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Componentes
3
8
Purina
N
3
NH
9
N
1
Pirimidina
Observe el amino en
C4 de la Citosina, el
metilo en C5 de la
Timina, y la ausencia
de grupo amino en el
Uracilo y la Timina
sustituido por un
grupo carbonilo
NH2
N
N
N
NH
Adenina: 6-amino purina
O
N
HN
H 2N
NH
P
U
R
I
N
A
S
NH2
Citosina: 2-oxi4-amino pirimidina
N
O
N
O
HN
O
N
O
CH3
HN
O
Uracilo: 2,4-dioxi
pirimidina
P
I
R
I
M
I
D
I
N
A
S
Tautomera.
Caso del Uracilo
Forma
ceto
O
HN
NH
Formas tautomricas
(ceto-enol) del uracilo
OH
Forma
enol
N
HO
PIRIMIDINAS
Xantinas
Algunas de ellas son intermediarios metablicos
en la degradacin de los cidos nucleicos:
La hipoxantina es una forma metablica de las
purinas, aunque ocasionalmente puede formar parte
de algunos RNAs.
Xantina Base prica formada por oxidacin de la
hipoxantina o por desaminacin de la guanina. Se
convierte a cido rico mediante la accin de la
Xantino-Oxidasa.
La forma degradativa final de las purinas en los
primates es el cido rico.
Hipoxantina:
6-oxi purina
O
N
HN
N
NH
Xantina:
2,6 dioxi purina
O
N
HN
O
NH
NH
cido rico:
2,6,8 trioxi purina
OH
N
N
HO
OH
N
NH
Productos naturales:
Metilxantinas
O
H 3C
O
N
N
CH3
Cafena
CH3
N
H 3C
NH
OH
N
N
N
CH3
Teofilina
NH
N
O
CH3
NH
CH3
Teobromina
Desde el punto de vista mdico y farmacolgico existen tres xantinas importantes que no se
hallan en los cidos nucleicos: la cafena, la teobromina y la teofilina que son tres xantinas
metiladas por lo que tambin se les conoce como metilxantinas. Son consideradas alcaloides
ya que son sustancias fisiolgicamente activas, contienen nitrgeno y se encuentran en
plantas; sin embargo, llegan a diferir de las bases alcaloideas en que son ligeramente
solubles en agua. La importancia concedida a estos compuestos deriva de la interpretacin
de su nombre: teobromina, "comida divina"; teofilina, "hoja de dioses" y cafena que viene de
la palabra rabe para designar el vino. Estos derivados de las purinas son poderosos
Inhibidores de la fosfodiesterasa del AMPc
Bases Modificadas
Las bases que constituyen los
cidos nucleicos pueden estar
naturalmente modificadas.
a) La Adenina y la Citosina se
encuentran a veces metiladas en
el DNA.
b) El tRNA contiene numerosas
bases modificadas.
Antimetabolitos
Anlogos sintticos de
bases: antimetabolitos
O
SH
N
N
N
NH
6-Mercaptopurina
Br
HN
O
5-Bromouracilo
O
N
H 2N
NH
2-Aminopurina
HN
H 2N
N
NH
8-Azaguanina
En el tratamiento del
cncer
Desaminacin de la Adenina:
O
NH2
N
HNO2
HN
+
N
NH
NH3
NH
NUCLESIDOS
Se le llama nuclesido a la molcula
formada por la unin covalente de una
pentosa con una base nitrogenada. Esta
unin se hace mediante un enlace
-glucosdico.
Si la pentosa es una ribosa, tenemos un
ribonuclesido. Estos tienen usualmente como
bases nitrogenadas a la adenina, la guanina, la
citosina y el uracilo.
Si la pentosa es una desoxirribosa, tenemos un
desoxirribonuclesido. Estos tienen como
bases nitrogenadas a la adenina, la citosina, la
guanina y la timina.
Forma Abierta-Ribosa
Forma Abierta
Forma Cclica
2-Desoxirribosa
-D-2-desoxirribofuranosa
Forma Cclica
-D-Ribofuranosa
NUCLESIDOS:
Son los compuestos formados por la unin de una
base nitrogenada con una pentosa a travs de un
enlace de tipo -N-glucosdico.
