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Archivo para la categora 'Nanotecnologa y Salud'
NOMFET, el transistor-neurona
CREADO EL MARZO 6, 2010 POR ADMIN
ARCHIVADO BAJO GENERALES, NANOMATERIALES Y NANODISPOSITIVOS, NANOTECNOLOGA Y SALUD
Entre las estrategias de desarrollo de nuevos mtodos de procesar la informacin, un enfoque consistira en imitar la manera en que
funcionan los sistemas biolgicos para producir circuitos electrnicos con nuevas caractersticas. En el sistema nervioso, la sinapsis es la
unin entre dos neuronas, que permite la transmisin de mensajes de una a otra y la adaptacin del mensaje en funcin de la naturaleza de
la seal recibida (plasticidad). Por ejemplo, si una neurona recibe pulsos de alta frecuencia mediante sinapsis, se transmitir un potencial de
accin ms intenso. Por el contrario, si los pulsos estn ms espaciados en el tiempo, el potencial de accin ser ms dbil. Es esta
plasticidad la que los investigadores han podido simular con xito mediante el NOMFET.
El transistor CMOS (Complementary Metal-Oxide Semiconductor), bloque bsico de construccin de un circuito electrnico integrado, se
puede utilizar como un interruptor (puede transmitir o no una seal) adems de ofrecer otras numerosas aplicaciones (amplificacin,
modulacin, codificacin, etc.)
La gran innovacin introducida por el NOMFET parte de la combinacin de un transistor orgnico con nanopartculas de oro. Las
nanopartculas son encapsuladas, fijadas al transistor y recubiertas con un compuesto orgnico denominado pentaceno adquiriendo un efecto
memoria que les permite imitar lo que sucede en una sinapsis durante la transmisin de la seal elctrica. Esta propiedad, por tanto, hace
que el componente electrnico sea capaz de evolucionar en funcin del sistema en el que se coloca, haciendo que su rendimiento sea
comparable al de siete transistores CMOS, necesarios hasta ahora para simular esta plasticidad.
Los dispositivos producidos se han optimizado para tamaos nanomtricos, a fin de ser capaces de integrarlos a gran escala. Los
ordenadores inspirados en esta tecnologa, a diferencia de los ampliamente extendidos ordenadores de silicio, son capaces de funciones
similares a las del cerebro humano, ya que pueden resolver problemas mucho ms complejos, como el reconocimiento visual.
Dominique Vuillaume, investigador del Instituto de Electrnica, Microelectrnica y Nanotecnologa del CNRS y uno de los autores del estudio,
afirma que el objetivo del NOMFET es conducir a una respuesta colectiva como la que puede proporcionar una red neuronal integrada por
mltiples informaciones, lo que dara lugar a sistemas tan flexibles que puedan ser programados por aprendizaje
Referencias:
http://www.sott.net/articles/show/202082-An-Organic-Transistor-that-Mimics-a-Brain-Synapse
http://www.informador.com.mx/tecnologia/2010/174535/6/nomfet-un-transistor-que-imita-neuronas.htm
An organic-nanoparticle transistor behaving as a biological spiking synapse , estudio publicado en la edicin del 22 de enero de 2010 de la
revista Advanced Functional Materials
Por Gurkhy
Es lgico pensar que a medida que la nanotecnologa se acerca al consumidor general, ste comience a mostrar cierta curiosidad por los
beneficios, y sobre todo por los riesgos que puede suponer para l. El desconocimiento sobre la materia no ayuda mucho a la integracin de
la nanocomida en la vida cotidiana.
Segn el artculo "The Development of regulations for food nanotechnology" (2007) el riesgo que implica la nanotecnologa aplicada a la
comida est an por evaluar y no se tienen datos (a fecha de publicacin del artculo) concluyentes en muchos campos. Adelantndose a una
regulacin definitiva y unos datos fiables, el Comit de seguridad Qumica de la Sociedad Americana de Qumica ha publicado unas guas y
recomendaciones para el apropiado manejo de nanomateriales en el laboratorio.Los autores plantean tres posibles rutas de entrada en el
organismo humano para las nanopartculas:
Exposicin Drmica
El impacto de los nanomateriales en el cuerpo depende de su habilidad para penetrar a travs de las capas externas protectoras y alcanzar la
epidermis o la dermis. Por ejemplo, ciertas microesferas fluorescentes pueden penetrar hasta alcanzar la dermis, mientras que nanopartculas
de dixido de titanio con un dimetro de unos 20 nm podran llegar a traspasar la piel e interactuar con el sistema inmune.
Hay, no obstante, muy poca informacin sobre los peligros de los nanomateriales que entran en contacto con la piel, y estas discusiones, a
fecha del informe, son meras especulaciones.
Inhalacin
Cualquier material slido con un dimetro de menos de 10 micras puede pasar a travs de la cavidad nasal y alcanzar los pulmones.
Partculas ms pequeas que 4 micras tienen grandes posibilidades de penetrar en la regin alveolar. Cunto ms pequea es una partcula,
ms probabilidades tiene de penetrar ms profundamente en los pulmones. El tamao de la partcula, su masa, la composicin qumica y los
cocientes de adhesin determinan su toxicidad pulmonar o sus efectos patognicos.
Cuando se inhalan ciertas partculas (por ejemplo dixido de titanio, nanotubos de carbono, etc.) se pueden acumular en los pulmones e
inducir enfermedades crnicas como inflamacin pulmonar, neumona, granuloma pulmonar, etc. Una vez la partcula ha alcanzando el
torrente sanguneo es capaz de llegar al cerebro. No obstante, hasta el momento del informe no se han llegado a conclusiones definitivas
sobre la toxicidad considerando nicamente el tamao de las nanopartculas.
Ingestin
El tamao de la partcula y el rea superficial son caractersticas importantes de un material desde una perspectiva toxicolgica. Las
nanopartculas pueden prolongar drsticamente el tiempo de permanencia de ciertos compuestos en el tracto gastrointestinal haciendo
disminuir la eficacia de los mecanismos de depuracin y proteccin internos. Algunas nanopartculas son capaces de penetrar profundamente
en los tejidos a travs de los capilares ms finos, permitiendo la absorcin efectiva de compuestos en ciertos objetivos del organismo,
adentrndose as en el campo de la nanomedicina. Partculas mayores que una micra son incapaces de penetrar a travs de la mucosa
intestinal, pero las nanopartculas se encuentran por debajo de este tamao.
Los potenciales riesgos de la nanotecnologa aplicada a la comida estn an por determinar, ya que en la propia naturaleza encontramos
numerosas nanopartculas sin intervencin alguna del hombre: protenas y polisacridos son ejemplos de ello. An permanece indeterminado
si las propiedades fsicoqumicas de los nanomateriales implicarn nuevos mecanismos y daos impredecibles al cuerpo humano.
Por otro lado, la reduccin de las dimensiones de los materiales a escalas nanomtricas no tiene porqu ser necesariamente perjudicial.
Algunos estudios muestran que ciertas substancias tpicamente txicas, como por ejemplo el selenio, muestran menos toxicidad cuando se
reducen a tamao nanomtrico. Los nanotubos de carbono puros administrados en la trquea de ratones producen la muerte inmediata,
mientras que si se dopan con nitrgeno se reduce su peligrosidad.
Enlaces de inters
Artculo "The Development of regulations for food nanotechnology", Chi-Fai Cahu, Shiuan-Huei Wu, Gow-Chin en (2007):
http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6VHY-4N1466T3&_user=885410&_rdoc=1&_fmt=&_orig=search&_sort=d&_docanchor=&view=c&_acct=C000047353&_version=1&_urlVersion=0&_userid=8
85410&md5=e44997daa37d14e2b0e479fc83ed707f
El proyecto CORDIS ofrece una amplia lista de referencia sobre seguridad en la nanotecnologa:
http://cordis.europa.eu/nanotechnology/src/safety.htm
Podemos encontrar un informe del proyecto CORDIS, "Particle Risk", en:
ftp://ftp.cordis.europa.eu/pub/nanotechnology/docs/particle-risk.pdf
El portal Nanosafe ofrece grandes cantidades de informacin sobre este campo:
http://www.nanosafe.org
Por Gurkhy
Es un hecho que la aplicacin de la nanotecnologa a los alimentos est creciendo rpidamente. Una prueba de ello son los muchos artculos
que se han publicado sobre el tema, no slo en revistas especializadas, si no tambin en pginas dirigidas a un pblico ms general, como el
Newsletter de supermercados Eroski. Las ventas mundiales de "nanotechnology products" para el envasado de comida y bebida fueron de
860 millones de dlares en 2004 respecto a los 150 millones de 2002. En el ao 2000, Kraft Foods puso en marcha su propio laboratorio de
nanotecnologa, apostando por la innovacin en el mercado de las bebidas.
