METABOLISMO DE COMPUESTOS NITROGENADOS II

Bueno, lo que tenemos que ver hoy da son vas de produccin de

aminocidos y la semana pasada habamos quedado con el .. clave de que
las vas centrales, la gliclisis, el ciclo de krebs, la va de las pentosas son
las fuentes principales de los intermediarios que van a formas aminocidos
y yo hice un esquema en el que estaban todas estas vas completas solo
que le vol la parte de arriba de la gliclisis, y le vol una parte del ciclo de
Krebs por que son partes de estas rutas pero no tienen Intermediarios es
solamente un set de reacciones importantes y que de hecho en este cuadro
estn todas las reacciones que conectan al metabolismo intermediario y
entonces los que no son importantes, los que no son precursores estn
marcados en gris

Entonces nosotros sobre este esquema empezamos a indicar cuales eran los
puntos de produccin de los distintos aminocidos: la primera observacin
es que son 20 aminocidos pero tienen varios de ellos rutas compartidas
tales como precursor-producto de los mismo aminocidos no hay por decirlo
as 20 rutas exclusivas, entonces otra cosa que yo mencion es que hay
ciertos metabolitos de las vas centrales que son -cetocidos, que eran cetoglutarato, oxalacetato, y piruvato, que eran precursores directos de
aminocidos.
El cetocido debe tener como estructura general una cadena lateral un
grupo ceto y un cido carboxlico de manera que el grupo ceto se va a
transformar en grupo amino, entonces de estos -cetocidos tenamos a
estos, dentro de todas las posibles rutas para empezar a hacer esta
descripcin hay que empezar estudiando la relacin del cetoglutarato.

Lo que yo les menciono es que ustedes tienen que empezar a estudiar de

todo los aminocidos, partan por la produccin del glutamato, desde el cetoglutarato y eso es por que es el punto de entrada de N como amonaco,
en todas las otro ruta biosinttica de aminocidos el N entra de alguna
manera, ayudado por una molcula orgnica en este caso en la produccin
de glutamato, del -cetoglutarato entra directamente como amonio
entonces por eso vamos a partir nuestras vas metablicas desde ac.
El -cetoglutarato tiene el grupo ceto de los -cetocido, y el glutamato en
la posicin en la que esta el grupo ceto, tiene el grupo amino y adems
tiene el H
Entonces la pregunta es como nosotros llegamos de glutamato hasta cetoglutarato
Esta flecha yo la estoy pintando en azul por que es el momento o la
reaccin en donde entra el N, van a ver otras vas metablicas en donde la
flecha azul por ejemplo va a estar en los puntos terminales por que la
molcula se va formando por ejemplo la cadena lateral, y solamente en la
etapa final de la sntesis en el caso de los -cetocidos es el primero.

La primera reaccin es la entrada del N, entonces pensemos en esta

reaccin de transformacin del grupo ceto en grupo amino y en este caso lo
que yo les comento es que el grupo amonio entra directamente, esta
reaccin entre un grupo ceto y el amonio es sper importante por que se va
a repetir como mecanismo de reaccin ustedes van a tener el grupo ceto y
ah ustedes tienen que recordar que el C tiene un positivo y que tomos
como N y como O, son un poco mas electronegativos que el C, entonces
vamos a tener el N, como un par electrnico no enlazado, y ese par
electrnico no enlazado puede atacar nucleofilicamente al C, y el C tiene un

doble enlace con el O, puede jugar, a transferir el par electrnico del enlace,
cuando se forme el enlace con el N, entonces este par electrnico migra
hacia la posicin del O, y aqu lo que viene es el reemplazo del O por el N
Entonces en la siguiente etapa de esta reaccin lo que sucede es que esta
carga negativa del O, se va a protonar, por protones del agua, o por los
protones que traen el mismo amonio, por que el amonio NH 4, aqu lo
estamos poniendo con un NH3, entonces este hidroxilo se empieza a
protonar y no solamente por protones sino que con 2 protones y de esta
manera forma el grupo saliente agua, entonces el O como tiene ese
potencial de aceptar electrones muy cerca de pi? va a robarse el par
electrnico que lo mantiene enlazado con el C, y va a salir como grupo
saliente el agua, en el intertanto este N, va si nosotros ponemos el kilo??
uno de estos protones va a perderse en funcin de protonar el hidroxilo y
entonces vamos a quedar nuevamente con un par electrnico, no apareado,
y ya este par electrnico formo el primer enlace con el C, entonces este otro
par electrnico va a formar un 2do enlace con el C de tal manera que vamos
a terminar con una estructura similar a la inicial, donde tenemos al C
formando inicialmente un doble enlace con O, pero ahora lo vamos a tener
formando un doble enlace con el N, entonces hay un reemplazo completo de
O por N, y esta estructura se llama Base de Schiff, la vamos a ver
reiteradamente y la estructura de la base de Schiff es esto aqu yo puedo
tener R, y aqu , aqu R2 y R3, esta reaccin carbonilo del N, entonces si
nosotros miramos la estructura del glutamato, adems del N nos hace falta
un H, de esos que tienen todos los aminocidos, ese H, es un hidruro que
va a llegar, por un transportador de grupo, y el transportador de grupo
universal, en el metabolismo es el NADH y el NADPH, entonces despus de
esa primera reaccin, no esquemtica de la formacin de la base de Schiff,
es una reaccin no enzimtica ocurre a una tasa apreciable, an en
ausencia de enzima pero la parte fundamental que la enzima est
catalizando, es la reduccin, de la bacteria, entonces la enzima es una
deshidrogenasa, su principal actividad es facilitar la transferencia del
hidruro desde el NADH NADPH hasta la molcula receptora que se va a
reducir y por lo tanto la actividad de se llama Glutamato
Deshidrogenasa, esta enzima a diferencia por ejemplo de las quinasas que
estn siempre utilizando ATP,una quinasa produce ATP como producto de la
reaccin en este caso la reaccin peude ir fcilmente por los 2 lados en
bacterias por ejemplo normalmente la bacteria por ejemplo una lo esta
creciendo en el microreactor y uno coloca amonio directamente en el medio
y entonces el amonio va a entrar al metabolismo, por medio de esa reaccin
y la cantidad de -cetoglutarato en la bacteria circulando en el orden
milimolar entonces va a haber siempre -cetoglutarato cuando hay una
suficiente cantidad de amonio y esta reaccin va a ir hacia la produccin de
glutamato
En el caso de nosotros de los mamferos, nuestro metabolismo recibe para
las obtenciones de energa recibe del consumo de azcares y aminocidos,
entonces en nuestro caso esta reaccin normalmente va a ir hacia la
izquierda, por que nosotros siempre vamos a tener un exceso siempre de
glutamato a partir de la dieta, y no importa que nuestra dieta misma sea
baja en glutamato, aunque otro de los aminocidos de nuestra dieta
siempre le van a transferir el amonio al glutamato y entonces vamos a tener
una acumulacin de glutamato y si nosotros queremos oxidar al glutamato
tenemos que eliminar primero el amonio entonces, esta reaccin ocurre en
mamferos hacia la izquierda, el amonio se libera y va hacia el ciclo de la

