UNIVERSIDAD DE CARABOBO

FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD

ESCUELA DE MEDICINA
DEPARTAMENTO DE BIOQUMICA

Siglo XIX

Los productos naturales que

contienen nitrgeno son esenciales
para la vida
PROTENA ( del griego: Proteios, primario)

G. J. Mulder
en 1839

Su digestin daba lugar a AMINOCIDOS

(descubiertos en 1830)

 Son cidos carboxlicos con un sustituyente -amino

RADICAL VARIABLE
(Determina solubilidad y permite clasificarlos)

1. Aminocidos Proteicos:
a. Aminocidos Estndar:
Esenciales.
No Esenciales.
b. Aminocidos No estndar o Modificados.

2. Aminocidos NO Proteicos:

Arginina (Arg), Histidina (His), Lisina (Lys), Treonina

(Thr), Isoleucina (Ile), Leucina (Leu), Metionina (Met),

Valina (Val), fenilalanina (Phe), Triptfano (Trp)

Arginina (Arg),
Histidina (His),

Tirosina (Tyr)

Aspartato (Asp), Glutamato

(Glu), Asparagina (Asn),
Glutamina (Gln), Cistena (Cys),
Serina (Ser), Alanina (Ala),
Glicina (Gly), Prolina (Pro),
Tirosina (Tyr)

 Aminocidos con Cadenas Laterales Alifticas

 Aminocidos con Cadenas Laterales Alifticas: Caso especial

Prolina (Pro) P

Iminocido

 Cadenas Laterales que contienen Grupos OH

 Cadenas Laterales que contienen tomos de S:

 Cadenas Laterales con Anillos Aromticos:

 Aminocidos Bsicos :

 Aminocidos cidos y sus Amidas :

CIDOS.

 Aminocidos cidos y sus Amidas :

AMIDAS.

Puente de hidrgeno

Los aa son solubles

en agua, cidos y
bases diluidas,
insolubles en
solventes no

polares.

Hidroxilo de un alcohol
y agua

Carboxilo de una
cetona y agua

Entre grupos peptdicos

en polipptidos

 Aminocidos con grupo R NO Polar :

 Aminocidos con grupo R NO Polar :

 Aminocidos con grupos R Polares Sin Carga :

 Grupos R Polares con Carga Positiva :

 Grupos R Polares con Carga Negativa :

AMINOACIDO

ESTRUCTURA

LOCALIZACION

4-Hidroxiprolina

Colgeno, pared
celular de las plantas

6-N-metil-lisina

Miosina

c. Carboxiglutmico

Protrombina

AMINOACIDO

ESTRUCTURA

LOCALIZACION

-QUERATINAS

CISTINA.

AMINOACIDO

-Alanina

HOMOCISTEINA

HOMOSERINA

ESTRUCTURA

FUNCION
Precursora del cido
Pantotnico

Intermediarios del
Metabolismo de los
Aminocidos
Intermediarios del
Metabolismo de los
Aminocidos

AMINOACIDO

CITRULINA Y ORNITINA

ESTRUCTURA

FUNCION

Intermediarios del
Ciclo de la Urea

AMINOCIDO

LOCALIZACIN

c. D-glutmico

Paredes bacterianas

D-Alanina

Larvas, insectos

D-Serina

Gusanos de tierra

Canavanina

Toxinas

-Cianoalanina

Toxinas

Carbono asimtrico
(Quiral)
Enantimeros

n
2

Configuracin Absoluta

Los aminocidos de las protenas son ESTEREOISMEROS L

Actividad ptica

Levgiro
Dextrgiro

PROPIEDADES CIDO BSICAS

-COOH
-NH3+

SUSTANCIA ANFTERA
(ANFOLITO)

H+ + COOH+ + NH2
PAR CIDO-BASE CONJUGADO

CIDO: Sustancia capaz de ceder protones al medio

BASE: Sustancia capaz de aceptar protones del medio

PROPIEDADES CIDO BSICAS

Fuerza de un cido

R-COOH
HA

Ka

R-COO- + H+
A-

Grado de disociacin del cido.

Eficiencia en ceder protones.
A mayor Ka ms fuerte es el cido.

H+

PROPIEDADES CIDO BSICAS

Fuerza de un cido

pKa = -Log Ka
TIPO DE GRUPO
-Carboxilo
-Amino

Ka

pKa

3,2 x 10-3
2,5 x 10-10

2,5
9,6

cido Fuerte: Disociacin total del cido. Ka infinito

cido Dbil: Disociacin parcial del cido.

