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Noctiluca scintillans, conocida comnmente como chispa de mar,3 es una especie de dinoflagelado martimo de vida libre, que exhibe bioluminescencia producida por un sistema de luciferina luciferasa situado en miles de orgnulos esfricos o "micro-fuentes", ubicados en todo el citoplasma de este protista unicelular.
Es un organismo hetertrofo que engulle por fagocitosis sus su alimentos, que consisten principalmente de plancton, incluyendodiatomeas y otros dinoflagelados, as como bacterias, coppodos y sus huevos y huevos de peces La caracterstica ms singular de N. scintillans es su capacidad de bio-luminiscencia debido a una reaccin de luciferina-luciferasa que se produce en miles de "microfuentes", pequeos organelos que se encuentran por todo el citoplasma que contiene la molcula de luciferina y la luciferasa de la enzima que cataliza la oxidacin (2). La luz emitida puede medirse con precisin, y ligeras variaciones del gen de la luciferasa ha sido diseado transgnicamente como un mtodo de visualizacin en otras especies
Bacterioplancton
Flavobacterium hibernum Hibernum Flavobacterium , que significa "invernales bacterias amarillas", es una bacteria en forma de bastn Gram negativo aerbico, capaz de crecer en medios fro, pobre en nutrientes. En primer lugar aislado de Crooked Lake en la Antrtida (McCammon, 1998), pero ahora se sabe que se encuentra en todo el mundo, en agua dulce, el hielo y los ecosistemas del suelo, y es en gran parte inexplorado genticamente (Chen, 2006). Una temperatura ptima de crecimiento de 26 C grupos F. hibernum con microbios psicrotrficas, aunque las temperaturas a las que el crecimiento fue posible oscilaron entre -7 C a 30 C. Esta bacteria exposiciones deslizndose motilidad, cuyo mecanismo es desconocido. Sin embargo, este mtodo de la motilidad puede estar relacionada con su capacidad para lisar las clulas Gram-positivas (tales como E. coli ) como un bacteriovore en la cadena alimenticia. F. hibernum es capaz de utilizar una amplia variedad de azcares y sustrato que contienen otros nutrientes. Adems,Flavobacterium hibernum y otra Flavobacterias se encuentran comnmente en los ambientes acuticos, incluyendo huecos de rboles donde los mosquitos de contenedores de cra de la raza. Flavobacteriumson consumidos por varias especies de mosquitos, incluyendo Anopheles gambiae y Aedes triseriatus , que pueden actuar como vectores de la enfermedad (Chen, 2010 ). Se ha propuesto que F. hibernum u otros miembros de su gnero se podran modificar para entregar las toxinas de B. thuringiensis o B. sphaericus y ser utilizado como un "insecticida novedoso para reducir las poblaciones de mosquito
Zooplancton
Globigerina bulloides es una especie de hetertrofos planctnicas foraminfero con una amplia distribucin en la zona ftica de los ocanos del mundo. Es capaz de tolerar un rango de temperaturas de la superficie del mar , salinidad y densidad del agua, y es ms abundante en las altas latitudes del sur (hasta 40 S), ciertas latitudes septentrionales altas (hasta 80 N), y en latitudes bajas regiones de surgencia. La densidad o la presencia de G.bulloides pueden cambiar en funcin de la floracin de fitoplancton sucesiones, [1] y que se sabe que son ms abundantes durante el invierno y primavera. [2] Al igual que otros foraminferos planctnicos, G. bulloides carbonato pruebas encontradas en los sedimentos marinos obtenidos de ncleos del ocano pueden ser usados para reconstruir historias climticas , y para alinear los ncleos de sedimentos marinos entre s o con los ciclos astronmicos . En este orden de ideas, anlisis de istopos de oxgeno de estos foraminferos a partir de ncleos de perforacin en el Atlntico Norte han ayudado precisamente la fecha, el momento del inicio de la glaciacin del hemisferio norte a finales del Plioceno , hace 2,5 a 3.000.000 aos. [3] El magnesio a calcio proporciones son tambin se utiliza en G. bulloides para reconstruir las historias de temperatura en los ocanos del mundo, como cultivos experimentales de la foram han demostrado de magnesio a las relaciones de calcio para aumentar de manera exponencial con el aumento de la temperatura del ocano.
