Caractersticas generales del RNAm

El ARN mensajero (RNAm) es el resultado de la trascripcin de un gen y lleva la informacin

necesaria para sintetizar una protena.
El ARN mensajero (RNAm) es el RNA que transporta la informacin gentica presente en los genes
hasta los ribosomas, en el citoplasma, donde se realiza la traduccin de esa informacin a protena.
La RNA polimerasa II hace posible que se transcriba la informacin del ADN sintetizndose una
molcula de ARN con una secuencia complementaria a la del ADN.
Esto ocurre en el ncleo pero las molculas de pre-RNAm obtenidas deben sufrir los procesos de
maduracin postranscripcional antes de salir al citosol.
El RNAm ya maduro dirige la sntesis de protenas en los ribosomas. La traduccin a protena se
basa en la secuencia de nucletidos del RNAm: cada triplete de nucletidos (codn) se traduce a un
aminocido.
Despus de su maduracin, el ARNm sale al citosol. Aqu se une al ribosoma para dirigir la sntesis
de la protena codificada en su secuencia de nucletidos: cada triplete de nucletidos indica el
aminocido a incorporar en la cadena polipeptdica naciente.

Tipos de RNA
RNA mensajero (RNAm)
Esto est formado por el proceso de transcripcin. La cadena de ADN acta como una plantilla
en la formacin de esta hebra de RNA. El ARNm lleva el cdigo gentico del ADN en el
citoplasma a los ribosomas para su traduccin del ARN en un filamento de protena o polipptido.

RNA ribosmico
Esto ayuda al ARNm y el ARN de transferencia a unirse para formar la cadena polipeptdica.

RNA de transferencia o RNAt

Hay al menos 20 especies de ARNt y estos actan en traer las bases para formar los
aminocidos de la cadena polipeptdica.

RNA no codificante o RNAt

Estos son codificados por genes de RNA y tambin deriva de intrones de ARNm.

Transferencia-mensajero RNA (tmRNA)

Esto se encuentra en muchas bacterias y plastos. Estas etiquetas las protenas codifican por el
ARNm que carecen de codones de parada para la degradacin e impide que el ribosoma calado.

Ribozimas (enzimas RNA)

Algunos RNAs son enzimas. Durante muchos aos se crea ampliamente que slo protenas
podran ser enzimas. RNAs son conocidos a adoptar estructuras terciarias complejas y actuar
como catalizadores biolgicos. Estas enzimas RNA son conocidas como ribozimas y exhiben
muchas de las caractersticas de una enzima clsica, como un sitio activo, un sitio de enlace para
un substrato y un sitio de enlace para un cofactor, como un ion de metal.
Una de las ribozimas de primera en ser descubierta fue ARNasa P, una ribonucleasa que participa
en la generacin de molculas de tRNA de mayor tamao, precursor RNAs. ARNasa P se
compone de RNA y protenas; Sin embargo, la porcin de RNA solo es el catalizador.

RNAs reguladores
Estos RNAs sirven para regular el proceso de la expresin gnica. MicroRNAs (miRNA; 21-22 nt)
por ejemplo son encontrados en eucariotas y actuar a travs de ARN de interferencia (ARNi).
Estos miRNA y enzimas pueden descomponer ARNm que es complementario a la miRNA. Esto
puede bloquear el ARNm de ser traducido, o aceleran su degradacin.
Por otro lado pequeos RNAs de interferencia (siRNA; 20-25 nt) a menudo son producidos por la
degradacin del ARN viral, tambin hay fuentes endgenas de ARNsi. Actan similares a miRNA.
Un ARNm puede contener elementos reguladores, como riboswitches, en la 5' UTR o 3' UTR;
Estos elementos cis reguladores regulan la actividad de ese mRNA.

RNAs en proceso de la estructura terciaria de RNA

RNAs muchos participan en la modificacin de otros RNAs. Por ejemplo, los intrones son
empalmados fuera del pre-mRNA por catabolizar, que contienen varios RNAs pequeos de
nucleares (snRNA).

RNA como material gentico o genomas de RNA

Como el ADN, RNA puede llevar la informacin gentica. Esto se ve en muchos virus de ARN.

RNA en la transcripcin inversa

Algunos virus como el VIH tienen RNA como su material gentico que copia en ADN en forma de
transcripcin inversa. Estas copias de ADN, a continuacin, se transcriben ARN nuevo.

RNA bicatenario
Estos son llamados dsARN donde el ARN tiene dos hebras complementarias, similares al ADN
encontrado en todas las clulas. dsARN constituye el material gentico de algunos virus (virus de
ARN bicatenario).

