Larticulation science/innovation en France : dix ans daction

publique pour le dveloppement de la gnomique et des

biotechnologies

Anne BRANCIARD

Laboratoire dEconomie et de Sociologie du Travail

35, avenue Jules Ferry 13626 Aix-en-Provence Cedex

2 novembre 1999

Ce papier est extrait du rapport dune recherche Espace dinnovation dans la biologie et
recomposition despaces productifs : analyse des processus institutionnels et politiques en uvre
effectue dans le cadre du Programme CNRS Enjeux conomiques de linnovation .
Il est publi dans la collection CNRS Les Cahiers de linnovation , Cahier n00005/2000.

INTRODUCTION

Les processus de construction des sciences et des techniques en biologie molculaire

et en gntique sinscrivent, dans le contexte socital franais actuel, dans des espaces
productifs auxquels ils sont articuls par l'innovation, via les biotechnologies. Cette recherche
a t axe en priorit sur le secteur biomdical, en particulier sur l'innovation en thrapie
gnique. Elle s'appuie sur l'hypothse que les recompositions de ces espaces productifs
accompagnent des redfinitions dans les productions et diffusions de connaissances dans le
tissu conomique et social ; des changements dans les pratiques scientifiques et les structures
locales de recherche ; ainsi que des volutions dans les institutions et rfrentiels politiques,
lies la construction de nouveaux acteurs.
L'laboration des savoirs et des pratiques scientifiques est en effet insre dans un
contexte conomique et social, dont les conditions d'efficacit en France pour articuler le
systme de recherche et le systme d'innovation ont fait l'objet de notre tude sur la dcennie
1985-1996, phase de mise en place des trajectoires de la biologie molculaire contemporaine
et de ses applications biomdicales et biotechnologiques.
Les biotechnologies1 reprsentent un cas-type de technologie gnrique fort contenu
scientifique, qui diffuse transversalement au sein d'une grande partie de l'appareil productif.
La matrise de leur dveloppement constitue donc un fort enjeu national de comptitivit
internationale2.
Plusieurs caractristiques se conjuguent actuellement pour dsigner leur volution :
- la ncessit d'une combinaison multidisciplinaire de corps de savoirs et de
comptences
- la modification dans la manire de produire de la science biologique (automatisation,
informatisation), qui conduit une codification mthodique croissante (catalogues) des
lments biologiques, permettant de rpondre des demandes spcifies. On est en effet dans
une phase de rendements croissants des savoirs biotechnologiques, o les nouveaux savoirs ne
se substituent pas aux anciens, mais s'y combinent en les systmatisant.
- la proximit importante entre les connaissances fondamentales et une large gamme
d'applications innovantes de type industriel (agrochimique ou pharmaceutique) ou pour
l'environnement, qui se rvlent progressivement. Les biotechnologies sont en effet
enracines dans le milieu acadmique, et diffusent dans le milieu industriel, elles constituent
donc une frange entre un monde dont la logique devrait tre de maintenir la diversit, et un
monde dont la logique est la standardisation. Sur un plan conomique, la systmatisation des
1 Au sens de l'utilisation de molcules ou d'organismes vivants pour des technologies applications industrielles et/ou la
mise au point de technologies ddies l'tude du vivant.
2 Ce secteur est en effet l'un des plus crateurs d'emploi (6 % de croissance annuelle, selon le Livre Blanc "Croissance,
comptitivit, emploi" de la Commission Europenne, 1993), et il reprsente 9 % de la valeur ajoute brute de la
Communaut, soit environ 45 milliards d'Ecus, et occupe 8 % de la main d'uvre, soit environ 9 millions de personnes.

connaissances biologiques peut la fois permettre des zones d'offre trs spcialises de se
dvelopper, gnralement partir du milieu acadmique, et des groupes industriels
recherchant des rendements d'chelle d'homogniser leur production.
Cette tension entre une tendance la standardisation et un maintien de la
diversification est gre par les modalits de rencontre entre des dispositifs d'action publique
et des configurations d'acteurs constitues de laboratoires, d'universits, d'quipements, et
d'entreprises, qui peuvent tre inscrites dans des rseaux ou dans des espaces localiss.
Des questions nouvelles se posent donc en terme d'organisation et d'orientation de la
recherche scientifique et du systme d'innovation, et de la place des politiques publiques et
des diffrentes institutions dans ces mutations.
L'analyse socitale du LEST, qui apprhende les mcanismes ou processus par
lesquels se construisent des cohrences socitales (Maurice, Sellier, Silvestre, 1982),
reprsente un socle partir duquel cerner les dimensions de la dynamique de l'innovation.
L'innovation, dans cette approche, est conue comme un ensemble complexe de processus
divers : organisationnels, relationnels, d'apprentissage, de transfert de savoirs et de savoirfaire. La dmarche socitale est celle d'une endognisation de l'innovation, par rapport
notamment une exognit des rgles d'encadrement et de la dynamique conomique
mondialise, impliquant la mobilisation de ressources spcifiques. L'analyse socitale partage
donc avec les dveloppements rcents en conomie de l'innovation la conception d'un
processus d'innovation saisi comme processus d'apprentissage.
Ce cadre conceptuel (qui nest pas exclusif) permet d'intgrer dans la notion
d'apprentissage les relations des units de production de recherche et d'innovation
(laboratoires de recherche ou entreprises) leur "environnement" socital, cadre susceptible
d'tre confront au concept de "systme national d'innovation" (en particulier selon Lundwall,
1992, qui fait de l'innovation un processus socialement encastr dans une construction
institutionnelle spcifique). Dans l'analyse socitale de l'innovation (Maurice et al., 1993),
convergent sur ce point avec des travaux d'Amendola et Gaffard, les "ressources gnriques"
issues du systme acadmique deviennent des "actifs spcifiques" (acteurs) en fonction de
leur champ d'inscription, et leur efficacit conomique dpend des combinaisons productives
dans lesquelles ils oprent, de leurs configurations de relations, et de leur insertion dans un
apprentissage collectif. A la fois vecteurs et rsultats de la dynamique d'innovation, ils sont
galement, par l'interdpendance de leur processus de socialisation et de leurs formes
particulires de structuration organisationnelle, porteurs d'irrversibilits propres chaque
pays, traduisant la faon dont les units de recherche et de production sont encastres dans des
"espaces d'innovation".
L'espace d'innovation est ainsi un construit social gnr par les interdpendances
entre des acteurs relevant de diffrents "espaces" (espaces scientifique et technique, espace
ducatif, espace industriel et du march) qui participent au processus d'innovation. Il intgre
transversalement les diffrents niveaux (micro, mso, macro) de la socit dans laquelle il se
situe, ce qui renvoie aux formes de construction d'acteurs. Il s'agit donc d'une approche
globale qui ncessite diffrents niveaux d'observation et d'analyse, sans se rduire aucun de
ceux-ci.
Ce papier est concentr sur les modalits et les consquences des interactions entre les
dispositifs d'action publique mis en place pour articuler science et innovation en sciences du
vivant, et les configurations d'acteurs porteuses des logiques d'interdpendance scientifique et

technique, tudies sur une premire priode 1985 - 1996. Nous montrons que cette dcennie,
en dpit de son apparente inefficacit dans le couplage science/innovation, a t nanmoins
porteuse des pr-requis pour une nouvelle politique scientifique et technique de meilleure
intgration entre recherche publique, prive, et industrie, dont la mise en place d'un espace
localis d'innovation en gnomique Evry constitue un exemple.
La figure suivante (fig. 1) schmatise la construction d'un "espace d'innovation"
partir d'un nouvel espace scientifique et technique en biologie.

Figure 1

Action publique

Dimension organisationnelle
Dimension cognitive
Espace S&T

Dimension professionnelle

Espace
industriel

Espace d'innovation

Valeurs sociales

March

On fait lhypothse que la construction de cet espace dinnovation est la rsultante

de plusieurs lments :
lmergence en France dun nouveau modle darticulation recherche/innovation
la trajectoire des politiques publiques scientifiques et technologiques suivies ces
dix dernires annes (1985-1996) dans le domaine de la biologie.

I LEMERGENCE DUN MODELE IDEAL-TYPIQUE DE PRODUCTION

DE CONNAISSANCES ET DIMBRICATION SCIENCE/INNOVATION

1. 1. Origine du modle
La biologie molculaire s'est constitue dans un espace transnational, mais son essor
est li au rle majeur jou par les Etats-Unis, et aux investissements importants attribus par
leurs organismes d'Etat son dveloppement, en relais des crdits apports antrieurement par
des organismes privs comme l'Institut Californien de technologie (Caltech) ou la Fondation
Rockefeller (Morange, 1995).
Avec le dveloppement du gnie gntique la fin des annes 70, la biologie
molculaire contemporaine prend un virage vers une technicisation de la science et vers un
dveloppement de ses applications. La majorit des projets et des investissements sont
concentrs aux Etats-Unis. La croissance acclre de ce domaine techno-scientifique
amplifie alors des caractristiques dj existantes du dveloppement des sciences aprs la
seconde guerre mondiale. Celui-ci a t initi par une refonte des activits industrielles (et
militaires) autour des sciences et de l'appareil d'Etat (Pestre, 1997). Ensuite, les volutions
conomiques et la fin de la guerre froide ont impuls un relatif dsengagement des Etats des
activits conomiques et techno-scientifiques, variable selon les contextes socitaux. La
comptition sur les marchs ouverts est devenue un critre primordial de l'action politique et
conomique.
A cette mutation politique, a correspondu une extension des pratiques de la science
connectes des espaces productifs valorisation conomique et/ou sociale, et une
interpntration croissante entre la recherche de "connaissances objectives" (i.e. la production
de savoirs acadmiques prsents comme "socialement neutres") et la recherche d'efficacit.
Cette volution induit un phnomne d'hybridation entre les activits scientifiques,
techniques, industrielles, et financires, selon des modalits de production des connaissances
particulires, qui sont illustres emblmatiquement par la Silicon Valley.

1. 2. Description du modle
L'mergence de ce "nouveau" rgime de production des savoirs a t dcrit par des
auteurs anglo-saxons dans un ouvrage dit par Gibbons, "The new production of knowledge,
the dynamics of science and research in contemporary societies" (Gibbons et al, 1994), dans
des termes porteurs de connotations positives par rapport aux enjeux d'action politique, de
dynamique conomique, et de dveloppement de la science. Il a t rig en modle,
dnomm dans la littrature acadmique "modle de la Triple Hlice", avanc notamment par
des auteurs amricain et hollandais, Etzkowitz et Leydesdorff (1997).
Dans ce modle, la localisation de ce qui volue dsormais vers une "co-production"
de connaissances se situerait l'intersection de trois sphres institutionnelles qui interagissent,
l'Universit et les organismes de recherche, l'industrie, et les pouvoirs publics. L'objectif de
cette mise en relation des structures de recherche acadmique avec l'industrie est de

dvelopper des capacits de recherche et un transfert l'industrie sur des savoirs

conomiquement pertinents, en intgrant les infrastructures de production de savoirs dans les
systmes d'innovation.
L'hypothse sous-jacente d'une telle approche est que dsormais, la dynamique
conomique est fonde sur le dveloppement de connaissances gnriques, qui diffusent
transversalement dans une grande part de l'appareil productif, et dont sont issus les nouvelles
technologies de l'information et de la communication, les biotechnologies, les nouveaux
matriaux, etc..., secteurs qui prfigurent selon certains historiens des sciences (Caron),
l'mergence d'un nouveau systme technique au XXIme sicle.
Dans ce schma, les interventions des pouvoirs publics devraient alors tendre
favoriser une spirale vertueuse entre les multiples liens de rseaux transversaux qui se
rvlent aux diffrentes tapes du processus d'innovation. En formulant des politiques et des
programmes encourageant les alliances stratgiques entre entreprises et organisations de
recherche, la cration de firmes "spin off", l'implantation de structures de R&D transcendant
les frontires traditionnelles institutionnelles (public/priv, acadmique/appliqu etc...), la
fondation de ples scientifiques et industriels au niveau local,... ces interventions publiques
s'inscriraient dans une logique d'accumulation organise des connaissances et de cration de
capacits d'innovation.
Il sagit donc l du modle acadmique anglo-saxon de la relation
science/innovation.
1. 3. Transfert du modle : dification en systme normatif et rinterprtation
selon les contextes socitaux spcifiques chaque pays
Les discours lis ce modle sont articuls des pratiques de production de la
recherche en expansion, mais qui sont lies au contexte socital des Etats-Unis 3. Ces pratiques
sont difies en systme normatif partir des reprsentations communes que sen font les
diffrents acteurs. Ce modle se diffuse largement au travers des logiques d'interdpendance
scientifiques et techniques, des rapports d'expertise et des actions programmatiques,
principalement de la Commission Europenne. Mais il est aussi mobilis par les acteurs
institutionnels, pour structurer les reprsentations des diffrents acteurs de la recherche et de
l'innovation, selon une appropriation diffrencie selon les pays europens.
On peut reconnatre avec D. Pestre que le rgime de production des savoirs propos
par ce modle, s'il est devenu massivement dominant dans les pays technologiquement les
plus avancs, n'est effectivement pas nouveau puisqu'il reprend son compte l'intrication
historiquement tisse de la science et des systmes de pratiques dployes dans des espaces
conomiques et sociaux plus larges. Mais si la question thorique de ce modle est la mme,
le modle science/innovation est reconfigur, puisqu'on observe une configuration d'acteurs
immergs dans une multiplicit de rseaux socio-techniques, complexes et htrognes, des
systmes localiss d'organisation entre intervenants territoriaux et dcentraliss de lEtat, des
logiques d'action enchevtres...

