FACULTAD DE CIENCIAS QUIMICAS Y DE LA SALUD BIOQUMICA ENZIMAS
1 BIOQUMICA ENZIMAS INTRODUCCION:
LA ENZIMA COMO UNIDAD FUNDAMENTAL DE VIDA
Cada clula y cada tejido tienen su actividad propia, lo que comporta continuos cambios en su estado bioqumico, en la base de la cual estn las enzimas, que tienen el poder de catalizar, facilitar, y agilizar determinados procesos sintticos y analticos. Los propios genes son reguladores de la produccin de las enzimas; por tanto, genes y enzimas pueden ser considerados como las unidades fundamentales de la vida. Este concepto poco difundido casi hasta el siglo XX, se ha desarrollado y concretado cada vez ms, y constituye un componente esencial de diversas disciplinas: la microbiologa, la fisiologa, la bioqumica, la inmunologa y la taxonoma, formando adems parte del campo aplicado, en gran variedad de industrias. El rasgo particular de las enzimas es que pueden catalizar procesos qumicos a baja temperatura, compatible con la propia vida, sin el empleo de sustancias lesivas para los tejidos. La vida es, en sntesis, una cadena de procesos enzimticos, desde aquellos que tienen por sustratos los materiales ms simples, como el agua (H2O) y el anhdrido carbnico (CO2), presentes en los vegetales para la formacin de hidratos de carbono, hasta los ms complicados que utilizan sustratos muy complejos. La formacin de los prtidos, los glcidos y los lpidos es un ejemplo tpico: Son a la vez degradados y reconstruidos por otras reacciones enzimticas, produciendo energa a una velocidad adecuada para el organismo, sin el gasto energtico que exigen los mtodos qumicos de laboratorio.
LAS ENZIMAS
Los enzimas son protenas que catalizan reacciones qumicas en los seres vivos. Los enzimas son catalizadores, es decir, sustancias que, sin consumirse en una reaccin, aumentan notablemente su velocidad. No hacen factibles las reacciones imposibles, sino que solamente aceleran las que espontneamente podran producirse. Ello hace posible que en condiciones fisiolgicas tengan lugar reacciones que sin catalizador requeriran condiciones extremas de presin, temperatura o pH.
2 BIOQUMICA ENZIMAS IMPORTANCIA BIOMDICA DE LAS ENZIMAS
Sin enzimas, no sera posible la vida que conocemos. Igual que la biocatlisis que regula la velocidad a la cual tienen lugar los procesos fisiolgicos, las enzimas llevan a cabo funciones definitivas relacionadas con salud y la enfermedad. En tanto que, en la salud todos los procesos fisiolgicos ocurren de una manera ordenada y se conserva la homeostasis, durante los estados patolgicos, esta ltima puede ser perturbada de manera profunda. Por ejemplo, el dao tisular grave que caracteriza a la cirrosis heptica puede deteriorar de manera notable la propiedad de las clulas para producir enzimas que catalizan procesos metablicos claves como la sntesis de urea. La incapacidad celular para convertir el amoniaco txico a urea no txica es seguida por intoxicacin con amoniaco y por ultimo coma heptico. Un conjunto de enfermedades genticas raras, pero con frecuencia debilitantes y a menudo mortales, proporciona otros ejemplos dramticos de las drsticas consecuencias fisiolgicas que pueden seguir al deterioro de la actividad enzimtica, inclusive de una sola enzima. Despus del dao tisular grave (por ejemplo, infarto del miocardio o pulmonar, trituracin de un miembro) o siguiendo a multiplicacin celular descontrolada (por ejemplo, carcionoma prosttico), las enzimas propias de tejidos especficos pasan a la sangre. Por lo tanto, la determinacin de estas enzimas intracelulares en el suero sanguneo proporciona a los mdicos informacin valiosa para el diagnstico y el pronstico.
CARACTERSTICAS DE LAS ENZIMAS
Desde el punto de vista qumico, las enzimas estn formadas de carbono (C), Hidrgeno (H), oxigeno (O), Nitrgeno (Ni), y Azufre (S) combinados, pero siempre con peso molecular bastante elevado y comn propiedades catlicas especficas. Su importancia es tal que puede considerarse la vida como un "orden sistemtico de enzimas funcionales". Cuando este orden y su sistema funcional son alterados de algn modo, cada organismo sufre ms o menos gravemente y el trastorno puede ser motivado tanto por la falta de accin como por un exceso de actividad de enzima. Las enzimas son catalizadores de naturaleza protenica que regulan la velocidad a la cual se realizan los procesos fisiolgicos, producidos por los organismos vivos. En consecuencia, las deficiencias en la funcin enzimtica causan patologas. Las enzimas, en los sistemas biolgicos constituyen las bases de las complejas y variadas reacciones que caracterizan los fenmenos vitales. La fijacin de la energa solar y la sntesis de sustancias alimenticias llevadas a cabo por los vegetales dependen de las enzimas presentes en las plantas. Los animales, a su vez, estn dotados de las enzimas que les permiten aprovechar los alimentos con
3 BIOQUMICA ENZIMAS fines energticos o estructurales; las funciones del metabolismo interno y de la vida de relacin, como la locomocin, la excitabilidad, la irritabilidad, la divisin celular, la reproduccin, etc. Estn regidas por la actividad de innumerables enzimas responsables de que las reacciones se lleven a cabo en condiciones favorables para el individuo, sin liberaciones bruscas de energa a temperaturas fijas en un medio de pH, concentracin salina, etc.; prcticamente constante. A diferencia de un catalizador inorgnico que interviene en numerosas reacciones las enzimas producidas por los organismos vivos habitualmente solo catalizan un tipo de reaccin o solo una reaccin determinada; la especificidad de las enzimas es tan marcadas que en general actan exclusivamente sobre sustancias que tienen una configuracin precisa; por ejemplo, si solo atacan a los aminocidos que tienen su carbono a , asimtrico, con estructura L-, no muestran la menor actividad sobre formas idnticas de dichos aminocidos, pero que sean del tipo D-. En los sistemas biolgicos se llevan a cabo diversas reacciones a partir de la misma sustancia; por ejemplo algunos microorganismos convierten la glucosa en alcohol y bixido de carbono, al paso que otros grmenes la convierten en cido lctico o cido pirvico o acetaldehdo. Esto quiere decir que la glucosa puede descomponerse en distintos productos y aunque todas las posibilidades son tericas y prcticamente posibles la presencia de ciertas enzimas favorece uno de los caminos que llevan a la acumulacin de determinados compuestos. Las enzimas, por lo tanto, se consideran como catalizadores altamente especficos que: Modifican la velocidad de los cambios promovidos por ellas. Determinan que sustancias particulares, de preferencia a otras distintas son las que van a sufrir los cambios. Impulsan dentro de los distintos cambios posibles que pueda seguir una sustancia, cul de ellos en especial, ser el utilizado. Las enzimas representan las sustancias encargadas de graduar la velocidad de una reaccin determinada en el interior de las clulas; como en las diversas clulas se realizan infinidad de reacciones, ya que en una de ellas se encuentran varios miles de sustancias, se deduce, tambin, la presencia de varios miles de enzimas. Es posible, por lo tanto, que la mayor parte de esta estructura protenica celular est formada por enzimas, encargadas de las diversas funciones de sntesis, degradacin, oxidacin, etc. caractersticas de la actividad vital de los distintos organismos. PROPIEDADES DE LAS ENZIMAS Las enzimas son catalizadores proteicos que incrementan la rapidez de una reaccin y que no se consumen durante una reaccin que catalizan.
4 BIOQUMICA ENZIMAS A. Sitios activos. Las molculas enzimticas contienen un saco o surco especial denominado sitio activo. El sitio activo contiene cadenas laterales de aminocidos que crean una superficie natural complementaria con el sustrato. El sitio activo fija al sustrato y forma un complejo de enzima y sustrato(ES), este ES se convierte en complejo de enzima y producto (EP), que se disocia ulteriormente en estos dos componentes.
B. Eficiencia cataltica. La mayor parte de las reacciones que se catalizan por enzimas son altamente eficiente, y proceden con una rapidez de 10 3 a 10 8 veces mayor que las reacciones no catalizadas. De manera caracterstica cada molcula enzimtica es capaz de transformar de 100 a 1000 molculas de sustrato en producto cada segundo. El nmero de molculas de sustrato que se han convertido en producto por molcula enzimtica por segundo se denomina nmero de recambio.
C. Especificidad Las enzimas son altamente especficas, y entran en interaccin con uno o ms sustratos y catalizan solo un tipo de reaccin qumica
D. Cofactores. Algunas enzimas se relacionan con un cofactor no protenico que se necesita para la actividad enzimtica. Entre los factores que se encuentran de manera ms frecuente estn iones metlicos como Zn 2+ y Fe ++ , y molculas orgnicas conocidas como coenzimas, que son a menudo sustancias derivadas de vitaminas. Por ejemplo la coenzima NAD + contiene niacina, la llamada FAD contiene riboflavina, y la coenzima A contiene cido pantotico. Se llama holoenzima a la enzima con su cofactor. El termino apoenzima se refiere a la porcin protenica de la holoenzima.
5 BIOQUMICA ENZIMAS En ausencia del cofactor apropiado, la apoenzima no manifiesta ninguna actividad biolgica de manera caracterstica. El grupo prosttico es una coenzima firmemente unidad a la enzima, que no se disocia de ella (ejemplo, la biotina que se encuentra en las carboxilasas.)
E. Regulacin. La actividad enzimtica puede ser regulada; esto es, las enzimas se activan o se inhiben, de modo que la tasa de formacin del producto en particular satisface las necesidades de la clula.
F. Localizacin dentro de la clula. Muchas enzimas estn localizadas en organelos especficos dentro de la clula. Esta distribucin en compartimientos sirve para aislar el sustrato o al producto de la reaccin de otras reacciones competitivas. Esto ofrece un ambiente favorable para la reaccin y organiza a las miles de enzimas que se encuentran dentro de la clula para que efecten sus funciones inherentes. (PAMELA C. CHAMPE, PhD BIOQUIMICA 3 era edicin pg.62- 63).
Las propiedades de las enzimas derivan del hecho de ser protenas y de actuar como catalizadores. Como protenas, poseen una conformacin natural ms estable que las dems conformaciones posibles. As, cambios en la conformacin suelen ir asociados en cambios en la actividad cataltica. Los factores que influyen de manera ms directa sobre la actividad de un enzima son: pH temperatura cofactores 1. EFECTO DEL pH SOBRE LA ACTIVIDAD ENZIMTICA Los enzimas poseen grupos qumicos ionizables (carboxilos -COOH; amino -NH 2 ; tiol -SH; imidazol, etc.) en las cadenas laterales de sus aminocidos. Segn el pH del medio, estos grupos pueden tener carga elctrica positiva, negativa o neutra. Como la conformacin de las protenas depende, en parte, de sus cargas elctricas, habr un pH en el cual la conformacin ser la ms adecuada para la actividad cataltica. Este es el llamado pH ptimo.
6 BIOQUMICA ENZIMAS La mayora de los enzimas son muy sensibles a los cambios de pH. Desviaciones de pocas dcimas por encima o por debajo del pH ptimo pueden afectar drsticamente su actividad. As, la pepsina gstrica tiene un pH ptimo de 2, la ureasa lo tiene a pH 7 y la arginasa lo tiene a pH 10 (Figura de la izquierda). Como ligeros cambios del pH pueden provocar la desnaturalizacin de la protena, los seres vivos han desarrollado sistemas ms o menos complejos para mantener estable el pH intracelular: Los amortiguadores fisiolgicos.
2. EFECTO DE LA TEMPERATURA SOBRE LA ACTIVIDAD ENZIMTICA En general, los aumentos de temperatura aceleran las reacciones qumicas: por cada 10C de incremento, la velocidad de reaccin se duplica. Las reacciones catalizadas por enzimas siguen esta ley general. Sin embargo, al ser protenas, a partir de cierta temperatura, se empiezan a desnaturalizar por el calor. La temperatura a la cual la actividad cataltica es mxima se llama temperatura ptima (Figura de la derecha). Por encima de esta temperatura, el aumento de velocidad de la reaccin debido a la temperatura es contrarrestado por la prdida de actividad cataltica debida a la desnaturalizacin trmica, y la actividad enzimtica decrece rpidamente hasta anularse.
3. EFECTO DE LOS COFACTORES SOBRE LA ACTIVIDAD ENZIMTICA A veces, un enzima requiere para su funcin la presencia de sustancias no proteicas que colaboran en la catlisis: los cofactores. Los cofactores pueden ser iones inorgnicos como el Fe ++ , Mg ++ , Mn ++ , Zn ++ etc. Casi un tercio de los enzimas conocidos requieren cofactores. Cuando el cofactor es una molcula
7 BIOQUMICA ENZIMAS orgnica se llama coenzima. Muchos de estas coenzimas se sintetizan a partir de vitaminas. En la figura inferior podemos observar una molcula de hemoglobina (protena que transporta oxgeno) y su coenzima (el grupo hemo). Cuando los cofactores y las coenzimas se encuentran unidos covalentemente al enzima se llaman grupos prostticos. La forma catalticamente activa del enzima, es decir, la enzima unida a su grupo prosttico, se llama holoenzima. La parte proteica de un holoenzima (inactiva) se llama apoenzima, de forma que:
ASPECTOS GENERALES SOBRE LAS ENZIMAS Prcticamente todas las reacciones qumicas que tienen lugar en los seres vivos estn catalizadas por enzimas. Los enzimas son catalizadores especficos: cada enzima cataliza un solo tipo de reaccin, y casi siempre acta sobre un nico sustrato o sobre un grupo muy reducido de ellos. En una reaccin catalizada por un enzima: 1. La sustancia sobre la que acta el enzima se llama sustrato. 2. El sustrato se une a una regin concreta de la enzima, llamada centro activo. El centro activo comprende (1) un sitio de unin formado por los aminocidos que estn en contacto directo con el sustrato y (2) un sitio apoenzima + grupo prosttico= holoenzima
8 BIOQUMICA ENZIMAS cataltico, formado por los aminocidos directamente implicados en el mecanismo de la reaccin 3. Una vez formados los productos el enzima puede comenzar un nuevo ciclo de reaccin
Las enzimas, a diferencia de los catalizadores inorgnicos catalizan reacciones especficas. Sin embargo hay distintos grados de especificidad. El enzima sacarosa es muy especfico: rompe el enlace -glucosdico de la sacarosa o de compuestos muy similares. As, para el enzima sacarosa, la sacarosa es su sustrato natural, mientras que la maltosa y la isomaltosa son sustratos anlogos. El enzima acta con mxima eficacia sobre el sustrato natural y con menor eficacia sobre los sustratos anlogos. Entre los enzimas poco especficos estn las proteasas digestivas como la quimotripsina, que rompe los enlaces amida de protenas y pptidos de muy diverso tipo.
MODO DE ACCIN DE LAS ENZIMAS En las reacciones espontneas, los productos finales tienen menos energa libre comienzo de la reaccin requiere un aporte inicial de energa. Esta energa inicial que hay que suministrar a los reactantes para que la reaccin transcurra se llama energa de activacin (E a ). Cuanto menor es la E a ms fcilmente transcurre la reaccin. 1.- El enzima y su sustrato 2.- Unin al centro activo 3.- Formacin de productos
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La accin de los catalizadores consiste, precisamente, en disminuir la E a (Figura superior derecha). Los enzimas son catalizadores especialmente eficaces, ya que disminuyen la E a an ms que los catalizadores inorgnicos. Por ejemplo, la descomposicin del agua oxigenada (H 2 O 2 ) para dar H 2 O y O 2 puede ocurrir sin catalizador, con un catalizador inorgnico (platino), o con un enzima especfico (catalasa). Las respectivas E a para cada proceso son 18, 12 y 6 Kcal/mol. As, se puede calcular que el platino acelera la reaccin 20.000 veces, mientras que la catalasa la acelera 370.000 veces. Para que una reaccin qumica tenga lugar, las molculas de los reactantes deben chocar con una energa y una orientacin adecuadas. La actuacin del enzima (1) permite que los reactantes (sustratos) se unan a su centro activo con una orientacin ptima para que la reaccin se produzca y (2) modifica las propiedades qumicas del sustrato unido a su centro activo, debilitando los enlaces existentes y facilitando la formacin de otros nuevos (Figuras inferiores):
Hay dos modelos sobre la forma en que el sustrato se une al centro activo del enzima: Perfil energtico de una reaccin espontnea Perfil energtico de una reaccin catalizada
10 BIOQUMICA ENZIMAS el modelo llave-cerradura el modelo del ajuste inducido
MODELO LLAVE-CERRADURA El modelo llave-cerradura supone que la estructura del sustrato y la del centro activo son complementarias, de la misma forma que una llave encaja en una cerradura. Este modelo es vlido en muchos casos, pero no es siempre correcto.
MODELO DEL AJUSTE INDUCIDO En algunos casos, el centro activo adopta la conformacin idnea slo en presencia del sustrato. La unin del sustrato al centro activo del enzima desencadena un cambio conformacional que da lugar a la formacin del producto. Este es el modelo del ajuste inducido (Figura de la derecha.). Sera algo as como un cascanueces, que se adapta al contorno de la nuez.
REGULACIN DE LA ACTIVIDAD ENZIMTICA
Una molcula de enzima no tiene por qu actuar siempre a la misma velocidad. Su actividad puede estar modulada por:
11 BIOQUMICA ENZIMAS cambios en el pH cambios en la temperatura presencia de cofactores las concentraciones del sustrato y de los productos finales presencia de inhibidores modulacin alosterico modificacin covalente activacin por protelisis isoenzimas
EFECTO DE LAS CONCENTRACIONES SOBRE LA ACTIVIDAD ENZIMTICA La velocidad de una reaccin enzimtica depende de la concentracin de sustrato. La Figura de la derecha muestra la velocidad de una reaccin enzimtica a 6 concentraciones distintas de sustrato. Adems, la presencia de los productos finales puede hacer que la reaccin sea ms lenta, o incluso invertir su sentido (Figura inferior).
