GENMICA Y SU APLICACIN

EN BOVINOS
DR. Remigio Espinosa
Veracruz,
Noviembre 2009
CROMOSOMAS
CLULA
ADN
LOS GENES
CONTIENEN
INSTRUCCIONES
PARA PRODUCIR
PROTENAS
LAS PROTENAS FORMAN LA
ESTRUCTURA DE LA VIDA Y
ACTAN EN FORMA COLECTIVA
PARA DETERMINAR EL
FENOTIPO
GENOMA


El proyecto de secuencia del
ganado bovino fue realizado
con vacas Hereford y tomo 6
aos en analizarse e involucr
a mas de 300 cientficos de
25 pases
ES POSIBLE EN LA GANADERA
LECHERA POR..
3 RAZONES:

1. El banco de datos de genotipo
CDDR
2. La informacin de pruebas de
progenie de mas de 50 aos
3. La capacidad computacional actual,
gran avance tecnolgico








Reproductive status of Holstein and Jersey cows in the United States
H. D. Norman,1 J. R. Wright, S. M. Hubbard, R. H. Miller, and J. L. Hutchison
Animal Improvement Programs Laboratory, Agricultural Research Service, USDA, Beltsville, MD 20705-2350

20 million breedings during >8 million
lactations of >5 million cows in >23,000 herds.
JDS 92:3517-3528

Son evaluados 40,000 marcadores genticos
(SNPs) single nucleotide polymorphism SNIP

Para cada SNP, es estimada la diferencia de
la habilidad predicha de transmisin
(HPT=PTA) entre los animales con un alelo
comparado con otro
La evaluacin Genmica combina el efecto de
os SNP y se estima con el promedio paterno
existente o los PTA de cada animal

Que son las evaluaciones
Genmicas?
Slo los 8 centros originales participantes de
IA tiene permitido someter machos para
genotipo durante los prximos cinco aos!
CRI
Select Sires
Alta
Accelerated
Taurus
ABS
Semex
Contribuidores al CCDR
(Cooperative Dairy DNA Repository)

Pruebas de enero 2009, primera vez que se
publican toros genmicos

El cambio mas grande de la
industria despus del semen
congelado

-Toros con alto Mrito Neto, nunca antes
visto por la industria

PROGRESO DE LA GENMICA
TERMINOLOGA GENTICA ANTERIOR
Habilidad predicha de transmisin (PTA)
y el promedio de los padres (PA)
-PTA- Progenie
-PA- Promedio de los padres

-Genmica- no requiere datos, pero se
adicionan en la prueba

Confiabilidad
-La confiabilidad de PA no poda exceder el
50% por el muestreo al azar de genes de cada
padre
- La genmica puede aumentar el %
GENMICA VS. PTA TRADICIONAL
El genotipo es una fuente de
informacin como los padres, progenie y
registros.
El PTA oficial tendr un indicador si
incluye una contribucin genmica (G)
Un genotipo es utilizado para calcular
las evaluaciones genmicas para los 29
rasgos
Las evaluaciones genmicas
son utilizadas de la misma
manera que el PTA tradicional
Vaquillas Hermanas Completas en el
hato Genesis Moet
Nombre
Toro MN

Vid.
Prod.

Tasa
Pr.
Hijas
Fenotipo
JELL DISON 374 3.3 1.5 **
JILL DISON 374 3.3 1.5 *
JULL DISON 374 3.3 1.5 ****
DEE BUCKEYE 436 1.9 2.1 ***
DOTTY BUCKEYE 436 1.9 2.1 *****
Promedio Padres
LOS RESULTADOS GENMICOS
Nombre
G-MN Dif. G-VP Dif. G-Tipo Dif
JELL 539 165 4.7 1.4 1.1 -0.4
JULL 510 136 4.2 0.9 1.5 0
JILL 329 -45 3 -0.3 1 -0.5
DEE 309 -127 3.5 1.6 1.4 -0.7
DOTTY 85 -351 -1.4 -3.3 1 -1.1
IMPORTANTE!
La Genmica ha cambiado los
programas tradicionales
permitiendo un progreso
gentico mucho ms rpido
ILLUMINA BOVINE SNP 50
GENOTYPING BEADCHIP
Hoy cuesta $225por animal
TOROS CON GENOTIPO ALREDEDOR
DEL MUNDO
desde Enero 2009
Paises Animales
Estados Unidos y Canada 22,344
Francia

