Microbiologia ambiental

Engenharia do Ambiente
Escola Superior Agrria
Instituto Politcnico de Coimbra
abelho@esac.pt
www.esac.pt/abelho

Mdulo 1.Ecologia microbiana

Parte 2. Ecologia microbiana

2.3 ACTIVIDADES MICROBIANAS

COM RELEVNCIA ECOLGICA
Manuela Abelho 2012

Microbiologia ambiental

O papel dos
microrganismos nos ciclos
de nutrientes

Ciclos biogeoqumicos envolvem

processos fsicos, qumicos e
biolgicos
Toda a matria orgnica
decomposta pelos microrganismos
quimioheterotrficos =
mineralizao (transformao de
compostos orgnicos em
componentes inorgnicos)
A maior parte da produo
primria no consumida pelos
animais = detritos

Quimioheterotrficos: classificao quanto s fontes de energia, de electres e

de carbono, respectivamente.
Quimio: fonte de energia e de e- = molculas orgnicas;
Hetero: fonte de carbono = molculas orgnicas
Manuela Abelho 2012

Microbiologia ambiental

A decomposio dos detritos orgnicos

Mineralizao
Os minerais que no so usados para a formao de
nova biomassa microbiana so libertados para o
ambiente
Processo pelo qual a matria orgnica decomposta
libertando compostos inorgnicos mais simples (e.g.
CO2, NH4+, CH4, H2)
Imobilizao
Processo pelo qual os microrganismos adquirem os
nutrientes de que necessitam para a sntese de
biomassa a partir do seu meio ambiente
Manuela Abelho 2012

Microbiologia ambiental

Principais formas de C, N, S e Fe nos

ciclos biogeoqumicos
Ciclo

Forma
gasosa

Principais formas e valncias

Reduzida

Estado intermdio

Oxidada

Carbono Abundante

CH4 (-4)

CO (+2)

CO2
(+4)

Azoto

Abundante

NH4+
N orgnico
(-3)

N2 (0)

N2O
(+1)

NO2(+3)

NO3(+5)

Enxofre

Abundante

H2S, grupos
SH (-2)

S0 (0)

S2O32(+2)

SO32(+4)

SO42(+6)

Ferro

Pouco
abundante

Fe2+
(+2)

F23+
(+3)

Ciclos do carbono e do azoto: formas gasosas abundantes; menos no ciclo do enxofre

Alguns microrganismos do solo e da gua podem fixar as formas gasosas destes nutrientes
Manuela Abelho 2012

Microbiologia ambiental

Ciclo do carbono
Oxidao aerbia e anaerbia (mineralizao) de compostos
orgnicos: produo de CO2, material bsico para a fotossntese
Para manter a concentrao de CO2 baixa e constante (0.03%)
essencial que exista equilbrio entre o consumo e a produo de
CO2
Sem a produo contnua, o CO2 atmosfrico seria esgotado pela
fotossntese em cerca de10 anos

Em ambientes anaerbios, parte do CO2 entra na atmosfera como

metano
O CH4 oxidado quimicamente em CO2 via CO ou biologicamente
pela aco de bactrias

Manuela Abelho 2012

Microbiologia ambiental

Reaces biolgicas do ciclo do carbono

FIXAO DE CARBONO
CO2
Fotossntse
Quimiossntese
RESPIRAO
Plantas
Algas
Cianobactrias

Produtores
primrios

Oxidao do
monxido de carbono
CO

Consumidores
de compostos
orgnicos

Respirao
Mineralizao
Oxidao
do metano

Via cadeias alimentares

Aerobiose
Anaerobiose

metanognese

CH4

CO2
Acetato

FIXAO DE CARBONO
Fotossntese
Bactrias
fototrficas

Produtores
primrios

Consumidores
de compostos
orgnicos

Via cadeias alimentares

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Respirao anaerbia
Fermentao

Microbiologia ambiental

Armazenados nos
combustveis
fsseis
7

Ciclo do carbono
Os dadores (e.g., H, um redutor forte) e os aceitadores (e.g., O2) de
electres influenciam as reaces qumicas e biolgicas que
envolvem C
Metano atmosfrico tem vindo a aumentar , constituindo
actualmente cerca de 1.7 ppm
plantaes de arroz, ruminantes, minas de carvo, esgotos, pauis

