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Unidad
1. |Introduccin
a las biomolculas
Antologa
Nombre de la asignatura
Unidad 1. Nombre
Ingeniera en Biotecnologa
Tercer semestre
Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
Clave
19142315
Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
Unidad 1. Introduccin a las Biomolculas
Presentacin de la unidad
Te damos la bienvenida a esta unidad, la primera de tu programa de estudio. Con ella vas
a obtener un panorama general sobre las biomolculas: Cules son? Para qu
sirven? Cul es su importancia? En qu procesos biolgicos intervienen y de qu
manera?.
Las biomolculas cumplen con funciones biolgicas importantes dentro de los organismos
y microorganismos, son los cimientos que conforman a tales sistemas, pero no todas son
iguales, de hecho difieren entre ellas por su estructura y funcin. Tal como t, tambin
forman parte de una familia y cumplen un rol dentro de ella, es por eso que se agrupan en
cuatro grandes bloques: los carbohidratos, los lpidos, las protenas y los cidos nucleicos.
Vamos! Comienza a revisar la unidad, vers que es muy interesante ligar a las
biomolculas con casos prcticos y ejemplos comunes. Las biomolculas son
fundamentales para la vida, muchos de los productos que actualmente utilizas contienes
biomolculas como enzimas (detergentes biodegradables), en complementos alimenticios,
etc. Tambin las identificas cuando ties membranas de una bacteria para verla a travs
del microscopio, cuando modificas genticamente alguna bacteria para que produzca
alguna protena o para identificar organismos. Las biomolculas se encuentran en todas
partes! Ya lo vers!. Espero que disfrutes y asimiles el contenido de esta unidad.
Propsitos de la unidad
Esta unidad tiene el propsito de:
Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
Competencia especfica
Temario de la unidad
1.1. Carbohidratos.
1.1.1. Clasificacin y estructura.
1.1.2. Importancia bioqumica de los carbohidratos.
1.2. Lpidos.
1.2.1. Clasificacin y estructura.
1.2.2. Importancia bioqumica de los lpidos.
1.3. Protenas.
1.3.1. Estructura.
1.3.2. Clasificacin e importancia bioqumica de las protenas
1.3.3. Capacidad cataltica de las protenas.
1.4. cidos nucleicos.
1.4.1. Estructura del DNA.
1.4.2. Clasificacin y estructura del ARN
1.4.3. Importancia bioqumica de los cidos nucleicos.
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Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
1.1. Carbohidratos
Los carbohidratos son compuestos de origen orgnico y son fundamentales para la vida.
Los carbohidratos son importantes ya que todos los seres vivos los utilizan como base
fundamental de su metabolismo, como reserva de energa adems de jugar un papel
estructural muy importante en las clulas. Todos los carbohidratos estn formados por
carbono, hidrgeno y oxgeno. En la naturaleza se encuentran en forma individual, es
decir, como monosacridos, en forma asociada formando disacridos (dos
monosacridos), trisacridos (tres monosacridos), etc., hasta generando molculas muy
complejas como los almidones y celulosa principalmente.
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Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
Todas las aldosas se consideran como estructuras derivadas del gliceraldehdo ya sea D
o L. En el caso de las cetosas, se consideran estructuralmente derivadas de la D- o Leritrulosa (Fig. 4).
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Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
sencilla para calcular este nmero de ismeros la cual est dada por 2n donde n es el
nmero de carbono asimtricos presentes en la molcula.
Te has preguntado el porqu de la conformacin D o L?. Es una propiedad fsica de las
molculas que son pticamente activas, es decir, que pueden desviar el plano de la luz
polarizada y se debe, en el caso de los carbohidratos, a la presencia de los carbonos
asimtricos.
De esta forma, las molculas que desvan la luz polarizada a la derecha se les llama
dextrgiros o dextrorrotatorios o simplemente D, y los compuestos que desvan la luz
polarizada a la izquierda se les llama levgiros o levorrotatorios o simplemente L. Es
importante sealar que la posicin del OH en el carbono asimtrico en los carbohidratos
da la casualidad que efectivamente, la conformacin D desva la luz polarizada a la
derecha y la conformacin L, a la izquierda. Existen otras formas de representar a los
carbohidratos a parte de la de Fischer y que pueden ser de mucha ayuda sobre todo
cuando se estn representando molculas ms complejas como los almidones o la
celulosa que se estudiarn ms adelante. Estas representaciones son la proyeccin de
Haworth que es una forma comn de representar a los carbohidratos de forma cclica y
la representacin de silla que presenta a las molculas en su forma ms estable (Fig.
5).
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BIOQUIMICA II
BIOQUIMICA II
APUNTES
BIOQUIMICA II APUNTES
Con tres tomos de carbono, la dihidroxiacetona es la ms simple de todas las cetosas y es el unico que no tiene
actividad optica. Las cetosas pueden isomerizar en aldosas cuando el grupo carbonilo se encuentra al final de la
molcula. Este tipo de moleculas se denominan azcares reducidos.
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Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
Sucrosa
egreso al inicio
Disacridos
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Carbono
Hidrocarburos
Cetonas
SucrosaLas uniones covalentes entre el hidroxilo anomrico de un azcar cclico y el hidroxilo de un segundo
zcar (o de otro compuesto que tenga alcohol) se llaman uniones glucosdicas, y las molculas resultantes son
s glucsidos. La unin de dos monosacridos para formar disacridos involucra una unin glucosdica. Varios
Sucrosa
sacridos con importancia fisiolgica incluyen la sucrosa, lactosa, y maltosa.
glicolpidos.