urea y el -cetoglutarato se degrada, donde se puede degradar? en Krebs y

genera mucho ATP.
En eucariontes en general esta enzima se encuentra en mitocondrias, y en
el caso de los mamferos el rgano principal del procesamiento del N, es el
hgado, hay cantidades muy grandes de glutamato deshidrogenasa en
mitocondrias de los hematocritos o hepatocrito???? , y de hecho la utilizan
como una especie de censor del estado de saludo del hepatocrito por que
cuando el hepatocrito, se afecta con una infeccin viral entonces ocurre una
inflamacin pero el hepatocrito aun esta integro no se rompe, cuando hay
enfermedades que producen necrosis del hepatocrito, la clula se rompe la
mitocondria libera la glutamato deshidrogenasa, y uno puede medir la
actividad, entonces la presencia de glutamato deshidrogenasa, en la
sangre , es una manera de determinar que tipo de enfermedad heptica
tiene un paciente, esta enzima esta en todos los organismos, todos, y en la
mayora por lo menos en eucariontes, en realidad eucariontes y procariotas
como regla general tiene regulacin alostrica en un sitio de unin para ATP,
o ADP solo que cuando se une ATP lo que ocurre es inhibicin de la
actividad, y cuando se une ADP o GDP, se activa, esto es fundamental en
bacterias normalmente, en plantas, no hay de estos fenmenos de
inhibicin alostrica, tambin otra manera de regular la enzima es por una
modificacin covalente, donde las modificaciones covalente de las protenas
para regular su actividad normalmente son fosforilaciones, en este caso en
vez de entregar un grupo fosfato a la enzima para cambiar su conformacin
la clula, la modifica covalentemente.
En vez del fosfato la otra parte que nos queda el ATP es el ADP, en vez de
transferir un grupo fosfato se transfiere el ADP, y esa modificacin se llama
ADP-ribosilacin, y adems hay enzimas que manifiestan preferencias por
NAD, otras especficas por NADP esto depende del tipo de metabolismo que
va a tener una clula si va a estar en metabolismo oxidativo o mas bien en
biosntesis.
Entonces esta es la entrada del amonio, directamente de compuesto
orgnicos, tenemos en este caso la reaccin reversa, -cetoglutarato
pasando a aminocido a glutamato pero hay una manera alternativa para la
entrada del amonio en el -cetoglutarato no solamente entra como amonio
libre sino que tambin entra
cuando tu en la reaccin tiene como dador de N, no al amonio libre sino que
al aminocido y entonces el -cetoglutarato lo que hace es recibir un grupo
amonio de un aminocido y entonces el grupo ceto se convierte en amino,
en glutamato y el amonio, el N del aminocido dador de esta reaccin,
entonces queda -cetocido y aqu lo que tenemos es que por lo tanto la
cadena lateral de primera aminocido queda como cadena lateral del cetocido y la reaccin complementaria, en este caso la reaccin se llama
transaminacin en el caso anterior lo que tenamos era aminacin
reductiva de un -cetocido para convertirse en aminocido, la reaccin
reversa sera desaminacin oxidativa en este caso se llama transaminacin
porque aqu tenemos como sustrato 2 molculas ms complejas no
solamente -cetocido y amonio, sino que -cetocido y aminocido

en este tipo de reacciones hay una coenzima que participa masivamente en

reacciones del metabolismo de nitrogenados, esta coenzima es el Piridoxal
y la parte noble de la coenzima es un grupo carbonilo y por lo tanto puede
sufrir este mismo mecanismo de reaccin.
La presencia de este anillo aromtico hace que la base de Schiff que se
forme puede desplazar electrones, hacia el resto de la molcula cuando
ustedes vean qumica organica hay grupos que son dadores de electrones y
hay grupos que son abstractores de electrones, y en este caso el piridoxal,
la parte aromtica acta drenando electrones de esta parte de la molcula y
vamos a ver cual es la importancia que tiene drenar electrones desde esta
regin.

Haciendo un pasaje rpido por el mecanismo de reaccin entonces de la

transaminacin tenemos el carbonilo unido al piridoxal, mediante este
mecanismo cierto forma la base de Schiff solo que ahora no va a ser un
amonio sino que va a tener el resto del esqueleto carbonado del
aminocido, ahora esta estructura fjate que, mira ah lo que estaba el
enlace, el doble enlace del carbonilo, ah mismo va a quedar el doble enlace
de la base de Schiff, lo que va a suceder ahora es que esa posicin donde
queda el doble enlace va a migrar y esa es la base del mecanismo de
reaccin del piridoxal esa es la explicacin de cmo funciona en la catlisis
de todas las enzimas que lo usa como cofactor y esto es porque tenemos el
doble enlace, y entonces la situacin es la siguiente este protn ya no va a
estar en el producto, esto se va a convertir en un grupo ceto por lo tanto ya
no va a tener un hibridacin sp3 y vamos a perder primero este protn y
por lo tanto el par electrnico que lo esta afirmando va a formar un doble
enlace ac cuando esto sucede el nitrgeno entonces no puede tener un
enlace y por lo tanto este par electrnico puede migrar a esta posicin y
cuando migra hacia esta posicin como tenemos un sistema de dobles
enlaces en el anillo aromtico entonces este puede migrar y finalmente el N,
del anillo aromtico va a quedarse con los electrones en este caso
perdemos la aromaticidad del piridoxal del anillo aromtico y ya no tenemos
un anillo aromtico sino que tenemos una quinona, la quinona en general
entonces son sper propensas a formar estructuras aromticas, pero en s
no son aromticas.

