Beruflich Dokumente
Kultur Dokumente
ARTICLE IN PRESS
REVISIN
PALABRAS CLAVE
Diagnstico de
laboratorio;
Enfermedades
metablicas
hereditarias;
Espectrometra de
masas;
Anlisis de
mutaciones;
Secuenciacin masiva
KEYWORDS
Laboratory diagnosis;
Inherited metabolic
diseases;
Mass spectrometry;
Mutation analysis;
Next generation
sequencing
http://dx.doi.org/10.1016/j.labcli.2015.01.002
1888-4008/ 2014 AEBM, AEFA y SEQC. Publicado por Elsevier Espaa, S.L.U. Todos los derechos reservados.
Cmo citar este artculo: Prez-Cerd C, Prez B. El laboratorio en el diagnstico de las enfermedades metablicas
hereditarias. Impacto de las nuevas tecnologas. Rev Lab Clin. 2015. http://dx.doi.org/10.1016/j.labcli.2015.01.002
+Model
LABCLI-241; No. of Pages 15
ARTICLE IN PRESS
C. Prez-Cerd, B. Prez
It is in the area of identication of metabolites (mass spectrometry) and mutation detection
(massive sequencing) where the impact of new technology in recent years has been spectacular, which facilitated rapid diagnosis with minimally invasive tests and will facilitate future
population screening.
2014 AEBM, AEFA y SEQC. Published by Elsevier Espaa, S.L.U. All rights reserved.
Introduccin
Las enfermedades metablicas hereditarias (EMH) son
enfermedades mendelianas (www.ncbi.nlm.nih.gov/Omim/
mimstats.html), que agrupan a un colectivo de ms de 600
patologas diferentes clasicadas en funcin de la va metablica alterada y su patognesis. La mayor parte cumplen
el criterio de enfermedad rara segn la denicin de la
Unin Europea: enfermedades raras, minoritarias, hurfanas o enfermedades poco frecuentes, incluidas las de origen
gentico, son aquellas enfermedades con peligro de muerte
o de invalidez crnica que tienen una prevalencia menor
de 5 casos por cada 10.000 habitantes. Aunque individualmente son poco frecuentes, colectivamente son numerosas,
contribuyendo de una forma muy signicativa al nmero
total de enfermos en la sociedad.
Las EMH se denen como trastornos genticamente
determinados en la sntesis y/o funcin de molculas proteicas. Gran parte de estas protenas son enzimas cuyo defecto
da lugar a un bloqueo en la va metablica implicada y la
consiguiente acumulacin en uidos corporales del sustrato
de la reaccin y otros metabolitos derivados. Este aumento
no siolgico de estos compuestos, en muchos casos txicos, as como la disminucin del producto de la reaccin,
estn implicados en los mecanismos siopatolgicos de la
enfermedad1 .
La mayora se heredan de forma autosmica recesiva,
alrededor del 20% tienen herencia autosmica dominante,
el 10% una herencia ligada al cromosoma X y una parte
importante de las denominadas enfermedades mitocondriales tienen una herencia materna ya que afectan al ADN
mitocondrial.
Recientemente, la Society for the Study of Inborn Errors
of Metabolism ha elaborado una clasicacin de los EMH,
agrupando las enfermedades en 15 grandes grupos, segn
afecten a molculas sencillas del metabolismo intermediario o energtico o a molculas complejas localizadas en
diferentes organelas celulares (tabla 1)2 .
Cmo citar este artculo: Prez-Cerd C, Prez B. El laboratorio en el diagnstico de las enfermedades metablicas
hereditarias. Impacto de las nuevas tecnologas. Rev Lab Clin. 2015. http://dx.doi.org/10.1016/j.labcli.2015.01.002
+Model
LABCLI-241; No. of Pages 15
ARTICLE IN PRESS
Clasicacin de las EMHs segn la SSIEM y enumeracin de las ms frecuentes o conocidas en cada grupo
Grupo de enfermedad
Enfermedad
GEN
OMIMGEN
Fenilcetonuria
Enfermedad de la orina con olor a jarabe de
arce
Tirosinemia tipo 1
Homocistinuria
Def. ornitinatranscarbamilasa
Citrulinemia
Hiperglicinemia no cetsica
Cistinuria
Aciduriaglutrica
Aciduriaisovalrica
Aciduriametilmalnica
Aciduriapropinica
Galactosemia clsica
Acidosis lctica congnita por def. de
piruvatocarboxilasa
Def. fructosa 1,6 difosfatasa
Glucogenosis tipo Ia (Von Gierke)
Glucogenosis tipo V (McArdle)
PAH
BCKDHA, BCKDHB
261600
