modelo e anlise de possveis tcnicas de medio dos parmetros e validao do modelo. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Augusto Cesar Noronha Rodrigues Galeo Jaime Edilberto Munoz Rivera Luiz Bevilacqua Maria Elizabeth Puelles Bulnes Sonia Limoeiro Monteiro Teresinha Fres Burnham Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: 1 Categoria Docente Docente Docente Discente Autor Outro Participante Outro Participante Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Modelagem Matemtica e Computacional de Circulao e Transporte Projeto de Pesquisa Modelagem Computacional de Ecossistemas Costeiros Ano Incio 2003

Descrio: Os problemas de circulao e transporte so governados por equaes de balano de massa, momentum e energia, acoplados com a desigualdade de produo de entropia e com relaes constitutivas que caracterizam processos termodinamicamente admissveis. Abrangem uma larga gama de problemas de interesse prtico com aplicaes em diversas reas da engenharia e cincias, dentre os quais encontram-se os escoamentos compressveis e incompressveis e a modelagem da disperso de concentraes. Os modelos acoplados escoamento-transporte, atuando e interagindo com ecossistemas, constituem instrumentos fundamentais na previso de impactos, tomadas de deciso, gesto e planejamento em vrios setores de atividade. A modelagem da circulao hidrodinmica, por exemplo, encontra aplicaes que vo desde a predio de correntes e elevaes de mars, vitais para a navegao, at a determinao do transporte de poluentes, de sedimentos, ou de organismos marinhos em rios, esturios, lagoas, e oceano costeiro. Os processos envolvidos no espalhamento da(s) grandeza(s) de interesse podem acontecer tanto em um meio em repouso, quanto sob a ao das correntes (adveco e difuso turbulenta). Nesta etapa, importante determinar a efetiva relevncia de cada um desses processos em funo das caractersticas da fonte e das condies ambientais do meio fsico receptor. Para tanto, necessrio um modelo hidrodinmico, que serve de base na determinao da adveco da concentrao de interesse (circulao) e um modelo de transporte, onde ingressam como dados o resultado do modelo hidrodinmico, o campo de ventos e as caractersticas da fonte. Atravs da resoluo numrica desses modelos obtm-se, em cada instante de tempo considerado, a distribuio espacial da concentrao, para as situaes caractersticas de escoamento e transporte selecionadas para a simulao. Com relao a sistemas marinhos reais, o conhecimento das caractersticas da circulao no-permanente, a dinmica dos eventos transientes, a distribuio das propriedades fsicas e os fenmenos de transporte que influenciam o ambiente marinho so de fundamental importncia para a determinao das interaes com os ecossistemas locais. Nas regies costeiras, a principal fonte de energia advm dos ventos, os quais so no uniformes e mudam com o tempo. Em conseqncia as guas superficiais reagem gerando correntes principalmente na direo dos ventos, existindo uma componente transversal da corrente devida influncia da rotao da Terra. Resultam da movimentos verticais da coluna d'gua, como as ressurgncias costeiras (no caso de divergncias de guas superficiais), ou subsidncias (no caso da convergncia superficial das guas). Tais fenmenos interferem fortemente na dinmica das populaes costeiras. Os mencionados processos precisam de ferramentas numricas sofisticadas para o estudo das correntes, das variaes das distribuies de temperatura e do ecossistema no espao e tempo em regies limitadas e abertas. Como as guas costeiras possuem uma estrutura vertical estratificada, com a densidade aumentando com a profundidade, os processos dinmicos nas regies costeiras podem ser representados como uma estrutura de camadas bi-dimensionais superpostas uma sobre as outras. Em cada camada considera-se a estrutura vertical uniforme em concordncia com a teoria de guas rasas. Solues analticas para as aplicaes mencionadas so impraticveis para a maioria dos problemas de interesse prtico. Aqui, a metodologia a ser empregada fundamenta-se na busca de aproximaes numricas, construdas em sub-espaos de elementos finitos. Em problemas elpticos, a utilizao da formulao de Galerkin do mtodo dos elementos finitos garante taxas timas de convergncia. Esta propriedade no verificada em problemas puramente hiperblicos ou incompletamente parablicos, (tpicos das aplicaes tratadas neste projeto). Na realidade, aproximaes de Galerkin de problemas predominantemente convectivos, geram algoritmos instveis. Surge, portanto, a necessidade de correo dessas aproximaes. Isto pode ser conseguido via uma formulao variacional consistente, baseada no mtodo de Petrov-Galerkin. Esta ser a formulao a ser empregada na aproximao numrica desses problemas. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Augusto Cesar Noronha Rodrigues Galeo Aureo Quintas Garcia Carlos Carbonel Humman Michel Iskin da Silveira Costa Othon Jambeiro Regina Clia Cerqueira de Almeida Renato Simes Silva Teresinha Fres Burnham Resp. Graduao: Mestrado: 1 Doutorado: 2 Categoria Docente Discente Autor Outro Participante Docente Outro Participante Docente Docente Outro Participante Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Modelagem Matemtica e Computacional de Circulao e Transporte Projeto de Pesquisa Modelagem Computacional de Reservatrios de Petrleo Ano Incio 2000

