Power nmero 5

-Las cosas mas pesadas es lo primero que se va al fondo del tubo

cuando intentamos separar las sustancias
-Lo que queda al final en el sobre nadante, ser el citoplasma,
todas las hieroglficas

- el ADN es hidroflico
- la cromatografia es la tcnica para separar las protenas, en este
mtodo se separan las molculas basadas en las diferencias
que hay en su estructura y composicin
-hay tres tipos de cromatografa:
a) de intercambio inico: cuando tenga un compuesto con
alguna carga, si mi molcula tiene carga negativa cuando
ponga la muestra arriba lograre separar las molculas con
carga negativa de las positivas, las cargas negativas pasaran
de largo, pero si quiero ocupar las de carga positiva que
quedan en el tubo tengo que cambiar el buffer para que rompa
los puentes H cambiando el pH y as se separan los enlaces
inicos.
b) de exclusin molecular_ tamao: dentro pondr nuevamente
partculas, y arriba toda la mezcla, estar partculas tendrn
pequeos ollitos y las molculas que quepan en ellos, entrarn, y
las mas grandes, pasan de largo y saldrn primero, este tipo de
cromatografa es un poco ms fina
c) por afinidad: la caracterstica que permite la separacin en este
tipos de cromatografia son las interacciones especificas, en este
caso lo que se pone dentro es una molcula que tiene pegado un
anticuerpo, esta cromatografa es altamente especfica
-La electroforesis es un tipo de cromatografa elctrica, y lo que se
hace es agregar un gel especial para separar protenas, todas las

protenas se irn hacia el polo positivo, se separarn por tamao,

las ms grandes se quedan arriba y las chicas siguen de largo
-En un gel de dos dimensiones tengo que aplicar dos criterios para
poder separar, el primero es de pH, luego pongo mi muestra, como
esta tendrn diferentes pH, se separaran dependiendo de su pH,
esta caracterstica es llamada punto isoelctrico, despus pongo
el capilar donde estarn las protenas separadas por el pH, tendr
una matriz donde habr una distribucin de pH, las molculas se
movern hasta que ese ph del medio quede en el equilibrio con el
pH de las protenas, ahora tomo el gel con diferencias de pH y este
pongo en otro gel que la separar por tamao, ahora se obtendrn
puntos que sern protenas especficas
-Las molculas que reconocen los anticuerpos son antgenos, los
eudocinofilos son los anticuerpos propios de las alergias del
sistema respiratorio

- el sida ataca a la inmunoglobulina es por esto que la persona se

encuentra inmunodeprimida y muere de un resfriado porque deja
de producir anticuerpos

Clase nmero 6

-La nica molcula que tiene la capacidad transformante es el ADN

-Los fagos infectan bacterias, es un virus, infectaron una bacteria
marcado con un fago fsforo 32 y el otro marcado con azufre 35, el
primero tendra marcado su genoma, en cambio el otro se marcara en
las protenas
-El ADN se transmite de los padres a los hijos como caractersticas
hereditarias, es una estructura doble
-Cada una de las clulas hay un ncleo y dentro esta el ADN, cuando la
clula se esta dividiendo (mitosis) podemos obtener cromosomas
mitoteros (como marraqueta), dentro de los cromosomas tendremos los
genes, que estn formado por una doble hebra de cidos nucleicos que
forman el ADN, cada clula tiene el mismo numero de cromosomas.
-El flujo de la informacin gentica es igual en todas las clulas, da lo
mismo que sea eucarionte o procarionte.
-El ARN NO pasa a ser ADN
-El VIH es un retrovirus, esto quiere decir que es un virus de ARN
-El ADN se puede REPLICAR, esto solo pasa cuando la clula se va a
dividir, tambin se TRANSCRIBE, es decir a partir de la informacin
gentica que esta en el ADN formara una molcula de RNA, este podra
ser mensajero, ribosomal, de transferencia. Si es mensajero ser
traducido a una protena.
-Cuando se forma ADN a partir de un RNA, primero de ADN simple y
despus doble, esto se le llama transcripcin reversa inversa o
retrotranscripcin, los que pueden hacer esto los retrovirus, ya que
tienen su informacin gentica en forma de RNA
-La replicacin es un proceso TOTAL, no le puede sobrar ni faltar
ninguna nucletido, el encargado de la replicacin es la DNA
POLIMERASA, la que copia ADN para formar ARN se llama RNA
polimerasa, esta es la que hace la transcripcin

