TRABAJO COLABORATIVO UNIDAD UNO MICROBIOLOGIA DE SUELOS

JORGE ISAAC RIVAS HINESTROZA CDIGO 1075020407

TUTORA SONIA AGUIRRE

UNIVERSIDAD NACIONAL ABIERTA Y A DISTANCIA - UNAD ESCUELA DE CIENCIAS AGRARIAS PECUARIA Y DEL MEDIO AMBIENTE PROGRAMA DE AGRONOMIA CEAD UIBDO

A!"# B$%&' C(#)' S*+",*-./* &* 2010

1$)"#/*2 3%* $4*)"$5 !$ $.%5&$5),$ 6 &,7*/2,&$& &* !$ -,)/# 6 -*2# 4$%5$ &*! 2%*!# 6 )#-# !# ($)*5 La diversidad biolgica ha sido un tema de preocupacin debido a los cambios causados en el ecosistema terrestre y acutico por el hombre en diferentes escalas, desde el paisaje ecolgico. Estos cambios son de naturaleza diversa por la intensificacin agrcola, la contaminacin el efecto invernadero, la urbanizacin, la prdida de biodiversidad en un ecosistema conduce a una alteracin de sus funciones principales. La disminucin de las reservas orgnicas, el aumento de acidez y la disminucin de cationes bsicos del suelo influyen en la disminucin de la actividad microbiana, en estas comunidades e isten especies !ue debido a su accin mecnica determinan la abundancia y la actividad de otros organismos. "ual!uier cambio producido en cual!uiera de las comunidades microbianas afecta por consiguiente al resto de los micros habitantes del suelo.

La abundancia o ausencia de la poblacin edfica compuesta por la micro y mesofauna responden a factores biticos y abiticos tales como el clima, la calidad del suelo, p#, ecosistema y los nutrientes. Esto determina !ue la poblacin edfica produzca cambios fsicos, !umicos y biolgicos del suelo, la hojarasca y la cantidad de materia orgnica producida. La actividad agrcola infiere significativamente en la abundancia de la poblacin del suelo ya !ue al alterarse las condiciones naturales modificadas por el hombre para crear agroecosistemas !ue en muchos casos dependen de una fuerte demanda de energa e terna y por consiguiente factores como el control de plagas y enfermedades conlleva al uso de agro!umicos !ue en muchos casos a los organismos del suelo, de igual forma, la mecanizacin de los suelos con arados, rastras y subsolador afecta las condiciones naturales de la poblacin edfica. 1$)"#/*2 $4*)"$5 !$ 7$/,$.,!,&$& *2+$),$! &* !$2 +#.!$),#5*2 -,)/#.,$5$2 La gran variabilidad en la composicin de los suelos referida a la cantidad y el tipo de sustancias nutritivas, la humedad, la aireacin, la temperatura, el p#, las interacciones, la presencia de races y las prcticas agrcolas, entre otras, producen grandes diferencias en la densidad y diversidad de la poblacin microbiana. $dems esta se ve afectada por procesos naturales y antrpicos, entre los principales podemos encontrar% Erosin y baja disponibilidad de nutrientes. &ertilizacin mineral y correctivos. 'resencia de antagonista, parsitos y depredadores. (emperatura y p# e tremos.

 E tremos en los contenidos de aire y humedad. &actores como sustancias nutritivas, humedad, aireacin temperatura, p# y las interacciones de todos estos componentes sumados a las prcticas agrcolas producen gran variabilidad espacial de la poblacin microbiana edfica. $ esto se le suma factores naturales como la erosin, presencia de antagonista, parsitos y depredadores y fertilizacin mineral y correctivos !ue afectan o influyen en la presencia de los microorganismos en el suelo. %* *2 !$ 1*58",)$ 6 )%9! *2 !$ &,4*/*5),$ *5"/* &,7*/2,&$& 4*5#":+,)$ 6 &,7*/2,&$& ;*5#":+,)$ Es una aplicacin de la sistemtica con el fin de clasificar un grupo determinado de individuos) es de mucha utilidad en los estudios de diversidad en poblaciones de microorganismos del suelo o de cual!uier otro ecosistema) se fundamenta en buscar un gran n*mero de caractersticas comunes y no comunes entre los organismos objeto de estudio, a mayor n*mero de caractersticas comunes mayor acercamiento de especies. "uando la diversidad y el fonograma son construidos con caractersticas como la morfologa y las reacciones bio!umicas, se les denomina diversidad fenotpica y cuando se valora la similitud total o parcial del $+, o $-, se denomina diversidad genotpica.
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pueden hacer comparaciones fenotpicas usando las propiedades bio!umicas y morfolgicas de los microorganismos, o se puede hacer con caractersticas genotpicas comparando fragmentos de $+, cromosomal o de $-, ribosomal

La fentica es una herramienta utilizada para la clasificacin de un grupo determinado de individuos, se fundamenta en buscar un gran n*mero de caractersticas comunes y no comunes entre los organismos objeto de estudio, a mayor n*mero de caractersticas comunes mayor acercamiento de especies. "uando se analizan propiedades bio!umicas y morfolgicas de los microorganismos se habla de diversidad fenotpica y cuando se comparan fragmentos de $+, cromosomal o de $-, ribosomal hablamos de caractersticas genotpicas.

