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Este documento apresenta um plano de estudos para doutorado em modelagem de sensores biológicos e desenvolvimento de circuitos eletrônicos para neuropróteses. O objetivo é aprofundar o conhecimento sobre o funcionamento de um sensor humano e projeto de microcircuitos para implantes neurais, modelando um sensor e construindo uma interface cérebro-máquina para testes clínicos.
Este documento apresenta um plano de estudos para doutorado em modelagem de sensores biológicos e desenvolvimento de circuitos eletrônicos para neuropróteses. O objetivo é aprofundar o conhecimento sobre o funcionamento de um sensor humano e projeto de microcircuitos para implantes neurais, modelando um sensor e construindo uma interface cérebro-máquina para testes clínicos.
Este documento apresenta um plano de estudos para doutorado em modelagem de sensores biológicos e desenvolvimento de circuitos eletrônicos para neuropróteses. O objetivo é aprofundar o conhecimento sobre o funcionamento de um sensor humano e projeto de microcircuitos para implantes neurais, modelando um sensor e construindo uma interface cérebro-máquina para testes clínicos.
Modelagem de sensores biolgicos e desenvolvimento de circuitos eletrnicos para neuroprteses
THIAGO LIMA LOUBACK 30/09/2013
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Sumrio I. Introduo e Justificativa .................................................................................................. 3 II. Objetivos ........................................................................................................................... 5 III. Metodologia ...................................................................................................................... 7 IV. Indicao das instituies de destino no exterior ............................................................. 8 V. Cronograma do plano de atividades ............................................................................... 11 VI. Bibliografia de referncia ................................................................................................ 12
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I. Introduo e Justificativa A rea de engenharia de reabilitao trabalha pesquisando e desenvolvendo solues para repor parcialmente/totalmente funes perdidas por partes do corpo. Os focos dessa rea de pesquisa so variados, desde biomateriais implantveis at prteses de longo prazo de durao. A maior parte das inovaes advindas dessa rea utiliza dispositivos conhecidos como interfaces crebro-mquina (ICMs). ICMs so uma comunicao direta entre dispositivos eletrnico-computacionais e redes neurais e so comumente utilizadas para assistir ou reparar funes cognitivas ou motoras (Vallabhaneni et al. 2005). Os primeiros desenvolvimentos nessa rea eram focados nas neuroprteses para audio, viso e movimento. Neuroprteses so ligaes entre o crebro e um dispositivo capaz de substituir a funo de uma parte danificada ou perdida do crebro, enquanto ICMs esto relacionadas, atualmente, s ligaes entre o crebro e um sistema computadorizado, permitindo criar uma interface com o sistema nervoso central. ICMs so usados tanto em humanos quanto em animais e funcionam a partir da possibilidade de se captar os sinais eltricos decorrentes da atividade do crebro (e.g. eletroencefalograma (EEG), potenciais de campo local, potenciais evocados, multi-unitrio multi-eletrodo, etc.) (Vidal 1977). A partir da aquisio de dados neurais, construo de ICMs para processar os sinais externos e insero de eletrodos no crebro, pode-se estimular eletricamente grupos especficos de neurnios, evocando processos sensoriais e mimetizando as funes de sensores biolgicos. A estimulao eltrica (EE) cerebral consiste na insero de um dipolo eltrico no parnquima cerebral no intuito de gerar potenciais de ao nos neurnios subjacentes ao eletrodo. Por meio da passagem de uma corrente eltrica pelo dipolo, controlada para minimizar leso ou dano das clulas cerebrais, ocorre uma despolarizao do potencial transmembrnico dos neurnios resultando na ativao de neurnios e fibras de passagem devido gerao dos potenciais de ao. (Salzman et al 1990; Romo et al 1998; Graziano et al 2002; Cohen and Newsome 2004; Otto et al 2005; Afraz et al 2006; Pezaris and Reid 2007). Desta forma, a EE se torna uma ferramenta extremamente til para viabilizar a produo de prteses com sensores artificiais. No desenvolvimento da monografia de graduao, trabalhei em um projeto cujo objetivo era utilizar uma ICM em conjunto com um sistema de processamento de sinais e estimulao eltrica ligada cabea de um rato para criar um sistema sensorial artificial. Esse sistema foi utilizado para condicionar o comportamento motor de ratos em um labirinto a partir da exposio dos animais a emissores de infra- 4
vermelho presentes no labirinto. Em meu projeto de doutorado, gostaria de continuar meu desenvolvimento nessa rea, focando na modelagem de sensores do corpo e na construo de ICMs ou neuroprteses funcionais, com o objetivo de traduzir conceitos cientficos em aplicaes prticas, colaborando com estudos clnicos e a indstria na produo de prteses para humanos. Estou especialmente interessado em projetos nessa rea devido possibilidade real de desenvolver produtos capazes de auxiliar pessoas com perdas funcionais. Apesar de existirem vrios produtos atualmente disponveis no mercado, voltados principalmente para audio, muita pesquisa ainda pode ser feita para melhorar o desempenho desses produtos e aumentar as chances de sucesso em pacientes. Parte dos avanos precisa ser feita em determinar como os sensores do corpo funcionam nos humanos, visto que grande parte das pesquisas realizada com animais. Outro grande avano vem da construo de circuitos de microeletrnica para processamento de sinal digital e sua integrao com sistemas neuronais existentes. O encontro destes temas e a possibilidade de trabalhar unindo engenharia e biomedicina so o que mais me atraem nos programas de doutorado da rea.