INHIBICIN DE LA ACTIVIDAD ENZIMTICA
12 BIOQUMICA ENZIMAS Cualquier sustancia que pueda disminuir la velocidad de una reaccin catalizada por enzimas se denomina inhibidor. Los inhibidores reversibles se fijan a las enzimas mediante enlaces no covalentes. La dilucin del complejo de enzima e inhibidor da por resultado disociacin del inhibidor enlazado de manera reversible, y recuperacin de la actividad enzimtica. Ocurre inhibicin irreversible cuando una enzima inhibida no recupera la actividad con la dilucin del complejo de enzima e inhibidor. Las dos clases de inhibicin que se encuentran ms a menudo son competitiva y no competitiva.
A. Inhibicin competitiva: La inhibicin de esta clase se produce cuando el inhibidor se fija de manera reversible al mismo sitio que ocupara normalmente el sustrato y, en consecuencia, compite con el sustrato para ocupar ese sitio. 1. Efecto sobre la V mx : el (S) en cantidad creciente invierte el efecto de un inhibidor competitivo. A concentracin suficiente elevada del sustrato, la velocidad de la reaccin alcanza la V mx observada en ausencia de inhibidor (fig. 5-12). 2. Efecto sobre la K m : un inhibidor competitivo incrementa la K m aparente para un sustrato determinado. Esto significa que en presencia de un inhibidor competitivo, se requiere ms sustrato para lograr V mx.
Inhibidor competitivo Inhibidor no competitivo
13 BIOQUMICA ENZIMAS 3. Efecto sobre la grfica de Lineweaver-Burke: la inhibicin competitiva manifiesta el trazo caracterstico de la grfica de lineweaver-burke en el que las curvas de las reacciones inhibida y no inhibida entran en interseccin sobre el eje Y a 1/V max (V max se conserva sin cambios). Las reacciones inhibida y no inhibida efectan intersecciones diferentes sobre el eje x, lo que indica que la K m aparente est aumentada en presencia del inhibidor competitivo (fig.5-12). 4. Los frmacos llamados estatinas son ejemplos de inhibidores competitivos: los agentes antihiperlipidemicos de este grupo inhiben de manera competitiva la primera etapa programada de la sntesis del colesterol. Esta reaccin es catalizada por la reductasa de la hidroximetilglutaril-CoA (reductasa de la HMG-CoA) Las estatinas, como la atorvastina y la sinvastina son anlogos estructurales del sustrato natural para esta enzima y compiten con eficacia para inhibir a la reductasa de la HMG-CoA. Al hacerlo inhiben la sntesis de novo del colesterol, y de esta manera disminuye las concentraciones plasmticas de este.
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B. INHIBICION NO COMPETITIVA: La inhibicin de este tipo se reconoce por su efecto caracterstico sobre la V max. Ocurre inhibicin no competitiva cuando el inhibidor y el sustrato se fijan en sitios diferentes de la enzima. El inhibidor no competitivo puede fijarse a la enzima libre o al complejo ES, y de esta manera impide que ocurra la reaccin. 1. Efecto sobre la V max : la inhibicin no competitiva no puede quedar superada por el incremento de la concentracin del sustrato. Por este motivo, los inhibidores no competitivos disminuyen la V max de la reaccin. 2. Efecto sobre la K m : los inhibidores no competitivos no interfieren con la fijacin del sustrato a la enzima. Por este motivo la enzima manifiesta la misma K m en presencia o en ausencia de un inhibidor de este tipo. 3. Efecto sobre la grfica de Lineweaver-Burke: la inhibicin no competitiva se distingue con facilidad de la competitiva al proyectar 1/V 0 contra 1/(S) y al observar que la V max disminuye en presencia del inhibidor no competitivo, en tanto que K m
persiste sin cambios. 4. Ejemplos de inhibidores no competitivos: algunos inhibidores actan formando enlaces covalentes con grupos especficos de enzimas. Por ejemplo, el plomo forma enlaces covalentes con las cadenas laterales del sulfihidrilo de la cistena en las protenas. La fijacin de este metal pesado produce inhibicin competitiva. La ferroquelatasa, enzima que cataliza la insercin del Fe 2+ en la protoporfirina es un ejemplo de enzima sensible a la inhibicin por el plomo. Otros ejemplos de inhibidores no competitivos son ciertos insecticidas que producen efectos neurotxicos como consecuencia de su fijacin irreversible sobre el sitio cataltico de la enzima acetilcolinesterasa (enzima que segmenta al neurotransmisor acetilcolina). C. Inhibidores enzimticos como frmacos. Por lo menos la mitad de los frmacos vendidos actan como inhibidores enzimticos. Por ejemplo, los ampliamente prescritos antibiticos lactamicos beta, como penicilina y amoxicilina, inhiben a las enzimas que participan en la sntesis de la pared celular bacteriana. Los frmacos pueden actuar tambin al inhibir las reaccio9nes extracelulares. Ilustren este caso los inhibidores de la
15 BIOQUMICA ENZIMAS enzima conversora de angiotensina (ACE). Disminuyen la presin arterial al bloquear a la enzima que segmenta a la angiotensina I para que forme a la poderosa sustancia vasoconstrictora angiotensina II. Estos frmacos que son captoprilo, enalaprilo, y lisinoprilo producen vasodilatacin y reduccin resultante de la presin arterial. (PAMELA C. CHAMPE, PhD BIOQUIMICA 3 era edicin pg. 68-69-70).
LA ESTRUCTURA ENZIMTICA
Por su estructura y composicin qumica puede afirmarse que el origen de las enzimas est vinculando al origen de las sustancias proteicas. Al hablar del origen de la vida se ha citado el xito de los experimentos realizados en el laboratorio para la produccin de aminocidos; estos aminocidos son los que precisamente constituyen la base del edificio proteico. Tambin en el laboratorio se ha intentado la sntesis de protenas a partir de aminocidos. La sede de las enzimas es el citoplasma. Los cloroplastos vegetales contienen una amplia gama enzimas encargadas de la funcin cloroflica, proceso que a travs de reacciones qumicas complejas y encadenadas transforman compuestos inorgnicos, como el agua, y el anhdrido carbnico, en sustancias complejas adecuadas para ser entre otras cosas el alimento fundamental de los animales.
16 BIOQUMICA ENZIMAS En las mitocondrias existe un sistema de transporte de electrones que determinan importantes fenmenos de xido reduccin, durante los cuales se forman notables cantidades de ATP, que es un compuesto altamente energtico del que depende la mayor parte de metabolismo, y coma, por tanto el trabajo de las clulas; en las mitocondrias se produce el metabolismo enzimtico de los cidos grasos, los cuales son en parte elaborados tambin en el citoplasma. En los ribosomas tiene lugar concretamente todas las sntesis de las sustancias proteicas, mientras que en los lisosomas se producen enzimas hidrolticos cuya misin escindir, con la intervencin del agua, molculas grandes en otras menores, que pueden a su vez ser utilizadas por las clulas; en cambio, las enzimas glucolticos estn difundidos en el citoplasma. La localizacin de las sedes de las distintas operaciones enzimticas antes mencionadas ha sido posible a travs del sistema de ruptura de las clulas y de la separacin de los distintos componentes mediante centrifugacin diferencial del homogeneizado de estas la ruptura celular y la subdivisin de los componentes subcelulares se realizan actualmente utilizando los tejidos, por ejemplo con saltos bruscos desde temperaturas inferiores a 0 C hasta temperaturas ms elevadas con cambios de presin osmtica o mediante ultrasonidos.
NATURALEZA QUMICA DE LAS ENZIMAS
Existen numerosas razones para afirmar que las enzimas son protenas. La Ms importantes son las siguientes: a. El anlisis de las enzimas obtenidas en forma ms pura, cristalizada, demuestra que son protenas. b. Las enzimas son inactivadas a altas temperaturas y, en general, la cintica de la desnaturalizacin trmica de las enzimas da resultados muy parecidos a los de la desnaturalizacin trmica de las protenas; por ejemplo el Q10 de la mayora de las reacciones qumicas es de 2 a 3, y, en el caso de las enzimas, a temperaturas elevadas, alrededor de 60 a 70 C, la actividad neta aumenta varios cientos, como sucede con la velocidad de la desnaturalizacin trmica de las protenas. c. Las enzimas son activadas en una zona muy restringida de pH, y presenta un punto ptimo de pH donde su actividad es mayor. Las protenas en su punto isoelctrico, muestran propiedades parecidas desde el punto de vista de viscosidad, solubilidad, difusin, etc., que resulta del todo similares a las propiedades de este tipo que muestran las enzimas. d. Todos los agentes que desnaturalizan a las protenas tambin destruyen o inactivan a las enzimas, ya sea el calor, los cidos fuertes, o los metales pesados que pueden combinarse con ellas.
17 BIOQUMICA ENZIMAS e. Los problemas de solubilidad y de precipitacin son comunes a las protenas y las enzimas; en general, son solubles en agua o soluciones salinas, insolubles en alcohol, precipitan con determinadas concentraciones de sales neutras, etc. COMPOSICIN QUMICA DE LAS ENZIMAS
Los conocimientos sobre la composicin qumica de las enzimas constituyeron materia de numerosas controversias hasta 1926, cuando J.B Sumner (1887-1955) consigui cristalizar la ureasa, enzima que transforma la urea en anhdrido carbnico y amoniaco, y demostrar que era una sustancia proteica. A, partir de entonces fueron aisladas otras enzimas en forma pura, cristalina, y el anlisis demostraba siempre la presencia de una protena, simple o conjugada. Cuando los anlisis qumicos demuestran que la enzima es una protena conjugada, pueden distinguirse en dos partes bien diferenciados: El grupo prosttico (Coenzima) La protena (Apoenzima) En algunas enzimas oxidantes fue observada la presencia de la cromoprotenas, en las cuales el grupo prosttico est representado por un compuesto que contiene Fe y otro elemento, el cual desempea un papel importante en la combinacin de la protena con el sustrato; otras veces este grupo prosttico es derivada de vitaminas (como la vitamina B); 4en muchos casos resulta fcil de separar de la molcula proteica. No obstante una vez separadas, las dos unidades no muestran actividad enzimtica; por tanto el grupo proteico (coenzima) y el grupo proteico (apoenzima) han de estar ntimamente ligados entre s para ser operativos. Por consiguiente, de las enzimas pueden distinguirse los formados por: Solo protenas, que difieren entre s por la secuencia con que los aminocidos estn combinados, como la ureasa y las enzimas digestivas (la pepsina y la tripsina) Los conjugados, separados en dos entidades qumicas bien definidas: la coenzima y la apoenzima. Despus del descubrimiento de Sumner, el nmero de las enzimas y el estudio de sus actividades qumicas proporcionaron un notable impulso en la enzimologa, y la gran cantidad de las enzimas que rpidamente se acumulaban determinaron la necesidad de utilizar una clasificacin o nomenclatura para evitar errores y facilitar la comprensin de futuros investigadores.
NOMENCLATURA Y CLASIFICACIN DE LAS ENZIMAS
18 BIOQUMICA ENZIMAS Cien aos atrs solo se conocan enzimas, muchas de estas, catalizaban la hidrlisis de enlaces covalentes. Algunas enzimas, de manera especial las que fueron descubiertas en un principio, recibieron nombres ligados ms bien a su sitio de procedencia anatmica que no siguen ninguna regla ni sistema; tal es el caso de la ptialina de la saliva, que ataca al almidn de la pepsina del estmago y de la tripsina del pncreas, que atacan protenas; de la renina, que coagula la leche; de la papana, enzima proteoltica que se encuentra en la papaya y de las catepsinas, tambin proteasas, que se encuentran en las clulas. Las enzimas relacionadas con la coagulacin de la sangre, como son la trombina, la plasmina, el plasmingeno, etc. reciben tambin nombres sistematizados. Al descubrir nuevas enzimas y proceder a su caracterizacin estricta se aplicaron reglas de nomenclatura basadas en el nombre del sustrato atacado, o en el tipo general de sustrato, o en la reaccin catalizada y se ha aadido convencionalmente, la terminacin -asa. Por ejemplo: las lipasas (hidrolizan lpidos o grasas), las amilasas (hidrolizan almidn), las proteasas (hidrolizan protenas), las esterasas (basado en la unin general de tipo ster presentes en muchas sustancias), colesterol estrerasa (si la esterasa es especfica de los esteres de colesterol) y acetilcolina esterasa (si la esterasa de la acetilcolina). Otros ejemplos: Las fosfatasas son enzimas que atacan las uniones ster, pero en este caso, toman su nombre del grupo vecino a la unin que van a atacar, de manera que se denominan fosfatasas (cuando quitan una molcula de monofosfato), pirofosfatasas (cuando quitan el cido fosfrico como esteres dobles (pirofosfatos), o triples, etc.) De la misma manera, las carbohidrasas se denominan as genricamente, pero pueden comprender enzimas con nombres proveniente del sustrato particular sobre el que actan como la amilasa que ataca al almidn y la celulosa que acta sobre la celulosa y, en otras ocasiones, se denominan de acuerdo con la unin atacada, como la b -glucosidasa que acta sobre las uniones b -glucosdicas. Los ejemplos se pueden extender a todos los terrenos de la actividad enzimtica, como en las enzimas proteolticas, las fosforilasas, las nucleasas, etc. Esta manera de llamarlas, se demostr que era inadecuada porque al descubrirse varias enzimas, notaron que varias enzimas catalizaban reacciones diferentes del mismo sustrato, por ejemplo, oxidacin o reduccin de la funcin alcohol de un azcar. Aunque el sufijo asa contina en uso; actualmente, al nombrar a las enzimas, se enfatiza el tipo de reaccin catalizada. Por ejemplo: las hidrogenasas catalizan la eliminacin de hidrogeno y las transferasas, reacciones de transferencia de grupo. Con el descubrimiento de ms y ms enzimas, surgieron ambigedades y con frecuencia no estaba claro cul era la enzima que un investigador deseaba estudiar. Para remediar esta deficiencia, la Comisin para el estudio de las enzimas, que constituye con respecto a los sistemas anteriores un punto de vista
19 BIOQUMICA ENZIMAS ms uniforme, preciso y descriptivo; est formada por la Unin Internacional de Bioqumica (IUB) adopto, en 1964, un sistema complejo pero inequvoco de la nomenclatura enzimtica basado en el mecanismo de reaccin. El sistema se basa en la reaccin qumica catalizada que es la propiedad especfica que caracteriza a cada enzima las cuales se agrupan en clases, porque catalizan procesos semejantes, y en subclases que especifican con mayor exactitud la reaccin particular considerada. En general, las enzimas reciben un nombre de acuerdo con el sustrato o los sustratos que participan en la reaccin seguido por el tipo de reaccin catalizada y, por fin, la terminacin -asa. A menudo los nombres as obtenidos resultan largos y complejos, por lo que es muy difcil que en la prctica se pueda excluir el uso de los nombres triviales, consagrados por la costumbre. Sin embargo, con fines de sistematizacin, se reconoce la necesidad de aceptar el nuevo sistema. Aunque su claridad y carencia de ambigedad recomiendan al sistema de nomenclatura IUB para trabajos de investigacin, nombres ms ambiguos, pero bastante ms cortos persisten en libros de texto y en el laboratorio clnico. Por esta razn, a continuacin solo se presenta principios generales del sistema IUB:
1. Las reacciones y las enzimas que las catalizan se dividen en 6 clases principales, cada una con 4 a 13 subclases. 2. El nombre de la enzima tiene 2 partes: la primera es el nombre del o los sustratos; la segunda, con terminacin asa, indica el tipo de reaccin catalizada. 3. Informacin adicional, si es necesario aclarar la reaccin, puede seguir el parntesis. Por ejemplo: la enzima que cataliza L-malato + NAD= = piruvato + CO2 NADH + H=, se denomina como 1.1.1.37 L-malato: NAD+ oxidorreductasa (descarboxilante). 4. Cada enzima tiene un numero clave (E.C.) que caracteriza al tipo de reaccin segn la clase (primer digito), subclase (segundo digito) y subclase (tercer digito). El cuarto digito es para la enzima especfica. As, E.C. 2.7.1.1 denota la clase 2 (una transferasa), subclase 7 (transferencia de fosfato), sub-clase 1 (una funcin alcohol como aceptor de fosfato). El ltimo digito denota a la enzima hexocinasa o ATP: D-hexosa-6-fosforotransferasa, enzima que cataliza la transferencia de fosfato desde el ATP al grupo hidroxilo de carbono 6 de la glucosa. Al final de sus y trabajos, clasifico las enzimas en seis grupos principales, correspondientes por sus trminos a las raciones que cada enzima ejerce sobre el sustrato. Estos grupos se subdividen en otro, segn el tipo de sustrato y los tomos concretos que son sensibles a sus acciones. Estos seis grupos son los siguientes:
20 BIOQUMICA ENZIMAS 1. Oxidoreductasas 2. Transferasas 3. Hidrolasas 4. Isomerasas 5. Liasas 1. Oxido-reductasas: Son las enzimas relacionadas con las oxidaciones y las reducciones biolgicas que intervienen de modo fundamental en los procesos de respiracin y fermentacin. Las oxidoreductasas son importantes a nivel de algunas cadenas metablicas, como la escisin enzimtica de la glucosa, fabricando tambin el ATP, verdadero almacn de energa. Extrayendo dos tomos de hidrgeno, catalizan las oxidaciones de muchas molculas orgnicas presentes en el protoplasma; los tomos de hidrgeno tomados del sustrato son cedidos a algn captor. En esta clase se encuentran las siguientes subclases principales: Deshidrogenasas y oxidasas. Son ms de un centenar de enzimas en cuyos sistemas actan como donadores, alcoholes, oxcidos aldehdos, cetonas, aminocidos, DPNH2, TPNH2, y muchos otros compuestos y, como receptores, las propias coenzimas DPN y TPN, citocromos, O2, etc.
