Bibliografa

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2.1 LOS CIDOS NUCLEICOS

Los cidos nucleicos se encuentran
en todas las clulas vivas y en clulas
eucariotas combinados con protenas.
Qumicamente, los cidos nucleicos llamados
as por dar reaccin cida con el agua, son
compuestos enormes con peso molecular de
decenas y cientos de millones.


2.2 CIDO DESOXIRRIBONUCLEICO (DNA)

ESTRUCTURA:

Cada molcula de DNA est
constituida por dos cadenas o bandas
formadas por un elevado nmero de
compuestos qumicos llamados nucletidos.
Estas cadenas forman una especie de
escalera retorcida que se llama doble hlice.
Cada nucletido est formado por tres
unidades: una molcula de azcar llamada
desoxirribosa, un grupo fosfato y uno de los
cuatro posibles compuestos nitrogenados
llamados bases: adenina (A), guanina (G),
timina (T) y citosina (C) ( Fig. 2.1y 2.2).




Fig. 2.1 Estructura de un nucletido.

Las bases de los cidos nucleicos
llamados as, por que dan reaccin alcalina
(bsica) en agua, son molculas cclicas de
complejidad variable, que tienen tomos de
nitrgeno en su estructura anular.

Una base nitrogenada, que puede ser una de
estas cinco:
Adenina
Guanina
Citosina
Timina
Uracilo




Fig. 2.2 Estructuras de las bases
nitrogenadas caracterstica de la molcula de
DNA.

La molcula de la desoxirribosa ocupa
el centro del nucletido y est flanqueada por un
grupo fosfato a un lado y una base al otro. El
grupo fosfato est a su vez unido a la
desoxirribosa del nucletido adyacente de la
cadena. Estas subunidades enlazadas
desoxirribosa-fosfato forman los lados de la
escalera, las bases estn enfrentadas por parejas
mirando hacia el interior, y forman los travesaos
de la doble hlice en forma de escalera de
caracol.
Los nucletidos de cada una de las dos
cadenas que forman el DNA establecen una
asociacin especfica con los correspondientes
de la otra cadena.
Debido a la afinidad qumica entre las
bases, los nucletidos que contienen adenina
se acoplan siempre con los que contienen
timina, y los que contienen citosina con los que
contienen guanina. Las bases complementarias
se unen entre s por enlaces qumicos dbiles
llamados enlaces de hidrgeno.
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En 1953, el bioqumico
estadounidense James Watson y el biofsico
britnico Francis Crick publicaron la primera
descripcin de la estructura del DNA. Su
modelo adquiri tal importancia para
comprender la sntesis proteica, la replicacin
del DNA y las mutaciones, que los cientficos
obtuvieron en 1962 el Premio Nobel de
Medicina por su trabajo (Fig. 2.3 y 2.4)
En las clulas eucariticas, casi
todas las molculas de DNA estn presentes
en el ncleo celular, donde estn combinadas
mediante enlaces inicos con protenas
bsicas llamadas histonas. Adems del
DNA nuclear, las clulas eucariticas
contienen tambin cantidades muy pequeas
de DNA en las mitocondrias y cloroplastos;
se diferencia del DNA nuclear en la
composicin de bases y en el peso
molecular.
El DNA mitocondrial (designado
como mtDNA) posee un peso molecular de
alrededor de 10 millones de pares de bases
representa del 0.1% al 0.2% del DNA celular
total. Los cloroplastos contienen tambin un
tipo distintivo de molcula de DNA pequea.
Muchos virus contienen DNA con un peso
molecular comprendido entre los 2 y los 100
millones, segn la especie viral.





Fig. 2.3 Estructura de la molcula de DNA

Fig. 2. 4 Watson y Crick en 1953 presentando la
estructura del DNA.