3 Et qui posent question sur leur transfrabilit dans d'autres contextes institutionnels...

1. 4. Les enjeux de lappropriation du modle

1.4.1. La construction de nouveaux rfrents de laction publique
Ce modle idal-typique a des effets concrets en terme de production politique et
sociale. En France, il agit concrtement en venant percuter le modle colbertiste du couplage
science/innovation, mais il ne s'y substitue pas, les chevauchements produisent des effets de
composition...
Les reprsentations de ce modle alimentent une rhtorique ministrielle, et
construisent en effet de nouveaux rfrents socio-cognitifs communs de l'action publique, en
tant que repres pour des modes d'action qui devraient tre renouvels, et qui tiennent compte
de la diversification des lieux de production des savoirs.
1.4.2. La qualification des produits de la recherche comme bien public ou
comme bien priv
La littrature consacre ces dix dernires annes l'conomie de la science et de
l'innovation met en effet l'accent sur l'importance des institutions dans l'interaction entre
enseignement suprieur, recherche publique et prive, structures de financement et
d'intermdiation entre recherche et production de biens ou de services.
Avec l'mergence des modles soulignant les interactions entre les diffrents lieux de
production scientifique et technique, dont le "Chain link model" propos par Kline et
Rosenberg (1986), elle met galement en cause la sparation entre recherche fondamentale et
recherche applique, et l'existence d'une relation causale, dans un schma linaire, entre
dcouvertes scientifiques, R&D industrielle, et march.
Enfin, les critres de partage a priori entre recherche publique et recherche prive
ont t critiqus par plusieurs auteurs. Notamment, M.Callon (1994) montre que les
investissements publics pour la production scientifique se justifient, non en raison d'une
caractristique intrinsque de la science comme bien public, mais pour conserver celle-ci un
degr de diversit et de flexibilit permettant terme de laisser ouvert un plus grand ventail
des possibles.
Ainsi les configurations institutionnelles qui mettent en place la relation
science/innovation seraient optimales quand elles permettent dassurer, par leurs choix de
mcanismes dincitation dans un systme dinnovation, un quilibre entre diffrenciation et
irrversibilits, conduisant un niveau optimal de surplus social.
Le rle de l'industrie est en effet de plus en plus prgnant dans la production et la
diffusion des connaissances sur l'insertion de matriel gntique dans des organismes vivants,
et dans les redfinitions des formes d'articulation entre sphre publique et sphre marchande
qui se jouent dans les recompositions en cours. L'industrie s'implique en effet dans la
production de connaissances en amont (la recherche fondamentale, et non plus seulement les
outils techniques, mme si celle-ci est largement externalise dans les petites entreprises de
biotechnologie) pour, en aval, contrler l'extension des marchs, sur une large gamme
d'applications qui passe par une monte en gnralisation de l'appropriation d'organismes
vivants comme facteur de production (brevets). Les caractristiques intrinsques de la
technique, par sa possibilit de concrtisation dans des artfacts, permettent juridiquement
cette appropriation. Cette participation ascendante de l'industrie joue sur les orientations de la
recherche scientifique vers un interventionnisme rentable. Elle rvle l'imprgnation

croissante de la connaissance (production socitale) par la technique, et la convergence (par

les orientations, les programmes, les personnels) des institutions publiques de recherche et des
firmes prives. Elle assigne aux outils du gnie gntique et aux rsultats du squenage un
usage prescrit par des stratgies de valorisation et de marchandisation des produits issus de la
recherche.
Cette imbrication de lindustrie dans la recherche alimente lapparition dune
controverse. Selon la thse contestataire, alors que linstrumentation du gnie gntique
pourrait tre dveloppe avec une variabilit et une capacit s'inscrire dans diffrents
contextes de pratiques, ouvrant des perspectives pour rsoudre des problmes majeurs au
niveau mondial (par exemple invention de nouveaux vaccins plus efficaces, ou production
industrielle partir du matriel gntique des animaux ou des plantes "d'aliments
synthtiques" pouvant contribuer rsorber la malnutrition), le choix des options techniques
guid par la logique industrielle rduirait l'ventail des dveloppements techniques et
scientifiques possibles, en les slectionnant selon leur rentabilit immdiate. Le risque est
alors que, au lieu d'tre source de diversit et d'largissement de l'univers des possibles, la
science biologique pntre par une logique technicienne "path dependant" (la distinction
originelle entre production de connaissances et application technique finalise tendant
s'effacer) et imbrique avec une volution technologique cumulative et crant des
irrversibilits, tende alors devenir, avec la redfinition des articulations public/priv,
davantage un "bien priv", amputant son bnfice conomique et social potentiel.
1.4.3. Le dplacement des frontires public/priv dans la production de
larticulation science/innovation
De plus en plus, le march ou les acteurs privs viendraient concurrencer les
institutions publiques dans les choix et les orientations des "applications" de la recherche
publique, dans la mise en uvre et l'usage des dispositifs d'action publique. Cet largissement
de la configuration d'acteurs htrognes s'accompagnerait d'un effacement des frontires
entre sphre publique et sphre prive. Mais ce constat dune dhirarchisation des acteurs, et
d'un enchevtrement des rationalits est nuancer, et ne peut masquer le fait que les pouvoirs
publics en France restent structurants, puisque ce sont encore des mesures d'action publique
qui mettent en place une liaison de plus en plus organique, de formes varies, entre universits
et organismes de recherche, entreprises, et capital financier, et qu'elles signifient une
extension du champ du rfrentiel d'action publique dans les politiques scientifiques et
technologiques.

II L'ACTION PUBLIQUE POUR LE

GNOMIQUE ET DES BIOTECHNOLOGIES

DVELOPPEMENT

DE

LA

En 1985, le lancement aux Etats-Unis du projet de squenage du Gnome Humain

(qui deviendra en 1988 le Programme international HUGO) suscite en France des polmiques,
et met en relief les clivages dans la communaut scientifique entre gntique mdicale et ce
qui deviendra la "gnomique", et dans la gnomique entre partisans du squenage du gnome
humain (au dbut fort peu nombreux) ou de gnomes d'organismes modles.
Pour articuler les avances scientifiques avec un dveloppement des biotechnologies,
la jonction des organismes de recherche avec l'industrie doit tre poursuivie. Plus
globalement, les incertitudes lies un champ nouveau, quant aux connaissances, aux
techniques, la gestion des donnes, aux financements, aux questions thiques et "politiques",
doivent tre rduites par des modes d'organisation collective et des initiatives institutionnelles.
Les pouvoirs publics vont donc lancer une srie d'actions, qui sont autant de mcanismes
d'incitation et de tentatives de coordination, produisant des effets contradictoires.

2. 1. Des mcanismes d'incitation et de coordination institutionnels segments,

mais imbriquant public et priv.
2.1.1. Les fondements de la constitution d'un espace scientifique et technique
2.1.1.1. La coordination de l'action publique avec la recherche prive associative :
une impulsion dcisive pour la cration d'un nouveau champ techno- scientifique, la
"gnomique"
Une collaboration public/priv : Le CEPH et l'mergence d'un domaine scientifique
sur le gnome en France
Le Centre dEtudes sur le Polymorphisme Humain tait un laboratoire de statut priv,
dfinissant ses propres rgles de fonctionnement et de recrutement de son personnel. Financ
au dpart par les fonds d'une fondation, son directeur Jean Dausset (Prix Nobel) obtint
ensuite, partir de 1988 avec son collaborateur Daniel Cohen, professeur de mdecine, une
ligne budgtaire directe du Ministre de la Recherche (H. Curien). Ce financement de 18
millions de francs reconduits chaque anne et reprsentant la moiti de son budget permit au
CEPH d'acqurir des quipements trs modernes, et d'initier des programmes de grande
ampleur. L'INSERM collabora galement en mettant disposition trois postes. En 1989, sur
ces fonds publics, le CEPH s'engage sur d'autres thmes de recherche sur le gnome humain,
avec des projets de cartographie physique et de squenage, sur lesquels les quipes des
organismes de recherche publics n'taient pas prsentes.

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L'intervention d'une nouvelle forme de mobilisation de la recherche, l'action de

l'AFM.
L'Association Franaise contre les Myopathies (AFM) est une association caritative de
malades et parents de malades, fonde en 1958 pour la gurison des maladies
neuromusculaires hrditaires, qui touchent environ 30.000 personnes en France. L'activit de
l'AFM couvre trois ples : Collecte et gestion, Aide la personne, et Actions de recherche.
En 1987, l'AFM, aprs une priode d'apprentissage, constatant la relative carence de
l'Etat sur les recherches sur les maladies gntiques, dcide de les soutenir financirement. A
partir de 1988, sa politique scientifique couvre tout le spectre des orientations depuis la
recherche clinique jusqu' la recherche gntique, en passant par la recherche thrapeutique,
combinant long terme et court terme, exploration et exploitation, donc toute activit
susceptible de contribuer la mise au point de traitements. Dans un premier temps, son action
est limite des appels doffre gnraux qui mettent en contact des quipes de recherche
susceptibles de contribuer ses objectifs. Aprs le premier Tlthon, l'AFM oprationnalise sa
stratgie dans deux espaces diffrents, une structure propre de recherche (le Gnthon), et des
quipes de laboratoires du CNRS et de l'INSERM subventionnes sur appels d'offres ou hors
appels d'offres, ces deux espaces ayant des zones de recoupement.
L'action associative a donc tent de fdrer des efforts d'origine diverse, et de
mobiliser la recherche et la R&D pour mutualiser les diffrents apports, afin d'atteindre in fine
les objectifs spcifiques de l'Association. A ct d'un "noyau dur" d'quipes acquises ces
objectifs par une convergence entre leurs objets de recherche et les axes stratgiques de
l'AFM, et qui concentre les financements, l'intervention de l'AFM a permis aux laboratoires
soutenus d'tre plus productifs sur des questions ponctuellement en phase avec ses priorits,
mais n'a pas inflchi significativement leurs thmatiques, essentiellement orientes vers la
recherche fondamentale. Ce faisant, elle a pos plus gnralement les principaux paramtres
significatifs d'un nouvel espace S&T.
Allies par une convergence dintrts, les actions conjugues du CEPH et de l'AFM
ont cr un domaine scientifique de la gnomique en France, dans un contexte localis
multidimensionnel. Leur sollicitation des pouvoirs publics pour susciter une dynamique par
des lancements de programmes scientifiques ou techniques mobilisateurs, ont prennis cette
existence, et bauch les principales dimensions d'un espace scientifique et technique
nouveau, rendant possibles des interventions complmentaires des pouvoirs publics, des
organismes publics et privs de recherche, des industries, des institutions hospitalires.
Quels taient alors les engagements de l'Etat, l'nonc de ses objectifs, les structures
et procdures mises en place pour monter en gnralit et affirmer une stratgie nationale
dans le domaine de la gnomique, et mettre en oeuvre une politique publique et ses
instruments de coordination ncessaires, en dgageant les moyens consquents ?
2.1.1.2. Les instruments de coordination entre organismes publics de recherche
2.1.1.2.1. L'entre de la France dans le Programme Gnme.
Contexte et conditions de l'action publique : une communaut scientifique divise.
Une partition de la communaut scientifique des biologistes s'opre en deux
configurations autour de rfrents diffrencis, correspondant une vision de la science

