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Etimologa e historia
Desde finales del siglo XVIII y principios del siglo XIX, se conoca la
digestin de la carne por las secreciones del estmago y la conversin del
almidn en azcar por los extractos de plantas y la saliva. Sin embargo, no
haba sido identificado el mecanismo subyacente.
En el siglo XIX, cuando se estaba estudiando la fermentacin del azcar en
el alcohol con levaduras, Louis Pasteur lleg a la conclusin de que esta
fermentacin era catalizada por una fuerza vital contenida en las clulas de
la levadura, llamadas fermentos, e inicialmente se pens que solo
funcionaban con organismos vivos. Escribi que "la fermentacin del alcohol
es un acto relacionado con la vida y la organizacin de las clulas de las
levaduras, y no con la muerte y la putrefaccin de las clulas" Por el
contrario, otros cientficos de la poca como Justus von Liebig, se
mantuvieron en la posicin que defenda el carcter puramente qumico de
la reaccin de fermentacin.
En 1878 el fisilogo Wilhelm Khne (18371900) acu el trmino enzima,
que viene del
La mayora de las enzimas, al igual que el resto de las protenas, pueden ser
desnaturalizadas si se ven sometidas a agentes desnaturalizantes como el
calor, los pHs extremos o ciertos compuestos como el SDS. Estos agentes
destruyen la estructura terciaria de las protenas de forma reversible o
irreversible, dependiendo de la enzima y de la condicin.
Especificidad
Las enzimas suelen ser muy especficas tanto del tipo de reaccin que
catalizan como del sustrato involucrado en la reaccin. La forma, la carga y
las caractersticas hidroflicas/hidrofbicas de las enzimas y los sustratos
son los responsables de dicha especificidad. Las enzimas tambin pueden
mostrar un elevado grado de estereoespecificidad, regioselectividad y
quimioselectividad.
Algunas de estas enzimas que muestran una elevada especificidad y
precisin en su actividad son aquellas involucrados en la replicacin y
expresin del genoma. Estas enzimas tienen eficientes sistemas de
comprobacin y correccin de errores, como en el caso de la ADN
polimerasa, que cataliza una reaccin de replicacin en un primer paso,
para comprobar posteriormente si el producto obtenido es el correcto Este
proceso, que tiene lugar en dos pasos, da como resultado una media de
tasa de error increblemente baja, en torno a 1 error cada 100 millones de
reacciones en determinadas polimerasas de mamferos. Este tipo de
mecanismos de comprobacin tambin han sido observados en la ARN
polimerasa en la ARNt aminoacil sintetasa y en la actividad de seleccin de
los aminoacil-tRNAs.
Aquellas enzimas que producen metabolitos secundarios son denominadas
promiscuas, ya que pueden actuar sobre una gran variedad de sustratos.
Por ello, se ha sugerido que esta amplia especificidad de sustrato podra ser
clave en la evolucin y diseo de nuevas rutas biosintticas.
Modelo de la "llave-cerradura"
Las enzimas son muy especficas, como sugiri Emil Fischer en 1894. Con
base a sus resultados dedujo que ambas molculas, enzima y sustrato,
poseen complementariedad geomtrica, es decir, sus estructuras encajan
exactamente una en la otra por lo que ha sido denominado como modelo
de la "llave-cerradura", refirindose a la enzima como a una especie de
cerradura y al sustrato como a una llave que encaja de forma perfecta en
dicha cerradura. Sin embargo, si bien este modelo explica la especificidad
de las enzimas, falla al intentar explicar la estabilizacin del estado de
transicin que logran adquirir las enzimas.
Mecanismos
Las enzimas pueden actuar de diversas formas, aunque, como se ver a
continuacin, siempre dando lugar a una disminucin del valor de G :
Reduccin de la energa de activacin mediante la creacin de un ambiente
en el cual el estado de transicin es estabilizado (por ejemplo, forzando la
forma de un sustrato: la enzima produce un cambio de conformacin del
sustrato unido el cual pasa a un estado de transicin, de modo que ve
reducida la cantidad de energa que precisa para completar la transicin).
Reduciendo la energa del estado de transicin, sin afectar la forma del
sustrato, mediante la creacin de un ambiente con una distribucin de
carga ptima para que se genere dicho estado de transicin.
Proporcionando una ruta alternativa. Por ejemplo, reaccionando
temporalmente con el sustrato para formar un complejo intermedio
enzima/sustrato (ES), que no sera factible en ausencia de enzima.