Los oligosacridosFigura
se unen10.
a los
lpidos
un enlace
a un grupo
Unin
demediante
oligosacridos
a O-glicosdico
protenas (tomado
de OH del lpido. La
figura izquierdahttp://chemistry.umeche.maine.edu/CHY251/Enzym-Stereo.html).
de la tabla inferior muestra un oligosacrido unido a un fosfolpido. La unin y la
estructura del oligosacrido son de tal manera que ste no presenta ningn grupo reductor libre. En la
composicin
del oligosacrido
formaraparte
monosacridos
como:
D-glucosa,con
D-galactosa,
DEn el caso
de los glicolpidos
estossuelen
se forman
partir
de un enlace
O-glicosdico
el
manosa, N-acetil-D-glucosamina, N-acetil-D-galactosamina, cido silico y fucosa.
grupo OH de un lpido (Fig. 11). Los oligosacridos que forman a la glicoprotenas y
glicolpidos y que
adems
seglicolpido
encuentran en la superficie externa
de la membrana
Estructura
de un
La membrana
plasmtica
plasmtica tiene una gran importancia en las funciones de reconocimiento en superficie
de diversas molculas orgnicas. Los oligosacridos ms comunes estn formados
generalmente por D-glucosa, D-galactosa, D-manosa, N-acetil-D-glucosamina, N-acetil-Dgalactosamina, cido silico y fucosa.
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enlace glucosdico) aunque hay que considerar que los polisacridos son
considerados como no reductores ya que no es posible detectarlos por las
tcnicas comunes de deteccin (tcnica de Fehling o Tollens). Los polisacridos
tienen diversas funciones en las clulas vivas. En los vegetales son considerados
la principal fuente de energa (aunque no es la nica), el almidn el cual est
presente en tubrculos y granos llega a ser de alrededor del 70 % en peso. El
almidn est presente formando dos diferentes estructuras, como amilopectina y
como amilosa, siendo la forma ms abundante la amilopectina. Los almidones son
la principal fuente de glcidos de la humanidad de ah su importancia. La amilosa
es un polmero con alto peso molecular formado por unidades de glucosa unidos
por enlaces (1-4), llegando a tener de entre 250-600 unidades de glucopiranosa
(representacin de Haworth) (Fig. 12). La amilopectina presenta un mayor peso
molecular que la amilosa. Este es un polmero ramificado (a diferencia de la
amilosa) llegando a tener alrededor de 1000 unidades de D-glucosa. La
amilopectina presenta enlaces de tipo (1-4) y (1-6) los cuales estn
espaciados cada 25-30 residuos de glucosa y son los causantes de las
ramificaciones de este polisacrido (Fig. 13).
e.
Figura 12. Representacin de un fragmento de amilosa (Curtis, 2009).
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Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
principal reserva de energa del planeta. Es un polmero lineal formado exclusivamente
por monmeros de glucosa unidos por enlaces (1-4) (Fig. 15). Finalmente, la quitina es
el otro polisacrido de importancia. La quitina es el principal componente del exoesqueleto
de los insectos y de las paredes celulares de los hongos. La quitina est formada por
monmeros de N-acetil glucosamina unidos por enlaces (1-4) (Fig. 16).
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2.
3.
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Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
Finalmente:
1. Realiza un ensayo en donde identifiques los carbohidratos que se involucran en
el proceso de sealizacin celular, procurando contemplar los siguientes puntos:
nombre de los carbohidratos, describir si se encuentran asociados a alguna otra
biomolcula, perspectivas de innovacin e investigacin.
2. Apoya tu trabajo con imgenes y s cuidadoso con la ortografa.
3. Integra tu trabajo en un documento de presentacin electrnica o de texto con
las caractersticas indicadas.
4. Guarda tu documento con la nomenclatura BBIQ_U1_A2_XXYZ y envalo a tu
Docente en lnear (a) mediante la seccin de tareas para que lo revise y te
retroalimente.
*Recuerda que tu documento no deber pesar ms de 4 MB.
Bibliografa recomendada
Murray, R., et al. (1997). Bioqumica de Harper. Buenos Aires. Editorial Manual
Moderno.
Osorio, J.H.O. (2002). Embarazo y metabolismo de carbohidratos. Revista
Colombiana de Obstetricia y Ginecologa. 54(2): 1-10.
Rodrguez, R., Villalba, M. (1997). Reacciones cruzadas entre alrgenos: implicacin
de los carbohidratos. Rev Esp Alergol Inmunol Clin. 12(5): 269-281.
1.2. Lpidos
Las siguientes biomolculas de las que hablaremos son los lpidos, molculas
responsables, entre otras cosas, de la reserva de energa y la formacin de membranas.
Comenzaremos conociendo un poco su estructura y clasificacin para terminar
entendiendo su principal funcin en las clulas y por lo tanto su importancia biolgica.
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las clulas. Algunos lpidos pueden contener fsforo, azufre e hidrgeno, pero no es muy
comn.
Los lpidos son muy variados pero podemos hacer una clasificacin simple atendiendo a
su estructura. Los lpidos saponificables son aquellos capaces de generar jabn
mediante una hidrlisis alcalina; al contrario de los lpidos saponificables o
insaponificables.
La saponificacin es una reaccin qumica que consiste en la disociacin de los cidos
grasas en un medio alcalino de manera que se asocian con los lcalis formando las sales
sdicas de los cidos grasos que forman el jabn.
De esta manera, la clasificacin de los lpidos la podemos observar en la Tabla 1.
Tabla 1 Clasificacin de los lpidos
Tipo de lpido
Lpido
Saponificables
cidos grasos
Acilglicridos
Fosfoglicridos
Esfingolpidos
Ceras o cridos
No saponificables
Terpenos
Esteroides
Eicosanoides o prostaglandinas
a) cidos grasos
Son los lpidos ms simples siendo las unidades bsicas de los lpidos ms complejos.
Estn formada por una larga cadena hidrocarbonada, de 12 a 24 tomos de carbono,
con un grupo carboxilo terminal. Podemos encontrar cidos grasos saturados
compuestos nicamente por enlaces simples, o cidos grasos no saturados o
insaturados que contienen uno o ms enlaces dobles entre los C(Mathews, 2002) . Esta
caractersticas reduce el punto de fusin adems de alterar su estructura tridimensional,
tal y como podemos observar en la Figura 17. As mismo, por su estructura tiene un
carcter aliftico, es decir, tiene una regin apolar (la cadena hidrocarbonada) y una
regin polar (correspondiente al carboxilo terminal).
