15/09/2014

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Qumica de Protenas
Prof. Edson
Prof. Dr. Edson dos Anjos
Protenas
CARACTERSTICAS
Protena
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Protenas
CARACTERSTICAS
- Protenas simples: possuem apenas resduos de aminocidos e nenhum
outro grupo qumico (enzima ribonuclease).
Responsvel pela degradao do RNA (Rnase)
Classe Grupo Prosttico Exemplo
Lipoprotenas Lipdios
1
-Lipoprotena do sangue
Glicoprotenas Carboidratos Imunoglobulina G
Fosforoprotenas Grupos fosfatos Casena do leite
Hemoprotenas Heme (porfirina Fe) Hemoglobina
Flavoprotenas Flavinanucleotdeos Succinatodesidrogenase
Metaloprotenas
Ferro Ferritina
Zinco lcool desidrogenase
Clcio Calmodulina
Molibdnio Dinitrogenase
Cobre Plastocianina
Protenas
CARACTERSTICAS
- Protenas conjugadas: possuem componentes qumicos permanentes
(grupo prosttico) associados alm dos aminocidos.
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Protenas
CARACTERSTICAS
- Protenas conjugadas: possuem componentes
qumicos permanentes (grupo prosttico) associados
almdos aminocidos.
Classe Grupo Prosttico Exemplo
Lipoprotenas Lipdios
1
-Lipoprotena do sangue
Glicoprotenas Carboidratos Imunoglobulina G
Fosforoprotenas Grupos fosfatos Casena do leite
Hemoprotenas Heme (porfirina Fe) Hemoglobina
Flavoprotenas Flavinanucleotdeos Succinatodesidrogenase
Metaloprotenas
Ferro Ferritina
Zinco lcool desidrogenase
Clcio Calmodulina
Molibdnio Dinitrogenase
Cobre Plastocianina
His
CARACTERSTICAS
Protenas
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Protenas
CARACTERSTICAS
- Protenas conjugadas: possuem componentes qumicos permanentes
(grupo prosttico) associados alm dos aminocidos.
Classe Grupo Prosttico Exemplo
Lipoprotenas Lipdios
1
-Lipoprotena do sangue
Glicoprotenas Carboidratos Imunoglobulina G
Fosforoprotenas Grupos fosfatos Casena do leite
Hemoprotenas Heme (porfirina Fe) Hemoglobina
Flavoprotenas Flavinanucleotdeos Succinatodesidrogenase
Metaloprotenas
Ferro Ferritina
Zinco lcool desidrogenase
Clcio Calmodulina
Molibdnio Dinitrogenase
Cobre Plastocianina
lcool desidrogenase
C H
3
OH C H
3
H
O
C H
3
OH
O
lcool
desidrogenase
aldedo
desidrogenase
(mais txico) (menos txico)
Protenas
CARACTERSTICAS
- As Protenas podem conter mais de uma cadeia polipeptdica associadas
de maneiras no covalente: protenas multissubunitrias;
- Protenas multissubunitrias: podem ser subunidades diferentes ou
idnticas;
- Exemplo: Tubulina (citoesqueleto), uma protena dimrica, ou seja,
contm duas subunidades diferentes, -tubulina e -tubulina;
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Protenas
CARACTERSTICAS
- Protenas Oligomricas: possuem pelo menos 2 unidades (polipeptdeos)
idnticas;
- Essas unidades idnticas em uma protena so chamadas de protmeros;
- A Hemoglobina possui 4 subunidades
polipeptdicas:
> 2 cadeias idnticas;
> 2 cadeias idnticas;
(Dmero de protmeros ou Tetrmero)
Protenas
CARACTERSTICAS
As protenas podem ser classificadas de acordo com a solubilidade:
As Albuminas so protenas solveis em gua que coagulam atravs de
agitao; normalmente so deficientes em glicina. Elas so produtos de
plantas e animais.
Exemplos: albumina de ovo, albumina do soro do sangue, albumina do
leite, legumelina de ervilhas, leucosina de trigo, etc.
