ESCUELA SUPERIOR POLITECNICA DEL CHIMBORAZO

FACULTAD DE SALUD PBLICA

ESCUELA DE MEDICINA

Ensamblaje del ADN

Introduccin

El material gentico de la clula eucariota est organizado en una estructura compleja compuesta
de ADN y protenas localizada en un compartimento especializado, el ncleo. Esta estructura se ha
denominado cromatina (de la palabra griega "khroma", que significa coloreado, y "soma", que
significa cuerpo). En total, dentro de un pequeo ncleo de algunas mm de dimetro nos podemos
encontrar con casi dos metros de ADN. A pesar de este enorme grado de compactacin, el
ADNdebe ser accesible muy rpidamente para permitir su interaccin con las maquinarias
proteicasque regulan las funciones de la cromatina para la:
Replicacin, Reparacin y Recombinacin. Por lo tanto, la organizacin dinmica de la cromatina
tiene influencia, de manera potencial, sobre todas las funciones del genoma. La unidad
fundamental de la cromatina, denominada nucleosoma, est compuesta de ADN e histonas. Esta
estructura es la base del primer nivel de compactacin del ADN en el ncleo. Los nucleosomas se
encuentran separados de manera regular a lo largo del genoma para formar un nucleofilamento
que puede adoptar niveles superiores de compactacin (Fig 1 y 3), resultando finalmente en el
cromosoma metafsico, que representa el nivel mximo de esta compactacin. Dentro del ncleo
en interfase, la cromatina se organiza en territorios funcionales.
La cromatina se ha dividido en:
eucromatina y heterocromatina.
La heterocromatina ha sido definida como una estructura que no altera su nivel de condensacin o
compactacin a lo largo del ciclo celular, mientras que, por el contrario, la eucromatina se
descondensa durante la interfase. La heterocromatina se localiza principalmente en la periferia del
ncleo y la eucromatina en el interior del nucleoplasma. Adems podemos distinguir:
heterocromatina constitutiva, que contiene pocos genes y est formada principalmente por
secuencias repetitivas localizadas en grandes regiones coincidentes con centrmeros y telmeros,
de la heterocromatina facultativa compuesta de regiones transcripcionalmente activas que
pueden adoptar las caractersticas estructurales y funcionales de la heterocromatina, como el
cromosoma X inactivo de mamferos. En esta revisin definiremos los componentes de la
cromatina y esbozaremos los distintos niveles de su organizacin desde el nucleosoma a los
dominios nucleares. Adems, veremos cmo la variacin de los diferentes componentes bsicos
de la cromatina tiene importancia en su actividad y cmo diversos factores pueden afectar a esta
variacin de esta estructura dinmica. Finalmente, resumiremos cmo la cromatina tiene
influencia sobre la organizacin del genoma a nivel del ncleo.

Replicacin del ADN

La digestin o fraccionamiento parcial del ADN que forma parte de la cromatina genera
fragmentos de entre 180 y 200 pares de bases de longitud cuando se observan en una
electroforesis. Esta regularidad en la estructura de la cromatina fue confirmada por microscopa
electrnica, en la que se poda observar una serie de partculas separadas regularmente o
estructura en "cuentas de collar". Los anlisis de masas revelaron una estequiometra ADNhistonas en el nucleosoma de 1/1.

El nucleosoma es la unidad fundamental de la cromatina . Est compuesto de:

una parte central o ncleo (core) y
una regin de unin (o regin internucleosomal) que une partculas core adyacentes (Figura 1).

El core es una estructura muy conservada entre distintas especies y est compuesto de un
segmento de ADN de 146 pares de bases enrollado 1,7 veces alrededor de un octmero de
protenas formado por dos copias de cada una de las histonas H3, H4, H2A y H2B.

La longitud de la regin de unin, sin embargo, vara entre las especies e incluso el tipo celular. En
esta regin tambin se unen diversas histonas de unin. Todo ello hace que la longitud total de
ADN en el nucleosoma vare entre 160 y 241 pares de bases.

