Bioestadstica

Gua para el Alumno Stata 8.0

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SEMANA I - ASPECTOS GENERALES

Review acumula comandos anteriores, los cuales pueden ser reenviados a la ventana de Stata command clickeando sobre ellos
Stata Result, muestra los corridas de aplicar comandos en Stata

Variables, presenta las variables de base de datos en uso.

Stata se maneja con comandos, los cuales se tipean en la ventana Stata command

I. Introducc !n " mane#o $%& co de Stata A. Elemento& $%& co& 'o$tener a"uda( &al r)
Stata 8 presenta formato de mens como de ventanas, estas cuatro ventanas llamadas Review, Variables, Stata Results y Stata command . Si maneja Stata 8 con comandos, estos se tipean en la ventana Stata command, y los resultados aparecen en la ventana Stata Results. La ventana Review registra comandos utilizados previamente, los cuales pueden ser reenviados a la ventana de Stata command clickeando sobre ellos. Para obtener a"uda, clickee en el men

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la opcion *elp y siga las instrucciones en pantalla. Para terminar la sesin, cierre el programa clickeando en el botn superior derec o !como cual"uier otro programa #indo$s%.

&l programa Stata 8 nos presenta una variedad de iconos, "ue pueden agilizar el manejo y an'lisis de una base de datos. Para abrir un arc ivo, u&e. Para guardar arc ivo "ue se encuentra en memoria, &a+e Para poder imprimir un arc ivo, pr nt Para crear un arc ivo "ue guarde bit'coras del Stata Results, lo, Para crear un arc ivo "ue guarde programas de ventana Review, do Para abrir ventana de edicin de base de datos, ed t Para visualizar base de datos en uso, $ro-&e
COMAN.O .ESCRIPCION

/elp lo, u&e ed t code$oo0 de&cr $e &a+e l &t ... 1 ... drop 0eep la$el +ar a$le la$el de1 ne la$el +alue&

(yuda de programa stata, para comandos. )so de arc ivos de bit'cora (brir una base de datos en stata !e*tensin .dta% +ngreso de datos por medio de ventana de Stata Editor ,uestra variables con estad-sticos descriptivos .escribe contenido de datos en memoria o sobre el disco /opiar y pegar datos de ,S &*cel 0uarda los datos en disco con e*tensin 1.dta Lista de valores de variable Selecciona observaciones cumpliendo cierta condicion para la ejecucion del comando 2orrar variable o dato en memoria 2orra variables o datos no seleccionados /omando de eti"ueta de variables Primer paso para eti"uetar valores de una variable Segundo paso para eti"uetar valores de una variable

.emo&trac !n " e2pl cac !n de lo& comando& de Stata &n Stata la sinta*is de los comandos es la siguiente3

Bioestadstica comando lista de variables 4 1 expression5 4 n expression5, 4opciones5 /elp. Para obtener ayuda de parte del programa stata 8 Para opciones generales del comando
. help

Para ayuda sobre contenido general del uso en stata

. help contents

Para ayuda sobre el comando l &t . /elp l &t lo,. &l siguiente comando nos permite guardar las bit'coras realizadas en el analisis de datos, en un arc ivo con la e*tensin mas adecuada para el usuario. . lo, u& n, 3C45.ATA5cla&e6.t2t3( te2t --------------------------------------------------------------------------------------lo,4 C45.ATA5cla&e6.t2t lo, t"pe4 te2t opened on4 7 8un 7009( 694774:8 use Para el uso de la base de datos cancer.dat, escribiremos el comando u&e, usando ademas la opci6n clear, "ue nos permite cargar la base de datos en memoria aun teniando en uso otra base de datos y guardando los cambio cargados en memoria realizados en esta ultima u&e 3C45Stata5cancer.dta3( clear 'Pat ent Sur+ +al n .ru, Tr al)

edit Para ingresar los datos por medio de una ventana tipo oja de calculo utilizamos el comando edit, el cual apertura una ventana de ingreso de datos ed t
(l terminar de ingresar datos aga click en el icono preserve para no perder el ingreso de datos realizado

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code$oo0 &ste comando muestra una lista de las variables se7alando el tipo de variable, su rango, frecuencias en caso de una variable cualitativa !codificada% media, desviacin estandar y percentiles en caso fuera una variable continua. ;&e <C45Stata85auto.dta=( clear code$oo0
use "C:\Stata8\auto.dta", clear mp, M lea,e 'mp,) --------------------------------------------------------------------------------------t"pe4 numer c ' nt) ran,e4 >67(:6? un t&4 6 un @ue +alue&4 76 m && n, .4 0AB: mean4 76.7CB9 &td. de+4 D.B8DD percent le&4 60E 7DE D0E BDE C0E 6: 68 70 7D 7C repB8 t"pe4 numer c ' nt) ran,e4 >6(D? un @ue +alue&4 D ta$ulat on4 Fre@. Galue 7 6 8 7 90 9 68 : 66 D Repa r Record 6CB8