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Protenas
CARACTERSTICAS
As protenas podem ser classificadas de acordo com a solubilidade:
As Globulinas so insolveis em gua pura mas so solveis dentro de
solues diluda de sais e so coagulveis pelo calor. So precipitadas em
soluo com sulfato de amnio, geralmente contm glicina e correspondem
a um importante e amplamente distribudo grupo de protenas de animais
e de plantas.
Exemplos: ovoglobulina de gema de
ovo, globulina de soro de sangue, miosina
de msculo, legumina de ervilhas,
araquina de amendoins, etc.
Protenas
CARACTERSTICAS
As protenas podem ser classificadas de acordo com a solubilidade:
Protaminas e Histonas solveis em etanol 70-80%, insolveis em gua
ou etanol absoluto, ricas emArginina.
Exemplos de Protaminas: zena
salmina do esperma de salmo,
ciprinina de esperma de carpa, etc.
Exemplos de Histonas: histonas do
nucleossomo (regulao dos genes).
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Protenas
CARACTERSTICAS
As protenas podem ser classificadas de acordo com a solubilidade:
Prolaminas e Glutelinas insolveis em gua e solveis em cidos e bases
diludos, so encontradas basicamente nos vegetais.
Exemplos de Prolaminas: zena de milho, hordeina e gliadina do trigo, etc.
Exemplos de Glutelinas: glutenina de trigo, orizenina de arroz, etc.
Glutelinas: Protenas do gluten
gladina
glutelina
Gluten: gladina+glutenina
Cys
Van der Waals
Lig. de H
Farinha de trigo e gua
(massa, aps a
fermentao, pode gs e
dar forma caracterstica
aos produtos de
panificao).
Protenas
CARACTERSTICAS
As protenas podem ser classificadas de acordo com a solubilidade:
Escleroprotenas so as menos solveis de todas as protenas. Elas so
geralmente insolveis em gua, solues salinas, cidos e bases diludos e
lcool;
Clulas
Filamento
interm.
Protofibrilas
Protofilamento
Duascadeias
superenoveladas
-hlice
Estruturado cabelo
(-queratinas).
So tipicamente protenas animais, componentes
principais de estruturas externas como cabelo,
crnea, cascos e unhas, alm de outros
tecidos. Ricas em Gly, Ala e Pro.
Exemplos: queratinas de cabelo, da crnea,
elastina de tecido conjuntivo e ligamentos; colgeno
de ossos, cartilagem, e tendes; fibroina da seda.
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Protenas
Estrutura das protenas
Estrutura
primria
(Sequncia
de AAs)
Estrutura
secundria
(enovelamento
tridimensional)
Estrutura terciria
(estrutura
tridimensional, relaes
conformacionais das
cadeias laterais
Estrutura quaternria
(refere-se a estrutura e
as interaes de
associao no covalente
de subunidades
mltiplas).
Resduos de
aminocidos
-hlice Cadeia
polipeptdica
Subunidades
montadas
Protenas
Protenas
Estrutura tridimensional das
protenas
As protenas podem assumir um
nmero ilimitado de conformaes.
Devido rotao livre das ligaes dos
aminocidos que a compem.
Cada protena possui
uma funo qumica ou
estrutural especfica,
sugerindo que cada uma
tenha uma estrutura
tridimensional singular
especfica.
Glicina
Estrutura tridimensional da enzima quimiotripsina,
uma protena globular.
As protenas em
qualquer de suas
estruturas
conformacionais
enoveladas funcionais
so denominadas
protenas nativas.
Protenas
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Protenas
Estrutura tridimensional das protenas
A conformao de uma protena estabilizada em grande parte por
interaes fracas.
A ligao peptdica CN um pouco mais curta que a
ligao CN em uma amina simples (lig. rgida).
