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RA Reyment (
B
)
Naturhistoriska Riksmuset, S10405, Estocolmo, Suecia
e-mail: richard.reyment@nrm.se
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AMT Elewa (ed.), Morfometra para Nonmorphometricians, Lecture Notes in
Tierra
Ciencias 124, DOI 10.1007 / 978-3-540-95853-6_2,
C
Springer-Verlag Berlin Heidelberg 2010
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en un contexto de forma grande. Sin embargo, su desarrollo y aplicacin se
celebraron de nuevo
debido a las dificultades de clculo. Algunos estudios biolgicos notables
hicieron, sin
nunca, surgen para el material basado en slo unas pocas variables, por ejemplo,
el trabajo de
Pearce (1959, 1965) sobre la expresin de la forma en rboles frutales.
El trmino "Morfometra" parece haber sido acuado por Robert E. Blackith
(Profesor de Zoologa de la Universidad College de la Universidad de Dubln)
hace unos 50 aos
(Blackith 1957), que entr en el tema a travs de su compromiso con la
agricultura
problema cultural causada por un enjambre de langostas. Aplic estadstico
multivariante
mtodos a la morfologa del caparazn bsica de saltamontes y era capaz de
seguir
la probabilidad de que el desarrollo de una fase de enjambre en una poblacin por
alfiler
sealando los cambios morfolgicos que anuncian una explosin
demogrfica. Este enfoque es
claramente los resultados biolgicos y de Blackith representan una forma de
introducir una precisin
modelo biolgico en un anlisis estadstico de sello tradicional.
Esencial para anlisis morfomtrico es el requisito de que la variacin en la
forma sea
representado en trminos descriptibles y repetibles. Las races de los aspectos
geomtricos
artista del siglo Albrecht Drer, por lo general dice que es alemn, pero que en
realidad era
Hngara. El padre de Durero se traslad a Nuremberg donde cambi su nombre
primero
a Threr (del hngaro Ajtsi, doormaker), luego a Durero, ms acorde
con la pronunciacin dialectal local del Threr. En trminos geomtricos, Durero
utilizado
las propiedades de las transformaciones afines para distorsionar detalles (como
las caras) por Lateral o elongacin vertical, la cartografa as una plaza en un paralelogramo y, o,
por
esquila una caracterstica.
Blackith (1965) seal que los intentos registrados ms tempranos para comparar
el
formas de animales fue hecha por la escuela alrededor de Pitgoras ya en el 5
siglo antes de Cristo. Un dibujo en bruto de una planta o animal que registr la
esencia de la
organismo sealando el nmero de uniones entre las lneas del boceto, pero
con no ms que el nmero mnimo de lneas para representar la imagen de la
organismo proporcion la base del procedimiento.
Algo ms tarde, parece, los antiguos egipcios estaban preocupados con
embellecimiento
ing monumentos funerarios con figuras y escenas, tallada en piedra caliza. El
examen de
fotografas de algunas de estas obras de arte, por ejemplo, aquellos figuraban en
el tratado
por Gay Robins (1994) da a conocer que algunos de ellos mantienen un patrn
discernible de
cuadrados estandarizados, marcados en rojo "tiza" que forman un marco para la
toma
las tallas. Es evidente que la obra de arte terminada estaba destinado a ser
limpiado de
los "apoyos", pero esto no siempre se llevan a cabo. Cmo eran las plazas
til? Ella,
y otros, han sealado que haba un sistema reinante de convenciones,
presumiblemente
determinado por un cuerpo colegiado de expertos, que define las proporciones de
lo humano
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como una indicacin de variacin en el tamao. Vectores latentes posteriores se
dice que son indicativos de
diversos factores de la forma-variacin. Esta interpretacin es circunstancial en
que est en
parte basada en un artefacto. Sin embargo, el mtodo es todava en uso amplio y
hay
alguna evidencia que apoya las pretensiones de una descomposicin espectral til
de variabilidad
capacidad en tamao y forma. La misma metodologa se aplica en Geologa para
el estudio
de los datos sedimentarias, composiciones de especies en paleoecologa, y en el
anlisis de
datos geoqumicos. En estas conexiones puede haber justificacin ms
convincente
para la interpretacin (cosificacin) de los vectores latentes. Los resultados de
multivariante
anlisis de las distancias observadas en los fsiles se presentan a menudo como
ordenaciones. Eso esta,
como grficos de dispersin bivariados de las puntuaciones obtenidas a partir de
la sustitucin de las columnas de la
datos de matriz en los vectores latentes.