Reduciendo la variacin de entropa necesaria para alcanzar el estado de
transicin (energa de activacin) de la reaccin mediante la accin de
orientar correctamente los sustratos, favoreciendo as que se produzca
dicha reaccin.
Incrementando la velocidad de la enzima mediante un aumento de
temperatura. El incremento de temperatura facilita la accin de la enzima y
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Dinmica y funcin
La dinmica interna de las enzimas est relacionada con sus mecanismos de
catlisis. La dinmica interna se define como el movimiento de diferentes
partes de la estructura de la enzima, desde residuos individuales de
aminocidos, hasta grupos de aminocidos o incluso un dominio proteico
entero. Estos movimientos se producen a diferentes escalas de tiempo
medido en segundos. Casi cualquier residuo de la estructura de la enzima
puede contribuir en el proceso de catlisis por medio de movimientos
dinmicos. Los movimientos de las protenas son vitales en muchas
enzimas. Dichos movimientos podrn ser ms o menos importantes segn si
los cambios conformacionales se producen por vibraciones pequeas y
rpidas o grandes y lentas, y dicha importancia depender del tipo de
reaccin que lleve a cabo la enzima. Sin embargo, aunque estos
movimientos son importantes en el proceso de unin y liberacin de
sustratos y productos, an no est claro si estos movimientos ayudan a
acelerar los pasos qumicos de las reacciones enzimticas. Estos nuevos
avances tambin tienen implicaciones en la comprensin de los efectos
alostricos y en el desarrollo de nuevos frmacos.
Modulacin alostrica
Cofactores y coenzimas
Cofactores
Algunas enzimas no precisan ningn componente adicional para mostrar
una total actividad. Sin embargo, otras enzimas requieren la unin de
molculas no proteicas denominadas cofactores para poder ejercer su
actividad Los cofactores pueden ser compuestos inorgnicos, como los
iones metlicos y los complejos ferrosulfurosos, o compuestos orgnicos,
como la flavina o el grupo hemo. Los cofactores orgnicos pueden ser a su
vez grupos prostticos, que se unen fuertemente a la enzima, o coenzimas,
que son liberados del sitio activo de la enzima durante la reaccin. Las
coenzimas incluyen compuestos como el NADH, el NADPH y el adenosn
trifosfato. Estas molculas transfieren grupos funcionales entre enzimas.
Un ejemplo de una enzima que contiene un cofactor es la anhidrasa
carbnica, en la cual el zinc (cofactor) se mantiene unido al sitio activo,
Estas molculas suelen encontrarse unidas al sitio activo y estn implicadas
en la catlisis. Por ejemplo, la flavina y el grupo hemo suelen estar
implicados en reacciones redox.
Las enzimas que requieren un cofactor pero no lo tienen unido son
denominadas apoenzimas o apoprotenas. Una apoenzima junto con
cofactor(es) es denominada holoenzima (que es la forma activa). La mayora
de los cofactores no se unen covalentemente a sus enzimas, pero s lo
hacen fuertemente. Sin embargo, los grupos prostticos pueden estar
covalentemente unidos, como en el caso de la tiamina pirofosfato en la
enzima piruvato deshidrogenasa. El trmino "holoenzima" tambin puede
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Coenzimas
Termodinmica
Grfica de las energas de las diferentes fases de una reaccin qumica. Los
sustratos precisan mucha energa para alcanzar el estado de transicin,
pero una vez alcanzado, se transforman en productos. La enzima estabiliza
el estado de transicin, reduciendo la energa necesaria para formar los
productos.
Al igual que sucede con todos los catalizadores, las enzimas no alteran el
equilibrio qumico de la reaccin. Generalmente, en presencia de una
enzima, la reaccin avanza en la misma direccin en la que lo hara en
ausencia de enzima, slo que ms rpido. Sin embargo, en ausencia de
enzima, podra producirse una reaccin espontnea que generara un
producto diferente debido a que en esas condiciones, dicho producto
diferente se forma ms rpidamente.
Adems, las enzimas pueden acoplar dos o ms reacciones, por lo que una
reaccin termodinmicamente favorable puede ser utilizada para favorecer
otra reaccin termodinmicamente desfavorable. Por ejemplo, la hidrlisis
de ATP suele ser utilizada para favorecer otras reacciones qumicas.