Todo esto ha llamado la atencin de los gobiernos y de las empresas privadas, ya que es un hecho que la regulacin de la nanotecnologa
todava no est dirigida a su uso en los alimentos.
Para alcanzar una regularizacin universal de estos productos hace falta llegar a un consenso sobre factores como el tamao de la partcula,
procesado, propiedades fsicoqumicas, seguridad y riesgos. Tambin es necesario comprender que la nanotecnologa generar aplicaciones
que involucrarn diversas agencias de control y regulacin.
En un artculo del 2006 publicado por la Information Systems for Biotechnology (ISB), organizacin que se encarga de proporcionar
informacin sobre las ventajas y riesgos de la biotecnologa en la agricultura y el medio ambiente, se habla de los nuevos avances que se
estn produciendo en el campo de la industria alimentaria gracias a la incorporacin de la nanotecnologa, y de la necesidad de establecer un
mecanismo regulador (Jones, P.B.C. "A revolution in agriculture and the food industry", (2006)).
En "The development of regulations for food nanotechnology", C-F. Cahu, S-H. Wu y G-C. Yen proponen diferentes criterios a tener en cuenta
en el momento de realizar la regulacin de la "nanocomida". Algunos de los puntos clave son:
1. Tamao de la Partcula
Cul es el lmite para la nanocomida?
Qu tipo de tcnicas de anlisis se utilizan para medir estas partculas?
En qu momento del procesado del producto debe medirse el tamao de la partcula?
2. Propiedades Fsicas y Qumicas
Los materiales de la nanocomida son naturales o artificiales?
Sern asimilados y metabolizados por el organismo humano los productos con nanopartculas de igual manera que los productos convencionales?
Considerar las propiedades mecnicas, trmicas, estabilidad del pH, concentracin, masa, solubilidad, etc.
3. Procesado
Son los nanomateriales producidos mediante la sntesis a partir de materiales ms elementales (proceso "bottom-up") o a partir de la reduccin un material grande
mediante troceo y separacin hasta llegar a la nanoescala (proceso "top-down")?
Debido a la alta capacidad de adsorcin de la superficie de estos materiales, hay compuestos dainos generados al final del proceso?
4. Seguridad
Son los nanomateriales modificados qumicamente?
Se los considera una nueva substancia?
Considerar los peligros de la acumulacin de nanomateriales en el organismo humano.
Nanotecnologa hmeda
CREADO EL OCTUBRE 23, 2009 POR ADMIN
ARCHIVADO BAJO NANOMATERIALES Y NANODISPOSITIVOS, NANOTECNOLOGA Y SALUD, NANOTECNOLOGA, COMO LA VIDA MISMA...
Estas nanoestructuras de viejo cuo han demostrado su utilidad en un medio complejo y en cierto sentido lleno de desafos: la disolucin
acuosa. El agua tiene una serie de particularidades que la hacen nica. Es un medio de elevada densidad y elevado calor especfico,
constituido por molculas de un tomo de oxgeno y dos de hidrgeno. La elevada electronegatividad del oxgeno y la baja electronegatividad
del hidrgeno la convierten en una molcula altamente polar. Las molculas cargadas o polares en el agua se solvatan con muchsima
facilidad; las molculas en disolucin no se encuentran ordenadas sobre una superficie, donde es fcil llevar una "cuenta" de aquellas que
han sido ya intervenidas y cules no. El agua lquida se encuentra por definicin por encima de los 0C de temperatura; esta energa calorfica
dota a las molculas en disolucin de un movimiento espontneo y aleatorio, el movimiento browniano, que tiende a distribuirlas al azar por
toda la disolucin. El problema es que todas las estructuras vivas realizan sus funciones en una matriz de agua lquida, a temperatura
ambiente. En estas circunstancias las herramientas ptimas son aquellas mejor adaptadas a estas condiciones.
El mejor ejemplo a la hora de abordar las interacciones entre estos polmeros y el agua son las protenas. Las protenas son cadenas de
aminocidos en las cuales el grupo amino de un aminocido se une al grupo carboxilo del aminocido siguiente, quedando libres un grupo
amino en un extremo de la molcula y un grupo carboxilo en el extremo opuesto. Puesto que cada carbono tiene cuatro enlaces, cada
aminocido tiene dos enlaces libres; generalmente uno de ellos es un hidrgeno y el otro un grupo funcional ms o menos largo; si en este
grupo funcional slo hay tomos de carbono y de hidrgeno, ste ser relativamente apolar. Si hay otros tomos como oxgeno, nitrgeno o
azufre, este grupo ser relativamente polar. En los pptidos se da giro libre entre los enlaces de la cadena principal, por lo que en disolucin
acuosa, la protena tender a "esconder" sus zonas apolares entre los repliegues de la molcula y a "exhibir" sus zonas polares al entorno
acuoso; estas zonas polares establecern enlaces de hidrgeno con el agua. Esta diferencia de comportamientos entre aminocidos
modificar la forma de la protena, hacindola adoptar su estructura terciaria. En la naturaleza, las protenas funcionales lo son no tanto por
las propiedades de la cadena de aminocidos que las compone sino por la forma que adoptan por interaccin con las molculas de agua en
disolucin. Es pues una nanoestructura especializada en el funcionamiento en disolucin acuosa.
Esto nos da una nueva visin sobre las ciencias tradicionales que utilizan protenas con fines especficos, como la enzimologa; realmente es
una forma de nanotecnologa hmeda. En combinacin con la nanotecnologa de materiales, base de la nanotecnologa seca, ha dado ya
lugar a mltiples avances, especialmente en aplicaciones biomdicas. Un ejemplo llamativo es la bacteriorrodopsina programable, que puede
activar un comportamiento auttrofo en una halobacteria cuando la concentracin de oxgeno desciende hasta el punto de que la bacteria no
puede mantenerse en su forma hetertrofa.
Sin embargo, las funciones de los nanosistemas hmedos no se limitan al campo de la salud. Se han conseguido disear, por ejemplo,
ordenadores de ADN basados en las uniones especficas de stos, cadena a cadena y en matemtica combinatoria.
Para lograr su objetivo, los cientficos equiparon el nuevo material por un lado con molculas capaces de identificar las clulas tumorales y
de unirse a ellas y otras que se activan antes de ser inyectadas y fluorecer al ser observadas con luz infrarroja. De esta forma se puede
saber dnde se encuentra el rea afectada por el cncer y el tamao exacto que tiene el tumor. Se puede llevar a cabo un seguimiento
completo del nanomaterial introducido desde el primer momento hasta su completa degradacin.
Enlace de inters:
http://postadental.cl/?p=28
Originalmente la tinta detectora de sodio se ide para permitir el seguimiento de este elemento a travs de diferentes procesos, como la
sinapsis y los latidos del corazn. La reaccin entre una molcula de pigmento y un ion de sodio hace que aquella se vuelva fluorescente
cuando se le aplica radiacin infrarroja. De este modo puede monitorizarse los cambios de concentracin a travs de las clulas e inferir as
su recorrido a travs del proceso.