- La transcripcin es PARCIAL

- la replicacin y transcripcin son independientes

- no todas las clulas se replican
-Para que haya traduccin tiene que haber antes una transcripcin
-los grupos fosfatos le dan la caractersticas acidas al ADN, y la
base nitrogenada que le da la caracterstica bsica
-El azcar puede ser ribosa que tiene el OH en el C numero 2 o
desoxirribosa que son las que tienen un H, cuando es desoxirribosa el
nucleotido es de DNA y cuando es ribosa es RNA

- un nucleotido con otro esta unidos por enlace convalente

-El extremo 5` esta unida al carbono 5 lo que hay disponible es un
grupo fosfato con carga (-), en el extremo 3` que esta unida al carbono
3 es un hidrxilo, estos dos extremos son qumicamente distintos es por
esto que se dice que la hebra esta polarizada.

- Las bases nitrogenadas quedan hacia el interior en la molcula de

ADN y el azcar y el fosfato queda en el exterior, la funcin de este
ultimo es proteger a las bases nitrogenadas formando puentes de H,
ademas este grupo fosfato provee a la hebra de aDN de carga (-), el
ADN es formado por dos cidos nucleicos que estn ubicados de
forma antiparalela,en cambio el ARN siempre es una cido nucleico
simple, no es doble, formado por union sucesiva de nucleotidos, el
ARN tendr las bases nitrogenadas expuestas
-ADN cuando se replica lo hace de manera semi conservativa
-cada cromosoma formada por una sola molcula de ADN, la que
estaba asociada a protenas que le permiten el plegamiento, estas son
las llamadas histonas
-Las cromatinas es el complejo de ADN + protenas
-histona ayudan a la compactacin
-Un careotipo es la muestra de un cromosoma total de una especie

-tincin de giemsa hace precipitar sobre el dan regiones ricas en A y T

- en el caso del genoma procarionte el genoma esta en el cromosoma

circular, el cual es doble

- el plasmidio es informacin gentica, doble y circular que se replica

- cada cromosoma contiene regiones que son esenciales para su
funcin y estructura, estos son los toleremos y centrmeros, los
toleremos estn en los extremos de los cromosomas, esta formados por
secuencias de ADN repetidas no codificantes y el centrmetro tampoco
hay ADN codificante, tiene la funcin de posicionar las proteinas que
forman el cinetocoro, este es la estructura que permite que se unan los
microtbulos que forman el huso mittico despus de la mitosis.
-interfase, esta en estado normal, con su ADN mas o menos ligero,
cuando esta clula entra a mitosis (se divide para formar las dos clulas
hijas), tendr que compactar su ADN de forma correcta para unirlo a los
microtbulos para dar origen a las clulas hijas,
-cromosoma interfsico es cuando la clula esta relajada, tiene dos
tipos de cromatinas, la eterocromatina, la cual es una que esta muy
condensada y es transcripcionalmente inactiva como por ejemplo los
toleremos y centraremos, y la urocromatina es la cromatina donde esta
la informacin, es la que se transcribe
-el nucleosoma es cuando desenrollo el ADN, cada uno de ellos esta
formado por un complejo de protenas histonas + ADN, cada
nucleosoma al separarlo nuevamente, esta formado por 8 protenas
histonas, por lo tanto, es un octmero de histonas con 2 protenas
H2A, 2 de H2B, 2 de H3 y 2 de H4 y al rededor de estas histonas esta
enrollado 146 pares de base de ADN.
-las histonas son pequeas, conservadas, y tienen carga (+), esto
importa porque el ADN tiene carga (-)