2.3 CIDO RIBONUCLEICO (RNA)

ESTRUCTURA:

La existencia del RNA fue postulada en
1961 por los cientficos franceses Francois
Jacob y Jaques Monod. Aunque el RNA (como
el DNA) es una larga macromolcula de cido
nucleico, tiene propiedades muy diferentes. En
primer lugar, el RNA es siempre de cadena
sencilla, no una hlice doble. En segundo
lugar, el RNA contiene en sus nucletidos el
azcar ribosa (de ah su nombre), en lugar de
desoxirribosa. En tercer lugar, el RNA contiene
la base pirimidnica, uracilo en lugar de timina.
No obstante, el uracilo forma puentes de
hidrgeno con la adenina, exactamente como
la timina.


2.4 TIPOS DE RNA

Los cidos ribonuclecos estn
presentes universalmente y combinados con
las protenas en las clulas vivas en forma de
nucleoprotenas. Se presentan en el citoplasma
celular y en menor cantidad en el ncleo. Se ha
reconocido en el citoplasma tres tipos de RNA
de suma importancia por las funciones que
realiza en la sntesis de protenas.

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2.4.1 RNA Mensajero
El ARN mensajero (RNAm) transmite
la informacin gentica desde el ncleo hasta
el citoplasma. En las clulas eucariotas
deriva del transcrito primario de RNA por
corte y empalme, mientras que en las
procariotas se produce directamente por la
transcripcin. Forma el molde sobre el que se
generarn los polipptidos durante la
traduccin, y es una molcula monocatenaria
sin ningn puente de hidrgeno
intramolecular.

2.4.2 RNA de Transferencia
El RNA de transferencia (RNAt):
*Transporta aminocidos especficos
al lugar de la sntesis de protenas.
*Tiene dos sitios activos que le
permiten efectuar sus funciones.
*Es una molcula lineal con un
promedio de 76 nucletidos.
*Presenta un fuerte apareamiento
intramolecular de sus bases, lo que le
confiere una caracterstica estructura en
forma de <<hoja de trbol>> (Fig. 2.5).

Fig. 2.5. Estructura del RNA
t


















2.4.3 RNA ribosmico o ribosomal
El RNA ribosmico (RNA
r
) es un
componente de los ribosomas. En una clula

eucariota, cada ribosoma est formado por dos
subunidades desiguales, constituidas por
protenas y RNA, denominadas subunidad S
(pequea) y L (grande).
Las molculas de RNA experimentan
un amplio apareamiento intramolecular de sus
bases, importante para la determinacin de la
estructura ribosmica. Los ribosomas son
capaces de autoesamblarse en condiciones
fisiolgicas, en presencia de todos sus
componentes

2.5 TOPOLOGA DEL DNA
En el modelo de la estructura de doble
hlice del DNA, en cada una de las cadenas
cada base est girada 36 respecto a las bases
adyacentes de la misma cadena .Por tanto
cada 10 bases la cadena del DNA da una
vuelta completa de 360 , siendo siempre este
giro a la derecha. Estas caractersticas, que
fueron las originalmente descritas por Watson y
Crick, son las que presentan el modelo
estructural del DNA que se conoce como hlice
tipo B . Aunque la doble hlice tipo B es el
modelo de estructura que adopta
mayoritariamente el DNA en el interior de la
clula, existen variaciones de dicha estructura,
en particular en ciertas regiones del DNA, bien
como resultado de la existencia de una
determinada secuencia de bases o por
diferentes condiciones fisiolgicas . Por ello se
acepta que existen familias de estructuras de la
doble hlice del DNA .
Hay descritas cuatro familias de
estructura de doble hlice: DNA A con giro a la
derecha cada 11 pares de bases, el ya
mencionado DNA B con giro a la derecha cada
10 pares de bases, DNA C con giro a la
derecha cada 9.33 pares de bases y el DNA Z
con giro a la izquierda cada 12 pares de bases.
Respecto a la estructura de doble
hlice del DNA, hay que tener en cuenta dos
puntos. En primer lugar, el genoma de ciertos
virus como los papovirus consta tan solo de
una nica cadena de DNA (monocatenario),
por lo que no presenta dicha estructura. En
segundo lugar, aunque el DNA se presenta

