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CTEDRA: BIOQUMICA

Carreras: Farmacia
Profesorado en Qumica
Licenciatura en Qumica
Licenciatura en Alimentos

CIDOS NUCLEICOS
1) a) En la figura seale, englobando con un trazo continuo, lo siguiente:

un nucletido
un nuclosido
una base prica
una base pirimdica
un puente hidrgeno
una unin fosfodister
un extremo 3
un extremo 5
una desoxirribosa

b) Qu peso molecular promedio tiene un DNA de cadena doble de 150 pares


de bases de longitud? (PM promedio de un nucletido: 330)
2) Cul ser la masa molecular aproximada de una molcula de DNA cuya
longitud es de 16,4 ?
3) Ordene las siguientes molculas de DNA de acuerdo a su temperatura de
fusin (Tm), de menor a mayor.
a) AAGTTGTCTGAAAT
TTCAACAGACTTTA
b) GGACCTCTCAGGCG
CCTGGAGAGTCCGC
c) AGTCGTCAATGCAG
TCAGCAGTTACGTC

4) Cul de las siguientes cadenas tiene la menor temperatura para la


separacin de las hebras y por qu?
a) AGTTGCGACCATGATCTG
TCAACGCTGGTACTAGAC
b) ATTGGCCCCGAATATCTG
TAACCGGGGCTTATAGAC
5) Un segmento de DNA de cadena simple tiene la siguiente composicin de
bases: A 31,5%, C 23,7%, T 17,1%, G 27,7%.
Cul sera la composicin de bases de la cadena complementaria?
Cul sera la composicin de bases de la forma de doble cadena de dicho
segmento?
6) El DNA del bacterifago M13 tiene la siguiente composicin de bases: A
23%, T 36%, G 21%, C 20%. Qu nos dice esta informacin acerca del DNA
de este fago?
7) Cul es el % molar de adenina en un DNA de doble hebra que contiene 20
moles % de citosina?
8) En muestras de DNA aisladas de dos especies no identificadas, la
composicin de A es 32 y 17% respectivamente del total de bases. Qu
cantidades relativas de C, G y T esperara encontrar en las dos muestras de
DNA? Qu debera usted asumir? Una de estas bacterias es termoflica.
Cul es el DNA que proviene de esta bacteria? En qu se basa usted para
afirmar esto?
9) Calcule el peso en gramos de una molcula de DNA doble hlice de longitud
igual a la distancia desde la tierra a la luna (aprox. 200000 millas). La doble
hlice de DNA pesa aproximadamente 10-18g por 1000 pares de nucletidos.
Hay 1,6.10 12 nm por milla y cada par de bases se extiende 0,34 nm. (Para que
usted haga una interesante comparacin su cuerpo contiene 0,5 g de DNA.)
10) Un bacterifago lambda sufri una mutacin que acort la longitud de su
DNA de 17 a 15 . Cuntos pares de bases perdi este mutante?
11) Cul es el nmero mnimo de pares de nucletidos en el gen de la enzima
ribonucleasa pancretica (124 aminocidos de largo)? Por qu podra ser el
nmero de pares de nucletidos mayor que su respuesta?
12) El peso molecular del gen codificante de una glutatin reductasa es de
800.000. Calcule el peso molecular de la enzima y el nmero de nucletidos del
ARNm correspondiente.
13) El peso molecular de un gen es de 3.106. Calcule la longitud de dicho gen y
el nmero de aminocidos de la protena codificada.
14) El ARNm codificante de una porina contiene 1875 nucletidos. Calcule el
peso molecular de la porina y la longitud del gen que codifica para dicha
protena.