Tras el xito en las pruebas con ratones decidieron cambiar el enfoque y ver si eran capaces de fabricar un sensor que permitiera conocer de
forma rpida y sencilla la concentracin de glucosa de una persona. De momento los resultados parecen prometedores. Se ha conseguido
una tinta que cambia de un color violeta en ausencia de glucosa a amarillo cuando la concentracin es alta. Para un nivel adecuado de
glucosa el tono se torna anaranjado. Sin embargo, an faltan ciertas cuestiones por responder, como, por ejemplo, si el nivel de glucosa en
la piel es realmente indicativo de su nivel en sangre, o si bien presenta un retardo; o que las nanopartculas no provoquen ningn tipo de
respuesta inmune en seres humanos, que alterara significativamente el nivel de glucosa en sus alrededores, falseando la medida.
Puede que an quede un largo camino que recorrer para alcanzar los tpicos de la ciencia ficcin, sin embargo los primeros pasos en dicha
direccin ya estn dados, y parecen pasos firmes y decididos. Por otro lado, este tipo de tecnologa suscita otras cuestiones menos
agradables. Por ejemplo, llegaremos a hablar de nanodoping en deportistas, de forma similar al dopaje tcnico que se est planteando
ahora con los trajes de bao en la natacin? El tiempo lo dir.
Enlaces de inters:
o
http://www.technologyreview.com/biomedicine/22014/
http://dsc.discovery.com/news/2009/02/12/diabetes-tattoo.html
http://www.draper.com/nanosensor/documents/nl0707860.pdf
Por Gurkhy
La Nanotecnologa, nuestro superhroe favorito, se enfrenta a una nueva misin: la comida; y para superarla debe vencer a un enemigo
nada duro de roer: el consumidor.
El consumidor habitual, los hombres y mujeres que pueblan los supermercados no estn familiarizados con el lenguaje ni los entresijos de la
ciencia. Cuando necesitan pan, piensan en harina y agua y ni pueden llegar a imaginarse a miles de nanocpsulas de aceite de pescado
viviendo en una rebanada de Bimbo.
Por eso los estudios ahora se enfocan en dos direcciones. Primero, desarrollo de nanopartculas en la alimentacin, y segundo, asegurarse
de que los consumidores entienden las ventajas del producto, algo que une estrechamente la ciencia con el marketing.
Segn el estudio realizado por M. Siegrist del Institute for Environmental Decisions (Zurich) y sus colaboradores de otras instituciones Suizas,
el problema se puede explicar a travs del siguiente esquema:
Es decir, la percepcin que el consumidor tiene de las nanopartculas en la alimentacin afectar al beneficio que percibe de estos productos
y tambin al riesgo. De ambas cosas depende su predisposicin a consumir este tipo de artculos.
Por eso la educacin del futuro cliente es fundamental. Las empresas que estn invirtiendo en esta rama de la nanotecnologa deben
asegurarse de que entienden correctamente las ventajas e inconvenientes, y eliminar los rumores infundados aportando mucha informacin,
o se arriesgan a perder una cantidad de dinero importante. Un ejemplo lo tenemos en Supermercados Eroski, que informan a sus clientes
sobre estos avances a travs de su newsletter .
Por Gurkhy
La nanotecnologa est presente en nuestra vida diaria de una manera mucho ms importante de la que imaginamos. Prueba de ello es el
artculo elaborado por el departamento de Ciencia alimenticia y Biotecnologa de la Universidad Chung Hsing (Taiwan) y divulgado por la
publicacin Trends in food Science & Technology , que da cuenta de algunas de las aplicaciones de esta rama de la ciencia en un sector tan
fundamental como el de la alimentacin.
En concreto, se enumeran usos en hasta cuatro mbitos diferentes:
Procesamiento de comida:
Diseo de colores y sabores: Cmo hacer un zumo ms sabroso o ms atractivo a los ojos del consumidor? Aadiendo
nanocpsulas que luego estallan. En este caso la clave es saber cules deben estallar, cundo y con qu frecuencia, para que la mezcla de
colores sea la deseada y no nos encontremos con un batido de color sospechoso y sabor extravagante
Purificacin de agua: Con la ayuda de nanomembranas. Eso favorecera especialmente a los pases en desarrollo, ya que la
desalinizacin y el reciclaje del agua seran mucho ms baratos con esta tcnica segn han demostrado cientficos de la Universidad de
California con el diseo de una membrana que necesita menos energa para que el agua sea bombeada a travs de ella.
Desarrollo de hierbas medicinales: Extraccin de los principios activos de las plantas medicinales y encapsulacin de los
o
mismos.
o
o
Refinar el aceite usado: Un nanodispositivo cataltico consigue refinar el aceite ya usado para frer.
Protenas de leche: La alfalactoalbmina, una protena de la leche, permite formar nanotubos para la nanoencapsulacin de
molculas que se quieran incorporar a algunos alimentos, como por ejemplo las explicadas en los puntos anteriores. Tambin se pueden
utilizar para hacer gelatinas, soluciones viscosas, etc.
Envasado de comida:
o
Plata, TiO2, SiO2: Se pueden aadir nanopartculas de estos elementos en los materiales de envasado para incrementar la
resistencia al calor, proteger los alimentos de los microbios, de la luz ultravioleta. Tambin pueden hacer los materiales ms o menos
permeables.
Nanocompuestos de nylon: Se utilizan para botellas de cerveza y otras bebidas alcohlicas. Su objetivo es evitar que se
evapore y conservar su frescura.
Nutraceutical delivery:
o
o
Seguridad y deteccin:
o
Un nanocantilever recubierto de protenas, que por naturaleza vibra a una determinada frecuencia, es una nueva clase de sensor
de silicona extremadamente pequeo para la rpida deteccin de virus y bacterias. Cuando una bacteria llega al dispositivo, ste comienza a
vibrar con una frecuencia distinta, lo que facilita su localizacin.
Esta informacin ayudar a ganar eficiencia a la hora de eliminar tumores, segn Babak Ziaie, investigador del Birck Nanotechnology Center.
Ziaie ha liderado el equipo que ha estado testando este prototipo de "micro-dosmetro pasivo implantable inalmbrico" y asegura que en 2010
podr empezar a ser probado clnicamente.
Aunque los tcnicas convencionales basadas en imgenes proporcionan la posicin del tumor durante la terapia, son procedimientos muy
caros y que muchas veces requieren rayos X, que usados asiduamente pueden daar el tejido. Por el contrario, este dispositivo usa
identificacin por radio frecuencia (RFID en ingls), que no emite rayos-X dainos.
El dispositivo, que no tiene bateras y ser activado por bobinas elctricas situadas cerca del paciente, es una versin en miniatura de los
dosmetros que llevan consigo los operarios que trabajan en lugares donde hay radioactividad.
El mismo grupo de ingenieros ya present una primera versin de este dispositivo inalmbrico en 2006. Aquel primer prototipo, a pesar de
tener la sensibilidad adecuada, era demasiado grande y no permita ser implantado fcilmente. Era muy parecido al circuito que encontramos
en una radio y fue un buen ejemplo de un sistema microelectromecnico, o pequeo dispositivo mecnico fabricado con procesos vinculados
a la fabricacin de elementos electrnicos.
La versin que ahora se presenta ha permitido reducir considerablemente su tamao y desarrollar un dosmetro ms sensible, pudiendo ser
implantado usando una inyeccin convencional. Los investigadores han probado el prototipo con cobalto radioactivo.
Los trabajos continuarn, ya que la finalidad ahora es encontrar un modo de simplificar y abaratar el proceso de fabricacin del dispositivo. El
diseo actual parece facilitar bastante este proceso, ya que no requiere la presencia de intrincados circuitos, lo que lo convierte en una
tecnologa fcil y barata.
El tamao del diseo presentado es de alrededor de 2,5 milmetros de dimetro y dos centmetros de largo. Estas medidas son lo
suficientemente reducidas como para caber en una aguja e inyectarlo directamente en el tumor, pero los ingenieros trabajan ya en reducir
todava ms su tamao, hasta alcanzar el de un grano de arroz (medio milmetro de dimetro por un centmetro de largo).
Los proyectos multidisciplinares llevados a cabo hasta el momento para tratar de llevar a la prctica los avances para diagnosticar, tratar y
prevenir el cncer, son los siguientes:
Prevencin y Control del Cncer
o
recogidos para su anlisis en el laboratorio o analizados en ese mismo momento, mientras que los resultados pueden ser transmitidos al
mdico, va tecnologa inalmbrica.