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como una hlice lineal, in vivo esto no es as,
ya que en realidad adopta una conformacin
cerrada. En ciertos virus pequeos el DNA
existe como DNA circular de doble hlice. En
los genomas bacterianos y eucariticos, el
DNA se presenta como un lazo o loop muy
largo. Cada loop se mantiene porque los
extremos de las dos cadenas de DNA estn
muy prximos , formando un simulacro de
crculo. Esta organizacin es importante,
pues permite que se de una estructura
adicional, el superenrollamiento, que se
superpone a la doble hlice.

2.6 GENES Y CROMOSOMAS

Un gene es definido como una
porcin del cromosoma que codifica para un
slo componente celular. Los genes
estructurales codifican para polipptidos o
para RNAs. En el caso de los genes de
clulas eucariotas que codifican para
protenas, contemplan todas las secuencias
de DNA requeridas para la sntesis de una
protena funcional, incluyendo los intrones
(los cuales son secuencias no traducidas que
interrumpen las secuencias que codifican
para un polipptido) y regiones que controlan
la transcripcin. Hay otras secuencias
identificables dentro de los cromosomas.
Estas incluyen secuencias regulatorias, las
cuales funcionan como seales para prender
o apagar procesos dependientes de DNA;
secuencias altamente repetitivas de DNA no
codificante que est asociada con
centrmeros y telmeros; y DNA
moderadamente repetitivo el cual est
localizado a lo largo de los cromosomas y no
tiene una funcin conocida.
Los cromosomas eucariticos estn
constituidos de cromatina la cual incluye no
slo DNA sino tambin cantidades
significativas de protenas y pequeas
cantidades de RNA. Las protenas de la
cromatina son histonas, las cuales son
pequeas protenas bsicas. Su estricta
conservacin de la secuencia de

aminocidos entre las especies es un
indicacin de su funcin critica. Las histonas
actan como estructuras alrededor de las
cuales el DNA de doble hlice se enrolla.
Tales molculas constituyen un nucleosoma el
cual es considerado como el primer nivel de
empaque del DNA. Una posterior comprensin
del DNA es llevada a cabo por la formacin de
fibras de 30nm que enrollan a los nucleosomas
dentro de una estructura que asemeja el tallo
de las plantas y que recibe el nombre de
solenoide . Este elaborada estrategia de
compactamiento es necesaria para guardar al
DNA de enorme longitud dentro de la clula
manteniendo una organizacin suficiente como
para permitir el desenrollamiento y
accesibilidad de porciones especficas del
DNA.

2.7 HIDRLISIS DE LOS CIDOS
NUCLEICOS POR CIDOS Y BASES

La hidrlisis suave del DNA con cido
diluido a pH 3.0 determina la separacin
hidroltica selectiva de todas sus bases
purnicas, sin que resulten afectados los
enlaces pirimidina-desoxirribosa ni los enlaces
fotodister del esqueleto. El derivado resultante
del DNA, que carece de bases pricas, se
llama cido apurnico. La eliminacin selectiva
de las bases de pirimidina, que se consigue en
condiciones qumicas algo diferentes, produce
un cido apirimidnico.
El DNA no resulta hidrolizado por
lcalis diluidos, mientras que el RNA si lo es,
debido a los grupos 2-hidroxilo que contiene.
La disolucin diluida de hidrxido de sodio
(NaOH) produce, a partir del RNA, una mezcla
de 2~ y 3-fosfatos de nuclesido. Los
primeros productos de la accin de los lcalis
sobre el ARN son los 2~ y 3-monofosfatos
cclicos, que son intermediarios obligatorios; las
cuales son hidrolizados ulteriormente por el
lcali, que ataca a uno o a los dos enlaces P-
O-C, para rendir una mezcla de 2,3-
monofosfato de nuclesido. El descubrimiento
de este mecanismo explica por qu el DNA no
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se hidroliza por las bases: el DNA no posee
grupos hidroxilo 2, y por ello no puede
formar los 2,3-monofosfatos cclicos
intermedios; estos fosfatos cclicos
nucleosdicos son tambin intermediarios en
la accin de algunas ribonucleasas.