15) La longitud de un gen es de 1650 nm. Calcule el peso molecular de la


protena que codifica y el nmero de bases del ARNm codificante de dicha
protena.
16) Un hexanucletido doble cadena, por ejemplo, tres guaninas en una
cadena y tres citosinas en la otra, tiene una Tm muy baja con respecto a un
polinucletido que contiene 1000 guaninas y 1000 citosinas en cada cadena
respectivamente. Explique.
17) Una solucin de DNA de doble cadena se calienta y se enfra luego a
temperatura ambiente durante un intervalo de dos minutos. Cmo cambiar la
absorbancia a 260 nm durante el enfriamiento:
a) si la solucin se calent un poco por debajo de Tm.
b) si la solucin se calent muy por encima de Tm.
c) puede proponer tres clases de estructuras de polidesoxirribonucletidos de
dobles cadenas (naturales o sintticos) que daran un perfil de absorbanciatemperatura totalmente reversible en solucin acuosa?
18)
A260
2
1

Temp.
Las dos grficas superiores pertenecen a 2 cidos nucleicos 1 y 2. Cabra
deducir:
a) 1 posee ms purinas que 2.
b) 1 posee ms peso molecular que 2.
c) 1 posee un porcentaje de (C+G) inferior al de 2.
d) 1 posee un menor porcentaje de adenina que 2.
e) 1 posee menos pirimidinas que 2.
19) Dadas las siguientes molculas de cidos nucleicos de cadena doble:
a) AAGTTCTCTGAA
TTCAAGAGACTT

b) GTCGTCAATGCA
CAGCAGTTACGT

c) GGACCTCTCAGG
CCTGGAGAGTCC

Seale V o F:
- Ninguna de las tres molculas puede ser degradada por una RNAsa.
- Las tres molculas tienen igual temperatura de fusin (Tm) porque tienen la
misma longitud.
- Las dos hebras de cada una de ellas son antiparalelas.
- Tm a Tm b Tm c
- Tm b Tm a Tm c
- Tm c Tm b Tm a

- Tm a Tm c Tm b
Justifique.
20) Explique el siguiente grfico, obtenido midiendo la absorbancia (A) de luz
UV de dos muestras de DNA sometidas cada una a calentamiento gradual:

a) A qu corresponden TI y TII?
b) A qu corresponden Aa y Ab?
c) Qu diferencia existe entre el DNA de la curva I y el de la curva II?
d) Grafique la curva correspondiente a una muestra de DNA II al doble de la
concentracin original manteniendo igual la concentracin de sales.
21) Usted recibe una muestra de material gentico de origen viral para su
estudio qumico y estructural. La muestra present las siguientes
caractersticas: Fue totalmente insensible a NaOH 0,5 mM, el tratamiento con
una endonucleasa produjo un solo fragmento de masa molecular 8 105 Da y al
elevar la temperatura por encima de la temperatura crtica se produjo un
marcado aumento de la absorbancia a 260 nm. Con los datos precedentes
caracterice tanto como le sea posible a la muestra justificando en cada caso su
respuesta.
22) Usted recibe una muestra de material gentico de origen viral para su
estudio qumico y estructural. La muestra present las siguientes
caractersticas: Fue totalmente hidrolizada en NaOH 0,5 mM, el tratamiento con
una endonucleasa produjo un solo fragmento de masa molecular 2 106 Da y al
aumentar la temperatura por encima de la temperatura crtica no se observaron
variaciones sustanciales en la absorbancia a 260 nm. Con los datos
precedentes, caracterice tanto como le sea posible la muestra justificando su
respuesta.
23) Usted recibe en su laboratorio una muestra de material biolgico que
presenta las siguientes caractersticas: masa molecular 22000 Da, fue
totalmente insensible al tratamiento con enzimas proteolticas y con
exorribonucleasas, fue totalmente hidrolizado en NaOH 0,5 mM, no present
efecto hipercrmico y fue hidrolizado por endorribonucleasas. Caracterice la
muestra y justifique.
24) Usted recibe una muestra de material biolgico desconocido que presenta
4