Thiobacillus denitrificans es corto en forma de barra (0,5 1.0-3.0 um), Gram-negativas, obligately chemolithoautotrophic, y un miembro de la beta-subclase de las proteobacterias. A diferencia de muchas bacterias conocidas quimiolitotrofas oxidantes del azufre (como ferrooxidans Acidithiobacillus) que son estrictamente aerbico, T. denitrificans crece como una chemolithotroph anaerobios facultativos, el acoplamiento de la oxidacin de compuestos de azufre inorgnicos para la reduccin de compuestos de nitrgeno oxidados (tales como nitrato, nitrito) de dinitrgeno. Las condiciones ptimas para la desnitrificacin son pH 6,85 a 32,8 C, mientras que las condiciones ptimas de crecimiento son pH 6,90 a 29,5 C. Esta especie se encuentra ampliamente en tierra, barro, sedimentos de agua dulce-y marinos, de aguas residuales y estanques de tratamiento de residuos industriales y tanques de digestin que se encuentran bajo condiciones de anoxia. T. denitrificans pueden remediar el agua subterrnea natural y sistemas de tratamiento de agua de ingeniera, eliminando el exceso de nitratos. Es la primera y nica bacteria auttrofa reportado para oxidar U (IV) a U (VI) los minerales de xido de forma
anaerbica, lo que podra contrarrestar parcialmente los esfuerzos para remediar los acuferos contaminados por uranio in situ inmovilizacin reductora (la U radiactivos y mvil (VI) puede dissimilatorily ser reducido a la forma inmvil de U (IV) por algunos microorganismos, tales como Geobacter sp.). T. denitrificans es uno de los mejor estudiados de unos microorganismos quimiolittrofos obligately que pueden combinar la oxidacin de azufre compuesto inorgnico con desnitrificacin.
Thiococcus sp
el primer Thiorhodaceae sabe que contienen bacterioclorofila b,se aisl de lodo del ro utilizando la luz filtrada por encima de 900 milimicras como el agente de seleccin en los enriquecimientos. El color naranja-marrn del inmviles, gramnegativos, cocos photolithotrophic se debe a dos nuevos carotenoides, 3,4,3 ', 4'-tetrahydrospirilloxanthin y 3,4,3', 4'-tetrahydrospirilloxanthinal. Los pigmentos fotosintticos parecen estar asociados con un sistema de membrana interna nica que consta de tubos de membrana ramificados de incluso dimetro (aprox. 450 ) continuo con la membrana celular. Los tubos teidas negativamente examinados en el microscopio electrnico revelan una estructura fina superficie de los cuerpos elevadas dispuestas en un patrn hexagonal regular.
Zona profunda
Shewanella putrefaciens
Shewanella putrefaciens es una bacteria que se encuentra principalmente en los ambientes marinos. Es una bacteria gram negativa, lo que significa que no tie durante la tincin de Gram, que por lo general indica una resistencia a los antibiticos ms fuertes. Tambin es un anaerobio facultativo, lo que significa que puede someterse a la respiracin aerbica cuando el oxgeno est presente, y puede reducir el hierro y el magnesio metablicamente. Debido a esto Shewanella putrefaciens pueden reducir uranio y crear depsitos de uranio (Fredrickson).Sheweanella putrefaciens crece rpidamente tanto en medios slidos y lquidos, y es reconocible por su color rosa. Shewanella putrefaciens fue aislado por primera vez de los productos lcteos en 1931 por el Derby y el martillo. Shewanella putrefaciens tambin es bien conocido por su uso en biotecnologa. Shewanella putrefaciens es un metal reductor, facilitar anaerobio y esta cualidad contribuye a su capacidad de ser utilizado en la biotecnologa. Es utilizado por muchas cosas desde un biorremediar de compuestos clorados a un radionclido y un biocatalizador. Su capacidad para ser un biocatalizador y para reducir el hierro ha dado lugar a una investigacin interesante hecho con Shewanella putrefaciens se utilizan en las pilas de combustible. Esta investigacin se est haciendo en el Instituto Coreano de Ciencia y technologyand ha demostrado que la Shewanella tiene la capacidad de ser utilizado en una celda de combustible como parte de un biosensor para el lactato. Esto significa con la presencia de Shewanella putrefaciens como un aceptor de electronon y reductor de metal de hierro su era un cambio de carga detectado en la celda de combustible cuando se aadi lactato. Esta presencia de una reaccin electroqumica podra significar un montn de cosas para el uso de Shewanella putrefaciens en pilas de combustible ms tarde (Kim). Las bacterias tambin se ha demostrado para derivar la energa mediante la reduccin de uranio, manganeso, vanadio, y tecnecio (Min).