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Figura 17. Estructura de cidos graso saturado (a) donde se puede observar con una
estructura lineal, a diferencia del cido graso con una insaturacin (b) donde se observa
un pliegue en el doble enlace (Nelson y Cox, 2009).
En referencia a la nomenclatura de los cidos grasos, existen tres formas pero antes
de explicarles cada una es importante que entiendan la configuracin cis y trans presente
en las insaturaciones. Estos conceptos se refieren a la orientacin de los tomos de
hidrgeno con respecto al doble enlace (cis significa en el mismo lado y trans significa
en el lado opuesto) y para que les quede ms claro pueden observar la Figura 18
(McMurry, 2001).
Figura 18. Configuracin Cis y Trans de los cidos grasos insaturados (Nelson y Cox,
2009).
Ahora s, las tres formas de nombrar a los cidos grasos y para ello tomaremos como
ejemplo el cido oleico (Figura 19):
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1. La comn donde se le dan los nombres a los cidos grasos por tradicin, por
ejemplo el cido palmtico le debe su nombre a su origen en el aceite de palma,
as como el cido oleicos del aceite de oliva o cido esterico a su origen griego
stear que significa grasa o sebo.
2. Sistemtica segn las reglas definidas por la IUAC de manera que al carbono
carboxlico corresponde el nmero 1 y el resto de las posiciones se refieren a l.
En este caso se indica el nmero de carbonos con la terminacin decanoico
cuando se refiere a un cido graso saturado, por ejemplo: cido hexadecanoico
(16 tomos de C, saturado) o cido octadecanoico (18 tomos de C, saturado). En
caso de tener alguna insaturacin se comenzar con cis o trans (segn el tipo de
enlace), seguido del nmero del C donde se encuentra la insaturacin,
posteriormente el nmero total de C para terminar con enoico precedido del
nmero de insaturacin, por ejemplo: decenoico (cuando sola hay uno doble
enlace); dienoico (cuando tiene 2 dobles enlaces) o trienoico (cuando tiene 3
dobles enlaces). En nuestro ejemplo del cido linolico sera: cis,cis-9,12ocatadecadienico.
3. Finalmente, existe la forma abreviada o numrica donde aparecen nmero, letras
y el smbolo delta. En nuestro ejemplo sera
. El primer nmero
hace referencia al total de C que contiene. El segundo nmero
. indica el total de los dobles enlaces que posee. La letra
son las configuraciones y posiciones de los dobles enlaces (c cuando es cis y t
cuando es trans). Delta y uno o ms nmeros
corresponden al tomo
de carbono en el que inicia cada doble enlace, estos nmeros se designan
contando a partir del carboxilo.
Figura 19. Estructura del cido linolico (nomenclatura comn), cis,cis-9,12ocatadecadienico (nomenclatura sistemstica) o
2 (nomenclatura abreviada o
numrica). Observa que cuenta con 18 tomo de carbono y dos insaturaciones tipo cis
entre los carbonos 9 y 10 y entre 12 y 13 (Nelson y Cox, 2009).
b)
Acilgliceroles
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Su estructura bsica es de una molcula de glicerol unida a uno o ms cidos grasos por
un enlace ster; as pues de acuerdo al nmero de cidos grasos que posea la molcula
existen tres tipos:
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Los triacilglicridos son la principal reserva de energa de los seres vivos y los
acilglicridos ms abundantes en las clulas. En la Figura 21 pueden observar uno de
ellos representado de diferentes formas.
Fosfoglicridos
Se caracterizan por tener un grupo fosfato lo cual les confiere una mayor polaridad. En
este caso se conforman por un cido fosfatidico, glicerol y dos cidos grasos que
pueden ser saturados o insaturados (Fig. 22).
Los diferentes tipos de fosfoglicridos difieren en el tamao, forma y carga elctrica de
sus grupos de cabeza polares (Nelson y Cox, 2009).
Figura 22. Fosfatidilcolina formada por un fosfato, un glicerol y 2 cidos grasos, uno
saturado y uno insaturado (tomado de Nelson y Cox, 2008)
El grupo fosfato posee un alcohol o un aminoalcohol que son molculas altamente
hidroflicas o polares y esta caracterstica hace que los fosfolpidos formen las
membranas plasmticas con una regin polar y una regin apolar (Fig. 23).
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Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
Esfingolpidos
Su estructura est constituida por una cadena larga del aminoalcohol esfingosina en
lugar de un glicerol, se le une un cido graso, el ms comn es el grupo de las ceramidas.
En la Figura 24 est la estructura de la Esfingomielina y se puede observar un gran
parecido estructural con los fosfolpidos, es por ello, que ambos tipos de lpidos forman la
membrana plasmtica.
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Un resumen de los lpidos que forman la membrana plasmtica, con la estructura de cada
una de ellas, se presenta en la Figura 26.
Figura 26. Diferentes tipos de lpidos que conforman la membrana plasmtica (Nelson y
Cox, 2009)
e) Cridos o ceras
Son molculas que se obtienen mediante la esterificacin de un cido graso y un alcohol
monovalente de cadena lineal y larga (Figura 27). Son slidos y duros a temperatura
ambiente. Estas molculas son altamente hidrofbicas por lo que son insolubles en agua.
Lpidos no saponificables
a) Terpenos
Derivan del isopreno, constan de dos a ms molculas de isoprenos, ste es un
hidrocarburo de cinco tomos de carbono. Reciben una subclasificacin dependiendo de
las unidades de isopreno que presenten, tal como lo indica la tabla 2.
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Nombre
Nmero de isoprenos en su
estructura
Monoterpenos
Dos unidades
Sesquiterpenos
Tres unidades
Diterpenos
Cuatro unidades
Triterpenos
Seis unidades
Tetraterpenos
Ocho unidades
Regularmente se encuentran unidos cola con cabeza, sin embargo no es raro encontrar a
las unidades de isopreno unidas cola con cola, un ejemplo de terpeno es el licopeno (Fig.
