Beruflich Dokumente
Kultur Dokumente
QBI
TEMA 1. Elementos Inorgnicos en los Sistemas Biolgicos: Introduccin. Papel de los iones
metlicos en los sistemas biolgicos. Clasificacin de las Metalobiomolculas. Molculas
Biolgicas que pueden actuar como ligandos: protenas, cidos nucleicos, otras biomolculas.
Bibliografa:
-Vallet Mara (coord.), Faus Juan, Garca-Espaa Enrique, Moratal Jos. Introduccin a la qumica bioionorgnica. Sntesis, 2003.
-Kaim, W., Schwederski, B., Bioinorganic Chemistry : Inorganic Elements in the Chemistry of Life an introduction and guide.
Chichester John Wiley 1995 (Reprinted with corrections)
T1.QBI
*Panormica de la Q. Bioinorgnica.
- El hecho de que en los seres vivos predominen bsicamente los elementos C, H, N y O, que son los elementos
fundamentales de la Q. ORGNICA, siempre cre, inconscientemente, la suposicin de que slo los
compuestos orgnicos eran esenciales a los seres vivos y que los elementos y compuestos comnmente
llamados "inorgnicos" tenan escasa o ninguna significacin para ellos.
- Durante mucho tiempo la Q.O. fue considerada exclusivamente como la QUMICA DE ORIGEN
BIOLGICO.
- Despus se llego a considerar a la BIOQUMICA (qumica en disolucin acuosa) como una parte
especializada de la Q.O.
- No obstante existan precedentes en la historia de la Qumica que ponan de manifiesto una relacin entre
los ORGANISMOS VIVOS y LOS ELEMENTOS Y COMPUESTOS TPICOS DE Q. INORGNICA:
- El fsforo blanco (P4) se obtuvo en 1669 a partir de la orina
- El K2CO3 conocido desde el siglo XVIII, se obtena a partir de cenizas de las plantas
- El Fe se conoca desde el siglo XVIII como necesario para la vida...
- El I2 se obtuvo en 1812 a partir de cenizas de algas marinas
T1.QBI
- A pesar de estos precedentes, la QUMICA INORGNICA no estuvo bien relacionada con la
BIOQUMICA hasta el ltimo tercio del siglo XX.
- Desde entonces se ha tomado conciencia cabal de que muchos otros elementos inorgnicos, presentes
generalmente como trazas, son absolutamente esenciales para todos los seres vivos.
La falta de tcnicas y mtodos adecuados para el estudio de trazas, no permiti descubrir hasta hace
relativamente poco tiempo la relacin entre elementos-traza y sus efectos biolgicos.
T1.QBI
- Desde aprox. 1960, por parte de bioqumicos y de qumicos inorgnicos, se ha ido manifestando a la
comunidad cientfica, que los conceptos y mtodos de estudio de la Q. INORGNICA pueden ser utilizados
para comprender los PROCESOS BIOLGICOS.
- De la misma forma que se puede aprender y desarrollar una nueva Q. INORGNICA, a partir del estudio
de la QUMICA DE LOS STMAS BIOLGICOS.
Como resultado de este parentesco surge una NUEVA DISCIPLINA que se denomina:
Q. BIOINORGNICA.
BIOINORGNICA: la misma palabra encierra una contradiccin semntica, ya que el prefijo bio significa
vida (biolgico), mientras que inorgnico significa lo no viviente.
rea de conocimiento que resulta del solapamiento entre la Q. Inorgnica y la Bioqumica.
T1.QBI
- En el ao 1971 se celebr el 1er SIMPOSIO INTERNACIONAL sobre esta materia que estuvo organizado
por la ACS (American Chemical Society): fecha oficial del nacimiento de la Bioinorgnica.
- Desde entonces esta rea ha tenido un desarrollo espectacular, constituyendo una de las reas de conocimiento
de mayor crecimiento en las ltimas dcadas.
- La Q. Bioinorgnica es una rama interdisciplinar de la Qumica que se ocupa de una amplia gama de
problemas ubicados en la interfase entre la Qumica y las Ciencias Biolgicas y que ha tenido un explosivo
auge y constante crecimiento en las ltimas dos dcadas, causando un profundo impacto en las Ciencias
Naturales.