2. Las Transferasas: Estas enzimas catalizan la transferencia de una parte de la molcula (dadora) a otra (aceptora). Su clasificacin se basa en la naturaleza qumica del sustrato atacado y en la del aceptor. Tambin este grupo de enzimas actan sobre los sustratos ms diversos, transfiriendo grupos metilo, aldehdo, glucosilo, amina, sulfat, sulfrico, etc.
Un ejemplo es la glucoquinasa, que cataliza la reaccin representada en la Figura de la derecha:
glucosa + ATP
ADP + glucosa-6-fosfato
21 BIOQUMICA ENZIMAS 3. Las Hidrolasas: Esta clase de enzimas actan normalmente sobre las grandes molculas del protoplasma, como son la de glicgeno, las grasas y las protenas. La accin cataltica se expresa en la escisin de los enlaces entre tomos de carbono y nitrgeno (C-Ni) o carbono oxigeno (C-O); Simultneamente se obtiene la hidrlisis (reaccin de un compuesto con el agua) de una molcula de agua. El hidrgeno y el oxidrilo resultantes de la hidrlisis se unen respectivamente a las dos molculas obtenidas por la ruptura de los mencionados enlaces. La clasificacin de estas enzimas se realiza en funcin del tipo de enlace qumico sobre el que actan. A este grupo pertenecen protenas muy conocidas: la pepsina, presente en el jugo gstrico, y la tripsina y la quimotripsina, segregada por el pncreas. Desempean un papel esencial en los procesos digestivos, puesto que hidrolizan enlaces ppticos, estricos y glucosdicos. Un ejemplo es la lactasa, que cataliza la reaccin: lactosa + agua
glucosa + galactosa
4. Las isomerasas: Transforman ciertas sustancias en otras ismeras, es decir, de idntica formula emprica pero con distinto desarrollo. Son las enzimas que catalizan diversos tipos de isomerizacin, sea ptica, geomtrica, funcional, de posicin, etc. Se dividen en varias subclases. Las racemasas y las epimerasas actan en la racemizacin de los aminocidos y en la epimerizacin de los azcares. Las primeras son en realidad pares de enzimas especficas para los dos ismeros y que producen un solo producto comn. Las isomerasas cis trans modifican la configuracin geomtrica a nivel de un doble ligadura. Las xido reductasas intermoleculares catalizan la interconversin de aldosas y cetosas, oxidando un grupo CHOH y reduciendo al mismo tiempo al C = O vecino, como en el caso de la triosa fosfato isomerasa, presente en el proceso de la gluclisis ; en otros casos cambian de lugar dobles ligaduras, como en la (tabla) isopentenil fosfato isomerasa, indispensable en el cambio biosintico del escaleno y el colesterol. Por fin las transferasas intermoleculares (o mutasas) pueden facilitar el traspaso de grupos acilo, o fosforilo de una parte a otra de la molcula, como la lisolecitina acil mutasa que transforma la 2 lisolecitina en 3 lisolecitina, etc. Algunas isomerasa actan realizando inversiones muy complejas, como transformar compuestos aldehdos en compuestos cetona, o viceversa. Estas ltimas desarrollan una oxido reduccin dentro de la propia molcula (oxido reductasa intermoleculares) sobre la que
22 BIOQUMICA ENZIMAS actan, quitando hidrgeno, a algunos grupos y reduciendo otros; actan ampliamente sobre los aminocidos, los hidroxcidos, hidratos de carbono y sus derivados. Son ejemplos la fosfotriosa isomerasa y la fosfoglucosa isomerasa, que catalizan las reacciones representadas en la tabla inferior:
5. Las Liasas: Estas enzimas escinden (raramente construyen) enlaces entre tomos de carbono, o bien entre carbono y oxgeno, carbono y nitrgeno, y carbono y azufre. Los grupos separados de las molculas que de sustrato son casi el agua, el anhdrido carbnico, y el amoniaco. Algunas liasas actan sobre compuestos orgnicos fosforados muy txicos, escindindolos; otros separan el carbono de numerosos sustratos.
Un ejemplo es la acetacetato descarboxilasa, que cataliza la reaccin: cido acetactico
CO 2 + acetona
6. Las Ligasas: Es un grupo de enzimas que permite la unin de dos molculas, lo cual sucede simultneamente a la degradacin del ATP, que, en rigor, libera la energa necesaria para llevar a cabo la unin de las
23 BIOQUMICA ENZIMAS primeras. Se trata de un grupo de enzimas muy importantes y recin conocidas, pues antes se pensaba que este efecto se llevaba a cabo por la accin conjunta de dos enzimas, una fosfocinasa, para fosforilar a una sustancia A (A + ATP A - + ADP) y una transferasa que pasara y unira esa sustancia A, con otra, B (A - + B A B + Pi). A este grupo pertenecen enzimas de gran relevancia reciente, como las aminocido ARNt Ligasas conocidas habitualmente con el nombre de sintetasas de aminocidos ARNt o enzimas activadoras de aminocidos que representan el primer paso en el proceso biosinttico de las protenas, y que forman uniones C-O; las cido-tiol ligasas, un ejemplo tpico de las cuales es la acetil coenzima. A sintetasa, que forma acetil coenzima. A partir de cido actico y coenzima A; las ligasas cido amoniaco (glutamina sintetasa), y las ligasas cido- aminocido o sintetasas de pptidos, algunos de cuyos ejemplos ms conocidos son la glutacin sintetasa, la carnosina sintetasa, etc. La accin de estas enzimas se manifiesta con la formacin de enlaces entre tomos de carbono y oxigeno de diversas molculas, o bien entre carbono y azufre, carbono y nitrgeno y carbono y carbono. Las ligasas utilizan siempre, para el proceso de reaccin, la energa proporcionada por el ATP o compuestos homlogos que son degradados, Por consiguiente las enzimas de esta clase son los nicos que intervienen en reaccin no espontnea desde un punto de vista termodinmico; Actan sobre los sustratos ms diversos y revisten particular importancia en el metabolismo de los cidos nucleicos. Estas reacciones enzimticas se desarrollan en dos tiempos: en el primero se forma un complejo intermedio con potencia energtica muy alta-, en el segundo utilizan la energa obtenida para realizar la reaccin de sntesis. Un ejemplo es la piruvato carboxilasa, que cataliza la reaccin:
piruvato + CO 2 + ATP
oxaloacetato + ADP + P i
24 BIOQUMICA ENZIMAS
GRUPO ACCIN EJEMPLOS 1. Oxidoreductasas Catalizan reacciones de xido reduccin. Tras la accin catlica quedan modificados en su grado de oxidacin por lo que debe ser transformados antes de volver a actuar de nuevo. Dehidrogenasas Aminooxidasa Deaminasas Catalasas
2. Transferasas Transfieren grupos activos (obtenidos de la ruptura de ciertas molculas) a otras sustancias receptoras. Suelen actuar en procesos de interconversiones de azucares, de aminocidos, etc. Transaldolasas Transcetolasas Transaminasas 3. Hidrolasas Verifican reacciones de hidrlisis con la consiguiente obtencin de monmeros a partir de polmeros. Suele ser de tipo digestivo, por lo que normalmente actan en primer lugar Glucosidasas Lipasas Peptidasas Esterasas Fosfatasas 4. Isomerasas Actan sobre determinadas molculas obteniendo de ellas sus ismeros de funcin o de posicin. Suelen actuar en procesos de interconversin Isomerasas de azcar Epimerasas Mutasas 5. Liasas Realizan la degradacin o sntesis (entonces se llaman sintetasas) de los enlaces denominados fuertes sin ir acoplados a sustancias de alto valor energtico. Aldolasas Decarboxilasas 6. Ligasas Realizan la degradacin o sntesis de los enlaces fuertes mediante el acoplamiento a sustancias ricas en energa como los nucleosidos del ATP Carboxilasas Peptidosintetasas
EFECTO DE LA MODIFICACIN COVALENTE SOBRE LA ACTIVIDAD ENZIMTICA Otros enzimas pasan de una forma menos activa a otra ms activa unindose covalentemente a un grupo qumico de pequeo tamao como el P i o el AMP. Tambin se da el caso inverso, en el que un enzima muy activo se desactiva al liberar algn grupo qumico. En las enzimas de las vas degradativas del metabolismo, la forma fosforilada es ms activa que la no fosforilada, mientras que
25 BIOQUMICA ENZIMAS en las vas biosintticas ocurre lo contrario. En las figuras inferiores se ilustra la activacin de una protena por fosforilacin.
ACTIVACIN PROTEOLTICA DE LA ACTIVIDAD ENZIMTICA
Algunos enzimas no se sintetizan como tales, sino como protenas precursoras sin actividad enzimtica. Estas protenas se llaman proenzimas o zimgenos. Para activarse, los zimgenos sufren un ataque hidroltico que origina la liberacin de uno o varios pptidos. El resto de la molcula proteica adopta la conformacin y las propiedades del enzima activo. Muchos enzimas digestivos se secretan en forma de zimgenos y en el tubo digestivo se convierten en la forma activa. Es el caso de la -quimotripsina, que se sintetiza en forma de quimotripsingeno (Figura superior). Si estos enzimas se sintetizasen directamente en forma activa destruiran la propia clula que las produce. As, la tripsina pancretica (una proteasa) se sintetiza como tripsingeno (inactivo). Si por alguna razn se activa en el propio pncreas, la glndula sufre un proceso de autodestruccin (pancreatitis aguda), a menudo mortal.
Elementos de la reaccin El enzima no fosforilado es inactivo El enzima fosforilado es activo
26 BIOQUMICA ENZIMAS PARTES DEL SISTEMA ENZIMATICO
Los sistemas enzimticos en general, estn formados por la enzima propiamente dicha (apoenzima), el sustrato o los sustratos un grupo proteico (o coenzimas) y sustancias activadoras. La estructura formada por la apoenzima y la coenzima se denomina holoenzima; con cierta frecuencia se reconocen sistemas enzimticos que no tienen grupo prosttico o activadores reconocidos. Apoenzima: concepto del centro activo La apoenzima es la enzima propiamente dicha, de naturaleza proteica formada por cadenas de polipptidos, con peso molculas elevado, no dializable y termolbil. Las estudiadas analticamente hasta ahora, han sido, por razones tcnicas de peso molecular bajo, 12 a 24 000, tienen una sola cadena polipeptidica (ribonucleasa, papana, tripsina, pepsina, etc.) excepto uno o dos casos (a - quimotripsina y aldolasa) que tienen dos. El anlisis de los aminocidos que componen a diversas enzimas demuestran que tienen una estructura similar a la de cualquier protena; existen, de hecho unos cuantos casos en los que se ha determinado su secuencia completa, es decir, el orden en el que estn dispuestos todos ellos en la cadena. El anlisis de la estructura secundaria de la protena, sea el modo como la cadena peptdica se dispone a lo largo de su eje mayor y el de la estructura terciaria, sea la forma en que la cadena se pliega y se acomoda para formar una estructura tridimensional se conoce muy mal para todas las enzimas. Solo en el caso de la lisozima (enzima presente en las lgrimas donde funciona como un antisptico suave y que tiene la capacidad de atacar a los polisacridos que forman la pared de diversas bacterias) se ha determinado la estructura tridimensional de una enzima; para este fin se aplican las tcnicas de cristalografa de rayos x, con una solucin de dos , lo que demostr que la lisozima es una protena con su cadena de 129 aminocidos ampliamente plegada y en la que se reconoce una hendidura representante del centro activo donde se acomodan muy bien los inhibidores ciertos compuestos del tipo de carbohidratos que nulifican su actividad enzimtica. Se ha demostrado, en este caso, que es cierta regla general de que el modo como se ordenan y disponen los aminocidos determina el arreglo espacial que permite a las otras partes del sistema enzimtico sustratos, cofactores, iones, etc. adaptarse, en el espacio, en forma adecuada, para que se lleve a cabo la accin cataltica. Por lo tanto, las estructuras indispensables que permiten la combinacin con el sustrato y que confieren propiedades enzimticas a la molcula se denominan "centro activo". Se acepta que el centro activo no es una parte muy grande de la enzima completa y, en ciertos sistemas estudiados por medio de bloqueos qumicos no parece constituir una zona de ms de 20 de dimetro. Es muy posible que el centro activo est formado por la contribucin de grupos funcionales de aminocidos situados en distintas cadenas o en diferentes
27 BIOQUMICA ENZIMAS repliegues de una cadena, asiendo aparecer a dichos grupos muy distantes entre ellos si se considera el orden que guardan a lo largo de la cadena polipeptidica. Un caso muy ilustrativo sobre lo que significa la estructura del centro activo desde el punto de vista de la composicin de los aminocidos es el de la triptfano pirrolasa, enzima ampliamente estudiada en bacterias desde el punto de vista de la bioqumica gentica. En ella, la modificacin de algunos aminocidos produce perdida de la actividad enzimtica, que se recupera si vuelve a incluirse los aminocidos en el orden original; sin embargo, se pueden reemplazar dos de ellos por otros completamente distintos, y la enzima vuelve a ser totalmente activa. Es posible que con estos nuevos aminocidos se consigan tambin las condiciones de distribucin espacial de grupos funcionales y estructuras necesarias para la actividad enzimtica. El concepto de arreglo tridimensional adecuado de los aminocidos que forman la cadena polipeptidica de la enzima para lograr la actividad funcional correcta permite entender numerosos fenmenos: la necesidad de que la molcula proteica ntegra est preservada en su forma; el hecho de que la desnaturalizacin de la enzima al permitir la separacin de los pliegues, conduce a la perdida de la actividad enzimtica; que al calentar una enzima con su sustrato (por ejemplo, la invertasa con sacarosa, la transaminasa con cido a -cetoglutrico), se impide una desnaturalizacin que sin ellos se producira, pues es posible que el propio sustrato contribuya a sostener y reforzar la aproximacin de los pliegues de la cadena, etc. Tambin se entiende por qu al atacar la ribonucleasa con pepsina y romper una sola unin peptdica que separa un tetrapeptido del extremo con grupo carboxilo libre se pierde la actividad, mientras que si solo se quita los tres ltimos disminuye su accin sugiriendo as la importancia del residuo de cido asprtico para sostener el centro activo en condiciones de eficiencia, o lo que es ms probable, para formar parte del propio centro activo. Si se parte la ribonucleasa entre los aminocidos 20 y 21, y se separan los dos fragmentos, ninguno es activo, pero basta mezclarlos para que se unan en tal forma que se restablece la actividad, aunque un poco menor que la originalmente observada. El estudio detallado de la estructura del centro activo se hace por medio de inhibidores o de reactivos que se combinan de modo especfico, con algunos de los aminocidos del centro activo tales como el diisopropilfluorofosfato (DFP), que se combina con el OH del aminocido Serina, en diversas esterasas, peptidasas, etc. , e inactiva el centro activo del que forman parte dicho aminocido; este inhibidor, an a concentraciones de 10-10 M, inhibe a la acetilcolinesterasa; mucho de los derivados del DFP se utilizan como gases de guerra o como insecticidas (parathion), y su utilidad se debe, en rigor a su capacidad para destruir funcionalmente ciertas enzimas.