Crecimiento y cambio de forma incluyen un componente tensorial en que estn
en dilas tasas de dife- en diferentes direcciones en las ubicaciones tpicas en un
tejido. Huxley (1932)
era muy consciente de esta distincin. Esta direccionalidad no es fcil de probar
en un prindescomposicin componente cipal, pero de fcil acceso si una orientacin
geomtrica es
adoptado.
(1970) El artculo de Mosimann en alometra, y la "identificacin" del vector de
tamao
se puede decir que marcar el punto de partida para un enfoque ms geomtrica a
morfomtricas y uno que se encuentra cerca del corazn de las nuevas morfometra
geomtrica
pero sin tener que ir todo el camino.
Blackith (1957) se embarc en un ambicioso programa dirigido a establecer
una base cuantitativa para el estudio de crecimiento y la forma en los insectos. La
publicacin inicial
cin puede ser visto como un intento de trazar un programa para la investigacin
detallada con
mtodos estndar de anlisis multivariante tales como estaban disponibles en el
momento, en un biovista lgico y con nfasis en los resultados que se consiguen por la escuela india
(Calcuta) en manos de PC Mahalanobis y CR Rao (1952) con referencia
la encuesta antropomtrica del sistema de colada en la India (Provincias
Unidas). Los Las
procedimientos revisados en ese trabajo fueron la funcin discriminante lineal, el
mtodo
de la discriminacin mltiple (anlisis de variacin cannica) y componentes
principales.
Una caracterstica de este breve artculo es el uso que se hace de una tabla de
distancias generalizadas
a lo largo de dos ejes, uno para la fase y uno para el tamao. Dentro del campo de
la experimentacin
biologa tal, Blackith (1957, 1960), en un conjunto de artculos dedicados al
polimorfismo
en los insectos, en la que se manejaron distancias Mahanolobis 'y variables
cannicas
con gran perspicacia, estableci una fundacin para el estudio cuantitativo de la
variacin en
tamao y forma. Un gran problema que hay que resolver en el uso de "medidas
de distancia" en el
estudio de la variacin est en el hecho de que el tamao y forma se
confunden. Esto significa
que un conjunto de mediciones en un caparazn de langosta, por ejemplo,
representan no slo
un componente A que expresaba talla diferencias, sino tambin la diferenciacin
entre las variables
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anlisis de variacin son directamente equiparable con las races latentes de
componentes principales
anlisis. Esto es a menudo una cuestin de confusin para los usuarios
matemticamente no entrenados
de programas de ordenador.
Morfometra segn la interpretacin de matemticos estadsticos
El matemtico Ingls Maurice S. Bartlett, que fue conectada ntimamente
con el desarrollo de varias reas principales de la estadstica matemtica, tambin
hecha
contribuciones a la aplicacin de la estadstica multivariante a la biologa
cuantitativa
(Bartlett, 1965). Admirable aunque como esta es como a la presentacin clara de
multimetodologa tivariate, la perspicacia de Bartlett en los procesos biolgicos deja
mucho que
deseada.
TP Burnaby comenz su vida profesional como un paleontlogo de la
Universidad de
Keele, Reino Unido Sus estudios fueron desde el principio en torno a los aspectos
cuantitativos de la
diversos invertebrados, principalmente foraminferos y bivalvos. Burnaby muri
prematuramente
Foraminferos Paleoceno. Entre los mtodos propuestos por Gower para estimar
etc. vectores de crecimiento, hemos utilizado dos de ellos, a saber, la solucin de
componentes principales
cin y la aproximacin mediante el anlisis mximo factor de probabilidad (es
decir, "factor de verdadera
anlisis "(Reyment y Jreskog 1999). El objetivo principal de nuestro anlisis fue
utilizar la variable cannica significa para las comparaciones entre especies
observadas en
diferentes intervalos de tiempo y no intentar un anlisis de la forma de la
variabilidad. Esta es
una importante limitacin en el alcance del estudio y uno mantenimiento de la
pena en mente.
