Beruflich Dokumente
Kultur Dokumente
Microbiologa clnica
RAMAS DE LA MICROBIOLOGIA
CAMPOS DE TRABAJO
Mdica o clnica Odontolgica (oral, (oral bucal) Veterinaria Inmunologa Industrial Farmacutica Alimentaria o bromatologa Agrcola Fitopatologa Ingeniera sanitaria
MICROBIOLOGIA MEDICA
Es el estudio de las interacciones entre los humanos y los microorganismos con los que coexisten
Comensales
Colonizan el cuerpo sin causar dao Microbiota o flora microbiana normal
Patgenos
Producen dao en el husped humano
Invasin
Tipo
Priones Virus Bacterias Hongos Parsitos
Virulencia microbiana
Habilidad intrnseca relativa de un microorganismo
de
causar enfermedad.
Priones
Son protenas con capacidad patognica Encefalitis espongiforme
Enfermedades de las
Virus
Parsitos intracelulares obligados muy pequeos No se puede ver con microscopio de luz No tienen sistema de produccin de energa Un solo tipo de cido nucleco: ADN o ARN Replicacin viral utilizando clulas husped.
Bacterias
Hongos
Clulas Eucariticas Reproduccin por gemacin o formando colonias (mohos) Saprofitos ambientales y no necesitan producir infeccin humana
Procariotes pues no tienen membrana nuclear Tienen un solo cromosoma en la forma de un nucleoide Tienen ambos tipos de cidos nuclecos Presentan pared celular Se reproducen por fisin binaria Necesidades nutricionales son variables
Parsitos
Protozoarios y organismos eucariticos multicelulares Ciclo de vida complejo con varios huspedes.
Presentacin clnica
Diagnstico
Clnico: signos y sntomas Epidemiolgico: poblacin Microbiolgico: identificacin del agente etiolgico
Forma de inicio: brusca o insidiosa Sntomas: dolor, sensacin de alza trmica, debilidad progresiva Sgnos: fiebre, perdida de peso, hepatomegalia, petequias, etc. C bi en f Cambio funcin i fi fisiolgica i l i Pruebas anormales de laboratorio
Anlisis microbiolgico
Historia clnica y epidemiolgica Examen clnico Localizacin anatmica Microorganismo sospechoso Pruebas microbiolgicas: coloraciones, cultivos, y pruebas de susceptibilidad. Exmenes histopatolgicos Exmenes inmunolgicos Exmenes radiolgicos
Un resultado acadmicamente exacto en microbiologa clnica no es muy til para un paciente que ya esta muerto
Filogenia
PROCARIOTES Y EUCARIOTES
Dr. Alfredo Guilln Oneeglio
DIVISIO SIONES
Procariotae i t Protista
Eucariotae
REINO Bacteria Archae TIPO UniDE celular CLUo LAS colonias de clulas
Fungi
Plantae
Animalia
UniUnicelular MultiMulticelulares (algunos) celulares celulares (mayora) MultiMulticelulares celulares (mayora) (algunos)
Estructura bacteriana
Relacin entre los diferentes sujetos y la resolucin del ojo humano, el microscopio ptico y el microscopio electrnico
Clula tipo: bacteria Microorganismo unicelulares Divisin simple o fisin binaria. Pared celular diferente:
Gram positivas Gram negativas Micobacterias. Micobacterias
Coloracin de Gram
Desarrollada por Christian Gram en 1884 B. Pasos: 1. Cristal violeta tincin primaria 2. Iodo de Gram - mordiente 3. 3 Alcohol agente decolorante 4. Safranina - contracolorante
Cromosoma circular nico compuesto t por ADN y no presentan membrana nuclear Membrana citoplasmtica
Transporte Produccin de energa g Biosntesis especializada.