28).
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c) Eicosanoides
Son derivados de los cidos grasos escenciales de 20 carbonos, sus precursores son el
cido araquidnico, el cido linoleico y el cido linolnico.
Se dividen en prostaglandinas (Fig. 30), tromboxanos y leucotrienos, de los cuales los
ms estudiados y considerados como los ms importantes son las prostaglandinas. Las
prostaglandinas E y F fueron las primeras en aislarse, se denominan E a las que son ms
solubles en ter y F a las solubles en amortiguador de fosfatos, por esta razn ahora se
les conoce como PGE y PGF.
Estructuralmente contienen dos grupos carboxilo, cada uno unido a una cadena lateral y
ambas unidas a un anillo de ciclopentano, al designarlos se cuenta con un subndice que
indica el nmero de dobles enlaces, por ejemplo la PGE2. Se designa alfa o beta para
indicar si es cis o trans respectivamente.
a) cidos grasos
Los cidos grasos no los encontramos de esta manera en las clulas, si no que estn
formando lpidos ms complejos como acilgliceroles. Existen cidos grasos esenciales
que sern aquellos que los organismos deben ingerir porque no son capaces de
sintetizarlos. Uno de los ms abundantes es el cido linolico (Fig. 31), este cido no es
sintetizado por los mamferos sino que son obtenidos mediante la dieta por medio de los
vegetales donde se encuentran en grandes cantidades. De esta manera tenemos un
ejemplo de un cido graso que es esencial para los mamferos pero no para los vegetales.
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Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
las hidrofbicas formando una doble capa (Fig. 33). Si nicamente existen fosfolpidos
como en la imagen (Fig. 33 c), entonces hablamos de una micela.
Figura 33. Asociacin de fosfolpidos para formar una micela (Curtis, 2009).
Las micelas que hemos hablado contienen una zona altamente hidrofbica que no puede
ser atravesada por compuestos polares, como los azcares, que son necesarios para las
clulas como hemos visto en el apartado anterior. Es por ello, que las membranas
plasmticas, estn formadas adems, por protenas (Fig. 34) cuya funcin principal ser
el transporte de micromolculas como comentaremos en el siguiente apartado. De esta
manera, las membranas se transforman en estructuras semipermeables y selectivas de
manera que solo se transporte aquellos metabolitos que son necesarios para la vida
celular. Adems, las membranas tiene, en su cara externa a la clula, un conjunto de
oligosacridos que le ayudarn en el sealamiento intercelular (Lodish, 2007).
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Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
Figura 34. Ilustracin de una membrana plasmtica formada por fosfolpidos (azul)
donde se observa una protena de canal (en amarillo) por donde se transportan
molculas polares (Science Photo Library).
Si quieres conocer ms sobre la importancia de los lpidos y el transporte de molculas en
las membranas plasmticas consulta el captulo Biomenbranas y arquitectura celular
(Lodish, 2007).
d) Esfingolpidos
Los esfingolpidos tambin forman parte de la membrana plasmtica de todos los seres
vivos siendo los segundos ms importantes pero donde son ms abundantes en el tejido
nervioso de los animales, puesto que la esfingomielina junto con el cido lignocrico y
un aminoalcohol llamado colina, conforman las vainas de mielina (Fig. 35), las cuales
protegen y aslan a las clulas nerviosas, adems de favorecer la sinapsis.
Figura 35. Neurona, la flecha seala una vaina de mielina (Science Photo Library).
e) Cridos o ceras
Las podemos encontrar formando cubiertas protectoras en los animales, ya sea sobre la
piel, en forma de pelo (como la lanolina de la lana de las ovejas) y plumas de las aves. En
los vegetales en las hojas, tallos y frutos recubrindolos y protegindolos de la prdida de
agua por efecto de la evaporacin. En los insectos los podemos encontrar en el
Ciencias de la Salud Biolgicas y Ambientales | Ingeniera en Biotecnologa
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exoesqueleto y tambin en un gran ejemplo en las ceras producidas por las abejas
compuesta, principalmente, por steres del cido palmtico
2. Lpidos simples o no saponificables
a) Terpenos
Son importantes porque forman los aceites esenciales que aportan olor y sabor a
algunos vegetales algunos ejemplos son el geraniol, mentol, limoneno, alcanfor, pineno,
etc. Otro terpeno es el fitol que forma parte de la molcula de clorofila (Fig. 36). Tambin
conforman otros pigmentos fotosintticos como los carotenoides y pueden estar presentes
en bacterias y hongos como metabolitos secundarios con importancia biotecnolgica.
Tambin existen terpenos con importancia fisiolgica puesto que son vitaminas
liposolubles, son las vitaminas A, K y E, adems otros terpenos son coenzimas por
ejemplo la coenzima Q que acta como transportador de hidrgeno en las oxidaciones
biolgicas de las mitocondrias (Nelson y Cox, 2009).
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Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
Otro problema relacionado con los esteroides es la produccin de esteroides anablicos
que son sustancias sintticas formadas a partir de los andrgenos u hormonas esteroides
masculinas, su efecto es promover el acelerado crecimiento muscular, lo cual es
considerado como deshonestidad deportiva conlleva varios riesgos a la salud adems de
acarrear la descalificacin de los atletas en eventos deportivos.
c) Eicosanoides
Una de las funciones de los eicosanoides es como biocatalizador, es decir que facilitan
las reacciones qumicas que se producen en los seres vivos; adems tienen accin en la
comunicacin celular, en los procesos de inflamacin y la respuesta inmune (Fig. 37)
de vertebrados e invertebrados, ya que las prostaglandinas son un tipo de eicosanoide
que tiene funciones en dicha respuesta.