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comme productive de connaissances acadmiques versus la science comme productive de

valeurs d'usage conomiques ou appliques. Ces discours sont articuls des pratiques
infres par des logiques d'action, et qui se dploient dans des espaces sociaux parallles,
mais souvent inclusifs.
Face au projet Gnome, la communaut scientifique franaise est plus particulirement
traverse de profondes divergences entre organismes publics, fondations prives et
associations, entre le CEPH et ses adversaires critiques sur la qualit de ses rsultats, entre les
partisans de l'tude des gnomes et les gnticiens mdicaux, sans toutefois que les lignes de
clivage recouvrent les frontires des organismes.
L'appel l'expertise et une dcision ministrielle sans suite
Charg dtudier lopportunit dentrer dans le Programme Gnme international, le
directeur de l'INSERM dlgua Ph.Kourilsky, biologiste l'Institut Pasteur, la charge
d'tablir un projet, aprs consultation des milieux concerns. Rendu en juillet 90, le rapport
tablissait les bnfices scientifiques, technologiques, conomiques, commerciaux et de
formation attendre d'un tel projet.
Le 17 octobre 1990, le Programme National Gnome Humain est annonc
officiellement en Conseil des Ministres, sous forme d'un projet cohrent et quilibr, proche
du rapport Kourilsky, et prvoyant aussi d'organiser la distribution des ractifs, la formation
des personnels, et la valorisation des rsultats. Ce programme devait tre orient et gr par
un GIP et bnficier d'un financement spcifique de 50 MF en 1991, 100 MF en 1992,
relativement comparable aux investissements amricains et britanniques. Cet "effet
d'annonce", suivi d'une mission exploratoire confie un scientifique membre du dpartement
Biologie, Mdecine, Sant du Ministre de la Recherche et de la Technologie (MRT), n'a dans
un premier temps eu aucune concrtisation.
2.1.1.2.2. La fondation du Groupement de Recherches et d'Etudes sur les Gnomes
[GREG]
Pendant ces trois annes d'atermoiements politiques, les effets des programmes dans
les autres pays en lice se sont rapidement fait sentir, en particulier dans le domaine de la
cartographie physique, o la recherche anglo-saxonne a pris une avance dcisive, susceptible
de se propager dans l'analyse d'autres gnomes. En France, c'est la recherche prive du CEPH
et de l'AFM qui apparaissait au plan mondial. Dbut 1992, le Ministre H.Curien charge le
biologiste Piotr Slonimski, coordonnateur du consortium europen du gnome de la levure,
donc non engag dans un des camps en prsence, de reprendre le dossier, et le GREG est cr
in extremis, avant le changement gouvernemental en janvier 1993, pour une dure de six ans,
avec une dotation de 67 MF., et une formule GIP assurant la structure une certaine
autonomie par rapport au ministre, et autorisant en thorie la participation de partenaires de
recherche publics, privs, et d'entreprises.
2.1.1.2.3. Les formes d'intervention du GREG.
En tant qu'institution mise en place par les pouvoirs publics, le GREG a exerc ses
deux attributions, la rpartition de ressources publiques, et la production de formes
d'encadrement de l'activit scientifique et technique.

12

L'essentiel de l'action du GREG, au cours de ses annes de fonctionnement, a t plus

modeste que les missions affiches et a consist en grande partie lancer et grer des appels
d'offres publics. Sur les trois appels d'offres, la priorit devait tre donne aux projets
rsultant du regroupement ou de la collaboration de plusieurs quipes, de faon structurer la
communaut. Pour le squenage, le GREG n'a pris en compte que les projets manant de
consortia, de faon viter les travaux redondants.
L'effort de structuration et de coordination de la communaut de recherche en
gnomique a port sur le dveloppement d'avances technologiques dans le domaine de
l'analyse systmatique de l'ADN et des gnomes (automatisation, identification, marquage,
sparation . . .) ; sur la mise en place de services bioinformatiques dont la recherche sur les
gnomes est totalement dpendante ; et sur des actions de formation pour amliorer le niveau
de comptence des partenaires du GREG en bioinformatique et crer des chercheurs double
spcialit, informatique et gntique.
2.1.1.2.4. L'interruption du GREG et le lancement d'Actions Concertes Coordonnes
dans les Sciences du Vivant (ACC-SV).
A la fin de 1994, le GREG se trouvait dans une situation critique, ignorant le montant
de son budget pour lanne suivante. 1995 constitue ds lors un tournant dans l'histoire du
GREG, qui voit redfinis la fois ses missions et ses moyens. Le souci du ministre (qui avait
entre-temps subi un changement de majorit lectorale)4 fut rapidement d'entreprendre une
action volontariste de rquilibrage des priorits en faveur des gnomes d'intrt conomique,
qui constituaient une part rduite des projets financs par le GREG.
De fait, le GREG se voit retirer ses comptences en matire de gnome humain, de
gntique mdicale et de bioinformatique, et appliquer une rduction budgtaire drastique en
ce sens (80 MF d'AP et 70 MF de CP en 1994, 22 et 30 [dont 8 en mesures nouvelles] en
1995). Bien qu'il ait eu une action gnralement reconnue dans la communaut sinon de
structuration du milieu, du moins de contribution forte la dlimitation d'une communaut
scientifique largement transdisciplinaire (cf. infra), le GREG, sans qu'il y ait eu de vritable
procdure d'valuation publique, se voit ainsi au bout de deux annes de rel fonctionnement
vid de sa substance (et priv des moyens correspondant sa fonction) et subit une mise en
sommeil jusqu' son arrt de dissolution du 29 octobre 1996. En lieu et place, le Ministre de
lEnseignement Suprieur et de la Recherche MESR (Fillon) a dcid de consacrer 257 MF
des 500 MF de sa ligne budgtaire spcifique pour les Sciences du Vivant (le reste allant
lANRS) un Plan stratgique de soutien et de dveloppement des recherches sur les sciences
du vivant. Puis il a lanc la hte (un mois et demi de prparation des appels doffres et un
mois de dlai de retour) une procdure de 14 ACC-SV (Actions Concertes Coordonnes Sciences du Vivant) le 10 avril 1995, dont trois concernaient explicitement la gntique, une
la bioinformatique et une les biotechnologies, chacune dote dun Comit Scientifique et
Technique de 15 experts. Bien que 400 projets aient t retenus pour une subvention sur deux
ans, ces actions, qualifies d'"action-croupion" par certains, ne seront pas poursuivies l'anne
suivante.

4 Ministre Bayrou, avec E. Dufourcq Secrtaire d'Etat la Recherche.

13

2.1.1.2.5. Vers une relle politique scientifique du gnome ?

A la suite des Assises de la Recherche de 1993, il avait t plaid au Cabinet
Ministriel l'opportunit de crer un grand Comit de Politique des Sciences du Vivant. Projet
combattu par l'INSERM, qui ne dboucha donc pas sur la mise en place d'une structure, mais
bien sur l'inscription d'une ligne budgtaire ministrielle annuelle. Dbut 1995, le Ministre
nomme un Comit d'experts avec pour mission d'engager une rflexion sur la cration
ventuelle d'un centre franais de trs grand squenage, qui soit mme de concentrer
suffisamment de moyens et de savoir-faire pour :
- produire grande vitesse des donnes sur les squences de diffrents gnomes
choisis pour leur intrt sur le plan fondamental, mdical ou biotechnologique.
- amliorer les stratgies de squenages en tablissant tous les liens souhaitables avec
l'industrie.
Il s'agissait pour ce Comit de mesurer aussi prcisment que possible les
consquences pour la recherche et pour l'industrie franaises qu'auraient l'absence ou les
dlais d'mergence d'une telle infrastructure, dans un contexte international o les groupes de
Saint-Louis (E-U) et de Cambridge (G-B) proposaient un consortium international de
dterminer la squence complte du gnome humain d'ici 2001.
Le rapport d'expertise, rendu en 1995 au secrtaire d'Etat F.d'Aubert, est donc
favorable la cration d'un "centre multi-polaire de squenage en masse", mais il est enterr.
Il faut attendre les alas d'un changement ministriel, a priori peu clment au maintien de
projets conus sous une prcdente majorit, pour qu'il resurgisse. Le Comit Interministriel
de la Recherche Scientifique et Technique d'octobre 1996 cre, avec l'approbation du Premier
Ministre Jupp, le Centre National de Squenage (CNS), dot pour dix ans d'un budget de
80MF par an par le MENRT. Grand quipement collectif, il a pour mission, sur un statut de
GIP dcid ultrieurement, de participer au programme mondial de squenage du gnme
humain et de gnmes modles, sur programme propre, et sur activit de service sous forme
de collaborations avec des quipes acadmiques (slectionnes sur appel doffre annuel) et
des entreprises prives. Aprs de nombreuses ngociations, le CNS ne sera implant que fin
1997, sur Evry, o sige lAFM.
Cette cration constitue le premier jalon d'une volution dans la politique scientifique
et technologique de la gnomique, (voir tableau Rcapitulatif chronologique) par un vritable
engagement des pouvoirs publics. Mais le projet reste marqu par les caractristiques du
modle franais : centralisation et concentration des ressources sur une seule cible
technologique escomptant une meilleure intgration et un meilleur transfert de comptences 5,
ouverture des activits de services du centre en aval aux grands industriels (BSN,
Pasteur/Mrieux, Rhne Poulenc Rorer, Limagrain, Biosem . . .) pour mettre leur disposition
les squences "intressantes" pour leur comptitivit, financement tatique, correspondant la
dimension "politique" du programme. La mise en place de conditions permettant des
externalits positives ne viendra que deux ans plus tard, avec l'implantation de la Gnopole
d'Evry.

5 Alors qu'en Allemagne, le choix inverse a t fait, suscitant la cration de petits centres, souvent de droit priv, d'une
capacit annuelle de l'ordre du mgabase. Et que en Grande-Bretagne, le Sanger Center est financ privativement par le
Wellcome Trust raison de 400 Millions de F pour 5 ans.

15

Tableau 1 : Rcapitulatif chronologique

ANNE
1984

MINISTRES CHARGS DE LA RECHERCHE

Hubert CURIEN
MRT

1985
1986

Alain DEVAQUET

1987

Recherche et ES
Jacques VALADE
MEN, charg de

1988

Recherche et ES
Hubert CURIEN
MRT

1993

CRATION DE STRUTURES

PROGRAMMES CNRS

1983-90
Programme mobilisateur sur biotechnologies
FRT/MRT/CNRS
ATP tous les 2 ans

PCRD EUROPEN ET PROGRAMMES INTERNATIONAUX

1982-1986 Programme Biomolecular Engineering

Programme EUREKA europen

1986-1990 Programme Biotechnologies

MEN, charg de

1989
1990

1991
1992

PROGRAMMES MINISTRIELS

Programme Gnome MRT

AO 1988-89

Programme HUGO
Programme PIR IMABIO

Hubert CURIEN
Hubert CURIEN
et
Franois FILLON

MRT
Ministre recherche
Espace
Ministre E.S. et

Programme National Gnme humain

Cration de Gnthon par l'AFM

AO MRT/AFM
Programme Bio Avenir MR/MI (1992-1997)

Cration du GIP GREG

ATIPE Sciences de la vie 19901994

Programme PIR ULTIMATECH
Programme GENEXPRESS
CNRS/AFM/Gnthon (financement
CE)

1990-1994 3me PCRD

Programmes RDT Biotechnologies
Biomed

Contrat cadre MR/AFM sur thrapie gnique

Recherche
1994

4me PCRD
Programmes RDT Biotechnologies
Biomed 2

Mars 1995

Mai 1995

Novembre 1995

Franois BAYROU
Ministre EN*, ES**,
et
Recherche
Elisabeth DUFOURCQ SE Recherche
Franois BAYROU
Ministre EN, ES, et

Plan sratgique de dveloppement des

Sciences du Vivant ACC-SV 1995-97
- Plan d'action gntique
- Dveloppement des biotechnologies
Plan gnme/sant MESR/Ministre Sant
AO Centres d'application et rseau de
dveloppement des thrapies gniques

Recherche
Franois d'AUBERT SE Recherche
1996

Juin 1997

Mission interministrielle Biotechnologies

AO 1996-2000
Programme "Squenage du gnme" MESR
Claude ALLEGRE

MENRT

Cration du Centre National de

Squenage (CNS) Projet de Centre
National de Gnotypage (CNG)
Implantation du CNS Evry