Gerao de um pequeno dipolo eltrico
Protenas
Protenas
Estrutura tridimensional das protenas
Aligaopeptdicaplana
- A grandemaioriadasligaespeptdicasestona
forma trans (180
o
) pois nesta conformao, a
cadeia peptdica evita colises estricas
desfavorveisqueaconteceronaconformaocis;
- Por conveno, os ngulos das ligaes
resultantesdasrotaesemC sodenominados
paraaligaoN-C e paraaligaoC C;
- A princpio, e podemter qualquer valor entre
180e+180;
- No entanto, muitos valores so inatingveis por
impedimento estrico entre tomos da estrutura
peptdicaecadeiaslateraisdosaminocidos.
Protenas
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Protenas
Estrutura tridimensional das protenas
Protenas
Protenas
Estrutura tridimensional das protenas
- Quando e so definidos
como sendo 0, esta
conformao impedida em
virtudedasobreposioestrica
entreostomos.
Protenas
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Protenas
Estrutura tridimensional das protenas
A estrutura secundria refere-se conformao
local dealgumaporodeumpolipeptdeo.
Grupos R
projetados
para face
externa da
hlice.
Medida
entre as
unidades
repetitivas
As -hlices so
mais facilmente
formadas devido
as lig. H internas.
Protenas
Protenas
Estrutura tridimensional das protenas
DistinoentreogiroparaaDIRETIA eogiroparaaESQUERDA
Hlice com giro para a
esquerda
(sentido anti-horrio)
Protenas
Hlice com giro para a
direita
(sentido horrio)
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Protenas
Estrutura tridimensional das protenas
A conformao organiza as cadeias
polipeptdicasemfolhas(ziguezague).
Antiparalela Paralela
Vistalateral
Vista
superior
Vista
superior
Vistalateral
Protenas
Protenas
Estrutura tridimensional das protenas
Asdobras socomunsnasprotenas.
Esses so os
elementos de
conexo entre
trechos sucessivos
de -hlices ou
conformaes .
As dobras so as mais comuns
Tipo I so mais
comuns que a
do tipo II.
Tipo II sempre
apresentama Gly
(peq. E mais
flexveis)como
terceiro resduo.
A estrutura uma
dobra de 180 que
envolve 4
resduos de
aminocidos, com
lig. de H.
Protenas
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Protenas
Funes.
A funo da protena depende de sua sequncia de
aminocidos, logo protenas com diferentes funes
possuem sequncias de aminocidos diferentes;
Defeitos na produo de protenas (sequencia de
aminocidos) esto relacionadas as doenas;
Protenas
Anemia Falciforme faz parte de um grupo de doenas genticas
recessivas hereditrias chamadas de hemoglobinopatias. As
hemoglobinopatias podem consistir de variaes estruturais na
hemoglobina.
Protenas
Funes.
Sequencias e aminocidos idnticas podem estar em espcies diferentes:
Ubiquitina (76 aminocidos), responsvel pela regulao e degradao de
protenas;
Protenas
Regulao de protenas (por exemplo
protenas mal-dobradas so marcadas
pelaubiquitina para que sejam
degradadas por proteassomas)
drosfila
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Protenas
Funes.
A sequncia de aminocidos absolutamente fixa ou invarivel para
uma protena em particular?
Protenas
Protenas
Funes.
A sequncia de aminocidos absolutamente fixa ou invarivel para
uma protena em particular?
No. Pois podem existir algumas flexibilidades: 20 a 30 % das protenas
em humanos seja polifrmica (possuem sequncias de aminocidos
variveis na populao);
Porm essas variaes so to pequenas que acabam por no afetar
suas funes.
Protenas
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Protenas
Funes.
As protenas fibrosas so estruturalmente
adaptadas para uma funo.
-hlicedaqueratina
Superenovelamento
deduas cadeias
Protofilamento
Protofibrila
Clulas
Filamento
interm.
Protofibrilas
Protofilamento
Duascadeias
superenoveladas
-hlice
Estrutura do cabelo
(-queratinas).
Protenas
-queratinas
Protenas
Funes.