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II. Objetivos Durante o desenvolvimento de tecnologias para implantes e prteses, a compreenso do funcionamento dos complexos sistemas humanos uma das tarefas mais rduas. Muitas pesquisas foram feitas desde as primeiras tentativas de produzir prteses para reposio de membros, tanto em relao aos materiais utilizados quanto em relao sua integrao com o corpo humano. No entanto, o caminho a ser traado em direo obteno de dispositivos capazes de restaurar funes perdidas em sua totalidade ainda longo (Vallabhaneni et al. 2005). Por esse motivo, o objetivo deste estudo aprofundar o conhecimento em duas reas bastante especficas: o entendimento do funcionamento de um sensor do corpo humano e o desenvolvimento de circuitos microprocessados para implantes neurais. A proposta do trabalho estudar o desenvolvimento de neuroprteses, incluindo o projeto dos microcircuitos eletrnicos utilizados para construir as ICMs e sua interao com o corpo humano. Durante o projeto pretende-se modelar um sensor biolgico, construir uma ICM e realizar um teste clnico para validar o modelo projetado (ver Captulo V). A partir disso, espera-se expandir o conhecimento nas reas de design, projeto e implante de neuroprteses. Considerando a finalidade proposta, alguns objetivos podem ser traados: Modelar um sensor do corpo humano de acordo com a metodologia proposta; Estudar o funcionamento de redes neurais colaborativas; Estudar os diferentes mtodos de aquisio de dados neurais (invasivos e no invasivos); Construir um circuito eletrnico para processamento de sinais analgicos/digitais; Avaliar as diferentes contribuies de frequncia, tempo e amplitude na estimulao eltrica em implantes intra cranianos. Por se tratar de um estudo de longo prazo, vrios outros objetivos podem ser includos durante seu desenvolvimento, ao contribuir com projetos em conjunto com o orientador da universidade de destino.