Programme gnme humain DSV

16
Source : Anne Branciard

*EN : Education Nationale, **ES : Enseignement suprieur

17

2.1.2. L'ouverture de l'espace scientifique et technique sur des besoins de la

socit

Le document "Biologie 1990 - Enjeux et problmatiques" (1987) fixait la recherche

biologique quatre enjeux majeurs pour la socit : la sant, l'agro-alimentaire, l'utilisation des
micro-organismes, et l'environnement. Le rapport d'activit 1988 du Dpartement des
Sciences de la Vie du CNRS prcise que la politique scientifique doit tendre :
- utiliser les connaissances pour contribuer amliorer le bien-tre physiologique,
mental et sociologique des hommes. Le DSV a notamment pour mission de promouvoir ses
acquis en milieu mdical et chez des responsables de la sant publique, des fins de
prvention des maladies et de contrle des environnements.
- apporter son savoir-faire aux partenaires socio-conomiques, notamment dans le
domaine du matriel scientifique et biomdical, des industries alimentaires, des bio-industries
et du mdicament.
Face ces rquisits vis vis de la recherche scientifique, on peut examiner les
modalits et les obstacles de l'ouverture de l'espace scientifique et technique de la gnomique
au secteur mdical et au secteur industriel, ces deux derniers tant interconnects par les
biotechnologies.
2.1.2.1. La coordination entre recherche fondamentale, recherche pr-clinique et
recherche clinique : la science pour des applications biomdicales
L'accs au gnome humain marque une profonde rupture possible de la pratique
mdicale et du paradigme de recherche pharmaceutique. Les progrs acclrs de la gntique
molculaire, grce des approches semi-industrielles et robotises visant la multiplication
des marqueurs gnotypiques (les micro-satellites sont passs de 0 en 1989 plus de 5000 en
1994), grce au squenage systmatique des ADN complmentaires, et la localisation
rgionale des EST (Expressed Sequences Tags), ont d'importantes consquences pratiques sur
la recherche biomdicale et ses applications pharmaceutiques et thrapeutiques : ils
bouleversent le diagnostic des maladies hrditaires ; ils modifient les schmas classiques de
la comprhension des maladies acquises ; ils ouvrent enfin la voie de nouvelles stratgies
thrapeutiques, de transfert de gnes ex vivo ou in vivo, communment appeles l'"ADN
mdicament".
2.1.2.2. La conception des mdicaments, les biothrapeutiques et les ajustements des
stratgies de l'industrie pharmaceutique
Les marqueurs du gnome permettent le diagnostic prcoce des maladies (tests
gntiques6), le pronostic, et le dveloppement de la pharmacognomique. L'exploration du
gnome humain est un raccourci pour l'industrie pharmaceutique, l'inventaire des gnes
constituant une porte d'entre pour choisir ensuite tel ou tel axe de recherche pour de
nouvelles cibles.
L'enjeu le plus important de l'industrie pharmaceutique est en effet la conception de
nouvelles molcules actives. A l'empirisme et au criblage au hasard de milliers de molcules,
6 Dont le march mondial tait valu 80 milliards de F en 1996

18

tend se substituer un processus d'innovation invers, une approche conduisant la

conception de structures molculaires qui interagissent d'une manire aussi slective que
possible (activation ou inhibition) avec une cible pralablement caractrise.
La place de la biologie devient prpondrante en amont et en aval de l'ensemble des
processus conduisant l'laboration d'une molcule active. La pharmacologie deviendra alors
terme un sous-produit des recherches des biologistes, des structuralistes et des chimistes
organiciens. Face cette volution considrable, l'industrie pharmaceutique doit modifier ses
stratgies pour intgrer les mthodes et les avances des biotechnologies : d'o des formes de
partenariat multiples entre petites entreprises de recherche biotechnologique ou structures de
recherche et des firmes industrielles qui se regroupent et se restructurent au niveau mondial
(leur nombre de brevets actifs tant en diminution) pour prendre en charge l'innovation, i.e les
diffrentes tapes du dveloppement de l'invention d'un nouveau mdicament, des essais prcliniques et cliniques jusqu' la mise sur le march.
Ct amont, sur les quinze dernires annes, un tiers des mdicaments dcouverts
l'ont t partir de l'identification de cibles dans le gnome. Ceci explique que quelques
milliers de gnes soient en attente de brevets aux Etats-Unis et que plusieurs milliers de
brevets aient dj t accords.
Ct aval, les biothrapeutiques se basent sur une action directe au niveau des
processus biologiques fondamentaux par des substances identiques ou voisines de la nature.
Les enjeux conomiques sont considrables, les estimations des industriels pour le seul
domaine des cytokines portant sur un march mondial de 3 mds de dollars en 1997.
2.1.2.3. La difficile mise en relation de l'espace S&T avec l'espace industriel
2.1.2.3.1. L'impact de l'encadrement institutionnel dans la relation science/industrie
La difficult de la construction d'un espace d'intgration entre la recherche scientifique
et l'industrie rside en premier lieu dans les incertitudes de l'encadrement juridique et
institutionnel qui prside cette mise en relation, donc la structuration du systme
d'innovation ; en second lieu dans une singularit dans l'environnement europen des
dispositifs institutionnels franais s'appliquant la recherche biomdicale, l'un et l'autre de ces
lments pouvant constituer des prjudices l'volution de la structure industrielle franaise,
dans un contexte de comptitivit internationale.
L'volution du systme des droits de proprit intellectuelle sur les squences
gntiques et sur les inventions biotechnologiques
L'analyse conomique accorde au systme de protection intellectuelle, dont les brevets
sont jusqu' prsent l'une des formes essentielles, un rle conomique majeur de rgulation
dans le processus d'innovation, et le considre donc comme un facteur de comptitivit
internationale.
L'organisation d'interactions plus fortes entre la recherche publique et l'industrie pose
le problme de la protection juridique des inventions biotechnologiques, et de la
brevetabilit des lments et des produits du corps humain, puisque ceux-ci constituent,
pour le moment, la source essentielle de "matire premire" pour la recherche et l'industrie
biomdicales.

19

La pratique amricaine, et prsent europenne, pour rpondre l'exigence de

description de la fonction nouvelle de la squence gntique revendique comme "invention",
est d'anticiper au maximum et de demander la protection de la gamme la plus large possible
d'applications potentielles.
La lgislation europenne a entrin les principes tablis par l'volution des pratiques
techniques de l'Office Europen des Brevets (OEB), puisque la proposition de directive de
1988 concernant la protection juridique des inventions biotechnologiques, rejete en 1995 par
le Parlement Europen, a finalement t adopte le 12 mai 1998 et publie le 30 juillet 1998.
Elle stipule, en effet, que :
- La connaissance de la structure totale ou partielle d'un gne humain, en tant que
telle, n'est pas brevetable.
- En revanche, "un lment isol du corps humain ou autrement produit par un
procd technique, y compris la squence ou la squence partielle d'un gne, peut constituer
une invention brevetable, mme si la structure de cet lment est identique un lment
naturel" (art. 5 modifi). Mais, par ailleurs, "la fonction d'une squence ou d'une squence
partielle d'un gne doit tre concrtement expose dans la demande de brevet".
Au-del de l'harmonisation des lois et pratiques des tats membres afin de parvenir
une protection cohrente et efficace au sein de l'Union Europenne, l'objectif explicite de la
directive est bien de maintenir et d'encourager les investissements dans le domaine des
biotechnologies. Cet objectif s'appuie sur deux arguments conformes la doctrine
prpondrante dans les pays industrialiss :
- la science et la technique, dans un contexte de globalisation, doivent tre au
service de la comptitivit internationale, et donc les avances doivent tre protges en
matire de proprit intellectuelle pour favoriser les investissements
- le niveau de la recherche industrielle, et des interactions entre la recherche
publique et l'industrie, doit augmenter de faon significative.
Le droit des brevets europen s'homognise donc, par glissements successifs, dans le
sens d'un droit technicien et utilitariste qui permet une imbrication plus forte de la recherche
et de l'industrie. Actuellement environ 1000 gnes associs des maladies ont t brevets
dans le monde.
Le problme du statut des procds et des produits de thrapie gnique et les obstacles
au dveloppement de l'industrie biomdicale en France
En France, il subsiste l'heure actuelle une incertitude sur le statut appliquer selon
les produits de thrapie gnique. Cette dfinition des objets est importante pour la rpartition
des pouvoirs de ngociation, et les modes de coordination entre acteurs de recherche,
tablissements de sant et industries. L'incertitude sur la valorisation (encore tout fait
hypothtique) de ces produits, et les conditions de partage des rsultats des inventions
scientifiques peuvent jouer comme facteur contre-incitatif du dveloppement industriel.
Cette incertitude sur les modes de coordination et les jeux coopratifs mettre en
place en R/D a amen les entreprises industrielles dans le monde diversifier leurs stratgies.
Pour conclure sur l'impact du cadre juridique sur la relation science/industrie en
France, le secteur de la recherche biomdicale en thrapie gnique est trs rglement et
administr, les essais cliniques sont trs encadrs, mais subsiste une incertitude sur le statut de
commercialisation du produit final. Le droit actuel de proprit intellectuelle dlite de plus en
plus la distinction entre invention et dcouverte pour gommer les spcificits des
biotechnologies, dans un processus d'homognisation du droit des brevets, adapt

20

l'volution conomique, et permettant une imbrication plus forte de la recherche et de

l'industrie. On peut interprter cette volution comme s'inscrivant dans un mouvement
mondial d'extension de l'appropriation de l'immatriel.
Les dispositifs actuels tendent effacer les frontires entre recherche
fondamentale/recherche clinique/applications industrielles. La coopration entre
tablissements de recherche et de sant/entreprises de biotechnologies/industries
pharmaceutiques devient incontournable en thrapie gnique.
Cependant, les incitations conomiques de l'action publique en France semblent, sur le
priode tudie, avoir t trop tardives et faibles pour encourager cette coopration en
suscitant la cration de petites entreprises franaises, et la rglementation est reste trop
pesante pour favoriser les recherches publiques sur cette thmatique thrapeutique, et la
diffusion de cette pratique innovante.
2.1.2.3.2. Les tentatives de partenariat des organismes publics de recherche avec la
recherche industrielle
Entre 1983 et 1988, un programme intgr (Programme mobilisateur sur les
biotechnologies) est dvelopp par le Fonds de la Recherche et de la Technologie (FRT) du
Ministre de l'Industrie, le Ministre de la Recherche, le CNRS (dpartement SDV, Chimie,
SPI, la DVAR et le PIRSEM), avec un objectif double :
- encourager les chercheurs envisager, et le cas chant dvelopper, les
consquences de leurs travaux applicables court terme, sous forme de retombes
technologiques.
- uvrer au dveloppement des recherches fondamentales en amont des
biotechnologies, en particulier favoriser les collaborations interdisciplinaires entre
laboratoires.
Il s'agissait donc de favoriser l'applicabilit des recherches, de faon mieux articuler
recherche scientifique et cration de technologies pour la recherche publique ou industrielle 7
et susciter ensuite l'mergence de petites entreprises de biotechnologies.
En fait, ce programme dclin sous forme d'ATP de deux ans, a reu un faible
financement, qui est all en dcroissant (10 MF pour 2 ans en 1983 ; 2,4 MF en 1988), et a eu
une faible diffusion (de 13 27 contrats par an).
Le rapprochement de la recherche avec l'industrie s'inscrit, quant aux objectifs, dans
les axes prioritaires des organismes publics de recherche, et quant aux ralisations, dans un
certain nombre d'actions de programmation :
- Des programmes interdisciplinaires de recherche (PIR), auxquels participent
plusieurs dpartements du CNRS, et qui dveloppent des interfaces avec l'industrie. Le DSV
consacre ces programmes interdisciplinaires la moiti de son budget d'actions propres.
- Un programme ATIPE (Actions thmatiques incitatives sur programmes et quipes)
des Sciences de la Vie a pour objet de mettre les bourses du priv au service de la recherche
publique, en mobilisant de jeunes quipes sur des thmes de recherche intressant l'industrie.
Entre 1990 et 1994, les ATIPE ont conduit la constitution de 32 jeunes quipes au
DSV/CNRS.
7 Le Programme comprenait cinq volets :
- Micro-organismes d'intrt industriel, agricole ou mdical
- Gnie enzymatique
- vecteurs
- Application des sondes gntiques au diagnostic et au pronostic en mdecine
- Valorisation des biotechnologies pour l'industrie (DVAR).