248600
FAH
CBS
OTC
ASS
GLDC
SLC3A1, SLC7A9
GCDH
IVD
MUT
PCCA, PCCB
GALT
276700
236200
311250
215700
238300
220100
231670
243500
251000
232000
230400
PC
FBP1
G6PC
PYGM
CPT2
ACADM
266150
229700
232200
232600
255110
201450
ACADVL
201475
HADHA, HADHB
HMGCS2
ACAT1
PDHA1
143450
600234
100678
312170
DelecionesADNmt
MutionesADNmt
SUCLA2
530000
540000
612073
256000
ACAD9
ETFHE1
SLC6A8
HPRT
ADSL
XDH
UMPS
DPYD
TYMP
DHCR7
CYP27A1
HMBS
UROD
FECH
APOA5,LIPI
ABCA
ALDH3A2
PMM2
MPI
EXT1/2
ATP6V0A2
611126
602473
300352
308000
103050
278300
258900
274270
131222
270400
213700
176000
176100
177000
238600
205400
270200
601785
602579
133701
611716
Def. de carnitinapalmitoiltransferasa 2
Def. acilCoA deshidrogenasa de cadena
media
Def. acilCoA deshidrogenasa de cadena muy
larga
Def. de protena trifuncional mitocondrial
Aciduria 3-hidroxi-3-metilglutrica
Def. de beta-cetotiolasa
Def. del complejo piruvato deshidrogenasa
E1
Sndrome de Kearns-Sayre
Sndrome de Melas
Aciduriametilmalnica con
encefalomiopata
Sndrome de Leigh
Def. de complejo I de cadena respiratoria
con respuesta a riboavina
Aciduriaetilmalnica con encefalopata
Def. del transportador de creatina cerebral
Enfermedad de Lesch-Nyhan
Def. de adenilosuccinatoliasa
Xantinuria
Aciduriaortica
Def. de dihidropirimidina deshidrogenasa
Def. de timidinafosforilasa (MNGIE)
Sndrome de Smith---Lemli-Opitz
Xantomatosis cerebrotendinosa
Porria aguda intermitente
Porria cutnea parda
Protoporriaeritopoytica
Hipertrigliceridemia familiar
Enfermedad de Tangier
Sndrome de Sjogren-Larsson
Def. de fosfomanomutasa
Def. de fosfomanoisomerasa
Exostosis mltiple tipoI/II
Cutis laxa por dcit de ATPasa V
Cmo citar este artculo: Prez-Cerd C, Prez B. El laboratorio en el diagnstico de las enfermedades metablicas
hereditarias. Impacto de las nuevas tecnologas. Rev Lab Clin. 2015. http://dx.doi.org/10.1016/j.labcli.2015.01.002
+Model
LABCLI-241; No. of Pages 15
ARTICLE IN PRESS
C. Prez-Cerd, B. Prez
Tabla 1 (continuacin)
Grupo de enfermedad
Enfermedad
GEN
OMIMGEN
10.-Enfermedades lisosomales
Enfermedad de Sanlippo A
Enfermedad de Morquio A
-Manosidosis
Enfermedad de Gaucher
Enfermedad de Fabry
Enfermedad de Krabe
Enfermedad de Niemann-Pick A o B
Cistinosis
Enfermedad de Wolman
Enfermedad de Pompe
Adrenoleucodistroa ligada al X
Sndrome de Zelweger
Condrodisplasia rizomlicapunctata tipo 1
Enfermedad de Refsum
Def. de tirosina hidroxilasa
Def. de succnico semialdehido
deshidrogenasa
Malabsorcin hereditaria de folato
Def. de metilentetrahidrofolatoreductasa
Aciduriametilmalnica con homocistinuria
SGSH
GALNS
MAN2B1
GBA
GLA
GALC
SMPD1
CTNS
LIPA
GAA
ABCD1
PEX1 y otros
PEX7
PHYH
TH
ALDH5A1
252099
253000
248500
230800
301500
245200
257200
219800
278000
232300
300100
214100
215100
266500
191290
271980
SLC46A1
MTHFR
MMACHC
MMADHC
SLC19A2
229050
236250
277400
277410
249270
BTD
ALDH7A1
MOCS1
GCH1
ATP7A
ATP7B
HFE
FMO3
253260
266100
603707
233910
309400
277900
235200
602079
11.-Enfermedades peroxisomales
la separacin de metabolitos segn sus propiedades fsicoqumicas. Se hace pasar las molculas a travs de una
columna cromatogrca (fase estacionaria) bombeadas por
un lquido o solvente (fase mvil) aplicando presin alta. El
metabolito se identica segn su tiempo de retencin y se
detecta y cuantica con distintos detectores. La deteccin
electroqumica se utiliza en el anlisis de neurotransmisores
en LCR5 , para el diagnstico de, p.ej., las distonas con respuesta a dopa por defectos de tirosina hidroxilasa (sndrome
de Segawa) o GTP ciclohidrolasa, que cursan con disminucin de cido homovanlico y/o cido hidroxiindolactico.
Con el detector de uorescencia se mide la homocistena6
y las pterinas7 , estos ltimos metabolitos alterados en las
hiperfenilalaninemias por defectos en la sntesis y regeneracin del cofactor BH4 de la fenilalanina hidroxilasa. Para la
cuanticacin de purinas y pirimidinas se utiliza el detector
diodearray (UV/visible)8 (g. 1B).