28 BIOQUMICA ENZIMAS La unin del DFP al aminocido cedina es muy estrecha y a permitido el anlisis de los aminocidos vecinos a l, haciendo un estudio de su ordenamiento en el centro activo. La secuencia de los centros activos de diversas enzimas hidrolticas sensibles al DFP, se demuestran que la mayora tienen cerina y adems un aminocido dicarboxlico (asprtico o glutmico) y en el otro un aminocido neutro (alanina o glicina). Tambin se ha demostrado que la histidina, cuando menos para el caso de la quimotripsina, forma parte del centro activo aun cuando el anlisis de la secuencia no demuestra que exista cerca de la cerina ninguna histidina; se trata, por lo tanto, de otro ejemplo de una aminocido, alejado e otro, y en distinto pliegue de la cadena, que integra el centro activo. Teniendo en cuenta estos hechos, se deduce, por lo tanto, que la actividad de la enzima depende en parte de la disposicin o arreglos de los aminocidos y grupos prostticos en determinada regin de la protena. Los aminocidos que componen a las protenas pueden tener moderadas actividades catalticas, aunque de ninguna manera comparable en su magnitud, cuando se les considera en forma aislada, a las que muestran la gran molcula proteica. De hecho para muchos sistemas enzimticos se han ideado modelos anlogos, sea sustancias qumicas sencillas que suelen reproducir los efectos ocasionados por la enzima, tal es el caso de los anlogos, a base de piridoxsal que representan la parte activa de enzimas descarboxilantes y transaminantes. Esto no significa que necesariamente, en el estado natural, la enzima funcione como lo hace el anlogo pues muchos sistemas pudieran tener otro mecanismo de operacin; la hidrlisis del almidn lo mismo se logra con la adicin del cido que con la enzima especfica amilasa, aun cuando en el primer caso se atacan indiscriminadamente numerosas uniones glucosdicas, y con la enzima, en cambio solo se desprenden, uno tras otro fragmentos de dos unidades de glucosa de los extremos de las ramificaciones. Conformacin de la enzima y propiedades del centro activo. La propiedad cataltica de las enzimas parece depender de la facilidad con la que ayudan a que se pongan en contacto las sustancias reaccionantes para dar el producto o los productos de la reaccin. Esto implica que el sistema enzimtico tenga una conformacin especial sea, una disposicin adecuada de os grupos funcionales aminocidos de la apoenzima y grupos prostticos, cuando existen estos y de las molculas mismas de los sustratos que se unirn a aquellos y permitirn que se lleve a cabo la reaccin qumica. Este acercamiento de las sustancias reaccionantes de los grupos prostticos y los grupos funcionales fue las razn del modelo de Ehrlich, conocido clsicamente como de la "llave y la cerradura". As la enzima sera un molde tridimensional en negativo, de la estructura tambin tridimensional, en positivo de los reaccionantes que se adaptaran perfectamente a ala disposicin de la enzima. Sin embargo ha sido necesario reconsiderar esta
29 BIOQUMICA ENZIMAS situacin y sugerir de acuerdo con Koshland la teora de un "acomodo inducido". As las enzimas pueden sufrir un cambio en su estructura desde el momento en que entran en contacto con los reaccionantes, sustratos y cofactores, y es posible que todos ellos modifiquen el arreglo tridimensional de la enzima; la enzima los recibe en un orden determinado y cada uno de ellos al unirse a la enzima modifica su estructura. La nueva analoga es la del "guante y la mano"; aquel no representa una estructura de negativo tridimensional mientras no se halla la mano en el, ya que antes pueden tener diversas formas y disposiciones, una vez que ha entrado la mano - que a su vez tambin puede adoptar distintas posiciones se ponen en contacto todas las partes correspondientes, es decir, en el caso de la enzima, las partes reactivas del sistema enzimtico, con las partes reaccionantes, osea los sustratos. Se ha preservado con esta nueva idea, el aspecto de la armona estructural entre el sustrato y la enzima pero se introduce el nuevo concepto de que es necesario provocar un cambio en la estructura proteica que favorezca la colocacin adecuada de todos los elementos que interviene en la reaccin enzimtica. Los cambios de la estructura proteica se denominan "conformacionales". El cambio en la disposicin tridimensional puede hacerse a distancia y en muchas ocasiones la unin del sustrato a una parte de la enzima modifica otras zonas de ella y an su estructura completa, debido a plegamientos que acercan o alejan diversos grupos colocados a lo largo del pptido que forma la enzima. Esta alteracin mltiple y de tipo flexible, permite entender mejor el proceso de entrada ordenada de los sustratos, y los cofactores y la reaccin en la que se participan. Tambin permiten comprender porque un sustrato entra a una enzima y es atacado y uno que no lo es an muy parecido a l, puede quedar excluido del centro activo. Se ejemplifican estas ideas en A se encuentra la enzima en una forma desplegada con ciertos grupos reactivos (+) y (-), colocados en una zona de la superficie de la enzima. La entrada de un cofactor F1, modifica una parte del sistema (B); se introduce en el sistema un nuevo arreglo a base de la reactividad de tipo electrnico entre la zona (+) y una parte del cofactor F1, recin introducido; por fin la entrada de un nuevo reaccionate F2 modifica la parte terminal de la enzima de manera que permite la entrada del otro reaccionante (sustrato) que se acomoda en un lugar preparado previamente por los reaccionantes F1 y F2, y permite de esta manera echar a andar la reaccin cataltica. Los cambios conformacionales, se pueden demostrar con diversos mtodos algunos de tipo fsico, como son las modificaciones en la rotacin ptica o en el patrn de sedimentacin en el campo gravitacional de la ultracentrfuga, o qumicos como el aumento o la disminucin de la actividad enzimtica bajo la influencia de cambios trmicos o la adicin de agentes desnaturalizantes. Basten unos cuantos ejemplos: la transaminasa a -
30 BIOQUMICA ENZIMAS cetoglutrica se pude calentar a 65 C. en presencia de su sustrato sin que se afecte, al paso que la enzima sola es rpidamente degradada, cambia de configuracin y se precipita; la miosina, protena muscular contrctil, en presencia de ATP hace ms notable su forma de espiral y permite el reconocimiento de aminocidos previamente ocultos en sus pliegues; la D-amino oxidasa, al unirse a su cofactor, el FAD, pasa de la forma espiral en a -hlice, a una disposicin irregular distribuida al azar.
COENZIMA Y GRUPOS PROSTTICOS
Una coenzima es una molcula orgnica pequea necesaria para la actividad de una enzima. Las coenzimas son cofactores de naturaleza orgnica.
Una coenzima es un cofactor de naturaleza orgnica. Las coenzimas son necesarias para la actividad de muchas enzimas. La tetrahidrobiopterina, el ATP, el GTP, el NAD, la coenzima A o la coenzima Q son algunos ejemplos de coenzimas. Muchas coenzimas son vitaminas o derivados de ellas especialmente de la vitamina B.
Normalmente sufren reacciones de oxidacin, reduccin y transferencia de grupos qumicos. Las coenzimas sufren las transformaciones qumicas necesarias para la catlisis enzimtica evitando que la enzima las sufra. De este modo la enzima queda intacta y puede llevar a cabo otro ciclo de reacciones simplemente cambiando la coenzima.
Las coenzimas tienen un papel fundamental en el metabolismo y en la fisiologa del organismo y, de hecho, hay muchas enfermedades producidas por defectos en coenzimas. Algunos ejemplos de este tipo de enfermedades son la fenilcetonuria en la que existe un defecto de tetrahidrobiopterina o la pelagra que se produce por un dficit de NAD (Nicotinamida Adenina Di nucletido).
MECANISMO DE ACCIN DE LAS COENZIMAS El mecanismo de accin bsico de las coenzimas es el siguiente: 1. La coenzima se une a una enzima. 2. La enzima capta su sustrato especfico. 3. La enzima ataca a dicho sustrato, transfiriendo algunos de sus electrones. En realidad la unin de sustrato y enzima produce una nueva sustancia. Esta sustancia es inestable, lo que provoca su separacin en diferentes partes: enzima, producto, y la forma reducida de la coenzima, que se
31 BIOQUMICA ENZIMAS qued con algunos electrones (al oxidar el sustrato sta se reduce) por presentar mayor fuerza de atraccin molecular. 4. La enzima cede a la coenzima dichos electrones provenientes del sustrato. 5. La coenzima acepta dichos electrones y se desprende de la enzima. 6. La coenzima reducida va a la cadena de transporte de electrones, en la cual se genera ATP y H2O (respiracin celular), al "dejar" all sus electrones sta mediante unas lanzaderas, vuelve a su estado inicial. Este ltimo paso es esencial para no agotar la dotacin de coenzimas de una clula ya que las enzimas junto con las que acta no pueden realizar la reaccin qumica sin el concurso de su coenzima. Algunas coenzimas estn fuerte y permanentemente unidas a su enzima, constituyendo en la prctica un grupo prosttico; tal es el caso del FMN a la enzima NADH deshidrogenasa o el FAD a la succinato deshidrogenasa. Cada coenzima est especializada en aceptar y transportar un tipo de tomos determinado; unos aceptan hidrgenos, otros grupos acetilo, amino, etc. No obstante, las coenzimas no son nada especficas respecto a las enzimas a las que se unen, de modo que una misma coenzima puede unirse a un gran nmero de enzimas distintas y es por ello que el nmero de coenzimas diferentes es relativamente bajo.
PRINCIPALES COENZIMAS:
Coenzima A. FAD (flavn-adenn dinucletido): transferencia de electrones y protones. FMN (flavn mononucletido): transferencia de electrones y protones. NAD + (nicotn-adenn dinucletido): transferencia de electrones y protones. NADP + (nicotn-adenn dinucletido fosfato): Coenzima A: transferencia de grupos acetilo (por ejemplo, en la descarboxilacion del cido pirvico) y de grupos acilo en general. Coenzima Q: transferencia de electrones en la cadena respiratoria.
32 BIOQUMICA ENZIMAS Coenzima B 12 : transferencia de grupos metilo o hidrgenos entre molculas. TPP (pirofosfato de tiamina): transferencia de grupos aldehdo; forma parte, entre otros, del complejo piruvato deshidrogenasa. Vitamina C PLP (fosfato de piridoxal): transferencia de grupos amino. PMP (fosfato de piridoxamina): transferencia de grupos amino. FH 4 (cido tetrahidroflico): transferencia de grupos formilo, metenilo y metileno. Biocitina: transferencia de dixido de carbono. cido lipoico: transferencia de hidrgenos, grupos acilo y metilamina.
Aparte del sustrato, cuya transformacin ser condicionada por la enzima, existe otra parte del sistema enzimtico, de peso molculas bajo y por lo tanto dializable, termostable y en general, no proteica, adherida de ms o menos laxa a la apoenzima y a la cual se le llama grupo prosttico, si est muy ntimamente ligada a la apoenzima como es el caso del ncleo porfirnico de numerosas oxidasas o la estructura flavnica de la deshidrogenasa succnica o coenzima cuando la unin es dbil y se separan fcilmente, como por ejemplo el DPN y el TPN que asisten a las funciones de varias deshidrogenasas. Es muy grande la importancia del grupo prosttico o de la coenzima desde el punto de vista funcional pues suelen ceder y recibir alternadamente parte de los productos de la reaccin. Por ejemplo en las reacciones de xido reduccin los hidrgenos desprendidos de un sustrato deben ser captados por una sustancia con lo que se expulsa al sustrato oxidado y es posible recibir una nueva molcula del sustrato con hidrgenos. Tal sustancia es una coenzima, como el DPN, el TPN, el FAD, etc., que, a su vez, suele cederlos a una tercera sustancia o, cuando las reacciones son reversibles los pasan al sustrato oxidado para reducirlo. Algunos autores denominan cosustratos a estos agrupamientos coenzimticos para hacer nfasis en su carcter reversible, no cataltico y equimolecular con respecto al sustrato. Una proporcin de las vitaminas forman parte de molculas ms complejas que funcionan como coenzimas en diversas reacciones.
Muchas enzimas requieren una coenzima Muchas enzimas que catalizan la transferencia de grupos y otras reacciones requieren, adems de su sustrato, una segunda molcula orgnica conocida como coenzima sin la cual son inactivas. Para distinguirlas de iones metlicos activadores y de las enzimas mismas, las coenzimas se definen como compuestos orgnicos termoestable, de peso molecular bajo, requeridas para la actividad de las enzimas. La mayor parte de las coenzimas se unen a las enzimas
33 BIOQUMICA ENZIMAS por fuerza no covalentes. Las que forman enlace covalentes con las enzimas se denominan tambin grupos prostticos. Entre las reacciones que requieren coenzimas estn las oxido reducciones, las reacciones de transferencia de grupo e isomerizacin y las reacciones que forman enlaces covalentes (claves 1, 2,5 y 6; IUB). Las reacciones lticas que comprenden reacciones hidrolticas catalizadas por enzimas digestivas no requieren de coenzimas.
Las coenzimas pueden considerarse como segundo sustrato La coenzima puede considerarse como un segundo sustrato o cosustratos por dos razones. En primer lugar, los cambios qumicos en la coenzima compensan exactamente a los que realizan en el sustrato. Por ejemplo, en las reacciones u oxido reduccin (deshidrogenasa), una molcula de sustrato es oxidasa y una molcula de coenzima es reducida. Una segunda razn para dar igual nfasis a las reacciones de la coenzima es que, en realidad, este aspecto de la reaccin es el que puede ser de significado fisiolgico fundamental. Por ejemplo, la importancia de la capacidad del msculo que trabaja en condiciones anaerobias para convertir el piruvato en lactato no reside en el piruvato ni en el lactato. La reaccin sirve solamente para oxidar la coenzima reducida NADH a NAD+. Sin NAD+ la gluclisis no puede continuar y la sntesis anaerobias de ATP (y por tanto, el trabajo) tiene que cesar. En condiciones anaerobias, la reduccin del piruvato en lactato reoxida al NADH y permite la sntesis de ATP. Otras reacciones pueden servir igualmente bien. Por ejemplo, en las bacterias o levaduras que crecen en medio anaerobio, algunos metabolitos derivados del piruvato son utilizados como oxidante para el NADH y son reducidos en el proceso. Las coenzimas funcionan como reactivos en la transferencia de grupos Las reacciones bioqumicas de transferencia de grupo del tipo. D G + A = A G + D
En la cual un grupo funcional, G es transferido de una molcula donadora, D-G, a una molcula aceptora, A, por lo general comprende la participacin de una coenzima como ltimo aceptor (por ejemplo, reacciones de hidrogenacin) o como portador intermediario del grupo (por ejemplo, reacciones de transaminacin). El esquema siguiente muestra el ltimo concepto.
D-H CoE A-G D CoE-G A
34 BIOQUMICA ENZIMAS Aunque estos sugiere la formacin de un complejo sencillo CoE-G, durante el curso de la reaccin global, pueden intervenir varios complejos intermediarios CoE-G en una reaccin particular (por ejemplo, transaminacin). Cuando el grupo transferido es el hidrgeno, es costumbre representar slo la "mitad izquierda de la reaccin":
D-H CoE D CoE-H
Que esto representa en realidad slo un caso especial de la transferencia general de grupos puede apreciarse mejor en trminos de las reacciones que ocurren en las clulas intactas. Se pueden representar de la siguiente manera:
D-H CoE A-H D CoE-H A
Las coenzimas pueden clasificarse de acuerdo al grupo cuya transferencia facilitan. Basndose en este concepto podra clasificarse a las coenzimas como sigue: Para la transferencia de grupos distintos del hidrgeno:
Fosfatos de azcares CoASH Pirofosfato de tiamina. Fosfato de piridoxal Coenzimas del folato Biotina Coenzimas de cobamida (B12) cido lipoico Para la transferencia del hidrgeno: NAD+, DADP+ FMN, FAD. cido lipoico Coenzima Q. -Muchas coenzimas derivan de vitamina B y del monofosfato de adenosina Las vitaminas B forman parte de la estructura de numerosas coenzimas. Las vitaminas B; nicotinamida, tiamina, riboflavina y cido pantotnico son constituyentes esenciales de las coenzimas para las oxidaciones y las reducciones biolgicas y las coenzimas cido flico y cobamida funcionan en
35 BIOQUMICA ENZIMAS el metabolismo de compuestos de un solo carbono. Numerosas coenzimas contienen adenina, ribosa y fosfato y se derivan del monofosfato de adenosina AMP. Los ejemplos incluyen NAD+ y NADP+
ACTIVADORES
Las enzimas son catalizadores orgnicos que disminuyen la barrera denominada energa de activacin; y por tanto facilitan el que se inicie una reaccin. Este proceso implica el trabajo necesario para poner a dos molculas en un contacto lo suficientemente estrecho como para que reaccionen; adems, el trabajo debe realizarse sobre la unin qumica una con covalencia en sentido estricto para que pueda romperse y formar otros compuestos. Las enzimas, como muchos catalizadores, son partculas de gran superficie y muestran que tienen capacidad para atraer y captar diversas molculas. Cualquier factor que permita por una parte atraer al sustrato a su centro activo se pude considerar como un activador, adems algo que permita la rpida salida de los productos tambin pude considerarse como un activador. As se reconocen diversas posibilidades:
Activacin inica. Numerosos metales mono divalentes son necesarios para la actividad enzimtica de diversos sistemas. Destacan entre ellos los siguientes: K+, Mn++, Mg++, Ca++, Fe+++, Cu+, Cu++, etc. A menudo el metal, a estas condiciones, es el centro que permite la unin conjunta del sustrato, de la coenzima y de la misma apoenzima con la que forma quelatos (de chelos, garra; complejos moleculares sostenidos por un metal) al unirse con grupos cargados elctricamente. Muy amenudo se demuestra que es posible sustituir los metales divalentes entre ellos, sin grandes modificaciones de la velocidad de la reaccin. Los metales como el hierro, el cobre y el molibdeno, actan a menudo como transportadores de electrones y no se les puede considerar activadores en el sentido estricto pues forman parte integral del grupo prosttico. Algunos aniones tambin son necesarios para la actividad de ciertas enzimas; bien conocido es el caso del Cl-, el que puede sustituirse, aun cuando con baja de la velocidad, por Br- , para la amilasa salival; o el propio radical fosfato que se requiere en reacciones de fosforilacin.
Activacin por el grupo prosttico. En determinadas reacciones estos son indispensables para el trabajo de la enzima y constituyen, en rigor, la parte funcional activa del sistema.
36 BIOQUMICA ENZIMAS Activacin de la apoenzima. Consiste en la obtencin de una correcta estructura del centro activo de la protena con actividad enzimtica, ya referido anteriormente. Integridad de los grupos funcionales del centro activo. Destaca la relacionada con los grupos sulfhidrilo, -SH. Cualquier alteracin qumica que los destruya, bloquee u oxide a disulfuro, -S-S-, puede inactivar a las enzimas. Esto puede suceder incluso en las suaves condiciones del trabajo celular por exposicin a agentes oxidantes o al oxigeno mismo, aunque puede lograrse por el efecto de sustancias que los ataquen y que combinen con ellos como la yodacetamida. En otras ocasiones la destruccin de los grupos SH, aun la distancia del centro activo modifica de tal manera la estructura tridimensional de la enzima que el centro activo se deforma al grado de que no puede llevar a efecto su accin sobre las sustancias reaccionantes. Existen otros grupos funcionales cuyo bloqueo acaba por completo con la actividad enzimtica; en tal caso estara la accin de inhibidores o venenos enzimticos. Medida de la actividad enzimtica. Aparte del problema de medir las pequesimas cantidades de enzimas presentes en los tejidos; muy pocas de ellas poseen caractersticas qumicas o espectroscpicas particulares que permita medirlas directamente. En general, las enzimas se cuantean siguiendo la actividad de la reaccin que catalizan y se aceptan, en principio que dicha actividad es proporcional a la cantidad de enzima presente. Como la actividad de unas enzimas slo rara vez se puede expresar en relacin a su peso absoluto o a la molaridad de la enzima, lo habitual es expresarla en "unidades" fijadas de modo convencional con relacin a la protena presente en la preparacin. La actividad enzimtica se mide por la desaparicin del sustrato o la aparicin de alguno de los productos de la reaccin, siguiendo dichos cambios en el tiempo. Sin embargo, las condiciones del sistema no son uniformes a lo largo del tiempo: el grado de saturacin de la enzima con el sustrato cambia constantemente, los productos que aparecen suelen inhibir a la enzima o se presentan modificaciones del pH que afectan a la reaccin, etc. Para evitar estos problemas se hace la medida de la velocidad inicial, tomando en cuenta solo el comienzo, en forma de lnea recta de la grfica, lo que sucede en general cuando se ha consumido no ms de una cuarta parte del sustrato. La actividad puede expresarse, una vez determinada la reaccin, en relacin con el tiempo empleado por la enzima para producir un cambio determinado; mientras mayor sea el tiempo, la actividad de la enzima es menor. Por lo tanto, la recproca del tiempo (la inversa del tiempo sea el valor que resulta de dividir la unidad sobre el tiempo, 1/T) es una medida de la actividad enzimtica.