21

- Le partenariat des organismes publics de recherche avec l'industrie se traduit aussi

dans la fondation d'units mixtes (6 pour le DSV entre 1986 et 1992).
- Enfin, lanc par le Ministre de la Recherche (H. Curien), le Programme Bioavenir
(1992-1997) a t l'origine prsent comme un modle de coordination entre recherche
publique et prive, par son ampleur, sa dure, et sa vocation large. Soutenu par les pouvoirs
publics (Ministres de la Recherche et de l'Industrie), ce grand programme a fait collaborer
les principaux organismes de recherche publique, CEA, CNRS, INRA, INSERM, Institut
Pasteur, Universit, et un industriel, Rhne-Poulenc. Avec un budget de 1,6 mdF (soit 1md de
Rhne-Poulenc et 610 MF des Ministres - 410 MF du MENRT et 200 du MEFI - ou 1,8
mdF si l'on inclut les apports financiers des EPST), il avait pour objectif d'assurer la
mobilisation des comptences et des moyens l'interface des sciences du vivant et de la
chimie, renforcer les collaborations, pour acclrer le transfert des connaissances entre la
recherche fondamentale et la recherche applique ou industrielle ; mais plus spcifiquement,
pour Rhne-Poulenc, investir, trs en amont, sur la recherche fondamentale, identifier et
caractriser des cibles biologiques nouvelles en tirant parti des acquis les plus rcents de la
biologie molculaire et de la gntique, et adopter une conception rationnelle dans
l'laboration de nouvelles molcules actives, en "faisant merger les comptences ncessaires
pour lever les verrous technologiques identifis".
2.1.2.3.3. La mobilisation de l'industrie autour des dispositifs de l'AFM
Le recentrage de l'action de l'AFM sur la thrapie gnique exige que l'association se
dote d'un aval industriel, capable de susciter un march pour rendre viable le dveloppement
sur une grande chelle de ces thrapies. L'AFM s'appuie sur une double stratgie. D'une part,
elle conclut des accords de coordination avec des firmes de biotechnologies, organisant ex
ante des actions concertes pour gnrer de l'innovation, en mettant en relation des actifs
spcifiques complmentaires (l'AFM contrlant les gnes des malades). Pour les industriels,
l'apport des Associations de malades constitue une incitation s'engager dans le champ de la
thrapie gnique, par la prise en charge d'investissements longs et coteux, par le couplage
troit avec les cliniciens et la mise en oeuvre thrapeutique (la coopration des malades), par
la coordination des actifs complmentaires pour assembler des savoirs et savoir-faire
diversifis (mise en place d'une base technologique, coordination des centres de recherche en
vectorologie et des centres de thrapie gnique . . .), qui permettront ensuite un transfert par
les entreprises des comptences acquises pour investir les marchs de masse esprs.
Par ailleurs, l'AFM cherche agir sur les pouvoirs publics pour que ceux-ci attirent
des comptences industrielles susceptibles de crer un environnement favorable l'impulsion
des thrapies gniques en matire technologique et de march. "Le but de l'AFM est d'arriver
un stade o des socits de pharmacie vont produire des mdicaments ADN pour gurir la
maladie" (Conseil d'Administration, 1994). L'AFM doit donc argumenter la mise en
quivalence de ses propres objectifs avec l'intrt national de dvelopper une industrie forte,
afin d'obtenir des pouvoirs publics des mesures incitatives la R&D industrielle. Les actions
de coordination menes par l'AFM induisent des modifications dans les pratiques de
recherche, en initiant des relations entre les quipes de recherche finances par l'Association
et des industriels, relations qui seront prennises dans le temps.

22

2.2. La dynamique du fonctionnement des dispositifs d'incitation et de

coordination
Nous avons dcrit la configuration des acteurs -chacun jouant un rle spcifique- de la
construction d'un espace scientifique et technique en gnomique et de ses ouvertures sur
l'espace industriel pour poser les fondements d'un espace innovant.
Cette construction s'est appuye sur des connexions tablies entre des ensembles
scientifiques, techniques, et institutionnels autonomes, mais ayant des liens
d'interdpendance. La gestion du principe d'incertitude prsidant l'mergence d'un espace
d'innovation, permissif du dveloppement des thrapies gniques en France, a ncessit des
initiatives institutionnelles, et des modes d'organisation et des apprentissages collectifs. Mais
les inerties institutionnelles n'ont pas permis une articulation cohrente des dimensions
cognitives, organisationnelles, et politiques de la configuration de relations, support d'une
dynamique de l'innovation. Nous avons cherch caractriser les interactions entre acteurs
collectifs produites par les dispositifs institutionnels tudis, la nature des apprentissages, et
les consquences sur la priode en termes de performances technologiques, d'innovation, et de
comptitivit internationale ; enfin les dficiences obrant la potentialit d'un espace
d'innovation issu de la gnomique.

2.2.1. Dynamique scientifique et technique et inerties institutionnelles

La juxtaposition et la simultanit des dispositifs de coordination de l'action publique
avec l'AFM, d'une part, et du GREG, d'autre part, ont cr une segmentation institutionnelle
des politiques scientifiques du vivant, et du champ scientifique en biologie entre gntique
mdicale et recherches sur les gnomes, ayant un effet ngatif sur la coopration scientifique
et technique. Dans ce processus, nous examinerons les poids respectifs d'un facteur externe, le
rle de l'AFM et d'un facteur interne, le maintien des logiques d'autonomie et d'opportunisme
des EPST dans les dispositifs institutionnels de coordination.
2.2.1.1. L'impact structurant de l'AFM sur les orientations de la recherche en
sciences de la vie
La multiplication des financements externes sur des objectifs scientifiques, notamment
de sources caritatives, n'est pas sans poser le problme de la faon dont ces financements
affectent les orientations de recherche des OPR, en particulier du DSV du CNRS.
Ces initiatives de l'AFM, qui ont cr un champ de recherche bien dot financirement
et technologiquement, et non pas inflchi les orientations de la recherche publique, ont eu un
"effet de levier" sur la structure scientifique existante, sans laquelle l'action scientifique
associative serait reste inconsistante. Mais les trajectoires des quipes aboutissent terme
une implication du dpartement sur les thmatiques de l'association, selon une dynamique qui
lui chappe largement, puisqu'il est sollicit, en parallle des autres acteurs de recherche
publique, pour reprendre l'infrastructure et les assemblages de comptences raliss sur les
oprations de l'AFM, maintenance et personnel, lorsque celle-ci roriente sa stratgie.

23

Concomitamment la monte exponentielle de la biologie molculaire, puis de la

gntique sous l'influence de l'AFM, d'autres disciplines de la biologie, telles la virologie, la
physiologie, la biochimie, la gntique et surtout la microbiologie, n'ont pas t suffisamment
dveloppes et se retrouvent en dficit par rapport aux rquisits actuels de la recherche
biologique. Le dveloppement de la gnomique impuls par les subventions de l'AFM,
"partenaire de l'Etat", engage les pouvoirs publics prendre le relais de l'association sur des
questions que celle-ci considre d'intrt collectif, comme la localisation et l'identification des
gnes, et investir massivement sa suite dans la cartographie et le squenage.

2.2.1.2. Le bilan du GREG : la dlimitation d'une communaut scientifique

Cr dans un milieu de clivages scientifiques autour de la controverse de squencer ou
non le gnme humain, le GREG est l'aboutissement d'une priode de non dcision politique
relayant cette controverse au niveau des pouvoirs publics. Il constitue donc un compromis
institutionnel, stabilisation de logiques contradictoires, reflt dans son appellation mme, qui
comprend les gnomes. Le CEPH et le Gnthon avaient ouvert un champ scientifique par
une technologie, le squenage massif, il relevait du dispositif public de coordination de
l'ancrer dans un contexte spcifique (une communaut scientifique segmente) par la
constitution d'un cadre institutionnel structurant cette communaut autour d'objets communs.
En fait, le dispositif a t appropri selon leurs formes organisationnelles prexistantes
par les organismes de recherche, rticents voir des ressources publiques consquentes
chapper leur contrle. La configuration d'interrelations entre acteurs de la recherche a t
maintenue, et ce sont des logiques de concurrence qui ont prvalu au sein du GREG entre
CEPH, CNRS, INSERM et INRA, pour concentrer les ressources sur leurs gnomes
prfrentiels -gnme humain, gnomes modles, ou gnomes d'intrt conomique.
Enfin le GREG n'a pas t mobilis comme instrument politique de structuration de la
communaut scientifique, il n'a pas dvelopp une politique forte, avec une planification sur
six ans budget constant et soutiens rcurrents rguliers, sur des axes dgags pralablement
pour effectuer un suivi, tablir une cohrence. Il a laiss jouer la rgulation professionnelle
des organismes de recherche selon leurs objectifs propres, au lieu d'imposer une rgulation
publique pour obtenir une coordination, promouvoir une recherche cooprative fonde sur des
changes entre acteurs scientifiques diversifis, objectif pour lequel il avait t mis en place
par le ministre. Il a nanmoins eu, par son allocation de ressources, une action de
dplacement d'un certain nombre d'quipes, vers un champ entre le gnome et la gntique
mdicale, qui leur a donn une place honorable au niveau international, et leur a permis de
bnficier des retombes de la cartographie et des avances du Gnthon. Il a dfini les
contours d'une communaut l'intersection d'aires d'intrts communs, mais qui est reste
fragmente, sans jeux coopratifs. Suspendue au bout de trois ans, sous la pression de l'AFM
qui prnait au ministre un transfert des connaissances acadmiques vers des projets semiindustriels, et rendait le GREG responsable des lacunes des pouvoirs publics, son action a t
de trs court terme et n'a donc pas t dterminante, faute galement d'articulation avec les
actions simultanes de l'AFM.

24

2.2.2. Une faible efficience en termes de performances technologiques,

d'innovation, et de comptitivit
Les mcanismes institutionnels que nous avons examins prsident pour partie aux
formes d'agencement des relations entre la recherche et l'industrie et leurs interactions sur
cette priode. Par les formes organisationnelles nouvelles qu'ils ont suscites, ils fournissent
des cadres l'accentuation plus ou moins forte de l'intgration science/industrie, et la
dynamique productive de nouvelles technologies issue de la rencontre de connaissances
mobilises et d'acteurs innovants. Au-del de la rhtorique dveloppe par les directions
scientifiques des EPST sur l'ouverture de la recherche aux acteurs socio-conomiques et sur le
renforcement des partenariats industriels, quelles ont t sur cette dcennie les incidences des
politiques publiques scientifiques et technologiques sur le dveloppement de liens entre
recherche en sciences du vivant et performances conomiques, quel a t l'impact de cette
recherche sur les opportunits technologiques, la cration d'activits nouvelles, et le
dveloppement industriel ?
Dans une dfinition en terme de processus, le modle de l'innovation en boucles de
Kline et Rosenberg met en vidence l'existence de liens double sens entre espace S&T et
industrie. Dans les sciences de la vie, les aspects technologiques et de R&D se situent la fois
en amont de la recherche, pour l'utilisation d'organismes ou de composants du vivant des
fins analytiques ou pour la mise au point d'une instrumentation pour la recherche biologique
(automatisation, informatique, dtecteurs, gnie biologique et mdical . . .), et en aval, par les
applications biotechnologiques issues des avances des connaissances scientifiques ou par la
valorisation industrielle des appareillages et procds innovants, supports de la production
scientifique.
2.2.2.1. Les rendements conomiques de la recherche
Nous pointerons le dcalage entre production scientifique et position technologique de
la France dans le domaine des sciences du vivant et des biotechnologies, en prenant trois
indicateurs de la relation recherche/innovation : les brevets, les relations contractuelles entre
OPR et entreprises, et la cration d'entreprises partir du potentiel scientifique. Les relations
insuffisantes entre les laboratoires de recherche publique et les entreprises sont dnonces
comme une des faiblesses majeures du systme franais.
2.2.2.1.2. Les brevets
La part mondiale de la France a fortement diminu, tous domaines confondus, entre
1987 et 1996 dans le systme de brevets europens, passant de 8,5% 7%. En biotechnologie,
le mme dclin peut tre observ, aboutissant une position franaise qui ne reprsente que
6,4% des brevets europens. La position franaise est dans l'industrie pharmaceutique de
6,6% en 1996. En brevets amricains, la part globale franaise a dcru sur la mme priode de
3,8% 3,1%, l'affaiblissement tant cependant moins marqu dans les biotechnologies, et
dans le secteur pharmaceutique (5,1%), tmoignant de l'implantation, sur la priode, de firmes
franaises aux Etats-Unis par cration de filiales ou acquisition de socits amricaines.