Epilimnion
Chlamydomonas reinhardtii Chlamydomonas reinhardtii, o "Chlamy", es una nica clula de alga verde. Utiliza la fotosntesis como su principal medio para obtener energa. Chlamy tambin puede sobrevivir en la oscuridad en los medios de comunicacin de acetato. Es un organismo esfrica o elipsoidal con dos flagelos de igual tamao situado en la parte anterior de la clula. Estos organismos contienen en forma de copa de cloroplastos, pyrenoids y "manchas oculares" que detectan la luz. Chlamy se encuentran en agua dulce, tierra hmeda, el mar y, a veces incluso nieve. Sobreviven muchos entornos diferentes. Este organismo se utiliza muy a menudo como un organismo modelo en biologa debido a su tiempo de generacin muy
rpido, robustez, crece tanto en la luz y la oscuridad, y se reproducen sexualmente o asexualmente. Chlamydomonas reinhardtii es un antepasado de las plantas y los animales y conserva muchas caractersticas de ambos, incluyendo los flagelos y la capacidad fotosinttica. Chlamy se est estudiando actualmente por combustibles alternativos y energas. Un uso de Chlamydomonas reinhardtii es para la produccin de aceite. Las algas pueden producir y almacenar lpidos que son muy similares a los aceites vegetales. Mediante la manipulacin de este rasgo en esta especie, los cientficos esperan encontrar formas de producir una gran cantidad de lpidos, sin tener que usar los alimentos. Chlamy no es el mejor organismo para utilizar para la produccin de petrleo, pero debido a que es un organismo modelo est siendo estudiado extensivamente. El proceso para la produccin y el almacenamiento de petrleo sigue siendo en gran medida desconocido y los cientficos esperan que el estudio de este organismo ayudar a determinar la va de esta funcin Termoclina Hetertrofos Hipolimnion
Spirochaeta americana
S. americana es un extremfilos. Se ha encontrado en el ambiente anaerbico altamente alcalina de Mono Lake, California. S. Americanatambin pueden habitar las zonas con altas concentraciones de azufre y sal. S. americana tiene a los cientficos especialmente emocionado.Algunos creen que el duro ambiente del lago Mono es similar a la de Marte, dando esperanza a la teora de que la vida existi all. [1, 2] S.americana es un anaerobio obligado y tiene un rango de pH ptimo de 8,0 a 10,5. [2] Las clulas de la cepa Gram-negativos eran mviles y espiroquetas forma-con tamaos de desde 0,2 hasta 0,22 x 8-18 micras. [3] El crecimiento es dependiente de carbonato de sodio y los iones en el medio. No hay crecimiento se produce por debajo del 2% (w / v) de NaCl o por encima de 12% (w / v) de NaCl. Las clulas pueden ser almacenadas congeladas en un medio lquido. Estrictamente anaerbico, chemoheterotroph catalasa-negativos con el tipo fermentativo del metabolismo. Los sustratos preferidos son D-glucosa, fructosa, maltosa, sacarosa, almidn y D-manitol. Requiere vitaminas y extracto de levadura para el crecimiento. Producto final primaria de la fermentacin de glucosa es H2; los productos finales de menor importancia en la fase estacionaria de crecimiento son acetato, formiato, etanol y CO2.Resistente a la kanamicina y la rifampicina, pero sensibles a la gentamicina, tetraciclina y cloranfenicol. [3
El tallo se adhiere a las superficies sumergidas, cuando la clula se divide, a travs del crecimiento vegetativo, el tallo lo hace con la clula. En ocasiones forman una masa de tallos que es lo que le confiere su aspecto macroscpico. Las sustancias polimricas extracelulares (EPS) que forman los tallos estn hechas principalmente de Polisacridos y Protenas, formando un complejo de varias capas que es muy resistente a la degradacin.
