Beruflich Dokumente
Kultur Dokumente
Tema 2.2
ANFTERO.
En la naturaleza existen gran variedad de aminocidos, de los cuales unos forman parte de las
protenas y otros no. En los anlisis realizados en protenas de animales, bacteria, plantas y otros
microorganismos, solo se han encontrado 20 aminocidos diferentes componentes de todas las protena,
que reciben el nombre de aminocidos proteicos.
Los aminocidos proteicos son compuestos qumicos con un grupo amino (NH2, que tiene
carcter bsico) y otro carboxilo (COOH, cido), unidos covalentemente a un tomo de carbono
central (C), al cual tambin se unen un tomo de hidrgeno (H) y una cadena lateral (R) distinta para
cada uno de los 20 aminocidos.
COOH
H2NCH
Comportamiento anftero.
En los medios biolgicos (condiciones fisiolgicas de pH=7), los aminocidos se comportan
como sustancias anfteras, ya que pueden presentar carcter cido (por la presencia del grupo
carboxilo), capaz de ceder protones (H+) al medio, o bsico, por la presencia del grupo amino (-NH 2),
capaz de aceptar protones (H+) del medio.
En cuanto a la ionizacin, tanto el grupo NH2 como el COOH pueden ionizarse, de la
siguiente forma:
Forma no ionizada
Forma ionizada.
Medio cido
Medio bsico
Los aminocidos tendrn un comportamiento cido o bsico, en funcin del pH del medio y del
tipo de aminocido. En condiciones fisiolgicas (pH=7), los grupos amino se encuentran en gran parte
protonados y los grupos carboxilo desprotonados, por lo que estn doblemente ionizados formando
iones hbridos que se denominan formas zwitterinicas (del alemn zwitter, hermafrodita).
Caractersticas:
1. El enlace peptdico es muy resistente a la hidrlisis (enlace covalente), lo que hace muy
estables a las cadenas polipeptdicas.
2.- Su estructura tridimensional es muy peculiar ya que permite que los tomos del grupo
carboxilo y del grupo amino (CO-NH) se siten en un mismo plano, con distancias y ngulos fijos.
No pueden rotar, y esto es debido a que se originan dos formas que se estabilizan por resonancia y le
dan al enlace peptdico un carcter parcial de doble enlace que le impide girar libremente, solo
pueden girar los carbonos . Adems, presenta una cierta rigidez que inmoviliza en el plano los
tomos que lo forman.
El carcter parcial de doble enlace del enlace peptdico impone unas limitaciones en el
plegamiento de las protenas; (no pueden rotar alrededor del enlace peptdico y s alrededor de los
enlaces N-C y C-C), por ello determina la estructura de las protenas.
Diferencia entre pptidos y protenas.
Aunque el lmite es arbitrario, se suele basar en dos criterios:
1.- La longitud. Generalmente los pptidos suelen tener menos de 10 aa, los polipptidos cuando el
nmero es mayor, generalmente 50 aa y las protenas ms de cincuenta o un peso molecular
de 5000 o mayor. No obstante, hay discrepancias, por ejemplo, el glucagn (29 aa) y la
insulina (51 aa) son hormonas del pncreas que regulan la concentracin de glucosa en sangre
y la sntesis e hidrlisis de glucgeno; la insulina ya se puede considerar, ms que un pptido,
una verdadera protena. La oxitocina y la vasopresina, hormonas de la hipfisis, son pptidos
de 9 aminocidos. La oxitocina produce contraccin de la musculatura lisa del crvix uterino y
estimula la salida de la leche despus del parto y lactancia, la vasopresina (ADH) interviene
en la excrecin de agua.
Otros pptidos importantes son neuromoduladores, sustancias que intervienen en la
transmisin nerviosa modulando, en muchos casos, la accin de los neurotransmisores. Por
ejemplo, las endorfinas, opiceos naturales del cerebro humano, que son importantes en el
control del dolor entre otros procesos.
Por ltimo, algunos antibiticos, como la gramicidina, tambin son peptdicos.
2.- La existencia biolgica. Una cadena polipeptdica sintetizada en el laboratorio y sin existencia
probada en algn ser vivo, se denomina pptido, independientemente de lo larga que sea.
17.- NIVELES DE ORGANIZACIN DE LAS PROTENAS.
Cada protena posee una estructura tridimensional (conformacin) nica que le confiere una
actividad biolgica especfica. As, la protena toma una determinada forma, que en definitiva depende
de la estructura primaria.
La organizacin de una protena viene determinada por cuatro niveles estructurales: la
estructura primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria. Cada una de estas estructuras corresponde a
la disposicin de la anterior en el espacio.
Estructura Primaria.