25

Au total, les biotechnologies reprsentent en 1996, selon l'INPI, 2,9% des dpts de
brevets franais, europens, et internationaux PCT dsignant la France.
2.2.2.1.3. Les relations de coopration entre Organismes Publics de Recherche (OPR)
et industriels
Tous domaines confondus, les contrats de R&D perus par les organismes de
recherche et les Universits et Ecoles en provenance des entreprises s'levaient en 1995
3,4mds de F., la part des EPST tant de 10% seulement. Le montant de ces ressources
contractuelles pse faiblement dans le budget de R&D des OPR, il ne reprsentait en 1994
que 3,1% de leurs dpenses de R&D (hors CEA), alors qu'il tait de 7% pour les universits
amricaines dont 12% pour les sciences biologiques et mdicales (Rapport Guillaume). Les
EPST passent davantage de contrats avec les grandes entreprises (2/3 des ressources
contractuelles), la situation est inverse pour les Universits (la moiti provient des PME). Du
point de vue des entreprises, les contrats avec la recherche publique reprsentent environ 3%
du financement de leur recherche. Ce qui signifie que le mouvement d'externalisation de la
recherche par les entreprises observ depuis quelques annes bnficie peu la recherche
publique. Les dpenses extrieures de R&D d'entreprises ayant bnfici de fonds publics ont
peu de retour vers les laboratoires publics (6,9%) (source MENRT). Dans ces relations
contractuelles, les PMI sont largement sous-reprsentes.
Dans ce cadrage, on peut spcifier les particularits des relations entre recherche
acadmique et entreprises dans les sciences du vivant (cf.Tableau). Selon le Livre Blanc de la
coopration en R&D entre industrie et secteur public publi par le Syndicat National des
Industries Pharmaceutiques en 1997, les relations de rseaux fonctionnent avec l'INSERM, et
avec le secteur hospitalo-universitaire sur des collaborations pour la recherche clinique.
Au CNRS et dans les universits, les structures d'interface ayant pour mission
d'optimiser les relations avec l'industrie sont insuffisantes, ou trop centralises. Lorsque les
logiques de deux types de partenaires ne convergent pas, ce qui est le plus souvent le cas,
aucune tentative de rapprochement n'est faite pour formaliser les gains rciproques d'une
collaboration long terme.

26

Tableau 2 : Les relations industries-organismes publics

Organismes
CEA

Prestations de recherche
- synthse de molcules biologiques par des
isotopes stables et radioactifs,
- tudes pharmacologiques et
pharmacocintiques en vue de la prparation de
dossiers AMM,
- validation de processus bioindustriels pour
leur capacit dtruire des agents infectieux non
conventionnels (prions).
INSERM
- recherche dlgue (phase exploratoire,
cibles pharmacologiques, criblage molculaire),
prise en charge financire par l'industriel,
- recherche partage (nouveaux
mdicaments),
- quipe intgre,
- prestation de recherche.
CNRS
- Cinq units mixtes de recherche en lien
direct avec industriels, - accords-cadres avec
contrats particuliers,
- engagement du dpartement Sciences de
la Vie dans le programme BIOAVENIR,
- contrats courts,
- soutien de ressources humaines.
UNIVERSI
20 DEA finalit "mdicament" dont :
TES
- substances pharmacologiquement actives,
- valuation des mdicaments et
xnobiotiques,
- lgislation pharmaceutique.
PASTEUR

- bactriologie et mycologie,
- virologie,
- biochimie et gntique molculaire,
- biotechnologies,
- ...

Source : Livre blanc de la coopration en R&D, SNIP, 1997.

Contrats
114 contrats en 1994 45 % de
collaboration (dure moyenne : 2 ans), 5 %
prestations de recherche.
Montant total : 32 F. (RP-Rorer,
Sanofi, P.Fabre, Servier, Biotech, Orion, Glaxo,
Basf, Roussel-Uclaf, Transgne.
Non communiqu

Le CNRS prfre la formule des

units mixtes aux contrats de recherche

Non communiqu

Le bureau de valorisation et des

relations industrielles assure le transfert des
rsultats dans les units vers les industries (22
MF d'expertise en 1994, 5 MF de contrats de
R&D, redevances verss par les licencis
l'institut : 200MF).

Perspectives pour les industriels

Le CEA souhaite tre impliqu plus
officiellement dans les instances de dcision de
l'industrie.
L'industrie le souhaite galement en
esprant que la volont se traduise dans le vcu
des structures de laboratoire.
Besoin de collaboration plus
approfondie.
Homologation rciproque des
diplmes facilitant et les mobilits et les
carrires sur des emplois mixtes.
Favoriser le rapprochement des units
publiques par la construction de thmes
fdrateurs.
Homologation rciproque des
diplmes facilitant les mobilits et les carrires
sur des emplois mixtes.
Amlioration de la visibilit des
formations de recherche.
Intgrer et organiser les formations
doctorales.
Encourager la mobilit (rvision des
statuts).
Dsenclaver les collaborations de
l'institut (deux partenaires privilgis : Sanofi
Diagnostic Pasteur, Pasteur Mrieux Srums et
Vaccins).

27

2.2.2.1.4. La cration d'entreprises

Les biotechnologies sont un secteur o l'innovation provient surtout de petites
entreprises, dont la cration est fortement lie au systme institutionnel. Aux Etats-Unis, la
plupart des protines recombinantes (70% environ) ont t inventes par des "spin-off" de
chercheurs, pour tre ensuite commercialises par les grands groupes pharmaceutiques. En
France, moins de cinquante start-up taient issues en 1996 de l'essaimage de la recherche avec
souvent des Aides pour Projet Innovant de l'ANVAR. Plusieurs se sont hisses au rang
mondial (Genset, la premire avoir t cote sur le nouveau march et le NASDAQ en 1996,
Cerep, Flamel Technologies, IDM, Appligne, Oncor, Transgne, Genopoetic, Chemunex,
Biovector Therapeutics)
2.2.2.1.5 Les obstacles l'articulation entre recherche publique, dveloppements
technologiques, et valorisation industrielle
Deux types d'argumentaires "socitaux" peuvent tre recenss en ce qui concerne ces
obstacles, l'un d'ordre institutionnel, et l'autre d'ordre culturel. Les arguments institutionnels
ont t largement comments, notamment dans le Rapport d'Henri Guillaume sur la
technologie et l'innovation (mars 98). Nous distinguerons ceux affrents la dynamique de
l'essaimage de la recherche publique de ceux du transfert de dveloppements technologiques
pour ou issus de la recherche vers des applications industrielles.
Sur le second point, on constate que les modalits de coopration prvues par la loi
d'orientation et de programmation pour la recherche et le dveloppement technologique de
juillet 1982 ont t insuffisamment mises en oeuvre : la formule des GIP a t juge d'une
grande lourdeur par rapport aux objectifs et leur interdiction de recruter des personnels
affaiblit leur intrt. Les UMR n'ont pas eu le dveloppement escompt (moins d'une dizaine
avec le DSV du CNRS). Enfin, contrairement d'autres pays, il n'existe pas de solution
juridique satisfaisante l'tablissement de consortia regroupant des petites et grandes
entreprises et des laboratoires pour dvelopper des ressources technologiques communes ou
des centres de recherche coopratifs.
Sur le premier point, les handicaps financiers, fiscaux ou juridiques la cration de
start up les plus souvent cits comme constituant un environnement dfavorable taient :
- la fiscalisation pnalisante des stock options mises par les nouvelles socits de
biotechnologies
- la remise en cause de la restitution immdiate du crdit d'impt recherche pour les
entreprises nouvelles de hautes technologies
- le manque de systme de financements adapts, fonds d'amorage et capital risque
- des dpts de brevets insuffisants par les organismes publics de recherche avec
licences exclusives des petites entreprises. Or le capital-risque n'investit que sur les
technologies brevetes, et les concurrents dposent des brevets.
- un statut de chercheur rigide, qui exclut toute prise de participation au capital d'une
start up, et cre des conditions de retour difficiles sur l'EPST d'origine
- l'absence de formations croises scientifiques et l'entreprenariat.
On peut nanmoins discuter la pertinence de certains de ces arguments de type
institutionnel.

28

Sur le DPI, par exemple, il n'est pas vident que la dfense des intrts patrimoniaux
des OPR soit compatible avec une logique de dveloppement des start-up et des PE de
croissance. Par ailleurs, le brevet est trs onreux la fois pour son dpt et pour sa dfense
juridique en cas de contestation. Enfin, le secret sur les inventions les plus potentiellement
innovantes est souvent prfr jusqu' la phase de dveloppement industriel possible.
S'agissant d'une pnurie de financements, mme si sur les 200 socits
d'investissements en France, une dizaine seulement investissent sur les start-ups
technologiques, il existe, ct de l'ANVAR, des fonds de capital-risque franais dont les
actifs sont en croissance.
Socits spcialises sur les start-up
Intervenant

Actifs
grs
900 MF
500 MF
400 MF
300 MF
300 MF
250 MF
200 MF
200 MF
150 MF
150 MF

Sofinnova
Innovacom
CDC-Innovation
Finovelec
Thomson-CSF Ventures
Partech International
Atlas Venture
Epicea
Banexi Ventures
Galileo
Source : AFIC - Rapport Guillaume

En France, les biotechnologies concentraient en 1995 15% du capital-risque (174 MF),

et le secteur mdical/sant 18% (260 MF) (Source AFIC). Ce taux tait appel crotre trs
fortement ultrieurement.
Figure 2 : Venture capital investment in
biotechnology and health care by country
Sw izerland
Italy
Belgium
Netherlands
Germany
France
United Kingdom

1995
1996
0

50

100

150

200

250

300

Ucu in Millions

Source : European Venture Capital Association

Le goulot d'tranglement ne se situe donc pas vraiment dans la ressource financire.
Pour Pascal Brandys, prsident de Genset, "le premier frein la cration d'entreprises de
biotechnologies reste le dficit en entrepreneurs de qualit".
A ct des freins institutionnels, le facteur de la spcificit de la culture scientifique
franaise serait prpondrant. Les chercheurs des OPR aspirent une carrire scientifique de
type acadmique, o les critres de russite et les incitations correspondantes sont poss en

29

interne par une communaut scientifique ontologiquement cohrente, faonne pour la

production de connaissances scientifiques selon un "ordre" dominant.
La recherche technologique est peu dveloppe, parce que non valorise dans une
carrire de chercheur, de mme que les efforts de valorisation industrielle ou la mobilit vers
les entreprises. Il est symptomatique que le saut qualitatif fait en France grce l'introduction
de techniques de squenage grande chelle l'ait t dans un laboratoire priv (le Gnthon),
et considr par le milieu des biologistes comme une "drive technologique" connotation de
dveloppement, et non plus de recherche.
Selon des chercheurs en biologie ayant assum des directions scientifiques, les
obstacles juridiques la cration d'entreprises en France seraient plutt un alibi pour autojustifier la mentalit des chercheurs publics, le peu de passage l'acte partir d'une ide de
crneau d'application, et l'absence de vision stratgique.