37 BIOQUMICA ENZIMAS LAS ENZIMAS SON CATALIZADORES ESTEREOESPECFICOS
Casi todos los sustratos forman por lo menos tres enlaces con las enzimas. Esta adherencia en tres puntos puede conferir asimetra a una molcula por otro lado simtrica. La figura * muestra una molcula de sustrato, representada como un tomo de carbono que tiene tres grupos diferentes, prximos a adherirse en tres puntos a un sitio de la enzima. Si el sitio puede ser alcanzado slo desde un lado y nicamente los tomos complementarios y los silios pueden interactuar (ambos suposiciones vlidas para las enzimas reales), la molcula se unir slo en una forma. La reaccin misma puede estar confinada a los tomos unidos en los sitios 1 y 2 an, cuando los tomos 1 y3 sean idnticos. Girando mentalmente la molcula de sustrato en el espacio, ntese que puede adherirse en tres puntos a un costado del sitio planear con una sola orientacin. En consecuencia, los tomos 1 y 3 aunque sean idnticos vienen a ser distintos cuando el sustrato est adherido a la enzima. Por tanto, un cambio qumico puede afectar el tomo uno (pero no al tomo tres) o viceversa. Esto puede explicar por qu la reduccin, catalizada enzimticamente de la molcula del piruvato pticamente inactiva, forma L- y no D,L-lactato.
ESPECIFICIDAD ENZIMTICA
Los distintos grupos de enzimas muestran variaciones considerables en su grado de especificidad. Algunas de ellas muestran requerimientos estrictos tanto para el sustrato (o los sustratos si se trata de reacciones biomoleculares) como para el tipo de unin qumica sobre el que van a actuar; pequeos cambios en cualquiera de ellos bastan para inactivar la reaccin; tal es el caso de la mayora de las enzimas. En otras ocasiones, la deshidrogenasa alcohlica, que funciona con DPN como coenzima, es absolutamente especfica para el DPN, pero pude actuar sobre diversos alcoholes aparte del etlico que es su sustrato caracterstico. Asi mismo, las enterasas, las fosfatasas y ciertas peptidasas a menudo solo son especficas para el tipo de unin atacada ster, peptdica, etc. y no requieren estructuras definidas en el sustrato, a ambos lados de la unin. Hay ejemplo de especificidad doble: la xantina oxidasa, altamente especfica para la xantina a la que convierte en cido rico, y por otro lado muy activa, pero en forma inespecfica, al mostrar gran capacidad para mostrar la activacin de gran variedad de aldehdos.
El requisito de estreo especificidad para los sustratos es muy importante. Las enzimas que habitualmente atacan a los azcares naturales con configuracin D-, no lo hacen sobre sus ismeros artificiales L-; las enzimas tan activas en la naturaleza sobre los aminocidos comunes tipo L- so inactivas para los
38 BIOQUMICA ENZIMAS aminocidos artificiales (o muy raros en los organismos vivos) de tipo D-. Esto es tan absoluto que cuando existen mezclas racmicas de ismeros D- y L-, un mtodo conveniente de separarlas, es el de dejar que actu sobre ellas una enzima que degradar exclusivamente a uno de los dos ismeros dejando al otro intacto. Cuando el sustrato es simtrico y el producto es asimtrico, la enzima provoca, especficamente, la formacin de uno solo de los productos asimtricos, aquel para el que la enzima es activa; tal es el caso de la deshidrogenasa lctica que, al actuar sobre el cido pirvico (simtrico) produce exclusivamente cido D-lctico y no cido L-lctico, y el de la deshidrogenasa glutmica que al atacar el cido a - cetoglutrico produce solo cido L-glutmico:
CH3CH3 | | C = O HCOH | | COOH COOH
cido pirvico cido D-lctico
Existen otras formas de isomerismo geomtrico aparte del isomerismo D-, L-, susceptibles de ser reconocidas por enzimas. Tal es la situacin de los ismeros cis trans en que solo uno de los tipos del par es atacado. La fumarasa introduce una molcula de agua en el cido fumrico trans, pero el ismero cis, o sea el cido maleico, no es atacado.
H C COOH H C COOH HOOC C H H C COOH
cido fumrico (trans) cido maleico (cis)
Las enzimas tambin pueden distinguir molculas que desde el punto de vista estructural, como compuestos qumicos, son idnticas. Por ejemplo, la glicerol cinasa, por medio de ATP, convierte al glicerol en L-glicerol 3- fosfato, sea produce su fosforilacin, pero exclusivamente en la posicin 3, hecho que se ha demostrado con glicerol marcado con C radiactivo, C14, en las dos posiciones posibles 1 y 3. Los mismo sucede con el cido ctrico que al ser oxidado y descarboxilado hasta producir cido a -cetoglutrico adquiere un grupo C=O, en uno de los lados de la molcula, qumicamente simtrica. Esta capacidad de la enzima para reconocer el sustrato obedece a que debe tener por lo menos tres grupos qumicos orientados
39 BIOQUMICA ENZIMAS en el espacio de tal modo que el sustrato, aunque en apariencia simtrica, solo puede adaptarse por completo a la enzima en una sola posicin. De todo esto se desprende por el sustrato a los sustratos necesitan tener un patrn peculiar de grupos qumicos, especficos para cada enzima particular, de modo que se adapte perfectamente a su centro activo; mientras mayor y ms complejo sea este requerimiento mayor ser la especificidad de la enzima.
ISOENZIMAS O ISOZIMAS Deshidrogenasa Lctica LDH1 (MMMM) Isozimas o Isoenzimas son protenas con diferente estructura pero que catalizan la misma reaccin. Con frecuencia, las isoenzimas son oligomeros de diferentes cadenas peptdicas, y usualmente difieren en los mecanismos de regulacin y en las caractersticas cinticas.
Desde el punto de vista fisiolgico, la existencia de isoenzimas permite que haya enzimas similares con diferentes caractersticas, personalizadas de acuerdo a los requerimientos especficos del tejido o a determinadas condiciones metablicas.
Un ejemplo de las ventajas que ofrecen las isoenzimas al permitir un ajuste fino del metabolismo, en diferentes condiciones metablicas y en diferentes rganos, es el siguiente:
Glucoquinasa y Hexokinasa son ejemplos tpicos de isoenzimas. De hecho, hay cuatro Hexoquinasas: I, II, III y IV. Hexokinasa I est presente en todos los tejidos, y la Hexoquinasa IV, tambin conocida como Glucoquinasa, est presente principalmente en el hgado, el pncreas y el cerebro.
Ambas enzimas catalizan la fosforilacin de la glucosa: Glucosa + ATP Glucosa 6 (P) + ADP
40 BIOQUMICA ENZIMAS Hexokinasa I tiene un bajo Km y es inhibida por Glucosa 6 (P). Glucokinasa no es inhibida por Glucosa 6 (P) y tiene un alto Km. Estos dos hechos indican que la actividad de Glucoquinasa depende de la disponibilidad de substrato y no de la demanda del producto. Debido a que la Glucoquinasa no es inhibida por Glucosa 6 (P). En condiciones en que la concentracin de glucosa es alta, esta enzima continua fosforilando glucosa, la cual puede ser usada para la sntesis de glucgeno en el hgado. Adems, debido a que la Glucoquinasa tiene un alto Km, su actividad no compromete el suministro de glucosa a otros rganos; en otras palabras, ya que la Glucoquinasa no es inhibida por glucosa 6 (P), si esta enzima tuviera un bajo Km, continuara convirtiendo glucosa a glucosa 6 (P) en el hgado, haciendo que la glucosa no estuviera disponible para otros rganos (recuerde que despus de las comidas, la glucosa llega primero al hgado antes que a los otros rganos, a travs del sistema porta.) Debido a que las isoenzimas tienen diferente distribucin tisular, su estudio es un importante instrumento en la determinacin del dao sufrido por rganos especficos. Ejemplos del uso diagnstico de isoenzimas son el estudio de la Lactato Deshidrogenasa y de la Creatina quinasa
Deshidrogenasa Lctica (LDH)
Esta enzima est formada por la asociacin de cinco cadenas peptdicas de 2 diferentes tipos de monmeros: M y H. Las variantes encontradas en el ser humano son:
LDH1: M M M (abundante en el corazn, el cerebro y los eritrocitos; alrededor del 33 % de la LDH en el suero humano es de este tipo)
LDH2: M M M H (abundante en el corazn, el cerebro y los eritrocitos; alrededor del 45 % de la LDH en el suero humano es de este tipo)
LDH3: M M H H (abundante en el cerebro, los riones y los pulmones; constituye alrededor del 18 % de la LDH en suero humano)
LDH4: M H H H ((abundante en el hgado, musculo esqueltico y el tejido renal; constituye alrededor del 3 % de la LDH srica)
LDH5: H H H H ((abundante en el tejido heptico, musculo esqueltico y el ileum; apenas hasta 1 % de la LDH del suero humano es LDH5)
41 BIOQUMICA ENZIMAS En el infarto del miocardio, la LDH total en suero aumenta, y debido a que el musculo cardiaco contiene ms LDH1 que LDH2, el nivel de LDH1 en suero se hace mayor que el de LDH2 entre 12 y 24 horas despus del infarto, por lo que el radio LDH1/LDH2 se hace mayor y se mantiene invertido durante varios das.
Se observa un aumento de LDH5 en diversas patologas hepticas como la cirrosis, hepatitis y otras. Un aumento de LDH5 durante una enfermedad cardiaca sugiere congestin heptica secundaria. Creatina Kinasa: Creatina Kinasa (CK), tambin conocida como Creatina fosfoquinasa (CPK) es otro ejemplo de isoenzimas cuyo estudio es til para el diagnstico. Hay tres isoenzimas de CK formadas cada una por la combinacin de diferentes subunidades: CK1 (BB) abunda en el cerebro y en la musculatura lisa (esta prcticamente ausente del suero) CK2 (MB) abunda en el corazn y aparece en ciertas cantidades en el musculo esqueltico (prcticamente est ausente del suero) CK3 (MM) abunda en el musculo esqueltico y el cardiaco y constituye prcticamente el 100 % de la CK srica.
Creatina Kinasa CK3
Estas isoenzimas pueden diferenciarse en base a su diferente movilidad electrofortica.
42 BIOQUMICA ENZIMAS Los estudios de CK son tiles fundamentalmente en el diagnstico de infarto del miocardio, donde se constata un aumento de la variante MB, pero tambin puede usarse para estudiar otras condiciones, como enfermedades y traumas musculares (MM y MB) y traumas y ciruga del cerebro (BB). CK2 aparece en el suero dentro de las 6 horas siguientes a un infarto del miocardio y desaparece despus de 24 a 48 horas. La persistencia de CK2 en suero indica extensin del infarto a otras reas o el desarrollo de otro infarto. REGULACIN DE LA ACTIVIDAD ENZIMTICA POR MEDIO DE ISOENZIMAS Algunos enzimas tienen distinta estructura molecular aunque su funcin biolgica es similar. Se llamanisozimas o isoenzimas. Estas diferencias de estructura se traducen en ligeros cambios en sus propiedades, de forma que cada isozima se adapta perfectamente a la funcin que debe realizar. As, podemos observar la existencia de isoenzimas en funcin de: el tipo de tejido: Por ejemplo, el lactato deshidrogenasa presenta isozima distintos en msculo y corazn. el compartimento celular donde acta: Por ejemplo, la malato deshidrogenasa del citoplasma es distinta de la de la mitocondria. El momento concreto del desarrollo del individuo: Por ejemplo, algunos enzimas de la glicolisis del feto son diferentes de los mismos enzimas en el adulto.
CINTICA DE LAS REACCIONES ENZIMTICAS
Aunque las leyes generales de la catlisis debieran ser vlidas para las enzimas, el hecho de que stas sean sustancias complejas, de alto peso molecular, de tamao coloidal y de composicin difcil de precisar, impide la aplicacin de dichas leyes de una manera estricta; por ejemplo, su tamao coloidal puede causar fenmenos de adsorcin o diversas reacciones debidas a sus numerosas cargas elctricas. No obstante, los factores que afectan la velocidad de la reaccin enzimtica son los ya sealados a propsito de las reacciones qumicas en general, como la temperatura y las concentraciones de las sustancias reaccionantes que, en este caso particular, son la enzima el sustrato. Adems intervienen el PH medio donde se realiza la reaccin, la presencia de los productos de la reaccin, y otros factores secundarios como las radiaciones y los efectos xido reductores.
43 BIOQUMICA ENZIMAS CINTICA ENZIMTICA La cintica enzimtica estudia la velocidad de las reacciones catalizadas por enzimas. Estos estudios proporcionan informacin directa acerca del mecanismo de la reaccin cataltica y de la especificad del enzima. La velocidad de una reaccin catalizada por un enzima puede medirse con relativa facilidad, ya que en muchos casos no es necesario purificar o aislar el enzima. La medida se realiza siempre en las condiciones ptimas de pH, temperatura, presencia de cofactores, etc., y se utilizan concentraciones saturantes de sustrato. En estas condiciones, la velocidad de reaccin observada es la velocidad mxima (V mx ). La velocidad puede determinarse bien midiendo la aparicin de los productos o la desaparicin de los reactivos. Al seguir la velocidad de aparicin de producto (o de desaparicin del sustrato) en funcin del tiempo se obtiene la llamada curva de avance de la reaccin, o simplemente, la cintica de la reaccin. A medida que la reaccin transcurre, la velocidad de acumulacin del producto va disminuyendo porque se va consumiendo el sustrato de la reaccin (Figura de la derecha). Para evitar esta complicacin se procede a medir la velocidad inicial de la reaccin (v 0 ). La velocidad inicial de la reaccin es igual a la pendiente de la curva de avance a tiempo cero (Figura de la derecha). De esta forma, la medida de v 0 se realiza antes de que se consuma el 10% del total del sustrato, de forma que pueda considerarse la [S] como esencialmente constante a lo largo del experimento. Adems, en estas condiciones no es necesario considerar la reaccin inversa, ya que la cantidad de producto formada es tan pequea que la reaccin inversa apenas ocurre. De esta forma se simplifican enormemente las ecuaciones de velocidad.
44 BIOQUMICA ENZIMAS Para estudiar la cintica enzimtica se mide el efecto de la concentracin inicial de sustrato sobre la velocidad inicial de la reaccin, manteniendo la cantidad de enzima constante. Si representamos v 0 frente a [S] 0 obtenemos una grfica como la de la Figura de la derecha. Cuando [S] 0 es pequea, la velocidad inicial es directamente proporcional a la concentracin de sustrato, y por tanto, la reaccin es de primer orden. A altas [S] 0 , el enzima se encuentra saturada por el sustrato, y la velocidad ya no depende de [S] 0 . En este punto, la reaccin es de orden cero y la velocidad es mxima (V max ). MODELO CINTICO DE MICHAELIS-MENTEN Los estudios sistemticos del efecto de la concentracin inicial del sustrato sobre la actividad enzimtica comenzaron a realizarse a finales del siglo XIX. Ya en 1882 se introdujo el concepto del complejo enzima- sustrato como intermediario del proceso de catlisis enzimtica. En 1913, Leonor Michaelis (foto de la izquierda) y Maud Menten (foto de la derecha) desarrollaron esta teora y propusieron una ecuacin de velocidad que explica el comportamiento cintico de los enzimas. Para explicar la relacin observada entre la velocidad inicial (v 0 ) y la concentracin inicial de sustrato ([S] 0 ) Michaelis y Menten propusieron que las reacciones catalizadas enzimticamente ocurren en dos etapas: En la primera etapa se forma el complejo enzima-sustrato y en la segunda, el complejo enzima-sustrato da lugar a la formacin del producto, liberando el enzima libre:
En este esquema, k 1 , k 2 y k 3 son las constantes cinticas individuales de cada proceso y tambin reciben el nombre de constantes microscpicas de velocidad. Segn esto, podemos afirmar que: v 1 = k 1 [E] [S] v 2 = k 2 [ES]
45 BIOQUMICA ENZIMAS v 3 = k 3 [ES] Se puede distinguir entre enzima libre (E) y enzima unido al sustrato (ES), de forma que la concentracin total de enzima, [E T ], (que es constante a lo largo de la reaccin) es: [E T ] = [E] + [ES] Como [E] = [ET] - [ES], resulta que: v 1 = k 1 [S] [E T ] - k 1 [S] [ES] Este modelo cintico adopta la hiptesis del estado estacionario, segn la cual la concentracin del complejo enzima-sustrato es pequea y constante a lo largo de la reaccin (Figura de la derecha). Por tanto, la velocidad de formacin del complejo enzima-sustrato (v 1 ) es igual a la de su disociacin (v 2 + v 3 ): v 1 = v 2 + v 3
Adems, como [ES] es constante, la velocidad de formacin de los productos es constante:
v = v 3 = k 3 [ES] = constante. Como v 1 =v 2 +v 3 , podemos decir que: k 1 [S] [E T ] - k 1 [S] [ES] = k 2 [ES] + k 3 [ES] Despejando [ES], queda Que: , siendo , en donde la expresin (k 2 +k 3 )/k 1 se ha sustituido por K M , o constante de Michaelis-Menten. Este enlace nos aporta una explicacin sobre las razones que hacen de la K M un parmetro cintico importante. Por lo tanto, en el estado estacionario, la velocidad de formacin del producto es:
46 BIOQUMICA ENZIMAS
v = v 3 = k 3 [ES] =
Para cualquier reaccin enzimtica, [E T ], k 3 y K M son constantes. Vamos a considerar dos casos extremos: A concentraciones de sustrato pequeas ([S] << K M ) v = (k 3 [E T ]/K M ) [S]. Como los trminos entre parntesis son constantes, pueden englobarse en una nueva constante, k obs , de forma que la expresin queda reducida a: v = k obs [S], con lo cual la reaccin es un proceso cintico de primer orden.
