El sistema de salud boliviano se organiza en subsectores: pblico, seguridad social, privado y la
medicina tradicional. La fragmentacin del sistema (sobre todo pblico y de la seguridad social) y la segmentacin (al interior de la seguridad social muchos entes gestores) constituye uno de los problemas ms delicados del sistema. La fragmentacin y segmentacin del sistema reproducen profundas inequidades en el acceso al sistema de salud y a los servicios en particular. Un 27 % de la poblacin boliviana es cubierta por el sistema de seguros de salud de corto plazo (seguridad social), un 30% por el Ministerio de Salud y Deportes (pblico), un 10% por el subsector privado, existiendo aproximadamente un 30% de la poblacin que no tiene acceso a ningn tipo de servicios de salud, salvo la prctica de la medicina tradicional.
La Ley de Participacin Popular (1994) que transfiri la infraestructura pblica de salud a los Gobiernos Municipales, dejando la gestin del recurso humano en la administracin central del Ministerio de Salud y sus entes desconcentrados o Servicios Departamentales de Salud (en el mbito de las Prefecturas) ha dado paso a la conformacin de los Directorios Locales de Salud, entidades de gestin compartida en el mbito local donde concurren, el representante de la Alcalda Municipal, el representante del Servicios Departamental de Salud y el representante de la sociedad civil, quienes son responsables de la gestin local de salud en el mbito municipal.
Organizacin de los servicios de salud pblica: Los servicios de salud estn organizados en Redes de Salud. El sistema de salud consigna cuatro niveles de gestin y tres niveles de atencin. Los niveles de gestin responden a las dimensiones: nacional, departamental, municipal y local o del establecimiento de salud.
Los niveles de atencin estn estructurados segn la capacidad resolutiva de los servicios:
El primer nivel de atencin. Se corresponde con la atencin ambulatoria. El segundo nivel de atencin. Con los hospitales generales (especialidades bsicas). El tercer nivel de atencin. Con los hospitales de especialidades.
El modelo de organizacin de los servicios descansa en la estrategia de la atencin primaria de salud. Bajo esa orientacin, la medicina tradicional estar integrada con la medicina occidental y viceversa. El pas viene estudiando las mejores iniciativas para el logro de esta integracin. Una de las preocupaciones en el actual modelo de atencin en el de consolidar la participacin social en los procesos de gestin y organizacin de los servicios de salud.