Revista Colombiana de Fsica, Vol. 42, No. 3 de 2010.

Uso Del Software Simion 3D Para El Diseo De Un Tubo De Tiempo De

Vuelo
Design Of A Tube Of Time Of Flight Using Simion 3D Software
B.E. Sanabria Arenas a, R. Cabanzo Hernndez a, E. Meja-Ospino* a
a

Laboratorio de Espectroscopia Atmica y Molecular (LEAM). Universidad Industrial de Santander. A.A 678;
Bucaramanga, Colombia.
Recibido 17.03.10; Aceptado 17.12.10; Publicado en lnea 17.04.11.

Resumen
La espectrometra de masas por Tubo de Tiempo de Vuelo (MS-TOF) es una tcnica analtica que permite la
determinacin directa de las masas de especies bajo estudio. La muestra es ionizada y los cationes son acelerados
mediante un campo elctrico a travs de una regin de vuelo libre para ser separados con base a su relacin m/z, donde
m= masa del ion y z= carga del ion. En el diseo y la construccin de un tubo de tiempo de vuelo, es necesario conocer
como es el comportamiento de los iones bajo la accin de un campo elctrico en condiciones de alto vaco. Para el
desarrollo de la presente investigacin se utiliz el programa computacional SIMION 3D versin 7.00, y de esta manera
se simul el comportamiento de los iones de estudio dentro del tubo de tiempo de vuelo, con el fin de obtener los valores
ptimos de potencial que permiten la mejor resolucin del equipo; adems se observ la variacin de la resolucin del
instrumento al modificar las condiciones iniciales de los iones. La resolucin de un tubo de tiempo de vuelo es afectada
por varios factores, principalmente debido a una distribucin en la energa cintica inicial de los iones, la cual se relaciona
con el sistema de introduccin de la muestra, y por una distribucin en la posicin inicial de los iones, la cual depende del
volumen de ionizacin de la muestra.
Palabras clave: Espectrometra de Masas; Tubo de Tiempo de Vuelo; SIMION 3D.

Abstract
The time-of-flight mass-spectrometry (TOF-MS) is an analytical technique used to determine directly the mass of the
species under study. The sample is ionized and the cations are accelerated by an electrostatic field through a free flying
regin, the ions are separated according to their m/z relation, in which m= mass of ion and z= charge of ion.
For the design and construction of a Time-of-Flight Tube, it is necessary to understand how ions behave in an electrostatic
field in vacuum conditions. For the development of this research it was used the computational program Simion 3D
version 7.00, and we simulated the behavior of ions in the Time of Flight Tube, in order to obtain the optimal values of
potential allowing the instruments best resolution; in addition to this it was observed the variation of instrument`s
resolution, when the ions initial conditions were modified. The resolution of a Time of Flight Tube is affected by several
factors, mainly by the distribution of initial kinetic energy of the ions, which is related to the introduction of the sample,
and by a distribution in the initial position of the ions, which depends on the ionization volume of the sample.
Keywords: Mass Spectrometry; Time of flight tube; SIMION 3D; Resolution.
PACS: 82.80.Rt.
2010 Revista Colombiana de Fsica. Todos los derechos reservados.

* emejia@uis.edu.co

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1.

velocidades subrelativistas (como ocurre en el rgimen de

energas de los keV) una buena descripcin del TOF-MS
no requiere ms que fsica Newtoniana como se muestra en
las siguientes ecuaciones [2-3].

