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Receptores acoplados a protena G (GPCR) son una protena grande sper

familia de receptores transmembrana. Se caracterizan por una de siete


transmembrana (7TM) topologa comn, tres bucles extracelulares, tres
bucles intracelulares, un dominio extracelular amino-terminal y un dominio
intracelular carboxi terminal (Lefkowitz, 2004; Kenakin et al., 2010). Ellos
median una amplia gama de procesos fisiolgicos y se consideran un
objetivo importante para la intervencin teraputica, con casi la mitad de
todos los medicamentos actuales en el mercado que actan sobre miembros
de la familia estos receptores. El mecanismo de varias patologas, como los
trastornos de hipertensin y neuropsiquitricos, estn vinculadas a la
desregulacin de la sealizacin de GPCR.

En el sistema nervioso, que desempean un papel fundamental en la


excitabilidad, la transmisin sinptica, erentiation di ff y la percepcin
sensorial. Pertenecen en su mayora a la familia GPCR A (rodopsina-like) y
otros para la familia C (glutamato similares). Sus ligandos son mono-aminas
(adrenalina, noradrenalina, serotonina, dopamina, histamina), otras
pequeas neurotransmisores (acetilcolina, cido gamma aminobutrico,
glutamato, ATP, adenosina, los cannabinoides) y muchos neurotransmisores
peptdicos (opioides, somatostatina, NPY, la oxitocina, la vasopresina ,
neurotensina).
Los mecanismos moleculares y celulares que regulan GPCRs son complejos
y no completamente entendido. El mecanismo de sealizacin clsica
implica GPCRs respuesta a sus ligandos o agonistas y los cambios
conformacionales que permiten la activacin de las protenas G
heterotrimricas. Adems, el complejo mecanismo de sealizacin del
receptor implica muchos otros tipos de protenas GPCR interactuar (GIPS)
que se puede ajustar con precisin la actividad del receptor. Estos
mecanismos son diversos y comprenden homo receptores "o heteromer y la
interaccin con las protenas erent di ff, tales como edad ff sca, adaptadores
y ectores ff e, formando grandes complejos de protenas (Karnik et al., 2003;
Ritter y Hall, 2009). GIPs ejercen dramticos eja e ff en los pasos erent di ff
de un ciclo de vida del receptor, se pliegue, biosinttica cking ffi tra, anclaje
a la membrana plasmtica y post-endoctica clasificacin para complejo de
tipo de clulas especficas de ajuste de la actividad de GPCR (Bockaert et
al., 2004; Ritter y Hall, 2009). La regulacin ajuste fino se produce por
cualquiera de seal de retroalimentacin positiva o negativa. El primero
conduce a un aumento en la velocidad y la e fi cacia de GPCR sig-naling, por
ejemplo, los nios de ff sca como A-quinasa protenas de anclaje (AKAP;
Woods, 2010) sujecin aguas abajo e ff ec-res en las proximidades del
receptor. Este ltimo, conduce a una disminucin en el curso intensidad y / o
el tiempo de la sealizacin de GPCR mediante la interrupcin de la
asociacin de GPCRs con Protenas G o, en algunos casos, la contratacin de
los reguladores negativos de la sealizacin de GPCR (Ritter y Hall, 2009).
Muchas protenas no atraviesa la membrana reportados como la interaccin
con GPCRs son protenas 14-3-3 (Couve et al, 2001;.. Olayioye et al, 2003;
Tazawa et al., 2003), CaM (Wang et al., 1999; Bofill-Cardona et al, 2000),
PDZ (PSD-95 discos de grandes protenas ZO-1) (Hall et al, 1998;.. Hu et al,
2000;.. Becamel et al, 2001), que contiene el dominio SH3-pro-protena