las siguientes propiedades: dio negativa la reaccin de biuret, no reaccion con


periodato, no fue afectada por tratamiento con NaOH 0,5 mM, present un pico
de absorbancia a 260 nm, al calentar la muestra hasta 80C la A260 aument 5
veces con un punto de inflexin para la curva de aumento de absorbancia a los
56C. Caracterice lo ms posible la muestra recibida en base a sus
propiedades. Fundamente su respuesta.
25) Usted recibe una muestra de material biolgico desconocido que presenta
las siguientes propiedades: dio negativa la reaccin de biuret, dio positiva la
reaccin de periodato originndose grupos aldehdos, fue totalmente
degradado por tratamiento con NaOH 0,5 mM, al calentar la muestra hasta
80C la A260 no present variaciones significativas. Caracterice lo ms posible
la muestra recibida en base a sus propiedades. Fundamente su respuesta.
26) Se recibe una muestra de DNA que posee 120000 nucletidos y la
siguiente estructura:
5
3
Calcule la masa molecular y la longitud de la muestra. Teniendo en cuenta la
estructura anterior cmo esperara usted que reaccionara la muestra frente a:
los lcalis, exo y endonucleasas y aumentos de temperatura? Si la proporcin
de A es 17%, cul sera la composicin de bases de la muestra?
27) El DNA de una mutante del bacterifago lambda tiene una longitud de 15
en vez de 17 . Una solucin de dicho DNA present una A260 de 0,5. Por
calentamiento de dicha solucin a 90C la A260 fue de 1,5. Este aumento de
absorbancia tambin fue observado cuando el DNA mutante se someti a un
tratamiento con NaOH. La composicin de las bases nitrogenadas de una de
las hebras del DNA del mutante es de 30 % adenina y 24 % guanina. Una
porcin de la secuencia nucleotdica de este DNA fue la siguiente:
5-GATCAAACGCGTTCGAACTACCAT-3
a) Escriba en el sentido 5-->3 la secuencia de bases complementaria a la
secuencia indicada.
b) Calcule la Tm de la secuencia descripta considerando que por cada adenina
presente en la secuencia debe sumar 2C y por cada guanina 4C.
c) Cuntos pares de bases menos tiene el DNA mutante respecto al DNA
original del bacterifago lambda?
d) Cul es el porcentaje de C+T del DNA mutante?
28) Se aisl el material gentico de 3 virus diferentes: A, B y C. Se realizaron
estudios para su caracterizacin, obtenindose los datos de la tabla adjunta. En
base a estos datos caracterice lo mejor posible el material gentico de cada
virus.
El grfico muestra la A260 en funcin de la temperatura a la que fue calentado el
material gentico de cada uno de los virus. Indique a qu virus corresponde,
respectivamente, cada uno de los trazos del grfico. Justifique brevemente su
respuesta.

TRATAMIENTO
NaOH 0,5 mM
Exorribonucleasa
Exodesoxirribonucleasa
Endorribonucleasa
Endodesoxirribo-nucleasa

A
Insensible
Insensible
Hidrlisis total
Insensible
3 fragmentos
PM: 3, 6 y 8 104
A, T, C, G.
%G= 20
S

Contenido de bases
Efecto hipercrmico

A260

B
Insensible
Insensible
Insensible
Insensible
1 fragmento
PM 17 104
A, T, C, G.
%G= 32
S

C
Insensible
Insensible
Insensible
Insensible
1 fragmento
PM 8 104
A, T, C, G.
%G= 60
No

2
1

Temperatura
29) El material gentico de una bacteria tiene una longitud de 34 m. La
composicin de A + T es de 28 %. Una solucin de dicho material present una
absorbancia a 260 nm de 0,5. Por el calentamiento de dicha solucin la
absorbancia a 260 nm vari como se muestra en la tabla siguiente. a) Calcule
la Tm del material gentico. b) Cuntos pares de bases tiene este material? c)
Cul es el porcentaje de T + C?
Temperatura (C)
35
45
55
65
75
85

Abs 260 nm
0,5
0,5
0,7
1,0
1,5
1,5

30) El ARNm de un receptor hormonal contiene 1800 nucletidos.


a) Calcule el peso molecular del receptor. (3 puntos)
b) Considerando que el gen que codifica para dicho receptor presenta un 40 % de
regiones no codificantes, calcule el nmero de nucletidos de dicho gen. (3 puntos)
c) Indique qu le ocurrir al ARNm luego de los siguientes tratamientos: (4 puntos)
- NaOH 5 M
- exorribonucleasa
- endodesoxirribonucleasa
- calentamiento por encima de la Tm