26
Coloracin de Gram
Gram
27
28
Bacterias espiriladas
Vibrios
Espirilos
Espiroquetas
29
pyogenes Staphylococcus aureus Micrococcus luteus Neisseria meningitidis 2. Bacilos Bacillus anthracis Escherichia coli
30
Streptococcus
Glicocalix
Estructuras externas
Cpsula y Capa mucosa Flagelos Fimbrias y Pili
31
Estructura formada por carbohidratos en la superficie de la bacteria Presente solo en algunas bacterias (Gram + y Gram -)
casos por protenas. Esta bien adherido Capa mucosa (slime layer): adherencia laxa, formada por carbohidratos extracelulares
32
Glicocalix
Glicocalix: Cpsula
Composicin: polisacridos complejos o por polipptidos Localizada en la superficie de la clula, se encuentra envolviendo a una o ms clulas Da un aspecto viscoso a la colonia. No tiene afinidad por los colorantes Microscopa: montajes hmedos con tincin negativa (tinta china), halos bordeando las clulas. Su presencia se puede demostrar (serotipia) con sueros especficos anticapsulares.
34
Cpsula
33
Slime layer
Funciones de la cpsula
Klebsiella pneumoniae
Adherencia Evitar la fagocitosis Resistencia a la desecacin Reservorio para algunos nutrientes Depsito de productos de desecho.
35
Flagelos
Estructuras proteicas filamentosas largas, largas delgadas Dimetro uniforme: 12 a 30 nm Longitud es varias veces el tamao de la clula. Microscopio electrnico:
flagelos se originan en la membrana celular Estn adheridos mediante un gancho, un cilindro y varios anillos
37
38
Disposicin de flagelos
Atricos
Shigella
Monotricos
Vibrio
Anfitricos
Campylobacter
L f ti Lofotricos
Pseudomonas
Peritricos
Escherichia
39
10
Deteccin de flagelos
Filamentos axiales
Observando su presencia:
Coloraciones: aumentar el dimetro de los flagelos usando
Observando el movimiento:
Microscopio de campo oscuro, de contraste
Se encuentran solamente en espiroquetas: Treponema, Leptospira y Borrelia. Composicin: protenas fibrilares que encuentran alrededor de las bacterias adheridos a ambos polos de la clula. Localizacin: debajo de la membrana externa Funcin: dar movimiento rpido a las espiroquetas Nmero:
T. microdentium tiene dos filamentos por clula. T. reiteri tiene de 6 a 8.
42
Espiroquetas
Pili o Fimbrias
Apndices filamentosos cortos, ms rectos y delgados que los flagelos y que cubren a las bacterias Gram negativas. Tamao: 4 a 8 nm Nmero: 100 a 200 fimbrias Composicin: protenas (lectinas) dispuestas en forma h li id l helicoidal. Funcin: adherencia bacteriana a lugares especficos de la superficie de las clulas.
44
Filamento axial
Cubierta externa
43
Pared celular
11
Pili sexual
Son morfolgica y qumicamente similares a las fimbrias Menor nmero: 1 - 4 por bacteria Distribucin al azar en la superficie de la bacteria. Funcin: transferencia del DNA durante la conjugacin bacteriana.
45
46
Pili sexual
Pared Celular
Pared rgida
Proteccin en medios de baja presin osmtica Da la forma a las bacterias Ausente en pocos casos (micoplasmas)
Compuesto por peptidoglicn Peso seco de la pared celular es 20-30% del peso total de la bacteria. El contenido de Ca y Mg es de 0.016% Espesor: 0.15 a 0.5 nm (0.8 en Lactobacillus acidophilus).
48
47
12
Pared Celular
Peptidoglicn
Gram positivo
49
Gram negativo
50
Hexosas: N-acetilglucosamina cido N-acetil-murmico. En NAM se fijan tetrapptidos. L-alanina cido D-glutmico cido diamino pimlico D-alanina
Gram positivo
51 52
Gram negativo
13
53
54
Membrana Citoplasmtica
Membrana Citoplasmtica
Funciones:
Tiene permeabilidad selectiva Controla el transporte
de la mayora de compuestos que ingresan o salen de la clula. Sistema de transporte de electrones y protones liberados durante la oxidacin bacteriana (sistema de energa). Contiene enzimas para la sntesis de la pared celular y segrega enzimas hidrolticas extracelulares. Asegura la separacin de material nuclear (DNA) a las clulas hijas durante la divisin celular.
