INTRODUCCION

La expresin de la informacin gentica

contenida en un segmento de DNA siempre
requiere la sntesis de una molcula de RNA.
Durante el proceso de transcripcin , una
enzima, llamada RNA polimerasa, convierte la
informacin gentica de un segmento de DNA en
una hebra de RNA con una secuencia
complementaria a una de las hebras del DNA.

Estructura y propiedades del RNA
El RNA , al igual que el DNA es un polmero
lineal de nucletidos unidos por enlaces
fosfodiester 3',5' , a diferencia del DNA los
nucletidos en el RNA son ribonucletidos, y se
encuentra la base uracilo en lugar de la timina.

La presencia caracterstica en el RNA del grupo
hidroxilo 2' (2'OH) en la ribosa hace que la
molcula de RNA sea ms susceptible a la
hidrlisis
Estructura y propiedades del RNA
El RNA normalmente esta compuesto de una
sola hebra, pero puede formar regiones de doble hlice
intramolecular que le dan una conformacin
tridimensional.
El RNA es la nica molcula que tiene funciones
informacionales y catlticas.

Tipos de RNA

1. RNA mensajero (mRNA), lleva la informacin
que codifican para la secuencia de aminocidos de uno
o ms polipptidos especificados por un gen o conjunto
de genes hacia los ribosomas donde se realiza la sntesis
de las protenas. Tienen una vida media que va de
minutos a horas.
RNA de Transferencia (tRNA), es una molcula
adaptadora que lee la informacin codificada en el
mRNA y transfiere el aminocido apropiado a la cadena
polipeptidica 1. en crecimiento durante la sntesis de
protenas. Tiene una vida media que va de horas a das.

Tipos de RNA
1. RNA ribosomal (rRNA), molculas que asociadas con
protenas forman el ribosoma. Tienen una vida media que
va de horas a das.
2. RNA pequeo del ncleo (snRNA), se encuentran
formando complejos con protenas conocidas partculas
ribonucleoproteicas pequeas del ncleo o "snurps". Estas
se encuentran en el ncleo de las clulas eucarioticas y
participan en el procesamiento de los pre-mRNA.
Tipos de RNA
3. RNA de virus, muchos virus de bacterias, plantas
y mamferos tienen RNA como material gentico.
4. Ribozimas, algunas enzimas tienen RNA como
una parte integral de sus sitios activos. Tambin hay
enzimas que son puro RNA.
TRANSCRIPCION EN
PROCARIONTES
La bacteria E. coli una sola RNA polimerasa es la
responsable de toda la transcripcin que ocurre en
la clula. Tiene las siguientes caractersticas
estructurales y funcionales.
Tiene 6 subunidades funcionales: 2 subunidades
alfa, una subunidad beta, una subunidad beta
prima , la subunidad o factor sigma y una
subunidad omega
Formas de la RNA polimerasa
La enzima ncleo, compuesta de 2 subunidades alfa,
una subunidad beta y una subunidad beta prima. Es capaz
de copiar ambas hebras del DNA pero carece de
especificidad.
La RNA polimerasa holoenzima, es la forma
totalmente funcional de la enzima. Consiste de la enzima
ncleo ms el factor sigma. Tiene especificidad y reconoce
seales especficas de inicio de transcripcin en el DNA
conocidas como regiones promotoras, debido a la
presencia del subunidad o factor sigma que reconoce las
regiones promotoras y que luego de la iniciacin se disocia.
RNA Polimerasa
la sntesis de RNA llevada a cabo por la RNA
polimerasa es semejante a la sntesis del DNA.
sintetiza una hebra de RNA aadiendo unidades de
ribonucletidos al extremo 3' terminal de una
cadena de RNA, construyendo una cadena de RNA
en direccin 5'->3.
Requerimientos de la RNA
polimerasa

Para su actividad la RNA polimerasa requiere:
Un DNA molde
Mg ++ o Mn++
Los cuatro ribonuclesidos trifosfatos (ATP,
GTP,UTP,CTP)

Mecanismo general de la
transcipcion
La RNA polimerasa requiere un DNA de doble
cadena como molde. Sin embargo durante la
transcripcin de un gen en particular, slo una de las
hebras del DNA llamada hebra anti-sentido o hebra
molde (antisense strand) , es copiada a RNA. La hebra
de DNA complementaria a la molde se le llama hebra
con-sentido (sense strand).
Mecanismo II
La direccin de la transcripcin es 5'->3', lo
que significa que la hebra molde es leda en
direccin 3'->5'.
A diferencia de las DNA polimerasas , las
RNA polimerasas no requieren RNA cebadores o
primers.
Durante la transcripcin , la RNA polimerasa
desenrolla parcialmente la doble hlice del DNA.

Mecanismo III
Conforme se mueve a lo largo del DNA
una regin de aproximadamente 17 pares de
bases se mantiene desenrrollada.
Debido a que los nucletidos son
incorporados al RNA teniendo como regla el
apareamiento de bases con la hebra molde del
DNA, se forma un hbrido transitorio DNA-
RNA de 12 pares de bases justo detrs del sitio
de polimerizacin.
Mecanismo IV
Posteriormente , el RNA se libera del molde y las dos
cadenas del DNA se unen.
La RNA polimerasa aade entre 40 - 50
nucletidos por segundo.

PROMOTORES
La sntesis del RNA se inicia en un promotor
PROMOTORES.
Un promotor es una secuencia de DNA a la cual la
RNA polimerasa se une, para posteriormente iniciar la
transcripcin.