Ahora lo que sucede es que cuando tenemos la estructura de le quinona el

par electrnico que haba llevado al N, puede devolverse y entonces ah
tendramos la reacciones de la reaccin sin embargo fjate que el par
electrnico no se devuelve hasta el C sino que se devuelve solamente
hasta la formacin aqu del C este que era originario de un carbonilo ya o
sea el N, pasa el doble enlace para ac este otro doble enlace esta aqu y
este va se va a quedar en esta posicin del carbonato, lo que vamos a tener
como producto es que el carbono originalmente era carbonilo del aldehdo
va a quedar ahora con hibridacin sp3 aun vamos a tener el doble enlace
aqu entre el C- y su N original, entonces lo que sucede ahora como
tenemos este doble enlace de la base de Schiff pero que migr de posicin
no es la misma posicin del doble enlace original.

Entonces todo esto ahora puedo tener la reaccin reversa que acepta a
esta agua como atacante nucleoflico ok sobre el C . Ventiladores,
entonces lo fundamental es que originalmente el doble enlace es atacada y
aqu va iba a quedar el carbonilo, ahora el doble enlace esta ac y por lo
tanto el carbonilo va a quedar ac, como va a ocurrir la reaccin reversa el

grupo amino se va a quedar ahora con el piridoxal y vamos a tener la forma

aminada del Piridoxal que se llama piridoxamina y va a haber salido del
sitio activo el -cetoacido del ..original.

Pero hasta ahora hemos visto que el aminocido que surgi de un cetoacido, pero tenemos un problema por que la enzima no se ha
regenerado del piridoxal, que esta en el sitio activo de la enzima, como que
absorbi el N y esta quedando con l y normalmente las enzimas tienen que
devolverse a su estado original pero para devolverse al estado original,
tiene que ocurrir, tiene que haber, tiene que aparecer un receptor de N del
piridoxal, pero no puede ser el mismo este -cetoacido original porque o
sino no tenemos reaccin nos vamos a devolver al principio entonces lo que
hace la enzima es desplazar ahora el -cetocido que se fue lo va a
reemplazar por un -cetocido R2 con una cadena lateral diferente es decir
R en lo siguiente el piridoxal originalmente en la enzima donde esta unido al
sitio activo esta formando una base de Schiff pero con una lisina, la cadena
lateral de la lisina es un N de amina primaria, esos Ns no pueden ser
escindidos por el piridoxal, por lo tanto el piridoxal va a estar queriendo el N
cadena lateral de la lisina, pero no va a poder por que la estructura de esta
cadena lateral no se lo permite, entonces va a estar como en una
conformacin quieta, ya lo que sucede cuando llega el aminocido para
entregarle amino al piridoxal es que se libera esa base de Schiff e
inmediatamente por reacciones que acabamos de ver hace un ratito se
forma la piridoxamina es decir por ejemplo aminocido glutamato le entrega
el grupo amino al piridoxal forma piridoxamina y ah se va como -cetocido
y ahora lo que sucede es que llega un nuevo -ceto cido y ocurre la
formacin de la ketinina? es decir la base de Schiff, el doble enlace migra
desde el C hasta el C aldehdo del piridoxal y despus la hidrlisis ocurre
en este doble enlace y se libera el esqueleto carbonado de este -cetocido
que qued con un grupo amino que era el que tena el piridoxal.
Profesor y esta enzima es especfica para cada cadena o reconoce mas de
alguna en ese caso??

Hay varias transaminasas que difieren en el,.. mira normalmente tu vas a

tener 2 sitios para el -ceto cido y para el aminocido, pero uno de esos
sitios siempre va a tener preferencia por glutamato y en el otro sitio va a
tener una preferencia variable de manera que cuando tu comes, dieta rica
en protenas y tienes una cantidad grande de aminocidos todos esos
aminocidos van a cederle los N al glutamato, entonces si hay diferencia de
especificidad de transaminasas , pero no para todas las combinaciones de
-cetocido y -aminocido sino que especficamente para glutamato.

Entonces si sumamos las reacciones que hemos visto vamos a tener que el
glutamato deja su amonio, su grupo amino se convierte en -cetoglutarato ,
el piridoxal fosfato que esta en la enzima cambia su grupo que aldehdo por
un grupo amino, y despus tienen que entrar un segundo -cetocido que
por ejemplo en este caso oxaloacetato va a recibir el grupo amino del
piridoxal se convierte en asprtico, entonces de esta manera se regenera la
forma aldehdo original del piridoxal, a ese mecanismo se le llama PingPong no se si ustedes lo revisaron, las enzimas con mecanismo ping pong
son super inusuales pero la caracterstica de todas es que llega el primer
sustrato y sale el primer producto y le deja algo a la enzima ya y despus
llega el segundo sustrato la enzima le da su .. ? Y se va el 2do producto,
entonces en este caso es perfecto un clsico mecanismo de ping pong por
que lo que el carbo? Que le deja a la enzima es el grupo amino.