2.2.2.1.6. La situation des socits spcialises en biotechnologies (SSB) et leurs

stratgies
Selon l'enqute d'Ernst et Young 1996, fin de la priode que nous avons analyse, la
situation compare des SSB tait la suivante :

Tableau 3
FRANCE
Dpenses de R&D
Nombre d'entreprises
Dont cotes en march
boursier
Nombre d'employs

< 50
1

EUROPE
10mds F
716
50

3000

27.500

ETATS-UNIS
48mds F
1287
300
118.000

Sur le plan des produits, depuis plus de vingt ans, le secteur est domin par les EtatsUnis qui en 1996 dtenaient 90% de l'ensemble du march mondial. Les deux tiers de ces
marchs sont orients vers les produits thrapeutiques et diagnostiques.
Ct franais, des formes de partenariat entre units de recherche, entreprises de
biotechnologie engages dans l'identification de gnes et de rgions rgulatrices associes
des maladies, et industrie pharmaceutique (avec des licences exclusives ou non) ont aussi t
conclues. Genset, la premire firme gnomique franaise, qui a des accords avec l'INSERM
pour une structure de recherche commune, a aussi des protocoles d'accords exclusifs sur une
maladie avec deux groupes pharmaceutiques : Synthlabo, qui a pris une participation au
capital de Genset a une licence exclusive d'exploitation du brevet dpos en 1996 sur le gne
impliqu dans le cancer de la prostate. Johnson & Johnson, qui participe aussi son capital
et finance la R&D de Genset pendant deux ans sur des gnes associs la schizophrnie,
moyennant redevance sur les ventes de produits dvelopps partir des gnes dcouverts. On
peut citer aussi Gnopoetic, qui valorise des techniques de thrapie gnique partir de
brevets de l'Institut Pierre et Marie Curie, et qui avait le soutien de RPR pour la
commercialisation de produits. Transgne, enfin, s'est dveloppe essentiellement sur fonds

30

publics et caritatifs, puis avec un apport limit dans le temps de Rhne-Poulenc (avant de
conclure en 1998 des accords avec HGS et Schering-Plough).
L'impact des biotechnologies sur l'industrie pharmaceutique reste cependant difficile
mesurer. En 1995, une tude de TMC Dveloppement rvlait que la moiti de l'activit
gnomique biomdicale tait concentre dans 1% des entreprises pharmaceutiques. Sur les
4000 firmes recenses dans le monde, seules 39 avaient une vritable politique dans ce
domaine, dont les groupes franais RPR (au cinquime rang), Sanofi et Synthlabo. Mais ce
constat correspond, en corollaire, au mouvement d'externalisation de la recherche des groupes
pharmaceutiques (environ 20% de la recherche des firmes US pharmaceutiques est
externalise), dont on a vu les stratgies d'alliances avec des petites entreprises de
biotechnologies qui assument les risques de recherche. A partir de la seconde moiti des
annes 90, l'Europe commence rattraper son retard dans le domaine des biotechnologies,
mais le dsquilibre concurrentiel de la France avec les autres pays europens, continue se
creuser. Malgr un dcollage dans la cration d'entreprises, la France passe au troisime rang
derrire l'Allemagne, en 1997.

2.2.2.2. L'efficacit limite du financement public de la R&D industrielle

Les biotechnologies ont fait l'objet en France depuis le dbut des annes 80 de
programmes nationaux : le programme mobilisateur "Essor des biotechnologies" en 1982, le
Programme National Biotechnologies en 1985, les "Sauts technologiques" en 1988 ; le
Programme Bioavenir en 1992,
Selon le MENRT, les pouvoirs publics consacrent chaque anne plus de 10mds de F.
aux recherches biologiques, agronomiques et mdicales. Mais il n'existe pas, selon le Rapport
Guillaume, de vision de synthse ni d'valuation de l'affectation et de l'utilisation des crdits
publics, et de leur impact technologique et conomique, et ces lacunes reflteraient l'absence
de stratgie de l'Etat en matire de coordination et de suivi du financement public de la R&D.
On peut cependant faire globalement un double constat paradoxal : la faible capacit du tissu
industriel franais intgrer les avances ralises dans l'espace S&T, et le savoir-faire d'un
petit nombre de groupes industriels profiter de fonds et ressources publics dvolus aux
transferts de la recherche vers l'industrie et au dveloppement de la recherche industrielle.
Le programme interministriel Bioavenir (programme de R&D d'intgration de
concepts et de techniques novatrices en biologie) est reprsentatif des politiques franaises de
grands programmes technologiques faonnes par le modle colbertiste de la priode de
l'aprs-guerre. Ce programme a mobilis 610MF de subventions ministrielles et 210MF des
EPST entre 1992 et 1997 pour assurer une co-programmation recherche-industrie avec un seul
acteur industriel, Rhne-Poulenc. En dpit d'lments positifs, l'valuation faite du
Programme laisse apparatre des dviances dfavorables la coopration de la recherche
publique avec un industriel : une monopolisation des fonds publics au lieu de les consacrer
l'incitation d'un tissu industriel de petites entreprises de biotechnologies, la non transparence
des rsultats de recherche, une appropriation des savoirs et des avances de la recherche
fondamentale au bnfice d'un seul groupe industriel priv, une collaboration cloisonne entre
R-P et chaque quipe de recherche participante sans mise en rseau ni interfaces
disciplinaires, contrairement aux vises des dispositifs de coordination.

31

Cette concentration des ressources publiques sur R-P a eu une double consquence
ngative pour les applications biomdicales de la recherche gntique.
D'une part, le groupe pharmaceutique, par ses effets d'annonce sur son programme
thrapie gnique prsent comme une activit compltement intgre, matrisant toute la
chane de la recherche la production et la commercialisation future, a indirectement
bloqu, par son positionnement monopolistique, le dveloppement de petits centres
"artisanaux" de thrapie gnique dans les CHU, et dissuad les pouvoirs publics de soutenir la
cration de petites entreprises de biotechnologies issues de la recherche acadmique. En outre,
Rhne-Poulenc-Rorer a finalement externalis les applications technologiques de thrapie
gnique aux Etats-Unis, partir de 1994, dans sa division Gencell.
D'autre part, la focalisation des ressources publiques sur R-P a eu pour effet de lier de
faon plus troite le dveloppement des recherches en thrapie gnique la logique de
march. En effet le choix des cibles thrapeutiques pour les industriels dpend de la frquence
des maladies dans les pays occidentaux, et laisse donc de ct les maladies rares, ou au
contraire trs frquentes mais survenant dans des pays conomiquement dfavoriss qui ne
constituent pas des marchs solvables.
On voit bien l que le choix des options techniques guid par la logique industrielle
peut rduire l'ventail des dveloppements scientifiques et techniques possibles. L'enjeu de
diversit et d'largissement des potentialits d'applications partir des orientations de la
recherche, que reprsente la mise en compatibilit entre valeur prive et valeur sociale de
l'innovation, relve de la dfinition par les acteurs publics des formes d'articulation entre
recherche et industrie, et du maintien ou non d'une conception de la science comme "bien
public".

32

III COMMENT LE NOUVEAU MODLE SCIENCE/INNOVATION

VIENT PERCUTER LA TRAJECTOIRE PASSE DE POLITIQUE PUBLIQUE
SECTORIELLE : LES EFFETS DE COMPOSITION

3.1.
Bilan de la politique publique sectorielle dont hritent les dispositifs
daction publique actuels
. Quelle a t la capacit de laction publique mettre en place, sur les dix ans qui ont
suivi le lancement international du Programme gnme , les conditions runir pour
conforter un espace scientifique et technique sur la gnomique, et construire les dimensions
dun espace dinnovation , qui favorise la cration et la comptitivit des entreprises, la
diffusion des avances de la recherche dans le tissu conomique et social, et leur
transformation en richesse sociale ?
Au niveau organisationnel, plusieurs logiques daction se sont superposes, sans quil
y ait pour autant de convergence :
Le CEPH et lAFM, structures prives, ont t des acteurs innovants en introduisant
des mthodes scientifiques semi-industrielles dans la biologie molculaire et en dveloppant
la gntique molculaire. Ils ont pos les fondements dun espace scientifique et technique
nouveau et positionn la France au niveau international.
Le GREG, en tant que cadre de controverses, de ngociations, dlaboration de
compromis entre les diffrents EPST, et les hospitalo-universitaires, a t lbauche dun
premier rapprochement dquipes de disciplines et dappartenance diffrentes. Son
intermdiation a permis dinitier un apprentissage collectif organisationnel, mais qui sest
limit au milieu scientifique. Il na pas servi dattracteur pour structurer un espace plus large
autour dun programme national de gnomique fortement identifi, imbriquant science et
industrie.
Le Programme Bioavenir, quant lui, a eu des effets de socialisation des chercheurs
publics la recherche industrielle, en leur permettant de voir que sur des proccupations
industrielles, on pouvait faire de la recherche fondamentale.
Ces retombes de dispositifs de coordination public/priv ont t segmentes, et elles
nont pas permis la construction dune dimension transversale essentielle un espace
dinnovation, savoir la structuration dun espace professionnel transcendant les
disciplines, les vocations spcifiques des diffrents tablissements de recherche, publics ou
privs, et rapprochant des savoirs et des comptences scientifiques, techniques, et appliqus.
Le maintien des cloisonnements entre institutions, linsuffisante hybridation des disciplines
(pour la bioinformatique par exemple), la tendance la dispersion des moyens de squenage
(ou dessais prcliniques pour la thrapie gnique) dans des sites isols de recherche
artisanale , ont frein une circulation des connaissances contextualises sur lanalyse
des gnomes, ses enjeux socio-conomiques, et les moyens technologiques mobiliser pour
participer au niveau mondial la production des donnes conditionnant leur utilisation.
En laissant par ailleurs une association prive caritative inflchir les orientations de la
recherche publique en biologie en tendant son champ daction, lEtat na pas jou le rle
responsable qui devait tre le sien parce quil sest content, en priode de crdits rares pour

33

la recherche, de trouver des relais ses insuffisances de financement, et de se rapproprier,

dans un systme de dpendance rciproque, le discours et les priorits dune association, sans
sengager dans une politique volontaire et efficace organisant larbitrage entre valeur dusage
acadmique et valeurs dusage industrielle des avances de la recherche.
Les squences dintervention des acteurs institutionnels ont t discontinues et en
dcalage par rapport la dynamique donne aux logiques dinnovation et de diffusion
industrielle dans ce domaine par la mondialisation. La France na pas jou le rle
dentranement au niveau europen quelle aurait pu avoir sur sa base scientifique.
Linadaptation des outils dinformation des EPST, le caractre court-termiste et
erratique de laction publique d en particulier linstabilit politique et aux tensions entre le
Ministre et les diffrents EPST dans les jeux dinfluence et la concurrence des rfrents
(avances mdicales, gnes dintrt conomique), labsence dvaluation relle des
dispositifs interrompus et dun apprentissage procdural suffisant, toutes ces caractristiques
dune politique publique top/down ont t finalement plutt perturbatrices de la construction
de lespace scientifique et technique en gnomique, par un secteur priv sollicit pour
combler les carences de laction publique.
Le processus de construction de ce domaine nouveau, la gnomique, est donc rest
morcel, et na pas permis un apprentissage institutionnel qui aurait significativement
renouvel les modes dintervention des pouvoirs publics, qui sont marqus par la permanence
des inerties dans linteraction recherche/socit et les outils de politique technologique.
Cette politique publique sectorielle a en effet t marque par une dpendance de
sentier des institutions, modeles pour rpondre des objectifs de politiques scientifiques et
technologiques daprs-guerre (Callon, Foray, 1998). Elle a juxtapos sa caractristique de
mission-oriented policy (caractrise par une centralisation des dcisions top/down et une
concentration de lallocation des ressources dans de grands programmes) des zones de non
dcision et de saupoudrage dans un systme opaque sur les champs nouveaux dvelopper
dans le couplage science/innovation. De plus, elle est reste rfre au modle dinnovation
linaire, allant de la recherche fondamentale vers la recherche applique, puis le
dveloppement des produits ou des services. Elle a donc gnr, dans le contexte socital
franais de la priode 1985-1996, une faible efficience par rapport aux enjeux des dispositifs
destins produire, distribuer et changer des connaissances et comptences nouvelles.
Si cette priode na pas fait merger un espace dinnovation en biologie et biotechnologies,
en labsence dune dynamique dans ce sens du jeu institutionnel national, elle a nanmoins t
porteuse de certains apprentissages localiss (cration et diffusion de connaissances et
comptences) qui en constituent des pr-requis. Les phases dun processus dinnovation ne se
succdent pas de faon linaire, elles se chevauchent et s'imbriquent, produisant une
"irrversibilit cumulative" due des innovations graduelles, tant organisationnelles et
institutionnelles que techniques.

34

3. 3. Les effets de composition

3.3.1. Bousculement des reprsentations en France de la relation

science/innovation par les interdpendances et la diffusion scientifiques et
technologiques : une raction socitale endogne
Les interdpendances et la diffusion scientifiques et technologiques au niveau de la
globalisation de la recherche dans la biologie ont non seulement modifi les techniques
constitutives, et paralllement les formes organisationnelles des diffrents secteurs mobiliss,
mais elles ont suscit la gnralisation dun "modle" de production de la science (la "coproduction" de connaissances l'intersection de trois sphres institutionnelles qui
interagissent, l'Universit et les organismes de recherche, les pouvoirs publics et l'industrie),
qui a t dcrit (1.2.).
Ces irrversibilits et ce bousculement des reprsentations en France induit une
raction endogne socitale d'ajustement l'environnement mondialis, un changement dans
le rfrentiel et dans les modes d'action publics, pour tenter d'amorcer une dynamique
institutionnelle en cohrence avec la dynamique scientifique et technique, et pour crer les
conditions d'appropriation du modle par les organismes de recherche et les entreprises, au
niveau local, national et international, en bref pour "transformer les rsultats de recherche en
innovation conomique et sociale".