La cromatografa de gases (gas chromatography [GC]) es
la tcnica de excelencia utilizada desde hace dcadas para
el anlisis de cidos orgnicos, molculas en general voltiles de bajo peso molecular. En este caso, previamente
al anlisis en el cromatgrafo, las molculas se derivatizan (habitualmente se forman trimetilsilil-derivados), y la
Cmo citar este artculo: Prez-Cerd C, Prez B. El laboratorio en el diagnstico de las enfermedades metablicas
hereditarias. Impacto de las nuevas tecnologas. Rev Lab Clin. 2015. http://dx.doi.org/10.1016/j.labcli.2015.01.002
+Model
LABCLI-241; No. of Pages 15
ARTICLE IN PRESS
Tipo de muestra, estudios bioqumicos bsicos y especcos (metabolitos) y tcnica utilizada en el diagnstico de EMH
Tipo de muestra
Estudios bsicos
Estudios especcos
Tcnica
Enfermedades
Sangre entera
(EDTA o
heparina)
Conservar a ta
ambiente
Plasma
Conservar a -20a
Suero
Conservar -20 C
Eritrocitos
Conservar a
-20 C
Hemograma
Gases y
electrolitos
Anin Gap
Glucosa
Calcio, fosfato,
magnesio
Transaminasas, CK
Coagulacin
Colesterol
Triglicridos, c.
rico
Lactato/piruvato
Cuerpos cetnicos
Aminocidos
CIO
Amioacidopatas
cidos grasos de
cadena muy larga
cidos tnico y
pristnico
Esteroles
Plasmalgenos
eritrocitarios
Carnitina y
acilcarnitinas
GC/SIM/MS
Enfermedades peroxisomales
GC/SIM/MS
Enfermedades peroxisomales
GC/SIM/MS
GC/FID
ESI-MS/MS
Orina
Aleatoria
o fraccin de
24 h
Conservar a
-20 C
Olor y color
especial
Glucosa
cuerpos
reductores
(clinitest)
Cuerpo cetnicos
(comburtest)
Sultos (sultest)
pH
Urea
cido rico
creatinina
c. pipeclico
HPLC/ESI-MS/MS
Coenzima Q
HPLC/APCI-MS/MS
Homocistena
HPLC
Catecolaminas
HPLC
Piridoxal-P
HPLC
Tiamina y steres en
sangre entera
Galactosa
Galactosa-1-P
eritrocitaria
Isoformas de
transferrina (% CDT)
Isoformas de ApoC3
HPLC
Defectos -oxidacin
mitocondrial de cidos gasos.
Acidurias orgnicas
Enfermedades peroxisomales y
epilepsia dependiente de
piridoxina
Defectos biosntesis de CoQ y
enfermedades mitocondriales
Homocistinurias y defectos
metabolismo folato
Defectos metabolismo aminas
bigenas
Epilepsia dependiente de
piridoxina y de piridoxal-P
Defectos metabolismo tiamina
Espectrofotomtrico
Espectrofotomtrico
Galactosemias
Galactosemias
IEF y HPLC
Defectos N-glicosilacin
protenas
Defectos O-glicosilacin
protenas
Aminoacidopatas
Aminocidos
IEF
CIO
Cmo citar este artculo: Prez-Cerd C, Prez B. El laboratorio en el diagnstico de las enfermedades metablicas
hereditarias. Impacto de las nuevas tecnologas. Rev Lab Clin. 2015. http://dx.doi.org/10.1016/j.labcli.2015.01.002
+Model
LABCLI-241; No. of Pages 15
ARTICLE IN PRESS
C. Prez-Cerd, B. Prez
Tabla 2 (continuacin)
Tipo de muestra
LCR
Conservar -20 C
Estudios bsicos
Glucosa
Lactato/piruvato
Estudios especcos
Tcnica
Enfermedades
c. orgnicos
Succinilacetona
Galactitol y
galactonato
c biliares
GC/MS
GC/MS
GC/MS
Acidurias orgnicas
Tirosinemia tipo 1
Galactosemias
ESI-MS/MS
Trimetilamina
Guanidinoacetato y
creatina
D,L 2-OHglutarato
cido
alfa-aminoadpico
semialdehido
Oligosacridos
c ortico y orotidina
Purinas y pirimidinas
ESI-MS/MS
ESI-MS/MS
HPLC/ESI-MS/MS
HPLC/ESI-MS/MS
Aciduria 2-OHglutricas
Epilepsia dependiente de
piridoxina
ESI-MS/MS
HPLC
HPLC
Oligosacaridurias
Defectos ciclo de la urea
Defectos metabolismo purinas
y pirimidinas
Defectos metabolismo BH4
Defecto fructosa 1,6
difosfatasa
Mucopolisacaridosis
Aminoacidopatas
Pterinas
Glicerol-P
HPLC
GC-SIM-MS
Glucosaminoglicanos
Aminocidos
Espectrofotomtrico
IEC
Piridoxal-P
HPLC
Neurotrasmisores
HPLC
Pterinas
HPLC
Epilepsia dependiente de
piridoxina y de piridoxal-P
Defectos de la
neurotransmisin cerebral
Defectos metabolismo BH4 y de
la neurotransmisin cerebral
Aunque las espectrometra de masas aplicada al diagnstico de EMH se empez a desarrollar en los a
nos sesenta del
siglo XX, ha sido a partir de la dcada de los 90 cuando hubo
un avance extraordinario en el desarrollo de nuevas aplicaciones para el anlisis de compuestos polares no voltiles
de menor o mayor tama
no de forma rpida, utilizando poca
cantidad de muestra e incluso en muestra de sangre y orina
en papel, con apenas manipulacin previa11 . La combinacin del sistema de ionizacin de electrospray (electrospray
ionization [ESI]) con la espectrometra de masas en tndem
(ESI-MS/MS) es la utilizada para la medida de la concentracin de acilcarnitinas (g. 1D) y otros metabolitos. La