Los distintos anlisis han puesto de manifiesto, primero, la distorsin del ADN enrollado alrededor
del octmero de histonas y , segundo, que las interacciones histona/ADN e histona/histona a
travs del "dominio de plegamiento de las histonas" forman una configuracin similar al apretn
de manos. Las histonas del core, H3, H4, H2A y H2B, son protenas pequeas y bsicas muy
conservadas en la evolucin (Figura 2). La regin ms conservada de estas histonas es su dominio
central, compuesto estructuralmente de un "dominio de plegamiento" formado por tres hlices
alfa separadas por dos regiones lazo. Por el contrario, las colas aminoterminales de estas histonas
son ms variables y carentes de estructura comn. Estas colas son particularmente ricas en lisina y
arginina, hacindolas extremadamente bsicas. Esta regin es el lugar de numerosas
modificaciones post-traduccionales que, se ha propuesto, modificaran la carga de la histona,
alterando la accesibilidad del ADN y las interacciones protena/protena con el nucleosoma.

Es interesante hacer notar que otras protenas que interaccionan con el ADN tambin presentan el
"dominio de plegamiento" de las histonas.

A. Estructura de las histonas del nucleosoma.

B. Colas aminoterminales de las histonas del core. Los nmeros indican posicin del aminocido.
Se indican las modificaciones postraduccionales (ac en rojo = lugares de acetilacin ; p en azul =
lugares de fosforilacin ; m verde = lugares de metilacin ; rib prpura = ribosilacin ADP) Las
histonas de unin se asocian con la regin de unin del ADN existente entre dos nucleosomas. A
diferencia de las histonas del core, estas histonas no estn muy conservadas entre las distintas
especies. En los eucariotas superiores estn compuestas de tres dominios: uno central globular y
no polar, esencial para establecer las interacciones con en ADN y dos colas amino y carboxilo
terminales no estructuradas y altamente bsicas, que se cree son el lugar para las distintas
modificaciones post-traduccionales. Las histonas de unin tienen un importante papel en el
espaciado de los nucleosomas y pueden modular la compactacin de orden superior
suministrando una regin de interaccin entre los nucleosomas adyacentes. El ensamblaje del
ADN en la cromatina requiere un gran nmero de acontecimientos, comenzando con la formacin
de la unidad bsica, el nucleosoma, y formando finalmente una organizacin compleja de
dominios especficos dentro del ncleo. La progresin de este ensamblaje se muestra de manera
esquemtica en la Figura 3.
El primer paso consiste en la unin del ADN a un tetrmero de nueva sntesis (H3-H4)2 para
formar una partcula sub-nucleosomal, esto es seguido por la adicin de dos dmeros H2A-H2B.
Esto tiene como resultado la formacin de una partcula core nucleosomal compuesta por 146
pares de bases de ADN enrollado alrededor del octmero de histonas.
Esta partcula core junto con el ADN forman el nucleosoma.
Las histonas de nueva sntesis sufren una serie de modificaciones especficas (por ejemplo, la
acetilacin de la histona H4).
El siguiente paso es la maduracin, que requiere ATP para establecer el patrn regular de
espaciado entre los distintos cores para dar lugar al nucleofilamento. Durante este paso, las
histonas de nueva incorporacin son desacetiladas.
A continuacin, la incorporacin de las histonas de unin se acompaa del plegado del
nucleofilamento para dar lugar a la fibra de 30 nm, estructura que permanece por caracterizar.
Existen dos modelos principales: el modelo del solenoide y el zig-zag.
Finalmente, los sucesivos plegamientos tienen como consecuencia un nivel de organizacin
complejo y la formacin de dominios especficos en el ncleo.

En cada uno de los pasos descritos anteriormente, la modificacin de los componentes bsicos y la
actividad de diversos factores de estimulacin implicados en los procesos de ensamblaje tienen
como resultado la modificacin en la composicin y actividad de la cromatina.

Referencias
http://www.math.toronto.edu/crojas/memoria.pdf
http://geneticafcien.com/genoma_eucariota/Practico_parvovirus.pdf
http://atlasgeneticsoncology.org/Educ/CromatinaSpID30017SS.html