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Commandes usuelles de R
J. Chiquet, janvier 2010
data.frame
Cration de donnes
c(...) fonction gnrique combinant une suite dlments en
un vecteur
Extraction de donnes
Indexation des listes
x[n]
une liste avec les lments de n
x[[n]]
le ne lment de la liste
x$name,x[["name"]] llment "name"
Indexation des vecteurs
x[n]
ne lment du vecteur
x[-n]
tous les lments sauf le ne
x[1:n]
n premiers lments
x[-(1:n)]
tous les lments sauf les n premiers
x[c(1,4,2)]
lments 1,4 et 2
x["name"]
lment(s) de nom "name"
x[x > 3]
tous les lments plus grands que 3
x[x > 3 & x < 5] tous les lments compris entre 3 et 5
Indexation des matrices
x[i,j]
lment de la ie ligne et je colonne
x[i,]
ie ligne
x[,j]
je colonne
x[,c(1,3)]
colonnes 1 et 3
x["name",]
lignes intitules "name"
x[rowSums(x)>10,] lignes dont la somme est suprieure 10
Variables et attributs
as.array(x),
as.data.frame(x),
as.numeric(x),
as.logical(x), as.character(x), . . . conversion
de type
Mathmatiques
abs, sqrt, sin, cos, tan, asin, acos, atan, atan2, log, log10,
exp, . . . fonctions mathmatiques lmentaires
max(x), min(x), range(x), sum(x), diff(x), prod(x),
mean(x), median(x), sd(x) maximum, minimum, amplitude, somme, diffrences, produit, moyenne, mdiane, cart-type
quantile(x,probs=) fractiles des lments de x
weighted.mean(x, w) moyenne de x pondre par w
var(x), cov(x) variance empirique corrige; si x est une matrice, renvoie la matrice de variance-covariance
cor(x) matrice de corrlations de x
var(x, y), cov(x, y) covariance entre x et y, ou entre les
colonnes de x et de y si ce sont des matrices ou des
tableaux
cor(x, y) idem pour la corrlation linaire
round(x, n) arrondit les lments de x n dcimales
scale(x) centre et rduit les donnes x; pour centrer et/ou rduire uniquement, utiliser les scale et/ou center
pmin(x,y,...), pmax(x,y,...) un vecteur dont le i e lment est le minimum (resp. maximum) entre x[i] et
y[i]
cumsum(x) un vecteur dont le i e lment est la somme des i
premiers lments de x
le min, le max
partie relle,
partie imaginaire, module, argument et conjugu dun
nombre complexe
convolve(x,y) calcule de convolution entre deux squences
fft(x), mvfft(x) transformation de Fourier dune matrice,
resp des colonnes dune matrice
filter(x,filter) application dun filtre linaire chaque
lment dune suite x
Matrices
rowSums(x),
Traitements avancs
apply(x,INDEX,FUN=) renvoie un vecteur ou une liste de
valeurs obtenues en appliquant la fonction FUN aux lments de la dimension INDEX de x
lapply(x,FUN) applique FUN aux lments dune liste
tapply(x,INDEX,FUN=) applique FUN chaque groupe du
tableau X dfini par les indices INDEX
by(data,INDEX,FUN) applique FUN au tableau de donnes
data dcoup via INDEX
ave(x,...,FUN) applique FUN chaque sous-ensemble de x
dfinis par des facteurs
Chanes de caractres
paste(...) concatnation de vecteurs aprs conversion en
caractres
match(x,table) un vecteur renvoyant les positions o les lments de x ont t pour la premire fois rencontrs dans
table
x %in% table identique, mais renvoie un vecteur de boolens
pmatch(x,table) appariement partiel des lments de x
parmi table
nchar(x) nombre de caractres de x
Graphiques et figures
x11(), windows() ouvre une nouvelle fentre graphique
pdf(), png(), jpeg(), bitmap(), xfig(), pictex(),
postscript() pilote graphique produisant des sorties
dans des fichiers plutt qu lcran
termplot(mod.obj) trace les termes dun modle de rgression en fonction des prdicteurs
y1 et y2
polygon(x, y) trace un polygone en liant les points de coordonnes dfinies dans les vecteurs x et y
legend(x, y, legend) ajoute une lgende au point (x,y)
spcifi par legend
title() ajoute un titre et ventuellement un sous-titre
axis(side) fonction de bas niveau pour grer les axes de la
figure
box() trace un cadre autour de la figure courante
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* *
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.
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X X a a ? ?
optim(par, fn) mthode doptimisation gnrique minimisant la fonction fn en partant de la valeur par des
coefficients
1 2
16 17
Distributions
Toutes les fonctions suivantes peuvent sutiliser en remplaant la
lettre r avec d, p ou q pour obtenir, respectivement, un tirage de
n ralisations dune variable alatoire, la densit de probabilit,
la fonction de rpartition, et la valeur des fractiles.