separacin de ismeros de acilcarnitinas o de cidos orgnicos requiere una separacin previa por cromatografa lquida
(HPLC-ESI/MS/MS)12 . Otro sistema de ionizacin utilizado es
la ionizacin qumica a presin atmosfrica (atmospheric
pressure chemical ionization [APCI]) que en combinacin con
la cromatografa lquida (HPLC/APCI/MS/MS) se utiliza para
medir el coenzima Q1013 . Para el anlisis de molculas ms
grandes como pptidos, protenas o glicoprotenas se han
desarrollado otras tcnicas como, por ejemplo, la que utiliza
el sistema de ionizacin por desorcin mediante lser asistida por matriz (matrix-assisted laser desorption/ionization
[MALDI]) junto con el analizador de tiempo de vuelo (time
of ight [TOF]): MALDI/TOF/MS/MS, en el diagnstico de
Cmo citar este artculo: Prez-Cerd C, Prez B. El laboratorio en el diagnstico de las enfermedades metablicas
hereditarias. Impacto de las nuevas tecnologas. Rev Lab Clin. 2015. http://dx.doi.org/10.1016/j.labcli.2015.01.002
+Model
ARTICLE IN PRESS
A
500
CIO de aminocidos
HPLC de purinas
450
Absorbance (mAU)
Leu
400
MSUD
350
Control
300
Val
250
Ile
alle
0
400
150
100
50
Control
Time (min)
30
Time (min)
30
0
0
S-Ado
Def.ADSL
Absorbance (mAU)
200
SAICAr
400
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
Aciduria isovalrica
C0
LC-MS/MS de acilcarnitinas
IVG
Aciduria propinica
MADD
MC
C10
C4
PG
3OHP
C6
C8
C5
3OHIVA
C12
2OHIVA
C0
73
73
Espectro de masas
MC
Espectro de masas
IVG
102
C8
288
MCADD
287
147
147
130
176
261
57
361
221
389 419
479
303
C6
C10:1
333
Figura 1 Ejemplos de cromatogramas diagnsticos de diferentes EMH. A) Cromatograma de aminocidos en plasma por CIO de un
paciente de jarabe de arce (MSUD), se observa el aumento de los aminocidos marcadores de la enfermedad valina (Val), aloisoleucina (aIle), isoleucina (Ile) y leucina (Leu). B) Cromatograma de purinas en lquido cefaloraqudeo (LCR) por HPLC de un paciente
con deciencia en adenilosuccinato liasa (ADSL), se observa el aumento de los metabolitos diagnsticos succinilaminoimidazol
carboxamida ribsido (SAICAr) y succiniladenosina (S-ado). C) Cromatogramas y espectros de masas de cidos orgnicos en orina
por GC-MS de una aciduria propinica, se observan los biomarcadores cidos 3-hidroxipropinico (3 OHP) y metilctrico (MC) y la
propionilglicina (PG) y el espectro de masas del MC; y de una aciduria isovalrica, se observan los metabolitos marcadores cidos
2-hidroxiisovalrico (2 OHIVA) y 3-hidroxiisovalrico (3 OHIVA) e isovalerilglicina (IVG) y el espectro de masas de la IVG. D) Espectros
de masas de acilcarnitinas en plasma por ESI-MS/MS de una deciencia mltiple de acilCoA deshidrogenasa (MADD), se observa el
perl con aumentos de butirilcarnitina (C4), isovalerilcarnitina (C5), hexanoilcarnitina (C6), octanoilcarnitina (C8), hexanoilcarnitina (C6), decanoilcarnitina (C10) y dodecanoilcarnitina (C12); y de una deciencia de acilCoA deshidrogenasa de cadena media
(MCADD), con aumentos de C6, C8 y decenoilcarnitina (C10:1).
gentico o bien cuando no existen metabolitos biomarcadores de la enfermedad. Para el estudio de la funcin proteica
se necesitan clulas (linfocitos, broblastos de piel cultivados a partir de una biopsia de piel, eritrocitos, linfoblastos) o
tejidos (biopsia heptica, muscular etc.). La actividad enzimtica suele medirse incubando con el sustrato del enzima
para medir disminucin de sustrato o aparicin de producto
por tcnicas espectrofotomtricas o radiactivas. As se conrma la actividad propionilCoA carboxilasa deciente en
pacientes con aciduria propinica, utilizando 14 CO3 H, uno
de los sustratos de la carboxilacin del metilmalonilCoA17 .
Las clulas cultivadas, fundamentalmente broblastos de
piel y linfoblastos, permiten realizar ensayos in vitro (incorporacin de aminocidos, oxidacin de sustratos), para
determinar la funcin de una va metablica completa,
Cmo citar este artculo: Prez-Cerd C, Prez B. El laboratorio en el diagnstico de las enfermedades metablicas
hereditarias. Impacto de las nuevas tecnologas. Rev Lab Clin. 2015. http://dx.doi.org/10.1016/j.labcli.2015.01.002
+Model
ARTICLE IN PRESS
C. Prez-Cerd, B. Prez
Control
Control
Control
PMM2-CDG
0,0090
0,0080
0,0070
0,0060
0,0050
0,0040
0,0030
0,0020
0,0010
T4
0,0
1,0
3,0
4,09
3,47
2,0
5,78
T5
T2
T0
1,92
Volts
4,0
5,0
6,0
T5
T4
7,0
T3
Time (min.)
4,77
T1
T0
T4
0,0120
0,0110
5,50
T2
2,98
T0
3,92
Volts
0,0130
1,62
T2
Tipo 1
PMM2-CDG
0,0140
0,0100
0,0090
0,0
1,0
2,0
3,0
4,0
5,0
6,0
Time (min.)