Las enzimas catalizan reacciones qumicas tanto en un sentido como en el
contrario. Nunca alteran el equilibrio, sino nicamente la velocidad a la que
es alcanzado. Por ejemplo, la anhidrasa carbnica cataliza su reaccin en
una u otra direccin dependiendo de la concentracin de los reactantes,
como se puede ver a continuacin:
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Cintica
Mecanismo para una reaccin catalizada por una enzima con un nico
sustrato. La enzima (E) une un sustrato (S) y genera un producto (P).
La cintica enzimtica es el estudio de cmo las enzimas se unen a sus
sustratos y los transforman en productos. Los datos de equilibrios utilizados
en los estudios cinticos son obtenidos mediante ensayos enzimticos.
En 1902, Victor Henri propuso una teora cuantitativa sobre la cintica
enzimtica, pero sus datos experimentales no fueron muy tiles debido a
que la importancia de la concentracin del ion de hidrgeno an no era
considerada. Despus de que Peter Lauritz Srensen definiera la escala
logartmica del pH e introdujera el concepto de "tampn" (buffer) en
1909, el qumico alemn Leonor Michaelis y su postdoctoral canadiense
Maud Leonora Menten repitieron los experimentos de Henri confirmando su
ecuacin, que actualmente es conocida como cintica de Henri-MichaelisMenten (o simplemente cintica de Michaelis-Menten). Su trabajo fue
desarrollado ms en profundidad por George Edward Briggs y J. B. S.
Haldane, quienes obtuvieron las ecuaciones cinticas que se encuentran tan
ampliamente extendidas en la actualidad.
La mayor contribucin de Henri fue la idea de dividir las reacciones
enzimticas en dos etapas. En la primera, el sustrato se une
reversiblemente a la enzima, formando el complejo enzima-sustrato
(tambin denominado complejo Michaelis). En la segunda, la enzima
cataliza la reaccin y libera el producto.
Curva de saturacin de una reaccin enzimtica donde se muestra la
relacin entre la concentracin de sustrato y la velocidad de la reaccin.
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Inhibicin
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Funcin biolgica
Las enzimas presentan una amplia variedad de funciones en los organismos
vivos. Son indispensables en la transduccin de seales y en procesos de
regulacin, normalmente por medio de quinasas y fosfatasas Tambin son
capaces de producir movimiento, como es el caso de la miosina al hidrolizar
ATP para generar la contraccin muscular o el movimiento de vesculas por
medio del citoesqueleto. Otro tipo de ATPasas en la membrana celular son
las bombas de iones implicadas en procesos de transporte activo. Adems,
las enzimas tambin estn implicadas en funciones mucho ms exticas,
como la produccin de luz por la luciferasa en las lucirnagas.71 Los virus
tambin pueden contener enzimas implicadas en la infeccin celular, como
es el caso de la integrasa del virus HIV y de la transcriptasa inversa, o en la
liberacin viral, como la neuraminidasa del virus de la gripe.
Una importante funcin de las enzimas es la que presentan en el sistema
digestivo de los animales. Enzimas tales como las amilasas y las proteasas
son capaces de degradar molculas grandes (almidn o protenas,
respectivamente) en otras ms pequeas, de forma que puedan ser
absorbidas en el intestino. Las molculas de almidn, por ejemplo, que son
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Control de la actividad
La actividad enzimtica puede ser controlada en la clula principalmente de
estas cinco formas:
Implicaciones en enfermedades
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Aplicaciones industriales
Las enzimas son utilizadas en la industria qumica, y en otros tipos de
industria, en donde se requiere el uso de catalizadores muy especializados.
Sin embargo, las enzimas estn limitadas tanto por el nmero de reacciones
que pueden llevar a cabo como por su ausencia de estabilidad en solventes
orgnicos y altas temperaturas. Por ello, la ingeniera de protenas se ha
convertido en un rea de investigacin muy activa donde se intentan crear
enzimas con propiedades nuevas, bien mediante diseo racional, bien
mediante evolucin in vitro. Estos esfuerzos han comenzado a tener algunos
xitos, obtenindose algunas enzimas que catalizan reacciones no
existentes en la naturaleza.
A continuacin se muestra una tabla con diversas aplicaciones industriales
de las enzimas:
Aplicacin
Procesado de
alimentos
Enzimas utilizadas
Usos
Amilasas de hongos y
plantas.