A concentraciones de sustrato elevadas ([S] >> KM), v = k 3 [E T ]. La velocidad de reaccin es independiente de la concentracin del sustrato, y por tanto, la reaccin es un proceso cintico de orden cero. Adems, tanto k 3 como [E T ] son constantes, y nos permite definir un nuevo parmetro, la velocidad mxima de la reaccin (V mx ): V max = k 3 [E T ], que es la velocidad que se alcanzara cuando todo el enzima disponible se encuentra unido al sustrato. Si introducimos el parmetro V max en la ecuacin general de la velocidad, (la frmula recuadrada anteriormente), obtenemos la expresin ms conocida de la ecuacin de Michaelis-Menten:
47 BIOQUMICA ENZIMAS Hay enzimas que no obedecen la ecuacin de Michaelis-Menten. Se dice que su cintica no es Michaeliana. Esto ocurre con los enzimas alosterico, cuya grfica v frente a [S] no es una hiprbola, sino una sigmoide (Figura de la derecha). En la cintica sigmoidea, pequeas variaciones en la [S] en una zona crtica (cercana a la K M ) se traduce en grandes variaciones en la velocidad de reaccin.
CLCULO DE LA K M Y DE LA V max DE UN ENZIMA La representacin grfica de la ecuacin de Michaelis-Menten (v 0 frente a [S] 0 ) es una hiprbola (Figura de la izquierda). La V max corresponde al valor mximo al que tiende la curva experimental, y la K M corresponde a la concentracin de sustrato a la cual la velocidad de la reaccin es la mitad de la V max .
Para determinar grficamente los valores de K M y V max es ms sencillo utilizar la representacin doble recproca (1/v 0 frente a 1/[S] 0 ), ya que es una lnea recta. Esta representacin doble recproca recibe el nombre de representacin de Lineweaver- Burk (Figura de la derecha). Es una recta en la cual: La pendiente es K M /V max
48 BIOQUMICA ENZIMAS La abscisa en el origen (1/v 0 = 0) es -1/K M
La ordenada en el origen (1/[S] 0 = 0) es 1/V max
De esta forma, a partir de los datos experimentales se puede calcular grficamente, los valores de K M y V max de un enzima para diversos sustratos. ACTIVIDAD ENZIMTICA Se define la unidad de actividad enzimtica (U) como la cantidad de enzima que cataliza la conversin de 1 mol de sustrato en un minuto. La actividad especfica es el nmero de unidades de enzima por miligramo de protena (U/mg prot) o por mililitro de disolucin (U/ml). Recientemente, el Sistema Internacional de unidades (SI) ha definido la unidad de actividad enzimtica como la cantidad de enzima que transforma 1 mol de sustrato por segundo. Esta unidad se llama katal(kat). Como 1 mol son 10 6 moles y 1 minuto son 60 segundos, resulta que 1 katal equivale a 60 x 10 6 U. Esta unidad es muy grande, de forma que se utilizan frecuentemente los submltiplos como el microkatal (kat, 10 -6 kat) o el nanokatal (nkat, 10 -9 kat). Cuando se conoce el peso molecular del enzima puro y el nmero de centros activos por molcula de enzima, las medidas de actividad enzimtica permiten calcular el nmero de recambio del enzima, o sea, el nmero de reacciones elementales que realiza el enzima por cada centro activo y por unidad de tiempo. RELACIONES ENTRE LA ENZIMA Y EL SUSTRATO. Es universalmente aceptado, que la enzima, como todo catalizador, participa de una manera activa en la reaccin. Existen pruebas experimentales de esta situacin cuando menos para algunos. Un ejemplo bien conocido es el de la peroxidasa que, en presencia de perxido de hidrgeno, H2O2, y un aceptor de hidrgeno adecuado, produce la reduccin del H2O2, La peroxidasa en ausencia de H2O2 muestras unas bandas de absorcin caractersticas en el espectro visible; cuando se combina con el H2O2, pero sin que exista el aceptor de los hidrgenos, aparece una nueva distribucin de las bandas. Si se permite el paso de los hidrgenos a un aceptor, automticamente desaparecen las bandas nuevas y reaparecen las originales de peroxidasa. Se acepta corrientemente una hiptesis propuesta por Michaelis para explicar la actividad enzimtica, sobre la base de la informacin de un compuesto de la enzima con el sustrato (complejo enzima sustrato), previamente al ataque del sustrato por la enzima y a la liberacin de los productos de la reaccin.
49 BIOQUMICA ENZIMAS El desarrollo matemtico que permiti a Michaelis formular su hiptesis, estuvo acorde con los datos experimentales obtenidos una vez vencidos los enormes obstculos de orden tcnico para llevar a cabo la confirmacin de la teora en el laboratorio. Si se hace el estudio de la actividad de una enzima en relacin con la concentracin de sustrato. En ella se registran, en las abscisas, la cantidad creciente de sustrato y, en las ordenadas, la cantidad de uno de los productos de la reaccin liberada de un tiempo dado, que expresa, en rigor, la actividad de la enzima. La curva obtenida es la de una hiprbola rectangular, la cual tiene algunas propiedades interesantes; por ejemplo, la velocidad lmite o velocidad mxima, es el valor que trata de alcanzar la curva a medida que se aumenta el sustrato y que, en la figura, est sealada con la lnea V. Existe un punto, fijado arbitrariamente, en el que la mitad de la velocidad lmite corresponde a una concentracin especfica del sustrato; esta concentracin de sustrato se representa habitualmente como KM, y se denomina constante de Michaelis, valor caracterstico para un par enzima sustrato y que, por lo tanto, es la concentracin de sustrato con la cual se alcanza la mitad de la velocidad lmite o velocidad mxima de la reaccin. Los resultados obtenidos experimentalmente concuerdan con los derivados de modo matemtico, sobre la hiptesis de formacin de un complejo enzima sustrato. La constante de Michaelis, KM, indica en trminos generales, las relaciones de afinidad entre el sustrato y la enzima; un KM, implica la necesidad de una alta concentracin de sustrato que, al combinarse con una enzima, produzca la mitad de la velocidad mxima, o sea, que la afinidad por la enzima y sustrato es pobre; por el contrario, si la concentracin de sustrato que se requiere para alcanzar la mitad de la velocidad es muy pequea (KM pequea), quiere decir que el sustrato tiene una gran afinidad por la enzima. En ocasiones, la misma enzima puede ser ms afn a un sustrato que a otro; por ejemplo, la sacarosa es 16 veces ms activa para atacar a la sacarosa que a la rafinosa. Se conocen con exactitud los valores de KM para muchos sustratos y enzimas, con los siguientes: la pepsina, actuando sobre albmina, de huevo: KM de 4.5. Por ciento; la tripsina sobre la casena: KM de 2 por ciento; la amilasa sobre el almidn en presencia de Cl : KM de 0.4 por ciento; la sacarosa de levadura, sobre la sacarosa: KM 0.016 a 0.04 M, etc. La explicacin de la curva hiperblica que implica la formacin del complejo enzima sustrato parece depender de la existencia fsica, en la enzima, de determinados sitios donde se absorbe el sustrato para ser activado. Al principio de la curva se puede aumentar la concentracin del sustrato y la enzima es capaz de activarlo con toda eficiencia; pero como una vez activado el sustrato se separa en forma de los productos, y la velocidad con la que stos se separan no es igual a la velocidad con la que captado el sustrato, y en vista de la cantidad creciente del
50 BIOQUMICA ENZIMAS sustrato, la lnea obtenida no es una recta, sino la curva sealada. Cuando la cantidad de sustrato ha sobrepasado la capacidad fsica de la enzima para recibirlo y poder transformarlo, la curva alcanza una meseta, lo que significa que la reaccin prosigue a la misma velocidad, independientemente de la cantidad de sustrato adicionada. De acuerdo con los trminos ligados a la velocidad de reaccin, expresados en la pgina 36, se encuentra que, al principio del experimento, la reaccin depende exclusivamente de la concentracin del sustrato y se trata de una reaccin de primer orden; al final de ella, cuando hay un exceso de sustrato, la reaccin es independiente de la cantidad de sustrato y, por lo tanto, es de orden cero. Otra caracterstica en relacin con la finalidad de la enzima por el sustrato es la comprendida en el llamado nmero de recambio, el cual representa los moles de sustrato atacados por un mol de enzima en una unidad de tiempo determinada, generalmente un minuto. Este nmero de recambio, en algunas ocasiones, es muy elevado, como sucede con la catalasa que a 0 C., tiene un nmero de recambio de 2.5 millones; es decir, un mol de enzima es capaz, en un minuto, de desdoblar dos y medio millones de moles de H2O2; el citrocomo c, a 38 C, tiene un nmero de recambio de 1.4 X 10 3 ; la carboxilasa a 30 C., da un nmero de recambio de 1 X 10 3 , etc. Mecanismo Ping Pong En la transaminacin, la reaccin avanza a travs de los fenmenos alternos de adicin de sustrato y liberacin de producto. Iones sustrato Estos facilitan la fijacin del sustrato y la catlisis por creacin de varias de complejo de puente constituidos por un enzima, metal y sustrato en la que os iones metlicos pueden actuar como catalizadores cidos generales o facilitar la aproximacin de los reactantes.
ANTAGONISMO METABLICO (ANTI METABOLITOS)
Las enzimas pueden ser inhibidas por diversos compuestos, especialmente los que presentan una estructura parecida al sustrato natural, como expres en el caso del cido malnico y el cido succnico con respecto a la deshidrogenasa succnica. Esta inhibicin se denomina metabolitos las sustancias presentes o producidas en el curso del metabolismo celular, y antimetabolitos las sustancias parecidas a aqullos, y que impiden su aprovechamiento y utilizacin; en general, se trata de sustancias que compiten, a nivel enzimtico, en vista de su parecido estructural, con los metabolitos naturales.
51 BIOQUMICA ENZIMAS Numerosos hongos, actinomicetos, bacterias, etc., producen sustancias que muestran actividad contra otros microorganismos. Estas sustancias se han denominado antibiticos y, en principio, se deben considerar como antimetabolitos que impiden, por razones de competencia, el crecimiento de determinadas formas microbianas. En medicina ha resultado del mayor inters el aislamiento y la actividad de los antibiticos, ya que en ciertas condiciones se usan para reprimir el desarrollo de grmenes patgenos para los seres humanos. El estudio de los antimetabolitos probablemente se inici al observar que numerosas bacterias podan crecer en un medio que tuviera sulfanilamida, que normalmente es un inhibidor de su crecimiento, siempre que se aadieran grandes cantidades de cido p-aminobenzoico, una vitamina necesaria para la nutricin celular. En vista del parecido estructural entre las dos molculas, la sulfanilamida y el cido p-aminobenzoico, se acept que los fenmenos de inhibicin tenan una base estructural. Entre los antibiticos, existen algunos de gran utilidad teraputica, como la penicilina, aislada de diversos hongos Pemicillium ; la estreptomicina, proveniente de cultivos de Streptomyces griseus, y las tetraciclinas, sustancias que tienen amplio campo de accin de diversas infecciones producidas por bacterias grampositivas o gramnegativas. Qumicamente, son sustancias complejas formadas por distintos grupos: por ejemplo, la estreptomicina contiene glucosamina, estreptosa y estreptidina. Algunos antibiticos son pptidos, de tipo bsico, aislados de bacterias, tales como la gramicidina y las tirocidinas. Un ejemplo peculiar de antibitico producido por el hongo Pemicillium notatum es la notatina, idntica a la enzima glucosa oxidasa que ataca a la glucosa permitiendo su conversin a gluconolactona y cido glucnico; es posible que de esta manera ejerza su accin de antibitico. Muchos antimetabolitos suelen intervenir de modo especfico a nivel de las coenzimas o de los grupos prostticos, cuando stos son del tipo de las vitaminas. Se trata, por lo tanto, en estos casos, de anti vitaminas, muy comunes en las del grupo B. As, la tiamina modificada en su estructura qumica para formar piritiamina u oxitiamina, no participa en los procesos de descarboxilacion. El cido piridn 3 sulfnico impide la accin de la vitamina natural parecida a l, o cido nicotnico y perturba numerosas reacciones de deshidrogenacin. La piridoxina es antiorganizada por la desoxipiridoxina y la biotina, de la misma manera, por la destiobiotina. Se han preparado numerosas sustancias parecidas a las bases pricas y pirimidnicas con la finalidad de bloquear los sistemas de formacin de protena, que dependen de la presencia de cidos nucleicos que contienen dichas bases, en el interior de las clulas; estos trabajos se han planeado para deprimir la velocidad de desarrollo de clulas cancerosas. Entre las sustancias obtenidas en fechas recientes se puede sealar el grupo del 5 fluorouracilo, que produce inhibicin tumoral por el siguiente mecanismo, que
52 BIOQUMICA ENZIMAS puede ser comn a un gran nmero de sustancias con estas propiedades : en el tumor falta la enzima que destruye el antimetabolitos, en este caso el 5 fluorouracilo, el cual se vuelve muy agresivo hacia el tumor ya que no es degradado por l; en cambio, dicha sustancia es menos txica para el tejido normal que s est en posibilidad de destruirlo.
INHIBICIN ALOSTERICO
De gran importancia en el fenmeno de la actividad enzimtica es el hecho de que, en las protenas, pueden existir dos (o cuando menos dos) sitios diferentes desde el punto de vista estereo- especfico y que, adems, estn en lugares distintos. Uno de estos sitios es el centro activo, donde el sustrato es atacado para dar origen a los productos de la reaccin y por lo tanto donde reside el aspecto funcional de la protena. El otro sitio denomina sitio alosterico y en l puede acomodarse de manera complementaria - pero reversible - alguna sustancia llamada efector alosterico ; al efectuarse esta unin se produce una alteracin discreta de la estructura de la protena, la transicin alostrica, que modifica la actividad biolgica de la protena, porque altera la distancia, las propiedades del sitio activo. Es muy importante que el efector alosterico normal no tiene relacin qumica o metablica alguna con el sustrato de dicha enzima y que su accin tan especfica se debe a que altera de tal modo la conformacin de la protena que modifica su centro activo. El efecto alosterico se ha estudiado de manera especial en bacterias, pero ocurre tambin en animales superiores. En un principio se reconoci como un efecto inhibidor que, por su caractersticas, fue denominado "por retro- alimentacin" o "por producto final. En rigor, en las bacterias, es la regla que el metabolito formado al final de un camino metablico, resulte un poderoso inhibidor de su propia sntesis. Parte de la explicacin de este efecto (pg. 535) se debe a que dicho metabolito inhibe especficamente a una sola enzima localizada en el camino metablico que forma a dicha sustancia, y de manera curiosa, la enzima sensible al metabolito final es la primera de este camino metablico. En un ejemplo de camino A B C D E, siendo E el metabolismo final, ste inhibira a la primera enzima la que forma B a partir de A. En este captulo en que se estudia la regulacin metablica se analizan con detalle algunos de estos ejemplos y las reacciones qumicas individuales afectadas. La inhibicin alostrica demuestra la alta especializacin de las enzimas que reconocen tanto al sustrato como al inhibidor, siendo muy especficas para ambos. Como qumicamente el sustrato y el efector alosterico son muy distintos, se acepta que la unin con la enzima debe efectuarse en sitios diferentes, lo que ha demostrado con mutantes bacterianas no
53 BIOQUMICA ENZIMAS sensibles al efector alosterico. Adems, no hay interaccin directa entre el sustrato y el inhibidor puesto que los sitios receptores estn muy separados. Las protenas alostricas pueden corresponder a polmeros, es decir, a molculas compuestas de sub- unidades idnticas, con ejes de simetra definidos. El hecho de que se agreguen las subunidades, por una parte, y el que al estar en forma polimrica adopten diversas situaciones conformaciones, hace susceptibles a la enzima a los inhibidores, o por el contrario, a recibir (fig. 3-10) al sustrato y llevar a efecto su accin caracterstica. Ms an, para el caso de la transcarbamilasa asprtica se ha demostrado que una subunidad se combina con el sustrato y otra, distinta, con el inhibidor. Estos fenmenos adquieren una importancia de tipo general, al demostrar que es factible modificar la accin de las enzimas por cambios en la estructura cuaternaria de las protenas, basadas en la asociacin y disociacin de subunidades. Algunos ejemplos particulares son los siguientes: la deshidrogenasa glutmica, con peso molecular de cerca de 1 milln puede partirse en subunidades de 250 000 por diversos agentes: DPN, ADP, estrgenos tiroxina y ciertos aminocidos. Otro ejemplo es la carboxilasa de la acetil coenzima. A, que es activada por la adicin de citrato, el cual cambia el coeficiente de sedimentacin de la enzima de 18 S a 43 S, o sea la molcula pasa a forma de polmero activo a partir de monmeros inactivos. Un caso ya clsico es el de la fosforilasas inactiva que se convierte en activa cuando se fosforila; la estructura inactiva est formada por 2 unidades y la activa por 4.
ENZIMAS DIGESTIVAS Las enzimas adoptan una estructura tridimensional que permite reconocer a los materiales especficos sobre los que pueden actuar (sustratos). Cada una de las transformaciones, que experimentan los alimentos en nuestro sistema digestivo est asociada a un tipo especfico de enzima. Estas enzimas son las llamadas enzimas digestivas. Cada enzima acta sobre un solo tipo de alimento, como una llave encaja en una cerradura. Adems, cada tipo de enzima trabaja en unas condiciones muy concretas de acidez, como se puede ver en el cuadro de abajo.
Ptialina, en la boca, para almidones
54 BIOQUMICA ENZIMAS Si no se dan estas condiciones, la enzima no puede actuar, las reacciones qumicas de los procesos digestivos no se producen adecuadamente y los alimentos quedan parcialmente digeridos.