La estructura primaria de una protena es la secuencia lineal de los
aminocidos que la integran, es decir, nos indica qu aminocidos la constituyen y en qu orden se
disponen en la cadena. La estructura primaria es mantenida por los enlaces peptdicos y determina la
conformacin espacial de la molcula, es decir, va a determinar las estructuras secundaria, terciaria y
cuaternaria.
Si se rompen los enlaces peptdicos, se destruye la estructura primaria (y, con ello, la cadena
polipeptdica).
Las cadenas lineales de aminocidos se denominan pptidos (pocos aminocidos).
Convencionalmente, en todas las protenas se considera como extremo inicial aquel que
presente el aminocido con el grupo amino libre (extremo N-terminal), y como extremo final aquel
cuyo aminocido tiene el grupo carboxilo libre (extremo C-terminal).
La secuencia de aminocidos de una protena se expresa enumerando los aminocidos desde
el extremo N-terminal hasta el extremo C-inicial. Ejemplo: NH2-Gly-Cys-Ala-Val-COOH.
Como el esqueleto covalente del pptido (6 tomos que se repiten: -NH-CH-CO-) es idntico en
todas las protenas, lo que vara y le da individualidad propia a los pptidos, y por extensin a las
protenas, es el orden o secuencia de sus cadenas R: las protenas se diferencian por el nmero,
naturaleza y secuencia de aminocidos y de la forma que adopte, y de ello depender su funcin
biolgica.
Dos caractersticas importantes relacionadas con la estructura primaria son la variabilidad y la
especificidad.
Variabilidad. Puesto que existen 20 aminocidos proteicos, y que una protena tiene siempre al
menos varias decenas de aminocidos, y fcilmente ms de un centenar, es posible construir un
nmero fabuloso de protenas diferentes. Encadenando los mismos aminocidos en diferente orden
se obtienen protenas distintas. Entonces, si pensamos en protenas que tengan n restos de
5
aminocidos, ser posible construir (al menos en teora) 20n distintas. La variedad real de protenas
que existen tambin es muy grande, aunque muy inferior a la terica, por supuesto.
Especificidad. Siendo tanta la variabilidad de las protenas, no debe sorprender que tambin haya
particularidad. Es decir, cada ser vivo, o cada grupo de seres vivos, tiene sus propias protenas,
distintas a las de otros seres vivos, o grupos: en esto consiste la especificidad. Podemos observar
especificidad a nivel de especie; por ejemplo, el citocromo c (una protena transportadora de
electrones) humano no es igual que el de otras especies de mamferos (perro, asno, caballo, conejo,
cerdo,...). Esta caracterstica se ha utilizado para estudiar relaciones evolutivas y elaborar rboles
filogenticos. Pero incluso existe especificidad a nivel de individuo: un individuo tiene protenas
propias, distintas a las de sus semejantes; incluso entre gemelos idnticos hay diferentes protenas.
Estructura Secundaria.
La estructura secundaria es la disposicin espacial y regular de la cadena de aminocidos
(estructura primaria). Esta disposicin puede encontrarse en toda o, al menos, en parte de la protena.
Gracias a la capacidad de giro de los enlaces no peptdicos, a medida que los aminocidos se van
uniendo durante la sntesis proteica, la cadena polipeptdica que se forma, adopta una disposicin
espacial estable (el estado de mnima energa) que se corresponde con la estructura secundaria; es
decir, cada una de ellas adquiere la forma tridimensional ms cmoda
El plegamiento de la estructura primaria depende del nmero de enlaces de hidrgeno (P-H)
que se pueden formar entre los grupos, -C=O de unos enlaces peptdicos y los grupos NH de otros
enlaces prximos ( -C=OH-N-), de manera que las cadenas laterales R distribuidas a lo largo de la
cadena peptdica adoptan determinadas posiciones en el espacio. Tambin depende de las
condiciones de tensin y temperatura en que se encuentra.
Se conocen tres tipos de estructuras secundarias que se repiten en muchas protenas: -hlice,
hoja plegada- y la hlice de colgeno.
Estructura en -hlice.
Se forma al enrollarse la estructura primaria sobre s misma, con un giro dextrgiro con 3,6
aa por vuelta y originando una hlice apretada que se estabiliza exclusivamente por los numerosos
puentes de hidrgeno entre el CO- de un aminocido y el hidrgeno del NH- del cuarto
aminocido siguiente. (-C=OH-N-).
La formacin espontnea de estos enlaces de hidrgeno hace que todos los oxgenos de los
grupos CO- queden orientados en el mismo sentido, mientras que todos los hidrgenos de los
grupos NH- quedan orientados en sentido contrario. Las cadenas laterales (R) de los aminocidos, no
participan, sobresalen hacia afuera. Ejemplo: la -queratina del pelo y de la piel.
entre distintas cadenas polipeptdicas adyacentes. Esta estructura se presenta, entre muchas otras
protenas, en la fibrona de la seda.