(Oldenhof et al, 1998;.. Liu et al, 2004), la protena que contiene el dominio
SH2 (. Karoor et al, 1998; Venema et al., 1998) y elementos del
citoesqueleto (Smith et al., 1999; Saunders y Limbird, 2000;. Richman et al,
2001). As, la especificidad de la sealizacin del receptor puede ser
determinada por interacciones competitivas de varios GIPs, para un GPCR
dado. Aunque se sabe que GIPs juegan un papel importante en la funcin
GPCR y sealizacin, los patrones de-la interaccin slo son conocidos por
un pequeo nmero de receptores. Mejorar el conocimiento de los posibles
sitios ing de vinculacin de los receptores no debera ser beneficioso para
los estudios experimentales. Otras interacciones importantes que involucran
GPCRs son homo o heteromerizacin receptores. Es bien sabido que la
forma GPCR tanto homo y hetermeros, y, para algunos receptores, este
proceso es esencial para lograr la expresin adecuada de la superficie y la
actividad funcional. Heteromerizacin receptor puede modificar
significativamente las caractersticas funcionales de los protmeros
individuales, dando lugar a nuevas entidades funcionales que posee nuevas
caractersticas bioqumicas (Agnati et al., 2003;. Prinsterer et al, 2005;
Woods, et al., 2005). Ellos incluyen aumento en la funcin y cambios en las
propiedades farmacolgicas, tales como cambios en la cooperatividad,
sealizacin e fi tra cking / localizacin subcelular (ligando vinculante Agnati
et al., 2003; Levoye et al, 2006;. Milligan, 2009;. Prinsterer et al, 2005;.
Springael et al, 2007). Ejemplos de heteromerizacin la participacin de
GPCR se muestran en la Tabla 1.
Carboxi-terminal, tercer bucle intracelular (3iL) y amino-terminal dominios
son las regiones ms variables de GPCR (Otaki y Firestein, 2001). Muestran
una alta propensin a la conformacin estructurada (Jaakola, 2005; Agnati
et al., 2008) y as se consideran, a ser dominios de plstico que pueden
interactuar con mltiples ligandos, y con los dominios de otros receptores y
protenas interactan ing-receptor (Agnati et al, 2008;.. Borroto-Escuela et
al, 2011a, b). Woods (2010) demostr que los receptores de dopamina son
muy desordenado. La regin desordenado de una protena se define como
que carece de una estructura tridimensional estable (3D). Estas regiones
son ricas en aminocidos hidroflicos, cargado y de estructura perjudicial y
pobres en los hidrofbicos y aromticos, cuando com-paracin con las
regiones ordenados (Dunker et al., 2001). La gran proporcin de interfaz a la
superficie de esta porcin muy flexible de la protena que les permite asumir
conformaciones erent di ff, lo que les permite unen con varias protenas y se
adaptan a su estructura 3D diferente.
Sitios de unin dentro de las regiones desordenadas son motivos lineales
cortos tambin conocidos como LMS (Fuxreiter et al., 2007), y son por lo
general los sitios de unin utilizados para la fijacin de los diversos GIPs
mencionados anteriormente. La interaccin se produce con frecuencia con
un relativamente bajo nidad ffi y alta especificidad. Las condiciones que
permiten desordenada regiones interacten e iniciar el proceso de
sealizacin luego rpidamente se disocian cuando la tarea se lleva a cabo
(Wright y Dyson, 2009). Por otra parte, las regiones intrnsecamente
desordenadas (IDR) tambin son objetivos habituales para las
modificaciones posteriores a la traduccin, que son de importancia
fundamental para la sealizacin de GPCR, inter-nalizacin as como la

interaccin (Ciruela et al., 2004; Gao y Xu, 2012). Tambin estn sesgadas
hacia secuencias PEST, que son protenas clsica seales de orientacin
ricos en los aminocidos trastorno de promocin:. Prolina (P), cido
glutmico (E), serina (S) y treonina (T) (Singh et al, 2006 ). Esta clase de
adorno confiere inestabilidad a los pro-protenas y es una seal importante
objetivo para la degradacin de la ubiquitina-proteasoma y pro-vas
calpana-degradacin (Gregory y Hann, 2000; Bordone y Campbell, 2002).
Adems de los extensos estudios que abordan su funcin como seal de
degradacin de protenas, que han sido reportados como dianas de
fosforilacin y sitios de interaccin protena-protena (Rechsteiner y Rogers,
1996;. Marchal et al., 1998; Kim et al, 2002). Aunque secuencias PEST
pueden ser importantes para la sealizacin de GPCR, su distribucin en los
receptores es escasa.
En conjunto, estas caractersticas relacionadas con trastorno de la protena
pueden proporcionar una respuesta de sintonizacin fina para el receptor de
sealizacin en el escenario muy complejo que se encuentra en
heteromerizacin, modificaciones post-traduccionales y las protenas que
interactan, por lo tanto un ff in de la capacidad de los GPCRs para
transducir estmulos extracelulares en cambios en la fisiologa celular ,
especialmente en las respuestas neuronales. Teniendo en cuenta la
relevancia de GPCRs para la sealizacin apropiada de la clula y la
respuesta del neurotransmisor, la caracterizacin de sus propiedades
funcionales puede conducir a una mejor comprensin de los mecanismos
moleculares y fisiopatologa de las enfermedades y puede conducir a la
identificacin de nuevas dianas teraputicas. Utilizamos herramientas
computacionales para la prediccin basada en la secuencia de la protena
desorden intrnseco y regiones no estructurados dentro de las protenas.
Hemos ampliado el conjunto de receptores estudiados por Agnati et al.
(2008) y caracterizado GPCRs travs enfoque 'a la bioinformtica, la
integracin del anlisis de IDR, motivo PEST y motivos de unin de Nterminal, 3iL y dominios C-terminal.

Procedimientos experimentales

datos de la secuencia

Se analizaron setenta y cinco secuencias de GPCRs humanos implicados en


la neurotransmisin. Ellos se obtuvieron de la base de datos UniProtKB /
Swiss-Prot. Ellos pertenecen a las siguientes familias: la serotonina, la
adenosina, acetilcolina muscarnicos, adrenrgicos, cannabinoides, la
dopamina, GABA, Metabotrpicos glutamatrgicos, histamina, Neurotensin,
narctico, orexina, oxitocina, Purinergic y receptores de somatostatina. Ellos
fueron seleccionados en base a la frecuencia con que se presentan en la
literatura. ID de la adhesin de los receptores son los siguientes: 5
HT1A_HUMAN, 5HT1B_HUMAN, 5HT1D_HUMAN, 5HT 1E_HUMAN,
5HT1F_HUMAN, 5HT2A_HUMAN, 5HT2 B_HUMAN, 5HT2C_HUMAN,

5HT4R_HUMAN, 5HT5A_ HUMANO, 5HT6R_HUMAN, 5HT7R_HUMAN,


AA1R_HU MAN, AA2AR_HUMAN, AA2BR_HUMAN, AA3R_HU MAN,
ACM1_HUMAN, ACM2_HUMAN , ACM3_HUMAN,

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