El campo que abarca es particularmente interesante, amplio y complejo ya que a l concurren no slo ideas y
modelos bsicos de la Bioqumica y la Q. Inorgnica sino tambin de la Fisicoqumica, la Q. Orgnica, la
Medicina y las Ciencias Naturales en general.
T1.QBI
Q. Bioinorgnica:
- Estudio de los sistemas y compuestos inorgnicos presentes en tejidos y fluidos biolgicos.
- Estudio de sistemas y compuestos inorgnicos "modelos".
- Mediante los modelos se puede simular o reproducir, en forma parcial o total, el comportamiento qumico
de los sistemas naturales.
caractersticas estructurales,
electrnicas y qumicas del mismo.
T1.QBI
*Ejemplos de problemas de la Qumica moderna que podran ser abordados mediante el uso de sistemas
biomimticos (potencialmente la aparicin de buenos sistemas biomimticos podran solventar algunos de estos
problemas de la Qumica moderna):
- Eficiente captacin, conversin y almacenamiento de E (por ejemplo con el uso de sistemas biomimticos
de centros reaccionales fotosintticos: captura y transformacin de E luminosa en E qumica)
- Activacin cataltica de sustancias inertes, especialmente molculas pequeas como H2O, O2 y N2, bajo
condiciones suaves (oxidacin del H2O, activacin y reduccin del O2, N2) (PSII (Mn), Oxidasas (Fe, Cu),
Oxigenasas (Citocromo P450 (Fe)), Nitrogenasa (Mo))
- Sntesis estreo selectiva de sustancias de alto valor (en qumica fina, mejora del Rdt, disminucin de
subproductos) (Citocromo P450(Fe))
- Minimizacin de problemas en procesos de detoxificacin y/o reciclaje de sustancias o elementos qumicos
diversos.
(uso de catalizadores biomimeticos de metaloenzimas = quimica verde = agentes oxidantes ecolgicos)
T1.QBI
*Elementos Esenciales
En la actualidad se reconocen como ELEMENTOS ESENCIALES PARA LA VIDA aproximadamente 30
elementos del SP. Estos se han representado en la denominada Tabla Peridica de los Bioelementos.
T1.QBI
Elemento Esencial (EE)
- En la prctica se considera elemento esencial, aquel cuyo suministro insuficiente a un ser vivo produce
efectos patolgicos, efectos que se evitan o remedian con un suministro adecuado.
(El trmino EE se aplica a aquellos elementos del SP que son necesarios por lo menos para un amplio y
diverso tipo de organismos, ya sean microorganismos, plantas o animales)
G(I):
G(II):
1erST:
2ST:
3ST:
G(13):
G(14):
G(15):
G(16):
G(17):
H, Na, K
Mg, Ca
V, Cr, Mn, Fe, Co, Ni, Cu, Zn
Mo
W
B
- Los elementos C, H, N y O, que son los constituyentes bsicos y
C, Si
caractersticos de los compuestos orgnicos
N, P, As
- Todos los dems son elementos tpicamente "inorgnicos".
O, S, Se
F, Cl, Br, I
- Los EE son elementos ligeros. Slo hay tres de nmero atmico
mayor que 35, Mo (Z=42), I (Z=53) y W (Z=74).
T1.QBI
*Composicin elemental de un ser humano adulto de 70 Kg. de peso
ELEMENTOS
MAYORITARIOS
>98% peso
humano adulto
ELEMENTOS
TRAZA
T1.QBI
Los elementos mayoritarios representan prcticamente ms del 98% del peso humano adulto e incluyen,
adems de los cuatro elementos tpicos de la qumica orgnica C, H, O, N, a los elementos representativos Na,
K, Mg, Ca, Cl, S y P.
Nota: el Na no parece ser esencial para las plantas
En el segundo grupo se incluyen los llamados elementos traza cuyas concentraciones son sumamente
bajas; entre estos encontramos tres metales de transicin verdaderamente importantes, Fe, Zn y Cu.