Desarrollo de plataformas colectivas inteligentes para realizar un anlisis espectroscpico de marcadores mltiples asociados al
o
cncer.
Diseo de agentes de contraste localizados, inyectables e inteligentes, que mejoran la resolucin grfica a nivel celular individual.
Nanodispositivos capaces de dirigir la diversidad biolgica de las clulas cancergenas mltiples, que evolucionan y que
conforman el tumor dentro de un individuo.
Terapias multifuncionales
o
o
Diseo de nanodispositivos que puedan suministrar ptimamente los medicamentos para las condiciones de tratamiento que
puedan surgir en el tiempo con terapias anticncer crnicas, incluido dolor, nuseas, prdida de apetito, depresin y dificultad de respirar.
Formacin de programas interdisciplinares
Coordinacin de esfuerzos para dar formacin multidisciplinar en biologa molecular y de sistemas, a ingenieros dedicados a
nanotecnologa e investigadores del cncer.
Creacin de programas nuevos interdisciplinares que mejorarn la comunicacin interprofesional y facilitar la especializacin de
nuevos profesionales.
Para saber ms:
http://news.bbc.co.uk/hi/spanish/science/newsid_4738000/4738403.stm
http://www.nanotecnologica.com/nanotecnologia-versus-cancer-ii/
http://www.euroresidentes.com/Blogs/nanotecnologia/2005/03/nanoparticulas-para-detectar-cancer.html
http://www.portalciencia.net/nanotecno/nanocancer.html
http://www.cienciaysociedad.info/nano/2008/07/nanotecnologia-contra-el-cancer/
Be Sociable, Share!
http://blogs.creamoselfuturo.com/nano-tecnologia/category/nanotecnologia-ysalud/page/3/
La primera computadora biolgica
Cientficos de la Universitat Pompeu Fabra crean grupos de clulas que actan como un ordenador tras cinco aos de trabajo
Ciencia| 08/12/2010 - 18:54h
Josep Corbella
Barcelona
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Entre las posibles aplicaciones medioambientales, Ricard Sol cita como ejemplo la laguna de Venecia. Es un sistema altamente
contaminado en el que, siempre que se han intentado soluciones del tipo de poner barreras, el sistema las ha sorteado y el
problema ha persistido. Pero con la biologa sinttica y la computacin biolgica podemos pensar en ofrecer soluciones
adaptativas, es decir, en crear microorganismos que se adapten a las condiciones de la laguna y las corrijan.
Estamos empezando a especular, estas aplicaciones an quedan lejos, advierte Francesc Posas. No querramos crear
expectativas prematuras en personas con diabetes o cncer.
Lo que han hecho hasta ahora los equipos de Sol y Posas no tendr aplicaciones prcticas a corto plazo, advierten. Han ideado
una estrategia para realizar computaciones con clulas y han demostrado cmo llevarla a la prctica con clulas de levadura.
Las clulas de sus experimentos actan del mismo modo que las puertas lgicas en un circuito electrnico convencional. Por
ejemplo, han diseado un circuito celular en que hacen falta dos estmulos para producir una respuesta: es la puerta lgica AND
(llamada as por la conjuncin inglesa que significa y). Otro circuito en que hace falta uno de los dos estmulos: la puerta lgica OR
(por la conjuncin que significa o). Un tercer circuito en que hace falta que no se d ninguno de los dos estmulos: la puerta lgica
NOR (ni). Y as hasta completar todos los tipos de puertas lgicas posibles, segn los resultados de la investigacin presentados
ayer en la edicin electrnica de la revista Nature.
La lgica matemtica es la misma que en un circuito electrnico y la programacin interna es idntica, explica Ricard Sol. La
diferencia es que en el circuito electrnico la seal es elctrica y aqu la seal es bioqumica.
Esta diferencia haba frustrado hasta ahora todos los intentos de construir computadoras biolgicas. En un circuito electrnico la
seal entra por un punto a travs de un cable y sale por otro punto a travs de otro cable. Pero un sistema biolgico no se puede
cablear del mismo modo porque las seales bioqumicas pueden salir de cualquier clula y llegar a cualquier clula.
Se nos ocurri que, en lugar de crear un sistema de computacin biolgica que imitara la computacin electrnica, como haban
intentado antes otros investigadores, tenamos que abandonar la idea de que la seal de inicio tuviera que salir de una clula
concreta, explica Sol. A partir del momento en que nos planteamos que cualquier clula pudiera dar la seal de inicio, vimos que
todo se simplificaba.
Para construir la computadora biolgica, Francesc Posas y su equipo trabajaron con clulas de levadura. Las eligieron porque son
uno de los organismos ms fciles de manipular en el laboratorio. Pero tambin porque son clulas eucariotas es decir, con
ncleo igual que las humanas. Las levaduras son ms parecidas a nosotros de lo que solemos pensar, explica Posas.
Les introdujeron distintos genes para que reaccionaran a seales del entorno y para que respondieran produciendo otras seales.
Por ejemplo, algunas levaduras se manipularon para que respondieran a la presencia de sal. Otras, para que produjeran la protena
fluorescente GFP de modo que emitieran luz verde: si las clulas se encendan, significaba que la computacin biolgica
funcionaba.
Segn los resultados presentados en Nature, con tres tipos de clulas manipuladas genticamente de maneras distintas es posible
construir computadoras biolgicas que realicen ms de cien funciones distintas. Y con cuatro tipos de clulas, se pueden superar las
doscientas funciones.
Los investigadores han demostrado adems que las clulas se pueden reprogramar fcilmente. Tal como hemos diseado el
sistema, que es modular, podemos hacer que, cambiando la seal externa, las clulas respondan de modo distinto, explica Sol.
En los prximos meses, los investigadores de la UPF tienen previsto repetir los experimentos con clulas de mamfero.
Pero antes de que la computacin biolgica fructifique en productos comerciales, falta demostrar que estos cultivos celulares son
estables a largo plazo. A diferencia de los circuitos electrnicos convencionales, los sistemas biolgicos tienen una molesta
tendencia a reproducirse y a morir. Por ahora, los investigadores han conseguido que el sistema sea estable durante nueve
generaciones lo que, en clulas de levadura, equivale a 36 horas.
Para que esta nueva tecnologa pueda aplicarse con fines mdicos implantndola en el cuerpo humano, como proponen los
investigadores para la diabetes, falta resolver tambin el problema del rechazo inmunitario.
El punto en que se encuentran las investigaciones sobre computacin biolgica es comparable al punto en que se encontraba la
electrnica cuando se invent el transistor, explica Posas. Nadie saba an muy bien qu se podra llegar a hacer con el transistor,
pero ya se sospechaba que iba a ser algo importante.
http://neofronteras.com/?p=4072
Consiguen crear un sistema biolgico que efecta operaciones lgicas anlogas a las que pueden realizar los transistores de silicio.
El transistor es el componente principal de los circuitos integrados que usan todos los dispositivos electrnicos que usamos en la actualidad. En los
microprocesadores hay millones de ellos. Estos transistores manipulan corrientes elctricas y estn hechos de semiconductores, en concreto suele ser silicio.
Cuando se trata de componentes digitales los transistores realizan operaciones lgicas. Aunque otra de sus funciones importantes es la amplificacin se
seales. Hasta el momento la tecnologa de los transistores de silicio es la nica que permite la computacin de una manera sencilla y barata. Sin embargo, no
es
el
nico
tipo
de
transistor
que
se
puede
concebir.
Ahora un equipo de investigadores de la Universidad de Stanford ha conseguido realizar transistores biolgicos que usan ADN, ARN y enzimas para
manipular
seales
bioqumicas.
Lo
llaman
transcriptor.
El transcriptor permite a realizar computacin dentro de clulas vivas segn stas son expuestas a ciertos estmulos externos y as poner en marcha o no
procesos
especficos
segn
las
necesidades.
Los investigadores implicados sostienen que las computadoras biolgicas pueden ser usadas para reprogramar sistemas vivos, vigilar el ambiente y mejorar
terapias.