Descrio: Desenvolvimento de modelos matemticos e computacionais para a simulao de escoamento em meios porosos rgidos ou deformveis orientados para probleamas de interesse da indstria de petrleo. So estudados problemas discretos associados a escomentos misciveis e imisciveis e a injeo de traadores, e probleamas inversos de identificao de prioridades fsicas e geomtrica visando a caracterizao de reservatrios. A modelagem multiecala empregada no estudo de problemas de geomecnica de interesse na rea de prospeo de petrleo tais como estabilidade de poos, subsidncia e compactao de reservatrios. Na soluo numrica destes problemas so utilizados mtodos de elementos finitos associados a tcnicas de decomposio de dominio orientadas para a computao de alto desenpenho em mquinas com memrias distribuidas. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Abimael Fernando Dourado Loula Eduardo Lucio Mendes Garcia Helio Jos Correa Barbosa Joo Nisan Correia Guerreiro Marcio Arab Murad Raul Antonino Feijo Sandra Mara Cardoso Malta Projeto de Pesquisa Modelagem Computacional e Anlise Numrica em Problemas de Escoamento Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: Categoria Docente Docente Docente Docente Docente Docente Docente Ano Incio 2000 Especializao:

Descrio: Este projeto da continuidade as atividades de pesquisa e desenvolvimento nos temas: Modelagem , Anlise e Simulao Computacional de Fluxos em Meios Porosos, e Modelagem Computacional de Circulao e Transporte de massa e calor, incluindo anlise matemtica, anlisse numrica, estudo de convergncia de novos algoritmos e implementao em paralelo, de problemas de escomantos em meios porosos rgidos ou deformveis, escoamento de fluidos no-newtonianos, escoamentos newtonianos snicos e transnicos, circulao ocenica e atmosfrica modelos de guas, rasas, disperso de poluentes. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Abimael Fernando Dourado Loula Augusto Cesar Noronha Rodrigues Galeo Aureo Quintas Garcia Eduardo Lucio Mendes Garcia Elson Magalhaes Toledo Frederic Gerard Christian Valentin Helio Jos Correa Barbosa Jairo Vales de Alencar Ramalho Jiang Zhu Joo Nisan Correia Guerreiro Maicon Ribeiro Corra Marcio Arab Murad Regina Clia Cerqueira de Almeida Sandra Mara Cardoso Malta Resp. Graduao: Mestrado: 1 Doutorado: 3 Categoria Docente Docente Discente Autor Docente Docente Docente Docente Discente Autor Docente Docente Discente Autor Docente Docente Docente Especializao:

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PROGRAMA: 31036015001P-1

LINHA DE PESQUISA: Modelagem Matemtica e Computacional de Circulao e Transporte Projeto de Pesquisa Modelagem Computacional Multi-Escala de Meios Porosos Deformveis Ano Incio 2000