55
56
14
Transporte activo
Mesosomas
Invaginaciones de la membrana membrana, usualmente de forma irregular. Se observan sobre todo en bacterias Gram positivas Funciones
posiblemente ibl t sirven i para aumentar t lla superficie fi i
d de lla membrana celular (respiracin y transporte) posiblemente servir de sitio de unin al nucleoide.
57 58
Mesosomas
Citoplasma
Composicin:
80 % de agua, cidos nuclecos, protenas,
lpidos,
59
15
ADN Bacteriano
No tiene membrana nuclear: Procariotes Concentrado en el cromosoma bacteriano como un nucleoide. Presentando una larga molcula de DNA circular de doble cadena. Representa 2 a 3% del peso de la clula y ocupa el 10% del volumen celular.
Plsmidos
Molcula o unidad gentica extracromosomal no esencial Capacidad de replicacin autnoma Cadenas dobles de DNA circular. Son ms pequeos que los cromosomas bacterianos. La mayora de los plsmidos estan entre 1/10 y 1/100 del tamao del cromosoma bacteriano.
62
61
Ribosomas
Ribosomas
Son estructuras complejas compuestas de varias molculas de RNA y protenas. Miden aproximadamente 20 nm de dimetro. Composicin: dos subunidades
una con un coeficiente
Funcin: sntesis proteica. Sitio de accin de algunos antibiticos que impiden la sntesis de protenas.
63 64
16
Inclusiones Citoplasmticas
Esporas
Almacn temporal de exceso de metabolitos Su presencia y cantidad varia con el tipo de bacteria y su actividad metablica. Tipos:
Grnulos de glicgeno, cido polihidroxibutrico, fosfatos
inorgnicos, azufre o compuestos de nitrgeno. Grnulos de volutina o metacromticos: polmeros de fosfatos de alto peso molecular, de color rojizo cuando se colorea con azul de metileno, se presentan en Corynebacterium diphtheriae.
Cuerpos ovales de pared gruesa, que es una clula de alta resistencia. Caracterstico de Bacillus y Clostridium. Sntesis de dentro del citoplasma vegetativo de un nuevo citoplasma destinado a convertirse en espora. Formacin de cido dipicolnico (que no se encuentra en la clula vegetativa), y grandes cantidades de Calcio. Cortex: complejo Ca++- cido dipicolnico-peptidoglican En su interior se encuentra el material gentico.
65
66
Esporas
Partes de la espora
La localizacin de la espora:
central paracentral subterminal terminal.
Forma: oval o esfrica. Su dimetro puede ser mayor o menor que el de la bacteria y puede deformar a la bacteria. Las esporas son muy resistentes a los agentes fsicos y qumicos adversos.
67 68
Core - Citoplasma deshidratado, contiene DNA, DNA ribosomas, ribosomas enzimas, etc. Lo que necesita para cuando vuelva a la forma vegetativa. Cortex - Capa de pared celular/peptidoglican. Cubierta -capas capas de protena impermeables a muchas sustancias qumicas (resistencia)
17
Patogenicidad bacteriana
69
Conceptos generales
Tipos de patgenos
Oportunistas
Trasmisibilidad: entre 2 huspedes o un reservorio a un husped Infectividad: capacidad de romper las defensas del husped Virulencia: variable multifactorial, que denota la capacidad del patgeno de daar al husped
Virulencia clnica: relacin compleja husped parsito, en que la capacidad de producir dao esta en relacin con la resistencia del husped.