8,500
Holanda, Nueva Zelanda 6,000
Nueva Zelanda e Irlanda 4,500
Alemania 3,000
Australia 2,000
Dinamarca, Finlandia, Suecia 2,000
ANIMALES CON
GENOTIPO(n=25,393)
En Estados Unidos hasta Abril 2009
ANIMALES PREDICTORES
RAZA TOROS VACAS Total
Holstein 7,600 2,711 10,311
Jersey 1,807 337 2,144
Pardo Suizo 655 41 696
El Semental perfecto
En Suiza nos muestran la seleccin
GENMICA





http://videoportal.sf.tv/video?id=51bbae2f-
a5f9-461d-8c54-f832020cd866
EFECTO DE LOS SNP PARA
PRODUCCIN DE LECHE
OConnell, 2008
Beltsville \ BARC Beltsville \ BARC Beltsville \ BARC
Show \ Hide Left Navigation : Home : About : Help : Contact Us : En Espaol :
Marker Effects Menu
Marker Effects

Brown Swiss
Holstein or Red & White
Jersey
SNP Marker Effects for Holstein or Red & White

Calculated August 2009

DISEO EXPERIMENTAL
Holstein, Jersey y Pardo Suizo
HOL JER BSW
Predictor:
Toros nac.<2000 4,422 1,149 472
Vacas con datos 947 212 40
Total 5,369 1,361 512
Predicho:
Toros nac. >2000 2,035 388 150
Datos del 2004 utilizados para predecir datos independientes del
2009
PRUEBAS GENMICAS
Toros jvenes de E.U. con cdigo NAAB, Abr. 2009
Ao de
nacimiento
Toros
muestreados
Toros
probados
Probados
Genomica-
mente %
2008* 649 615 95
2007* 1548 1172 76
2006 1726 1118 65
2005 1677 1217 73
2004 1655 991 60
* 2007-2008 conteos incompletos
USOS POTENCIALES PARA LOS PRODUCTORES
Identificacin posibles reemplazos
Animales genticamente superiores
Identificacin de recesivos indeseables
Verificacin de parentesco
Valor aadido a ventas de hembras
Cruzamientos dirigidos, perfil de DNA
complementario

-40
-20
0
20
40
60
80
X 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20 22 24 26 28 30
Chromosome
N
M
$
NM$
SELECCIN
La seleccin genmica de
hembras jvenes ser una
herramienta importantsima
para el ganadero.
El servicio de tipificacin ya se
puede solicitar en algunos pases
Consumo de alimento
Nivel hormonal
Grado de Inmunidad
Cuidado de pezuas
Etc

DE EVALUACIN GENMICA A PRUEBA
CON HIJAS
Los datos de evaluacin genmica se obtuvieron en Enero
y las pruebas con hijas son de Abril 2009
56 Toros
40 hijas en promedio, rango de 10 a 91

CAMBIO
RASGO PROMEDIO MAX MIN

Leche -74 412 -612
Grasa -3 9 -18
Protena -1 11 -15
Vida Productiva -0.5 0.8 -2.0
DPR 0.0 0.7 -0.8
Fac. de Parto 0 1.0 -1.0
PTA TIPO -0.07 0.19 -0.60
$MNV -37 41 -188
MNV CONF. 10 17 1



El Genoma en el Ganado de Carne
Instituciones y Organismos
USDA 35 MILL DE DLARES
Baylor College of Medicine, Houston,
Texas
Instituto Nacional de Salud, Dr. Raynard
Kington
Instituto de Gentica Humana en la
Universidad de Mnchen, Alemania.
Universidad de Washington,
Departamento de Ciencia Animal y
Escuela de Ciencias biolgicas.




El Cromosoma 14
El cromosoma 14 (BTA14) ha sido explorado para distintos locis de
rasgos cuantificables (QTL) y genes de importancia econmica tanto
en ganado de leche como de carne.

En la Universidad de Washington, ms de 40 investigadores
encontraron cerca de 126 QTL para el genoma del ganado de carne.
La mayora encontrados de la regin 15 a la 45 del cromosoma.

Rasgos de importancia econmica:
El Cromosoma 14
Rasgos de importancia econmica:

Ganancia diaria promedio pre-destete
(PrWADG)
Ganancia diaria promedio post-
destete (PoWADG)
Peso al nacimiento (BW)
Peso de la canal (CW)
Espesor de grasa dorsal (BFT)
Marmoleo (BMS)
Promedio de peso corporal (ABW)
Calidad de canal (EQT)
Tasa de crecimiento (GR)
Area del Rib eye (REA)
SmartGene para Carne
Es un proyecto que
proporciona informacin
para la evaluacin gentica
en la industria de carne en
Australia, proporciona
nuevos EBVs e incrementa
la confiabilidad de algunos
valores de cruzamiento.
GRACIAS POR
SU ATENCIN


respinosa@reproduccionanimal.com.mx
Dr. Remigio Espinosa G.