3.3.2. Changement dans le rfrentiel et les modes daction publique

3.3.2.1. Les prmices de nouvelles modalits dintervention publique (diffusion
oriented policy)
Au plan institutionnel, un certain nombre de programmes et de nouvelles mesures de
porte gnrale ou spcifique, tendent permettre l'installation de nouvelles logiques d'action
dans une certaine prennit, et des conditions de trajectoires de dveloppement pour des
petites entreprises innovantes, par le passage d'une logique patrimoniale une logique
entrepreneuriale.
Le CIRST du 3 octobre 1996 a lanc un Programme fdrateur stratgique pour les
biotechnologies pour cinq ans. Ce programme a pour objectif de financer avec des procdures
prives/publiques des projets associant des laboratoires de recherche publics et des
entreprises, et d'apporter une aide la cration de nouvelles socits. Les crdits publics
viennent du FRT, de l'ANVAR, et du Ministre de l'Industrie, le financement priv
d'investisseurs institutionnels et de capitaux risque, avec la cration des Fonds Communs de
Placement de l'Innovation. Dj une vingtaine d'entreprises ont t cres.
Le CNRS a un Programme Gnome Humain dont l'un des axes principaux est le
dveloppement technologique sur les puces ADN.
En cadre gnral, les dcrets d'octobre 1996 prvoient l'intressement des chercheurs
aux produits de leurs dcouvertes. La proposition de loi sur linnovation de F. d'Aubert de

35

1997 incitait la cration d'entreprises par des chercheurs, tout en gardant un lien avec leur
laboratoire d'origine.
Aux Assises de l'Innovation du 12 mai 1998, le Ministre de l'Economie a annonc des
mesures financires et fiscales favorisant les apports du capital-risque aux PE innovantes, qui
ont t mises en place en 1999, et un projet de loi sur l'innovation et la recherche, modifiant la
loi de juillet 1982 d'orientation et de programmation pour la recherche et le dveloppement
technologique en France. Celle-ci, vote en Juillet 1999, constitue un nouveau cadre des
relations entre science, technologie et entreprises, ayant pour objectifs la croissance et
lemploi.
3.3.2.2. Une logique dincitation des innovations plus dcentralises et diversifies
Ces modalits d'intervention publique ("diffusion oriented policy") visent alors, pour
rpondre aux nouveaux objectifs historiques, substituer au modle colbertiste une logique
d'innovation plus diversifie et dcentralise, diffusant dans le tissu conomique et social.
Elles prvoient, par la multiplication des partenariats, des champs d'application diffrents
(agronomique et agro-industriel, pharmaceutique, mdical, environnement), o pourront
s'inscrire les produits de la recherche. Elles cherchent aussi accrotre la logique d'incitation
par rapport la logique de subvention pour renforcer la motricit de la relation
science/industrie dans la configuration d'acteurs, par rapport la relation pouvoirs
publics/industrie.
Cependant, concrtement les nouveaux arrangements institutionnels devant rester
fonctionnellement compatibles avec la configuration organisationnelle gnrale de la
recherche et de lintervention publique, qui est historiquement faonne, l'ajustement au
"modle" ne peut faire l'objet en France que d'un apprentissage "politico-cognitif" (Hatchuel)
de nature incrmentale, qui reste marqu par l'inertie.

CONCLUSION
Pour conclure sur la priode tudie en France, les mcanismes d'incitation et de
coordination des institutions pour fonder un "espace d'innovation" en gnomique et
biotechnologies ne se sont pas trouvs suffisamment mis en cohrence avec les logiques
de diffusion et d'interdpendance scientifiques et techniques.
Cette dsarticulation dans l'espace socital franais entre l'action tatique et le
mouvement de dveloppement scientifique et technique auquel participe la communaut
scientifique a laiss place aux jeux autonomes des acteurs intermdiaires que sont les
organismes publics de recherche, au pilotage des partenaires extrieurs privs, et une
carence de transformation des avances scientifiques en richesse conomiques et sociales.
En revanche, les logiques scientifiques et techniques ont quant elles produit un
apprentissage collectif cognitif, dans l'accumulation et la diffusion des connaissances
scientifiques et techniques, et un apprentissage organisationnel par la structuration de la

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communaut scientifique autour d'objets devenus communs, et par la standardisation des

mthodes.
Ces apprentissages cognitifs et organisationnels ont conduit constituer les pr-requis
fonctionnels de l'mergence d'un espace d'innovation, fond sur le modle d'une nouvelle
forme de couplage entre science et technologie, o firmes industrielles, entreprises de
biotechnologie, laboratoires de recherche publics et privs et services cliniques seraient
associs tous les stades d'laboration et de diffusion des produits de la recherche gnomique
et de gntique mdicale.

BIBLIOGRAPHIE GNRALE
Boyer R., Chavance B., Godard O. (eds) (1991) Les figures de l'irrversibilit en
conomie, EHESS
Branciard A. (1996) Changements technologiques dans linstrumentation physique
et mutations organisationnelles de la recherche : le cas de lInstitut de Physique Nuclaire
dOrsay . Rapport de recherche, LEST, 1996, 73 p., ann
Branciard A. (1999), Espace dinnovation dans la biologie et recomposition
despaces productifs, analyse des processus institutionnels et politiques en uvre. Rapport
pour le Programme CNRS Enjeux conomiques de linnovation , Avril 1999, LEST
CNRS, 151 p.
Branciard A., Huard P. (1992) Rgulations enchevtres et dynamique du systme
sanitaire , In : CHYTIL ( M. K.), DURU (G.), EIMEREN( W. van) and al. Eds, Health
Systems, the challenge of change. Omnipress Publisher, 1992, pp. 954-960
Branciard A., Huard P., Moss Ph. (1993) Nouveaux modes de coordination de
l'organisation productive : le cas du systme de sant, XVme journes des Economistes de la
Sant, Kremlin-Bictre, janv. 1994.
Callon M., Foray D. (1997) "Nouvelle conomie de la Science ou socio-conomie de
la recherche scientifique ?" Revue d'Economie Industrielle, 79.
Callon M. (1989) La science et ses rseaux, Ed. La Dcouverte.
Callon M. (1991) "Rseaux technico-conomiques et irrversibilits" in : Boyer, R.,
Chavance B., Godard O. (eds) (1991) Les figures de l'irrversibilit en conomie. EHESS.
Callon M. (1994) "Is science a public good ?", Science Technology and Human
Values, 19 (4).
Callon M., Foray D. (1998) "Inerties institutionnelles et performances technologiques
dans la dynamique des systmes d'innovation : l'exemple franais", Colloque IRIS
Changement institutionnel et dynamique de l'innovation, Paris, 2-4 dc. 1998.
Cohendet P., Heraud J.A., Zuscovitch E. (1992) "Apprentissages technologiques,
rseaux conomiques et appropriabilit des innovations" in : Foray D., Freeman C. (eds)
Technologie et richesse des nations. Economica.

37

Dasgupta P., David P. (1994) "Toward a New Economics of Science", Research

Policy, vol. 23, 5.
Ellul J. (1965) La socit technicienne.
Etzkowitz H., Leydesdorff L., eds (1997) Science policy dimensions of the triple
helix of University-Industry-Government relations, Special issue of Science and Public
Policy
Foray D. (1995) "Les brevets dans la nouvelle conomie de l'innovation" in : Basl
M., Dufourt D., Hraud J.A., Perrin J. (eds) Changements institutionnels et changements
technologiques. Evaluation, droits de proprit intellectuelle, systme national d'innovation.
CNRS.
Foray D., Freeman C., dir. (1992) Technologie et richesse des nations, Economica.
Guillaume H. (1998) Rapport de mission sur la technologie et l'innovation, mars
1998.
Hatchuel A. (1990) Production de connaissances et processus politiques dans la vie
des entreprises. Vers une thorie intgre. Communication au Congrs mondial de sociologie,
Madrid, juillet 1990.
Iribarne A. (d') (1990) La gestion de l'organisation et des ressources humaines
comme facteur stratgique de la production et de la diffusion de l'innovation, Revue
d'Economie Industrielle, 51.
Jobert B., Mller P. (1987) L'tat en action, PUF.
Julian-Reynier C. Moatti J.P. Bourret P. (1996) Vers une colonisation gntique de
la mdecine ? Sociologie et Socits, 2.
Kline S., Rosenberg N. (1986) "An overview of Innovation" in : Landau R.,
Rosenberg N. (eds) The Positive Sum Strategy. National Academy Press.
Lanciano C. Maurice M., Nohara H., Silvestre J.J. (1993) "L'analyse socitale de
l'innovation : gense et dveloppement". Document LEST-CNRS repris dans Lanciano et alii
(eds) (1999) Les acteurs de l'innovation et l'entreprise. L'Harmattan.
Lundvall B. (1988) "Innovation as a interactive Process" in : Dosi G. et alii (eds)
Technical Change and Economic Theory. Pinter.
Lundvall B. (ed) (1993) National Systems of Innovation. Towards a Theory of
Innovation and Interactive Learning. Pinter.
Maurice M et al. (1993) L'analyse socitale de l'innovation, Rapport Scientifique,
LEST, Aix en Provence.
Maurice M. Silvestre J.J. (1995) "Comment se construisent une innovation et une
dcision d'investissement dans un contexte de comptitivit ? Une analyse en termes de
rseau d'acteurs et d'espace de comptence". In : LEST (1995) La socit salariale crise et
recomposition.
Maurice M., Sellier F., Silvestre JJ. (1992) Politique d'ducation et organisation
industrielle en France et en Allemagne, PUF, Paris.
Moati P., Mouhoud E.M. (1994) Information et organisation de la production : vers
une division cognitive du travail, Economie Applique, 1.

38

Pavitt K. (1991) "What makes basic research economically useful ?", Research
Policy, 20.
Qur M., Ravix J. (1995) Procdure de dcouverte et dynamique de l'organisation
recherche-industrie, Communication la Confrence internationale sur la Connaissance dans
la dynamique des organisations productives, Aix en Provence.
Revue d'Economie Industrielle (1997), n 79, n spcial "L'conomie industrielle de
la science".
Roqueplo P. (1983) Penser la technique : pour une dmocratie concrte, ed. Le Seuil.
Willinger M., Zuscovitch E. (1993) Efficience, irrversibilits, et constitution des
technologies, Revue d'Economie Industrielle, 65.

BIBLIOGRAPHIE SPECIFIQUE
Acadmie des Sciences (1995) La brevetabilit du gnme, Rapport n 32.
Barral P.E. (1995) "Vingt ans de rsultats de la recherche pharmaceutique dans le
monde (1974-1994)", Rhne-Poulenc Rorer Fundation.
Bartoli F. (1998) "Systme national d'innovation et dynamique du secteur
pharmaceutique en France", Communication au colloque IRIS Changement institutionnel et
dynamique de l'innovation, Paris, 2-4 dc. 1998.
Bulletin de l'Acadmie Nationale de Mdecine, (1995), 179, n 3. Sance consacre
la prsentation du Rapport sur le diagnostic gntique et la thrapie gnique.
Cano J.P., Fischer A. (1994) Rapport du Groupe de rflexion sur la thrapie gnique.
Ministre de la sant.
Dumoulin J. (1994) "Innovations pharmaceutiques et rglementation : le paradigme
de l'explication", Economie Applique, vol. 46, n 1.
Huriet C. (1995-1996) "Garantir les conditions du dveloppement et la scurit
sanitaire des produits de thrapie gnique et cellulaire. Rapport du Snat, n 53.
Joly P.B. (1995) "A quoi serviront les brevets en biotechnologie ? Une analyse des
logiques de la transformation des droits de la proprit intellectuelle" in Changement
institutionnel et changement technologique, Basl M. Dufour D., Hraud J.A., Perrin J.
coord, ed. CNRS.
Jordan B. (1996) Gntique et gnme : la fin de l'innocence, ed. Flammarion.
Kahane B. Charity business et politiques de recherche sur la sant : comment lAFM
mobilise la recherche publique. ( paratre dans Sociologie du travail, 2000, vol. 42, n 1).
Maraninchi D., Cano J.P., Herv P. (1995) Thrapie cellulaire. Rapport au Ministre
de la Sant.
Martin P. (1995 "The American gene therapy Industry and the Social Shaping of a
new technology". The Genetic Engineer and Biotechnologist, vol. 5, n 2-3.
Morange M. (1994) Histoire de la biologie molculaire, Ed. La Dcouverte.

39

Paraponaris C. (1998) Pharmaceuticals, Document provisoire, Projet SESI, LEST.