Entonces la salida del H es una de las posibles reacciones que puede

ocurrir con el piridoxal por que claro el protn ah sale y el par electrnico
que esta en A, migra hacia el sistema de dobles enlaces alrededor del
piridoxal pero tambin puede salir CO2, me entiende el producto final de la
reaccin puede ser la descarboxilacin del aminocido no solamente la
descarboxilacin del -ceto se puede descarboxilar y tambin puede perder
la cadena lateral, es decir cualquiera de los 3 enlaces covalente del C va a
sufrir una eliminacin del grupo que tiene y eso se debe a que si
consideramos el piridoxal tiene un sistema de dobles enlaces conjugados
vamos a tener una enzima, enzima ..del anillo aromatico y cuando tenemos
al grupo amino del aminocido que ha unido al aldehido algunos de estos 3
enlances del C-va a quedare en lnea con los orbitales que ya se han
formado en el sistema aromtico del piridoxal y ese es el que va a sufrir el
clivaje entonces aqu este C puede girar y ya no ser el R1 el que va a ser el
par electrnico que va a ser sustrado y por lo tanto terminar R1 que no se
puede ser el par electrnico de R2 y R3, por ejemplo entonces todo va a
determinar de cmo la enzima agarra a este intermediario molecular,
tenemos el anillo del piridoxal y entonces por ejemplo en el caso de las
transaminasas es el par electrnico del H es el que va a quedar
perpendicular, en lnea, con el sistema del piridoxal pero cuando se trata
por ejemplo de una enzima como la serina hidroxilmetil transferasaa lo que
sucede aqu no es transaminacin sino que se pierde la cadena lateral que
es un hidroximetilo entonces .. sistema de doble enlaces del piridoxal va a
ser el par electrnico que esta sujetando que esta sujetando al grupo R

Profe entonces lo que esta en blanco en la figura es un anillo aromtico

visto de lado?
Eso exacto, como es plano el anillo aromtico ah esta visto de lado, ah
deberas considerar que esta un orbital por all arriba y otra parte del
orbital por atrs
Entonces bsicamente el producto de reaccin lo define los aminocidos
que sujetan al intermediario molecular

De hecho si tenemos un aminocido que ha sido capturado por el piridoxal,

el par electrnico puede devolverse hasta el mismo C que originalmente
haba cedido su par electrnico del H pero cuando regresa este par
electrnico el C puede regresar hacia un lado o hacia el otro del plano que
esta formando el C del enlace simple entonces si el par electrnico regresa
hacia la parte superior de este plano, es decir hacia delante de la pizarra se
va a formar una quiralidad de aminocidos y que el par electrnico migra y
llega hacia la parte de atrs de la pizarra se va a formar le aminocido con
otra? Quiralidad entonces ah encima se utiliza el piridoxal que lo que hacen
en vez de quitar el grupo amino forma su base de Schiff elimina el protn
pero cuando el par electrnico se devuelve al C se devuelve por el plano
opuesto y entonces genera otro aminocido con otra quiralidad, en general
las bacterias, la pared celular de las bacterias tiene aminocidos que tienen
quiralidad D no E, y la manera en que general estos aminocidos D, es por
enzimas que dependen de piridoxal, y otra reaccin entonces cuando tienen
el piridoxal capturando el aminocido, antes que se pierda el H se pierde el
carboxilo como CO2, cede su par electrnico y lo que resulta como producto
final es el aminocido sin carboxilato y entonces en este caso por ejemplo
tenemos que al glutamato no le sucede una transaminacin para formar el
-cetoglutarato, sino que le sucede una descarboxilacin se forma en el
sitema nervisoos central el amino E?, la amina que se llama GAMA amino
glutirato, que es un inhibidor, es decir un neurotransmisor de sinapsis
inhibitoria en el tema central y la manera de sintetizar las neuronas es con
una enzima que depende de piridoxal
Profe que determina que se lleve a cabo la transaminacin o la
descarboxilacin o la racemizacin? .. del compuesto quiral, donde termina
la configuracin del sitio activo, entonces las transaminasas sujetan, o los
distintons tipos de actividad, que se originan debido a que los aminocidos

del sitio activo, dan la orientacin desde este par electrnico con respecto
del orbital y entonces a partir de eso se generan las ..?

Ok entonces fjense que hasta ahora nos hemos enfocado en que cetoglutarato, se puede transformar reversiblemente en glutamato, y ac
tenamos 2 maneras de hacerlo,1 es la entrada de amonio directa, y la otra
era la reaccin de transaminacin es decir, aqu tenamos que exponer un amino y de las 2 maneras se puede formar glutamato.
Uno supondra debido a la existencia de la glutamato deshidrogenasa y de
la transaminasa, que la manera en la que entra el amonio a todos los
aminocidos sera primero que entra el amonio, al -cetoglutarato por la
glutamato deshidrogenasa, y despus la transaminasa transfiere este amino
del glutamato varios otros aminocidos ya y as se pueblan de aminocidos
todos -cetocidos de la clulas pero el problema es que el amonio
normalmente no est en altas concentraciones en el citoplasma ni en el
ambiente y la Km de la glutamato deshidrogenasa es como del orden de 10
mM, 20 mM, entonces necesitaramos por ejemplo concentraciones 10
veces Km 10 mM para que la reaccin se lleve a cabo lo otro que sucede es
que la va de entrada del amonio al metabolismo no es exclusivamente con
la glutamato deshidrogenasa y la transaminasa , sino que nos falta una
reaccin adicional y en este sistema participa entonces adems del
glutamato, glutamina entre la sntesis de glutamato, la sntesis de
glutamina y la transaminaciones, entre estos 3 tipos de reaccin es que el
amonio llega finalmente a los metabolitos y eso se debe a que la glutamina
es mucho mejor dador de N, que el amonio.
Ya entonces primero, vemos como se genera la glutamina, nosotros
tenemos una cadena lateral que es un carboxilato, cuando se fosforila con