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1.Clasificacin
2. Estructura
3. Funcin
4. Aplicacin
Colesterol
Fosfatidilcolina
Triaconilpalmitato
Leucotrieno B4
Astaxantina
Esfingomielina
1-palmitoil, 2-oleil,
3-estearoil-glicerol
5. Posteriormente a tu investigacin, realiza lo siguiente:
a. Completa la tabla anterior cuidando que las fuentes en que basaste tu
actividad sean confiables, posteriormente escribe una conclusin sobre esta
actividad, considerando en todo momento la diversidad de las funciones de las
biomolculas anteriores.
b. Apoya tu trabajo con imgenes y s cuidadoso con la ortografa.
c. Si tienes dudas, por favor, consulta la informacin referenciada en la seccin
Para saber ms.
Cierre:
Los lpidos tiene una gran importancia en la clula, no slo en la estructura y la
obtencin de energa y son varios los tipos de lpidos que podemos encontrar segn
su estructura. As mismo, como futuro Ingeniero en Biotecnologa es importante que
analices la aplicacin que pueden tener los conocimientos adquiridos y este trabajo
es una buena oportunidad para que analices dichas implicaciones. En el Apndice de
respuestas encontrars una tabla con las respuestas correctas aunque, recuerda, que
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Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
las aplicaciones pueden ser variadas y no tienes porqu poner exactamente la misma
que aparece en la respuesta.
Para saber ms:
La realizacin de esta actividad es compleja ya que engloba el anlisis de varios
lpidos diferentes, por ello, te invito a revisar varios libros que te ayudarn a completar
correctamente la actividad:
Mathews, C.K, Van Holde, K. E y Ahern, K.G. (2002). Bioqumica. (3a edicin)
Mxico: Editorial Pearson Addison Wesley.
Murray, R. Mayers, P. Granner, D. y Rodwell, V. (2010). Harper. Bioqumica
ilustrada. (28 edicin) Mxico: Editorial McGraw Hill.
Nelson, D.L. y Cox, M.M. (2009). Lehninger: Principios de Bioqumica.
Espaa: Editorial Omega.
1.3. Protenas
Las protenas se pueden considerar como los materiales de construccin de todos los
organismos vivos. Su funcin es muy variada, forman parte de los tejidos y son
consideradas como sustancias plsticas lo que implica que tienen funciones de
construccin y de reparacin de estructuras celulares y finalmente, presentan actividad
biolgica lo que significa que participan en procesos de reparacin, de transporte, de
regulacin, de defensa, de reserva y de catlisis lo que les hace diferentes a los glcidos
y lpidos los cuales son considerados como sustancias inertes.
1.3.1. Estructura
Para tratar el tema de las protenas es necesario mencionar que existen ms de 300
aminocidos, aunque slo 20 de ellos son los que destacan debido a que constituyen las
unidades monomricas de las protenas (Murray y col., 2010); las diferentes
combinaciones de aminocidos generan una cadena peptdica, pero para que una
protena sea funcional es necesario que su estructura tenga la correcta conformacin
tridimensional, as pues te voy a mencionar las estructuras de las protenas y brevemente
desarrollar algunas caractersticas, ten en cuenta que la funcin deriva de la estructura
tridimensional y la estructura tridimensional est establecida por la secuencia de
aminocidos (Lodish y col., 2007).
a) Estructura primaria
Es la unin de dos o ms aminocidos, tambin se denominan pptidos cuando la
cadena es corta, de 20 a 30 aminocidos y polipptido cuando es larga (31 aminocidos
en adelante) (Fig. 38).
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Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
Los aminocidos estn unidos entre s por el enlace peptdico, este enlace se forma a
partir del extremo amino de un aminocido y el extremo carboxlico de otro aminocido
(Fig. 39). Su hidrlisis o ruptura tiene como resultado la liberacin de una molcula de
agua. Debido a su estabilidad, el enlace peptdico es considerado como un doble enlace a
pesar que no lo es, el porqu de esta consideracin?, quizs se deba a que como el
nitrgeno es menos electronegativo que el oxgeno, el enlace C-O tiene un 60 % de
carcter de doble enlace y un 40 % de enlace sencillo dado por el enlace C-N. Estas dos
caractersticas genera que el enlace peptdico presente resonancia dando origen a su
carcter de enlace doble parcial.
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Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
se puede predecir en que sitio se encontrar una hoja beta plegada, un giro y una hlice
alfa.
Respecto a las hlices alfa, esta conformacin surge a partir de la unin del oxgeno del
carbonilo con un hidrgeno del aminocido de cuatro posiciones anteriores tal como se
muestra en la Figura 40.
Figura 40. Hlice alfa, forma parte de la estructura secundaria de una protena (Lodish,
2007).
Por otra parte la hoja beta se forma, como lo muestra la figura 41, por hebras de
aproximadamente 5 a 8 aminocidos que se agrupan lateralmente, los enlaces que posee
provocan que el pptido se pliegue.
Figura 41. Hoja beta plegada, a) vista superior y b) vista lateral (Lodish, 2007).
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Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
Dentro de la estructura de las hojas beta plegada se pueden observar un par de giros
cortos que proporcionan la forma de U, estos giros estn compuestos por tres o cuatro
aminocidos, sirven para redirigir la estructura del pptido.
c) Estructura terciaria
Aqu encontramos que los elementos de la estructura secundaria, las hlices alfa, las
hojas beta plegadas y los giros azarosos (Fig. 42) que se mantienen compactados gracias
a que la cadena polipeptdica se estabiliza mediante las interacciones hidrfobas entre las
cadenas laterales no polares y tambin por los enlaces de hidrgeno entre las cadenas
laterales polares y enlaces peptdicos; sin embargo por la debilidad de los enlaces an se
modifica su estructura momentneamente.
d) Estructura cuaternaria
Consta de dos o ms polipptidos que se unen entre s, hace referencia al nmero de
subunidades que posee, mismas que pueden ser idnticas o diferentes, en este caso
pueden asociarse con otras protenas que se encuentran en el mismo lugar o bien que
cumplan funciones dentro del mismo proceso, es decir forman asociaciones multimricas
dentro de la clula formando de esta forma un sinfn de complejos protenicos; por
ejemplo un replisoma que es la unin de la helicasa, una DNA polimerasa y una primasa
(Fig. 43).