Rara vez causan enfermedad en un husped con defensas inmunolgicas y anatmicas intactas Alteracin por enfermedad congnita, uso de terapia inmunosupresiva o ciruga. Muchos son parte de la flora normal Introduccin a otros lugares anatmicos o eliminacin de la flora competitiva por el uso de antibiticos Pueden producir una enfermedad en personas sanas con defensas inmunolgicas intactas Producen enfermedades mas graves en inmunosuprimidos
Primarios
18
Factores de virulencia
Facilitan la patognesis Corrientemente la bacteria necesita varios Intervienen en diferentes estadios de la enfermedad No todas las cepas son igualmente virulentas Pueden causar enfermedades diferentes dependiendo del tipo de factor de virulencia Regulacin coordinada para evitar expresin de factores innecesarios y desperdicio de energa
Proceso de la infeccin
Ingreso Colonizacin Invasin Evitar los mecanismos de defensa Produccin de toxinas Otros mecanismos de agresin
Vas de ingreso
Tracto respiratorio Tracto gastrointestinal Vas urinarias Va genital Piel y mucosas Trauma en piel y mucosas: picadura de insectos, ciruga,
Como ingresan
Contacto directo Contacto indirecto Vehculos o fomites Reservorios Flora normal de la piel
19
Colonizacin
Adherencia a clulas blanco Multiplicacin por adquisicin de nutrientes del husped Resistencia a los mecanismos de defensa del husped destinados a combatir la infeccin
Adherencia a una superficie de una clula de la mucosa Evita mecanismos inespecficos con peristalsis o los sistemas de lavado del mucus, saliva u orina que elimina a los MO no adheridos Que intervienen
Receptores en la membrana celular de las clulas que son usualmente carbohidratos. Ligandos o receptores en las bacterias que son protenas. Propiedades no especificas de la pared celular de las bacterias: carga elctrica de superficie, hidrofobicidad
Colonizacin
Colonizacin
Pili o fimbrias
Superficie de bacterias Gram negativas Identificacin por composicin
Adhesinas no pili
Flagelos
Penetracin en la mucosa intestinal en Vibrio cholerae
Hemaglutinina filamentosa en B. pertussis Hemaglutinina mannosa resistente en S. typhimurium Hemaglutinina fibrilar en Helicobacter pylori Protenas de membrana externa (OMPs) en N. gonorrhoeae y EPEC Exopolisacridos en bacterias Gram positivas: S. mutans en caries, S. epidermidis en prtesis Glicoproteina multifuncional presente en plasma y asociado a superficies de clulas de la mucosa S. pyogenes, S. aureus, Treponema pallidum
Unin a Fibronectina
20
Invasin
Mecanismos de defensa
Defensas fsicas y qumicas Inmunidad no especfica Inmunidad especfica
Aspectos histricos
Taxonoma Bacteriana
21
Definiciones
Taxonoma: Es la ciencia de la clasificacin, clasificacin identificacin y nomenclatura. Clasificacin: arreglo ordenado de las bacterias en grupos
Definiciones
Nomenclatura
Como se definen las caractersticas
de una especie y se
Definicin: Especie
Observacin de colonias
Bacteria con determinadas caractersticas o un grupo de bacterias que se parecen unas a otras en los aspectos ms importantes
87
22
Definiciones
Cepa bacteriana: Poblacin de organismos que se origina de un slo organismo o de un aislamiento en cultivo puro. Biovar: Variantes bacterianos, caracterizados por diferencias bioqumicas o fisiolgicas. Serogrupo y serovar (serotipo): Identificacin de antgenos somaticos y flagelares, flagelares utilizando sueros especficos. Fagovar: Identificacin de antgenos de superficie especficos, utilizando fagos.