un grupo fosfato el ATP, tenemos que este O ahora se convierte en grupo

saliente por que este carbonilo puede ser atacado por un nucleofilo, cuando
es atacado por nucleofilo entonces sale, el O por un grupo fosfato, y el
nucleofilo, en este caso es amonio ya entonces el amonio en este caso entra
muy fcil a la molcula de glutamina, mucho ms fcil, que cuando tiene
que hacer aminacin reductiva, por que aqu esta indicado un proceso que
es muy muy favorable que es la hidrlisis del ATP, ya en el caso de la
aminacin reductiva no hay un proceso tan favorable, y por eso es mas
difcil ahora una vez que se genera la glutamina vamos a tener que el cetoglutarato de la misma manera que lo que ocurra en la glutamato
deshidrogenasa, es decir liberando?(42:59) una fuente de hidruros ya va a
generar glutamato pero esta vez el amonio que va a entrar en esta reaccin
viene aportado por glutamina la cual se form por una reaccin que
liberaba.. , entonces como un empuje termodinmico en la reaccin de esta
manera tu lo que tienes es que la enzima que hidroliza ATP, para la
formacin de glutamina, a partir de glutamico, genera la glutamina
suficiente para que esta reaccin la glutamato sintasa, ya no la glutamato
deshidrogenasa sino que la glutamato sintasa, tome el N de la cadena
lateral y genera glutamato a partir del -cetoglutarato y se regenera, se
fijan que tenemos una glutamina y un -cetoglutarato,se genere el
glutamato para este sitio y este glutamato se forma a partir del cetoglutarato, es la fuente de grupos amino por transaminacin para todos
los otros -cetocidos en el citoplasma, en el citoplasma, y ese es el sistema
por el cual entra amonio a los esqueletos carbonados, de los intermediarios
del metabolismo celular
Parte de las bacterias que fijan N, .. despus de la ..
Sii exacto justamente
nosotros los mamferos
En nuestro caso la manera de generar glutamato que es lo que va a
alimentar por transaminacin la formacin de muchos aminocidos, es por
la obtencin de glutamato desde la comida, en cambio en plantas y en
bacterias tu, vas a necesitar partir con amonio, cantidad no es que la
nica manera de introducirlo es e -cetoglutarato no es por el glutamato
deshidrogenasa, sino que es a travs de este sistema,

OK por lo tanto hemos, tenemos hasta ahora 3 actores glutamato,

glutamina y el esqueleto del -cetoglutarato, nosotros habamos visto que
haban otros 2 aminocidos ms que provienen desde el glutamato, no
solamente la glutamina sino que tambin la prolina, y la arginina, en este
caso partimos de una estrategia sper similar porque tenemos que actuar
con la cadena lateral, tenemos el carboxilato de la cadena lateral, y para
generar glutamina nosotros, le habamos .. ?(46:44) un grupo fosfato para
poder sacar el hidroxilo, para poder reemplazarlo por amino en este caso
tenemos que hacerle algo a la cadena lateral, solo que el, quien va a
reemplazar el grupo fosfato, intermediario, quien va a transportar? El
grupo fosfato es un hidruro del NADPH, entonces si yo reemplazo este grupo
fosfato saliente por un hidruro, puede ser un aldehdo y en este caso el
producto de reaccin glutamico semialdehdo, semi por que estos 2 grupos
carboxilatos originalmente solamente uno quedo como aldehdo, y ahora
este grupo aldehdo es sper reactivo por que normalmente el carbonilo del
aldehdo es ms reactivo que del grupo ceto y puede sufrir una ..cin?? por
parte de Schiff y de hecho eso es lo que ocurre fundamentalmente en el
caso de la prolina, tenemos el glutamico semi aldehdo y ahora
directamente el grupo amino forma una base de Schiff con este carbonilo,
y despus aqu lo nico que nos queda es el inverso?? porque las prolinas
no tienen doble enlace en su cadena lateral entonces eliminando este doble
enlace es una reduccin dependiente de NADPH, generamos la estructura
de la prolina, por lo tanto cada vez que ustedes ven una prolina en realidad
y ustedes ponen le dedito ac lo que uno tiene fundamentalmente es un
glutamico, a partir del mismo intermediario aldehdo podemos ir, en va
hacia la arginina y fjate que el grupo carbonilo es, insistentemente? un
formador de base de Schiff, sino lo va a formar con su grupo amino, lo va
a formar con un grupo amino que se lo va transfiriendo una transaminasa
desde glutamato, y entonces esta es una transaminacin pero no es entre
C, sino que el C del glutamato y el amino va a migrar hacia la cadena
lateral del semialdehdo, y se va formar otro intermediario que despus lo
vamos a ver en la sntesis de arginina,

el ciclo de la urea, tambin se llama ciclo de la ornitina, ya y un

intermediario del ciclo de la Urea es la Arginina

Entonces el glutamato, tiene 2 reacciones para transformarse en cetoglutarato, que pertenece al ciclo de Krebs, la transaminacin y la
aminacin reductiva, o la reaccin opuesta la desaminacin reductiva, pero
tambin puede transformarse en glutamina, tambin implica la entrada
directa de grupo amonio, adems formando el intermediario glutamico
semi-aldehdo, puede generar arginina que va hacia el ciclo de la urea, o
puede formar prolina inmediatamente, por lo tanto ah tenemos la relacin
precursor-producto entre glutamato, glutamina, prolina y arginina.

Ahora algo que nosotros hacia el final de esta discusin de

metabolismo de nitrogenados vamos a tocar as muy .. almente es
que los aminocidos en general son precursores de muchas otras
cosas, del metabolismo fundamentalmente de nucletidos,
aminocidos son precursores de nucletidos, tambin ya vimos que
por ejemplo el glutamico produce el gamma, que es el gamma
aminobutirato, mezcla descarboxilacin que es una especie de
reaccin alternativa del piridoxal, no transaminacin sino que la
descarboxilacin
Y el glutmico tambin puede formar parte de cofactores como por
ejemplo el glutatin que es un agente reductor o el tetrahidrofolato,
que es un transportador de grupo fenil, entonces el glutamato esta
sper conectado en la red de reacciones del metabolismo de
nitrogenados es uno de los principales, y a diferencia de los otros
aminocidos tiene grupos en su retro reacciones grupos nitrgenos,
que entran como amonio directamente.

