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Objectivos:
Este relatório pretende dar a conhecer os resultados e conclusões obtidos
da experiência feita nas duas últimas aulas da disciplina de Métodos e
Técnicas em Biologia Molecular. Para que o protocolo fosse cumprido de forma
eficaz seguimos algumas linhas orientadoras que nos permitiram atingir os
objectivos do trabalho. De modo a tornar este procedimento mais
pormenorizado foi dividido em duas aulas.
Na primeira aula, os nossos objectivos prendiam-se com a produção da
proteína de fusão recombinante e respectiva purificação por cromatografia de
afinidade. Na segunda aula pretendíamos analisar por electroforese em gel de
poliacrilamida em condições desnaturantes a proteína produzida para averiguar
o seu grau de purificação.
Resultados:
No que toca a cálculos temos no protocolo os seguintes dados:
A280nm =1 [GST] = 0,5 mg/ml
Através deste valor de absorvância apenas calculamos a concentração da
proteína de fusão diluída 1x. Recorrendo ao espectrofotómetro para analisar as
eluições obteremos os valores de absorvância necessários para calcular a
concentração de GST. A partir daqui teremos de calcular os valores quando as
soluções são diluídas 1x ou 50x. O valor da proteína recombinante purificada
será o correspondente aos da diluição a 50x.
Exemplo dos cálculos para a primeira eluição (E1):
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Seguindo este modelo calculamos os valores para as seguintes eluições.
Os resultados estão expressos na seguinte tabela:
Proteína
A280nm [GST] [GST] x 1 [GST] x 50 recombinante
(mg/ml) (mg/ml) (mg/ml) purificada
(mg/ml)
Valor de
1 0,5 0,5 - -
Referência
E1 0,047 0,0235 0,0235 1,175 1,175
E2 0,048 0,024 0,024 1,2 1,2
E3 0,056 0,028 0,028 1,4 1,4
Figura 1 - Esta tabela expõe os dados e valores obtidos ao longo do processo até à obtenção da proteína
recombinante purificada.
Através dos dados que nos foram fornecidos no protocolo e dos valores
obtidos na purificação da proteína recombinante, visíveis nesta tabela, foi
possível quantificar a proteína. Podemos observar na última coluna que ao
longo das eluições a concentração de proteína recombinante purificada
aumenta, sendo que a última eluição é a que apresenta maior grau de pureza.
Os valores de absorvância vão aumentando ligeira e gradualmente como
podemos analisar melhor no seguinte gráfico.
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Figura 3. Resultados obtidos na electroforese em gel de poliacrilamida em condições
desnaturantes.
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proteínas, existindo apenas duas bandas devido à inexistência da banda
correspondente a contaminantes.
Quanto à coluna correspondente ao GST era suposto obtermos uma
única banda o que efectivamente aconteceu, mostrando que o GST usado
estava puro. Não tem proteínas com peso molecular superior ou inferior.
Discussão e Conclusão:
Os resultados obtidos foram os esperados, mas existindo algumas
incorrecções. Estas podem ser devido a erros de medição durante a realização
do protocolo e erros de cálculos.
Os resultados obtidos na electroforese em gel de poliacrilamida,
apresentam, para além dos dados esperados, duas bandas que correspondem
a contaminantes e a GST em determinadas eluições. As bandas
correspondentes a contaminantes encontram-se nos resultados, pois podem
ter sido provocadas por uma cromatografia errada, tendo as eluições ficado
pouco purificadas. No caso das bandas referentes a GST, o seu aparecimento
deve-se à inexistência de inibidores de proteases, o que levou a que estas
clivassem algumas proteínas de fusão dividindo-as em GST e CTGluR.
A banda referente à proteína recombinante encontra-se na posição
esperada, visto que o peso molecular desta é de 30 kDa, e está posicionada
entre a banda de 25 e a de 37 kDa da solução padrão, no entanto não está
purificada como se pode deduzir pela existência de duas bandas em vez de
apenas uma.
Para corrigir alguns erros, podia-se ter efectuado o Western Blot. Neste
processo é utilizado um anticorpo anti-GST que se ligava a todas as proteínas
excepto aos contaminantes, por não possuírem GST. Com este processo
podia-se concluir se houve ou não falhas na purificação das proteínas.