En qu consisten los pasos de la Transcripcin

Fase de iniciacin de la transcripcin. Para que se inicie la transcripcin es necesario que
el gen est accesible para lo que la cromatina debe disminuir su grado de empaquetamiento. La
acetilacin de determinadas lisinas de las histonas favorece la descondensacin de la cromatina. El
complejo remodelador de la cromatina o CRM (Chromatin-Remodeling-Machine) tiene afinidad por
las lisinas acetiladas de las histonas y se une a ellas a travs del dominio llamado "Bromodominio".
El CRM desorganiza los nucleosomas aumentando el grado de exposicin y de accesibilidad de los
promotores. Finalmente el mediador, la ARN polimerasa II y los factores de transcripcin hacen que
se inicie la transcripcin.
El promotor de un gen es una regin del ADN con unas caractersticas especiales que determina el
punto en el que la ARN polimerasa comienza a transcribir un gen. Una vez que la ARN polimerasa
ha reconocido el promotor y se ha unido a l en primer lugar se forma el complejo de preiniciacin.
Este complejo est formado por algunos factores de transcripcin y la ARN polimerasa II. Despus
se forma el complejo de iniciacin cerrado al unirse otros factores de transcripcin y el mediador.
Posteriormente se forma el complejo de iniciacin abierto gracias a la actividad helicasa de uno de
los factores. En este instante comienza la sntesis de ARNm por la ARN polimerasa II a partir del
sitio llamado +1 que marca el punto de inicio de la transcripcin de un gen. Hasta que el fragmento
de ARNm sintetizado no tiene 8-10 nucletidos el proceso es reversible siendo posible que el
complejo se desorganice y la transcripcin del gen no se lleve a cabo. A este fenmeno se le conoce
como iniciacin abortiva. Cuando ya hay un fragmento de ARN de tamao adecuado, se fosforila el
dominio CTD (Carboxi-Terminal Domain) de la ARN polimerasa II. Esta fosforilacin, llevada a cabo
por el mismo factor que tiene actividad helicasa o por el mediador, es muy importante, ya que
desestabiliza las interacciones que tiene la ARN polimerasa II con algunos factores de transcripcin
favoreciendo su avance rpido transcribiendo el gen.

 Fase de elongacin. Durante la fase de elongacin el CTD debe seguir fosforilado. En esta
etapa, la ARN polimerasa II cataliza la formacin de los enlaces fosfodister entre nuclotidos.
Intervienen otros factores, conocidos como factores de elongacin. Sus funciones son disminuir las
pausas de la ARN polimerasa II, desorganizar los nucleosomas y favorecer los procesos de
correccin de errores. Tambin intervienen factores de transcripcin involucrados en la iniciacin. En
la elongacin se fosforila otra posicin del CTD. El CTD fosforilado es reconocido tambin por
protenas encargadas del procesamiento y maduracin del pre-ARNm, de modo que la maduracin
del pre-ARNm se produce de forma simultnea a la transcripcin. Concretamente, la formacin de la
caperuza (cap) metilada ocurre en la fase de iniciacin de la transcripcin y normalmente, el
proceso de splicing durante la elongacin. La poliadenilacin comienza en la fase de terminacin de
la transcripcin y acaba una vez finalizada sta.

Fase de terminacin. El CTD es defosforilado por una fosfatasa. La ARN polimerasa II

contina transcribiendo hasta llegar a una secuencia especfica que determina el sitio de
poliadenilacin. Esta secuencia es reconocida por una endonucleasa. Esta enzima corta el ARNm
unos nucletidos ms all de la secuencia que reconoce, liberndolo. Posteriormente esta secuencia
especfica es reconocida por una enzima encargada de aadir la cola de poli-A al transcrito.
El proceso de transcripcin debe estar finamente regulado, ya que de l depende la adaptacin al
medio y el buen funcionamiento del organismo. Cada tipo celular y cada estado funcional necesita
un perfil de expresin gnica diferente que se adapte a sus necesidades. Los factores reguladores
pueden incidir sobre cualquiera de los elementos de este complejo proceso. As hay reguladores que
modifican la accesibilidad de los genes, otros que alteran la fase de iniciacin, otros que actan en
la fase de elongacin y otros en la de terminacin. Igualmente existen reguladores de la
transcripcin que actan sobre los procesos de maduracin del ARN
La regulacin de la accesibilidad de los genes depende de las regiones controladoras de locus o
LCRs (Locus Control Region), de los insulators (aisladores), de los procesos de modificacin de
histonas, de los procesos de desempaquetamiento y desorganizacin de nucleosomas y de la
metilacin del ADN:
Las LCRs son regiones del ADN donde la expresin gnica est favorecida.
Los insulators son regiones del ADN que delimitan a modo de barrera las zonas
transcripcionalmente activas de las que estn inactivas participando en la correcta organizacin de
la cromatina.
Las modificaciones en las histonas son muy importantes en el control de la transcripcin. La
metilacin de lisinas impide la transcripcin gnica ya que las histonas con este tipo de modificacin
reclutan protenas silenciadoras de genes que suelen poseer un cromodominio que intervienen en
la interaccin con las histonas metiladas. En cambio, la acetilacin de determinadas lisinas favorece
la interaccin con el CRM que lleva a cabo la desorganizacin de los nucleosomas y por tanto hace
los genes accesibles para ser transcritos.
La metilacin del ADN es otra modificacin que produce silenciamiento de genes. La metilacin de
genes es muy importante en procesos del desarrollo, en la impronta gantica y en el silenciamiento
de genes repetidos.
Otro nivel de regulacin de la transcripcin es el que se lleva a cabo actuando sobre el proceso de
iniciacin. Existen protenas activadoras que se unen a elementos prximos al promotor y otras que
se unen a los llamados potenciadores que pueden localizarse en posiciones ms alejadas del
promotor. Las protenas activadoras se unen a sus sitios de unin en el ADN y favorecen el
reclutamiento de la ARN polimerasa II y de los factores de transcripcin necesarios para que se
forme el complejo de iniciacin y comience la transcripcin. Las protenas represoras actan de
forma directa unindose al operador y evitando que se una la ARN polimerasa o de forma indirecta
bloqueando la accin de las protenas activadoras.
Otros reguladores de la transcripcin actan sobre las protenas involucradas en el proceso de
elongacin bloqueando la transcripcin a este nivel.
Tambin existen reguladores de la transcripcin que actan sobre el proceso de poliadenilacin,
evitando la liberacin de la ARN polimerasa y la finalizacin de la transcripcin.