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Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
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Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
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Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
e) Protenas motoras que son las que originan el movimiento y conforman los
filamentos de actina y miosina (Fig. 48) forman la maquinaria contrctil del
msculo.
Figura 48. Tbulos de miosina (color verde) y actina (rojo) (Science Photo
Library).
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Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
La Enzyme Commission es el organismo encargado en clasificar a todas las enzimas y
lo hace a partir de un conjunto de dgitos que indican la clase de enzima y el tipo de
reaccin que cataliza. Los dgitos asignados por esta comisin definen como ya se ha
mencionado a la enzima en cuestin es decir, el primer dgito indica la clase de enzima, el
segundo dgito indica la subclase de enzima, el tercer dgito indica la subclase de la
subclase y el cuarto dgito corresponde a la enzima especfica. Estos cuatro dgitos son
antecedidos por las siglas EC que indican Enzyme Commission. As por ejemplo, la
enzima EC 2.7.1.1 nos denotara que la enzima se trata de una Transferasa (clase 2),
subclase 7 (transferencia de fosfato), subclase 1 (una funcin alcohol como aceptor de
fosfato) y el ltimo dgito denota a la enzima hexocinasa o ATP D-hexosa-6fosfotransferasa.
La clasificacin resulta un poco compleja por lo en la actualidad se sigue utilizando el
nombre convencional de las enzimas y que dan idea del sustrato que catalizan, por
ejemplo, la celulasa nos indica que hidroliza a la celulosa; la amilasa, hidroliza al almidn,
de esta forma podemos distinguir un nmero importante de enzimas. Tendras que tener
cuidado en la clasificacin de enzimas utilizando esta nomenclatura ya que solo basta con
que agregues la terminacin asa al sustrato principal de la enzima en cuestin. La
importancia de las enzimas en el metabolismo es fundamental, sin ellas sera imposible la
vida. Como futuro biotecnlogo debes tener claro que las enzimas juegan un papel de
suma importancia en procesos de sntesis y en el crecimiento celular y que su control a
travs del conocimiento de variables como pH, temperatura y fuerza inica as como del
conocimiento de los procesos de inhibicin ya sea por sustrato o por producto, te
permitirn optimizar y mejorar procesos de sntesis o de produccin de biomasa.
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Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
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Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
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Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
Figura 51. Estructura de los desoxinucletidos, los dos primeros (A y G) formados por
bases puricas y los dos ltimos (T y C) formados por bases pirimidnicas. As mismo, se
observa que existen tres formas correctas para denominar un desoxinucletido (tomado
de Nelson y Cox, 2009)
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Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
Ahora que sabemos cmo son los desoxinucletidos, pasemos a revisar cmo se unen
entre s para formar las cadenas de ADN. Esto ocurre mediante un enlace fosfodister
(tambin conocido como enlace nucleotdico) entre el OH del carbono 3 del nucletido
presente en la cadena con el fosfato del carbono 5 del nucletido que se incorpora; de
esta manera podemos observar cmo el crecimiento de todas las molculas de cidos
nucleicos siempre ocurre en direccin 5-3 (Fig. 54).
41
Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
Figura 54. Enlace fosfodister (A) para la formacin de la cadena de ADN. Observa
cmo el nuevo nuclotido se incorpora en el extremo 3 (B) por lo que el crecimiento se
dar en direccin 53 (modificado de http://cienciastella.com/ADN.html y
http://www.iesaltoalmanzora.es/centro/departamentos/biologia/2bto_bio/unid6.htm)
Finalmente, llegamos a la cadena de desoxinuclotidos que se unir con otra para formar
el ADN mediante puentes de hidrgeno entre las bases presentes: la adenina forma dos
puentes de hidrgeno con la timina; mientras que la guanina forma 3 puentes de
hidrgeno con la citosina; para ello, es importante que las cadenas sean antiparalelas los
que permitir la interaccin entre las bases nitrogenadas (Fig. 55).
Figura 55. Interaccin entre las bases nitrogenadas de las dos cadenas de
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Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
desoxinucletidos para la formacin de una cadena de ADN (Nelson y Cox, 2009)
El ADN es una molcula muy flexible y se han descrito 3 formas (Fig. 56): la forma A
presente cuando el ADN est en una solucin poco acuosa; la forma B, la ms estable,
descubierta por Watson y Crick en 1953, y la forma Z donde se observan giros levgiros
(a la izquierda) en vez de dextrgiro (a la derecha) como en las otras formas. Si quieres
conocer ms sobre estas estructuras o el crucial descubrimiento de estos dos grandes
investigadores, por favor, revisa el Captulo 12, pp. 331-337 de Nelson y Cox (2009).
Figura 56. Diferentes formas que puede adoptar el ADN. Cada una de las estructuras
presentes tienen 24 pares de bases (Nelson y Cox, 2009).
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Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
1.4.2. Clasificacin y estructura del ARN
En cuanto a la estructura del ARN, este cido nuclico est formado por la unin de
nucletidos por enlaces fosfodister similares a los descritos para el ADN. Las diferencias
bsicas entre estos dos polmeros son 3:
1. El azcar del nuclotido es ribosa y no desoxirribosa
2. Las bases pricas presentes son las mismas que para el ADN a diferencia de la
bases pirimidnicas de manera que en el ARN encontramos Citosina y Uracilo
mientras que en el ADN ste ltimo no est presente.
3. El ARN es monocatenario (tiene solo una cadena de nucletidos) a diferencia del
ADN que, como vimos, es bicatenario.
De este modo, en la figura 57 les presento la estructura de los 4 diferentes nucletidos
que conformar el ARN de todos los seres vivos.
