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(Oldenhof et al, 1998;.. Liu et al, 2004), la protena que contiene el dominio
SH2 (. Karoor et al, 1998; Venema et al., 1998) y elementos del
citoesqueleto (Smith et al., 1999; Saunders y Limbird, 2000;. Richman et al,
2001). As, la especificidad de la sealizacin del receptor puede ser
determinada por interacciones competitivas de varios GIPs, para un GPCR
dado. Aunque se sabe que GIPs juegan un papel importante en la funcin
GPCR y sealizacin, los patrones de-la interaccin slo son conocidos por
un pequeo nmero de receptores. Mejorar el conocimiento de los posibles
sitios ing de vinculacin de los receptores no debera ser beneficioso para
los estudios experimentales. Otras interacciones importantes que involucran
GPCRs son homo o heteromerizacin receptores. Es bien sabido que la
forma GPCR tanto homo y hetermeros, y, para algunos receptores, este
proceso es esencial para lograr la expresin adecuada de la superficie y la
actividad funcional. Heteromerizacin receptor puede modificar
significativamente las caractersticas funcionales de los protmeros
individuales, dando lugar a nuevas entidades funcionales que posee nuevas
caractersticas bioqumicas (Agnati et al., 2003;. Prinsterer et al, 2005;
Woods, et al., 2005). Ellos incluyen aumento en la funcin y cambios en las
propiedades farmacolgicas, tales como cambios en la cooperatividad,
sealizacin e fi tra cking / localizacin subcelular (ligando vinculante Agnati
et al., 2003; Levoye et al, 2006;. Milligan, 2009;. Prinsterer et al, 2005;.
Springael et al, 2007). Ejemplos de heteromerizacin la participacin de
GPCR se muestran en la Tabla 1.
Carboxi-terminal, tercer bucle intracelular (3iL) y amino-terminal dominios
son las regiones ms variables de GPCR (Otaki y Firestein, 2001). Muestran
una alta propensin a la conformacin estructurada (Jaakola, 2005; Agnati
et al., 2008) y as se consideran, a ser dominios de plstico que pueden
interactuar con mltiples ligandos, y con los dominios de otros receptores y
protenas interactan ing-receptor (Agnati et al, 2008;.. Borroto-Escuela et
al, 2011a, b). Woods (2010) demostr que los receptores de dopamina son
muy desordenado. La regin desordenado de una protena se define como
que carece de una estructura tridimensional estable (3D). Estas regiones
son ricas en aminocidos hidroflicos, cargado y de estructura perjudicial y
pobres en los hidrofbicos y aromticos, cuando com-paracin con las
regiones ordenados (Dunker et al., 2001). La gran proporcin de interfaz a la
superficie de esta porcin muy flexible de la protena que les permite asumir
conformaciones erent di ff, lo que les permite unen con varias protenas y se
adaptan a su estructura 3D diferente.
Sitios de unin dentro de las regiones desordenadas son motivos lineales
cortos tambin conocidos como LMS (Fuxreiter et al., 2007), y son por lo
general los sitios de unin utilizados para la fijacin de los diversos GIPs
mencionados anteriormente. La interaccin se produce con frecuencia con
un relativamente bajo nidad ffi y alta especificidad. Las condiciones que
permiten desordenada regiones interacten e iniciar el proceso de
sealizacin luego rpidamente se disocian cuando la tarea se lleva a cabo
(Wright y Dyson, 2009). Por otra parte, las regiones intrnsecamente
desordenadas (IDR) tambin son objetivos habituales para las
modificaciones posteriores a la traduccin, que son de importancia
fundamental para la sealizacin de GPCR, inter-nalizacin as como la
interaccin (Ciruela et al., 2004; Gao y Xu, 2012). Tambin estn sesgadas
hacia secuencias PEST, que son protenas clsica seales de orientacin
ricos en los aminocidos trastorno de promocin:. Prolina (P), cido
glutmico (E), serina (S) y treonina (T) (Singh et al, 2006 ). Esta clase de
adorno confiere inestabilidad a los pro-protenas y es una seal importante
objetivo para la degradacin de la ubiquitina-proteasoma y pro-vas
calpana-degradacin (Gregory y Hann, 2000; Bordone y Campbell, 2002).
Adems de los extensos estudios que abordan su funcin como seal de
degradacin de protenas, que han sido reportados como dianas de
fosforilacin y sitios de interaccin protena-protena (Rechsteiner y Rogers,
1996;. Marchal et al., 1998; Kim et al, 2002). Aunque secuencias PEST
pueden ser importantes para la sealizacin de GPCR, su distribucin en los
receptores es escasa.
En conjunto, estas caractersticas relacionadas con trastorno de la protena
pueden proporcionar una respuesta de sintonizacin fina para el receptor de
sealizacin en el escenario muy complejo que se encuentra en
heteromerizacin, modificaciones post-traduccionales y las protenas que
interactan, por lo tanto un ff in de la capacidad de los GPCRs para
transducir estmulos extracelulares en cambios en la fisiologa celular ,
especialmente en las respuestas neuronales. Teniendo en cuenta la
relevancia de GPCRs para la sealizacin apropiada de la clula y la
respuesta del neurotransmisor, la caracterizacin de sus propiedades
funcionales puede conducir a una mejor comprensin de los mecanismos
moleculares y fisiopatologa de las enfermedades y puede conducir a la
identificacin de nuevas dianas teraputicas. Utilizamos herramientas
computacionales para la prediccin basada en la secuencia de la protena
desorden intrnseco y regiones no estructurados dentro de las protenas.
Hemos ampliado el conjunto de receptores estudiados por Agnati et al.
(2008) y caracterizado GPCRs travs enfoque 'a la bioinformtica, la
integracin del anlisis de IDR, motivo PEST y motivos de unin de Nterminal, 3iL y dominios C-terminal.
Procedimientos experimentales
datos de la secuencia