Ya ahora que es lo que pasa con su primo hermano el asprtico, tambin las
cosas que le pasan son dependientes de transformaciones de la cadena
lateral, tenemos desde el oxaloacetato, la transaminacin del grupo ceto

para formar el asprtico, y quienes son hijos del asprtico son la

Asparragina, la metionina, treonina y lisina,
La principal diferencia en la transformacin de la cadena lateral de acido
carboxlico del grupo amida, que es la misma reaccin uno dira en el caso
del glutamico pasando a glutamina es que aqu para obtener al O como
grupo saliente yo no lo fosforilo como grupo fosfato sino que es el ADP
completo o el AMP, el que se queda transformando el grupo saliente de esta
enzima, y despus igual que en el caso de la glutamina entonces entra
amonio reemplazando a esta parte de ATP??? Pero este amonio viene desde
glutamina, no entra directamente como grupo amonio, glutamina que
escindi el grupo amino su cadena lateral para que entraran los sustrato, la
glutamina igual que el glutamato en el metabolismo de los aminocidos es
como un cofactor, el ATP es un cofactor que transporta grupos fosfatos, el
piridoxal es un cofactor que transporta grupos aminos, la glutamina y el
glutamato son cofactores, son aminocidos tambin pero son cofactores que
transportan grupos amino
Entonces aqu lo que tenemos que distinguir es que la transformacin de la
cadena lateral del grupo amida, entonces implica agarrar por completo a
ADP, desde el ATP, si por lo contrario hubiera sido un grupo fosfato el que
hubiera estado en la cadena lateral del asprtico, ya el destino metablico
es gliclisis? Y entra AMP a la cadena lateral del destino que tom la
asparragina, y entra el grupo fosfato gamma del ATP, entonces son otros
aminocidos treonina, metionina y lisina los que derivan.

Entonces entra el grupo fosfato gamma del ATP, se forma un intermediario

que se llama Aspartil fosfato, y luego este grupo carboxilo va a formar un

aldehdo igual que en el caso del glutamico semialdehdo este se llama

asprtico semialdehdo, y el asprtico semialdehdo que es el puntito all
arriba, entonces tiene vas de reacciones hacia habamos dicho metionina,
hacia treonina, y hacia lisina, fjate que en el caso de la treonina nosotros
tenemos el mismo nmero de carbonos en la cadena lateral igual que el
asprtico, tenemos 2 carbonos en la cadena lateral y en este caso tenemos
tambin unos carbonos, y lo nico que nosotros necesitamos aqu es que
este carbonilo , migre de alguna manera como hidroxilo, sobre el C y para
que emigre entonces participa el ATP, no nos importa el mecanismo de
reaccin pero lo que s tenemos que saber es que la diferencia entre el
asprtico semialdehdo, o el aspartato y la treonina es la posicin de un
hidroxilo que migra por efecto de la hidrlisis del ATP.
En el caso de la metionina nosotros antes del azufre, tenemos 2 C, estos son
los 2 C originales del asprtico, por lo tanto en la va de reacciones que
llevan hacia metionina necesitamos una fuente de S, y una fuente de grupos
metilo, entonces lo que sucede ac si ustedes se fijan participa succinil CoA,
pero succinil CoA se va despus de este .. succinato? No esta aportando
nada en esta reaccin, es una especie de activador igual que el grupo
fosfato es un activador del grupo saliente, el succinil tambin es un
activador y aqu por el contrario una vez que esta activado el grupo succinil
entonces la cistena que trae sus grupos tioles, le deja el S al asprtico que
genera un intermediario que vamos a ver quien es y despus tenemos un
cofactor que es transportador de grupos metilo, y el deja despus su grupo
metilo.
Por lo tanto aqu pensando en la va que va hacia treonina y va hacia
metionina tenemos un intermediario inicial en donde el grupo aldehdo se
redujo hacia hidroxilo y despus de ese hidroxilo por lo tanto tiene que
migrar a cierta posicin por causa del ATP, en el caso de la va hacia la
metionina lo que hicimos es que entra el succinato, pero entra como un
activador del hidroxilo que esta aqu en el extremo de la cadena lateral, y lo
que permite esto es que este hidroxilo pueda ser rechazado? por el S de la
cistena entonces aqu la cistena ve a esta regin como grupo saliente y
entonce entra y ataca nucleoflicamente este C y tiene aqu a la cistena
pegada por su S, de la cadena lateral, y despus esto se hidroliza, cuando
se hidroliza esta parte de la molcula tenemos un aminocido, que te fijas
que es como el metileno mas grande que la cistena, ya entones la
nomenclatura en eso, es que se denomina homocistena.
Y la homocistena lo que sucede es que si ustedes ven aqu la reaccin
anterior, este nodo? que esta aqu es la homocistena que recibe un grupo
metilo de un cofactor y se forma la metionina, ahora una vez que tenemos
una cadena lateral armada como metionina la funcin de cofactor aparece
para este aminocido y en este caso, su funcin de cofactor es transferir a
este grupo metilo terminal, el grupo metilo que esta en el S, se puede
activar para ser transferido a otras molculas cuando tienen ATP, se forma
aqu en vez de tener el grupo fosfato, el grupo trifosfato del ATP, este C, se
une covalentemente al S, y entonces con el S tiene 3 enlaces, como tiene 3
enlaces tiene, una carga + y una manera de aliviar esta carga + es
eliminando el grupo metilo, entonces cuando .. (59:57)el grupo metilo ahora
lo que tenemos es este intermediario entre ATP, o AMP, y homostena ok,
entonces ese intermediario homocistena, puede hidrolizarse, y la
homocistena entonces lo que necesita ahora es metilarse nuevamente para
formar metionina nuevamente tenemos el ATP, se forma este aducto entre

metionina y ATP; que es un dador de metilo, y despus se forma

nuevamente la homocistena y este ciclo que esta ac, es uno de los ciclos
fundamentales del transporte de metilo en el metabolismo, donde se genera
necesidad por grupo metilo, en la sntesis de nucletidos, en la sntesis de
bases nitrogenadas, en la sntesis de serina, entonces lo que ustedes tienen
que, como uno llega altiro a saber que metionina participa de grupos de
transferencia de grupos metilo, porque este eter que esta aqu, es sper
inestable es un tioeter, ya normalmente va a tener hidrolizarse y quedar
como grupo metilo, pero lo que las enzimas hacen es acoplar esta hidrlisis
a la formacin de un intermediario que lo activa mas para su transferencia,
del grupo metilo