P/#.!*-$2 +$/$ !$ -*&,),'5 &* &,7*/2,&$& -,)/#.,$5$< 'ara el caso de la medicin de los microorganismos el fenmeno es muy complejo por!ue es muy difcil establecer el concepto de 0especie1 ya !ue en los microorganismos se presenta con gran frecuencia variedades, serotipos, subespecies y dada la inherente dificultad de definir una especie de bacteria.

$rbitrariamente se determinan algunas pautas para definir un biotipo, lo !ue conduce a un gran problema estadstico. 'or consiguiente, se aplican mtodos e ndices de medicin utilizados en plantas y animales los cuales no son apropiados para medir o cualificar las caractersticas !ue permiten definir la especie de bacteria, constituyndose esto en un gran problema a la hora de medir la diversidad microbiana. +ado !ue las metodologas !ue han e istido para la medicin de especies son aplicables a plantas y animales ha resultado difcil implementarlas a la medicin de microorganismos, esto debido a lo dificultoso a la hora de elegir el concepto de especie microbiana, lo cual obviamente ha conllevado a elegir arbitrariamente la determinacin de algunas pautas para definir un biotipo, lo !ue conduce a un gran problema estadstico a la hora de cuantificar las caractersticas !ue permiten definir la especie de bacteria, y por consiguiente medir la diversidad microbiana.

C%9!*2 2#5 !$2 -*"#&#!#;:$2 3%* 2* %",!,=$5 *5 *2"%&,#2 &* $)",7,&$& 6 &,7*/2,&$& -,)/#.,$5$ &*! 2%*!# Las metodologas utilizadas corresponden% M8"#&#2 &*+*5&,*5"*2 &* )%!",7#< .$islamientos en medios de cultivo, perfil fisiolgico de comunidades bacterianas2. M8"#&#2 I5&*+*5&,*5"*2 D* C%!",7# PL1A >P(#2+(#!,+,&2 1$""6 A),&?< $nlisis de cidos grasos de fosfolpidos2. 1AME >1$""6 A),& M*"(6! E2"*/?@ $nalisis de esteres metlicos de cidos grasos PCR-DGGE .'olimerase "hain -eaction3+enaturing 4radient 4el Electrophoresis2. -eaccin en cadena de la polimerasa 5 electroforesis en gel con gradiente denaturante (3-&L' .(erminal3-estriction &ragment Lenght 'olymorphism2, 'olimorfismo terminal de la longitud de fragmentos de restriccin. C#-# ,54!%6* !$ -,5*/$!#;:$ &*! 2%*!# *5 !$ &,7*/2,&$& -,)/#.,$5$ +/*2*5"* *5 %5 &*"*/-,5$&# 2%*!#< Los microorganismos re!uieren nutrimentos minerales para su supervivencia dependiendo de las condiciones del suelo, las cuales estn influenciadas por factores abiticos como humedad, temperatura, p#, o geno presente en los poros del suelo y los nutrientes presentes en los minerales, algunos favorecern la reproduccin de cierto tipo de microorganismo, otros no, en algunas partes del suelo se forman colonias microbianas naturales, .por!ue no necesitan ning*n elemento e terno al ambiente2.