LAS ENZIMAS Y LA DIGESTIN
Enzima Acta sobre Proporciona Se produce en Condiciones para que acte Ptialina Almidones. Mono y disacridos La boca (glndulas salivares) Medio moderadamente alcalino Amilasa almidones y azcares Glucosa El estmago y pncreas Medio moderadamente cido Pepsina protenas Pptidos y aminocidos El estmago Medio muy cido Lipasa grasas cidos grasos y glicerina Pncreas e intestino Medio alcalino y previa accin de las sales biliares Lactasa lactosa de la leche Glucosa y galactosa Intestino (su produccin disminuye con el crecimiento) Medio cido
El proceso normal de digestin de los alimentos, mediante la accin de las enzimas, da como resultado nutrientes elementales (aminocidos, glucosa, cidos grasos, etc.) que asimilamos en el intestino y son aprovechados por el organismo. Sin embargo, cuando las enzimas no pueden actuar o su cantidad es insuficiente, se producen procesos de fermentacin y putrefaccin en los alimentos a medio digerir. En este caso, son los fermentos orgnicos y las bacterias intestinales las encargadas de descomponer los alimentos. La diferencia es que en lugar de obtener exclusivamente nutrientes elementales, como en el caso de la digestin propiciada por las enzimas, se producen adems una gran variedad de productos txicos (indol, escatol, fenol, etc.). Estas sustancias tambin pasan a la sangre, sobrecargando los sistemas de eliminacin de txicos del organismo.
55 BIOQUMICA ENZIMAS
No slo para provocar la digestin
ENZIMAS INTRACELULARES Otras enzimas actan en el interior de las clulas, transformando los nutrientes que les llegan a travs de la sangre en otras sustancias, como el cido oxalactico o el pirvico, que forman parte del metabolismo celular. Las enzimas intracelulares tambin son los responsables de los procesos de degradacin celular. En estos procesos se obtienen nutrientes elementales a partir de los materiales estructurales propios de las clulas cuando el aporte mediante la dieta se interrumpe (por ejemplo, durante el ayuno), o cuando la clula no puede utilizar los nutrientes de la sangre (por ejemplo, en la diabetes). PARTICULARIDADES Hay enzimas que necesitan la participacin de otros compuestos qumicos no proteicos, denominados cofactores, para poder actuar realmente como enzimas. Estos compuestos pueden ser: el grupo prosttico, como por ejemplo el grupo hemo de la hemoglobina, o una coenzima, como la coenzima A o el fosfato de piridoxal. A la parte proteica sin el cofactor se le llama apoenzima, y al complejo enzima-cofactor holoenzima. Tambin existen enzimas que se sintetizan en forma de un precursor inactivo llamado proenzima. Cuando se dan las condiciones adecuadas en las que la enzima debe actuar, se segrega un segundo compuesto que activa la enzima. Por ejemplo: el tripsingeno segregado por el pncreas activa a la tripsina en el intestino delgado, el pepsingeno activa a la pepsina en el estmago, etc.
56 BIOQUMICA ENZIMAS Las enzimas actan generalmente sobre un sustrato especfico, como la ureasa, o bien sobre un conjunto de compuestos con un grupo funcional especfico, como la lipasa o las transaminasas. La parte de la enzima que "encaja" con el sustrato para activarlo es denominada centro activo, y es el responsable de la especificidad de la enzima. En algunos casos, compuestos diferentes actan sobre el mismo sustrato provocando una misma reaccin, por lo que se les llama isoenzimas. DIGESTIN, ENZIMAS Las principales enzimas que intervienen en la dinmica digestiva son las siguientes: Principales enzimas digestivas
ENZIMA ORIGEN SUBSTRATO FUNCIN CATALTICA O PRODUCTOS
Amilasa salival Glndulas salivales Almidn Hidroliza LOS enlaces 1,4, produciendo dextrinas limitantes, matotriosa y maltosa.
Pepsinas Estmago Protenas y polipptidos Rompen los enlaces peptdicos adyacentes a los aminocidos aromticos
Tripsina Pncreas exocrino Protena y polipptidos Rompen los enlaces peptdicos adyacentes a la arginina o lisina. Quimotripsinas Pncreas exocrino Protena y polipptidos Rompen los enlaces peptdicos adyacentes a los aminocidos aromticos Carboxipeptidasa Pncreas exocrino Protena y polipptidos Separa los carboxiaminocidos terminales Lipasa pancretica Pncreas exocrino Triglicridos Monogliceridos y
57 BIOQUMICA ENZIMAS cidos grasos Esterasa pancretica Pncreas exocrino Esteres de colesterol Colesterol Amilasa pancretica Pncreas exocrino Almidn Igual que la amilasa salival Ribonucleasa Pncreas exocrino ARN Nucletidos Desoxirribonucleasa Pncreas exocrino ADN Nucletidos Enteropeptidasa Mucosa intestinal Tripsingeno Tripsina
Aminopeptidasas Mucosa intestinal Polipptidos Separa el aminocido N- terminal del pptido Dipeptidasas Mucosa intestinal Dipptidos Dos aminocidos Maltasa Mucosa intestinal Maltosa, maltotriosa Glucosa Lactasa Mucosa intestinal Lactosa Galactosa y glucosa Sacarasa Mucosa intestinal Sacarosa Fructosa y glucosa Dextrinasa limitante Mucosa intestinal Dextrinas limitantes Glucosa Nucleasa y enzimas relacionadas Mucosa intestinal cidos nucleicos (ADN y ARN) Pentosas y bases pricas y pirimdicas Diversas peptidasas Citoplasma de las clulas de la mucosa Di-, tri-, y tetrapptidos Aminocidos.
ENZIMAS EN EL DIAGNSTICO CLNICO
Las enzimas plasmticas se pueden clasificar en dos grupos principales. En primer lugar se encuentra un grupo relativamente pequeo de enzimas que secretan activamente hacia la sangre ciertos tipos de clulas. Por ejemplo las clulas hepticas secretan cimgenos (precursores inactivos) de las enzimas que participan en la coagulacin de la sangre. El segundo grupo est constituido por gran nmero de especies enzimticas que descargan las clulas durante su recambio normal. Estas enzimas funcionan casi siempre dentro de la clula y carecen de utilidad fisiolgica en el plasma. En los individuos sanos las
58 BIOQUMICA ENZIMAS concentraciones de estas enzimas son bastante constantes, y representan un estado sostenido en el que la tasa de descarga desde las clulas lesionadas hacia el plasma se encuentra equilibrada por una tasa igual de remocin de la enzima protenica desde el plasma. La presencia de actividad enzimtica elevada en el plasma puede indicar la lesin tisular que se acompaa de aumento de la descarga de enzimas intracelulares (fig. 5-20) (nota el plasma es liquido no celular constituyente de la sangre. Las pruebas de laboratorio de la actividad enzimtica se efectan ms a menudo con suero que se obtiene mediante configuracin de la sangre entera despus que ha dejado coagular. El plasma es un lquido fisiolgico, en tanto que el suero se prepara en laboratorios.) A. ALTERACIN DE LAS CONCENTRACIONES DE ENZIMAS PLASMTICAS EN LOS ESTADOS DE ENFERMEDAD. Muchas enfermedades que producen lesin tisular tiene como consecuencia aumento de la descarga de enzimas extracelulares hacia el plasma. Las actividades de muchas de estas enzimas se identifican de manera sistemtica con finalidad diagnosticas en las enfermedades de corazn, hgado, musculo, esqueleto y otros tejidos. La magnitud de las actividades de una enzima especifica en el plasma suele guardar correlacin con la extensin de la lesin tisular de este modo a menudo es til determinar el grado de elementos de la actividad de una enzima en particular en el plasma para valorar el pronstico de pacientes. B. ENZIMAS PLASMATICAS COMO INSTRUMENTOS DIAGNOSTICOS Algunas enzimas manifiestan actividades relativamente elevadas nada ms en uno o unos cuantos tejidos. La presencia de concentraciones incrementadas de estas enzimas en el plasma
59 BIOQUMICA ENZIMAS refleja, en consecuencia lesin del tejido correspondiente. Por ejemplo, la enzima aminotransferasa de la alanina abunda en el hgado. La aparicin de concentraciones elevadas de esta enzima en el plasma indica posible lesin del tejido heptico. Los aumentos de las concentraciones plasmticas de enzimas que tienen gran distribucin tisular son indicaciones menos especficas del sitio en que se encuentran las clulas daadas. Esta falta de especificidad tisular limita el valor diagnstico de muchas enzimas plasmticas.
C. ISOENZIMAS Y ENFERMEDADES DEL CORAZON. La mayor parte de las isoenzimas (llamadas tambin Isozimas) son enzimas que catalizan la misma relacin. Sim embargo no tienen necesariamente las mismas propiedades fsicas a causa de los diferencias de la secuencia de aminocidos producida de manera gentica. Por este motivo, las isoenzimas pueden contener nmeros diferentes de aminocidos cargados y, por este motivo, se parece entre s mediante electroforesis. Diferentes rganos contienen a menudo proporciones caractersticas de isoenzimas distintas. El patrn de isoenzimas que se encuentra en el plasma puede servir, por este motivo como medio para identificar el sitio de la lesin tisular. Por ejemplo, las concentraciones plasmticas de cinasa de la creatina (CK) y de deshidrogenasa del lactato (LDH) se miden con frecuencia para ser el diagnstico de infarto del miocardio. Tienen utilidad particular es difcil interpretar el electrocardiograma, como en los casos en que han ocurrido crisis previas de enfermedad del corazn. 1. Estructura cuaternaria de las isoenzimas: Muchas isoenzimas contienen subunidades diferentes en diversas combinaciones. Por ejemplo, la cinasa de la creatina se encuentra como 3 isoenzimas. Cada isoenzima es un dmero compuesto por dos polipeptidos (denominados subunidades BiN) enlazados en una de tres combinaciones:CK1=BB, CK2= MB, y CK3= MM. Cada isoenzima CK manifiesta una movilidad electrofortica caracterstica. 2. Diagnstico de infarto del miocardio: el musculo miocrdico es el nico tejido que contiene ms del 5% de la actividad total del CK como la isoenzima CK2 (MB). La aparicin de esta isoenzima hibrida en el plasma es virtualmente especifica de infarto de miocardio. Despus de un infarto agudo del miocardio, la isoenzima aparece entre 4 y
60 BIOQUMICA ENZIMAS 8 horas despus de haberse iniciado el dolor torcico y alcanza su actividad mxima en cerca de 24 horas (nota: la actividad de deshidrogenasa del lactato se eleva tambin en el plasma despus del infarto del miocardio y alcanza una nivel de 36 a 40 horas despus de iniciarse los sntomas. Las actividades LDH es, por este motivo de utilidad diagnostica en los pacientes que ingresan en el hospital ms de 48 horas despus de haber sufrido infarto, momento en el que la CK2 puede ofrecer resultado equivoco). 3. Marcadores de infarto del miocardio de aparicin ms reciente: la troponina T y la troponina I son protenas reguladoras que participan en la contractibilidad miocrdica. Se descarga en el plasma como reaccin a la lesin cardiaca. Las troponinas sricas elevadas son factores de prediccin ms importantes de resultados adversados en los casos de angina inestable y de infarto del miocardio que la prueba ordinaria para determinar la CK2. ( PAMELA .C. CHAMPE , PhD bioqumica 3 era edicin pg. 73-74-75) COLISNESTERASA (esterasa de acetilcolina) La colinesterasa del suero o plasmtica (CoP) es la inespecfica o seudocolinesterasa o II frente a la genuina que es la contenida en los hemticos y en el tejido nervioso. Normalmente de 2 a 4 U.* en unidades internacionales los valores normales oscilan entre 1.900 y 3.800 Mu/ml. 1. En la miastenia grave, algunos autores registran valores altos. 2. En la miotonia congnita por el contrario cifras subnormales. Ambos resultados no han podido ser comprobados por otros investigadores. Disminuye: 1. En las hipoproteinemias e hipoalbuminemias (cirrosis, kala- azar, anemia perniciosa, etc.). Suele encontrar un descenso del poder colinesterasico del suero, exacto en los casos debidos a escape colinesterasico del suero, excepto en los casos debidos a escape renal de la seroalbmina o sea con albuminuria positiva. 2. Su utilizacin como prueba funcional heptica puede encontrarse en la sesin correspondiente: la colinesterasa desciende en la insuficiencia heptica, y su determinacin sirve para observar el pronstico en las hepatopatas terminales graves. Tambin se utiliza en la monitorizacin de los trasplantes de hgado. 3. Ciertos insecticidas inciden especficamente la actividad colinesterasica del suero (insecticidas tipo alkil- fosfato).
61 BIOQUMICA ENZIMAS 4. Existe una forma congnita de deficiencia de colinesterasa que puede ocasionar apneas prolongadas por succinilcolina menos usada como miorrelajantes despus de la anestesia. La colinesterasa baja y permite identificar a los pacientes sensibles a la succinilcolina. 5. En la anemia perniciosa decrecen tanto la del plasma como la eritrocitaria. 6. En la triquinosis, descensos que pueden durar meses, especialmente los de la eritrocitaria. Aumenta: 1. En el sndrome nefrtico aumenta la colinesterasa (Vincent), a pesar de las perdidas renales de protenas. 2. En los diabticos obesos es frecuente una hipercolinesterasemia. 3. En la esclerosis en placas se ha comprobado disminucin en la desmielinizacion y aumentos notables en las formas progresivas (jones). LIPASA EN SANGRE Normalmente de 0 a 1 U/ml solo se considera claramente patolgicos los resultados superiores a 2 U. En la tcnica clasificadamente usada, 1U equivale a 1 ml de solucin de N/20 de NaOH necesaria para neutralizar los cidos grasos liberados en la hidrolisis de aceite de oliva por suero. 1. Aumenta la lipasemia: a. En las pancreatitis agudas se alcanzan cifras de hasta 10 U/ml. La hiperlipasemia en estos casos perdura mucho ms que la hiperamilasemia, de forma que normalizada esta puede el diagnstico tardo confirmarse mediante la comprobacin de una cifra de lipasa en sangre en la primera o en la segunda y en ocasiones, hasta en la tercera semana de enfermedad. b. En algunas pancreopatias crnicas, al revs de lo que sucede con la amilasemia, se observa un franco aumento de la lipasemia, especficamente en el cncer de cabeza de pncreas, dato de gran valor para el diagnstico diferencial con otras ictericias obstructivas. En los procesos pancreticos de larga duracin pueden normalizarse la actividad lipoltica del suero, y entonces esta no se eleva ni siquiera tras la administracin de secretina y otros estimulantes, combinada con la inyeccin de morfina para cerrar el esfnter de Oddi (prueba funcional). c. En algunas afecciones hepticas- ciertas ictericias parenquimatosas, cirrosis heptica, as como casos de ulcus duodenal aunque no de forma constante ni caracterstica,
62 BIOQUMICA ENZIMAS indicara una participacin pancretica concomitante o secundaria. 2. Disminuye la lipasemia a. Durante el embarazo como variacin fisiolgica, especialmente en los ltimos meses, con pronta recuperacin despus del parto. b. En el curso de la tuberculosis y otras enfermedades infecciosas. c. Frecuentemente en la diabetes sacarina. d. En el 56 % de casos de pancreatitis crnica. Pero en el 75 % en las formas con insuficiencia exocronica marcada o despus de larga evolucin ( Kehl).
LIPOPROTEINLIPASA Valor normal: + - 4.6 umol FFS/ml/hora. Se encuentra disminuida en la aterosclerosis coronaria (Breier) y coincide con el colesterol alto, HDL-col bajo y triglicridos elevados. AMILASA (diastasa) EN SANGRE Normalmente 70-200 U/100 ml (mtodo Somogyi), equivalentes a 3-10U Wohlgemuth por mililitro. Actualmente se tiende a expresar en unidades internacionales, que oscilan en el adulto normal entre 230 y 3.500/100 ml (o sea 20 U/ml).hasta 160 U Ricel/l y 200UI/I con el mtodo nefelomtrico de Coleman. 1. Aumentos de la amilasemia* se observan: a) En las pancreatitis agudas como hallazgo caracterstico, excepto en los casos de necrosis fulminante, que no permiten la elevacin de la amilasemia. Cuando se produce hiperamilasemia, se alcanza cifras elevadas que pueden llegar a 3.00 U o ms, normalizndose a las 48 horas o como mximo a los 4 o 6 das. Tambin en las pancreatitis secundarias a hepatitis agudas por virus, lo cual tiene valor para diagnosticar esta complicacin. Se han descrito amilasemias por pancreatitis yatrgenas (en tratamientos con macrlidos: erotromicina, roxitromicina). Por el contrario las afecciones crnicas del pncreas no suelen elevar la amilasemia, excepto en los brotes agudos de una pancreatitis crnica, pero a veces tambin en los tumores y quistes pancreticos. b) En el ulcus gstrico penetrante en pncreas. En estos casos, los aumentos son mucho menores que en la pancreatitis aguda. En distintos procesos abdominales
63 BIOQUMICA ENZIMAS para pancreticos: gastritis, ulcus duodenal perforado, peritonitis, obstruccin del intestino delgado, etc. Hay discretas elevaciones de la diastasemia. c) En los traumatismos pancreticos y en la obstruccin del conducto pancretico o de la esfnter de Oddi por litiasis o carcinoma (ampuloma). Hiperamilasemia transitorias poscolangiopancreatografia. d) En la parotiditis, sobre todo si es bilateral, generalmente entre el quinto y sptimo da de enfermedad. A veces el aumento se exagera por la participacin pancretica. La litiasis salival con obstruccin determina tambin hiperamilasemia. e) En el curso de diversas infecciones-tiroides tifoidea, tifus exantemtico, paludismo, neumona, sarampin, meningitis meningococica- se observan a veces aumentos moderados, posiblemente en relacin con una afectacin toxica de pncreas. f) En la insuficiencia renal pueden registrarse aumentos moderados de la amilasemia cuando esta interceptada la excrecin urinaria de la diastasa. La fraccin P3 de la amilasa (isoamilasa P3) es la ms frecuentemente elevada. En estos casos, la amilasuria es negativa. g) La simple inyeccin morfina, codena y otros opiceos puede ocasionar una elevacin, incluso marcada de la amilasemia en individuos sanos o por lo menos sin afeccin pancretica, posiblemente a consecuencia de un espasmo a nivel del esfnter de Oddi(Gross). h) En la insuficiencia cardiaca con uremia extrarenal y trastornos electrolticos. i) En los trastornos del sistema reticuloendotelial con dficit de catabolismo del enzima. j) En la macroamilasemia, una alteracin por polimerizacin o formacin de complejos macromoleculares con IgG, de origen incierto (Horstmann). El gran tamao molecular impide el paso a travs del filtro renal: amilasuria negativa. k) En el embarazo ectpico. l) Incluso en neoplasias pulmonares, ovricas o de colon. 2. Disminucin de la amilasemia: a) En hepatopatas graves.