2.8 HIDRLISIS ENZINMTICA DE LOS
CIDOS NUCLEICOS

Los cidos nucleicos ingeridos por
los animales experimentan hidrlisis
enzimtica en el intestino por la accin de
las nucleasas secretadas por el pncreas.
Estos y otros enzimas capaces de hidrolizar
a los cidos nucleicos constituyen
importantes instrumentos para el anlisis de
la secuencia nucleotdica


2.9 DESNATURALIZACIN DEL DNA

Las disoluciones de la forma de
doble hlice del DNA experimentan cambios
significativos en varias de sus propiedades
fsicas cuando se someten a: 1) pHs
extremos, 2) temperatura, 3) disminucin de
la constante dielctrica del medio acuoso por
incorporacin de alcoholes, cetonas, etc., y
4) exposicin a la urea, amidas y otros
solutos similares. La viscosidad de las
disoluciones del DNA disminuye, la absorcin
luminosa a 260nm aumenta, la rotacin
ptica se torna ms negativa y la densidad
de flotacin aumenta. Este cambio fsico del
DNA se denomina desnaturalizacin: ntese
que los agentes desnaturalizantes del DNA
son idnticos a los que inducen la
desnaturalizacin o desplegamiento de las
protenas globulares. Durante la
desnaturalizacin del DNA no se rompen
enlaces covalentes; pero la estructura
duplohelicoidal se desenrolla y se separa.




























































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Problemas


Seale encerrando en un crculo la o las
respuestas correctas segn se indique en la
pregunta.


1.- Son los carbohidratos que forman parte de
los cidos nucleicos :
a) fructosa d) sacarosa
b) glucosa e) desoxiribosa
c) ribosa

2.- Con respecto a las purinas y pirimidinas:
a) son los componentes fundamentales de los
nucletidos, pero no de los nuclesidos.
b) son anillos aromticos planos que
contienen nitrgeno.
c) la adenina y la citosina son ejemplos de
purinas.
d) la guanina y la timina son ejemplos de
pirimidinas.
e) se asocian con azcar, pentosa y un grupo
fosfato para formar nucletidos.

3.- Son bases pirimidcas:
a) A
b) T
c) C
d) G
e) U

4.- Son componentes de un nuclesido:
a) una pentosa
b) una base nitrogenada
c) un aminocido
d) un grupo fosfato

5.- Un nucletido est formado por:
a) fosfato, purina, base nitrogenada
b) fosfato, fructosa, base nitrogenada
c) fosfato, pentosa, base nitrogenada
d) pentosa, base nitrogenada

6.- En un nucletido:
a) la base nitrogenada se une al carbono
1de la pentosa
b) los tomos de carbono de la pentosa
se numeran con un apstrofo
c) la pentosa puede ser ribosa o
desoxirribosa
d) el cido fosfrico se esterifica con el
OH del carbono 5 de la pentosa

7.- En el DNA, las bases nitrogenadas que
forman puentes de hidrgeno entre s son:
a) A-T y C-G
b) A-C y T-G
c) A-G y T-C
d) A-G y T-U

8.- Con respecto a los cidos nucleicos:
a) los virus no contienen cidos nucleicos.
b) en el DNA, la citosina se aparea con la
guanina.
c) en la transcripcin, la adenina del DNA se
aparea con la timina en el RNA.
d) en condiciones fisiolgicas, todo el RNA
forma doble hlice.
e) son polmeros de nucletidos.