As como el transistor semiconductor controla el flujo de electrones en los circuitos, el transcriptor manipula el flujo de ARN polimerasa (una enzima) segn
sta viaja por la hebra de ADN. Para realizar este control se usan unas protenas naturales denominadas integrasas. Al igual que el transistor sirve para
amplificar una seal elctrica, en el caso del transcriptor un pequeo cambio en la integrasa puede crear un gran cambio de la expresin de otros dos genes.
En ambos casos la amplificacin es algo esencial para que el sistema funcione bien sin que las seales desaparezcan en el ruido de fondo.
El sistema permite implementar puertas lgicas genticas basadas en el lgebra de Boole habitual que devuelven respuesta de verdadero o falso a preguntas
bioqumicas que se den en la clula. La eleccin de las enzimas necesarias se debe hacer en funcin de si se trata de bacterias, hongos, plantas o animales
para
as
tener
biocomputacin
en
una
gran
variedad
de
organismos.
Obviamente
el
transcriptor
por
s
slo
no
constituye
un
computador
completo,
sino
algo
mucho
ms
sencillo.
Adems de realizar operaciones lgicas, un computador tiene que almacenar y transmitir informacin. Pero estas otras dos tareas ya fueron realizadas con
componentes biolgicos el ao pasado por el mismo grupo investigador. As, pudieron almacenar informacin gentica reescribible en el ADN y transmitirla
de clula a clula en una especie de internet biolgica sencilla. Juntando estas funciones se podra crear un sistema de computacin biolgico completo.
De momento se planea usar este tipo de computacin en investigacin bsica para Biologa. No se pretende competir con la computacin tradicional basada
en
semiconductores.
Aunque
el
sistema
slo
est
limitado
por
la
imaginacin.
Estos investigadores han puesto sus resultados en dominio pblico para que otros tambin puedan desarrollar y mejorar este concepto de computacin
biolgica.
Copyleft: atribuir con enlace a http://neofronteras.com/?p=4072
Fuentes
Nota
y
de
referencias:
prensa.
Artculo original.
---------------------------------------------------------------------------------http://www.sciencemag.org/content/340/6132/599
Published Online March 28 2013
Science 3 May 2013:
Vol. 340 no. 6132 pp. 599-603
DOI: 10.1126/science.1232758
Report
Jerome Bonnet,
Peter Yin*,
Monica E. Ortiz,
Pakpoom Subsoontorn,
Drew Endy
+ Author Affiliations
1.
+ Author Notes
* Present address: Department of Biology, University of Pennsylvania, Philadelphia, PA
19104, USA.
1.
Organisms must process information encoded via developmental and environmental signals to survive
and reproduce. Researchers have also engineered synthetic genetic logic to realize simpler, independent
control of biological processes. We developed a three-terminal device architecture, termed the
transcriptor, that uses bacteriophage serine integrases to control the flow of RNA polymerase along DNA.
Integrase-mediated inversion or deletion of DNA encoding transcription terminators or a promoter
modulates transcription rates. We realized permanent amplifying AND, NAND, OR, XOR, NOR, and
XNOR gates actuated across common control signal ranges and sequential logic supporting autonomous
cell-cell communication of DNA encoding distinct logic-gate states. The single-layer digital logic
architecture developed here enables engineering of amplifying logic gates to control transcription rates
within and across diverse organisms.
Received for publication 14 November 2012.
Summary
Full Text
Full Text (PDF)
Engineering modular and tunable genetic amplifiers for scaling transcriptional signals in
cascaded gene networks Nucleic Acids Res 1 October 2014: 9484-9492.
o
Abstract
o
Full Text
o
Full Text (PDF)
Broad-host-range vector system for synthetic biology and biotechnology in cyanobacteria
Nucleic Acids Res 14 August 2014: gku673v2-gku673.
o
Abstract
o
Full Text
o
Full Text (PDF)
Programmable bacteria detect and record an environmental signal in the mammalian gut Proc.
Natl. Acad. Sci. USA 1 April 2014: 4838-4843.
o
Abstract
o
Full Text
o
Full Text (PDF)
Binary recombinase systems for high-resolution conditional mutagenesis Nucleic Acids Res 1
April 2014: 3894-3907.
o
Abstract
o
Full Text
o
Full Text (PDF)
Secreting and Sensing the Same Molecule Allows Cells to Achieve Versatile Social Behaviors
Science 7 February 2014: 1242782.
o
Abstract
o
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o
Full Text (PDF)
Recombinatorial Logic Science 3 May 2013: 554-555.
o
Abstract
o
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o
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http://sociedad.elpais.com/sociedad/2012/07/29/actualidad/1343579824_30605
1.html
Clulas
Bacteriologa
Nanotecnologa
Computacin
Genoma
Tecnologa
Gentica
Investigacin cientfica
Sanidad
Biologa
Informtica
Salud
Ciencias naturales
Industria
Ciencia
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Hay investigadores que creen que la miniaturizacin de los componentes electrnicos de los
ordenadores llegar a un punto en el que, al alcanzar determinados lmites fsicos, ser
imposible bajar ms de escala. Y que ese da est ms cerca que lejos. Entonces, habr
llegado el momento de imitar o incluso tratar de echar mano directamente de estructuras
microbianas, que puedan cumplir el papel de cables o de discos duros.
Otros cientficos sostienen, sin embargo, que no tiene mucho sentido tratar de reproducir
estructuras que la industria ha conseguido no solo reducir con habilidad, sino abaratar
enormemente a lo largo de las ltimas dcadas, cuestiones en las que ha mostrado una
elevada eficiencia. El objetivo no es tanto replicar un ordenador en miniatura con otros
materiales, expone Francesc Posas, director del centro de ciencias experimentales y de la
salud de la Universidad Pompeu Fabra de Barcelona. Nosotros pretendemos programar un
sistema vivo para que ejecute operaciones diseadas por nosotros, explica. Por ejemplo,
clulas o sistemas de clulas.
Unos y otros investigadores trabajan para avanzar en lo que, desde distintos puntos de vista,
se podran denominar ordenadores biolgicos.
En el primer grupo, aquellos que aspiran a mirarse en el espejo de los microorganismos
para seguir bajando de escala y aumentar la velocidad de clculo, se encuentran los
investigadores britnicos y japoneses que hace unos meses presentaron a unas bacterias con
propiedades magnticas como punto de partida para desarrollar una alternativa
microscpica de futuro a los discos duros actuales. Cientficos de la Universidad de Leeds
en colaboracin con un equipo de la Universidad de Agricultura y Tecnologa de Tokio se
fijaron en la bacteria Magnetospitillium magneticum, cuyo hbitat natural se encuentra en
lagunas donde el oxgeno es escaso.
Cuando estos microbios comen hierro, unas protenas que tienen en su interior crean
minsculos cristales de magnetita, el mineral ms magntico que existe. El resultado es una
especie de superficie imantada similar a la de los discos duros de los ordenadores.
La carrera de la nanotecnologa tiene unos lmites fsicos
Medio siglo ms tarde es habitual encontrar memorias externas para uso domstico de 260
gramos con capacidad de almacenamiento de 1 terabyte (con capacidad para 250.000
canciones grabadas en mp3, unos dos aos de escucha seguida). La reduccin de tamao
mientras se aumentaba la velocidad de acceso a los datos ha sido espectacular, pero quizs
no se pueda mantener por mucho ms tiempo.
Algo similar ha sucedido con los procesadores gracias, en buena parte, el uso de nuevos
materiales como el silicio, adems de la reduccin de escala. Ya lo vislumbr all por el ao
1965 el cofundador de Intel, Gordon Moore, al vaticinar que el nmero de transistores de
un chip se duplicara aproximadamente cada dos aos, una regla que en trminos generales
se ha ido cumpliendo. Pero, hasta cundo podr seguir mantenindose este ritmo?
Estamos llegando a los lmites de la fabricacin electrnica tradicional, sealaba la
coordinadora del trabajo, Sarah Staniland, en una nota distribuida por la Universidad de
Leeds. Las mquinas que hemos utilizado para construir los ordenadores son torpes a
pequea escala, pero la naturaleza nos ha proporcionado la herramienta perfecta para
solucionar este problema, indica.
