INTRODUCCION AL MODELAMIENTO EN BIOMATEMATICA TAREA NO.

4
FERNANDA SEPULVEDA PENRROZ CAMILA SOTO ROSALES INGENIER IA CIVIL MATEMATICA

Date : 11 de diciembre de 2013.

1

Problema 17.(Invasiones biol ogicas). Estudiar la Secci on 5.5: Biological Invasionsde N.F. Britton, Essential Mathematical Biology, Springer-Verlag, London, 2003, pp. 161-163, y resolver dos de los ejercicios (Exercises 5.12-5.14) (pregrado), todos los ejercicios (Exercises 5.12-5.14) (doctorado).

Problema 18.(Inestabilidad de Turing I). Estudiar la Seccion 7.2: Turing Instability de N.F. Britton, Essential Mathematical Biology, Springer-Verlag, London, 2003, pp. 206-211, y resolver uno de los ejercicios (Exercises 7.1, 7.2) todos de los ejercicios (Exercises 7.1, 7.2)

Problema 19. (Inestabilidad de Turing II). Estudiar las Secciones 7.3 Turing Bifurcations 7.4, Activator- inhibitor systemsde N.F. Britton, Essential Mathematical Biology, SpringerVerlang, London, 2003, pp. 211-217, y resolver dos de los ejercicios (Exercises 7.3-7.6) (pregrado), tres de los ejercicios (Exercises 7.3-7.6) (doctorado). Soluci on: 7.3 a) Sabemos que tr(J ) = 0 y |J | = 4, luego, de la ecuaci on 2 tr(J ) + (J ) = 0 se tiene los valores propios de ut = Ju son = 2i. Por lo tanto, todas la soluciones son de la forma (x(t), y (t)) = (A cos(t), B sin(t)), de donde el estado estacionario es estable. b) El problema de valores propios en la variable espacial es F (x) = F (x) sobre ]0, 2 [ s.a F (0) = F ( ) = 0 la soluci on a este problema de Sturm Liouville es F( x) = cos(nx) donde n = n2 De la ecuaci on (7.4.33) del libro N.F. Britton, Essential Mathematical Biology, los modos n inestables son tales que n , en donde y son las soluciones positivas de
a2 () = D1 D2 2 (D2 fu + D1 gv ) + |J |

= 92 24 + 4 = 0 luego, como 0,18 y 2,48, n debe ser igual a 1.

7.6 a) Sean f (u, v ) :=

u2 f f bu y g (u, v ) := u2 v ; la matriz pedida es J = u v , gu gv (u ,v ) v 0 0 donde f (u0 , v0 ) = 0 y g (u0 , v0 ) = 0. 1 1 , , de donde la matriz Jacobiana es: Luego (u0 , v0 ) = b b2 b b2 J = 2 1 b b) De las ecuaciones (7.4.25) y (7.4.26), se tienen las condiciones para que el estado estacionario sea estable para perturbaciones uniformes espaciales, las cuales son tr(J ) < 0 y |J | > 0, luego se tiene que b < 1 y b > 0.
> 0, por lo tanto db > 1. + gv c) De la condici on (7.4.29), se tiene que dfu

La curva de estabilidad marginal se obtiene de la ecuaci on (7.4.28), se tiene (db 1)2 (db 1)2 4db (db)2 6db + 1 (db 3)2 4db 0 0 8 db = 2 2 + 3, = = = =

donde se descarta el signo menos por la condici on db > 1. La regi on que dene el espacio param etrico queda denida por b = 1 y bd = 3 + 2 2,

d) Las condiciones para que exista la inestabilidad de Turing son (7.4.25), (7.4.26), (7.4.29) y (7.4.30), por lo tanto en este caso se tiene que dicha inestabilidad se da cuando 0 < b < 1 y db > 2 2 + 3. e) En este caso, como |J | = b, D1 = 1, D2 = d y = 1, de la ecuaci on (7.4.35) se tiene que b bd bd 2 2+3 1+ 2 c = = = = = d d2 d d d

. Problema 20. Se solicita implementar el metodo numerico descrito en la Seccion 10.6 de los apuntes, y reproducir el efecto de formacion de patrones para el sistema de reacci on-difusi on (10.28), con los par ametros indicados, para lo menos tres pares (m,n) sobre el dominio (x, y ) [0, 4] [0, 1].