888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888
un t&4 6 m && n, .4 DAB:

de&cr $e &ste comando muestra una lista de las variables de la base de datos en uso.
. describe Contains data from miarchi.dta obs: 3 vars: 3

5 Nov 2002 12:35

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size: 102 (99.9 of memor! free" ############################################################################### stora$e displa! value variable name t!pe format label variable label ############################################################################### name str20 20s a$e float 9.0$ se% str& 9s ############################################################################### 'orted b!:

Cop ar de una /o#a e2cel dato& a Stata 8 &l programa Stata 8 tiene la facilidad de copiar los datos de una oja de e*cell con simples opciones de copiar y pegar "ue se utilizan en $indo$s, antes teniendo la ventana de edit activada en Stata 8. 9. &dit, stata8 7. Cam$ o de +entana a e2cell 9. Selecc onar dato& a &er cop ado& " /acer cl c en cono de cop ar( ctrl. H C :. cam$ ar de +entana ed t de Stata 8 D. *acer cl c en cono de pe,ar( ctrl H G

&a+e
Para guardar datos "ue se an ingresado &a+e m arc/

Bioestadstica Si no se muestra el directorio donde estara el arc ivo, por defecto se guarda el arc ivo en el directorio /3:.ata. Si el arc ivo ya abia sido creado anteriormente y se an ingresado datos nuevamente se utiliza la opcion replace save miarc i, replace l &t. Presenta los valores de las variables. Si no presenta variables con el comando list, se presentaran los valores de todas las variables use ;/3:Stata:auto.dta;, clear list drug age 9. >. <. B. C. ?. @. drug 9 9 9 9 ... ... ... age <= ?? @A BB ... ... ...

1 al final de un orden significa usar slo los datos especificados. 1 es permitido con la mayor-a de los comandos de Stata. list drug age if age D BC >. <. =. 99. 9B. drug 9 9 9 9 9 age ?? @A B8 ?< ?B

drop. 2orra variables 6 valores seleccionados. drop +ar a$le .e inmediato desaparece de ventana de variables en memoria 0eep. 2orra variables o valores no seleccionados. 0eep +ar a$le la$el( sirve para eti"uetar datos, variables y valores.

Bioestadstica la$el variable age ;edad del paciente; de&cr $e age storage display value variable name type format label variable label 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 age int E8.Ag edad del paciente la$el de1 ne. &s utilizado como un primer paso para el eti"uetar valores de variables seleccionada label define drogas 9 F,egacilinaG > FHetracicilnaG < FI*acilinaG B FPenicilinaG la$el +alue&. &s utilizado como segundo paso para el eti"uetar valores de variables seleccionada label values drug drogas

Bioestadstica E2plorac !n " pre&entac !n de dato&. ,enerate replace mer,e collap&e &ummar Ie ta$ulate ta$le ,rap/ &catter $o2plot& $ar l ne& &tac0ed $ar mean 0enera variable Jeemplaza valores de variable bajo alguna condicin +ngresa variables o casos de una base patrn a otra /alculo de estad-sticos descriptivos para variables cuantitativas (n'lisis para variable cuantitativa, media, mediana, etc Habla de frecuencias para variables cualitativas Habla de frecuencias simples para variables cualitativas /rea un grafico de cual"uier variable 0enera grafico de dispersin entre > variables 0rafico de cajas 0rafico de barras 0rafico de lineas 0rafico de barras apiladas 0rabar y editar revie$. )so del editor de programas !arc ivo .do% Kariables3 Kariables /uantitativas o Kariable .iscretas o Kariable continuas Kariables /ualitativas o Kariable nominal o Kariable ordinal .emo&trac Jn " e2pl cac Jn .efinicin de tipos de datos, presentacin de datos en tablas de contingencia y resumen, presentaciones gr'ficas diversas. &stad-stica descriptiva simple3 medidas de tendencia central y dispersin. )so de arc ivos de bit'cora !log%, 9. Para el analisis de las variables numericas tenemos el comando &ummar Ie, el cual calcula estadisticos de tendencia central, asi como de distribucion. &ntonces trabajando con el arc ivo de c3:stata:cancer.dta, tenemos ,enerate. 0enera una variable "ue va a ser recodificada ( por ejemplo si tenemos en uso el arc ivo cancer !c3:stata:cancer.dta% y "ueremos recodificar la variable age en una nueva variable age1 @ue conten,a lo& nter+alo& de edad :D-D0 D6-DD DK-K0 K6aH. Entonce& &e,u mo& lo& pa&o& corre&pond ente& para el e#emplo