Tras estudiar el proceso por el cual las bacterias generan minidiscos duros en su interior
especialmente cmo moldean y posicionan los minsculos imanes en su organismo, los
cientficos reprodujeron este mtodo y lo aplicaron en el laboratorio, de forma que
consiguieron recubrir una superficie con imanes similares en un trabajo publicado en la
revista Small. Si seguimos usando los procesos industriales actuales, que bsicamente
consisten en obtener pequeos imanes a partir de trocear uno de gran tamao, nos ser cada
vez ms difcil producirlos ms diminutos y con el tamao y forma que necesitaremos para
almacenar datos.
Hay cables biolgicos similares a las conexiones elctricas
La alternativa, para Johana Galloway, otra investigadora del equipo de Staniland, consiste
en encargar este trabajo a las protenas que se ocupan de ello en las Magnetospirillum
magneticum y transforman el hierro en cubos magnticos del mismo tamao. Ya lo han
conseguido, aunque an queda trabajo. Especialmente en lo que se refiere a reducir el
tamao de los imanes.
Tambin en Small, el mismo grupo esta vez dirigidos por el equipo japons, ha
publicado otro trabajo en el que se ha empleado otra protena para desarrollar minicables
elctricos a travs de nanotubos formados por lpidos. En un futuro, podramos conectarlos
con otros componentes como parte de un ordenador biolgico completo, seala Masayoshi
Tanaka, de la Universidad de Agricultura y Tecnologa de Tokio.
Los cables de origen biolgicos son otro de los modelos de la naturaleza que los
investigadores pretenden replicar y aplicar a la parcela de la nanobiotecnologa. Antes del
trabajo de Small publicado hace semanas, otra investigacin de la Universidad Hebrea de
Jerusaln ya sugiri esta posibilidad. El artculo, que reprodujo Cell en marzo del ao
pasado, planteaba un nuevo sistema de comunicacin entre las bacterias. Ms all de
relacionarse a travs de la secrecin y absorcin de molculas, se descubri que las
bacterias emplean nanotubos para conectarse entre s y que les sirven para intercambiar
pequeas molculas, protenas o incluso pequeos fragmentos genticos conocidos como
plsmidos.
No fueron bacterias, sino levaduras, los microorganismos empleados por un grupo de
estudiantes de dos universidades valencianas (la Universitat de Valncia y la Politcnica)
para crear una pantalla con la que alcanzaron el tercer puesto de un concurso sobre biologa
sinttica (International Genetically Engineered Machines) organizado por el Instituto
Tecnolgico de Massachusetts en 2009.
Los alumnos emplearon unas levaduras a las que les introdujeron en gen de la Aequiorina,
una protena con propiedades luminiscentes de las medusas. Estos microorganismos
funcionaban como pxeles (la biopantalla tena 96 cultivos celulares) que se encendan y
apagaban para formar imgenes en respuesta a una seal elctrica. Al recibir un impulso
elctrico, las levaduras abran en sus membranas determinados canales que permitan la
entrada en la clula de iones de calcio, que activaba la Aequoina y la emisin de luz.
Ya se trate de microimanes, nanocables o levaduras luminiscentes que funcionan como
pxeles, la filosofa que subyace a todos estos casos es la misma: producir componentes
hasta ahora elaborados de forma industrial a travs de otros procesos con la ayuda o
reproduciendo las estructuras de los microorganismos. Pero, en el fondo, se trata de copiar,
de reproducir la estructura de los ordenadores actuales.
Tiene sentido competir con una industria que est consiguiendo buenos resultados no solo
en cuanto al desarrollo de mayor capacidad de procesamiento, sino tambin a los costes del
producto? Merece la pena esforzarse en replicar una tecnologa que ya funciona?
La bacteria 'magnetospirillum magneticum' hace minidiscos duros
Las clulas vivas, explica Ricard Sol, han sido comparadas a menudo con un ordenador
paralelo y, en muchos sentidos, rivalizan con el mayor supercomputador que exista en la
actualidad. Es un ordenador peculiar, que detecta los cambios en el mundo en su superficie
(en la membrana) y lleva a cabo los procesos de computacin en su interior, explica
Ricard Sol. Es un entorno fluido y muy ruidoso, pero con la ventaja de que las clulas
son mucho ms fiables que nuestros ordenadores y los fallos en las partes de la maquinaria
molecular son rpidamente corregidos.
Esta es la teora, pero se puede conseguir que varias clulas computen? S, la cuestin es
encontrar los lmites de la complejidad de los procesos que pueden asumir, responde
Posas, una incgnita en la que se encuentra trabajando su equipo. Posas y Sol han
demostrado que se pueden disear circuitos complejos de computacin biolgica usando
http://www.tendencias21.net/El-primer-transistor-biologico-introduce-la-computacion-encelulas-vivas_a16885.html
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Artculos relacionados
De electrnica a biologa
La investigacin se centra en la creacin del primer anlogo biolgico del transistor, pieza
clave en la electrnica moderna. As, mientras en electrnica este dispositivo controla el
flujo de electrones a lo largo de un alambre de metal, en biologa se encarga del
movimiento de una protena especfica, en este caso la ARN polimerasa, a lo largo de una
cadena de ADN. En otras palabras, el ADN sustituye al cable, y la ARN al electrn.
Para ello han utilizado un grupo de protenas naturales llamadas integrasas, conocidas
por alterar la programacin de la clula humana para que fabrique VIH. La eleccin de
estas enzimas concretas es muy importante, ya que deben funcionar en bacterias,
hongos, plantas y animales, para que las biocomputadoras puedan modificarse dentro de
una variedad de organismos, destaca Jerome Bonnet, investigador de Bioingeniera y
autor principal del estudio.
Usando varios transcriptores, el equipo ha creado lo que se conoce en ingeniera elctrica
como puertas lgicas, capaces de generar respuestas de verdadero-falso a prcticamente
cualquier pregunta bioqumica que se plantee en una clula. Los investigadores se
refieren a ellas como Puertas Lgicas Booleanas de Integrasa (Boolean Integrase Logic
Gates, en ingls) o BIL Gates, para abreviar.
Estas puertas no constituyen un ordenador por s solas, pero s son el tercer y ltimo
componente necesario para que una computadora biolgica pueda funcionar dentro de
clulas vivas individuales. Su misin sera la misma que la de cualquier equipo
convencional, es decir, almacenar y transmitir datos, y realizar operaciones lgicas con
ellos.
Los otros dos componentes ya fueron noticia el ao pasado. Endy y su equipo disearon
un tipo de almacenamiento de datos digital regrabable en el ADN, adems de un
mecanismo para transmitir informacin gentica de clula a clula, una especie de
Internet biolgica. Todo ello se suma a la creacin de un equipo dentro de una clula viva.
Jerome Bonnet, autor principal del estudio. Fuente: Steve Fisch/ Stanford University
Aplicacin
Otra similitud entre electrnica y biologa son las posibilidades que ofrecen, ilimitadas en
ambos casos. Se puede probar si una clula se ha expuesto a cualquier nmero de
estmulos externos, como la presencia de glucosa y cafena. En ese caso las puertas
lgicas permitiran tomar esa determinacin y almacenar la informacin, por lo que se
podra identificar fcilmente las expuestas de las que no", explica Bonnet.
De la misma manera, se puede indicar a una clula que inicie o detenga la reproduccin
en funcin de determinados factores. Y si a ello se suma la Internet biolgica diseada
tambin por el equipo, es posible comunicar la informacin gentica de clula a clula
para orquestar el comportamiento de un grupo.
Los investigadores esperan que, a largo plazo, las biocomputadoras puedan utilizarse
para estudiar y reprogramar sistemas de vida y mejorar las terapias celulares, un campo
de la medicina que se basa en la gentica y la biologa celular para regenerar y
reemplazar tejidos y rganos muertos o enfermos.
Las posibles aplicaciones estn nicamente limitadas por la imaginacin del
investigador, segn la coautora del estudio Monica Ortiz. De hecho, el equipo sugiere
que algn da podran existir puentes vivos o edificios construidos por el crecimiento
autodirigido de sus materiales naturales -controlados por circuitos biolgicos internos-, o
incluso pequeos submarinos mdicos, con ordenadores de ADN a bordo, navegando en
el interior de nuestros cuerpos.