Los resultados obtenidos para los mtodos propuestos por Gower (1976)
mostraron que la
componentes principales de la matriz de covarianza intra-muestras fueron xito
exi- en la eliminacin de la principal fuente de variacin en conflicto. Esta
variacin se
encontrado derivar de individuos de la especie de foraminferos haber estado en
diferente
rentes etapas de crecimiento cuando se fosilizan. Tambin se encontr que los
patrones producen cuando
las variable cannica medias de la muestra del crecimiento libre se representaron
frente cronolgico
Para llev a comparaciones evolutivas tiles entre especies.
Lectura Suplementaria
El libro de la planta-ecologista P. Greig-Smith (1957) es una lectura esencial para
Anycuerpo seriamente interesados en la aplicacin de mtodos cuantitativos para el
estudio de las plantas
entre otras cosas porque el tratamiento prctico detallada de los componentes
principales y
anlisis factorial de componentes principales.
Una introduccin avanzada becharming al anlisis biomtrico es el libro de
CR Rao (1952), a pesar de sus casi 60 aos desde la primera edicin.
Preguntas que se hacen por tyros hoy con respecto a los aspectos de la variable
cannica
anlisis (Rao no utiliza este trmino en su libro, prefiriendo la designacin
mltiple
discriminacin ple) se recogi en, por ejemplo, el caso de la seorita MM
Barnard
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Un tratamiento matemticamente riguroso de lo que se conoce como "anlisis de
factores"
en muchas conexiones es el texto por Reyment y Jreskog 1999. La distincin
puesto de relieve aqu es que el modelo de factores verdad es rara vez, o nunca,
se encuencados en la biologa. Un sustituto de validez algo desvencijada se emplea en su
lugar, la
trmino apropiado para el que es "el anlisis factorial de componentes
principales". La confusin
parece haber surgido con (1938) La expresin de Teissier "analizar factorielle"
para un
El anlisis de componentes principales de los cangrejos y una traduccin
demasiado literal, de los franceses
texto.
Reyment (1996) hizo una revisin histrica del fondo a principios de morfomtricas en el que se describe la evolucin en el pensamiento sobre ese tema.
El Coeficiente de Similitud Racial se introdujo en la antropometra de Karl
Pearson. Era, sin embargo, nada ms que la distancia estadstica generalizada de
Mahanalobis PC (que se muestran a Pearson en 1927 por Mahanalobis), con todo
fuera de la diagonal
elementos cero y varianzas a lo largo de la diagonal. Pearson no quiso admitir la
superioridad y la pertinencia de la distancia generalizada, embarcndose con ello
en un
controversia estril (cf. Mahanolobis, 1936).
Morfometra en una configuracin geomtrica
El problema de cmo construir una solucin prctica y matemticamente
justificable
cin al concepto de coordenadas basados de Thompson (1917, 1942) para
geomtricamente
que ilustra las relaciones de forma en los organismos con el nfasis puesto en
phylogereconstrucciones magnticos persiguieron biometristas durante muchas
dcadas. Thompson pens que
debera ser posible para representar relaciones entre los organismos relacionados
por deformacin
rejillas cionales. Por medio de una transformacin afn, un gnero de peces, por
ejemplo,
podra ser transformado grficamente a otro gnero, es de esperar confilogenticamente
conectado. Durante aos los trabajadores desconcertados sobre cmo se hizo
realidad - lo que hizo
las matemticas se parecen? La especulacin se prolong durante aos y aos sin
mucho
luz que se echaron sobre el tema. Bookstein (1991) y Dryden y Mardia (1998,
p. 200) observ la subjetividad vinculados a las transformaciones a mano alzada
de Thompson.
Huxley (1932, pp. 104-110) discute las debilidades se consideran inherentes a
el mtodo de coordenadas cartesianas desde el aspecto de la constancia de
crecimientogradientes. El libro de Thompson fue reimpreso muchas veces despus de 1917,
pero no lo hizo en
cualquiera de las ediciones se refieren a la forma en que haba hecho sus
figuras. En cualquier caso, Thompson
visin fue un importante avance en el pensamiento acerca de la variabilidad
biolgica, sino que era
no hasta 1978 que Bookstein proporcionado una solucin para el caso afn y
luego para
el caso no afn (Bookstein 1986) en muchas publicaciones posteriores, que se
resumen en
Bookstein (1989, 1991). Estas obras yacen una ubicacin cntrica en el origen de
la modesarrollo ern de morfometra geomtrica. No es exagerado afirmar que
sin visin de Bookstein excepcional y habilidades didcticas, el anlisis
geomtrico
de forma no habran convertido en una disciplina biolgicamente relevante, capaz
de ser ampliado en muchas direcciones.