9.- En el modelo de doble hlice del DNA
propuesto por Watson y Crick, las dos hebras
del DNA:
a) son antiparalelas
b) se mantienen siempre a la misma
distancia entre si
c) se mantienen unidas tanto por
interacciones covalentes como por
interacciones no covalentes
d) tienen siempre la misma secuencia

10.- En el modelo de doble hlice del DNA
propuesto por Watson y Crick se cumple:
a) A = C
b) G = C
c) A + G = T+C
d) Purinas = pirimidinas

11.- El contenido en G + C del ADN:
a) es el mismo para todos los organismos
b) afecta la temperatura de
desnaturalizacin
c) es igual al contenido en A + T
d) nada de lo anterior es cierto

12.- En la doble hlice del ADN, cada par de
bases:
a) se mantienen unidas por dos puentes
de hidrgeno.
b) se mantienen unidas por tres puentes
de hidrgeno.

Bibliografa
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c) estn girado 36 con respecto al par
anterior.
d) est formado por un nucletido de
purina y un nucletido de
pirimidina .

13.- Cuando se desnaturaliza el DNA:
a) su absorbancia a 260 nm aumenta
b) su absorbancia a 260 nm disminuye
c) se separan las dos hebras
d) la molcula adopta su configuracin
nativa

14.- Una de las siguientes afirmaciones es
falsa:
a) El RNA contiene uracilo, el DNA
contiene timina
b) El RNA es de cadena sencilla, el DNA
es de cadena doble
c) El RNA nunca se encuentra en el
ncleo, el DNA nunca se encuentra
en el citoplasma

15.- Los RNA
m
de las clulas eucariticas
poseen en el extremo 5 un grupo:
a) metil guanosina
b) trifosfato
c) metil citosina
d) una cadena de poli A

16.- El RNA:
a) es el cido nucleico ms abundante
de la clula
b) es qumicamente ms estable que el
DNA
c) se puede purificar con facilidad
d) presenta un grupo OH en posicin
2.

17.- El RNA
t
:
a) presenta bases modificadas
b) puede unirse a aminocidos
c) presenta un plegamiento complejo
d) slo se encuentra en eucariotas

18.- Las dos hebras del DNA de doble hlice
pueden ser separadas por calentamiento si
usted elevara la temperatura de una solucin
que contiene las siguientes tres molculas de
DNA. En qu orden podra usted suponer
que ellas podran separarse? Explique su
respuesta.
a) 5-GCGGGCCAGCCCGAGTGGGTAGCCCAGG-3
3-CGCCCGGTCGGGCTCACCCATCGGGTCC-5

b) 5 - ATTATAAAATATTTAGATACTATATTTACAA-3
3 - TAATATTTTATAAATCTATGATATAAATGTT-5

c) 5 -AGAGCTAGATCGAT-3
3 -TCTCGATCTAGCTA-5


Consultando su bibliografa conteste
correctamente las siguientes preguntas .

19.- Cuales son las principales diferencias
estructurales entre DNA A, B y Z?

20.- a) Escribe la estructura qumica del
tridesoxinucletido: pdAdCdT b) escribe la
estructura qumica del tridesoxinucletido que es
complementario a pdAdCdT

21.- Cuntas clases de RNA conoces y en que
procesos intervienen?

22.- Existen una serie de nucletidos como son
el ATP, el NAD, el FAD, etc. , que tienen alguna
relacin estructural con los constituyentes del
material gentico. estn relacionados estos
compuestos con otros procesos celulares que
no sean de transmisin gentica?

23.- Qu diferencias estructurales y
funcionales existen entre el DNA y el RNA?

24.- Describe en que se diferencian los
nuclesidos de los nucletidos.

25.- Defina el concepto de gene.

26.- Una secuencia regulatoria codifica para un
polipptido?

27.- En que parte del cromosoma eucaritico
se localizan segmentos altamente repetitivos?.
Dnde los segmentos moderadamente
repetitivos?. Cuales son sus funciones?

28.- Si la funcin del Alu es desconocida por
qu es importante mencionarlas?

29.- Cuntas veces es ms largo el genoma
humano comparado con un DNA de tamao
medio de un virus tales como el bacteriofago
lambda ()?