Para conseguir que todo esto sea una realidad cuanto antes, Endy y su equipo han
expuesto todos los componentes al dominio pblico para que puedan aprovecharse
inmediatamente y mejorar as las herramientas. La mayora de la biotecnologa no se ha
imaginado an, y mucho menos se ha convertido en una realidad. Al compartir libremente
importantes herramientas bsicas todos podemos trabajar juntos y mejor, confa Bonnet.
http://www.sebbm.com/pdf/169/s02169.pdf
http://www.elprofesionaldelainformacion.com/contenidos/1999/junio/ordenadores_b
iologicos.html
Junio 1999
Ordenadores biologicos
Por Ana Teresa Garca Martnez
Resumen: La investigacin en ingeniera informtica nos ofrece una nueva
tecnologa revolucionara que afecta a la esencia misma del hardware y
software, tal y como lo conocemos hoy da: el ordenador electrnico. Estas
mquinas nos transportan a nuevas formas de configuracin de la mano de
componentes bioqumicos que condicionan el modelo de datos as como las
caractersticas de la arquitectura que lo sustenta. No obstante tambin
presenta algunas similitudes con el ordenador convencional en cuanto a
operaciones sobre los datos se refiere. Aunque bien es cierto que el campo
de aplicacin de esta tecnologa est dirigido fundamentalmente a la
resolucin de problemas combinatorios de complejidad exponencial.
Palabras clave: Ordenadores biologicos, Informtica ADN, Codificacin de
informacin, Arquitectura ADN, Tecnologa molecular.
Title: Biological Computers
Abstract: Research in computer engineering offers us a new technology
that affects the essence of hardware and software, as we now know it, that
is to say the electronic computer. These machines are leading us to new
forms of configuration through the use of biochemical components, which
condition the data models as well as the architectural characteristics that
support them. However they also have similarities with the traditional
computers in terms of data operations, although is true that the scope of
this technology is directed to resolving combinatory problems of
exponential complexity.
Keywords: Biological computing, DNA computer, Information
representation, DNA Architecture, Molecular technology.
Para llevar a cabo los clculos los ordenadores ADN, que representan
la informacin en trminos de las unidades qumicas de ADN,
requieren sintetizar series especficas de ADN y permitirles reaccionar
en una probeta; a diferencia de los convencionales, que realizan los
clculos mediante un programa que maneja la informacin,
representada fsicamente, reflejndose en el flujo de electrones a
travs de los circuitos lgicos.
Tambin contribuye a la configuracin de este modelo la capacidad de
procesamiento, y es que estos ordenadores son increblemente
ligeros, ya que aproximadamente con 1/2 Kg de ADN se obtiene ms
poder de procesamiento que con cualquiera de los ordenadores
actuales.
De esta composicin se deduce que la coleccin de molculas aporta
al diseo del nuevo ordenador las caractersticas internas de hmedo
y fluido en cuanto afecta a la unidad de procesamiento y memoria, por
lo que debe prestarse atencin al PH, la temperatura y las
concentraciones de sal, como condiciones qumicas que influirn en
una ptima ejecucin de los procesos.
Limitaciones
Su aplicacin est limitada a ciertos tipos de problemas, puesto que
los ordenadores ADN slo resuelven problemas combinatorios. No hay
procesadores de texto o posibilidades de juegos para los ordenadores
ADN, y adems son lentos en ciertos casos, ya que los problemas
simples se resuelven ms rpidamente en un ordenador electrnico.
Los ordenadores ADN son mucho ms rpidos para los grandes
problemas ms complejos. Por ejemplo buscar en la memoria de un
ordenador ADN puede ser lento porque encontrar una secuencia le
puede llevar entre 17 minutos y tres horas, mientras que buscar en el
disco duro de un ordenador supondra 15 milisegundos.
Por otra parte en el tratamiento de las respuestas complejas nos
encontramos que puede llevar ms tiempo clasificar la respuesta al
problema que encontrar la solucin, es decir, que puede llevar mucho
tiempo hacer las operaciones que actualmente estn en
experimentacin, tales como unin, vertido y separacin de
secuencias ADN.
Por ltimo se contempla el concepto de fiabilidad, que es muy baja en
este tipo de ordenadores puesto que el ADN cambia de forma natural
y aleatoriamente, se puede deteriorar, y adems las manipulaciones
de ADN tienen tendencia a error. Por todo ello es por lo que el
http://www.biounalm.com/2011/10/mejorando-el-diseno-de-los-circuitos.html
Uno de los principales objetivos de la biologa sinttica es el desarrollo de sensores biolgicos con la
capacidad de generar una respuesta lgica o inteligente en funcin al estmulo recibido. Pongamos un
ejemplo para ilustrar mejor esta idea:
Tenemos un individuo que ha sido infectado por un microorganismo patgeno. Lo que normalmente se hace
es tomar una muestra del paciente ya sea sangre, orina, lquido cefalorraqudeo, o algn otro fluido
corporal para hacerle una serie de ensayos en el laboratorio con el fin de identificar al agente infeccioso.
Una vez identificado, se le administra un determinado frmaco que controle la infeccin y elimine al
organismo indeseado. Todo este proceso demanda mucho tiempo y puede llegar a costar mucho dinero.
Imaginen ahora que cuentan con un biosensor capaz de realizar todo este proceso en un solo paso. Este
hipottico biosensor, el cual fue desarrollado gracias a la biologa sinttica, es capaz de reconocer al agente
infeccioso a travs de antgenos especficos liberados por l. Adems, en funcin al antgeno reconocido, el
biosensor activa una ruta metablica que sintetiza el antibitico especfico contra este patgeno,
terminando as con la infeccin. Y una vez cumplido su trabajo, se autoelimina.
En teora, esto se puede realizar a travs del uso de molculas sealizadoras, factores de transcripcin y
genes, que pueden ser conectados para formar un circuito lgico, tal como los que se encuentran en
cualquier dispositivo electrnico. Un circuito lgico no es ms que la unin y conexin de varias operaciones
lgicas donde una seal de entrada (input) genera una respuesta (output), definida por una operacin
especfica (gate).
En los ltimos aos, muchos investigadores e ingenieros han desarrollado circuitos lgicos biolgicos usando
bacterias y molculas de ADN. El principio es bastante sencillo. Un estmulo es reconocido por una molcula
sealizadora que activa la expresin de un gen, el cual puede codificar para un factor de transcripcin o
una molcula represora. Estas molculas, a su vez, pueden activar o reprimir la expresin de otros genes,
crendose as un circuito lgico gentico.
Sin embargo, hay dos inconvenientes que afectan el desarrollo de esta tecnologa: la interaccin de los
circuitos genticos con los propios genes y molculas del organismo que lo transporta (ruido gentico), el
cual puede generar reacciones cruzadas; y el nmero limitado de seales qumicas capaces de formar parte
Este pequeo circuito lgico fue probado en distintas cepas de E. coli, funcionando correctamente en la
mayora de ellas. Como inductores usaron tres mecanismos ampliamente conocidos: i) el IPTG, que induce el
promotor Plac, ii) la arabinosa, que induce el promotor PBAD y, iii) la homoserin-lactona (AHL), molcula
responsable de la comunicacin bacteriana que activa el promotor Plux. Tambin probaron distintas
secuencias RBS (secuencias reconocidas por los ribosomas al momento de traducir el ARNm), las cuales
presentan eficiencias de traduccin variables. Estas secuencias RBS sirvieron para ajustar los niveles de
expresin de los componentes del circuito lgico (HrpS, HrpR y GFP).
Con este experimento, Wang y sus colaboradores demostraron que se poda reducir el efecto del ruido
gentico mediante el uso de mecanismos de regulacin que naturalmente no se encuentran en determinados
organismos, y que tambin se podan desarrollar circuitos genticos a manera de mdulos, que pueden ser
introducidos o quitados del organismo, tal como las tarjetas de video, sonido o red de una
computadora. Los investigadores crean que el desarrollo de estos mdulos podra facilitar la formacin de
circuitos lgicos mucho ms complejos.