Fixao de C: cianobactrias, algas verdes, bactrias fotossintticas e

quimio-autotrficas aerbias
A disponibilidade de oxignio influencia a decomposio da matria
orgnica, levando produo de diferentes produtos finais
consoante os substratos so mineralizados sob condies aerbias
ou anaerbias:
Manuela Abelho 2012

Microbiologia ambiental

Influncia do oxignio na decomposio da matria

orgnica
Uso aerbio do C com
libertao de minerais

Oxidao de produtos reduzidos

H2
H2O
NH4
NO2NO3Matria orgnica
H2S
SO42complexa
CO2
Quimioheterotrficos
Quimioautotrficos

Uso anaerbio do C com

libertao de minerais
Matria orgnica
complexa
Vrios
quimiohetrotrficos
Manuela Abelho 2012

Produtos orgnicos
de fermentao
NH4 +
H2S
CO2
H2

Produo de
metano
CH4

Metanognicos

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Degradao da celulose
Os detritos vegetais so principalmente compostos por
polmeros estruturais das paredes celulares, dos quais a
celulose a mais abundante
A degradao microbiana (bactrias e fungos) da celulose
um passo essencial no processo da mineralizao e no ciclo
do carbono
Sob condies anaerbias, a decomposio da celulose
deve-se principalmente a clostrdeos mesfilos e termfilos
Sob condies aerbias nos solos e na gua, os fungos tm
o papel principal
Manuela Abelho 2012

Microbiologia ambiental

10

Ciclo do azoto
nitrogen cycle. [Art].
In Encyclopdia
Britannica. Retrieved from
http://www.britannica.co
m/EBchecked/media/6/Th
e-nitrogen-cycle

Manuela Abelho 2012

Microbiologia ambiental

11

 Maior reservatrio: atmosfera

(79%); principal forma: N2
Ciclo do azoto
Atmosfera

Deposio no solo e na gua:

precipitao
Alguma fixao no biolgica
ocorre na atmosfera: reduo a
nitrato (NO3-) e amnia (NH4+)
pela energia dos relmpagos

Tambm ocorre fixao por

processos industriais (fabrico de
amnia e fertilizantes ricos em
azoto)

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Processos biolgicos
no ciclo do azoto

1.
Fixao do azoto
atmosfrico (N2)

Precipitao: deposio de N2 no
solo e na gua
Fixao biolgica: bactrias fixadoras
de azoto
Bactrias fixadoras de vida livre
(Azotobacter, Clostridium, bactrias
fotossintticas cianobactrias)
Bactrias simbiticas com plantas
superiores (e.g. Rhizobium leguminosas)

Enzima nitrogenase: transforma o

azoto praticamente inerte da
atmosfera em amnia: NH4+
Processo muito dispendioso em
termos energticos (gasta muito ATP)

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Processos biolgicos
do ciclo do azoto

2.
Nitrificao

Embora as plantas possam usar

amnia, a maior parte
transformada em nitrito e nitrato
antes da sua utilizao pelas
plantas
Bactrias nitrificantes
(quimioautotrficas)
Reduo da amnia em nitrito
2NH4+ + 3O2 NO2- + 4H+ + 2H2O
Exemplo Nitrosomonas spp.

Oxidao do nitrito em nitrato

2NO2- + O2 2NO3 Exemplo Nitrobacter spp.
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Processos biolgicos
do ciclo do azoto

3.
Assimilao

Transformao pelas plantas de

azoto inorgnico (amnia,
nitrito, nitrato) em compostos
orgnicos
NO3- NH3 (reduo)
Compostos orgnicos
(protenas)

Azoto orgnico passa atravs da

cadeia alimentar

Manuela Abelho 2012

Microbiologia ambiental

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Processos biolgicos
do ciclo do azoto