T4
0,00300
0,00225
0,0
1,0
2,0
4,28
3,53
2,48
T0
T3
T2
T1
3,0
DSA
5,84
Tipo 2:
PGM-CDG
5,20
0,00675
0,00600
0,00525
0,00450
0,00375
1,75
Volts
Control
MSA
ASA
4,0
5,0
6,0
7,0
Time (min.)
nucletidos del ADN mediante un proceso llamado transcripcin genera una cadena de ARN, que se procesa (splicing)
para dar lugar al ARN mensajero (ARNm), que se traduce
(proceso de traduccin) en la secuencia de aminocidos de
la protena. Finalmente, la protena es sometida a una serie
de modicaciones postraducionales (fosforilacin, glicosilacin, etc.) para ser plenamente funcional.
Bsicamente, el diagnstico gentico consiste en buscar
mutaciones potencialmente patognicas del gen afectado en material gentico (ADN o ARN) del paciente. La
muestra a analizar puede ser sangre con anticoagulante
(EDTA), sangre seca impregnada en papel de ltro, tejidos
como biopsia de hgado o muscular, broblastos de piel
cultivados, biopsia corial o amniocitos para los estudios prenatales, etc. . . Las mutaciones pueden afectar a secuencias
reguladoras alterando su expresin, secuencias exnicas,
alterando la secuencia de aminocidos de la protena que
codica, o a regiones intrnicas, que en general afectan al procesamiento (splicing) del ARNm. En la secuencia
nucleotdica puede haber mutaciones puntuales que afectan
a un solo nucletido, deleciones o inserciones que afectan a
Cmo citar este artculo: Prez-Cerd C, Prez B. El laboratorio en el diagnstico de las enfermedades metablicas
hereditarias. Impacto de las nuevas tecnologas. Rev Lab Clin. 2015. http://dx.doi.org/10.1016/j.labcli.2015.01.002
+Model
LABCLI-241; No. of Pages 15
ARTICLE IN PRESS
Efecto en la protena
De cambio de sentido (missense)
p.Gly631Arg
Sin sentido (nonsense)
p.Arg313Ter
Insercin/duplicacin
p.Leu308Phefs*35
Delecin
p.His140Leufs*44
Mutacin en el procesamiento de ARNm
(splicing)
p.Val681 Thr706del26
p.Thr62 Ser100del39
p.Val429Phefs*6
Gran delecin
p.Val681 Thr706del26
Cambio nucleotdico
c.1891G>C
c.937C>T
c.923dupT
c.419delA
Ejemplos de mutaciones descritas en el gen PCCA (NM NM 000282.3), que causan aciduriapropinica.
Cmo citar este artculo: Prez-Cerd C, Prez B. El laboratorio en el diagnstico de las enfermedades metablicas
hereditarias. Impacto de las nuevas tecnologas. Rev Lab Clin. 2015. http://dx.doi.org/10.1016/j.labcli.2015.01.002
+Model
LABCLI-241; No. of Pages 15
ARTICLE IN PRESS
10
C. Prez-Cerd, B. Prez
c.483_484insT/wt
wt/c.373-?_543+?
c.483_484insT/c.373-?_543+?
150
160
Array CGH
Gen
PCCB
p.Pro113Leu/?
wt/wt
p.Pro113Leu/p.Pro113Leu
PMM2
(g.8788823-8849331)
rs12448572
(g.17980843)
D16S3395
D16S3134
D16S513
D16S3087
D16S407
D16S2613
D16S3114
D16S3131
D16S753
1
3
1
1
4
2
1
1
1
1
1
2
1
1
1
1
1
2
4
3
2
1
3
2
1
3
2
1
1
1
1
1
2
1
3
2
1/2
2/5
2/2
1/1
2/3
1/3
2/3
1/2
1/3
Figura 3 A) Secuenciacin convencional Sanger del exn 5 del gen PCCB de una muestra de ADN de un paciente con acidemia
propinica. Se observa la insercin de una T entre las posiciones 483 y 484 del cDNA en homocigosis que dar lugar a un cambio
en la fase de lectura y a la aparicin de un codn de terminacin prematura. Esta mutacin se encuentra en el alelo materno.
B) El anlisis de la segregacin mendeliana evidenci la posible presencia de una delecin que fue detectada en el alelo paterno
mediante hibridacin genmica comparada (aCGH metaboloarray). Se observa una delecin de 12,6 Mb, se indican las coordenadas
genmicas, en el cromosoma 3 que incluye parte del gen PCCB. C) Deteccin de una isodisoma uniparental segmental materna
de la regin del cromosoma 16 donde se localiza el gen PMM2, en un paciente con un defecto congnito de glicosilacin. En el
array de SNP se observa la prdida de heterozigosidad que se conrma mediante el estudio de microsatlites, lo que resulta en la
homocigosidad para la mutacin patognica p.Pro113Leu en el caso del ndice, siendo el padre no portador de la misma.