Para demostrar este segundo supuesto, Wang y sus colegas desarrollaron el operador lgico NOT. Para ello
usaron el promotor del fago lambda Plam que regula la expresin del gen reportero gfp. Este promotor esta
activo todo el tiempo a menos que est presente su molcula represora cI. Luego, conectaron este pequeo
operador lgico al primero (AND) al que le reemplazaron el output gfp por el represor cI para as obtener
el operador lgico NAND.
En este segundo caso, cuando los dos inductores se encuentran presentes, el factor 54 activa el promotor
HrpL permitiendo la expresin del represor cI. El represor inactivar la expresin del gen reportero gfp no
habr un output. Pero, si slo est presente uno o ninguno de los inductores, el represor cI no podr
expresarse y el output seguir expresndose.
Bueno, desarrollar pequeos circuitos lgicos es una tarea relativamente sencilla, el reto viene cuando se
pretende hacer circuitos lgicos mucho ms complejos, capaces de reconocer diferentes estmulos, por
ejemplo: agentes infecciosos, sustancias contaminantes, toxinas, clulas cancerosas, etc. Para ello, primero
debemos tener un profundo entendimiento de los procesos de transduccin de seales que se llevan a cabo
dentro de las clulas, en la cual participan una serie de protenas que reaccionan mediante fosforilaciones y
desfosforilaciones, ubiquitinaciones y desubiquitinaciones. Sin embargo, podemos decir que estamos
viviendo una poca donde se estn sentando las bases de la biologa sinttica y la computacin molecular.
Con lo rpido que avanza la ciencia, tal vez dentro de algunos aos obtengamos los primeros biosensores
basados en circuitos lgicos integrados.
Referencia:
Wang, B., Kitney, R., Joly, N., & Buck, M. (2011). Engineering modular and orthogonal genetic logic gates
for robust digital-like synthetic biology Nature Communications, 2 DOI: 10.1038/ncomms1516
Esta entrada participa en el III Carnaval de la Tecnologa celebrado en el blog Idea Secundaria.
Linkwithin
a las0:24
Etiquetas:Biologia Molecular,Biologa Sinttica,Biotecnologia,Gentica,Microbiologa,Peer Reviewed
http://www.biounalm.com/2011/01/el-uso-de-microorganismos-como.html
La base del funcionamiento de las computadoras actuales son las puertas lgicas, las cuales se
basan en los operadores booleanos. Este consiste en un sistema donde una seal de entrada
(input) es trasformada en una determinada seal de salida (output) en funcin a una operacin
lgica (gate).
Un output generado por una puerta lgica puede ser usado como un input para una segunda
puerta lgica, de esta manera, se pueden establecer largas conexiones lgicas que es la base de
todo sistema computacional. Las computadoras han desarrollado estas redes lgicas de manera
electrnica usando los transistores, generando circuitos integrados de mltiples inputs para dar
otra gran variedad de outputs digitales.
As que Tamsir et al. aplicaron esta misma idea pero usando microorganismos como si fueran
transistores. Los organismos vivos tambin responden de diferentes maneras ante los estmulos
de su ambiente, dependiendo de su metabolismo y las reacciones bioqumicas que ocurren en su
interior. As que un determinado estmulo, por ejemplo, la presencia de un antibitico, puede
generar la expresin de una enzima capaz de degradar el antibitico y evitar que lo perjudique.
En este caso, el antibitico sera el input, la activacin del gen de resistencia sera el gate o
puerta lgica y la enzima que degrada al antibitico sera el output. En bacterias, la mayora de
los genes estn ubicados dentro de operones, de esta manera, la expresin de varios genes se
dar como consecuencia de la presencia de un mismo estmulo.
Por ejemplo, la presencia de lactosa en el medio activar al opern Lac que comprende 3 genes:
uno que codifica para una protena que permitir el ingreso de la lactosa a la bacteria y otros dos
que se encargarn de modificar y degradar la lactosa para convertirla en galactosa y glucosa que
sern usados por la bacteria para su crecimiento.
Gracias a la ingeniera gentica podemos insertar o cambiar genes dentro de los operones.
Entonces, si insertamos un gen que exprese una protena fluorescente (gen reportero) dentro de
un determinado opern, podremos observar la presencia del estmulo a travs de la emisin de
fluorescencia por parte de la bacteria. Tamsir et al. usaron este principio para crear puertas
lgicas con bacterias.
Primero crearon las puertas lgicas OR y NOR. Para ello usaron como inputs a la arabinosa (input
1) y a la anhidrotetraciclina (input 2). Para la`puerta lgica OR, la cual da un output positivo
cuando al menos uno de los inputs est presente, Tamsir et al. pusieron al gen reportero (la
protena fluorescente amarilla: YFP) bajo el control de los promotores Ara y Tet dispuestos uno
despus del otro. As que ante la presencia de arabinosa y/o anhidrotetraciclina, el gen reportero
ser expresado.
Por otro lado, para la puerta lgica NOR, que slo dar un input positivo si ninguno de los input
est presente, pusieron al gen reportero bajo el control de un promotor que funciona todo el
tiempo pero es inactivado ante la presencia del represor cI y al represor cI lo pusieron bajo el
control de los promotores Ara y Tet dispuestos en tndem. Entonces, si hay arabinosa y/o
anhidrotetraciclina en el medio, el represor cI se expresar y bloquear la expresin del
reportero, y si no hay ninguno de los dos estmulos, no habr represor y el gen reportero (YFP) si
se expresar.
Pero, la idea de esto es crear circuitos lgicos. Para ello deben existir "cables de conexin" entre
una bacteria y otra, para que el output de uno sirva como el input de otro y as combinar y
generar circuitos lgicos que respondan de diferente manera ante la presencia de determinados
estmulos. Tamsir et al. se valieron del mecanismo de qurum sensing de las bacterias para
conectar una puerta lgica con otra usando las moculas de sealizacin liberadas durante este
mecanismo.
Generalmente, las molculas senalizadoras que intervienen en las bacterias gram negativas son
las acil-homoserin lactonas (A-HSL). Estas molculas son secretadas a medida que la densidad
celular va aumentando y tienen la capacidad de inducir la expresin de determinados genes.
Entonces Tamsir et al. usaron este mecanismo para desarrollar operaciones lgicas ms complejas
como AND y XOR.
Para la puerta lgica XOR, la cual da un output positivo slo si se presenta o bien la arabinosa o
bien la aciltetraciclina, pero no cuando los dos estn presentes, usaron 4 tipos de bacterias
diferentes. La bacteria #1 tena un sistema NOR, el cual estaba regulado por el promotor Ara y
Tet el cual expresaba el represor cI. Este represor cI controlaba la expresin de una A-HSL (LasI).
La bacteria #2 y #3 tambin tenan un sistema NOR pero esta vez controlado por la LasI y por uno
de los dos inductores: arabinosa (bacteria #2) o anhidrotetraciclina (bacteria #3). En estas dos
bacterias, el represor cI controlaba la expresin de otra A-HSL (RhlI). Finalmente, la bacteria #4
tena al gen reportero (YFP) regulado bajo el promotor Rhl. De esta manera, slo cuando estaba
presente uno de los inputs, Rhl era expresado y el reportero es visible (output positivo).
Adems Tamsir et al. pudieron crear ms puertas lgicas complejas usando este mismo
mecanismo. De esta manera demostraron que puede ser posible generar y combinar diferentes
tipos de bacterias, cada una sensible a un tipo de inductor, para as generar circuitos lgicos cada
vez ms complejos, que permitan desarrollar algoritmos ms elaborados. La ventaja de esto sera
que, a travs del uso de la biologa sinttica, poder disear nuevas molculas reguladoras,
sealizadoras y promotoras, de esta manera se podra usar en muchas reas de la ciencia. Por
ejemplo, se podran desarrollar promotores sensibles a derminados antgenos de ciertos virus o
bacterias patgenas, para un diagnstico rpido de la enfermedad o para ver si una nueva droga
esta funcionando adecuadamente.
Referencia:
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