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Os objetivos apresentados neste captulo podem sofrer alteraes em decorrncia do resultado final dos processos de aplicao, uma vez que os programas aos quais estou aplicando possuem diferenas na estrutura de laboratrios, grade curricular e orientadores com enfoques de pesquisa diversificados, ainda que todos estejam alinhados com o tema central de investigao. 7
III. Metodologia A metodologia deste trabalho no poder ser detalhadamente descrita, pois depende de vrias definies que sero discutidas com o orientador durante as definies iniciais de escopo do projeto (tipo de sensor a ser modelado, a escolha do mtodo de aquisio de dados, a ordem do modelo, etc.), mas a ideia geral da metodologia segue de acordo com os objetivos citados. Inicialmente, a escolha e modelagem de um sensor so primordiais para o desenvolvimento da pesquisa. A escolha do sensor pode determinar se o modelo utilizado ser de um sistema de malha com mltiplas entradas MISO (multiple-input single-output) ou de um sistema SISO (single-input single-output). Tal deciso tambm influenciar a escolha de se trabalhar com uma rede neural artificial para processar os sinais adquiridos. Em qualquer um dos casos, a modelagem proposta de um sistema do tipo caixa preta, realizando a aquisio de dados de entrada e sada (atravs dos possveis meios descritos no Captulo IIntroduo e Justificativa) com diferentes estimulaes externas, determinando a planta a partir da anlise dos dados coletados. Esse modelo da planta ser aproximado de acordo com as necessidades de constante de tempo, garantindo a mesma constante de ganho terica. A ordem da planta importante, pois devemos evitar o overshoot da resposta da planta, considerando a EE aps o processamento do sinal. Para validar o modelo do sistema ser construdo um circuito microprocessado capaz de transduzir os estmulos externos em corrente eltrica. Tal circuito deve processar os sinais analgicos medidos na entrada do sistema e transformar em sinais digitais, que sero usados como entrada para o sistema de estimulao propriamente dito. Aps essa etapa o prprio circuito de estimulao deve ser projetado, levando em conta as variaes necessrias nos padres de EE para que os resultados medidos sejam os mesmos projetados. Por fim, todo o projeto ser validado com testes clnicos e os resultados do monitoramento comparados ao longo do tempo com aqueles da coleta de dados inicial. 8
IV. Indicao das instituies de destino no exterior Meu objetivo profissional me tornar um professor universitrio e pesquisador, continuando a trabalhar com tpicos que aproximem a engenharia das aplicaes mdicas. Depois que terminei minha graduao, trabalhei diretamente na iniciativa privada com diferentes tecnologias e gostaria de redirecionar minha carreira para a rea acadmica, onde posso contribuir mais para a rea de pesquisa alm de proporcionar aos alunos de graduao e ps graduao uma nova viso a respeito de uma rea de grande inovao tecnolgica. Acredito que o prximo passo em direo a esse objetivo um doutorado. Esse programa me permitir trabalhar em laboratrios de tecnologia de ponta, onde os estudos mais avanados dessa rea so atualmente desenvolvidos, me capacitando para desenvolver uma carreira acadmica e fortalecer a pesquisa existente no Brasil. Com o conhecimento e a experincia adquiridos, poderei retornar e coordenar pesquisas, fortalecendo a rea de engenharia biomdica. Acredito tambm que o programa me dar diferentes vises a respeito dessa rea, seja estreitando laos de cooperao com a indstria biomdica mas tambm pela experincia com diferentes tecnologias. Nas universidades em que busco candidatura, a tradio de investimento de larga escala em pesquisa universitria pela iniciativa privada faz com que essa cooperao seja muito forte e possibilita aos laboratrios desenvolver tecnologias inovadoras e investir em equipamentos e produtos voltados diretamente para aplicao no mercado. A proposta de realizar meu programa de doutorado no exterior, em especial nos Estados Unidos, considera possibilidade de atuar nesses laboratrios e de ser orientado por professores reconhecidos internacionalmente na rea de engenharia biomdica. Tenho convico de que poderei me tornar um multiplicador do conhecimento adquirido com esta experincia na ocasio de meu retorno ao Brasil. Considerando o contexto apresentado, desejo continuar meus estudos em um programa de doutorado em engenharia biomdica ou bioengenharia, que aborde temas como: desenvolvimento, construo e implante de neuroprteses, modelagem de sistemas neurais e sistemas sensoriais do corpo humano e aquisio, tratamento e processamento de sinais. Apesar de ser um conjunto que abrange as mais diferentes especialidades, existem vrios programas voltados diretamente para essa rea, com pesquisas correntes de longo prazo e cujos professores trabalham com projetos envolvendo esses temas em conjunto com laboratrios de medicina e engenharia. As 9