Zona afotica
Vibrio harveyi
V. harveyi es un habitante natural del agua de mar, aunque se ha documentado principalmente en los trpicos. A diferencia de su pariente cercano '' Vibrio fischeri'' que es y no formar relaciones simbiticas que viven en libertad, pero es un patgeno comn en muchos organismos marinos. En la ciencia aplicadaVibrio harveyi es una parte integral del estudio de la comunicacin inter e intrabacteriana, la deteccin de qurum, as como la bioluminiscencia. La secuenciacin del genoma, sin duda, contribuir a una mayor comprensin de cmo las bacterias detectan el mundo alrededor de ellos y luego tomar decisiones en funcin de su entorno. V. harveyi es en forma de barra curvada, Gram-negativa, y monotrichous (movilizado por un solo flagelo polar). El autoinductora interspecial AI-2, producida por V. harveyi podra ser una molcula importante en la biotecnologa. Anlisis de la autoinductora podra conducir a Desarrollos de inhibidores sintticos de la va de comunicacin. Esta interferencia tiene la posibilidad de interrumpir los factores de virulencia, lo que conduce a nuevos antimicrobianos. "AI-2 s bien podra funcionar como un antibitico de amplio espectro que altera los sistemas de deteccin de qurum en una amplia variedad de patgenos Gram-negativas y Gram-positivas." (Federle, 2003
Neuston
Pseudomonas aeruginosa es una bacteria, asporgeno, y monoflagellated en forma de barra gram-negativa que tiene una versatilidad nutricional increble. Es una varilla de aproximadamente 1-5 micras de largo y 0,5-1,0 micras de ancho. P. aeruginosa es un respirer obligado, usando la respiracin aerbica (con oxgeno) como su metabolismo ptimo, aunque tambin puede respirar anaerbicamente en nitratos u otros receptores de electrones alternativos. P. aeruginosa puede catabolizar una amplia gama de molculas orgnicas, incluyendo compuestos orgnicos tales como benzoato. Esto, entonces, hace que P. aeruginosa un microorganismo muy ubicuo, ya que se ha encontrado en ambientes tales como el suelo, el agua, los seres humanos, los animales, las plantas, las aguas residuales y los hospitales (1). En todos los ecosistemas acuticos oligotropic, que contienen alto contenido de oxgeno disuelto, pero los nutrientes de la planta baja en todo, P. aeruginosa es el habitante predominante y esto hace claro que el organismo ms abundante en la tierra P. aeruginosa , as como muchos otros Pseudomonas, pueden degradar los hidrocarburos aromticos tales como metilbencenos, que son los subproductos de las industrias de petrleo y se utilizan comnmente como disolventes para esmaltes y pinturas as como en la produccin de medicamentos y productos qumicos. Metilbencenos son considerados como contaminantes ambientales que estn presentes en la atmsfera, subterrneas y los suelos y en las aguas superficiales (25). P. aeruginosa puede descomponer el tolueno, la forma ms simple de metilbenceno. P. aeruginosa degrada tolueno a travs de la oxidacin del grupo metilo a aldehdo, alcohol, y un cido, que despus se convierte a catecol. Por lo tanto, P. aeruginosa se puede utilizar en el control de la contaminacin (26).