En la tabla se pueden distinguir elementos no esenciales, tales como Rb, Zr, Sr, Ba, Al, Li que aparecen
tambin en la composicin elemental de un adulto humano.
(Estos elementos han sido incorporados probablemente por similitud qumica con otros elementos)
Elementos tales como As, Pb, Cd, conocidos por su toxicidad, en cantidades traza parece que
desempean alguna funcin fisiolgica, no siempre esencial.
T1.QBI
*Ideas Generales Acerca del Origen y la Especificidad de los Iones Metlicos en los Sistemas
Biolgicos (Abundancia, Asequibilidad y Esencialidad)
Por qu los seres vivos han seleccionado precisamente algunos elementos inorgnicos y no otros?
Por qu, por ejemplo, utilizan molibdeno (G6,2ST) y no wolframio (G3, 3ST) que es qumicamente muy
similar?
Por qu los tejidos duros se forman en base a fosfatos insolubles de calcio (G2) y no se utilizan los de
estroncio (G2) que son igualmente insolubles?
T1.QBI
T1.QBI
T1.QBI
T1.QBI
EXISTE UNA CLARA CORRELACIN ENTRE ABUNDANCIA Y ESENCIALIDAD.
Na, K, Mg, Ca, Fe son elementos muy abundantes y esenciales en los organismos vivos
Conclusin al respecto :
Los seres vivientes tratan de no hacerse dependientes de sistemas a los que tienen difcil acceso. Es decir, si
dos elementos resultan aptos para realizar una determinada funcin, los seres vivos elegirn, en primer
lugar, al ms abundante.
EXCEPCIONES:
-Si, Al, Ti son elementos muy abundantes que no parecen desempear ninguna funcin biolgica importante.
Por qu?
Posibilidad :
La insolubilidad de sus xidos puede constituir un factor limitante para su captacin y aprovechamiento.
En realidad, el Al, Si, Ti, bajo condiciones fisiolgicas (agua, pH 7) se encuentran en altos estados de
oxidacin formando xidos o hidrxidos insolubles, lo cual es un posible factor limitante para su captacin
y aprovechamiento
T1.QBI
-El Ti es un elemento muy abundante pero insoluble ya que se encuentra en forma de TiO2.
-El Al se encuentra en forma de aluminosilicatos muy insolubles.
Adems, en disolucin acuosa neutra no puede existir iones Al+3, ya que precipitan cuantitativamente como
Al(OH)3.
Este mismo problema debera afectar al Fe que se encuentra en la naturaleza como Fe2O3 insoluble. ???
La diferencia est en que el Fe, como MT que es, forma fcilmente complejos solubles, muy estables en
disolucin acuosa.
-Mo, por otro lado, no es muy abundante en la CT (54 en orden de abundancia) pero en forma de MoO42resulta muy soluble a pH 7 en el agua del mar; de aqu que este elemento sea raramente ms abundante en el
mar que en la tierra, resultando ms biodisponible que el W ([Mo] =10-2 mg/l, [W] = 10-4 mg/l).
La bioqumica del Mo es mucho ms extensa e importante que la del Cr, un elemento del mismo grupo del SP y
mucho ms abundante.
No es fcil entender como elementos tan poco abundantes como el I, Se o Mo han sido incorporados por los
organismos vivos como EE.
Posiblemente su qumica sea tan particular que no pueda ser sustituido por otro elemento ms abundante.
ADEMS, hay que tener en cuenta que:
-LA BIODISPONIBILIDAD DE LOS ELEMENTOS, AL CAMBIAR LA NATURALEZA QUMICA DE
LA SUPERFICIE TERRESTRE, PUEDE HABER CAMBIADO A LO LARGO DE LA EVOLUCIN.
T1.QBI
EVOLUCIN BIOLGICA EVOLUCIN GEOLGICA
T1.QBI
HAY QUE REMARCAR que debido a la creciente industrializacin de nuestro Mundo, se esta
produciendo un aumento continuo de contaminacin metlica, de tal forma que muchos elementos pesados
empiezan a adquirir, artificialmente, una concentracin elevada y en consecuencia, estos podran llegar a
competir con los elementos esenciales.