Figura 57. Estructura de los nucletidos presentes en el ARN (Nelson y Cox, 2009)
La formacin de la cadena es similar a la descrita anteriormente para el ADN con la
formacin de nuclesidos para posteriormente adicionar el fosfato que formar el
nucletido. Y la unin de nucletidos mediante enlaces fosfodister tambin ocurrir en
direccin 5-3.
Funcin celular
Tipo de ARN
mensajero
Sntesis de protenas
de transferencia
ribosmico
De interferencia
Reguladores
Micro ARN
Interferente pequeo
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Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
Asociados a Piwi
Antisentido
Largo no codificante
Riboswitch
Ribozima
Con actividad cataltica
Tabla 3.
clasificados
Espliceosoma
Pequeo nuclear
Tipos de ARN
segn su
funcin celular.
Figura 58. Estructura del ARNm presente en una clula eucariota (tomado de
http://www.inmegen.gon.mx/es/divulgacion/glosario-de-terminos)
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Figura 59. Estructura del ARNt, observe como el plegamiento es debido a las uniones de
las bases nitrogenadas G-C y A-U (http://sintesis-jmr.blogspot.mx/2010/11/arnmensajero-arn-de-transferencia-html)
El ltimo, pero no el menos importante, es el ARN ribosomal o ARNr que constituye
alrededor del 80% del ARN total de una clula. Varios tipos de ARN junto con varias
protenas diferentes forman los ribosomas celulares, lugar donde ocurre la sntesis de
protenas. En el caso de las clulas procariotas podemos encontrar los ARNr 5S, 16S y
23S mientras que para los eucariotas, los ARNr presentes son 5S, 5,8S, 18S y 28S (Fig.
60).
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Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
Figura 60. ARNr presente en las clulas procariotas y eucariotas. La unidad S (svedberg)
se refiere al coeficiente de sendimentacin durante una centrifugacin que depende de
una combinacin de tamao y forma (Lodish y Cox, 2009).
Ahora que conocemos la estructura del ADN y del ARN es hora de hablar de su
importancia bioqumica.
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Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
es una molcula que almacena energa y, entre otras funciones, es la encargada de
proveer la energa suficiente para que se produzcan los enlaces peptdicos durante la
sntesis de las protenas.
Figura 62. Estructura del AMPc y GMPc importantes en la sealizacin celular (Nelson y
Cox, 2009).
Continuando con las funciones de los cidos nucleicos y siguiendo con el tamao de los
mismos, pasemos a hablar de los ARN que tiene actividad cataltica como las
ribozimas. Supongo que muchos de ustedes piensan que las nicas molculas capaces
de acelerar reacciones qumicas son las enzimas de naturaleza protica, verdad?
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Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
Buenos, pues desde hace aos se ha demostrado que existen varios tipos de ARN que
pueden realizar esta misma funcin. Un ejemplo es el enlace peptdico durante la sntesis
de protenas ya que se ha demostrado que es un RNAr presentes en el ribosoma el
encargado de esta accin. Los primeros en sugerir esta accin fueron Crick y Orgen en
1967 pero no fue hasta 1980 cuando Cecha Altman lo demostraron de manera
independiente.
El resto de las funciones bioqumicas de los cidos nucleicos estn implicados en la
expresin de protenas, el almacenamiento y la transmisin del material gentico a
la descendencia. Para ello, es importante comenzar definiendo algunos conceptos
necesarios para entender este tema. En primer lugar, recordemos que las protenas son
cadenas polipeptdicas cuya diferencia es el nmero y la posicin de los aminocidos que
conforman su estructura primaria, por ello, para su sntesis es necesario tener la
informacin que nos indique la secuencia correcta. Esta informacin viene determinada en
el ADN, donde se encuentran los genes, que son secuencias que contienen la
informacin necesaria para la sntesis de un producto biolgico (ya sea protena, como
comentbamos, o ARN). Este proceso se lleva a cabo mediante dos procesos que
constituyen el Dogma Central de la Biologa Molecular (Fig. 63): en primer lugar se da el
proceso de transcripcin donde la secuencia de ADN se transforma en ARN y
posteriormente ocurre la traduccin donde la secuencia, especficamente del ARNm, es
ledo por el ARNt para formar la protena correspondiente en los ribosomas.
Por otro lado, es importante que se produzcan las protenas necesarias en cada situacin
ya que un exceso de las mismas equivaldra a un gasto de energa innecesario y una falta
de alguna protena podra conllevar la muerte de los organismos. Es por ello, que la
regulacin de los genes que se deben expresar en cada momento es de vital
importancia. Es ah donde estn involucrados los ARN reguladores como el ARN de
interferencia, el antisentido, los MicroARN o los Riboswith, entre otros.
Finalmente, esta informacin es vital para la supervivencia de cualquier organismo, ya
que sus capacidades dependern de las protenas que sea capaz de producir y stas
dependern del ADN que posea. Es por ello, que durante la reproduccin es importante la
transmisin correcta del material gentico. El proceso de replicacin se define como el
mecanismo que permite al ADN duplicarse y tambin forma parte del Dogma Central de
la Biologa Molecular.
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Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
Figura 63. Dogma central de la Biologa Molecular (modificado de Curtis y Barnes, 2009)
Los detalles de cmo ocurren estos procesos de replicacin, transcripcin y traduccin los
veremos en la Unidad III de este mismo curso, te interesa?
Autoevaluacin
Ahora que has terminado esta primera unidad, es momento de llevar a cabo la
evaluacin final para esta unidad, lee con atencin las siguientes preguntas y responde*
de acuerdo a lo que consideres correcto.
1. Relaciona las siguientes columnas, donde aparecen los biopolmeros, con sus
respectivos monmeros
a. Protenas
I.
Monosacridos
b. Carbohidratos
II.
cidos grasos
c. Lpidos
III.
Aminocidos
d. cidos nuclicos
IV.
Nucletidos
2. Ahora, relaciona cada polmero con el enlace que forman sus monmeros:
a. Protenas
I.