4.
Amonificao |
mineralizao do
azoto

Morte dos seres vivos +

Processos de excreo
decomposio dos seus
compostos orgnicos
Microrganismos saprfitas
libertam amnia (NH4+) que
usada pelas plantas
Em meio alcalino
NH4+ NH3
NH3 NH4+ (combinao com H+)

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Processos biolgicos
do ciclo do azoto

5.
Desnitrificao

Manuela Abelho 2012

Processo anaerbio levado a

cabo por bactrias
desnitrificantes
Reduo de nitrato (NO3-) a N2 e
N2O (volteis)

Microbiologia ambiental

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Reaces biolgicas do ciclo do azoto

N2

Nitrificao
NO2-

Assimilao

Desaminao

R-NH2 nas
protenas

Assimilao

Aerbios

NH4+

NO3Desaminao

Assimilao

Anaerbios

R-NH2 nas
protenas

Amonificao
do nitrato

N2

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N2O

NO2-

Assimilao

Respirao de
nitrato/nitrito

Desnitrificao

Microbiologia ambiental

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A quantidade de azoto
Distribuio do azoto na biosfera
Atmosfera
Biomassa das plantas terrestres
Matria orgnica morta terrestre
Biomassa das plantas aquticas
Matria orgnica morta aqutica

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Microbiologia ambiental

(toneladas)
3 800 000 109
12 109
300 109
0.3 109
550 109

19

Ciclo do enxofre

Manuela Abelho 2012

Microbiologia ambiental

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Ciclo do enxofre
Principais formas

o 10 elemento mais
abundante da Terra
S: enxofre elementar
H2S: sulfureto de hidrognio
ou gs sulfdrico
SO2: dixido de enxofre
SO4-: io sulfato
FeS: sulfureto de ferro
FeSO4: sulfato de ferro

Formas orgnicas: em todos

os organismos (protenas,
vitaminas, hormonas)
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Microbiologia ambiental

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Ciclo do enxofre

Processos geoqumicos e
meteorolgicos: lixiviao das
rochas
Actividade vulcnica
Em contacto com o ar: sulfato
(SO4-)
Plantas: converso em formas
orgnicas animais
Excreo e morte: decomposio
SO4-

A maioria dos microrganismos e

das plantas usam sulfato como a
nica fonte de enxofre,
enquanto os animais dependem
de enxofre reduzido
Manuela Abelho 2012

Microbiologia ambiental

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Ciclo do enxofre

Algumas reaces do ciclo

so apenas realizadas por
organismos procariotas
Beggiatoa & Thiobacillus:
usam enxofre & O2
Desulfovibrio &
Desulfomonas: usam
enxofre sem O2
Chromatium & Chlorobium:
usam enxofre e luz mas no
O2

Manuela Abelho 2012

Microbiologia ambiental

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Os microrganismos no ciclo do enxofre

24

Desulfovibrio
+
22CH2O+2H +SO4

Desulfomonas

H2S+2CO2+2H2O

sulfato sulfureto de hidrognio

(anaerobiose)

H2S+CO2+O2

Beggiatoa
Thiobacillus

CH2O+4S+3H2O

sulfureto de hidrognio enxofre elementar

(aerobiose)

2e-+2H++2H2S+CO2

Chromatium
Chlorobium

CH2O+2S+2H2O

sulfureto de hidrognio enxofre elementar

(na presena da luz mas em anaerobiose)
Manuela Abelho 2012

Microbiologia ambiental

Ciclo do enxofre

Enxofre libertado da matria orgnica

morta como H2S, produzido
principalmente atravs da reduo de
sulfato
H2S usado como fonte de energia de
bacilos quimioautotrficos e de
Beggiatoa, Thiothrix e Thiovolum
Bactrias que realizam dessulfurizao:
gneros Desulfovibrio,
Desulfotomaculum e bactrias
sulfurosas anaerbias (Desulfuromonas,
Desulfobacter, Desulfococcus,
Desulfonema, Desulfosarcina)
Existem nos solos e nos sedimentos e
metabolizam cidos orgnicos, etanol,
cidos gordos e hidrognio

Manuela Abelho 2012

Microbiologia ambiental

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A coluna de Winogradsky
Diatomceas e cianobactrias (fotoautotrficos)