instituies citadas so referncia na rea de engenharia biomdica e o processo para escolha das mesmas partiu da excelncia em ensino, disponibilidade de laboratrios alinhados com meu tema de interesse, verbas disponveis para projetos nessa rea e contato com professores da rea que tenham interesse em orientar meu estudo. O parecer final da candidatura ao qual esse plano de ensino se refere se dar entre os meses de maro e maio de 2014, sendo que o plano pode sofrer pequenas alteraes, devido aos acordos com o professor orientador e a universidade de destino. Desta forma, as universidades s quais apresentei minha candidatura para o programa de Doutorado so as seguintes: University of California, Irvine (UCI) A UCI uma universidade jovem, com menos de 50 anos, e de reconhecida competncia em ensino e pesquisa. A rea de pesquisa em engenharia biomdica foi criada em 1998 e, desde ento, vem se desenvolvendo rapidamente fazendo com que a UCI aparea liderando os rankings nacionais em produo de artigos na rea. Caso eu seja aceito, minha inteno trabalhar com o professor Zoran Nenadic, que conduz pesquisas de anlise e modelagem de redes neurais biolgicas, interfaces crebro-mquina e processamento de sinais biomdicos. University of North Carolina at Chapel Hill (UNC) / North Carolina State University (NCSU) A UNC uma universidade que oferece um programa inovador em conjunto com a escola de medicina da NCSU. O doutorado desenvolvido em conjunto em ambos campi e a colaborao das reas de engenharia e medicina constante. Caso eu seja aceito, minha inteno trabalhar no laboratrio da professora Helen Huang, focado na rea de engenharia de reabilitao, responsvel por pesquisas com prteses e interfaces crebro-mquina. University of Minnesota, Twin Cities (UMN) A UMN uma instituio reconhecida pelo ensino na rea das cincias exatas e engenharia. O programa de engenharia biomdica desenvolvido em conjunto com um centro acadmico de sade, localizado adjacentemente a um hospital de ensino, onde os projetos desenvolvidos no laboratrio so testados. Caso eu seja aceito, minha inteno trabalhar no laboratrio do professor Hubert Lim, que conduz um laboratrio focado no desenvolvimento e aplicao de interfaces crebro-mquina voltados para a rea de prteses neurais e neuroplasticidade e que busca transformar conceitos tericos em aplicaes prticas.
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University of Texas at Austin (UTA) A UTA uma instituio de ensino respeitada nos Estados Unidos e reconhecida internacionalmente e oferece programas de mestrado e doutorado na rea de engenharia biomdica desde 1969, sendo pioneira nesta rea de ensino. Alm disso, aparece liderando rankings de instituies de ensino superior e possui um corpo docente diversificado, vindos de vrios pases, que busca estar frente em suas reas de pesquisa. Caso eu seja aceito, minha inteno trabalhar no laboratrio da professora Lisa Griffin, que conduz pesquisas na rea de sistemas de estimulao eltrica e de instrumentao biomdica. Georgia Tech/Emory University (GATech) As universidades de Emory e Georgia Tech oferecem um programa conjunto focado no desenvolvimento de engenheiros biomdicos. A parceria foi criada com a escola de Medicina de Emory e a escola de Engenharia de GATech, ambas com excelncia e reconhecimento internacional em suas reas de pesquisa. O programa foi recentemente premiado com o segundo lugar no ranking dos programas de engenharia biomdica. Caso eu seja aceito, minha inteno trabalhar no laboratrio dos professores Garett Stanley e Maysam Ghovanloo, do Departamento de Engenharia Biomdica, que desenvolvem pesquisas em processamento de sinais neuronais, neuroprteses e dispositivos microeletrnicos. Os professores apontados acima como possveis orientadores so aqueles com os quais foi feito contato antes do envio da candidatura do doutorado, sem necessariamente implicar que os mesmos sero orientadores do projeto apresentado. Algumas faculdades apresentam um esquema de job rotation durante o doutorado e na maioria delas, a escolha do orientador se d normalmente durante o primeiro ano do doutorado. No entanto, o orientador ser um professor da mesma rea e alinhado com os objetivos apresentados neste plano de estudo.
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V. Cronograma do plano de atividades O incio das atividades se dar no segundo semestre de 2014 (agosto ou setembro). A data precisa depende dos processos de candidatura, da matrcula na universidade de destino e do processo de retirada do visto estudantil. Considerando esses fatores, o cronograma inicial previsto para este estudo : Atividades Semestrais Ano 2014 2015 2016 2017 2018 Semestre 2 1 2 1 2 1 2 1 Reviso bibliogrfica e redao da tese Avaliao e validao da metodologia Modelagem do sensor Elaborao do projeto do circuito Validao do modelo com ensaios no laboratrio Construo do circuito Testes do projeto Concluso da elaborao da tese. Defesa da tese de doutorado.