RESPUESTAS
1) b) 150 x 2 x 330 = 99.000
2) 31835000
3) a , c , b .
4) Tiene menor temperatura la a, porque la b presenta una zona unida muy
fuertemente por los pares CG seguidos y entonces se debe aumentar ms la
temperatura para separar las hebras.
5) cadena complementaria: T = 31,5 %, G = 23,7 %, A = 17 %, C= 27,7 %.
Doble cadena: A = 24,25, C = 25,7, T = 24,25, G = 25,7.
6) Nos dice que es un DNA simple hebra, ya que no presenta porcentajes
iguales de A y T, y C y G.
7) 30%.
8) Asumo doble hebra: 32 % A, 32 % T, 18 % C,18% G.
17 % A, 17 % T, 33 % C, 33 % G. Este es el DNA de la bacteria termoflica,
porque tiene un mayor porcentaje de pares de bases CG que forman mayor
nmero de puentes de hidrgeno, que le dan ms estabilidad y aumentan la
temperatura.
9) 9,4 10 -4g
10) 5882 pares de bases.
11) 372. Puede ser mayor, porque se necesitan nucletidos para indicar los
codones de iniciacin y terminacin, etc.
12) 44440, 1212 nucletidos
13) 4545 pares de bases, 1515 aminocidos
14) 68750, 0,6375 m
15) 177941, 4853 bases
16) Porque al ser mayor el nmero de pares de CG. esa doble hlice est
mucho ms estabilizada por la mayor cantidad de puentes de hidrgeno y por
lo tanto se va a requerir una temperatura mayor para desestabilizarla.
17) a) La absorbancia disminuye al enfriar, ya que el DNA se renaturaliza
porque las dos hebras no se separaron totalmente.
b) La absorbancia no cambia porque el DNA no se puede renaturalizar.
c) poli AT, poli CG, DNA circular.
18) Slo es verdadero la c.
19) (A+T)2 + (G+C)4 = Tm
a) 8x2 + 4x4 = 32
b) 6x2 + 6x4 = 36
c) 4x2 + 8x4 = 40
20) a) T de fusin de los DNA I y DNA II
b) Aa Absorbancia a 260nm de las 2 hebras de DNA separadas
Ab Absorbancia a 260 nm de la doble hlice
c) % CG de DNA II %CG de DNA I
21) DNA (porque el RNA se hidroliza), circular (porque origina un solo
fragmento con la endonucleasa), doble hlice (por aumento de absorbancia a
260 nm al elevar la temperatura) y peso molecular 8 105.
22) RNA circular simple hebra, peso molecular 2 106.
23) Peso molecular: 22000, no es protena ni RNA de cadena abierta, RNA,
simple hebra, circular.
24) DNA doble hebra, con Tm= 56C. No es protena (biuret negativo), no tiene
ribosa (periodato negativo). Es cido nucleico (absorbancia a 260), DNA (no se
hidroliz con NaOH), doble hebra (aumento de A260).
7

25) ARN simple hebra lineal. Para justificar ver 16.


26) 39600 kDa. 20,4 . No se hidroliza por lcalis. Se hidroliza por exo y
endonucleasas. Aumenta la A260 al aumentar la temperatura.
17 % A, 17 % T, 33 % C, 33 % G.
27) a) 5-ATGGTAGTTCGAACGCGTTTGATC-3
b) 70 C c) 5882 pb d) 46 % si consideramos una hebra (50 % si consideramos
la molcula de DNA completa)
28) A: DNA lineal, PM 17 104, doble hebra, 20 % C, 20 % G, 30 % T, 30 % A.
B: DNA circular, PM 17 104, doble hebra, 32 % G, 32 % C, 18 % A, 18 % T.
C: DNA circular, PM 8 104, simple hebra, 60 % G.
2 corresponde a A, 1 a B y 3 a C.
29) a) 65C b) 100.000 c) 50 %
30) a) 1800/3= 600 aminocidos x 110= 66000
b) 1800 x 100 / 60= 3000 pares de
bases c) NaOH 5 M: se hidroliza totalmente, exorribonucleasa: se degrada totalmente,
endodesoxirribonucleasa: insensible, calentamiento por encima de la Tm: es simple
hebra por lo tanto no aumenta la Abs a 260 nm.

MATERIAL SUPLEMENTARIO

Notacin taquigrfica

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