Estructura terciaria.
La estructura terciaria de las protenas es la conformacin definitiva de la cadena polipeptdica
(cada una con su correspondiente estructura secundaria, -hlice o -laminar) como consecuencia de
las interacciones establecidas entre las cadenas laterales R situadas a lo largo de la cadena.
La estabilidad de las protenas globulares se debe a los distintos enlaces entre los radicales
(R) de los aminocidos. Estos enlaces pueden ser:
Enlace disulfuro
(E. fuerte)
Enlace de hidrgeno
( E. dbil)
Enlaces inicos
(E. dbil entre
grupos ionizados)
SS.
NHO=C-
COO NH3+.
Interacciones hidrofbicas. Los enlaces hidrfobos, muy dbiles, que se establecen entre dos
cadenas laterales no polares al unirse sin que queden entre ellos molculas de agua, que se
mantienen fuera.
Segn el plegamiento completo de las protenas podemos encontrar dos tipos de protenas:
a) Protenas fibrosas, filamentosas, o escleroprotenas: cuando las cadenas suelen tener la misma
estructura secundaria en toda su extensin, sin giros y con pequeas o nulas modificaciones, ya que
las cadenas laterales R apenas influyen (tienen muy pocos grupos polares). En estos casos, la
estructura secundaria coincide con la terciaria. No se dan, en general, tramos con hlice- y otros
con lmina- en una misma cadena, sino que toda ella desarrolla un solo tipo de estructura
secundaria.
Suelen ser protenas alargadas, insolubles en agua, muy resistentes y con funcin estructural, como
el colgeno, la queratina del pelo y la fibrona de la seda, entre otras.
b) Protenas globulares: cuando, frecuentemente, la cadena polipeptdica se pliega en una estructura
tridimensional compacta y ms o menos esfrica.
Algunas caractersticas importantes de las protenas globulares son las siguientes:
-- Las protenas globulares tienen forma globular, esferoidal, como un ovillo. Son generalmente
solubles en agua y tienen funciones variadas.
-- La cadena polipeptdica se repliega, de forma que aminocidos que inicialmente estaban muy
alejados pueden quedar juntos. El plegamiento es un proceso espontneo.
-- Aunque cada protena tiene un modo distinto de plegarse, en todas ellas hay caractersticas comunes:
a) un plegamiento compacto, con poco o ningn espacio para las molculas de agua.
b) los grupos R hidrfilos estn localizados en el exterior,
c) los grupos R hidrfobos estn localizados en el interior.
.
Estructura Cuaternaria.
La estructura cuaternaria hace referencia al ensamblaje de dos o ms cadenas peptdicas
separadas, cada una con su estructura terciaria, que se unen mediante enlaces dbiles (no covalentes)
y, en ocasiones, por enlaces covalentes del tipo enlace disulfuro, para formar la protena completa
(oligmero). El conjunto se denomina oligmero, y cada una de sus cadenas monmero. Los
monmeros pueden ser idnticos o distintos.
Segn el nmero de monmeros, estas protenas se denominan dmeros, como la insulina;
trmeros, como el colgeno; tetrmeros, y una de las protenas globulares ms conocida con
estructura cuaternaria, es la hemoglobina. La hemoglobina est formada por cuatro subunidades, iguales
dos a dos: dos cadenas y dos cadenas (2 + 2 ).
Adems, cada una de las cadenas lleva un grupo hemo, una parte no formada por aminocidos, que
contiene Fe y que es donde se une el O2 transportado por la hemoglobina.
Como hemos dicho, la estructura cuaternaria solo se manifiesta en las protenas (fibrosas o
globulares) formadas por la asociacin de varias cadenas peptdicas iguales o diferentes, y por ello,
no todas las protenas globulares presentan estructura cuaternaria, por ejemplo, las protenas
constituidas por un nico polipptido, como la mioglobina, no pueden tener estructura cuaternaria y
solo alcanzan el nivel de plegamiento de la estructura terciaria.
La estructura cuaternaria de las protenas fibrosas se basa en la asociacin entre las distintas
unidades peptdicas que la componen y dan lugar a complejos supramolecualares de gran
importancia (la base fundamental de su estructura es la estructura secundaria porque la terciaria es
muy simple)
La estructura cuaternaria de las protenas (o la terciaria, en aquellas que solo presenten esta
estructura), es responsable de su actividad biolgica.