Podemos imaginar que a travs de los procesos evolutivos y de la adaptacin de los seres vivos al entorno,
muchos elementos han podido seguir, de alguna manera, la secuencia:
Elemento Txico
Impureza Tolerable
Elemento til
E. Esencial
Por eso no es descabellado suponer que a travs de este camino de adaptacin, otros nuevos elementos
lleguen a convertirse en esenciales.
T1.QBI
*Funciones Biolgicas de los Elementos Inorgnicos
En general los elementos inorgnicos se agrupan en varios grandes grupos segn las funciones que realizan:
(a) Funcin estructural
(b) Transporte de cargas
(c) Formacin, metabolismo y degradacin de compuestos orgnicos
(d) Transferencia de e(e) Activacin de molculas pequeas con alta simetra
(f) Reactividad organometlica
T1.QBI
(a) Funcin estructural:
-formacin de estructuras duras (endo/exo-esqueleto) va mineralizacin: BIOMINERALES
Ej. Huesos (Ca3(PO4)2)
-mantenimiento de la estructura de la doble hlice del DNA por mono y divalentes cationes capaces de
reducir las fuerzas de repulsin electrostticas entre las cargas negativas de los grupos fosfato de los nucletidos.
Ej. K+, Mg+2.
T1.QBI
(b) Transporte de cargas:
-Iones simples son utilizados como transportadores de carga, facilitando una rpida transferencia de
informacin a travs de las membranas biolgicas.
T1.QBI
(c) Formacin, metabolismo y degradacin de compuestos orgnicos en organismos que requieren catlisis
cida o bsica (funciones catalticas en reacciones cido-base)
Ej. Enzimas hidrolticas (Zn+2)
(hidrolasas, fosfatasas, sintetasas, isomerasas)
Carboxipeptidasas (Zn)
T1.QBI
(d) Transferencia de eDepende de la actividad redox del centro metlico.
(de gran importancia en procesos de conversin de Energa, pero no exclusivamente)
Ejs: iones metlicos con actividad redox:
FeII/FeIII
CuI/CuII
MnII/MnIII/MnIV
MoIV/MoV/MoVI
CoI/CoII/CoIII
NiI/NiII/NiIII
Ferredoxinas (clusters Fe/S)
Citocromos (hemoprotenas)
T1.QBI
(e) Activacin de molculas pequeas con alta simetra (molculas con altas Energas de enlace que
generalmente requieren la presencia de un catalizador para ser activadas).
Se realiza gracias a la capacidad que tienen los Metales de Transicin para aceptar y donar
simultneamente carga electrnica (enlace por retrodonacin)
- Activacin, transporte, acumulacin, conversin y/o generacin de 3O2 paramagntico (2S+1=3, S=1(1/2 +
1/2))
Cit P450: Fe hemo
Hemocianina: Cu
PSII: Mn
- Fijacin de nitrgeno molecular N2 y su conversin en NH3
Nitrogenasas: Fe/Mo/V
- Reduccin del CO2 con hidrgeno y formacin de CH4
Metano monooxigenasa (MMO) : Ni, Fe
T1.QBI
(f) Reactividad organometlica:
Fcil generacin de radicales para la rpida reorganizacin de molculas de sustrato
T1.QBI
-Desencadenate de procesos
-Transmisor de informacin
FTG
Vit B12
T1.QBI
*Clasificacin de las Metalobiomolculas
(En trminos de las diferentes funciones que realizan)
METALOBIOMOLECULAS
NO PROTEICAS
PROTEICAS
ENZIMAS
PROTENAS DE
TRANSPORTE Y/O
ACUMULACIN
- Oxidorreductasa (Clase I)
- Transferasas (Clase II)
- Hidrolasas (Clase III)
- Liasas (Clase IV)
- Isomerasas (Clase V)
- Ligasas (ClaseVI)
- Funciones Estructurales
- Captacin de Metales
- Sistemas de Control y Regulacin
- Sistemas Fotoqumicos
T1.QBI
ENZIMAS (clasificacin por clases segn la Comisin de Enzimas (CE) de la Unin
Internacional de Bioqumica y Biologa Molecular (IUBMB))
- Oxidorreductasa (Clase I)
- Transferasas (Clase II)
- Hidrolasas (Clase III)
- Liasas (Clase IV)
- Isomerasas (Clase V)
- Ligasas (ClaseVI)
T1.QBI
I. Oxidorreductasas: catalizan reacciones redox
Algunos Ejemplos:
- Oxidasas (Fe, Cu, Mo). Catalizn la oxidacin de un sustrato pero sin la incorporacin de
tomos de oxgeno. El sustrato pierde e- y el oxgeno es el aceptor final de estos e-.