DEFINICIN

Soluciones que se resisten a cambios de pH

despus de la adicin de pequeas cantidades de
cidos o bases fuertes. pH = pK
COMPOSICIN

CIDO DBIL
c. Actico
(CH3COOH)

BASE CONJUGADA
Acetato
(CH3COO-)

-COOH

-NH3+

H+ + COO-

H+ + NH2

pH < pKa

[cido] > [Base]

pH = pKa

[cido] = [Base]

pH > pKa

[cido] < [Base]

DEFINICIN
Es la transformacin logartmica de la expresin para la constante de
disociacin.

FINALIDAD
Calcular el valor de pK de cualquier cido, conociendo la
relacin molar de las especies dadoras y aceptoras de protones
a un pH determinado.

pH = pK + log [A-]
[HA]

Propiedades cido Bsicas

IN BIPOLAR
ZWITERIN
IN HBRIDO

= +1

=0
PUNTO ISOELCRICO

(pH ISOELCTRICO)

= -1

Carga Neta = Cero.

Mnimo Poder Amortiguador.
Mnima solubilidad

pI =

1
2

(pKa1 + pKa2)

COOH

Grupo -carboxlico

COO-

cida

Bsica

pH

<

pKa

[COOH]

>

pH

pKa

[COOH]

= [COO-]

pH

>

pKa

[COOH]

<

Grupo -amino

[COO-]

[COO-]

NH3+

NH2

cida

Bsica

pH

<

pKa

[NH3+]

>

pH

pKa

[NH3+]

pH

>

pKa

[NH3+]

<

[NH2]
[NH2]

[NH2]

 Monoamino-Monocarboxlicos

Ej.:
Glicina

 = +1

=0

50% Catin
50 % Zwitterion

= -1

50% anin
50 %
Zwitterion
100% Zwiterion

Ej:
cido

Glutmico

=0
= +1

= -1

= -2

Ej:
Histidina

 = +2

= +1

=0

= -1

BICARBONATO / ACIDO CARBONICO.

HCO3-/H2CO3

Pka= 6,1

ACIDOSIS RESPIRATORIA O
METABOLICA.
ALCALOSIS RESPIRATORIA O
METABOLICA

El sistema
Bicarbonato/Acido
carbnico
representa el 75%
de la
capacidad buffer
total de
la sangre, siendo
un
Buffer excelente.

Enlace Peptdico

 Es ms corto.
El enlace C-N: Posee carcter de doble enlace parcial.
No puede girar libremente.
Supone una clara restriccin para la forma de la molcula.

Los tomos: O, C, N, H son casi coplanares.

Carboxilo
terminal

Amino
terminal

El grupo de tomos alrededor del enlace peptdico se encuentra generalmente

en configuracin trans (trans:cis 4:1).

Dos o ms aminocidos unidos mediante enlaces peptdicos.

PROTEICOS

NO PROTEICOS

PPTIDOS
POLIPPTIDOS
(Protenas)

OLIGOPPTIDOS
(L-Asp-L-Phe)

(Ser-Gly-Tyr-Ala-Leu)

Caractersticas Estructurales
Cadenas ramificadas.
Cadenas cclicas.
Aminocidos D, L, y .
Enlace peptdico especial.
Su estructura los protege de las proteasas.

Pptidos Con Actividad Biolgica

ENCEFALINAS

Se producen en el SNC, tienen actividad opicea

Gramicidina S.
ANTIBITICOS Bencil-penicilina.
Bacitracina A.
Actinomicina D.

 GLUTATIN

PPTIDOS CON ACTIVIDAD BIOLGICA

Reducido (GSH)

-Glu

+NH

O
-OOC-CH-CH -CH -C2
2
3

Oxidado (GSSG)

Gly

Cys
O
N-CH-CH CH2

N-CH2-COOH

SH

-Glu-Cys-Gly
-Glu-Cys-Gly

IMPORTANCIA BIOLOGICA DEL GLUTATION:

Elimina los perxidos txicos que se forman durante el

crecimiento y el metabolismo (aerbico).

Mantiene el tomo de hierro de la hemoglobina en estado ferroso

(Fe++).

Es agente reductor de la glutarredoxina.

Puede experimentar xido-reduccin reversible.