Clulas
Filamento
interm.
Protofibrilas
Protofilamento
Duascadeias
superenoveladas
-hlice
Estrutura do cabelo
(-queratinas).
Protenas
enrola
Ondulao Permanente
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Protenas
Funes.
Assimcomo as -queratinas o Colgeno uma protena que garante uma
certaresistnciaaotecido;
Encontradonostendes, cartilagens, matriz orgnicadosossoseacrneados
olhos;
A estrutura secundria diferentedahlice: possui sentido anti-horrio e3
resduosdeaminocidospor volta
a) Estrutura secundria da
hlice
b) Modelo do volume atmico
c) 3 hlices juntas
d) A super hlice do colgeno
formada por 3 cadeias
Protenas
Protenas
Funes.
Estruturas das fibras do colgeno: PM:
300.000 u, forma de basto, 3.000 de
comprimento e 15 de largura;
Cada cadeia possui 1.000 resduos de
aminocidos;
Incio damolcula
do colgeno
Seo damolculade
colgeno
Estrias transversais
640 (64nm)
Protenas
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Protenas
Funes.
Fibrona da Seda: produzida por insetos e aracndeos, suas cadeias
polipeptdicasestopredominantementenaconformao.
Cadeialateral deAla Cadeialateral deGly
- A fibronaconsistedecamadasdefolha antiparalelasricas
emresduos deAla eGly, as pequenas cadeias lat. esto em
contato umacomasoutras(empacotamento dasfolhas).
Micrografiaeletrnicacolorizadadas
cadeias de fibrona emergindo de
umaaranha.
Protenas
Protenas
Funes.
Mioglobina: possui um grupo heme, que consiste em uma estrutura
orgnicacclica, aprotoporfirinaligadaaumtomodeFe
2+
.
Estrutura terciria tridimensional
da mioglobina representada em
fita.
Grupo heme, onde uma das ligaes coordenadas
perpendicularesestligadaaotomodenitrognio do
resduo de His. A outra abertae serve como stio
deligao paraumamolcula deO
2
.
Protenas
Protenas Globulares mencionar
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Protenas
Separao e Purificao.
Princpios da
cromatografia em coluna.
Protenas
Protenas
Separao e Purificao.
Cromatografia de troca
inica: explora as diferenas
no sinal e na magnitude das
cargas.
Matriz: polmero sinttico
- grupos aninicos (+)
- grupos catinicos (-)
Protenas
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Protenas
Separao e Purificao.
Cromatografia de excluso por
tamanho: filtrao em gel separa
as protenas de acordo com seu
tamanho.
Matriz: polmero contendo
ligaes cruzadas com poros de
um determinado tamanho.
Protenas
Protenas
Separao e Purificao.
Cromatografia de afinidade:
separa as protenas por suas
especificidades de ligao.
Matriz: ligante anexado
esfera de polmero.
Protenas
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Protenas
Determinao.
As protenas podem ser separadas e
caracterizadas por eletroforese.
Amostras diferentes so aplicadas no
topo do gel de poliacrilamida. As protenas
se movem quando um campo eltrico
aplicado (protenas menores se movem
mais rapidamente).
A visualizao se d com o tratamento
do gel com um corante como o azul
Coomassie.
Protenas
Protenas
Determinao.
Estimativa do PM por espectrometria de massas e determinao de
seqncias.
Protenas
Espectrmetro de massas por
tempo de vo (TOF):
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Protenas
Determinao.
Determinao por RMN.
Espectro de bidimensional (NOE).
Espectro de RMN de
1
H.
Protenas
Protenas
Determinao.
Determinao por cristalografia de
raios X.
Padres de difrao
gerados a partir de
umcristal da
protena.
Os dados so usados para
calcular ummapa de
densidade eletrnica
tridimensional da protena.
As regies de maior
densidade eletrnica
revelama localizao
dos ncleos atmicos.
Estrutura completa
da mioglobina
incluindo o heme.
Protenas
Lisozima