Camada de gua

Camada de lama com O2

(castanho-claro)

Fotoheterotrficos: bactrias prpuras no

sulfurosas Rhodospirilum, Rhodopseudomonas.
Usam MO como fonte de e- sob condies
anaerbias

Zona cor de
ferrugem

Lama

Zona
vermelha
Lama +
enxofre,
carbonato
e fonte de
celulose

Chromatium
usam sulfureto de hidrognio como dador
de e- e CO2 como fonte de C
Chlorobium

Zona
verde
Difuso de H2S

Zona anaerbia com H2S (preta)

Manuela Abelho 2012

Algas e microrganismos aerbios que oxidam

sulfato: Beggiatoa, Thiobacillus, Thiothrix. Usam
compostos reduzidos de enxofre como fonte de e- e
O2 como aceitador

Clostridium (celulose produtos de fermentao)

Desulfovibrio (produtos de fermentao+sulfato
sulfureto)

Microbiologia ambiental

26

Reaces biolgicas do ciclo do

enxofre

S0

Oxidao de H2S

Des-sulfurizao

Oxidao de S0

R-SH nas
protenas

Assimilao:
reduo de
sulfato

Aerbios
H2S

SO42-

Anaerbios
Des-sulfurizao

Desassimilao:
reduo de enxofre

Assimilao:
reduo de
sulfato

R-SH nas
protenas

S0
Oxidao de H2S

S0

Desassimilao:
reduo de sulfato

Oxidao de S0

Bactrias fototrficas
Manuela Abelho 2012

Microbiologia ambiental

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Ciclo do enxofre simplificado

Aeromonas; Clostridium;
Desulfovibrio; Desulfotomaculum

SO42Reduo
de sulfato
Desulfovibrio
Reduo de sulfato
(desassimilao)

Matria orgnica

SO32-

S0

Mineralizao

Oxidao de enxofre
H2S

Manuela Abelho 2012

Oxidao
de enxofre

Aerbios: Thiobacillus; Beggiatoa

Thiothrix; fototrficos anoxignicos
Anaerbios: Chlorobium; Chromatium

Microbiologia ambiental

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Microrganismos e ecossistemas
Os microrganismos tm um papel vital nos ecossistemas,
como produtores primrios, decompositores e consumidores
primrios
O carbono fixado pelos produtores primrios que usam a
energia da luz ou das ligaes qumicas.
As bactrias e os fungos quimioheterotrficos so os
principais decompositores da matria orgnica,
disponibilizando minerais para os produtores primrios
Os protozorios ciliados e os flagelados (consumidores
primrios) comem bactrias e fungos
Manuela Abelho 2012

Microbiologia ambiental

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O papel vital dos microrganismos nos ecossistemas

Consumidores tercirios

CO2
CO2

Consumidores secundrios

CO2

Consumidores primrios

Fluxos
de
carbono

Bactrias e fungos
Matria
orgnica

Matria
orgnica

Produtores primrios
Manuela Abelho 2012

Microbiologia ambiental

CO2

(Quimioheterotrficos)

(Fotoautotrficos,
quimioautotrficos)
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Funes dos microrganismos nos

ecossistemas
1. Contribuem para a formao de matria orgnica atravs dos processos
fotossintticos e quimiossintticos
2. Decompem a matria orgnica, com a libertao de compostos inorgnicos (e.g.
CO2, NH4+, CH4, H2) nos processos de mineralizao
3. So uma fonte de alimento rica em nutrientes para outros microrganismos
quimioheterotrficos, incluindo protozorios e animais
4. Contribuem para os ciclos biogeoqumicos atravs da modificao de substratos e
de nutrientes
5. Alteram as quantidades de materiais nas formas solveis e gasosas, directamente
atravs de processos metablicos ou indirectamente atravs da modificao do
ambiente
6. Produzem compostos inibitrios que decrescem a actividade microbiana ou
limitam a sobrevivncia e o funcionamento de plantas e de animais
7. Contribuem para o funcionamento das plantas e dos animais atravs de interaces
positivas e negativas
Manuela Abelho 2012

Microbiologia ambiental

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