C#-# ,54!%6* *! %2# &*! 2%*!# *5 !$ $)",7,&$& 6 &,7*/2,&$& -,)/#.,$5$< El uso !ue se le d al suelo influye en gran medida en la diversidad microbiana, un suelo !ue pertenece a un monocultivo, en el cual se desarrollan prcticas como el uso de !umicos no presenta la misma cantidad de microorganismos !ue un suelo donde se maneja un sistema agroforestal, las prcticas de cultivo !ue se utilicen inciden en la cantidad y la calidad de las reservas orgnicas y cationes bsicos del suelo factores fundamentales para la actividad microbiana. En las tierras bajo cultivo intensivo, el deterioro de la estructura del suelo se ha vuelto ms propenso a la compactacin y a la erosin) a esto debe incorporarse el proceso de desertificacin, salinizacin, alcalinizacin y contaminacin de aguas subterrneas con plaguicidas y fertilizantes. La degradacin del suelo por actividades agrcolas es un claro sntoma del mal uso y del manejo inapropiado de los sistemas productivos, debido a !ue la prdida de fertilidad est asociada a la alteracin de numerosos procesos biolgicos realizados por la biota edfica. C#-# *! ",+# &* -*"$.#!,2-# &*"*/-,5$ !$ %",!,&$& &* !#2 -,)/##/;$5,2-#2 +$/$ !$ $;/,)%!"%/$< Los microorganismos tienen diferentes metabolismos, as !ue seg*n sus especificaciones metablicas pueden servir para diferentes usos en la agricultura, son muy importantes en la mineralizacin del ,itrgeno y su fijacin para ser usado por las plantas. La importancia de la fijacin de nitrgeno en la agricultura ayuda a potenciar un mayor aprovechamiento de las cosechas, para un sistema agrcola sustentable es de suma importancia utilizar recursos renovables !ue puedan ma imizar los beneficios ecolgicos y minimizar el da6o ambiental. La mayora de las bacterias obtienen la energa de la materia orgnica y en el proceso producen la sustancia llamada humus, las bacterias !uimiotrpicas pueden hacer uso de sustancias inorgnicas) algunas de ellas son capaces de romper compuestos de azufre y cianuro as como herbicidas y pesticidas para obtener sus necesidades de energa. %* -*"#&#!#;:$2 2* %",!,=$5 +$/$ *! *2"%&,# &* !$ -*2#4$%5$ &*! 2%*!# 6 )#-# !$ -*2#4$%5$ *2 %5 .%*5 ,5&,)$&#/ &*! &*"*/,#/ &*! 2%*!# La mesofauna se colecta utilizando dos mtodos de muestreo% a2 una muestra compuesta !ue contiene varios n*cleos de suelo y hojarasca e trada de la superficie, bien por el mtodo 7erlese3(ullgren o por el de 7erlese modificado. b2 del contenido l!uido de las trampas pitfall. Los n*cleos de suelo, en principio, sirven para colectar mesofauna !ue habita en el suelo mineral, por debajo de la

hojarasca de la superficie y en la hojarasca en s, mientras las trampas pitfall se utilizan para colectar los !ue habitan en la superficie del suelo. Los grupos de la mesofauna del suelo son muy sensibles a los cambios !ue ocurren en el medio edfico por causas naturales o antrpicas, lo !ue provoca variaciones en su densidad y diversidad) por esta causa son considerados como certeros indicadores del estado ecolgico del suelo. El anlisis cualitativo de los grupos !ue integran esta categora zoolgica permitir hacer una evaluacin adecuada de la calidad del medio edfico. C%9!*2 2#5 !#2 +/#)*2#2 *&94,)#2 -92 ,-+#/"$5"*2 *5 !#2 3%* ,5"*/7,*5*5 !#2 -,)/##/;$5,2-#2 &*! 2%*!# L$ M*"*#/,=$),'5% Los organismos del suelo se encargan de descomponer y desintegrar el suelo, dejando disponible materiales y partculas !ue puedan ser movilizados por los agentes de la erosin. Los organismos !ue integran la meso y macrobiota del suelo desempe6an un papel fundamental en la fragmentacin, transformacin y translocacin de materiales orgnicos en l. 1#/-$),'5 &* H%-%2% 'or descomposicin de constituyentes de las plantas y la sntesis de productos microbianos enri!ueciendo el horizonte $. El #umus es una mezcla compuesta por molculas orgnicas, de naturaleza coloidal, proveniente de la descomposicin de la materia orgnica. #umus genera% $yuda a la retencin de agua por hidratacin. -etiene iones y facilita el intercambio inico con las races. 8ejora la nutricin vegetal. Evita la compactacin del suelo. 9ncrementa la porosidad. Es soporte de microorganismos !ue realizan el reciclado de la materia orgnica y cierra los ciclos de materia en el suelo. La respiracin y fermentacin por parte de los microorganismos genera calor, aumentando la temperatura del suelo. B,.!,#;/$4:$ A5$ A< S#)$//92 6 N< R#.$,5$. .:;<<2 "aracterizacin de la mesofauna edfica bajo diferentes usos de la tierra en suelo &erraltico -ojo de 8ayabe!ue y $rtemisa. En 'astos y &orrajes, .=ol. >?, ,o. : pp. <@A3<B@2. La #abana, "uba. D$5,*!@ (oro. .:;;C2. La biodiversidad microbiana del suelo, un mundo por descubrir. 8anizales, "olombia.