Introduccin

La espectrometra de masas por tiempo de vuelo (TOFMS, de sus siglas en ingls) ha llegado recientemente a la
familia de la espectrometra de masas, tuvo un uso prominente durante los aos 60s pero fue rpidamente desplazado por los instrumentos cuadrupolares y magnticos
debido a la sensibilidad y poder de resolucin de estos
ltimos. La razn ms significativa para el poco desarrollo
en los primeros aos del TOF-MS, la constituy la falta de
tecnologa que facilitara el registro y el procesamiento de
los espectros de masas en una escala de tiempo de microsegundos. Estas posibilidades tecnolgicas han emergido
ahora junto con nuevos mtodos de ionizacin de molculas biolgicas masivas y tambin con tcnicas rpidas de
separacin de mezclas complejas. TOF-MS es hoy da una
tcnica altamente ventajosa, por lo que est resurgiendo
como un poderoso sistema analizador de masas.

a=

Aceleracin:

(1)

Eq
)t
m
u - u0 m
ta =
( )
E
q
1 Eq 2
s = s0 + u o t + (
)t
2 m

Velocidad y Tiempo:

Posicin:

Eq
m

u = u0 + (

(2)
(3)

(4)

Velocidad de separacin:

uD =

2 qEs a
m

(5)

Tiempo de separacin:

tD =

D
2 qEs a
m

(6)

Tiempo de vuelo:
TOF = t0 + ta + tD + td

(7)

donde m y q son la masa y la carga de los iones, s0 es la

distancia a la posicin inicial, sa es la distancia de s0 a la
regin libre de campo, u0 y uD son la velocidades iniciales
y de separacin, E es la fuerza del campo elctrico, t0 es el
tiempo despus de t=0 en que los iones empiezan a acelerarse, ta es el tiempo en que el in pasa de la velocidad u0
a uD, tD es el tiempo de separacin a velocidad constante, D
es la distancia del espacio libre de campo, y td es el tiempo
de respuesta del detector.

Fig.1: Principales regiones de un tubo de tiempo de vuelo.

El principio esencial de TOF-MS descansa en el hecho

de que una poblacin de iones movindose en la misma
direccin y teniendo una misma distribucin de masas, a
una energa cintica aproximadamente constante, tendr
una correspondiente distribucin de velocidades en la cual
la velocidad es inversamente proporcional a la raz cuadrada de m/q. Si consideramos una situacin en la cual iones,
bajo la influencia de un campo elctrico externo, son acelerados en un plano espacial normal al vector de aceleracin,
su tiempo de llegada a un plano blanco paralelo al plano
de origen ser distribuido de acuerdo a la raz cuadrada de
m/q de los iones. La figura 1 muestra un esquema de un
TOF-MS en la configuracin diseada por Wiley-McLaren
[1]. En esta configuracin se pueden diferenciar 4 regiones: una regin de interaccin, en la cual la muestra es
impactada con la fuente de ionizacin, una vez se generan
los iones, los cationes son acelerados mediante la aplicacin de un campo elctrico, pasan a la regin de aceleracin donde son acelerados hacia la regin de separacin,
tambin conocida como regin de vuelo libre, debido a que
all no actan campos elctricos y/o magnticos, finalmente la partcula alcanza la regin del detector. En el caso de

Por otro lado, SIMION 3D es una de los software ms

verstiles, que permite simular las trayectorias de partculas cargadas en cualquier virtual campo elctrico o magntico. Adems SIMION 3D permite crear electrodos de
cualquier simetra, y aplicar potenciales positivos a negativos de manera controlada. SIMION ha sido utilizado para
simular filtros cuadrupolares, Tubos de Tiempo de Vuelo,
ciclotrones de resonancia de iones y trampas de iones.
Adems SIMION ha sido extremadamente poderoso en el
modelado de lentes inicos y guas de iones [4-8].
En este artculo se presenta el diseo y construccin
virtual de un analizador de masas tipo tubo de tiempo de
vuelo (TOF, por sus siglas en ingls), utilizando el programa computacional SIMION 3D versin 7.00. Se evalu, adems, la dependencia de la resolucin del dispositivo con la distribucin inicial de energa cintica y la distribucin espacial de los iones. [1].
354

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2.

truido e instalado en el laboratorio, este sistema tiene 60

cm de longitud y 2,56 cm radio interno. El TOF-MS real
tiene la configuracin de Wiley-McLaren [1]; lo cual significa que est constituido por tres regiones fundamentales;
regin de ionizacin, regin de aceleracin y regin de
separacin (o regin libre de campo). La figura 2 (arriba)
muestra una imagen en tres dimensiones del TOF, en el
que se reproducen las dimensiones de cada una de las regiones en el sistema real. La tabla 1 presenta los iones que
se utilizaron para simular el comportamiento del TOF.