La estructura cuaternaria depende de la terciaria, esta de la secundaria que a su vez depende
de la estructura primaria, es decir, de la secuencia de los aminocidos que componen cada una de las
cadenas polipeptdicas. Cualquier variacin de la secuencia de aminocidos puede afectar a los
distintos niveles de plegamiento y, por tanto, a su funcin biolgica.
18.- PROPIEDADES DE LAS PROTENAS.
Las propiedades de las protenas dependen de sus radicales libre (grupos R), de que estos
sobresalgan de la molcula y tengan, por tanto, la posibilidad de interaccionar con el entorno.
10
** Solubilidad.
11
1. Holoprotenas o Protenas simples. Estn formadas solamente por aminocidos que forman
cadenas polipeptdicas.
--Cromoprotenas. El grupo prosttico es una sustancia con color, por lo que tambin se les
llama pigmentos, y pueden ser:
--Pigmentos porfirnicos. El grupo prosttico es un anillo llamado porfirina, en cuyo
centro hay un catin metlico. Si se trata del catin ferroso Fe ++ (color rojo), la porfirina se llama
grupo hemo. Pertenecen a este grupo la hemoglobina, encargada de transportar oxgeno en la
sangre y la mioglobina, que ejerce la misma funcin en los msculos.
--Pigmentos no porfirnicos. Son los que tienen un grupo prosttico diferente a la
porfirina. Por ejemplo, la hemocianina, pigmento respiratorio azulado que lleva cobre y se
encuentra en a hemolinfa de crustceos y moluscos, (transporta oxgeno en la sangre de los
invertebrados) y la rodopsina que es una protena caracterstica de las clulas de la retina.
--Glucoprotenas. Su grupo prosttico es un glcido. Pertenecen a este grupo:
--Hormona estimulante del folculo (FSH) y hormona Luteinizante (LH).
12
1.- Protenas filamentosas, fibrosas o escleroprotenas: Son insolubles en agua, tienen forma
alargada (forman hilos, fibras) y su funcin es estructural. Pertenecen a este grupo:
--Colgeno. Se encuentra en tejidos conectivos como, el conjuntivo, cartilaginoso y seo.
Presenta una gran resistencia al estiramiento.
--Queratinas. La -queratinas se sintetizan y almacenan en las clulas de la epidermis y
formaciones epidrmicas como el cabello, uas, pezuas, cuernos, plumas, lana, escamas, etc.
--Elastinas. Protenas flexibles localizadas en los tendones y vasos sanguneos. Poseen una
gran elasticidad que les permite recuperar su forma tras la aplicacin de una fuerza. Las elastinas
tambin se localizan en rganos sometidos a deformaciones reversibles como los pulmones, las
arterias y la dermis.
-- Fibrona. Las -queratinas o fibronas se encuentran en el hilo de seda. (Gusano de seda y
las hebras hiladas por las araas).
-- Miosina: Participa en la contraccin muscular
-- Mucina:
2.- Protenas Globulares. Tienen una estructura ms o menos globular y compleja. Son solubles
en agua o bien en disoluciones polares. Tienen variedad de funciones. Su tamao oscila entre los
5000 daltons de peso molecular para las protaminas hasta el milln para las globulinas. Pertenecen a
este grupo:
--Albminas. Constituyen la parte principal de las protenas plasmticas. Regulan la presin
osmtica de la sangre y forman la reserva principal de aminocidos del organismo. Su capacidad
para unirse reversiblemente con otras sustancias les da un importante papel como transportadoras de
13
hormonas, cidos grasos o cationes. Entre ellas tenemos: la seroalbmina de la sangre (transporta
cidos grasos), la ovoalbmina de la clara del huevo, la lactoalbmina de la leche y la globina que
forma parte de la hemoglobina. (Son protenas de origen animal)
--Globulinas. Son protenas muy grandes con forma globular casi perfecta. Tenemos las y
-globulinas, asociadas a la hemoglobina y las -globulinas o inmunoglobulinas que constituyen los
anticuerpos. La lactoglobulina de la leche y el fibringeno, precursor de la fibrina en el proceso de
coagulacin sangunea.
--Protaminas. Son protenas bsicas asociadas al ADN del ncleo en los espermatozoides y
facilita su compactacin.
--Histonas. Son protenas bsicas asociadas al ADN de todas las clulas eucariotas, excepto
en los espermatozoides.
--Glutelinas. Son insolubles en agua pero solubles en cidos y bases diluidos. Se encuentran
en las semillas vegetales como la glutenina (gluten: mezcla de varias protenas) del trigo, la hordena
de la cebada, etc.
-- Actina: Participa en la contraccin muscular
[C] Segn la funcin biolgica que desempean, es el criterio ms informativo, aunque muy
heterogneo.
1.- La Funcin Enzimtica, es tan importante, que se tratar en el tema siguiente.
14