Descrio: Este projeto objetiva a modelagem computacional de meios porosos por meio de tecnicas de``upscaling" (ex. homogeneizacao, modelagem estocastica etc...). Nesta abordagem o meio poroso e constituido por diversas escalas de comprimento e o sistema de equaes diferenciais macroscopico e obtido pela ``homogeneizacao'' do sistema microscopico. Aplicacoes sao obtidas nas areas de Geomecanica de Reservatorios de Petroleo, guas Subterrana, Transporte de Contaminantes em Solos e Aquiferos e Anlise de Tecidos Biolgicos. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Christian Moyne Fernando Alves Rochinha Guzmn Eullio Isla Chamilco Jesus Alexei Orthegon Luis Felipe Feres Pereira Ma To Fu Maicon Ribeiro Corra Marcio Arab Murad Marcos Alcoforado Mendes Rosa Luz Medina Aguilar Sidarta Araujo de Lima Wanderson Rodrigues Bispo Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: 6 Categoria Outro Participante Outro Participante Discente Autor Outro Participante Outro Participante Outro Participante Discente Autor Docente Discente Autor Discente Autor Discente Autor Discente Autor Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Modelagem Matemtica e Computacional de Circulao e Transporte Projeto de Pesquisa Modelagem e Simulao Computacional do Sistema Atmosfera-Terra-Oceano Ano Incio 2001

Descrio: O LNCC tambm realiza pesquisa em meteorologia e oceanografia fsica e abriga o Centro de Modelagem do Sistema Atmosfera-Terra-Oceano (CATO). O CATO realiza previso numrica de tempo em carter operacional para o Sistema de Meteorologia do Estado do Rio de Janeiro (SIMERJ) (www.lncc.br/cato) e desenvolve atividades de pesquisa em modelagem regional da atmosfera, previsibilidade de tempo, estudos climticos, modelagem oceanogrfica e assimilao de dados (AD). Os mtodos de AD visam combinar de forma tima, em um sentido matemtico, campos de modelos com dados de observaes. Eles produzem novos campos, as anlises, que tm erros menores que os dos modelos. Isto faz com que as anlises sejam de enorme importncia para estudos diagnsticos e para previses, pois so usadas como condio inicial para os modelos previsores. Particularmente em modelagem oceanogrfica e AD, o interesse do CATO : (i) no uso do modelo Modular Ocean Model (MOM_3) do GFDL/NOAA para estudos e simulaes da circulao e do estado termo-salino dos oceanos Atlntico e Pacfico tropicais; e (ii) no desenvolvimento matemtico e computacional do mtodo de assimilao seqencial proposto por K. Belyaev em 2000. O mtodo de Belyaev uma verso do filtro de Kalman clssico e possui boas propriedades matemticas e computacionais. Ele j foi aplicado com sucesso para assimilar perfis de temperatura coletados pelas bias dos projetos PIRATA e TAO nos oceanos Atlntico e Pacfico, respectivamente. Dentro das atividades em andamento em ADO esto: (i) a integrao do MOM_3 em domnio global com resoluo de 1o x 1o x 15 camadas por 20 anos com fluxos de momentum da reanlise do NCEP/NOAA e temperatura de superfcie prescritos; (ii) a assimilao de dados dirios do PIRATA a partir de janeiro de 1999; (iii) desenvolvimentos de extenses do mtodo de Belyaev para considerar assimilao de dados multi-variveis e incluso de dados de alta freqncia; (iv) estudos sobre o impacto da assimilao nas simulaes; e (v) desenvolvimento de mtodo de inicializao por modos normais para o MOM_3. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Claudia Marins Alves Clemente Augusto Souza Tanajura Eliane Maracaj Porto Fabola Valria Barreto Teixeira Jean Felix de Oliveira Jos Walter Crdenas Konstantin Pavlovich Belyaev Patricia Snez Pacheco Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: 4 Categoria Discente Autor Docente Outro Participante Discente Autor Discente Autor Outro Participante Outro Participante Discente Autor Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Modelagem Matemtica e Computacional de Circulao e Transporte Projeto de Pesquisa Modelagem Matemtica e Computacional para Processos de Biorremediao em guas Subterrneas Ano Incio 2004