30.- Qu caractersticas de los plsmidos
hacen que sean similares a los cromosomas
bacterianos?en qu difieren?
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Aplicando tus conocimientos sobre los
cidos nucleicos discute lo siguiente.

31.- Hay alguna relacin entre la cantidad de
DNA por clula, o el nmero de cromosomas
por clula y la complejidad relativa de un
organismo?, por qu si? y por qu no?

32.- Basado en tu opinin de la estructura de
la mitocondria, especficamente en el interior
de la membrana, indica por qu algunas
protenas necesarias son codificadas en el
DNA mitocondrial

33.-Es el superenrollamiento del DNA un
proceso al azar?

34.- Cules son las dos funciones celulares
del ADN superenrollado?

35.- El DNA es una molcula cargada
negativamente. Ofrece esto una explicacin
sobre el hecho de que las histonas tienen
altos porcentajes de aminocidos bsicos?

36.- Son las histonas el nico tipo de
protenas asociadas con el DNA en la
cromatina?

37.- Por qu, en general, el DNA bacteriano
es menos condensado que el DNA
eucaritico?

38.- Hay 3.3 billones de pares de bases en el
DNA humano. Si se asume que (1) el
nucleosoma est asociado con DNA de 200
pares de bases y (2) que todo el DNA del
ncleo de las clulas esta asociado a los
nucleosomas, calcule el nmero de
nucleosomas que se podran encontrar en la
cromatina humana.


Bibliografa

Carreo G.V., Castillo, A. I. Principios de
Biologa Molecular. 1 ED.. Springer-Verlag
Ibrica. Barcelona,Espaa (2001) 15-16.

Lehninger A. L.. Bioqumica. 2.ed. Ediciones
Omega, S. A. Barcelona. Espaa. (1991): 876;
886.



Lindquist R.N. Biochemistry . Problems and
Solutions Guide to Accompany Rawn.1a. ed.
Neil Patterson Publishers.Burlington,U.S.A.
(1990) 231-238.

Macurulla J.M., Goi F.M. Biomolculas.
Lecciones de Bioqumica Estructural. Editorial
Revert. Universidad del Pas Vasco. Madrid.
Espaa. (1999).

Manson L. A., Jones E., Morris . Lo esencial en
clula y gentica. 2 ed. Editorial Elsevier.
Madrid. Espaa. (2003): 87; 95; 96-101; 109.

Pea D. A., Arroyo .,Gmez P. A.,Tapia R.
Bioqumica. 2.ed. Mxico. D.F. Editorial
Limusa. (1992): 329-331; 334; 343-348; 352-
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Biologa Celular y Molecular de De Robertis. 3.
ed. Buenos Aires, Argentina. Editorial El Ateneo.
(2001).: 228-235.


Bsqueda en la red

www.arrakis.es/~lluego/anucleicos.thml (es una
pgina en donde se encuentra la mayor
informacin acerca de los cidos nucleicos, as
como esquemas y animaciones).

www.ahu.es/biomoleculas/AN/AN.htm (pgina
acerca de estructura de los cidos nucleicos).

www.biologa.edu.ar/adn/adnestructura.htm
(pgina donde se encuentran estructuras del
DNA).

www.ehu.es/biomoleculas/AN/an3.htm (pgina
donde encontrars estructura del DNA y RNA
en flash)
ltima Revisin 14/11/05

Lecturas Recomendadas

Watson J, Crick F. Molecular Structure of
Nucleic Nature. .(1953) 171:737-738

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Maddox B. The double helix and the
wronged heroine. Nature. .(2003) 421:407
- 408

En ste captulo se incluyen dos
artculos: uno es la publicacin de James
Watson y Francis Crick (1953) sobre la
estructura del DNA. En el segundo Maddox
B. (2003) comenta sobre el papel
fundamental que el trabajo de Rosalind
Franklin tuvo en este descubrimiento.

Bibliografa
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