PPTIDOS CON ACTIVIDAD BIOLGICA

HORMONAS PEPTDICAS
HORMONA

N
residuos

FUNCIN

FACTOR LIBERADOR DE
LA TIROTROPINA (TRH)

Estimula la liberacin de la
Tirotropina (TSH)

OXITOCINA

Estimula la contraccin uterina

VASOPRESINA

Promueve la retencin de agua

desde los tbulos renales
distales.

PPTIDOS CON ACTIVIDAD BIOLGICA

HORMONAS PEPTDICAS
HORMONA
INSULINA

N
residuos

51*

FUNCIN
Estimula la glucognesis, la
lipognesis y la sntesis de
protenas

GLUCAGN

29

Antagonista de la insulina

CORTICOTROPINA

39

Estimula la corteza renal

Macromolcula compuesta por una o varias cadenas

polipeptdicas, cada una de las cuales tiene una secuencia
caracterstica de aminocidos unidos a travs de enlaces
peptdicos.

-L-Aminocidos
nicamente o conjugados con
otras biomolculas de
naturaleza no proteica

EN BASE A SU COMPOSICION QUIMICA

Protenas Simples

Protenas Conjugadas

Proteinas Simples:
Producen solo -L-aminocidos despus de su
degradacin hidroltica.
Ejemplo: Ribonucleasa, Quimiotripsina, Seroalbmina.

Protenas conjugadas:
Su hidrlisis da origen adems de -L-aminocidos a un Grupo
prosttico.

EJEMPLOS:
CLASE

GRUPO PROSTTICO

EJEMPLO

Lipoprotena

Lpidos

-lipoprotena

Glicoprotena

Carbohidratos

-globulinas

Hemoprotena

Hemo

Hemoglobina

EN BASE A SU FUNCIN
Catalticas.
Estructurales.
Transportadoras.
Contrctiles.
De defensa natural.
Respiratoria.
Represoras.
Hormonales.
Receptoras.
Transductoras de seales.
De la visin...

EN BASE A SU CONFORMACIN

FIBROSAS:

GLOBULARES:
OLIGOMRICAS:

Residuos de
aminocidos

-hlice

Cadena
polipeptdica

Subunidades
Unidas

ESTRUCTURA PRIMARIA
Se refiere al nmero y secuencia de aminocidos de la
cadena polipeptdica.
Enlaces Estabilizadores: Enlaces Peptdicos
(Ser-Gly-Tyr-Ala-Leu)

ESTRUCTURA SECUNDARIA
ENLACES ESTABILIZADORES
Enlace peptdico.
Enlaces de hidrgeno (intra e intercatenario).
Enlaces disulfuro.

-hlice

-conformacin

ESTRUCTURA SECUNDARIA
El esqueleto polipeptdico se encuentra
compactamente enrollado alrededor del eje
longitudinal de la molcula.

Los grupos R sobresalen del esqueleto helicoidal.

Todos los enlaces CONH participan en puentes de H.
El giro es dextrgiro.*
Cada giro de hlice constituye 3.6 Aac.
El giro de hlice ocupa 0.56 nm del eje longitudinal.

HLICE

ESTRUCTURA SECUNDARIA
HLICE

Localizacin

Aminocidos desestabilizadores:
Numerosas molculas de Glu, Arg o Lys (carga).
Asn, Ser, Thr y Leu (forma y tamao).
Pro y hidroxiprolina.

ESTRUCTURA SECUNDARIA

CONFORMACIN

Enlace peptdico.
Enlaces de hidrgeno predominantemente intercatenarios entre los
enlaces peptdicos de las -queratinas.

ESTRUCTURA SECUNDARIA
A. Paralela

B. Antiparalela

CONFORMACIN

 La secuencia de aminocidos es repetitiva.

Tienen un contenido elevado de aa no polares.

Alto contenido de Cys.

Son estructuras multihebra con una estructura
secundaria altamente regular.

En general son elsticas y flexibles, pero se

endurecen con la formacin de enlaces cruzados
disulfuro.

-QUERATINA

ESTRUCTURA SECUNDARIA: beta queratina

ESTRUCTURA SECUNDARIA

COLGENO
Secuencia de aminocidos.
(Gly-X-Y)
Conformacin helicoidal.

Enlaces de hidrgeno
intercadena.

Ordenamiento de triple hlice.

Empaquetamiento ordenado de
las molculas de tropocolgeno.

COLGENO
Aminocidos ms frecuentes en su estructura: Gly (35%), Ala (11%), Pro
(12%), Hyp (9%), Hya (9%).

La secuencia de AAc. caractersticas es: Gly-X-Pro o Gly-X-Hyp.