Descrio: Introduo A modelagem matemtica e computacional dos mais diversos problemas ambientais tem sido considerada uma ferramenta essencial no entendimento e na previso da evoluo dos fenmenos fsicos, qumicos, biolgicos e de outras naturezas que os governam. Um problema ambiental bastante conhecido em alguns pases com escassez de recursos hdricos e que atualmente tem despertado interesse at mesmo onde eles existem em abundncia o problema da contaminao das guas subterrneas. A grande preocupao a busca por tecnologias para a restaurao de stios contaminados bem como estratgias para simul-las e assim poder avaliar as suas atuaes e cincias. Em particular, os principais problemas relacionados com a contaminao dos recursos hdricos na Regio Norte do Brasil esto relacionados a quatro atividades, a saber: 1. Uso de defensivos agrcolas. Agricultura e a pecuria extensiva, que ocorrem prximo nas estradas e nas grandes cidades da Amaznia, causando: i)eroso e assoreamento dos cursos dgua, ii) desmatamento, iii) contaminao por agrotxicos; 2. Atividades de minerao. Garimpo nas sub-bacias dos rios Amazonas, Madeira e Tapajss, causando: i) assoreamento, ii) poluio por metais pesados e eroso dos rios; 3. Atividades industriais. Indstria de ferro gusa no Par e Plo industrial na Zona Franca de Manaus, causando poluio hdrica e do solo 4. Aterros Sanitrios: contaminao causada pelos lixes por meio da percolao de substncias poluidoras (chorumes) dos rios e lenis d'gua que abastecem de gua potvel as cidades de Belm e Manaus, entre outras. Assim, a construo de ferramentas computacionais capazes de simular os efeitos da contaminao dos aquferos uma importante etapa no entendimento (conhecimento dos processos ambientais e sua capacidade regenerativa) das principais questes relacionadas ao desenvolvimento sustentvel dessa regio. Deste modo, a modelagem matemtica e computacional mostra-se claramente como um instrumento forte de anlise, argumentao e dilogo entre empresas desenvolvedoras de tecnologias de remediao, empresas potencialmente contaminadoras e rgos de fiscalizao ambiental. 2 Objetivos Neste projeto, deseja-se desenvolver um modelo matemtico e computacional verstil que incorpore o transporte de mltiplos contaminantes e sub-modelos de biodegradao alternativos (Monod de taxa mnima, multiplicativo, etc) para a simulao de tcnicas de biorremediao in situ objetivando estudar a influncia dos processos de biodegradao no transporte de mltiplos contaminantes em meios porosos homogneos e heterogneos bidimensionais e visando diversos problemas de remediao natural de interesse (em particular aqueles j citados na seo anterior). Inicialmente, ser considerado o processo de biorremediao por ser um importante, seguro e econmico mtodo de transformao de substncias txicas em substncias inofensivas na sade humana. A utilizao de microorganismos vem emergindo como uma das vrias alternativas para a remoo de poluentes do ambiente e restaurao de reas contaminadas. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Neyva Maria Romero Paula Rogria Lima Couto Rigoberto Gregrio Sanabria Castro Sandra Mara Cardoso Malta Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: 1 Categoria Outro Participante Discente Autor Outro Participante Docente Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Modelagem Matemtica e Computacional de Circulao e Transporte Projeto de Pesquisa Modelagem Matemtica e Mtodo de Elementos Finitos Multi-Escalas para EDPs. Ano Incio 2000

Descrio: A linha de pesquisa est baseada no desenvolvimento e anlise matemtica de modelos e mtodos numricos visando a simulao de problemas contendo mltiplas escalas. Tcnicas de anlise assinttica e de decomposio de domnios so aplicadas no desenvolvimento de modelos de equaes diferenciais parciais (EDP) e de condies de contorno equivalentes visando a modelagem da iterao entre as diferentes escalas. Mtodos de elementos finitos adaptados a resoluo de problemas com multi-escalas e/ou camadas limites so desenvolvidos e analisados matematicamente. A pesquisa bsica direcionada resoluo de problemas reais e de interesse prtico oriundos de diferentes reas do conhecimento. A aplicao da pesquisa bsica feita atravs do desenvolvimento de softwares. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Alexandre Loureiro Madureira Frederic Gerard Christian Valentin Gabriel Barrenechea Jairo Vales de Alencar Ramalho Leopoldo Luis Cabo Penna Franca Rodolfo Araya Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: 1 Categoria Docente Docente Outro Participante Discente Autor Outro Participante Outro Participante Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Modelagem Matemtica e Computacional de Circulao e Transporte Projeto de Pesquisa PRONEX 2003: Modelagem Computacional Em Engenharia e Cincias Aplicadas Ano Incio 2003