(a) = 200, n = 1 y m = 2

(b) = 1000, n = 3 y m = 3

(c) = 1200, n = 4 y m = 3

(d) = 2000, n = 4 y m = 5

Figura 1. Cada gura muestra una simulaci on del modelo con difusi oon de Schnakenberg en dos dimensiones, con los valores a =0.2, b=0.5 y d=14 para diferentes valores de Listing 1. Problema 9 % METODO EXPLICITO PARA RESOLVER SCHAKENBERGER % % c o n d i c i o n e s de f r o n t e r a p e r i o d i c a s

clear a l l clc % parametros de l a m a l l a uniform3 l o n g =4; % % l o n g i t u d d e l cuadrado x l o n g 2 =1; % % l o n g i t u d d e l cuadrado y M=96; % intervalos h=l o n g /M; % % tamano d e l paso x h2=l o n g 2 /M; % % tamano d e l paso y x=0:h : l o n g ; x=x ; % %% nodos h o r i z o n t a l e s y=0: h2 : l o n g 2 ; y=y ; % nodos v e r t i c a l e s dt=1e 6; % % paso de tiempo T= . 5 0 ; % %% tiempo t o t a l N=f l o o r (T/ dt )+1 % i t e r a c i o n e s en e l tiempo % parametros a =0.2; b=0.5; gamma=2000; d=14; % parametros f i s i c o s de d i f u s i o n mu=(1 dt /h 2 ) ; mv=(d dt /h 2 ) ; % %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% % %%%%% co % n% diciones i n i c i a l e % %% v a l o r e s de q e u i l i b r i o de l a r e a c c i o n u0=a+b ; v0=b / ( a+b ) 2 ; f f =1; % % %c % o n t a d o r para e l v i d e o % c o n d i c i o n e s i n i c i a l e s prueba 1 v=v0 ones (M+3,M+3); for i =1:M+1 for j =1:M+1 suma ( i , j )=0; for k =1:20 suma ( i , j )=suma ( i , j )+ cos ( pi k/ l o n g ( x ( i ) 1 0 . 7 ) ) ; end u ( i +1, j +1)=u0+u0 . 0 0 1 suma ( i , j ) ; end end % % ruido a l e a t o r i o v=v+v0 .001 ( 1+2. rand (M+3,M+ 3 ) ) ; u=u ; v=v ; % %%%%%%%%%%%%% % grafica

s h o r t=u ( 2 :M+2 ,2:M+2)/u0 ; colormap ( gray ) surf ( x , y , s h o r t , FaceColor , texturemap , EdgeColor , none ) axis ( [ 0 , long , 0 , l o n g 2 ] ) tic for n=1:N % conciciones periodicas a la frontera u ( : , 1 ) = u ( : ,M+1); u ( : ,M+3)=u ( : , 3 ) ; u ( 1 , : ) = u (M+ 1 , : ) ; u (M+3 ,:)=u ( 3 , : ) ; u ( 2 , : ) = u (M+ 2 , : ) ; u ( : , 2 ) = u ( : ,M+2); v ( : , 1 ) = v ( : ,M+1); v ( : ,M+3)=v ( : , 3 ) ; v ( 1 , : ) = v (M+ 1 , : ) ; v (M+3 ,:)= v ( 3 , : ) ; v ( 2 , : ) = v (M+ 2 , : ) ; v ( : , 2 ) = v ( : ,M+2); % %%%%%%%%%%%% 5 %% % % %s % u s t i t u c i o n en e l esquema e x p l i c i t o for i =2:M+2, for j =2:M+2, u2 ( i , j )=dt f r e a c ( i , j , u , v , gamma, a)+(1 4 mu) u ( i , j ) + . . . mu ( u ( i +1, j )+u ( i 1, j )+u ( i , j +1)+u ( i , j 1 ) ) ; end end for i =2:M+2, for j =2:M+2, v2 ( i , j )=dt g r e a c ( i , j , u2 , v , gamma, b)+(1 4 mv) v ( i , j ) + . . . mv ( v ( i +1, j )+v ( i 1, j )+v ( i , j +1)+v ( i , j 1 ) ) ; end end % a c t u a l i z a c i o n de l a m a l l a u=u2 ; v=v2 ; % g e n e r a c i o n de l o s frames para e l v i d e o i f mod( n,3)==0 n colormap ( gray ) s h o r t=u2 ( 2 :M+2 ,2:M+2)/u0 ; surface ( x , y , s h o r t , FaceColor , texturemap , EdgeColor , none ) axis ( [ 0 , long , 0 , l o n g 2 ] )

M2( f f ) =getframe ; f f = f f +1; end end toc