Cmo citar este artculo: Prez-Cerd C, Prez B. El laboratorio en el diagnstico de las enfermedades metablicas
hereditarias. Impacto de las nuevas tecnologas. Rev Lab Clin. 2015. http://dx.doi.org/10.1016/j.labcli.2015.01.002
+Model
LABCLI-241; No. of Pages 15
ARTICLE IN PRESS
11
Cmo citar este artculo: Prez-Cerd C, Prez B. El laboratorio en el diagnstico de las enfermedades metablicas
hereditarias. Impacto de las nuevas tecnologas. Rev Lab Clin. 2015. http://dx.doi.org/10.1016/j.labcli.2015.01.002
+Model
LABCLI-241; No. of Pages 15
ARTICLE IN PRESS
12
C. Prez-Cerd, B. Prez
Tabla 4
Patologas recomendables para introducir en los programas de cribado neonatal y metabolito marcador
Aminoacidopata
Metabolito marcador
Hiperfenilalaninemia/fenilcetonuria
Defectos en la metabolismo de BH4
Enfermedad de la orina con olor a Jarabe de arce
Tirosinemia tipo 1
Homocistinurias
Defectos en la -oxidacin de cidos grasos
Def. de acilCoA deshidrogenasa de cadena media
Aumento
Aumento
Aumento
Aumento
Aumento
generadas con la secuencia del genoma humano de referencia. La gran cantidad de variantes detectadas se ltran
por una serie de programas informticos hasta determinar
cules podran ser las variantes causantes de enfermedad. Bsicamente, se analiza su presencia o no en bases
de datos de polimorsmos (dbSNP, db 1000 genomas, EVS,
db del laboratorio) y de mutaciones ya descritas [HMGD]),
se analiza su efecto funcional sobre la protena, siendo
buenas candidatas las variantes de cambio de sentido,
peque
nas duplicaciones o inserciones que afectan a la fase
de lectura (generan frameshifts o codones de parada de
la traduccin) o que afectan a las regiones conservadas
del procesamiento del ARNm. Las variantes de cambio aminoacdico (missense) se evalan mediante anlisis
estructural en programas bioinformticos (SIFT,polyphen2
etc.), que predicen su efecto patognico sobre la protena
de
de
de
de
de
Cmo citar este artculo: Prez-Cerd C, Prez B. El laboratorio en el diagnstico de las enfermedades metablicas
hereditarias. Impacto de las nuevas tecnologas. Rev Lab Clin. 2015. http://dx.doi.org/10.1016/j.labcli.2015.01.002
+Model
LABCLI-241; No. of Pages 15
ARTICLE IN PRESS
Sntomas
Consanguinidad
Retraso madurativo
Hipoplasia cerebelosa
Ataxia
Alteraciones oculares (Nistagmus)
Hepatopata
Transferrina alterada (35% disialoTfr)
13
Forward strand
Alelo materno
p. Trp19Ter (c.57G>A)
Chr4: g.56212560
CM107196 (HGMD)
MAF: 0
Alelo paterno
Figura 4 Estudio gentico en un caso con sospecha clnica y bioqumica de un defecto congnito de glicosilacin. Se analiz
el ADN del paciente utilizando el panel de genes TrusightOne, para el anlisis del exoma de 4800 genes del OMIM relacionados
con enfermedad. Tras la captura y secuenciacin de los fragmentos en un Myseq, se alinearon las secuencias y se detectaron 403
variaciones de un solo nucletido (SNV-single nucleotide variation) patognicas, de las cuales una (c.57G > A) se encontraba en la
regin codicante del gen SRD5A3 en homocigosis. Este cambio tiene un efecto presumiblemente severo, ya que da lugar a un
codn de parada prematuro (p.Trp19Ter). La presencia de la mutacin en homocigosis se conrm en muestras de los padres por
secuenciacin Sanger.
las que se reeren los resultados interpretados de las pruebas bioqumicas y genticas realizadas al paciente. Debe
ser claro, conciso, preciso e interpretativo, con el objetivo
ltimo de proporcionar respuestas tiles para el diagnstico
del paciente.
Conicto de intereses
Conclusin
Los autores declaran no tener ningn conicto de intereses.
La implementacin de los dos avances tecnolgicos ms interesantes de los ltimos a
nos, la espectrometra de masas
para el anlisis de metabolitos y protenas, y la secuenciacin masiva en el anlisis del ADN, han tenido y van a seguir
teniendo un gran impacto sobre el modo de diagnosticar
las EMH. Tanto para el cribado de poblacin asintomtica
(neonatal) como para el de la sintomtica, la espectrometra de masas tiene un gran potencial en el desarrollo de
mtodos muy sensibles para la identicacin y cuanticacin
de metabolitos (metaboloma)36 o protenas (proteoma)37 en
muestras humanas no invasivas38 . Por otro lado, los mtodos para la secuenciacin masiva del genoma y del exoma
son cada vez ms econmicos y rpidos en la obtencin de
resultados y parece inevitable en un futuro no muy lejano
su aplicacin en el diagnstico prenatal39 o en el cribado
de poblacin asintomtica. Aunque en este caso, todava
quedan numerosas cuestiones prcticas y ticas que resolver, especialmente las que se derivan de la necesidad de
la aceptacin por parte del paciente o de sus padres de
un consentimiento informado complejo, y del manejo de
numerosos datos genticos, algunos de ellos de signicado
incierto40 . La identicacin de portadores de enfermedades
Agradecimientos
Los autores agradecen a todo el personal cientco, tcnico
y administrativo del Centro de Diagnstico de Enfermedades Moleculares de la Universidad Autnoma de Madrid, su
excelente trabajo durante estos a
nos, muy especialmente
a su directora, la Profesora Magdalena Ugarte. Tambin
agradecen a Rosa Navarrete la composicin de las guras
de este trabajo.