Zona pelgica
Alexandrium tamarense
es un unicelular dinoflagelado, fottrofas que vive alrededor de los ambientes marinos costeros. Es la asociacin con las floraciones de algas formas mareas rojas. A.tamarense es de tamao microscpico en alrededor de 25 a 46 micrmetros de longitud por clula. A menudo es de color marrn en color y tiene una forma esfrica. Las floraciones de algas causadas por A. tamarense generalmente contiene millones de estas clulas por litro de agua de mar. Cada una de estas clulas son txicos, ya que producen una neurotoxina que es altamente txico para los organismos en que el medio ambiente, tales como pescados y mariscos. Los animales superiores como los humanos, mamferos y aves son afectadas a travs de la cadena alimentaria. Aunque Alexandrium tamarense proporciona una fuente de alimento para diversos organismos, como el pescado y el marisco, tambin es txico para estos organismos, daar el medio ambiente y sus habitantes. Aunque algunos organismos no se ven afectados por estas toxinas, una acumulacin de estas toxinas sobre puede ser muy txicos para los organismos superiores que se alimentan de ellas. El consumo de los organismos infectados puede causar diferentes enfermedades. Toxinas paralizantes de molusco (PST) son causadas por A. tamarense.Tamarense Alexandrium puede adaptarse rpidamente a diferentes niveles de nitrgeno, por lo que puede sobrevivir en un entorno en constante cambio. Algunas de las cepas de Alexandrium tamarense no son txicos. Las diferentes cepas se encuentran a menudo en las mismas floraciones de algas causados por esta especie Produce toxinas que aunque perjudicial para los seres humanos y otros organismos, tiene un uso potencial de la biotecnologa para la curacin de ciertas enfermedades
Zona bentica
Galdieria sulphuraria es un extremfilos, esfrica, formador de esporas, alga roja eucariota. G. sulphuraria aparece de color amarillo-verde a azul-verde oscuro crecido heterotrficamente en cultivo lquido, y, a menudo de color amarillo o verde en su entorno natural [7]. Es un acidfilo, as como un termfilo, y habita resortes muy cidos a altas temperaturas [4]. G. sulphuraria es un organismo mixotrfico capaz tanto de la fotosntesis y el catabolismo de una amplia variedad de metabolitos [4]. Su capacidad para sobrevivir en ambientes extremos, as como su produccin de ficocianina (PC) han hecho G.sulphuraria un candidato para aplicaciones de la biotecnologa, tanto en la biorremediacin y produccin de PC Como se menciona en la descripcin y significado seccin G. sulphuraria tiene posibles usos tanto en la biorremediacin y produccin de ficocianina (PC) [1,8]. En el caso de la PC, G. sulphuraria 074G cepa crecido en glucosa produce 20-287 veces la cantidad de PC producida por Spirulina platensis , que se utiliza actualmente en la produccin comercial de PC. Otra ventaja de G.sulphuraria es que produce PC aphotically mientras que S. platensis requiere luz para la produccin de PC, por lo que el potencial de produccin comercial ms fcil [1]. G. sulphuraria tambin es un candidato potencial para futuras aplicaciones en la biorremediacin debido a su capacidad capacidad de neutralizar algunos metales biopeligrosos
Hbitat epibiotico
Tubificoides benedii
Planicies de marea eutrficos y sitios costeros contaminados son el hbitat predominante de la marina oligoqueto Tubificoides benedii. Los gusanos viven en poblaciones densas en estos hbitats estresados que a menudo se caracterizan por altos niveles de sulfuro de hidrgeno. Esto indica que tienen una alta capacidad para tolerar condiciones anxicas (y sulfurosos). Las tasas de respiracin de T. benedii, medidas en diferentes concentraciones de oxgeno mostraron que la respiracin aerbica se mantiene incluso en concentraciones muy bajas de oxgeno. Esta capacidad se combina con una alta capacidad de regulacin de la absorcin de oxgeno. La adicin de sulfuro de reducir considerablemente esta capacidad de mantener las vas metablicas aerbicas a bajas concentraciones de oxgeno. El presente trabajo en relacin con los estudios fisiolgicos y estructurales anteriores (Giere et al, 1988;.. Dubilier et al, 1994, 1995, 1997) sugiere estrategias de adaptacin que hacen T. benedii uno de los habitantes de ms xito de vista ecolgico estresado, bentnicas sulfidic entornos. Esto es corroborado por la comparacin con otros tpicos "de sulfuro de anlidos", tales como los poliquetos Capitella capitata y Arenicola puerto deportivo.