T1.QBI
II. Transferasas: catalizan procesos de transferencia de grupos funcionales de una molcula a otra.
HOOC-CH2-CH2-CH(NH2)-COOH HOOC-(CH3)CH-CH(NH2)-COOH
T1.QBI
III. Hidrolasas: estn implicadas en catlisis de procesos hidrolticos (catalizan rupturas
hidrolticas).
- Carboxipeptidasas (Zn)
T1.QBI
IV. Liasas: llevan a cabo la catlisis de reacciones de adicin de grupos a dobles enlaces o la
formacin de stos por eliminacin de grupos .
- Anhidrasa carbnica (Zn)
CO2 + H2O HCO3V. Isomerasas: implicadas en la transferencia intermolecular de grupos para generar ismeros (catalizan
reordenamientos intramoleculares)
CH2OH
OH
O
OH
OH
OH
OH
OH
CH2OH
OH
VI. Ligasas: catalizan la formacin de enlaces C-C, C-O, C-N y C-S por condensacin acoplada con
consumo de ATP (catalizan reacciones en las que se unen dos molculas)
- Metionil-RNA sintetasa (Zn)
T1.QBI
PROTENAS DE TRANSPORTE Y ACUMULACIN
- Transporte de electrones:
- Citocromos (Fe-hemo)
- Protenas Fe-S: rubredoxinas y ferredoxinas
- Protenas azules de cobre
T1.QBI
PROTENAS DE TRANSPORTE Y ACUMULACIN
- Transporte de electrones:
- Citocromos (Fe-hemo)
- Protenas Fe-S: rubredoxinas y ferredoxinas
- Protenas azules de cobre
T1.QBI
T1.QBI
PROTENAS DE TRANSPORTE Y ACUMULACIN
T1.QBI
Molculas pequeas tipo Dinucletido de Nicotinamida y Adenina: NAD+/NADH
(agente redox de 2e-)
T1.QBI
Nicotinamide Adenine Dinucleotide Structure
T1.QBI
PROTENAS DE TRANSPORTE Y ACUMULACIN
- Transporte y acumulacin de metales:
- Ferritina (almacenamiento de Fe)
- Ceruloplasmina (protena plasmtica transportadora de Cu)
- Transferrina (transporte de Fe)
T1.QBI
PROTENAS DE TRANSPORTE Y ACUMULACIN
- Transporte y acumulacin de metales:
- Ferritina (almacenamiento de Fe)
- Ceruloplasmina (protena plasmtica transportadora de Cu)
- Transferrina (transporte de Fe)
T1.QBI
Ceruloplasmina (oxidasa polinuclear de Cu):protena azul-cielo del plasma
Tipo 1
Met-690
His-637
S
N
Cu
His-685
Cys-680
His-1026
His-975
Tipo 1
Cu
S
S
Met-1031
Cys-1021
His-978
Estructura de la Ceruloplasmina
humana (PDB: 1KCW)
Multifuncional:
S Cys-319
-transporte de Cu
Tipo 1
Cu
-ferroxidasa (FeIIFeIII)
His-324
-antioxidante(eliminacin R)
N
N
-aminooxidasa (controlando [aminas plasma])His-276
His-1022
N
His-103
His-101
Cu
N
Cu
His-161
Tipo 3
His-163
Tipo 2
Cu
O
N
His-1020
N His-980
T1.QBI
Ceruloplasmina (oxidasa polinuclear de Cu):protena azul-cielo del plasma
Enfermedad de Wilson
(hereditaria 1/100.000 nacimientos)
Estructura de la Ceruloplasmina
humana (PDB: 1KCW)
Multifuncional:
-transporte de Cu
-ferroxidasa (FeIIFeIII)