Descrio: O foco deste Projeto o desenvolvimento de Modelos Computacionais capazes de prever da forma mais realista possvel a resposta de sistemas fsicos, qumicos e/ou biolgicos nas reas de Engenharia e Cincias Biolgicas e da Natureza. Em termos matemticos, questes relativas anlise da existncia, unicidade e estabilidade da soluo so fundamentais para a confiabilidade dos modelos computacionais propostos. Estabelecido o modelo matemtico, a sua aproximao via modelo numrico e a algoritmizao do mtodo de soluo compe o modelo matemtico-computacional, para o qual o estabelecimento dos erros de aproximao, taxas de convergncia e computabilidade dos algoritmos propostos determina o grau de sua aplicabilidade real. No escopo deste Projeto, ao modelo anteriormente elaborado alia-se o uso de computao de alto desempenho, objetivando a otimizao da performance dos aplicativos a serem desenvolvidos. Uma metodologia comum de abordagem e soluo de problemas em reas disciplinares distintas permite a articulao das pesquisas propostas neste Projeto. Objetivando destacar as peculiaridades inerentes s classes de problemas que sero tratados no mbito deste Projeto, adotamos uma estrutura semelhante do PRONEX anterior, consolidando as atividades de pesquisa em trs grandes reas de atividades, a saber: Atividade 1: Modelos Computacionais Atividade 2: Anlise Matemtica e Numrica Atividade 3: Mtodos Computacionais A Atividade 1 concentra-se fundamentalmente na fenomenologia subjacente Modelagem Computacional dos Problemas de Engenharia e Cincias Aplicadas a serem abordados neste Projeto. Nesta Atividade o foco principal das pesquisas a serem desenvolvidas recai na construo de modelos que quantificam processos de evoluo e de equilbrio. De uma forma concisa ela aborda: i) os princpios fsicos, qumicos e/ou biolgicos, que governam o fenmeno a ser modelado; ii) as relaes constitutivas que descrevem as interaes entre os agentes do processo; iii) as condies de fronteira que restringem o objeto da anlise; iv) as condies iniciais que individualizam o processo de evoluo do sistema, e/ou as restries que asseguram o seu estado de equilbrio. Estrutura-se esta Atividade em Temas, que aglutinam um conjunto coerente de atividades multidisciplinares correlatas, com foco interdisciplinar definido. Assim, a Atividade 1 deste Projeto PRONEX consolidada nos Temas: Modelagem Computacional de Circulao e Transporte Modelagem Computacional Multi-Escala Modelagem Computacional na Anlise de Sensibilidade Mudana de Forma e Topologia e suas Aplicaes em Cincias Mecnicas, Geofsica e Mdicas Modelagem Computacional de Biossistemas e Bioinformtica Neste ultimo tema inclui-se a Modelagem do Sistema Cardiovascular, a Modelagem Molecular de Macromolculas Biolgicas e Bioinformtica e Genmica Evolutiva. A Atividade 2 focaliza a estrutura e as propriedades matemticas, numricas e computacionais que validam: a consistncia dos modelos desenvolvidos e a acuracidade, convergncia e eficincia dos algoritmos e mtodos computacionais elaborados. Esta Atividade consolidada nos Temas: Formulao Matemtica Anlise Numrica Otimizao A Atividade 3 sintetiza o desenvolvimento de tcnicas e simuladores computacionais, englobando os Temas: Visualizao Cientfica e Animao de Fluidos Ambientes Colaborativos Imersivos de Mnima Despesa Computao Cientfica e Distribuda Uma descrio detalhada destes temas pode ser obtida em http://www.lncc.br rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Augusto Cesar Noronha Rodrigues Galeo Resp. Graduao: Mestrado: 1 Doutorado: 23 Categoria Docente Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Modelagem Matemtica e Computacional de Problemas de Equilbrio e Otimizao Projeto de Pesquisa Anlise de Sensibilidade Mudana de Forma e suas Aplicaes em Problemas de Engenharia Ano Incio 2001