Produccin de
azcares desde el
almidn, como por
ejemplo en la
produccin de jarabe
de maz. En la
coccin al horno,
cataliza la rotura del
almidn de la harina
en azcar. La
fermentacin del
azcar llevada a
cabo por levaduras
produce el dixido de
carbono que hace
"subir" la masa.
Proteasas
Los fabricantes de
galletas las utilizan
para reducir la
cantidad de
protenas en la
harina.
La amilasa cataliza la
degradacin del almidn
en azcares sencillos.
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Para pre-digerir el
alimento dirigido a
bebs.
Elaboracin de
cerveza
Cebada germinada
utilizada para la
elaboracin de malta.
Las enzimas
liberadas degradan
el almidn y las
protenas para
Las enzimas de la cebada
generar azcares
son liberadas durante la
sencillos,
fase de molido en la
aminocidos y
elaboracin de la
pptidos que son
cerveza.
usados por las
levaduras en el
proceso de
fermentacin.
Enzimas de cebada
producidas a nivel
industrial
Ampliamente usadas
en la elaboracin de
cerveza para
sustituir las enzimas
naturales de la
cebada.
Amilasa, glucanasa y
proteasas
Digieren
polisacridos y
protenas en la
malta.
Betaglucanasas y
arabinoxilanasas
Mejoran la filtracin
del mosto y la
cerveza.
Amiloglucosidasas y
pululanasas
Produccin de
cerveza baja en
caloras y ajuste de
la capacidad de
fermentacin.
Proteasas
Eliminan la turbidez
producida durante el
almacenamiento de
la cerveza.
Acetolactatodecarboxilas Incrementa la
a (ALDC)
eficiencia de la
fermentacin
mediante la
reduccin de la
formacin de
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diacetilo.
Aclarado de zumos
de frutos.
Zumos de frutas
Celulasas, pectinasas
Industria lctea
Actualmente, cada
vez ms usadas en la
industria lctea.
Lipasas
Se introduce durante
el proceso de
produccin del queso
Roquefort para
favorecer la
maduracin.
Lactasas
Rotura de la lactosa
en glucosa y
galactosa.
Papana
Ablandamiento de la
carne utilizada para
cocinar.
Amilasas,
amiloglucosidasas y
glucoamilasas
Conversin del
almidn en glucosa y
diversos azcares
invertidos.
Queso de Roquefort.
Digestin de carne
Glucosa isomerasa
Glucosa.
Fructosa.
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Conversin de
glucosa en fructosa
durante la
produccin de jarabe
de maz partiendo de
sustancias ricas en
almidn. Estos
jarabes potencian las
propiedades
edulcorantes y
reducen las caloras
mejor que la
sacarosa y
manteniendo el
mismo nivel de
dulzor.
Amilasas, xilanasas,
celulasas y ligninasas
Degradacin del
almidn para reducir
su viscosidad,
aadiendo apresto.
Las xilanasas
reducen el
blanqueador
necesario para la
decoloracin; las
celulasas alisan las
fibras, favorecen el
drenaje de agua y
promueven la
eliminacin de tintas;
las lipasas reducen la
oscuridad y las
ligninasas eliminan
la lignina para
ablandar el papel.
Celulasas
Utilizadas para
degradar la celulosa
en azcares que
puedan ser
fermentados.
Ligninasas
Utilizada para
eliminar residuos de
lignina.
Celulosa en 3D.
Detergentes
biolgicos
Utilizadas para
ayudar en la
eliminacin de tintes
Principalmente proteasas,
proteicos de la ropa
producidas de forma
en las condiciones de
extracelular por
prelavado y en las
bacterias.
aplicaciones directas
de detergente
lquido.
Amilasas
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Detergentes de
lavadoras para
eliminar residuos
resistentes de
almidn.
Lipasas
Utilizadas para
facilitar la
eliminacin de tintes
grasos y oleosos.
Celulasas
Utilizadas en
suavizantes
biolgicos.
Limpiadores de lentes
Proteasas
de contacto
Catalasa
Proteasa (ficina)
Disolver la gelatina
de las pelculas
fotogrficas usadas,
permitiendo as la
recuperacin de su
contenido en plata.
Industria fotogrfica
Biologa molecular
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Utilizadas para
manipular el ADN
mediante ingeniera
gentica. De gran
importancia en
farmacologa,
Enzimas de restriccin,
agricultura, medicina
ADN ligasa y polimerasas
y criminalstica.
Esenciales para
digestin de
restriccin y para la
reaccin en cadena
de la polimerasa.
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