Bibliografa
1. Scriver CR. Garrods Croonian Lectures (1908) and the charter
inborn errors of metabolism: albinism, alkaptonuria, cystinuria, and pentosuria at age 100 in 2008. J Inherit Metab Dis.
2008;31:580---98.
2. Zschocke J. SSIEM Classication of inborn errors of metabolism.
En: Nenad Blau, Marinus Duran K, Michael Gibson, Carlo DionisiVici, editores. Physicians guide to the diagnosis, treatment, and
follow-up of inherited metabolic diseases. Heidelberg: Springer;2014.
Cmo citar este artculo: Prez-Cerd C, Prez B. El laboratorio en el diagnstico de las enfermedades metablicas
hereditarias. Impacto de las nuevas tecnologas. Rev Lab Clin. 2015. http://dx.doi.org/10.1016/j.labcli.2015.01.002
+Model
LABCLI-241; No. of Pages 15
ARTICLE IN PRESS
14
3. Saudubray JM, Sedel F, Walter JH. Clinical approach to treatable
inborn metabolic diseases: an introduction. J Inherit Metab Dis.
2006;29:261---74.
4. Mayne PD, Roche G, Deverell D. Amino acids: analytical aspects.
J Inherit Metab Dis. 2001;24:305---8.
5. Ormazabal A, Garcia-Cazorla A, Fernandez Y, FernandezAlvarez E, Campistol J, Artuch R. HPLC with electrochemical
and uorescence detection procedures for the diagnosis of
inborn errors of biogenic amines and pterins. J Neurosci Methods. 2005;142:153---8.
6. Vilaseca MA, Moyano D, Ferrer I, Artuch R. Total homocysteine
in pediatric patients. Clin Chem. 1997;43:690---2.
7. Fukushima T, Nixon JC. Analysis of reduced forms of biopterin in
biological tissues and uids. Anal Biochem. 1980;102:176---88.
8. Castro M, Carrillo R, Garcia F, Sanz P, Ferrer I, Ruiz-Sala P, et al.
Thirteen years experience with selective screening for disorders
in purine and pyrimidine metabolism. Nucleosides Nucleotides
Nucleic Acids. 2014;33:233---40.
9. Sweetman L. Organic acid analysis. En: Hommes FA, editor.
Techniques in diagnostic human biochemical genetics. Nueva
York: Wiley-Liss; 1991. p. 143---76.
10. Takemoto Y, Suzuki Y, Horibe R, Shimozawa N, Wanders RJ,
Kondo N. Gas chromatography/mass spectrometry analysis of
very long chain fatty acids, docosahexaenoic acid, phytanic acid
and plasmalogen for the screening of peroxisomal disorders.
Brain Dev. 2003;25:481---7.
11. Roschinger W, Olgemoller B, Fingerhut R, Liebl B, Roscher AA.
Advances in analytical mass spectrometry to improve screening
for inherited metabolic diseases. Eur J Pediatr. 2003;162 Suppl
1:S67---76.
12. Ferrer I, Ruiz-Sala P, Vicente Y, Merinero B, Perez-Cerda C,
Ugarte M. Separation and identication of plasma short-chain
acylcarnitine isomers by HPLC/MS/MS for the differential diagnosis of fatty acid oxidation defects and organic acidemias.
J Chromatogr B Analyt Technol Biomed Life Sci. 2007;860:
121---6.
13. Barshop BA, Gangoiti JA. Analysis of coenzyme Q in human blood
and tissues. Mitochondrion. 2007;7 Suppl.:S89---93.
14. Kiernan UA, Black JA, Williams P, Nelson RW. High-throughput
analysis of hemoglobin from neonates using matrix-assisted
laser desorption/ionization time-of-ight mass spectrometry.
Clin Chem. 2002;48:947---9.
15. Sturiale L, Barone R, Palmigiano A, Ndosimao CN, Briones
P, Adamowicz M, et al. Multiplexed glycoproteomic analysis
of glycosylation disorders by sequential yolk immunoglobulins immunoseparation and MALDI-TOF MS. Proteomics.
2008;8:3822---32.
16. Faid V, Michalski JC, Morelle W. A mass spectrometric strategy
for proling glycoproteinoses, Pompe disease, and sialic acid
storage diseases. Proteomics Clin Appl. 2008;2:528---42.
17. Perez-Cerda C, Merinero B, Rodriguez-Pombo P, Perez B, Desviat
LR, Muro S, et al. Potential relationship between genotype and
clinical outcome in propionic acidaemia patients. Eur J Hum
Genet. 2000;8:187---94.
18. Merinero B, Perez B, Perez-Cerda C, Rincon A, Desviat LR,
Martinez MA, et al. Methylmalonic acidaemia: examination of
genotype and biochemical data in 32 patients belonging to
mut, cblA or cblB complementation group. J Inherit Metab Dis.
2008;31:55---66.
19. Perez-Cerda C, Quelhas D, Vega AI, Ecay J, Vilarinho L, Ugarte
M. Screening using serum percentage of carbohydrate-decient
transferrin for congenital disorders of glycosylation in children
with suspected metabolic disease. Clin Chem. 2008;54:93---100.
20. Stenson PD, Mort M, Ball EV, Shaw K, Phillips A, Cooper DN.
The human gene mutation database: building a comprehensive
mutation repository for clinical and molecular genetics, diagnostic testing and personalized genomic medicine. Hum Genet.
2014;133:1---9.