Descrio: Os resultados obtidos na Anlise de Sensibilidade de primeira ordem sao extendidos para a Anlise de Sensibilidade de segunda ordem e assim sucessivamente. Na derivada segunda da energia potencial surge um novo tensor que denominamos tensor momento energia de segunda ordem, com propriedades similares ao tensor de primeira ordem introduzido por Eshelby. A Anlise de Sensibilidade a Mudana de Forma e aplicada anlise de slidos elsticos que contm algum tipo de dano j seja distribudo em uma regio ou concentrado em uma fissura. Introduzindo uma mudana de forma que represente o incremento da deteriorao j seja, uma rea com danos ou uma fissura, obtemos mediante a anlise de sensibilidade a energia dissipada correspondente ao crescimento unitrio da deteriorao para ambas condies. Por este procedimento chegamos a parmetros cujos valores comparados a valores caractersticos de cada material, permitem estabelecer critrios de propagao e da estabilidade da mencionada propagao j seja que o dano esteja distribudo em parte do slido ou concentrado em uma ou mais fissuras. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Edgardo Omar Taroco Aliano Raul Antonino Feijo Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: 1 Categoria Docente Docente Especializao:

Projeto de Pesquisa Ano Incio Mecnica dos Slidos Terica Aplicada e Computacional e suas Aplicaes na Simulao Computacional de 1999 Sistemas Complexos Descrio: Pesquisa e desenvolvimento nos seguintes temas: formulaes variacionais, anlise de sensibilidade, estimadores de erro, gerao automtica de malhas de elementos finitos, visualizao. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Luiz Bevilacqua Marco Lcio Bittencourt Raul Antonino Feijo Projeto de Pesquisa Meta-Heursticas inspiradas na Natureza Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: Categoria Docente Outro Participante Docente Ano Incio 2002 Especializao:

Descrio: Pesquisa em algoritmos computacionais inspirados na Biologia (computao evolucionista, ant-colony, swarm optimization, redes neuronais) e na Fsica (simulated annealing) visando sua aplicao em problemas de interesse nas Cincias e nas Engenharias. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Carlos Cristiano Hasenclever Borges Fernanda Maria Pereira Raupp Helio Jos Correa Barbosa Laurent Emmanuel Dardenne Luciana Rocha Pedro Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: 1 Categoria Docente Docente Docente Docente Discente Autor Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Modelagem Matemtica e Computacional de Problemas de Equilbrio e Otimizao Projeto de Pesquisa Modelagem Computacional no Projeto timo e na Avaliao de Integridade de Tubulaes e Vasos de Presso Ano Incio 2000

Descrio: Mediante a aplicao da anlise de sensibilidade e a introduo do conceito de foras configuracionais se modela computacionalmente de forma unificada, o comportamento, a anlise de integridade e a avaliao de vida til de tubulaes e vasos de presso em regime inelstico (plasticidade, creep e viscoplasticidade) incluindo a presena de defeitos e sua evoluo no tempo. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Edgardo Omar Taroco Aliano Fernando Pereira Duda Joo Nisan Correia Guerreiro Raul Antonino Feijo Projeto de Pesquisa Modelagem e Simulao Computacional do Sistema Cardiovascular Humano Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: 0 Categoria Docente Outro Participante Docente Docente Ano Incio 2000 Especializao:

Descrio: Pesquisa e desenvolvimento de modelos para a simulao computacional do sistema cardiovascular humano. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Antonio Carlos Salgado Guimares Eduardo Alberto Fancello Enzo Alberto Dari Gustavo Buscaglia Jos Karam Filho Luiz Bevilacqua Marcelo Venere Marco Lcio Bittencourt Raul Antonino Feijo Santiago Urquiza Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: Categoria Outro Participante Outro Participante Outro Participante Outro Participante Docente Docente Outro Participante Outro Participante Docente Outro Participante Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Modelagem Matemtica e Computacional de Problemas de Equilbrio e Otimizao Projeto de Pesquisa PRONEX 2003: Modelagem Computacional Em Engenharia e Cincias Aplicadas Ano Incio 2003