Parte Experimental
60

50

Posicin Y (cm)

40

30

20

10

3.

0
0

20

40

60

80

100

120

Resultados y Discusin

Posicin X (cm)

La primera etapa de la simulacin se realiz sobre un

nico in por especie estudiada, polarizando las dos primeras placas (la tercera placa y el tubo se mantienen a tierra)
con valores en el intervalo de 400 a 5000 V. Esta etapa
permiti determinar los potenciales de las placas adecuados para lograr una mejor separacin temporal de los iones
(Placa 1 a 800V y placa 2 a 400 V). La figura 2 (abajo)
muestra la superficie de potencial del tubo con las placas
polarizadas con los mejores valores de potencial. La figura
3 muestra la relacin del tiempo de vuelo versus la relacin
m/q de cada especie estudiada. El ajuste de esta relacin
muestra un comportamiento cuadrtico de acuerdo a lo
mostrado en la Ecuacin 6.

800
700
600

Potencial (V)

500
400
300
200
100
0
0

20

40

60

80

100

120

Posicin X (cm)

Fig. 2: Arriba: Tubo de tiempo de vuelo construido en SIMION

3D. Abajo: Superficie de potencial del tubo de tiempo de vuelo
en SIMION 3D.
Tabla No.1: Masa de los iones de estudio.
ION

MASA ( UMA)

H+

1,0079

H2+

2,0158

N+

14,0067

O+

La segunda etapa de la simulacin consisti en utilizar

un grupo de iones con la misma relacin m/q (30 iones)
distribuidos espacialmente con respecto a la posicin inicial en un volumen cbico de ionizacin de 1 mm3. Los
resultados para cada especie estudiada se presentan en la
tabla 2. Los intervalos de tiempos de vuelo representa la
anchura de los picos. A este volumen de ionizacin la
anchura de los picos no supera los 0,2 s y en ningn caso
se observa solapamiento de los picos (Tabla 2), esto demuestra que a los potenciales utilizados la resolucin del
sistema es adecuado. Sin embargo, con la finalidad de
tener un modelo ms cercano a la realidad, hemos conside-

15,9994
+

OH

17,0073

H2O+

18,0152

N2

Fig. 3: Masa de los iones vs. Tiempo de vuelo.

28,0134

NO+

30,0061

O2+
Ar+

31,9988
39,948

Se construy virtualmente un analizador de masas tipo

tubo de tiempo (TOF-MS) utilizando SIMION 3D (versin
7.0) con la finalidad de simular un TOF-MS lineal cons355

B.E. Sanabria Arenas, R. Cabanzo Hernndez, E. Meja-Ospino: Uso Del Software Simion 3D Para El Diseo De Un Tubo De Tiempo
De Vuelo

rado, finalmente, iones con energa inicial diferente de

cero, esto significa que los iones formados en la regin de
ionizacin poseen una distribucin de energa cintica
determinada por la temperatura a la que se encuentran.

Tabla No. 2: Intervalos TOF de los iones con una distribucin en

la posicin inicial.
Masa iones (uma)

Intervalos TOF (s)

Vol. Peq.