90
Rasgos estructurales
Coloracin de Gram
Gram positivo Gram negativo No se colorea con Gram
Disposicin
Diplo Estrepto Estafilo Tetrada Sarcina Empalizada Letras chinas
Morfologa
Cocos Bacilos Cocobacilos Espirales
91
92
23
Rasgos fisiolgicos
Temperatura Requerimiento R i i t d de oxgeno pH
Metabolismo oxidativo: necesita O2 para degradar la glucosa Metabolismo fermentativo: Glucosa es degradada anaerobicamente No fermentadores ni oxidadores
Rasgos ecolgicos
Medio ambiente Componentes de una determinada flora
Produccin de enzimas
Detoxificantes u oxidativas: Catalasa, Oxidasa, etc. Enzimas proteolticas: Hemolisina, Coagulasa, etc.
93 94
Dendograma
50 Porcentaje de similaridad 60 70 80
Rasgos genticos
90 100
bacteriano
Contenido de G-C:
Fraccin molar % G-C =
G+C G+C+A+T
Cepa
24
Nutricin bacteriana
Cultivo de microorganismos
Factores
Disponibilidad de nutrientes apropiados Oxgeno u otros gases Humedad pH ptimo Temperatura apropiada Medio libre de inhibidores Se debe prevenir la contaminacin
El crecimiento se define como un incremento de los constituyentes celulares. celulares Se puede producir un incremento del tamao del microorganismo, del nmero de bacterias o de ambos.
25
Cultivo de microorganismos
Requerimiento de oxgeno
siderforos
pH
Optima
15 C C 20-30 C 20-40 C 55-65 C 80 C
20 35 45 100 113
Muchas bacterias crecen a pH neutro Algunas pueden sobrevivir / crecer en pH cido o pH alcalino
26
Curva de crecimiento
Tiempo de generacin
Tiempo que necesita una bacteria para aumentar su nmero al doble El tiempo de generacin es variable dependiendo de la especie bacteriana:
Escherichia coli: 20, Mycobacterium
tuberculosis: 14-18 h.
Al tiempo 0 haban presentes 100 bacterias El tiempo de generacin es de 2 horas Despus de 8 horas la masa bacteriana es de: 100 x 28/2 = 1600 bacterias = 1,6 x 103
Metabolismo bacteriano
colonias
27
Definicin
Metabolismo
Metabolismo es el conjunto de reacciones bioqumicas que permiten el crecimiento de un organismo y creacin de nuevas clulas.
Coenzimas y Cofactores
CATABOLISMO
Coenzimas
Cofactores
Son orgnicos por naturaleza Una porcin no-proteca de la molcula enzimtica Muchos son sintetizados a partir de vitaminas:
Mg Zn Mn
28
Catabolismo de carbohidratos
Los azucares son degradados para generar energa. Se utiliza algo de ATP pero se produce mucho mas Las bacterias utilizan 3 vas
Va glicoltica
o Embden-Meyerhof-Parnas Va Pentosa fosfato paralela a la glicoltica Va Entner-Doudoroff - alternativa a la glicoltica y a la de la pentosa fosfato
Glucosa
Va Glicoltica Embden-Meyerhof-Parnas
Va comn No requiere oxgeno Usado por bacterias aerobias y anaerobias, animales y plantas Puntos clave:
ATP ADP
Va Glicoltica
Glucosa 6 Fosfato
Fructosa 6 Fosfato
ATP ADP
Dihidroxiacetona Fosfato
Gliceraldehido 3 Fosfato
NAD NADH
NAD
NADH
3 Fosfo Glicerato
Glucosa
C6 ADP
Piruvato
C3 ATP
2 Fosfo Glicerato
H2O
2 molculas de 3 carbonos Transferencia de electrones a la coenzima NAD Captura de energa en la forma de ATP
Piruvato
29
Va Entner-Doudoroff
Alternativa a las vas glicolticas y pentosa fosfato Glucosa va a una serie de reacciones cortas hasta gliceraldehido 3-P Gliceraldehido 3-P sigue los 5 ltimos pasos de la gliclisis Se genera 1 ATP Ejemplo
Pseudomonas aeruginosa