Entonces aqu intermediarios claves, metionina(1:01:39) cadena lateral, la

parte esta parte se llama adenosil, cuando los nucletidos no tiene grupos
fosfatos, cuando la adenina del ATP, no tiene su grupo fosfato se llama
adenosil, entonces tenemos un intermediario hbrido y adenosil metionina
transfiere su grupo metilo, ahora esto es cuando se forma el intermediario
homoserina pero en la va, en el camino que tiene el asprtico hacia lisina,
si uno cuenta la actividad de grupos de tomos de C, en la cadena lateral
tenemos 4 metilenos, y el asprtico originalmente tiene 2, entonces en esta
va, necesitamos que entre alguien .. este C, y en esta caso es el Piruvato,
pero cuantos C tiene el piruvato, tiene 3, entonces en este camino de
reacciones tiene que eliminar uno de los C por CO 2 y ah se suman los C
totales de la lisina, entonces aqu tenemos el piruvato con sus 3, se forma
un intermediario cclico que es una base de Schiff por que tenemos este
grupo carbonilo, aqu se forma la base de Schiff con el amino que esta ah,
cuando se rompe este anillo para que se forme la estructura lineal de la
lisina tambin tenemos la participacin de un succinil, pero en este caso el

succinil no participa con sus grupos carbonos, y una vez que esta unido con
el succinil se abren estos enlaces, de la base de Schiff y aqu nosotros
tenemos 1C que esta con NH y con carboxilato, entonces tenemos 1,2,3,4 C
y tenemos un carboxilo extra y aqu tenemos el piridoxal fosfato en su
reaccin de descarboxilacin, ya y es capaz de eliminar ese carboxilato que
esta como CO2.
Y lo que nos queda finalmente despus de esto, este grupo que esta aqu
que esta todava con el succinil, estamos en esta parte entonces depus de
esto viene la eliminacin del CO2, y ah nos queda la cadena lateral.

*No esta las diapositivas 26,27,28

Entonces nosotros tenemos ya los que provienen desde glutamico tenemos

los que provienen desde asprtico, y hay un -cetocido del que tenemos
que hacernos cargo que es el piruvato, el piruvato por transaminacin
produce alanina y nosotros habamos visto que los productos de
transaminacin ya sea de glutamico o de asprtico, glutamina, asparragina,
Perdn el producto de transaminacin del -cetoglutarato y del oxaloacetato
son los intermediarios que van a dar origen a otros aminocidos, en el caso
del piruvato cuando se transaminar, la alanina que se produce queda ah es
una va donde no hay posterior reacciones para la alanina sino que la
manera en la que el piruvato genera otros aminocidos, no es por una
reaccin inicial de transaminacin como es le caso del glutamico y del
asprtico
Entonces lo que tenemos aqu la transaminacin hacia alanina no es
importante sino que para que el piruvato genera a los aminocidos que son
descendientes de , son todos hidrofobicos, nosotros necesitamos que el
piruvato que tiene 3C inicialmente elimine un CO2, y ese intermediario es el
que ..nos va por ejemplo al ciclo de krebs, ya y que se une con el
oxaloacetato para formar el citrato entonces en este caso ese intermediario
lo que le sucede es que se une con su parte -cetocido, y los -cetocidos
con los que se une van a determinar cual es la cadena lateral que se forma.
Entonces fjate nosotros tenemos el piruvato y tenemos la forma en la que
se descarboxil, este es el CH3? De la cadena lateral del piruvato tenemos
el carbonilo, o que qued en realidad como hidroxilo, y entonces aqu
tenemos el resto de la coenzima que la esta sujetando ahora este grupo es
un carbanin, entonces lo que sucede es que se puede unir con este
carbanin se puede unir con -cetocido, porque los -cetocido tienen en
su grupo ceto como habamos visto hace un ratito una carga + , entonces
este carbanin forma un enlace con el grupo ceto, ya sea del piruvato
mismo es decir tendramos piruvato mas piruvato, en la formacin en este
caso de isoleucina?.. no la isoleucina es grande, este es valina, en la

formacin de valina, y tenemos un -cetocido un poco mas grande que el

piruvato que sera el -cetobutirato, el R, del piruvato, el R que esta ac es
el grupo metilo, y le R del -cetobutirato, es un metileno mas. Entonces
debido a que tienen esta diferencia, los productos finales de la reaccin
tambin tienen en un grupo metilo.
Entonces de la produccin de aminocidos por parte del piruvato, lo que me
interesa es que sepan es que la alanina es un aminocido terminal que no
produce mas descendente? (1:09:29) y que el piruvato para formar los
aminocidos hidrofobicos tiene que unirse con -cetocido eso es lo
fundamental

Ahora lo ltimo que quiero que veamos, volviendo al mapa de las vas
centrales, son aminocidos, que ya no provienen directamente de cetocido, en este caso la serina, es un aminocidos que tiene su cadena
lateral sin C, mas el C + el carboxilato tendramos 3 C en total, en la
estructura del aminocido en el metabolismo central, en la gliclisis,
tenemos a partir de una cierta reaccin, . a partir de la enolasa? tenemos
puras molculas de 3 C entonces la serina emerge desde una de sus
molculas de 3 C que es el 3-fosfoglicerato, y a partir de serinas se forman
cistena y se forma glicina
En este caso la flecha azul esta mostrando que primero algo le tiene que
pasar al 3 fosfoglicerato, para poder recin aminar?(1:10:50) ,que es la
flecha azul y eso que le sucede es que el 3Pfosfoglicerato, si ustedes
piensan en la estructura que tena el intermediario de la gliclisis, para
poder convertirse en un -cetocido, el C del medio, que tiene un hidroxilo
tiene que oxidarse, entonces lo primero que sucede en esta secuencia de
reacciones es un deshidrogenacin donde lo que sucede es la formacin del
hidroxilo en grupo carbonilo y una vez que esta como grupo carbonilo, ah
puede transaminar, y lo que se forma es si tenemos aqu al 3 fosfoglicerato