-antioxidante(eliminacin R)
-aminooxidasa (controlando [aminas plasma])
TRATAMIENTO
QUELATOTERAPIA
H2N(CH2)2NH(CH2)2NH(CH2)2NH2
T1.QBI
PROTENAS DE TRANSPORTE Y ACUMULACIN
- Transporte y acumulacin de metales:
- Ferritina (almacenamiento de Fe)
- Ceruloplasmina (protena plasmtica transportadora de Cu)
- Transferrina (transporte de Fe)
T1.QBI
PROTENAS DE TRANSPORTE Y ACUMULACIN
- Transporte y activacin de O2:
- Mioglobina (Fe-hemo)
- Hemoglobina (Fe-hemo)
- Hemeritrina (Fe-no hemo, en organismos marinos primitivos)
- Hemocianina (Cu, en artrpodos y moluscos)
T1.QBI
PROTENAS DE TRANSPORTE Y ACUMULACIN
- Transporte y activacin de O2:
- Mioglobina (Fe-hemo)
- Hemoglobina (Fe-hemo)
- Hemeritrina (Fe-no hemo, en organismos marinos primitivos)
- Hemocianina (Cu, en artrpodos y moluscos)
T1.QBI
PROTENAS DE TRANSPORTE Y ACUMULACIN
- Transporte y activacin de O2:
- Mioglobina (Fe-hemo)
- Hemoglobina (Fe-hemo)
- Hemeritrina (Fe-no hemo, en organismos marinos primitivos)
- Hemocianina (Cu, en artrpodos y moluscos)
T1.QBI
PROTENAS DE TRANSPORTE Y ACUMULACIN
-Transporte y activacin de O2:
- Mioglobina (Fe-hemo)
- Hemoglobina (Fe-hemo)
- Hemeritrina (Fe-no hemo, en organismos marinos primitivos)
- Hemocianina (Cu, en artrpodos y moluscos)
T1.QBI
BIOMOLCULAS Cu BIOMOLCULAS Fe
FUERTE PARALELISMO EN FUNCIONES:
-Metabolismo del O2(oxidasas-oxigenasas)
-Transporte de O2(hemocianina/hemoglobina)
-Transferencia de e-(citocromos/plastocianinas)
Cu Fe
Fe Cu????
T1.QBI
EVOLUCIN BIOMOLCULAS:
Edad del Fe Edad del Cu-Fe
Fe-Cu :
EL Cu NO DESPLAZA AL Fe EN SUS
FUNCIONES PREESTABLECIDAS
EL Fe: FUNCIONES INT. CLULA
EL Cu: FUNCIONES EXT. CLULA
Fe/Cu SE COMPLEMENTAN,
INCLUSO EN OCASIONES
COLABORAN (ej: Ceruloplasmina)
T1.QBI
NO PROTICAS
- Funciones estructurales:
- Ca3(PO4)2 (en estructuras seas de organismos superiores)
-CaCO3, SiO2 (formacin de tejidos duros)
T1.QBI
NO PROTICAS
- Captacin de metales (transporte y acumulacin):
- Sideroforos (captacin de Fe en microorganismos; los sideroforos son molculas de bajo
peso molecular con gran capacidad ligante, forman fcilmente complejos, ej. catecolatos)
T1.QBI
NO PROTICAS
- Sistemas de control y regulacin
- Fundamentalmente cationes alcalinos y alcalinotrreos: control de presin osmtica,
contraccin muscular, transmisin del impulso nervioso.
T1.QBI
NO PROTICAS
- Sistemas de control y regulacin
- Fundamentalmente cationes alcalinos y alcalinotrreos: control de presin osmtica,
contraccin muscular, transmisin del impulso nervioso.
T1.QBI
NO PROTICAS
-Sistemas fotoqumicos
-Clorofilas (Mg)
-PSII (Mg, Mn)