Descrio: O foco deste Projeto o desenvolvimento de Modelos Computacionais capazes de prever da forma mais realista possvel a resposta de sistemas fsicos, qumicos e/ou biolgicos nas reas de Engenharia e Cincias Biolgicas e da Natureza. Em termos matemticos, questes relativas anlise da existncia, unicidade e estabilidade da soluo so fundamentais para a confiabilidade dos modelos computacionais propostos. Estabelecido o modelo matemtico, a sua aproximao via modelo numrico e a algoritmizao do mtodo de soluo compe o modelo matemtico-computacional, para o qual o estabelecimento dos erros de aproximao, taxas de convergncia e computabilidade dos algoritmos propostos determina o grau de sua aplicabilidade real. No escopo deste Projeto, ao modelo anteriormente elaborado alia-se o uso de computao de alto desempenho, objetivando a otimizao da performance dos aplicativos a serem desenvolvidos. Uma metodologia comum de abordagem e soluo de problemas em reas disciplinares distintas permite a articulao das pesquisas propostas neste Projeto. Objetivando destacar as peculiaridades inerentes s classes de problemas que sero tratados no mbito deste Projeto, adotamos uma estrutura semelhante do PRONEX anterior, consolidando as atividades de pesquisa em trs grandes reas de atividades, a saber: Atividade 1: Modelos Computacionais Atividade 2: Anlise Matemtica e Numrica Atividade 3: Mtodos Computacionais A Atividade 1 concentra-se fundamentalmente na fenomenologia subjacente Modelagem Computacional dos Problemas de Engenharia e Cincias Aplicadas a serem abordados neste Projeto. Nesta Atividade o foco principal das pesquisas a serem desenvolvidas recai na construo de modelos que quantificam processos de evoluo e de equilbrio. De uma forma concisa ela aborda: i) os princpios fsicos, qumicos e/ou biolgicos, que governam o fenmeno a ser modelado; ii) as relaes constitutivas que descrevem as interaes entre os agentes do processo; iii) as condies de fronteira que restringem o objeto da anlise; iv) as condies iniciais que individualizam o processo de evoluo do sistema, e/ou as restries que asseguram o seu estado de equilbrio. Estrutura-se esta Atividade em Temas, que aglutinam um conjunto coerente de atividades multidisciplinares correlatas, com foco interdisciplinar definido. Assim, a Atividade 1 deste Projeto PRONEX consolidada nos Temas: Modelagem Computacional de Circulao e Transporte Modelagem Computacional Multi-Escala Modelagem Computacional na Anlise de Sensibilidade Mudana de Forma e Topologia e suas Aplicaes em Cincias Mecnicas, Geofsica e Mdicas Modelagem Computacional de Biossistemas e Bioinformtica Neste ultimo tema inclui-se a Modelagem do Sistema Cardiovascular, a Modelagem Molecular de Macromolculas Biolgicas e Bioinformtica e Genmica Evolutiva. A Atividade 2 focaliza a estrutura e as propriedades matemticas, numricas e computacionais que validam: a consistncia dos modelos desenvolvidos e a acuracidade, convergncia e eficincia dos algoritmos e mtodos computacionais elaborados. Esta Atividade consolidada nos Temas: Formulao Matemtica Anlise Numrica Otimizao A Atividade 3 sintetiza o desenvolvimento de tcnicas e simuladores computacionais, englobando os Temas: Visualizao Cientfica e Animao de Fluidos Ambientes Colaborativos Imersivos de Mnima Despesa Computao Cientfica e Distribuda Uma descrio detalhada destes temas pode ser obtida em http://www.lncc.br rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Augusto Cesar Noronha Rodrigues Galeo Resp. Graduao: Mestrado: 1 Doutorado: 23 Categoria Docente Especializao:

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LINHA DE PESQUISA: Modelagem Matemtica e Computacional de Problemas de Equilbrio e Otimizao Projeto de Pesquisa Sistemas Termo Magneto Elsticos e Matrias Mistas Ano Incio 2000

Descrio: Estuda-se os modelos lineares e no-lineares com especial nfase as propriedades assinitticas. Tambm estuda-se as Matrias Mistas, leis constitutivas e seus modelos linear e no-linear. rea de Concentrao: Modelagem Computacional Alunos Envolvidos: Equipe Gustavo Alberto Perla Menzala Guzmn Eullio Isla Chamilco Higidio Portillo Oquendo Jaime Edilberto Munoz Rivera Luci Harue Fatori Resp. Graduao: Mestrado: Doutorado: 1 Categoria Docente Discente Autor Outro Participante Docente Outro Participante Especializao:

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