Bioestadstica Para a$r r el arc/ +o cancer u&e <c45&tata5cancer.dta=( clear 0enerando la variable age9 con valores iguales a age ,enerate a,e6 L a,e Para reemplazar valores en la nueva variable age9, utilizamos el comando replace( 1 y operadores logicos y de relacion replace a,e6 L 0 replace a,e6 L 6 replace a,e6 L 7 replace a,e6 L 9 1 a,e MLD0 1 a,e N D0 O a,e ML DD 1 a,e N DD O a,e ML K0 1 a,e N K0

. replace age9 L A if age MLCA !9> real c anges made% . replace age9 L 9 if age D CA N age ML CC !99 real c anges made% . replace age9 L > if age D CC N age ML ?A !9B real c anges made% . replace age9 L < if age D ?A !99 real c anges made%
summarize. El presente comando es una opcin para obtener estadsticos descriptivos para variables cuantitativas. . &ummar Ie a,e Gar a$le P O$& Mean Std. .e+. Mn Ma2 -------------H----------------------------------------------------a,e P :8 DD.8BD D.KDC70D :B KB . &ummar Ie &tud"t me a,e Gar a$le P O$& Mean Std. .e+. Mn Ma2 -------------H----------------------------------------------------&tud"t me P :8 6D.D 60.7DK7C 6 9C a,e P :8 DD.8BD D.KDC70D :B KB

. summarize a$e( detail )atient*s a$e at start of e%p. ############################################################# )ercentiles 'mallest 1 +, +,

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5 10 25 50 ,5 90 95 99 ++9 50.5 5& &0 &5 &, &, +++9 1ar$est &5 &, &, &,

.bs 'um of /$t. 0ean 'td. 2ev. 3ariance '4e5ness 6urtosis

++55.-,5 5.&59205 32.02&& .31&10&& 2.12519,

Para generar estad-sticos para una determinada variable cuantitativa, necesitamos colocar los estadisticos sobre un parentecis

mer,e. &l comando nos ayuda a unir informacin entre bases de datos relacionadas. &jemplo3 uno a uno mer,e . use ds9 . mer,e using ds> collap&e. Jeporta estad-sticas sobre tendencia central. &l siguiente ejercicio muestra como se podr-a solicitar las estad-sticas descriptivas. collap&e !mean% age !median% systolic, by !drug% ta$ulate. Para trabajar variables cualitativas como factores, se*o, grupos de edad, etc
. tabulate dru$

2ru$ t!pe 7 (18placebo" 7 9re:. )ercent Cum. ############;################################### 1 7 20 +1.&, +1.&, 2 7 1+ 29.1, ,0.-3 3 7 1+ 29.1, 100.00 ############;################################### <otal 7 +100.00

Ore", representa al numero pacientes por tipo de droga "ue se reseto, percent, el porcentaje de pacientes "ue fue tratado por algun tipo de droga. /um., el porcentaje acumulado.
tabulate died( summarize( a$e" 'ummar! of )atient*s a$e at start

1 if 7

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patient 7 of e%p. died 7 0ean 'td. 2ev. 9re:. ############;#################################### 0 7 5+.1,&+,1 5.+3+09,1 1, 1 7 5&.-0&+52 5.&+,5325 31 ############;#################################### <otal 7 55.-,5 5.&5920+5 +-

Ta$le. &ste comando calcula frecuencias simple, adem's puede calcular otros estad-stico se7alados por el usuario, utilizando la opcin contents
. table dru$( contents (mean a$e"

###################### 2ru$ =sed 7 mean(a$e" ##########;########### 1 7 +&.& 2 7 +5.&&&, 3 7 +&.&&&, + 7 +2.1-,5 ######################

Para poder realizar gr'ficos tenemos el comando ,rap/, y sus diferentes variedades segn el tipo de gr'fico "ue se "uiere realizar. Pistograma &jemplo3 / &to,ram a,e
.3125

Fraction

0 47 Patient's age at start of exp. 67

(utom'ticamente el programa Stata8 divide el grafico en C barras, depende del usuario el numero de intervalos "ue se desean obtener, esto utilizando la opcin $ Qgrap age, bi!@% R. 0rafico de dispersin &catter &tud"t me a,e

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39

Months to death or end of exp.

1 47 Patient's age at start of exp. 67

0rafico de cajas ,rap/ $o2 a,e( o+er'dru,)

Patient's age at start of exp. 67

47 1 2 3

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0rafico de Linea l ne $ rt/rt "ear

45.1002

li e !irths per 1000 "o#en 6.60003 1940 1943 1946 1949 1952 1955 195% 1961 1964 1967 1970 1973 1976 1979 19%2 19%5 19%% 1991 $ear

do.
(rc ivo donde se arc ivan los programas ejecutados en sesin de Stata, para ello debemos acer clic en la parte superior derec a de la ventana de Review y acer clic en la opcin Save Review Contents.