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ha sido realizada por Dryden y Mardia (1998) y Bookstein (1991). Kendall et al.
(1999, p. 1) propugnan una interpretacin bastante rgida de puntos marcados
(que diestramente
omitir el uso de la palabra "seal") en su concepto matemtico de marcadores
en que subrayan que para ellos, los puntos marcados son bsicas y determinar el
objetos estudiados. De acuerdo con el concepto de orientacin biolgica de la
"geomtrica
morphometricians "se seleccionan los" puntos del marcador "de un general de
dos dimensiones
o continuo tridimensional. El inters biolgico no abarca los casos
donde se encuentran todos los marcadores en subespacio dimensional inferior o
dos o ms de ellos
coinciden, lo que contrasta con espacios de Kendall, que contienen las formas de
todos
configuraciones posibles, excepto aquellos para los que todos los puntos
coinciden (Kendall et al.
1999, p. 2).
Puntos de referencia se especifican por parejas de X, Y-coordenadas (el uso es
originalmente
un prstamo por ostelogos de levantamientos topogrficos, donde se encuentran
los arreglos
con respecto a los pares de coordenadas). Utilizando la geometra simple,
distancias puede ser contruido a partir de puntos de referencia taxonmica: el procedimiento inverso es,
sin embargo, no
posible. Los puntos arbitrarios en una circunferencia en eigenshapes son
igualmente paisajes terrestres
marcas, denotado por X, Y-coordenadas, pero carecen de la propiedad de
homologa o
correspondencia de punto a punto desde el espcimen a espcimen.
Morfometra base-Spline Thin-Plate
El concepto de las estras en forma de placa delgada para expresar grficamente
las deformaciones no es
basado en un concepto biolgico, en comn con la solucin algebraica. Parece
haber sido deveoped en relacin con el trabajo de ingeniera francesa,
posiblemente connectar con la estabilidad en fuselajes de aviones de ultrasonidos. Uno debe estar
seguro de lo
los morfometra basada en spline pueden hacer. Afirmaciones evanglicas de
relevancia biolgica
hecho especialmente en las etapas anteriores de las aplicaciones no siempre han
sido tiles
y, como se acaba de mencionar, no es cierto. La seleccin de los puntos de
referencia determina el resultado de
las conclusiones-forma analtica, debido al hecho de que la spline
descomposicin de placa delgada
posicin no se basa en la covariacin en forma-cambios en la entrada de
datos. De Ah Que,
cada configuracin de puntos de referencia es una representacin nica de slo el
conjunto de puntos
seleccionado en el objeto (Rohlf, 2002, p. 179). Delecin o adicin de puntos es a
menudo
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variaciones, los mtodos de registro y mtodos de distancia conducen a
conclusiones idnticas
acerca de la forma. Desafortunadamente, no hay una regla general para apoyar
esta creencia.
Posibles fuentes de error
Los errores pueden y deben surgir en el procesamiento analtico multivariado de
datos generados por
procedimientos de morfometra geomtrica. El mtodo intuitivamente atractiva
de triangulatdatos ing, Bookstein Coordenadas, por el que las coordenadas se registraron en
un comn
borde induce correlaciones espurias y matrices de covarianza en consecuencia no
vlidos
(Dryden y Mardia, (1998, p. 173). A pesar de ello, el teorema bsico que
todo lo que se puede lograr usando las coordenadas de la forma tambin puede
ser realizado por
medio de relaciones de distancias, como se demuestra en el documento original
en la forma coorcoor- (Bookstein, 1986). La posibilidad de aplicar la teora de la composicin
anlisis de datos (Aitchison, 1986) para el problema an no ha sido ms que
brevemente
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Bartlett MS (1965) estadsticas multivariantes. En Waterman TH, Horowitz HJ
(Eds.) Terica y
biologa matemtica, Captulo 8, Blaisdell Publishing Company, Newyork, pp
201-223