64 BIOQUMICA ENZIMAS b) En algunos casos de diabetes pancretica con esclerosis de la glndula y en todas las destrucciones masivas del pncreas: por pancreatitis crnica, fibrosis qustica avanzada, pancreatitis aguda fulminante. c) En el mongolismo de modo inconstante. d) En grandes quemaduras. e) En casos de insuficiencia cardiaca congestiva con anasarca. f) A veces en la neumona. g) En la tirotoxicosis severa. h) En la toxemia del embarazo TRIPSINA EN SUERO. Recientemente se ha descrito una tcnica para la determinacin por RIA en el suero de la tripsina inmunorreactiva (SIT). Valores normales: 10-57 ng/ml. 1. Se encuentra elevada: a) En las pancreatitis agudas y en los brotes agudos de las pancreatitis crnicas. b) Inconstantemente en casos de coledocolitiasis e incluso en algunas cirrosis, especialmente alcohlicas. c) En el 50 % de casos de carcinoma pancretico. d) Se ha descrito en la pancreatitis urliana (parotiditis) y en algunas viriasis. e) En los primeros meses o aos de nios con fibrosis qustica (mucoviscidosis). f) En la insuficiencia renal crnica. 2. Disminuye: a) En la pancreatitis crnica avanzada con insuficiencia exocrina. b) En el curso ulterior adolescentes y adultos- de la fibrosis qustica (mucoviscidosis). FOSFATASA ACIDA DEL SUERO (FAc). Normalmente comprendida entre 0.5 y 5 U King-Armstrong, o inferior a 1.5 U Bodansky. En unidades internacionales, la fosfatasa acida total no debe sobrepasar las 11mU/ml y la prosttica 4mU/ml. Por el mtodo de Bessey-Lowry: 0,10-63 U/ml en el varn y 0,01-0,56 U/ml en la mujer. El hecho de que las cifras sean sensiblemente iguales en la mujer y en el varn nos habla a favor de que fisiolgicamente, el origen de esta fosfatasa no sea la prstata, sino el hgado y bazo probablemente. Puede determinarse la fraccin prosttica de la fosfatasa acida por la tcnica de Fihman y Lerner, basada en la inhibicin por en L-tartrato de aquella.
65 BIOQUMICA ENZIMAS Patolgicamente: 1. El hallazgo de cifras elevadas de fosfatasa acida suele darse como un sinnimo de carcinoma de prstata metastatizado (ya que la fosfatasa acida originada en la prstata es vertida en el sano directamente al semen y orina, y no a la sangre), pero tambin los ndulos prostticos malignos, incluso algunos casos de hipertrofia prosttica benigna o de prostatitis, pueden hacerlo aunque con valores ms discretos. Los valores que ya deben indicar sospecha clnica de metstasis son de 3-5 U Bodansky (5-10 U King- Armstrong) y son ya totalmente demostrativas las cifras por enzimas de 5 U Bodansky, o de 10 U King-Armstrong. A veces (en especial en ancianos), a pesar de la existencia de metstasis de origen prosttico, la cifra de fosfatasa acida no esta elevada. En casi todos estos casos, tras 5 das de inyeccin diaria de 25 mg de propionato de testosterona, se comprueba su elevacin. A parte este inters diagnstico, el grado de elevacin de fosfatasa acida y su reduccin o persistencia con el tratamiento constituyen un ndice pronstico, siendo su acenso un signo de progresin de la enfermedad. Conviene sealar que normalmente despus de manipular la prstata por tacto rectal, puede elevarse la fosfatasemia durante 24 horas. Se supone que en estos casos la glndula tiene una estructura celular qustica. Si no aumenta la fosfatasa su textura es probablemente fibrosa. Tambin puede elevarse en la reseccin transuretral y en la biopsia. 2. En enfermedades seas de otro origen pueden registrarse elevaciones de fosfatasa acida: hiperparatiroidismo primario y metstasis carcinomatosas de diversas procedencias o linfomatosas, excepcionalmente en el mieloma y en el granuloma eosinofilo (histiocitos X) si est muy extendido. Tambin en la enfermedad de paget y en la osteopetrosis, el Ca urinario es bajo, hay ligeras elevaciones por actividad osteoclastica (pero es mucho ms alta la F alcalina) y a veces en la osteodistrofia renal, en la ontognesis imperfecta y en la ostetis fibrosa qustica. 3. En la enfermedad de Gaucher y en la de Niemann-Pick, igualmente se comprueban valores altos.
66 BIOQUMICA ENZIMAS 4. Tambin en la embolia pulmonar y en otras lisis plaquetarias (trombosis, trombopenia por destruccin, no por aplasia). As tambin en la hiperplaquetosis (trombositosis y trombositemia). 5. En hemopatas malignas: leucemias mieloides o linfoides o crnicas, de clulas peludas, mielomonociticas. Pero tambin en otras hemopatas: anemia megaloblastica, hemoltica, policitemia, mononucleosis infecciosa.
FOSFATASA ALCALINA DEL SUERO (FAI O ALP) La fosfatasa alcalina del suero procede principalmente de los huesos y tambin en parte del hgado. Aumenta normalmente la fosfatasemia en los periodos del crecimiento y reparacin sea. La cifra media normal de la fosfatasa alcalina es de 1.5 a 5 U Bodansky (4 a 3 U King-Armstrong). Durante el embarazo aumenta la fosfatasemia hasta valores 3 veces superiores a lo normal al final del primer trimestre, normalizndose a las 6 semanas del parto, aunque puede persistir un ligero aumento durante todo el periodo de lactancia. 1. Se registran aumentos de la fosfatasemia alcalina, patolgicos en los siguientes casos: a) En el hiperparatiroidismo primario donde los valores alcanzados son superiores, en algunas ocasiones a 50 o 60 U Bodansky. b) En la ostetis deformante o enfermedad de Paget, donde la fosfatasemia alcanza valores mximos, hasta 200 U Bodansky. c) En distintas neoplasis seas: en el carcinoma osteolitico matastasico inconstantemente y sobre todo en los casos con metstasis hepticas. d) En el cncer de prstata con metstasis seas, aunque aqu predomina especialmente la elevacin de la fosfatasa acida. e) En el mieloma mltiple, solo en algunos casos, casi siempre por amiloidosis heptica secundaria. f) En el raquitismo: ligeros aumentos en los casos leves y mucho mayores -60U Bodansky o ms.
2. Disminucin de la fosfatasemia: ocurre en los siguientes casos: a) En la hipofosfatasia, enfermedad rara de herencia recesiva, consistente en un raquitismo congnito por disfermencia familiar. Aqu la fosfatasa del suero est muy disminuida o ausente totalmente y aumenta la fosfoetanolamina en la orina.
67 BIOQUMICA ENZIMAS b) En el hipotiroidismo infantil, con o sin cretinismo. c) En el escorbuto excepto en la calcificasion de hemorragias. d) En la enfermedad celiaca. e) En la acondroplasia. (Alfonso Balcells 17 ava edicin la clnica y el laboratorio pg.124, 125, 126, 127, 128, 129,130-140) RIBOZIMAS: el ARN como enzima Las ribozimas son molculas de ARN que tienen la capacidad de actuar como catalizadores, es decir, de acelerar reacciones qumicas especficas. Al igual que las enzimas proteicas, poseen un centro activo que se une especficamente a un sustrato y facilita su conversin en un producto. Las ribozimas son menos verstiles que las enzimas proteicas. Anteriormente las protenas se consideraban como las nicas macromolculas biolgicas capaces de funcionar como catalizadores. El descubrimiento de la actividad cataltica del ARN ejerci un impacto profundo en el pensamiento de os bioqumicos. Se han descubierto algunas enzimas como componentes del ARN como la telomerasa y la RNasa P, enzimas que desprenden nucletidos adicionales de los extremos 5 de los precursores de tARN. Ms tarde se demostr que la porcin de ARN RNasa P tiene actividad catablica. El campo del ARN cataltico (las ribozimas) se inici con todo entusiasmo gracias al descubrimiento del ARN que cataliza su propio autoempalme. Es fcil entender la conexin entre este proceso y el empalme del mARN por snRNP. Ms recientemente se han demostrado que los ARN pueden catalizar reacciones que participan en la sntesis proteica. La eficiencia cataltica de los ARN catalticos es inferior al de las enzimas proteicas, y la eficiencia cataltica de los sistemas de ARN que existen en la actualidad mejora notablemente por la presencia de subunidades proteicas adems del ARN. Recordemos que muchas coenzimas importantes incluyen una parte de adenosina fosfato en su estructura. Los compuestos que tienen una importancia tan marcada
68 BIOQUMICA ENZIMAS en el metabolismo sin duda son de origen antiguo, otra evidencia que apoya el concepto de un mundo basado en ARN. Se sabe que existen varios grupos de ribozimas. En las ribozimas del grupo I hay un requisito para una guanosina externa, la cual se enlaza covalentemente con el sitio de empalme en el sitio de la excisin. Un ejemplo es el autoempalme que tiene lugar en el pre-rARN del protozoario Tetrahymena La transesterificacin (de esteres del cido fosfrico) que tiene lugar en este caso libera un extremo del intrn. El extremo 3-OH libre del exn ataca el extremo 5 del otro exn, con lo que provoca el empalme de ambos exones y libera el intrn. El extremo libre 3-OH del intron ataca entonces a un nucletido que se encuentra a distancia de 15 residuos del extremo 5, de tal modo que cicliza el intrn y libera la secuencia terminal 5. La precisin de esta secuencia de reacciones depende de conformacin de pliegues del ARN, que permanecen con sus puentes de hidrogeno internos durante el proceso. In vitro, este ARN cataltico puede actuar muchas veces, y se regenera del modo usual para un catalizador verdadero. Sin embargo, in vivo, solo parece actuar una vez, pues se autoempalma y deja de funcionar. Las ribozimas del grupo II presentan un mecanismo lariat de funcionamiento que es facilitado por el snRNP. No hay requisito de un nucletido externo; el 2-OH de una adenosina interna ataca el fosfato en el sitio del empalme 5. Evidentemente, el ADN no puede actuar al mximo de este modo porque no tiene un grupo OH en 2. El plegamiento del ARN es crucial para su actividad cataltica como ocurre en los catalizadores proteicos. Se requiere un divalente (Mg 2+ o Mn 2+ ); es muy probable que los cierres metlicos estabilicen la estructura plegada y neutralicen algunas de las cargas negativas sobre los grupos fosfato del ARN. Un catin divalente es fundamental para el funcionamiento de las ribozimas ms pequeas que se conocen, llamadas de cabeza de martillo, las cuales pueden tener actividad cataltica con tan solo 43 nucletidos. (El nombre proviene del hecho que sus estructuras se asemejan a la cabeza de un martillo cuando se muestran en representaciones convencionales de estructuras secundarias con puentes de hidrgeno). El plegamiento de ARN es tal que puede efectuarse cambios conformacionales a gran escala con gran precisin. Se realizan cambios similares a gran escala en el ribosoma en la sntesis proteica y en el espliceosoma en el procesamiento ce mARN: observe que an quedan mquinas de ARN cuando las protenas ya llevan a cabo gran parte del funcionamiento cataltico de las clulas. La capacidad del ARN para experimentar los cambios conformacionales necesarios a gran escala quiz desempee algn papel en el proceso. Una aplicacin clnica recientemente propuesta de los ribosomas ha sido sugerida
69 BIOQUMICA ENZIMAS como consecuencia. Si se puede disear un ribosoma que pueda romper el genoma del ARN del VIH, virus que provoca el SIDA esto constituira un gran avance en el tratamiento de esta enfermedad. Varios laboratorios realizan investigaciones sobre el tema.( MARY. K CAMOBELL bioqumica 4 ta edicin pg.314-315) INHIBICIN DE ENZIMAS EN EL TRATAMIENTO DEL SIDA Una estrategia clave en el tratamiento del sndrome de inmunodeficiencia adquirida (SIDA) ha sido el desarrollo de inhibidores especficos que bloquean selectivamente la accin de enzimas exclusivas del virus de inmunodeficiencia humana (VIH), que causa el SIDA. Muchos laboratorios estn explorando este enfoque de desarrollo de agentes teraputicos. Una de las enzimas ms importantes que se ha escogido como blancos es la VIH proteasa, una indispensable para la produccin de nuevas partculas de virus en las clulas infectadas. La VIH proteasa solo se encuentra en este virus, y cataliza el procesamiento de protenas virales en la clula infectada. La VIH proteasa, incluido su sitio activo se determin mediante cristalografa de rayos X. con esta estructura en mente, los cientficos han diseado y sintetizado compuestos que se unen al sitio activo. Se mejor el diseo del medicamento obteniendo las estructuras de una serie de inhibidores que se unen al sitio activo de la VIH proteasa. Dichas estructuras tambin se determinaron con cristalografa de rayos X. en ltima instancia el proceso llevo a varios compuestos que han comercializado diferentes compaas farmacuticas. Estos inhibidores de VIH proteasa incluyen saquinavir de Hoffman-LaRoche, ritonavir de Abbot, indinavir de Merck, viracept Pharmaceuticals. (Estas compaas mantienen pginas bases muy informativas en la World Wide Web).
70 BIOQUMICA ENZIMAS Los tratamientos del SIDA son ms eficaces cuando se usa una combinacin de terapias medicamentosa s y los inhibidores de la VIH proteasa desempean un papel importante. Se obtienen resultados especialmente prometedores cuando los inhibidores de VIH proteasa forman parte de terapias medicamentosas para el SIDA.
71 BIOQUMICA ENZIMAS GLOSARIO Proenzima: Un zimgeno o proenzima es un precursor enzimtico inactivo, es decir, no cataliza ninguna reaccin como hacen las enzimas. Para activarse, necesita de un cambio bioqumico en su estructura que le lleve a conformar un centro activo donde pueda realizar la catlisis. En ese momento, el zimgeno pasa a ser una enzima activa. El cambio bioqumico suele ocurrir en un lisosoma, donde una parte especfica de la enzima precursora se escinde del resto para activarla. La cadena de aminocidos que se libera por la activacin se llama pptido de activacin. Coenzima: Las coenzimas son cofactores orgnicos no proteicos, termoestables, que unidos a una apoenzima constituyen la holoenzima o forma catalticamente activa de la enzima. Tienen en general baja masa molecular (al menos comparada con la apoenzima) y son claves en el mecanismo de catlisis, por ejemplo, aceptando o donando electrones o grupos funcionales, que transportan de un enzima a otro. A diferencia de las enzimas, las coenzimas se modifican durante la reaccin qumica; por ejemplo, el NAD + se reduce a NADH cuando acepta dos electrones (y un protn) y por tanto se agota; cuando el NADH libera sus electrones se recupera el NAD + , que de nuevo puede actuar como coenzima. Holoenzima: Una holoenzima es una enzima que est formada por una protena (apoenzima) y un cofactor, que puede ser un ion o una molcula orgnica compleja unida (grupo prosttico) o no (una coenzima). En resumidas cuentas, es una enzima completa y activada catalticamente. Las apoenzimas son enzimas que carecen de los componentes qumicos apropiados para realizar la actividad cataltica, por ello, se ayudan de otras sustancias no proteicas, denominadas cofactores que, fijadas en su superficie mediante enlaces covalentes o dbiles, le aportan a la enzima los grupos y funciones qumicas que necesita. En estos casos, la parte proteica de la enzima de denomina apoenzima y la fraccin no proteica es el cofactor. Hemoglobina: La hemoglobina es una heteroprotena de la sangre, de masa molecular de 64.000 g/mol (64 kDa), de color rojo caracterstico, que transporta el oxgeno desde los rganos respiratorios hasta los tejidos, el dixido de carbono desde los tejidos hasta los pulmones que lo eliminan
72 BIOQUMICA ENZIMAS y tambin participa en la regulacin de pH de la sangre, en vertebrados y algunos invertebrados. La hemoglobina es una protena de estructura cuaternaria, que consta de cuatro subunidades. Su funcin principal es el transporte de oxgeno. Esta protena hace parte de la familia de las hemoprotenas, ya que posee un grupo hemo Sustrato: un Sustrato es una molcula sobre la que acta una enzima. Las enzimas catalizan reacciones qumicas que involucran al sustrato o los sustratos. El sustrato se une al sitio activo de la enzima, y se forma un complejo enzima-sustrato. El sustrato por accin de la enzima es transformado en producto y es liberado del sitio activo, quedando libre para recibir otro sustrato. Quimotripsina: La Quimotripsina es una enzima digestiva que puede realizar protelisis. La quimotripsina se sintetiza por biosntesis proteica como un precursor denominado quimotripsingeno enzimticamente inactivo. Se rompe por accin de la tripsina en dos partes que permanecen unidas por un enlace S-S, y estas molculas de quimotripsingeno pueden activar a otras eliminando dos pequeos pptidos en una trans-proteolisis. La molcula resultante es una quimotripsina activa, una molcula tripeptdica interconectada por enlaces disulfuro. Apneas: Una apnea es el cese completo de la seal respiratoria (medida por termistor, cnula nasal o neumotacgrafo) de al menos 10 segundos de duracin. Tetrahymena: Los Tetrahymena son un gnero de protozoos ciliados, que se encuentran naturalmente en aguas dulces. Las especies T. termophila y T. pyriformis son ampliamente empleadas como modelos de investigaciones biomdicas
73 BIOQUMICA ENZIMAS BIBLIOGRAFIA:
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