Corre en forma paralela con la gliclisis Comn en bacterias, plantas y animales Provee de precursores para biosntesis: Ej. Ribosa para cidos nucleicos, eritrosa para sntesis de aminocidos. Provee de poder reductor en forma de NADPH para uso en la biosntesis. Genera 1 ATP Ejemplos:
E. coli B. subtilis
Respiracin En presencia de O2
Piruvato entra la ciclo de los ATC [Krebs] Decarboxilacin oxidativa Acetil-CoA Acetil-CoA + Oxalacetato = Citrato Serie de reacciones oxidativas Regreso a oxalacetato Producto final: 2 moles de CO2, 3 moles de NADH, 1 FADH2, 1 GTP
Respiracin
El aceptor del electrn final es una molcula inorgnica
Fermentacin
El aceptor del electrn final es una molcula orgnica
30
Ciclo de Krebs
Respiracin aerbica
NADH y FADH2 entran a la cadena de transporte de electrones (cadena respiratoria) Electrones son pasados de portador a portador Cada portador es reducido cuando toma los electrones y es oxidado cuando lo pasa al siguiente portador en la cadena La energa liberada es capturada en molculas de ATP El aceptor final de los electrones es el O2 H2O
31
En ausencia de O2
Respiracin anaerbica
Fermentacin
NO3SO4CO2
ANABOLISMO
No se produce ATP
Relevancia clnica
32
Rojo de fenol
rojo amarillo
Shigella flexneri
Relevancia Clnica
Clostridium perfringens:
Fermenta
33
Inhibicin competitiva
Las sulfas compiten con el PABA por la enzima que la convierte en cido flico Penicilinas compiten con el substrato de la enzima para la transpeptidacin durante la sntesis de la pared celular bacteriana
34
Gentica microbiana
Gentica microbiana
Las bacterias no presentan un ncleo definido N l id zona d Nucleoide: de l la b bacteria t i d donde d esta t presente el material gentico El nucleoide puede ser diferenciada por microscopia electrnica. La mayor parte de las bacterias presentan un solo cromosoma Se han descrito algunas especies que presentan dos cromosomas
Brucella
melitensis
E. coli tiene 4.6 x 106 bases, esto hara que el cromosoma midiera 1400 m de largo, largo sin embargo la bacteria tiene 2-3 m. Cromosoma super enrollado por serie de enzimas ADN girasa: tuerce el ADN hasta lograr una estructura muy compacta. t Topoisomerasa II
35
Dogma central
Genes
Fenotipo: representa las caractersticas observables Gentipo: caractersticas genticas, genticas mapa gentico
resistencia
Vas Catablicas
36
Opern Lactosa
Opern Lactosa
Inductor: lactosa
Ausencia
i
p
Ausencia de lactosa
o
Activo
Gen Regulador
Operon
p
No lac mARN
& lac a
Presencia
Presencia de lactosa i
p
Control Negativo
Inactivo
-Galactosidasa Permeasa Transacetilasa
Transduccin
Descrita p por Zinder y Lederberg en 1952 Transferencia gentica de un donante a un receptor por medio de un bacterifago Resistente a las nucleasas ambientales
37
Transformacin
Descrito por Frederick Griffith en 1928. Definicin: Transferencia gentica por obtencin de ADN de un donante. Factores que afectan la transformacin
Neisseria, Streptococcus):
Haemophilus,
Conjugacin
Definicin
Transferencia de genes entre
Donante
Conjugacin bacteriana
Receptor
38
Pili sexual
Taxonoma bacteriana
Grupos bacterianos
39
Anaerobios
Exigentes
No exigentes
Bacteroides
Porphyromonas
Haemophilus Brucella
Fermentadores de glucosa
Fusobacterium
Prevotella
Campylobacter Helicobacter
Oxidadores y no fermentadores
Bartonella
40
41