este grupo fosfato, permanece entonces el C del medio se transform en

carbonilo, y despus el grupo amino y este CH 2? o.. grupo fosfato nos
muestra que tenemos un precursor de la serina, pero que esta fosforilado
entonces la ltima etapa antes de la formacin de la serina es una
fosfatasa, ya y una vez que tenemos al amincido formado, es decir la
transaminacin esta ocurriendo en una etapa , posterior la serina, tiene este
CH2OH, entonces en su cadena lateral, y lo que sucede es que hay una
reaccin dependiente de piridoxal fosfato, que es de estas reacciones
alternativas, donde en vez de hacer transaminacin este par electrnico es
el que se designa? Entonces la eliminacin del CH 2OH, de la estructura de la
serina nos deja solamente con un C, un carboxilato y una amino y eso por
lo tanto es la glicina, la glicina es un producto de degradacin de la serina, y
este CH2OH le pasa lo mismo entra dentro del circuito de la diferencia de
grupos metilo de la metionina, por que forma este cofactor cargado, aqu en
este caso el cofactor, despus vamos a ver la estructra que es el folato y
una vez que alguien les de un bloque de un C, entonces se transporta en
metileno folato? Y ese grupo metileno es el que sintetiza despus la
metionina.

Otra posible reaccin de la serina, es que tenamos la homocistena

proveniente del aqu si tuviramos un metilo, esto sera la metionina, pero
como la metionina esta en un ciclo de transferencia de grupos metilo, se
forma el intermedio homocistena, y uno de sus consecuencia metablicas,
es que es un dador de grupos tioles? entonces aqu la serina tiene que de
alguna manera activar este hidroxilo, como grupo saliente para que entre el
S de la homocistena y esta activacin en este caso tambin funciona por
succinil por grupo succinilos, los succinilos estn en varias de las vas de los
aminocidos actando como activador, igual que el grupo fosfato del ATP,
entonces se desplaza el grupo succinil queoriginalmente est unido al

hidroxilo y el S, electronegativo reemplaza, el hidroxilo, y despus tenemos

que escindir ahora este enlace del S, con el resto de la homocistena, y eso
nos genera el -cetobutirato que era uno de los 2 -cetocido que estaban
en la sntesis de aminocidos hidrofobicos desde el piruvato, entonces este
es el esqueleto carbonado de la homocistena y ahora el tiol, se va
(1:15:21) el grupo hidroflico,.
Por lo tanto la serina tiene este rol, de generador de glicina y de cistena,
pero la serina cuando genera la glicina y transfiere su grupo, su cadena
lateral de un como un metanol, yo les estaba comentando que lo que tiene
que transferir, a un cofactor, entonces esta es la estructura de la serina,
este es el C, que tiene el hidroximetil, entonces este hidroximetil de esta
molcula se forma glicina y es transferido hacia esta estructura que se
llama tetrahidrofolato, que es un derivado del glutamato, es un cofactor que
tiene estos 2 grupos N, que van a formar enlaces covalentes con el C que
sale de la serina, y en este estado es anlogo al NADPH, por ejemplo cuando
esta cargado de hidruro, o al ATP, cuando esta cargado del grupo fosfato, es
un cofactor que ya va a ser capaz de entregar, este grupo metil, y este
cofactor cargado lo vamos a ver despus como transportador de grupos de
unidades de C, en el metabolismo de los nucletidos
Por lo tanto nosotros si volvemos al esquema con el que habamos
terminado la clase pasada los metabolismo de las vas centrales, ya son los
precursores de ciertos aminocidos pero lo otro que tambin tienen que
tener en cuenta es que a partir de estas vas metablicas estos aminocidos
se generan precursores que van a estar de todas maneras involucrados en
la biosntesis de otros aminocidos, como por ejemplo como cistena, como
por ejemplo este -cetobutirato, como por ejemplos la unidades de un C de
la serina, dentro de las misma transformaciones de aminocidos dentro de
su ruta, hacia ser diferentes otros aminocidos, se van a formar
intermediarios que van a este entrelazados con otras vas de sntesis en el
metabolismo no solamente son rutas unidireccionales sino que son tambin
son ramificadas, y esos intermediarios hay que conocerlos porque no
solamente forman parte de una sola reaccin sino que de varias por
ejemplo, la glutamina que se forma a partir del glutmico va a entrar varias
veces en la va de sntesis de purinas, tambin va a participar en la sntesis
de pirimidinas,
Ok entonces la idea es que nosotros repasemos la manera en que estn
relacionadas estas vas metablicas, por eso es importante los
intermediarios estos que les decimos. mira hoy da tenemos ya agarrados
una parte de la que es la bioqumica maana vamos a terminar de ver la
degradacin de aminocidos, el proceso que acompaa a la degradacin de
aminocidos que es la obtencin del N como urea, y despus de esto vamos
a ver la formacin de nucletidos, la biosntesis de nucletidos, ya entonces
esos 4 captulos son los que vamos a estar revisando como materia, ciclo
del N, como la clase pasada, biosntesis, degradacin y ciclo de la urea, y
biosntesis de nucletidos, yo la clase pasada ya la sub la sub esa misma
tarde o el da el siguiente, entonces yo lo que quiero es facilitarle la lectura
del libro, porque le libro tiene caleta de reacciones, nombres, muchos
detalles por ejemplo en la relacin del metabolismo de aminocidos y
ciertas enfermedades, entonces lo que yo quiero con esto es decirle adems
de cuales son los puntos especficos que dentro de este universo a m me
interesan que ustedes sepan, quiero que alguna manera adelantarle un

poco el estudio, dndole algunas, estrategias de cmo ver estos sistemas,

cuales son las partes importantes de estas vas, as que nos vemos maana,
ya les digo con degradacin de aminocidos y ciclo de la urea.
FIN