O cronograma do plano de atividades apresentado neste captulo pode sofrer alteraes em decorrncia do resultado final dos processos de aplicao, sem no entanto prejudicar os objetivos propostos e sem exceder o limite de 48 meses para desenvolvimento do doutorado. 12
VI. Bibliografia de referncia [1] AFRAZ, S. R.; KIANI, R.; ESTEKY, H. (2006) Microstimulation of inferotemporal cortex influences face categorization Nature 442:692 695 [2] BUTOVAS, S.; SCHWARZ, C. (2003) Spatiotemporal effects of microstimulation in rat neocortex: a parametric study using multielectrode recordings [3] CHAPIN, John et al. (1999) Real-time control of a robot arm using simultaneously recorded neurons in the motor cortex [4] CHAPIN, John (2002) Using multi-neuron population recordings for neural prosthetics [5] CARMENA, Jose M. et al. (2003) Learning to Control a BrainMachine Interface for Reaching and Grasping by Primates [6] COHEN, M. R.; NEWSOME, W. T. (2004) What electrical microstimulation has revealed about the neural basis of cognition. Current Opinion in Neurobiology, vol. 14, no. 2, pp. 169177 [7] DAS, A. (2001) The brain decade in debate Sensory and motor - Brazilian Journal of Medical and Biological Research (2001) 34: 1497-1508 [8] DOTY, R. W. (1965) Conditioned reflexes elicited by electrical stimulation of the brain in macaques Journal of Neurophysiology 28:623 640 [9] DOTY, R. W. (1969) Electrical stimulation of the brain in behavioral context [10] DOTY, R. W.; LARSEN, R. M.; RUTHLEDGE JR., L. T. (2000) Conditioned reflexes established to electrical stimulation of cat cerebral cortex - Journal of Neurophysiology 19:401 415 [11] FITZSIMMONS, N. A.; DRAKE, W. et al. (2007) Primate Reaching Cued by Multichannel Spatiotemporal Cortical Microstimulation [12] GRAZIANO, M. S.; TAYLOR, C. S.; MOORE, T. (2002) Complex movements evoked by microstimulation of pre-central cortex Neuron vol. 34, no. 5, pp. 841 851 [13] LAFUENTE, Victor de; ROMO, Ranulfo (2005) Neuronal correlates of subjective sensory experience [14] OLDS, J.; MILNER, P. (1954) Positive reinforcement produced by electrical stimulation of septal area and other regions of rat brain [15] OTTO, K. J. ROUSCHE, P. J.; KIPKE, D. R. (2005) Microstimulation in auditory cortex provides a substrate for detailed behaviors J. Neural Eng., vol. 2, no. 2, pp. 4251 13
[16] OVER, E. A.; HOOGE, I. T. et al (2007) Coarse-to-fine eye movement strategy in visual search Vision Res vol. 47, no.17, pp. 2272-2280 [17] PEZARIS, John S. ; REID, R. C. (2007) Demonstration of artificial visual percepts generated through thalamic microstimulation Proc. Nat. Acad. Sci. USA, vol. 104, no. 18, pp. 76707675 [18] PHILLIPS, M. H.; EDELMAN, J. A. (2008) The dependence of visual scanning performance on saccade, fixation, and perceptual metrics Vision Research 48:926-936 [19] ROMO, R. et al (1998) Somatosensory discrimination based on cortical microstimulation Nature vol. 392, no. 6674, pp. 387390 [20] SALZMAN, C. D. et al (1990) Cortical microstimulation influences perceptual judgments of motion direction Nature vol. 346, no. 6280, pp. 174177 [21] VALLABHANENI, Anirudh; WANG, Tao; HE, Bin (2005) Brain-Computer Interface Bioelectric Engineering, pp. 85-121 [22] VIDAL, Jacques J. (1977) Real-Time Detection of Brain Events in EEG Procedings of the IEEE, Maio 1977 [23] WOLPAW, Jonathan R. (2000) BrainComputer Interface Technology: A Review of the First International Meeting - IEEE TRANSACTIONS ON REHABILITATION ENGINEERING, VOL. 8, NO. 2, Junho 2000
A bibliografia de referncia apresentada neste captulo pode sofrer alteraes em decorrncia do resultado final dos processos de aplicao, visto que os programas aos quais estou aplicando possuem diferenas na estrutura de laboratrios, grade curricular e orientadores com enfoque de pesquisa diversificados, ainda que todos estejam alinhados com o tema central do projeto.