H 2N
PURINAS
N
HOCH2
OH
OH
Adenosina
(la pentosa es ribosa)
H 2N
Enlace
N -N-glucosdico
N
N
HOCH2
OH
Desoxiadenosina
(la pentosa es 2-desoxirribosa)
NUCLESIDOS:
Pirimidinas
NH2
N
HOCH2
OH
O
O
OH
Citidina,
la pentosa es ribosa
Enlace
-N-glucosdico
HOCH2
O
O
NH2
N
N
OH
H
Desoxicitidina,
la pentosa es 2-desoxirribosa
NUCLESIDOS NUMERACIN
H 2N
Enlace
-N-glucosdico
5'
HOCH2
4'
3'
BASE PURNICA
6
7N
5
4
8
N9
2
N
3
1'
2'
RIBOSA
OH
OH
N1
O
HN
5'
HOCH2
O
N
4'
1'
3'
OH
2'
OH
Uridina
-1-ribosil - N1 - Uracilo
4
3
Conformacin de nuclesidos
Adenosina (anti-)
Adenosina (syn-)
N
HO
CH2
5'
O
1'
3'
OH
2-desoxi-Adenosina,
Adenosine un nuclesido
Nuclesidos de Purinas
Nuclesidos de Pirimidinas
Nuclesidos de Adenina
Nuclesidos de las
Pirimidinas
Propiedades qumicas de
los nuclesidos
1. Incremento marcado en la
solubilidad en agua con respecto a la
solubilidad de las bases aisladas.
2. Reacciones propias de la pentosa:
reaccin del orcinol en el caso de los
ribonuclesidos y de la difenilamina en
el caso de los desoxirribonuclesidos.
3. La absorcin a 260 nm se conserva
igual a la de las bases aisladas
Nuclesidos: Funciones
Puromicina
Cordicepina
La desoxiadenosina, tambin conocida como cordicepina es un derivado del
nuclesido adenosina, del que se diferencia por carecer del grupo 3'-hidroxilo
en su anillo de ribosa. La desoxiadenosina fue inicialmente extrada de un
hongo del gnero Cordyceps, pero actualmente se sintetiza artificialmente.
Por su estructura similar, algunas enzimas no pueden discriminar entre este
compuesto y la adenosina. Debido a ello puede participar en ciertas
reacciones. por ejemplo, ser incorporado a una molcula de RNA, causando en
consecuencia la terminacin prematura de su sntesis.
Posee tambin algunas propiedades interesantes como un agente contra virus
y hongos por su habilidad como inhibidor de algunas proten-cinasas.
Pseudouridina
HN
La Pseudouridina (representada por la letra griega
psi- ) es el ismero C-glucsido de la uridina. Es la
O
NH
ms frecuente de las cerca de cien diferentes bases HOCH
2
O
modificadas que se encuentran en el RNAt.
La se encuentra en todas las especies y puede
encontrarse en muchas clases de RNA, incluyendo el
Enlace C-C en lugar
RNAm. se sintetiza por las enzimas llamadas
del C-N habitual
sintasas, las cuales de manera post-transcripcional
OH
OH
isomerizan residuos especficos de uridina en un
proceso del RNA que se ha llamado pseudouridilacin.
Retrovir o AZT (Zidovudina) pertenece a una clase de
medicamentos anti-VIH llamados inhibidores nuclesidos de la
transcriptasa reversa (INTR), tambin conocidos como
anlogos nuclesidos o "nukes" (en ingls). Retrovir y los
dems INTR bloquean la Transcriptasa Reversa, una enzima
que el VIH necesita para hacer ms copias de s mismo. La
inhibicin de esta enzima puede retrasar el avance del VIH.
Nuclesidos
Insistamos: Qu son los nuclesidos?
Los Nuclesidos son N-glucsidos en los
cuales un nitrgeno de las bases pricas o
pirimdicas (el N-1 en las pirimidinas y el
N-9 en las purinas) est enlazado al
carbn anomrico, C-1 de la ribosa, o de
la desoxirribosa segn corresponda, por
medio de un enlace covalente -Nglucosdico.
Nucletidos
Los nuclesidos pueden combinarse con un
grupo fosfrico (cido fosfrico: H3PO4)
mediante determinadas quinasas de la clula,
produciendo derivados fosforados de los
nuclesidos, los Nucletidos.
Los nucletidos, adems de desempear
algunas funciones de importancia trascendental
para el funcionamiento celular, son los
componentes moleculares bsicos del DNA y el
RNA.
Estructura monomrica
de los cidos nucleicos
Los cidos nucleicos son
biopolmeros formados
por unidades monomricas llamadas nucletidos.
Las molculas formadas
por la unin de la base
nitrogenada con la
pentosa reciben el
nombre de Nuclesidos
Los nucletidos estn
formados por la unin de:
Una base
nitrogenada
Una pentosa
cido fosfrico
NH2
N
O
-
O P O CH2
O-
OH
OH
Pentosa
Fosfato
Base
Nuclesido
Nucletido
Los nucletidos se
unen para formar el
polinucletido por
uniones fosfodister
entre el carbono 5' de
un nucletido y el
carbono 3' del
siguiente.