Nucleotdico
b. Carbohidratos
II.
Peptdico
c. Lpidos
III.
Glucosdico
d. cidos nuclicos
IV.
ster
3. Observa la siguiente imagen e indica a qu tipo de biomolcula pertenece:
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a.
b.
c.
d.
Protena
Lpido
cidos nuclicos
Carbohidratos
51
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Respuesta
correcta
Retroalimentacin
1.
a III
bI
c II
d IV
2.
a II
b III
c IV
dI
3.
4.
5.
6.
7.
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terciarias y cuaternarias sern funcionales dependiendo del
nmero de polipptidos forme la protena. Cuando
nicamente est formada por un polipptido, entonces ser
funcional en estructura terciaria (como la lacasa).
8.
9.
10.
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Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
igual que en el punto 2, puedes completar la informacin con alguna imagen que
te ayude en tu explicacin
c. No olvides anexar la Bibliografa que has utilizado para hacer tu tarea.
Polmero
1.Monmero
2.Estructura
3.Clasificacin
4.Funcin
5.Ubicacin
celular
Carbohidratos
Lpidos
Protenas
cidos
nuclecos
Cierre:
Todas las clulas estn formados por 4 biomolculas: carbohidratos, lpidos, protenas y
cidos nuclicos. Conocer la estructura de cada una de ellas, as como su funcin y
ubicacin celular es fundamental para que un Ingeniero en Biotecnologa pueda utilizar
algn ser vivo para obtener un bien o un servicio.
Para saber ms:
Con esta ltima actividad, y como integradora, has realizado una comparacin entre las
4 biomolculas estudiadas durante esta unidad y has podido constatar que su estructura
es diferente as como su funcin y su ubicacin celular depender de sta, para conocer
ms sobre el tema te recomiendo revisar la siguiente bibliografa:
Alberts, B. J., Lewis, A, Raff, J., Keith, M. y Roberts W.P. (2008). Biologa
Molecular de la Clula. Mxico: Editorial Omega.
Curtis H. y Barnes, N.S. (2009) Biologa. Mxico: Editorial Mdica
Panamericana.
Lodish. H. Berk, A. Matsudaria, P. Kaiser, C. Scott, M. Zipursky, L. y Darnell,
J. (2007). Biologa celular y molecular. 5 edicin. Mxico: Editorial Mdica
Panamericana.
Cierre de la unidad
Ya hemos llegado al final de la unidad, te ha parecido interesante? Hemos analizado los
componentes bsicos de todos los seres vivos: las biomolculas que por su estructura y
funcin se pueden dividir en 4 grandes grupos:
1. Los polisacridos, polmeros formados por monosacridos como monmeros. Su
principal caracterstica estructural es estar formados por (CH2O)n y aunque existen
muchos tipos su principal funcin biolgica est relacionada con la produccin y
Ciencias de la Salud Biolgicas y Ambientales | Ingeniera en Biotecnologa
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Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
reserva de energa, como precursores de otras biomolculas como lpidos y cidos
nucleicos y como sealizadores intercelulares.
2. Tambin hemos estudiado a los lpidos, cuya principal caracterstica es ser un
compuesto aliftico (contiene una zona polar o hidroflica y una apolar o
hidrofbica). Dentro de sus funciones vamos a destacar dos de ellas: la reserva de
energa en forma de acilgliceroles y especficamente triaciltriglicerdos y la
formacin de membranas plasmticas.
3. La siguiente biomolcula analizada fueron las protenas, formadas por la unin de
aminocidos unidos por enlaces peptdicos. Hemos visto su importancia
estructural, como transportadores de biomolculas a travs de la membrana
plasmtica, receptores de seales sin olvidar la capacidad que tiene las enzimas
de catalizar reacciones qumicas.
4. Finalmente, y si quitarle importancia, tenemos a los cidos nucleicos compuestos
por nucletidos unidos por enlaces fosfodister. Su principal caractersticas es
estar formados por un azcar, fosfato y una base nitrogenada. Se divide en cido
desoxirribonuclico (o ADN) y cido ribonucleico (o ARN). Adems de estar
involucrados en la sntesis de protenas y en la transmisin del material genticos
hemos aprendido que algunos ARNs pueden tener actividad cataltica y que el
ATP, la molcula energtica por excelencia en las clulas, no es ms que un
nucletido. Adems de que el AMPc est involucrado en la transmisin de los
seales que provienen del exterior de la clula.
Te imaginabas algo as? Espero que hayas detectado la interaccin tan importante que
tienen las 4 biomolculas ya que solo trabajando juntas pueden hacer algo tan especial y
maravilloso como la vida. Te invito a que sigas conociendo ms sobre este mundo tan
maravilloso, como es la bioqumica, y que contines con la siguiente unidad que prometo
que ser igual o ms interesante que esta.
Para saber ms
Fuentes impresas
Curtis, H. Barnes, N.S. (2009) Biologa. Editorial Mdica Panamericana.
Daz, J. (2006). Bioqumica: un enfoque bsico aplicado a las ciencias de la vida.
Mxico. UNAM.
Lodish. H. Berk, A. Matsudaria, P. Kaiser, C. Scott, M. Zipursky, L. Darnell,
J. (2007). Biologa celular y molecular. 5 edicin. Mxico. Editorial Mdica
Panamericana.
Nelson, D.L., Cox, M.M. (2009). Lehninger: Principios de Bioqumica. Espaa.
Editorial Omega.
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Bioqumica
Unidad 1. Introduccin a las biomolculas
Fuentes electrnicas.
http://quimica-explicada.blogspot.mx/2010/07/saponificacion-reaccinqumica.del.html.
http://biomodel.uah.es/model2/lip/nomen.htm
http://es.scribd.com/doc/23794366/Tips-de-arn
http://www.genomasur.com/lecturas/Guia07.htm
http://www.news-medical.net/health/Ribozyme-Discovery-(Spanish).aspx
Fuentes de consulta
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