Pasos de la Transcripcin
La RNA polimerasa se desliza a travs del DNA
buscando promotores.
Cuando encuentra un promotor migra a la regin -35,
formando lo que se conoce como "complejo cerrado".

Pasos II
Luego el DNA es desenrrollado en
aproximadamente 17 pares de bases formando un
"complejo abierto" que empieza en la regin -10, y
que descubre la hebra molde en el sitio de
iniciacin.
Despus de la iniciacin la subunidad sigma se
disocia de la RNA polimerasa y la enzima ncleo
con el proceso de elongacin de la transcripcin.

Terminacin
1. Terminacin independiente de factor, que
consiste en una secuencia de nucleotidos que
permite la formacin de una region apareada con
forma de alfiler en el mRNA seguida de un tramo
de residuos de uracilo (U).
1. Terminacin dependiente de factor, requiere
de un factor proteico. El sitio de terminacin
llamado rut (el nombre viene de rho utilization) ,
es reconocido por un factor especfico llamado rho.
Transcripcin en eucariontes
Esta compartemenlizada debido a la presencia de la
envoltura nuclear.
El RNA naciente de eucariontes es procesado para
formar el RNA maduro.
RNA Polimerasa II
Es ms compleja que la RNA pol de E. Coli.
Consiste de 10 polipptidos (10 220 kD).
RPB1, RPB2 y RPB3 son esenciales equivalen a las
subunidades beta, beta prima y alfa respectivamente.
RPB4 a la subunidad sigma
RNA Polimerasa II
RPB5, RPB6 y RPB8 son componentes esenciales de
las 3 RNA polimerasas de eucariontes.

RNA pol de Procariontes y Eucariontes. Estructura
conservada de las subunidades grandes
Promotores de Eucariontes
Tienen una caja TATA cerca al sitio de inicio.
Otros elementos adicionales de control estn
localizados entre -40 y 110.
Los promotores fuertes tienen:
- caja CG
- caja CAAT
Promotores: Porcariontes Vs
Eucariontes

Elementos de transcripcin y del promotor para la RNA
polimerasa II
Promotor : secuencia de DNA cuesta arribia del gen
Determina el sitio de inicio (+1) para la transcripcin
Se localiza al lado del sitio de inicio (+1)
Permite la transcripcin basal (bajo nivel)
Elemento de transcripcin (secuencia de DNA que regula el
gen.
Determina la frecuencia o eficiencia de la transcripcin

Elementos de transcripcin y del promotor para la RNA
polimerasa II
Elemento de transcripcin (secuencia de DNA que regula el gen.
Determina la frecuencia o eficiencia de la transcripcin
Ubicado cuesta arriba, cuesta abajo o dentro de los genes.
Puede estar muy cerca o miles de bases aparte del gen.
Incluye:
Intensificadores.- Aumentan la velocidad de transcripcin
Silenciadores: desminuyen la velocidad de transcripcin
Elementos de respuesta (secuencias blanco para moleculas seal.
Los genes pueden tener muchos elementos de transcripcin
Promotores de Eucariontes
Los genes constitutivos tienen tendencia a tener cajas
GC.
Las cajas GC y CAAT son efectivas en las hebras
antisentido.
Elementos de transcripcin y promotores de la RNA
polimerasa II
Complejo de Transcripcin
El ensamblaje de un complejo de trascripcin requiere
de un grupo de protenas llamadas factores de
transcripcin II (TFII):
TFIID un complejo de 700 kD que tiene a la TATA
binding protein (TBP) de 30 kD que se une
directamente a la caja TATA.
Factores asociados a TBP (TAFs) que se unen a la TBP.
Complejo de Transcripcin
La unin del TBP induce una curvatura de 90 grados
en el DNA, quebrando el DNA a ambos lados de la caja
TATA y desenrolla el DNA
TFIIA, TFIIB, TFIIE, TFIIF, TFIIH, TFIIJ se ensamblan
junto con TFIID.
Se requieren factores adicionales para la sntesis de
mRNA en alto nivel

Formacin del Complejo de Iniciacin de la
transcripcin (PIC) en Eucariontes en genes que
codifican para protenas
TFIID se une a la caja TATA
TFIIB se une al complejo TFIID-TATA
El complejo TFIID-TATA ms TFIIB
reclutan a la RNA polimerasa II al
TFIIF, y forman el complejo mnimo de
iniciacin de la transcripcin.
TFIIE and TFIIH se unen y forman el
complejo de iniciacin de la
transcripcin completo (PIC).
El PIC solo permite niveles bajos de
transcripcin.
Los niveles elevados son inducidos por
los factores activadores que se unen a las
secuencias intensificadoras.
La interaccin entre el complejo factor
activador , enhancer y PIC estimulan la
transcripcin.

Unin de los factores
generales de transcripcin
Unin de la RNA polimerasa II
Unin de los fatores de
transcripcin especializados
Formacin de un complejo de
preiniciacin estable
Iniciacin de la transcripcin.
TFIIH fosforila al CTD
Secuencias Intensificadoras
El plegamiento del DNA permite que las protenas
activadoras se unan a secuencias intensificadoras
(secuencias que estn localizadas lejos de los
promotores).
Interactan con TFIID y otras protenas TF y la RNA
polimerasa II
Secuencias Intensificadoras
No tienen actividad promotora.
Pueden estar ubicadas cuesta arriba , cuesta abajo o
dentro del transcrito.
En cualquiera de las 2 hebras del DNA.
Son especficos para cada tejido.