Hbitat endobiotico
Epulopiscium fishelsoni
("invitado de Fishelson en el banquete de un pez") es un Gram-positivasbacteria que tiene una simbitica relacin con el cirujano . Es ms conocido por su gran tamao, que van desde 200 hasta 700 m de longitud y unos 80 m de dimetro. Hasta el descubrimiento deThiomargarita namibiensis en 1999, era el mayor bacteria conocida as bacterias presentan muchas caractersticas inusuales, sobre todo debido a las adaptaciones necesarias para su gran tamao.Epulopiscium es extremadamente poliploide , con cromosomas bacterianos que representan tanto como 100.000-200.000 copias delgenoma en toda la clula en un momento dado. [4] [5 ] Puesto que las bacterias se basan en la difusin en lugar del transporte del citoesqueleto como en eucariotas, esto puede ser necesario un exceso de expresin de protenas para dispersar por toda la clula.Este poliploida tambin se asocia con un muy alto flujo de salida de tasa, debido a la sobre-expresin de los genes para las bombas de exportacin. Epulopiscium tiene una anatoma nica que ayuda a superar las limitaciones de tamao inherentes en el volumen celular. Su pared celular contiene muchos pliegues con el fin de aumentar el rea de superficie , y que posee una "corteza" inusual que contiene tbulos, vesculas y otras estructuras que se encuentran generalmente en los eucariotas . Puede ser el caso de que estas estructuras estn involucrados en el transporte intracelular, lo que proporcionara un ejemplo nico de la evolucin convergente en el nivel celular. Si bien estas adaptaciones permiten que las bacterias para romper el lmite superior terico para el tamao, las razones subyacentes evolutivos para las bacterias para crecer a este tamao en el primer lugar siguen siendo especulativos. Una posible razn podra ser la capacidad de evitar la depredacin por protistas .
Chimeneas hidrotermales Barofilos, barotolerantes, bacterias endosimbioticas Beggiatoa alba La tincin Gram-negativas Morfologa Clulas incoloros, alrededor de 1,50 um de dimetro y aproximadamente 2-10 um de longitud, se producen en filamentos con dimetros de aproximadamente 1 a> 50 um. Los organismos pueden existir como clulas individuales o en filamentos que contienen hasta 50 o ms clulas. Las clulas en filamentos son cilndricos y son ms largos que anchos en las cepas ms delgadas (aproximadamente <7 um de dimetro). En las cepas ms amplios (aproximadamente> 7 um de dimetro), las clulas son generalmente en forma de disco y tpicamente son ms anchas que largas. Los filamentos se producen solos o en masas algodonosas en el que cada filamento conserva su individualidad Motilidad Hormogonios y filamentos son mviles por deslizamiento; no hay orgnulos motilidad se conocen. Vuelo sin motor es relativamente rpida (1-8 um s-1) y, a menudo se acompaa de flexin y flexin de los filamentos. Estructuras especializadas La reproduccin es por fisin binaria transversal de las clulas dentro de filamentos; divisiones son hechas por tabicacin, en el que las membranas citoplasmticas de peptidoglicano y cerrar como el iris de un diafragma. Dispersin de filamento es a travs de la muerte sacrificial de clulas (clulas necridial) y rotura del filamento o va sencilla desintegracin. Con algunas cepas, la desintegracin de los filamentos se produce hasta que existan unidades celulares en su mayora simples o dobles (hormogonios); un hormogonium entonces puede crecer hasta convertirse en un filamento. Las clulas contienen inclusiones de
azufre cuando se cultivan en presencia de sulfuro de hidrgeno y, con algunas cepas, tiosulfato. Inclusiones intracelulares de poli-B-hidroxibutrico (PHB) o polifosfato pueden estar presentes. Etapas de descanso no se conocen. Discos de fijacin adjuntos o vainas no estn presentes. Las cpsulas no se forman, pero los filamentos de por lo general producen una matriz de limo.
http://www.juntadeandalucia.es/medioambiente/portal_web/rediam/contenidos_ordenacion/ PDF/Atlas_Org_Planctonicos_1.pdf