C. Prez-Cerd, B. Prez
21. Vega AI, Perez-Cerda C, Desviat LR, Matthijs G, Ugarte M, Perez
B. Functional analysis of three splicing mutations identied in
the PMM2 gene: toward a new therapy for congenital disorder
of glycosylation type Ia. Hum Mutat. 2009;30:795---803.
22. Jorge-Finnigan A, Brasil S, Underhaug J, Ruiz-Sala P, Merinero
B, Banerjee R, et al. Pharmacological chaperones as a potential
therapeutic option in methylmalonic aciduria cblB type. Hum
Mol Genet. 2013;22:3680---9.
23. Mullis K, Faloona F, Scharf S, Saiki R, Horn G, Erlich H. Specic enzymatic amplication of DNA in vitro: the polymerase
chain reaction. Cold Spring Harb Symp Quant Biol. 1986;51 Pt
1:263---73.
24. Sanger F, Nicklen S, Coulson AR. DNA sequencing with
chain-terminating inhibitors. Proc Natl Acad Sci U S A.
1977;74:5463---7.
25. Desviat LR, Sanchez-Alcudia R, Perez B, Perez-Cerda C,
Navarrete R, Vijzelaar R, et al. High frequency of large genomic deletions in the PCCA gene causing propionic acidemia. Mol
Genet Metab. 2009;96:171---6.
26. Perez B, Nevado J, Lapunzina P, Gallego L, Perez-Cerda C,
Merinero B, et al. Segmental uniparental disomy leading to
homozygosity for a pathogenic mutation in three recessive
metabolic diseases. Mol Genet Metab. 2012;105:270---1.
27. Guthrie R, Whitney M. Phenylketonuria detection in the newborn infant as a routine hospital procedure. Publication 419.
Washington, DC: U.S. Department of Health, Education, and
Welfare (HHS); 1964.
28. Rashed MS, Ozand PT, Bucknall MP, Little D. Diagnosis of inborn
errors of metabolism from blood spots by acylcarnitines and
amino acids proling using automated electrospray tandem
mass spectrometry. Pediatr Res. 1995;38:324---31.
29. Loeber JG, Burgard P, Cornel MC, Rigter T, Weinreich SS, Rupp
K, et al. Newborn screening programmes in Europe; arguments
and efforts regarding harmonization Part 1. From blood spot to
screening result. J Inherit Metab Dis. 2012;35:603---11.
30. Burgard P, Rupp K, Lindner M, Haege G, Rigter T, Weinreich SS,
et al. Newborn screening programmes in Europe; arguments and
efforts regarding harmonization Part 2. From screening laboratory results to treatment, follow-up and quality assurance. J
Inherit Metab Dis. 2012;35:613---25.
31. Marn J, Aldamiz L, Casti
neiras D, Dalmau Serra J, Fernndez
no D, et al. Programas de criSnchez A, Gonzlez Lamu
na: actualizacin y propuestas de
bado neonatal en Espa
futuro. Documento de consenso. Real Patronato sobre discapacidad, Ministerio de Sanidad y Poltica Social. Gobierno de
Espa
na.Madrid:Editorial Polibea; 2010.
32. Mardis ER. Next-generation DNA sequencing methods. Annu Rev
Genomics Hum Genet. 2008;9:387---402.
33. Wong LJ. Next generation molecular diagnosis of mitochondrial
disorders. Mitochondrion. 2013;13:379---87.
34. Timal S, Hoischen A, Lehle L, Adamowicz M, Huijben K,
Sykut-Cegielska J., et al. Gene identication in the congenital
disorders of glycosylation type I by whole-exome sequencing.
Hum Mol Genet. 2012;21:4151---61.
35. Claustres M, Kozich V, Dequeker E, Fowler B, Hehir-Kwa JY,
Miller K, et al. Recommendations for reporting results of diagnostic genetic testing (biochemical, cytogenetic and molecular
genetic). Eur J Hum Genet. 2014;22:160---70.
36. Psychogios N, Hau DD, Peng J, Guo AC, Mandal R, Bouatra
S, et al. The human serum metabolome. PLoS One. 2011;6:
e16957.
37. Nanjappa V, Thomas JK, Marimuthu A, Muthusamy B,
Radhakrishnan A, Sharma R, et al. Plasma Proteome Database as
a resource for proteomics research: 2014 update. Nucleic Acids
Res. 2014;42:D959---65.
38. Kuhara T. Noninvasive human metabolome analysis for differential diagnosis of inborn errors of metabolism. J Chromatogr
B Analyt Technol Biomed Life Sci. 2007;855:42---50.
Cmo citar este artculo: Prez-Cerd C, Prez B. El laboratorio en el diagnstico de las enfermedades metablicas
hereditarias. Impacto de las nuevas tecnologas. Rev Lab Clin. 2015. http://dx.doi.org/10.1016/j.labcli.2015.01.002
+Model
LABCLI-241; No. of Pages 15
ARTICLE IN PRESS
15
41. Hodgson JM, Metcalfe SA, Aitken M, Donath SM, Gaff CL,
Winship IM, et al. Improving family communication after
a new genetic diagnosis: a randomised controlled trial of
a genetic counselling intervention. BMC Med Genet. 2014;
15:33.
Cmo citar este artculo: Prez-Cerd C, Prez B. El laboratorio en el diagnstico de las enfermedades metablicas
hereditarias. Impacto de las nuevas tecnologas. Rev Lab Clin. 2015. http://dx.doi.org/10.1016/j.labcli.2015.01.002