Nucletidos
Los
Ribonucletidos:
estructura bsica
Nucletidos
Cuando alguno de los -OH de la pentosa de un
Nucletidos
(ribonucletidos)
NH2
NH2
N
N
O
-
O-
OH
O P O CH2
NH2
OH
HOCH2
O
N
OH
-
5-nucletido
(5-CMP)
HOCH2
OH
O P O
O P O-
O-
O-
3-nucletido
(3-CMP)
2-nucletido
(2-CMP)
La unin del fosfato a la ribosa para formar un nucletido monofosfato a partir de un nuclesido, puede verificarse en cualquiera
de los tres grupos hidroxilos libres de la pentosa.
Nucletidos
(desoxirribonucletidos)
O
HN
O
-
O P O CH2
O-
5-dTMP
OH
HN
CH3
O
HOCH2
O-
3-dCMP
Desoxirribonucletidos
A pesar que tanto el DNA como el
RNA son molculas estables, el
DNA lo es mucho ms.
Esto ocurre por la utilizacin de
desoxirribonucletidos en vez de
ribonucletidos en su sntesis,
aunque no exclusivamente por esa
razn.
El RNA, debido a que tiene ribosa y
posee el grupo hidroxilo, es
susceptible a hidrlisis catalizada
por bases.
Si el grupo 2'-OH es eliminado de
la molcula, la tasa de hidrlisis del
RNA baja unas 100 veces en
condiciones neutras.
De esta manera, es posible pensar
que la remocin del grupo hidroxilo
en la ribosa fue un agente vital para
permitir la complejidad de los
organismos que vemos hoy en da.
Nucletidos cclicos
NH2
N
N
O
O O
-
OH
O
Una variedad particularmente importante de nucletidos
es la de los nucletidos cclicos, en los cuales se forma un
enlace fosfodister dentro de la misma pentosa formndose un
anillo. En la figura se ejemplifica esto con la estructura del 3, 5
Adenosin monofosfato cclico, AMPc.
NH2
N
O
-
5-Adenosina
monofosfato, AMP
O P O CH2
-
OH
NH2
OH
N
O P O P O CH2
-
5-Adenosina
difosfato, ADP
OH
NH2
OH
N
O
-
O P O P O P O CH2
-
OH
5-Adenosina
trifosfato, ATP
OH
Nucletido polifosfatos
O
O P O CH2
O-
O P O P O
O-
O-
Propiedades de los
nucletidos
1. Carcter cido debido al fosfato
2. Solubilidad incrementada respecto al nuclesido
3. Mximo de absorbancia UV a 260 nm
4. Conserva las propiedades reactivas debidas a
las bases y a la pentosa de los nuclesidos
NOMENCLATURA
Base
Nuclesido
Nucletido
Adenina
Guanina
Hipoxantina
Adenosina
Guanosina
Inosina
. Adenlico
. Guanlico
Citosina
Uracilo
Timina
Citidina
Uridina
Timidina
. Citidlico
. Uridlico
. Timidlico
ATP
ATP
NH2
N
O
-
O P O P O P O CH2
-
ATP
OH
OH
NH2
N
O
-
O P O P O P O CH2
-
ATP
OH
OH
H 2O
G = -7.6 kcal/mol
NH2
Pi
O
O P O P O CH2
-
ADP
OH
OH
ATP como
donador de energa
NUCLETIDOS NO
NUCLEICOS
No forman parte de los cidos nucleicos, se encuentran libres en
las clulas e intervienen en el metabolismo
El AMP cclico acta como segundo mensajero, activa a una protencinasa dependiente de nucletidos
cclicos, la Protencinasa A, la cual cataliza la fosforilacin de las protenas, cambia su conformacin y
altera su actividad.
Un ejemplo tpico es la activacin de la fosforilasa cinasa en el hgado por la adrenalina a travs del
AMPc y de la Protencinasa A.
El AMP cclico es inactivado por una Fosfodiesterasa.
El NAD y el FAD
Coenzima A
Pantetena
ADP
H
HS
C
O
H HO H
O
O
N
O P O P O CH2
C
OOO H3C CH3
H
H
OH
NH2
H
H
OH
S-adenosil
metionina, SAM
HOCH2
O
HN
O
O
OH
O P O P O CH2
OH
OH
O-
O-
OH
OH
NH2
N
CH3
H 3C N +
CH3
O-
OH
OH