- el ADN esta muy compactada para poder entrar dentro del ncleo,
esta compactacin la logra gracias a las protenas que le ayudan a
plegarse sobre si mismo, estas protenas se llaman histonas, estas
son protenas pequeas que tienen cargas (+), esta tiene la

importancia, son conservadas, esto quiere decir que su secuencia

aminoacdica y nucleotdica es conservada, son proteinas muy
parecidas de diferentes animales

- 1 gen tiene 500 pares de bases significa que tiene 500 pirimidinas y
500 purinas
-espacio de un nucleotido y otro se llama DNA espaciador, el cual esta
formado por un numero aprox de 200 pares de bases

- el primer nivel de compactacin de ADN es la formacin de

nucleosomas, despus se llama fibra de pentananomero, para que
este segundo pegamiento ocurra participa la histona llamada H1,
luego viene el plegamiento que se le conoce como la fibra de 30 nm
-Cuando el ADN necesita transcribirse para formar un ARNm, la super
compactacin, que es cuando esta muy apretado, le impide que logren
llegar todos los factores de transcripcin, por lo tanto el sistema
compactado sufrir otra compactacin en donde otras proteinas se
unirn a lugares especficos que permitirn que el ADN se relaje y se
suelte de las histonas y pueda transcribir.
-Un nucleosoma es el octmero de la histona con el ADN al rededor de
el
-las histonas tienen tres tipos de modificaciones que pueden ser
metiladas, acetiladas, o fosforiladas, estas modificaciones ocurren
solamente en la lisina
-La epigentica es como la transcripcin se regula.
-Cuando la replicacin se equivoca ocurren las mutaciones
-el ADN es copiado en Sntesis (replicado en la interfase), en mitosis la
clula solo se divide
-El proceso de polimerizacin es cuando se van agregando nucleotido a
una hebra molde, se unen a travs de 3 puentes de H con la base
nitrogenada de la hebra antiparalela y en la hebra que esta en

crecimiento se unen por un enlace fosfodiester que es un enlace

covalente, esto pasa en direccin 5`a 3`
-replicacin es semiconservativo, es decir, que las clulas hija
heredaran una hebra que viene de la original y otra nueva.
-el ADN se autoreplica, para que esto ocurra debe haber un complejo
enzimtico de muchas celular
-caractersticas de la replicacin: es total, es bidireccional, es
semiconservativa, comienza en un origen de replicacin
-La DNA polimerasa solo puede generar un enlace fosfodiester en los
extremos 3` OH, el que se lo dar un primer de RNA
-Los fragmentos de okazaki son aquellos que resuelven los problemas
de replicaron de la hebra es de 5 a 3`
-DNA polimerasa, polimeriza desde el 5`al 3`, en el 3`OH tiene la
capacidad de formar el enlace fosfodiester, tiene la capacidad
correctora desde el 3`a 5`y necesita de la enzima abrazadera permite
que la DNA polimerasa tenga una alta precesividad lo que dice que se
pega al DNA la DNA polimerasa, hasta que es innecesario polimerizar
-DNA primasa es la enzima que pone el partidor o primer de RNA para
que pueda comenzar la replicacin
-Los primer son secuencias cortas de RNA y se ponen en la secuencia
cada 100 o 200 pares de bases

- para evitar la hebra retrasada hay que eliminar el partidor de RNa y

esto lo hace una enzima que se llama nucleasa

- enzima elicasa rompe los puentes de H

- la ligasa que une los fragmentos de okasaki
- histonas estn asociadas al ADN
-DNA girasa o topoisomerasa evita que se sobre enrolle el ADN, lo que
hace para evitarlo es cortar enlace fosfodiester lo que hace que la hebra
libere la tensin