1,0079
2,0158
14,0067
15,9994
17,0073
18,0152
28,0134
30,0061
31,9988
39,948

1,73937-1,76909
2,45984-2,50186
6,48411-6,59489
6,93002-7,04842
7,14497-7,26704
7,35364-7,47927
9,16992-9,32659
9,49046-9,65261
9,80053-9,96797
10,9504-11,1375

Fig. 4: Espectro simulado para el sistema aproximado a un

sistema real.
Tabla No.4: Intervalos TOF de los iones con una distribucin en
la energa cintica inicial para 298 K y una distribucin en la
posicin inicial para un volumen pequeo de ionizacin.
Masa iones (uma)
1,0079
2,0158
14,0067
15,9994
17,0073
18,0152
28,0134
30,0061
31,9988
39,948

Para nuestra simulacin hemos considerado dos temperaturas de trabajo; 298 y 4 K. Estas temperaturas corresponden en la realidad a dos maneras de introducir la muestra en un tubo de tiempo de vuelo, por efusin y por haces
moleculares, respectivamente. La distribucin de energa
cintica de cada uno de los iones utilizados se determin
utilizando la ecuacin de distribucin de de MaxwellBoltzmann. La tabla 3 muestra la anchura temporal de los
picos para cada in estudiado. A las dos temperaturas es
posible obtener un espectro TOF bien resulto (sin solapamientos), sin embargo es evidente la estrechura que se
observa cuando se trabaja a 4 K. Finalmente, hemos combinado la distribucin espacial y la distribucin energtica
(a 298 K) y se ha obtenido un espectro TOF simulado que
se presenta en la figura 4. Se observa que al aumentar las
masas de los iones disminuye la resolucin (los picos estn
ms cercanos temporalmente), sin embargo los picos tienden a ser mas estrechos conforme aumenta la masa.

4.

La resolucin de un tubo de tiempo de vuelo se ve afectada por varios factores, pero en general se observa una
fuerte influencia en el ancho del pico en el espectro, debido
a la distribucin en la posicin inicial de los iones, y en la
distancia de separacin entre los picos, debido a una distribucin en la energa cintica inicial de los iones. Actualmente en el mercado existe una gran variedad de componentes y modificaciones en el analizador que permiten
aumentar la resolucin del instrumento tales como los
lentes Einzel, reflectrn, aceleracin ortogonal, entre otros;
sin embargo con solo utilizar una bomba turbomolecular
como sistema generador de vaco y un sistema de introduccin mediante haces moleculares, la resolucin del equipo
construido en el Laboratorio de Espectroscopia Atmica y
Molecular aumentara notablemente.

Intervalos TOF (s)

298 K
4K

1,0079
2,0158
14,0067

0,738134-0,737574
1,04388-1,04308
2,751620-2,74957

0,737881-0,737817
1,04351-1,04343
2,75069-2,75047

15,9994
17,0073
18,0152
28,0134
30,0061
31,9988
39,948

2,94087-2,93865
3,03207-3,0298
3,12064-3,11828
3,89142-3,88847
4,02745-4,0244
4,15903-4,15587
4,64699-4,64347

2,93988-2,93961
3,03106-3,03079
3,11959-3,1193
3,8901-3,88975
4,02608-4,02572
4,15759-4,15725
4,64539-4,64501

Conclusiones

Mediante el uso de herramientas computacionales como SIMION 3D es posible disear y optimizar un instrumento para uso cientfico, para este trabajo en particular un
tubo de tiempo de vuelo lineal, gracias a esto fue posible
realizar correcciones y predicciones del instrumento, permitiendo economizar dinero y tiempo en su construccin.

Tabla No.3: Intervalos TOF de los iones con una distribucin en

la energa cintica inicial para 298 K y 4 K.
Masa iones
(uma)

Intervalos TOF(s)
0,734987-0,740505
1,03942-1,04723
2,7399-2,76049
2,92835-2,95032
3,01917-3,04183
3,10734-3,13067
3,87484-3,90392
4,01028-4,04039
4,14129-4,17239
4,62719-4,66192

5.

Agradecimientos

Este trabajo fue apoyado por la Universidad Industrial de

Santander (UIS) a travs de vicerrectora de Investigacin
y Extensin.
356

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