Estructura secundaria nica distinta de la hlice .
Hlice levgira.

El enrollamiento superhelicoidal es dextrgiro.

El empaquetamiento de las cadenas en la triple hlice le proporciona
ms fuerza de tensin que un cable de acero de idntica seccin.

Agrupamiento estable de varios elementos de estructura secundaria

que se encuentran comnmente en ms de una protena.

Lazo --

Vrtice -

 Forma compacta.
Los diferentes segmentos de una cadena polipeptdica se pliegan
unos sobre otros.
Denso ncleo hidrofbico.

Cumplen con una amplia variedad de funciones biolgicas

dinmicas (transporte, regulacin, proteccin, etc.)

ENLACES ESTABILIZADORES

Enlace peptdico.
Interacciones electrostticas.
Puentes de hidrgeno.
Interacciones de Van der Waals.
Enlaces disulfuro.

ESTRUCTURA:
Cadena polipeptdica de 153 AAc.

MIOGLOBINA

Un grupo ferroporfirina o hemo, localizado en una hendidura de la

molcula.

Estructura secundaria: todo (78%).

Curvaturas: Pro, Ser, Thr, Asn.
Muy compacta.

FUNCIN
LOCALIZACIN

F8 (HIS 93)
Histidina proximal

Desoximioglobina = Agua
O2 - (HIS 64 E7)
Histidina distal

Estado nativo,
catalticamente activo
Adicin de urea y mercaptoetanol

RIBONUCLEASA
Estado desplegado
inactivo
Eliminacin de urea y
mercaptoetanol
Estado nativo, catalticamente
activo

REPLEGADO Y FORMACIN DE ENLACES DISULFURO

CONFORMACIN NATIVA

DOMINIOS
Regiones compactas semi-independientes que poseen una
geometra compacta caracterstica

Caractersticas
Contienen tpicamente entre 100 y 150 aminocidos continuos.
Presentan un exterior hidrfilo y un interior hidrfobo.
Varios dominios en una protena pueden estar conectados por un
segmento de la cadena polipeptdica.

PLEGAMIENTO ASISTIDO
Protenas que facilitan el ensamblaje adecuado de la
estructura proteica.

Chaperonas Moleculares:
Facilitan rutas de plegamiento correctas.
Favorecen el microentorno para que

tenga

lugar

el

empaquetamiento.

Bloquean el plegamiento de determinadas protenas que deben

permanecer desplegadas para atravesar la membrana.

Ayudan

al

oligomricas.

empaquetamiento

cuaternario

de

protenas

 ESTRUCTURA:
GLOBINA: 4 Cadenas polipeptdicas. 2 (141 Aac.) Y 2 (146

HEMOGLOBINA

AAc) de 146 AAc.

GRUPO HEMO: 4 grupos protticos hemo (Fe++).

FUNCIN.

Estado T

LOCALIZACIN

Estado R

ENLACES ESTABILIZADORES

ESTRUCTURA CUATERNARIA

Enlace peptdico.
Interacciones de Van Der Waals.

Enlaces disulfuro.
Puentes de Hidrgeno.
Interacciones Electrostticas.

El hierro posee 6
sitios de unin:
Cuatro
estn
ocupados por los
nitrgenos del
grupo hemo; el
quinto lugar lo
ocupa
un
nitrgeno de la
histidina
proximal y en el
sexto lugar se
une el oxgeno.

His E7
O2

His F8

HEMOGLOBINA

HEMOGLOBINA (Transporte de Gases)

Pulmones

ARTERIAS

VENAS

DESOXIHEMOGLOBINA

OXIHEMOGLOBINA

Mioglobina

pH=7,4

Tejiidos

Pulmones

2,3 BISFOSFOGLICERATO

HEMOGLOBINA (Efectos Alostricos)

pO2
pCO2 pH
[BPG]

HbT*(O2)4 + H+ + BPG

4 O2 + HbT*BPG

Forma T de la
desoxihemoglobina

pO2

pCO2 pH
[BPG]

Forma R de la
oxihemoglobina

ANEMIA DREPANOCTICA

Hemoglobina S: Sustitucin de un aminocido en la cadena

polipeptdica de la Hb

HEMOGLOBINA (Interaccin con CO)

CO se une a la Hb con una afinidad 250 veces mayor que el O2

 Slo aquel que tiene la mente Positiva es el que permanece

inmune a la enfermedad
Thomas Hamblin

Muchas Gracias!!!!