-la telomerasa es de los ecuaciones y lo que hace es replicar los

telomeros que tienen cientos de repeticiones de una secuencia
-Para que haya transcripcin no es necesaria que haya replicacin,
despus de una replicacin hay una transcripcin, son dos procesos
independientes, la transcripcin ocurre cuando la clula quiere expresar
una protena, y la replicacin ocurre cuando la clula necesita dividirse
-La transcripcin es el proceso que ocurre cuando a partir del DNA se
genera RNa, y la enzima responsable es la ArN polimerasa
-no todos los RNA se traducen a protena
-la hebra de RNA es sencilla, tiene la capacidad de plegarse sobre si
misma, y se pliega gracias a la formacin de puentes de H, como se
pliega as misma tiene una estructura tridimensional
-robosimas, es una molcula de RNA que va a adquirir la estructura
tridimensional, que tendr una capacidad cataltica, la cual bajar la
energa de activacin para acelerar una reaccin qumica

- la hebra que se copia de DNA para formar RNA ser la de 3`a 5`, se
-

llama DNA templado y la 5`3`se llama DNA codificante, en definitiva

siempre la transcripcin ser DNA codificante
donde empieza y donde termina el gen en la transcripcin es la
caja tata y en la traduccin es AUG, en el caso de la caja tata es
llamado promotor que esta antes de que comience el gen
los promotores son regiones no codificantes del ADN que regulan la
transcripcin, cada gen tiene su propio promotor
el promotor participa en la regulacin de la expresin
la transcripcin la hace la RNA polimerasa
el promotor regula la transcripcin, son no codificantes y se
encuentran antes de cada gen, su tamao es variable, no todos los
genes tienen promotores y los que no tienen no se pueden transcribir,
estos son llamados seudogenes
en la transcripcin de procariontes
la secuencia tata se encontrara al rededor del -10 y al rededor del -35
en bacterias
todo lo que esta antes del +1 va a corresponder a la zona del
promotor

- en las clulas procariontes la transcripcin y la traduccin es

-

simultneo porque no hay ncleos

en la transcripcin de ecuaciones no solo participa una RNA
polimerasa, tambin lo hacen tres mas diferentes, la RNA polimerasa
1 transcribir los RNA ribosomales, la 2 transcribe los genes
codificantes para proteinas rna mensajeros ademas de los rna
pequeos, la 3 transcribe los RNA de transferencia
en los procariontes esta el factor sigma
las diferencia de la DNa polimerasa y la RNA polimerasa es que una
polimerisa ribonucleotidos, la otra polimerisa desoxiribonucleotidos,
una utiliza partidores, la RNA no lo necesita, y una similitud es que
ambas corrigen errores en direccin 5 a 3
la caja TATA en procariontes esta en la posicin -10 y en eucariontes
esta en el -30
los eucariontes tienen intrones y exones, los primeros son no
codificantes y los segundos son codificantes, cuando se transcribe el
ADN los intrones tambin lo hacen
en los peroraciones el ADN esta organizado en operones, este es un
promotor que regula la transcripcin de varios genes, el alfa, beta y
gamma, a partir de un operon se genera un RNA mensajero
policistrnico, y a partir de este ultimo se generan diferentes
proteinas
el extremo 5de los RNAM se le llama cap 5que es una guaina que
tiene una metilacion unido por enlace fosfodiester al extremo 5del
RNAM
el RNa tiene una guanina 5 es para protegerlo y no sufra
degradacin y pueda viajar desde el ncleo al citoplasma para ser
traducido
splicing lo que hace es eliminar el intrn y pega los exones para
generar un RNAm maduro que lleva solo informacin codificante
el sistema como sabe cuales son los intrones y los exones? porque
los intrones comienzan con secuencia GU y al final AG
splaiciosomas esta formados por proteinas y RNAsn